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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-06-21 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
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research paper | 开发了一个合成生物学工具包,用于在纤维素生产菌株Kosakonia oryzendophytica中进行遗传操作 | 构建了一个可调表达模块和精确基因组编辑能力的综合工具包,用于重编程菌株以生产具有定制特性的下一代纤维素基功能材料 | NA | 开发合成生物学平台以工程化高产细菌纤维素合成菌株 | Kosakonia oryzendophytica菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9介导的无疤痕基因组编辑系统 | NA | NA | NA |
42 | 2025-06-21 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 该研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器平台,用于实现模块化通路区室化以精确控制代谢通量 | 利用工程化生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器,通过空间组织关键酶来克服代谢中间体扩散分散问题 | 目前仅在2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路中验证了该平台的有效性 | 开发合成生物学平台以优化区室化生物合成通路的效率 | 工程化大肠杆菌中的2'-岩藻糖基乳糖生物合成通路 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、代谢通路设计 | NA | 生物分子相互作用数据、代谢物浓度数据 | 工程化大肠杆菌菌株 |
43 | 2025-06-21 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
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研究论文 | 本文开发了一种分支卷积神经网络(B-CNN)结合遗传算法设计合成酵母启动子,并通过微流控荧光激活细胞分选(μFACS)系统进行高通量筛选 | 结合B-CNN和遗传算法设计合成酵母启动子,并开发了μFACS系统进行高通量筛选 | NA | 提高酵母启动子的设计和筛选效率,增强基因表达和代谢物生物合成 | 合成酵母启动子 | 合成生物学 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS) | 分支卷积神经网络(B-CNN) | 序列数据 | NA |
44 | 2025-06-21 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 本研究通过代谢和脂滴工程的结合,在酿酒酵母中实现了friedelin的从头合成 | 首次在酿酒酵母中构建了friedelin的从头合成途径,并通过多种优化策略将产量提高了30倍 | 研究仅在摇瓶发酵规模进行,尚未进行大规模发酵验证 | 开发更高效和可持续的friedelin生产方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程、发酵优化 | NA | NA | Z28菌株在250 mL摇瓶发酵 |
45 | 2025-06-21 |
Bioproduction of a Large-Scale Library of Tryptamine Derivatives for Neuropsychiatric Drug Screening
2025-Jun-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00857
PMID:40375477
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研究论文 | 本研究通过微生物代谢工程和发酵技术,构建了一个大规模色胺衍生物库,用于神经精神药物的筛选 | 利用生物合成策略构建大规模化合物库,克服了传统合成化学在通量、规模和多样性上的限制,并实现了目标产物的纯化 | 部分目标化合物未被检测到,且生物发酵的产量相对较低 | 开发一种基于生物发酵的大规模药物筛选方法,用于神经精神疾病的治疗 | 色胺衍生物 | 合成生物学 | 神经精神疾病 | 微生物代谢工程、发酵技术 | NA | 化学化合物 | 344种可能的生物转化,产生279种产物,其中17种新型乙酰化衍生物进行了放大培养和纯化 |
46 | 2025-06-21 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
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研究论文 | 该研究开发了一种植物基因开关,通过定量表征的转移函数和计算机模型指导组装,实现了在稳定工程植物中的预测功能 | 首次在植物中开发了可编程的基因开关,并通过计算机模型指导组件选择和电路优化 | 研究主要关注基因开关的功能验证,未全面评估植物特有属性(如环境敏感性、发育可塑性)对电路预测性的影响 | 开发可预测和可编程的植物基因设备,以利用植物独特能力于可持续人类和环境系统 | 植物基因元件和基因开关电路 | 合成生物学 | NA | 定量转移函数表征、计算机建模 | 基因调控网络模型 | 基因表达数据 | 稳定工程植物(具体数量未提及) |
47 | 2025-06-21 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Jun-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
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review | 本文探讨了人工智能(AI)在基因组编辑领域的革命性作用及其应用 | AI驱动的模型提高了sgRNA设计的准确性,发现了新的Cas蛋白,并增强了基因调控网络分析 | AI驱动的基因组编辑存在数据偏见、算法透明度和意外基因修改等伦理问题 | 研究AI如何提升基因组编辑的精确性和效率 | 基因组编辑技术及其应用 | machine learning | genetic disease | CRISPR-associated systems, deep learning-based predictors, protein language models | deep learning | genomic data | NA |
48 | 2025-06-21 |
Progress and prospects in metabolic engineering approaches for isoprenoid biosynthesis in microalgae
