合成生物学相关文章
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当前共找到 3177 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-05-29 |
Omics-driven onboarding of the carotenoid producing red yeast Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938
2024-Dec-28, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13379-w
PMID:39731599
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研究论文 | 本研究利用转录组学数据从红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938中发现了组成型和光调控启动子，并开发了一套模块化合成生物学元件库 | 结合系统生物学和合成生物学，开发了一种从组学数据快速获取遗传工具的流程，适用于非传统微生物 | 许多假定的调控启动子在合成遗传背景下表现出组成型活性，而非预期的调控特性 | 开发Xanthophyllomyces dendrorhous的遗传工具并研究其光生物学特性 | 红酵母Xanthophyllomyces dendrorhous CBS 6938 | 合成生物学 | NA | 转录组学、差异基因表达分析(DGE)、基因本体(GO)分析 | NA | 转录组数据 | 在不同波长光(红、绿、蓝、紫外)和氧化应激条件下培养的X. dendrorhous样品 |
| 42 | 2025-05-29 |
Identification of acidic stress-responsive genes and acid tolerance engineering in Synechococcus elongatus PCC 7942
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12984-5
PMID:38204133
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研究论文 | 本研究通过RNA测序比较转录组分析，在模型蓝藻Synechococcus elongatus PCC 7942中鉴定了酸性应激响应基因，并通过基因敲除和过表达实验验证了这些基因在酸耐受性中的作用 | 鉴定了六个参与酸性应激响应的基因，并通过过表达chlL和chlN基因成功提高了S. elongatus PCC 7942的酸耐受性 | 研究仅针对S. elongatus PCC 7942，未在其他蓝藻中进行验证 | 探究蓝藻的酸应激响应机制并提高其酸耐受性 | Synechococcus elongatus PCC 7942蓝藻 | 合成生物学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 43 | 2025-05-29 |
Regulation of genes encoding polysaccharide-degrading enzymes in Penicillium
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12892-8
PMID:38170318
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综述 | 本文综述了青霉菌中多糖降解酶(PPDE)的分布、功能、生物合成调控机制及高产PPDE菌株的分子育种研究进展 | 总结了青霉菌PPDE的最新研究进展，包括其分布、功能、调控机制及分子育种策略 | 作为小型综述，可能未涵盖该领域所有相关研究 | 促进通过代谢工程和合成生物学开发真菌PPDE生产，推动PPDE工业生物精炼应用 | 青霉菌(特别是草酸青霉)及其产生的植物多糖降解酶(PPDE) | 合成生物学 | NA | 分子育种、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 44 | 2025-05-29 |
Microbial host engineering for sustainable isobutanol production from renewable resources
2024-Dec, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-023-12821-9
PMID:38175234
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综述 | 本文综述了利用基因工程技术改造微生物宿主以提高可再生资源生产异丁醇的策略和合成生物学方法 | 总结了近年来通过基因工程改造天然和非天然微生物宿主以提高异丁醇产量的策略 | 讨论了工程化微生物宿主面临的挑战，如底物范围有限、溶剂耐受性低等问题 | 提高可再生资源生产生物燃料异丁醇的效率 | 微生物宿主 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-05-29 |
Minimisation of metabolic networks defines a new functional class of genes
2024-10-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52816-2
PMID:39482321
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研究论文 | 该研究通过构建最小代谢网络（MMNs）定义了一类新的功能基因——网络效率决定因子（NEDs） | 提出了一种新的计算方法来构建最小代谢网络，并定义了一类新的功能基因NEDs | 研究仅基于计算机模拟，尚未进行实验验证 | 理解代谢网络的起源并提高生物技术过程的效率 | 基因组尺度的代谢模型中的基因 | 合成生物学 | NA | 计算机模拟方法 | NA | 基因组数据 | NA |
| 46 | 2025-05-29 |
Development of a xylose-inducible and glucose-insensitive expression system for Parageobacillus thermoglucosidasius
2024-Oct-23, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13333-w
PMID:39441395
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研究论文 | 开发了一种木糖诱导且对葡萄糖不敏感的基因表达系统IExyl*，用于Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 | 通过结合xylA5p启动子及其转录调节因子XylR，并减少葡萄糖对木糖摄取的分解代谢抑制，开发了IExyl*系统 | NA | 开发一种多功能且高效的诱导表达机制，用于优化生物合成途径 | Parageobacillus thermoglucosidasius DSM 2542 | 合成生物学 | NA | 基因表达调控 | NA | NA | NA |
| 47 | 2025-05-29 |