2025-Jun-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02665-y
PMID:40533766
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综述 | 本文综述了微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法进展与前景 | 详细讨论了代谢工程和合成生物学策略在优化微藻类异戊二烯生物合成途径中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探讨微藻中类异戊二烯生物合成的代谢工程方法及其应用前景 | 微藻及其代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
49 | 2025-06-21 |
Addressing challenges in microbial manufacturing: Systematic microbial biotechnology
2025-Jun-02, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.100871
PMID:40528882
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研究论文 | 提出了一种系统微生物生物技术框架,用于解决微生物制造中的挑战,以实现经济和环境效益的最优化 | 采用系统性和整体性的方法,结合多学科技术,定制化解决微生物制造过程中的瓶颈问题 | 未提及具体的技术实施细节或实验验证结果 | 解决微生物制造在工业应用中的挑战,推动可持续循环生物经济的发展 | 微生物制造过程及其相关技术 | 合成生物学 | NA | 酶学、合成生物学、代谢工程、发酵、分离工程、AI技术 | NA | NA | NA |
50 | 2025-06-21 |
Polymeric Giant Unilamellar Vesicles Support Longevity of Native Nuclei in Protocells
2025-Jun, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400622
PMID:40529862
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research paper | 该研究通过将天然细胞核整合到聚合物巨型单层囊泡(pGUVs)中,创建了一种能够长期保持细胞核功能和完整性的原生细胞模型 | 利用双乳液微流控技术将天然细胞核整合到合成囊泡中,并证明细胞核的输入机制在原生细胞内仍保持功能,显著提高了核定位信号肽基多室胶束(NLS-MCMs)的递送效率 | NA | 开发一种简化的生物模拟系统,用于研究核过程及细胞器行为 | 天然细胞核和聚合物巨型单层囊泡(pGUVs) | 合成生物学 | NA | 双乳液微流控技术 | NA | NA | NA |
51 | 2025-06-21 |
Viral vector-based transient expression systems for plant biotechnology research at PUIs
2025, Frontiers in education
IF:1.9Q2
DOI:10.3389/feduc.2025.1598673
PMID:40520985
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mini-review | 该文探讨了病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究中的应用及其优势 | 提出病毒载体瞬时表达系统作为传统稳定遗传转化的高效替代方案,特别适合本科院校的教学与研究 | 未提及该系统的具体技术限制或潜在问题 | 推广病毒载体瞬时表达系统在本科院校植物生物技术研究和教学中的应用 | 本科院校的植物生物技术研究与教学 | 植物生物技术 | NA | 病毒载体瞬时表达系统(如TMV或Geminivirus) | NA | NA | NA |
52 | 2025-06-21 |
"Open science" meets commercial realities: a qualitative study of factors influencing sharing in synthetic biology research in Australia
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1604509
PMID:40529177
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研究论文 | 本文研究了合成生物学研究中数据和材料的共享行为,以及知识产权法规和商业化需求对其的影响 | 通过社会法律视角分析合成生物学领域的共享驱动因素和障碍,探讨学术与商业双重需求下的研究者行为模式 | 研究仅基于澳大利亚的案例,可能无法完全反映其他地区的实际情况 | 探讨合成生物学研究中数据/材料共享的影响因素及其与知识产权保护、商业化需求的关系 | 大学和商业环境中的合成生物学家以及商业化专业人士 | 合成生物学 | NA | 定性研究方法 | NA | 访谈数据 | 未明确说明具体样本量(涉及大学/商业机构的研究者及商业化专业人士) |
53 | 2025-06-21 |
Emerging technologies transforming the future of global biosecurity
2025, Frontiers in digital health
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fdgth.2025.1622123
PMID:40534823
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research paper | 探讨人工智能与合成生物学的融合如何改变全球生物安全 | 综合分析AI在生物安全中的应用及合成生物学在疫苗开发中的创新,同时探讨相关伦理和安全挑战 | 未提及具体技术实施的详细案例或数据支持 | 批判性地评估AI和合成生物学在提升全球生物安全方面的进展与风险 | 全球生物安全、公共健康准备系统 | machine learning | NA | AI、合成生物学 | NA | NA | NA |
54 | 2025-06-21 |
A robust synthetic biology toolkit to advance carboxysome study and redesign
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.08.617227
PMID:39416180
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研究论文 | 本文设计并验证了一个名为pXpressome的质粒工具包,用于稳健表达和纯化功能性α-羧酶体,并探索了通过基因突变调控羧酶体结构和性能的方法 | 开发了pXpressome工具包,实现了羧酶体的稳健表达和纯化,并通过基因突变调控其形态,提高了表达均匀性和细胞健康状态 | NA | 推进羧酶体的研究和重新设计,以增强碳固定能力或作为其他纳米封装目标的平台 | α-羧酶体 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因突变、荧光标记 | NA | NA | NA |