In vivo thrombin activity in the diatom Phaeodactylum tricornutum: biotechnological insights
2024-Oct-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13322-z
PMID:39377797
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研究论文 | 本研究通过硅学分析在三角褐指藻中识别出可能编码类凝血酶蛋白的序列，并通过体内实验验证了其切割效率 | 首次在三角褐指藻中发现并验证了一种新型类凝血酶蛋白酶的存在 | 研究仅基于硅学预测和体内验证，缺乏对该蛋白酶生化特性的详细表征 | 探索三角褐指藻中类凝血酶蛋白的功能及其在生物技术中的应用潜力 | 三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)中的类凝血酶蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质结构预测、分子对接、Western blot分析 | NA | 蛋白质序列数据、蛋白质表达数据 | 使用两种包含YFP的融合蛋白构建体进行体内验证 |
| 48 | 2025-05-29 |
Synthetic biology toolkit of Ralstonia eutropha (Cupriavidus necator)
2024-Aug-29, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13284-2
PMID:39207499
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review | 本文综述了目前可用于改造和增强Ralstonia eutropha生物生产的不同合成生物学技术 | 开发一个合成生物学工具包，赋予Ralstonia eutropha菌株新的能力，用于新颖应用 | NA | 增强Ralstonia eutropha的生物生产能力，用于生产新型生物产品 | Ralstonia eutropha（Cupriavidus necator） | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 49 | 2025-05-29 |
Enhancing Escherichia coli abiotic stress resistance through ornithine lipid formation
2024-Apr-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13130-5
PMID:38587638
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研究论文 | 通过工程改造大肠杆菌使其产生鸟氨酸脂质，以增强其对非生物胁迫的抗性 | 首次将鸟氨酸脂质（OLs）的合成能力引入原本不具备此能力的大肠杆菌中，并证明其能增强胁迫抗性和生物量产量 | 研究仅针对特定胁迫条件（如pH变化和磷酸盐限制），未涵盖所有可能的非生物胁迫 | 通过改造大肠杆菌的膜脂组成，构建具有增强非生物胁迫抗性的宿主，用于生物技术和合成生物学应用 | 大肠杆菌（Escherichia coli）及其工程改造菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程（表达合成操纵子olsFC）、转录组分析 | NA | 基因表达数据、生长表型数据 | 多种工程改造的大肠杆菌菌株 |
| 50 | 2025-05-29 |
DNA methylases for site-selective inhibition of type IIS restriction enzyme activity
2024-Jan-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13015-7
PMID:38270650
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研究论文 | 本研究旨在生产能够体外抑制IIS型限制酶BsaI、BpiI或LguI活性的重组DNA甲基化酶 | 通过克隆和表达来自I型和II型R-M系统的甲基化酶，优化其表达条件，并验证其在体外选择性抑制IIS型限制酶活性的能力 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内应用或更复杂的生物系统 | 开发新型分子和合成生物学工具，特别是用于DNA组装技术 | DNA甲基化酶及其对IIS型限制酶活性的抑制作用 | 合成生物学 | NA | 重组DNA技术、蛋白质表达与纯化、DNA甲基化分析 | NA | NA | 十种来自I型和II型R-M系统的甲基化酶 |
| 51 | 2025-05-28 |
Microfluidics-driven templating preparation of polymer vesicles with tailorable dimensions and rapid cellular internalization
2025-May-27, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm00377f
PMID:40237355
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研究论文 | 本文提出了一种基于微流控技术的聚合物囊泡制备方法，实现了对囊泡尺寸的可控调节和快速细胞摄取 | 首次报道了微球模板策略，结合微流控精确控制和嵌段共聚物自组装，克服了传统方法的限制 | NA | 开发一种可控尺寸和快速细胞摄取的聚合物囊泡制备方法 | 聚合物囊泡 | 纳米技术 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
| 52 | 2025-05-28 |
Deep mutational scanning and CRISPR-engineered viruses: tools for evolutionary and functional genomics studies
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00508-24
PMID:40272173
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review | 本文综述了深度突变扫描和基于CRISPR的基因组编辑这两种强大的方法，用于病毒蛋白的全面诱变和功能表征 | 利用合成生物学和测序技术的最新进展，实现对病毒基因组的精确操控，为病毒进化和适应提供深入理解 | NA | 探讨深度突变扫描和CRISPR基因组编辑在病毒进化、功能基因组学研究中的应用及其对疫苗开发和治疗策略的潜在影响 | 病毒基因组和病毒蛋白 | 合成生物学 | NA | 深度突变扫描, CRISPR基因组编辑 | NA | 基因组数据 | NA |
| 53 | 2025-05-28 |
Ponceau S as a Targeted Modulator for Protein Liquid-Liquid Phase Separation
2025-May-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c06432
PMID:40353860