55 | 2025-06-20 |
Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method
2025-Jun-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00026
PMID:40536055
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研究论文 | 本研究探讨了一种优化策略,通过使用改良的连续液滴界面交叉封装方法,从水包油乳液滴中生成具有可调尺寸的巨型单层囊泡(GUVs) | 通过系统调整关键参数(如腔室旋转时间、角频率和内溶液密度)来优化GUVs的尺寸分布,并研究了内溶液盐度对封装效率的影响 | 该方法在囊泡尺寸分布上存在广泛且难以控制的问题,这是构建人工细胞的一个显著缺点 | 优化巨型单层囊泡(GUVs)的尺寸分布,以促进合成生物学应用中具有生物相关性质的细胞大小隔室的创建 | 巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | 改良的连续液滴界面交叉封装方法(modified cDICE) | NA | NA | NA |
56 | 2025-06-20 |
Cardiac Regeneration From Scar to Syncytium: Mitigating the Formation of Scar Tissue
2025-Jun-18, Cardiology in review
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/CRD.0000000000000972
PMID:40530862
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综述 | 本文综述了当前心脏再生医学中的各种方法,包括细胞疗法、细胞外囊泡、直接心脏重编程、基因编辑以及合成生物学和组织工程 | 探讨了从细胞疗法到基因编辑和合成生物学的多学科创新,重新定义了心脏护理的边界 | 未提及具体临床试验结果或大规模应用的可行性 | 探讨心脏再生医学的当前方法和未来方向,以改善心脏功能 | 心肌梗死和心力衰竭患者的心脏组织 | 心血管医学 | 心血管疾病 | 细胞疗法、细胞外囊泡、直接心脏重编程、基因编辑(CRISPR/Cas9)、合成生物学和组织工程 | NA | NA | NA |
57 | 2025-06-20 |
Synthetic biology-driven induction of mature TLS formation enhances antitumor immunity in colorectal cancer
2025-Jun-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ado8395
PMID:40531967
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研究论文 | 该研究通过合成生物学方法诱导成熟三级淋巴结构(mTLS)的形成,以增强结直肠癌(CRC)的抗肿瘤免疫反应 | 首次设计了一种表达LIGHT的工程菌株SLC,通过LIGHT-HVEM信号通路特异性诱导mTLS形成,并揭示了ILC3在该过程中的关键作用 | 研究仅在两种CRC小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 探索通过诱导mTLS形成增强结直肠癌免疫治疗效果的新方法 | 结直肠癌微环境中的免疫细胞和三级淋巴结构 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 工程菌株构建、免疫组化分析 | NA | 动物实验数据 | 两种不同CRC小鼠模型 |
58 | 2025-06-20 |
A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli
2025-Jun-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00170
PMID:40527878
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研究论文 | 开发了一种基于Tn5转座酶的系统,用于在大肠杆菌中高效实现全基因组基因激活 | 利用Tn5转座酶系统实现全基因组范围的基因激活,为功能基因组学和合成生物学提供新工具 | 未明确说明系统的插入位点偏好性或可能的脱靶效应 | 开发高效的全基因组基因激活工具以促进细菌工程研究 | 大肠杆菌的基因组 | 合成生物学 | NA | Tn5转座酶系统 | NA | 基因组数据 | 未明确说明具体样本数量 |
59 | 2025-06-20 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Jun-16, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文综述了模块化聚酮合酶(PKSs)的结构见解和合理工程策略,特别关注顺式酰基转移酶(AT)PKSs的设计 | 探讨了基于结构和机制见解选择模块化构建块和设计催化域的多维性,以及通过修饰特定域来微调底物特异性和立体化学复杂性的创新方法 | 对单个域的微小改变可能在整个装配线中传播结构和功能变化,这对合理设计顺式AT PKSs提出了重大挑战 | 增强产品产量并扩大可访问聚酮化合物的范围 | 顺式酰基转移酶(AT)聚酮合酶(PKSs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
60 | 2025-06-20 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jun-13, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
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研究论文 | 本研究在全基因组范围内鉴定了与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶,并验证了其中三个酶的功能 | 首次在全基因组范围内鉴定并验证了Ophiorrhiza pumila中与喜树碱生物合成相关的10HGOs酶的功能 | 仅验证了三个10HGOs酶的功能,未对其他12个10HGOs进行功能验证 | 鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为利用合成生物学工具在异源系统中重建喜树碱生物合成途径提供元件 | Ophiorrhiza pumila中的10-羟基香叶醇氧化还原酶(10HGOs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 15个10HGOs基因,其中3个进行了功能验证 |