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研究论文 | 本研究介绍了Ponceau S作为一种选择性调节剂，用于诱导和监测蛋白质的液-液相分离（LLPS） | 首次提出Ponceau S作为小分子调节剂，能够精确调控蛋白质的液-液相分离，并通过其荧光特性监测相分离过程 | 研究仅针对牛血清白蛋白和溶菌酶两种蛋白质，未验证其在更广泛蛋白质体系中的适用性 | 探索小分子对蛋白质液-液相分离的精确调控方法 | 牛血清白蛋白和溶菌酶 | 生物分子工程 | NA | 荧光监测技术 | NA | 实验数据 | 两种蛋白质（牛血清白蛋白和溶菌酶） |
| 54 | 2025-05-28 |
Mitigating Uricase Immunogenicity through Zwitterionic Peptide Fusion for Enhanced Gout Therapy
2025-May-27, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.5c00829
PMID:40374583
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研究论文 | 通过合成生物学方法将两性离子肽与尿酸氧化酶融合，降低其免疫原性，从而增强痛风治疗效果 | 利用不同长度的两性离子肽（重复VPKEG序列）融合尿酸氧化酶，显著降低其免疫原性，并提高酶活性、底物亲和力及血液循环时间 | 研究仅在大鼠痛风模型中进行验证，尚未进行人体临床试验 | 开发低免疫原性的尿酸氧化酶以增强痛风治疗效果 | 尿酸氧化酶及两性离子肽融合蛋白 | 合成生物学 | 痛风 | 合成生物学 | NA | NA | 大鼠痛风模型 |
| 55 | 2025-05-28 |
Engineering a Biosynthetic Pathway for the Production of (+)-Brevianamides A and B in Escherichia coli
2024-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627567
PMID:39713314
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研究论文 | 该研究设计了一种在大肠杆菌中生产(+)-brevianamides A和B的生物合成途径 | 结合合成生物学、生物催化和合成化学方法，设计了一个五步工程生物合成途径，用于生产复杂的吲哚生物碱 | NA | 简化对含有BDO核心的二酮哌嗪天然产物的获取途径 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |
| 56 | 2025-05-27 |
Research progress and development prospects of microbial synthesis of ergothioneine
2025-May-26, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04415-6
PMID:40415044
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综述 | 本文综述了麦角硫因的微生物合成研究进展与发展前景 | 系统梳理了麦角硫因的应用、代谢途径、微生物合成策略及发酵优化方法，并展望了未来研究方向与技术挑战 | 未涉及具体实验数据或案例分析 | 提高麦角硫因的生物合成效率以满足市场需求 | 麦角硫因及其微生物合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程与发酵工艺优化 | NA | 文献资料 | NA |
| 57 | 2025-05-27 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine sensing mRNA element
2025-May-22, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文研究了2'-脱氧鸟苷（2'-dG）感应mRNA元素的遗传开关机制，揭示了调控螺旋在转录调控中的关键作用 | 发现dGsw-int转录中间体在无配体时形成稳定的抗终止螺旋（ON状态），而在2'-dG存在时该螺旋解离（OFF状态），提出代谢物感应发生在两个转录中间体合成的短暂时间窗口 | 研究主要基于体外化学探测和荧光淬灭实验，未涉及体内复杂环境验证 | 阐明2'-dG感应核糖开关的精细调控机制及其在转录过程中的动态变化 | 2'-脱氧鸟苷感应核糖开关（dGsw）及其转录中间体（dGsw-fl和dGsw-int） | 分子生物学 | NA | 化学探测技术、荧光淬灭实验 | NA | 生物化学数据 | NA |
| 58 | 2025-05-27 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 该研究展示了通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | 通过编程控制基因可用时间，利用位点特异性重组酶纠正多基因电路中的不良效应，显著提高了传感器的动态范围和特异性 | NA | 提高合成生物学中基因电路的稳健性和性能 | 内源性microRNA (miRNA)的比例传感器 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 59 | 2025-05-26 |
Development of Dipeptide-Based Liquid Droplets and Fibrils as Enzyme-Mimics
2025-May-24, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503916
PMID:40411841
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research paper | 开发了一种基于二肽的液滴和纤维作为酶模拟物 | 设计了一种简单的二肽，能够自凝聚成微米级液滴，并可作为微反应器用于疏水反应物，同时在不同pH值下形成纤维状组装体，作为高效的酯酶模拟催化剂 | NA | 探索最小化设计的超分子催化剂在酶学和合成生物学中的应用 | 二肽自凝聚形成的液滴和纤维 | synthetic biology | NA | liquid-liquid phase separation (LLPS) | NA | NA | NA |
| 60 | 2025-05-26 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
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研究论文 | 本文描述了一种通过RNA-DNA三链体调节转录速率的机制，并在大肠杆菌启动子设计的架构中验证了其能力 | 揭示了RNA-DNA三链体通过扭曲双链DNA结构来增强或抑制转录的新机制 | 实验证据仍缺乏在更复杂生物（如哺乳动物）中的验证 | 探究非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | 大肠杆菌启动子及其与RNA-DNA三链体的相互作用 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征 | NA | NA | NA |