合成生物学相关文章
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当前共找到 3514 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-08-09 |
Decoding NF-κB: nucleocytoplasmic shuttling dynamics, synthetic modulation and post-therapeutic behavior in cancer
2025-Aug-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10917-1
PMID:40775128
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综述 | 本文回顾了核因子κB（NF-κB）的结构、功能及其在癌症治疗中的行为，并探讨了通过合成生物学工具调控NF-κB的潜力 | 探讨了NF-κB核质穿梭的时空调节和分子动力学，以及利用合成基因电路和光遗传学工具精确控制NF-κB的创新方法 | NF-κB复合物的随机变异性导致单细胞水平的异质性反应，且缺乏明确的药物靶点，使其在癌细胞中的完全抑制具有挑战性和不确定性 | 研究NF-κB的调控机制及其在癌症治疗后的行为，以克服耐药性 | 核因子κB（NF-κB）及其在癌症中的调控机制 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路、光遗传学工具 | NA | NA | NA |
| 42 | 2025-08-09 |
CloneFast: A simple plasmid design and construction guide for labs venturing into synthetic biology
2025-Aug-06, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104025
PMID:40773353
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research paper | 介绍CloneFast指南，一种简化质粒构建的方法 | 提出CloneFast指南，通过生物信息学设计和实验步骤优化，实现高效质粒构建 | 未提及具体实验验证数据或与其他方法的比较 | 简化质粒构建过程，提高效率和可及性 | 质粒设计和构建 | 合成生物学 | NA | CompetePCR, 碘介导的切割 | NA | 生物信息学设计数据 | NA |
| 43 | 2025-08-09 |
Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase
2025-Aug-05, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003
PMID:40774389
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SacB的基因编辑系统，用于探索细菌纤维素合酶在细菌纤维素合成和结构中的功能 | 开发了pK18mobsacB系统，实现了标记自由的基因编辑，效率高达83.33%，并成功应用于细菌纤维素合酶的功能研究 | NA | 提高细菌纤维素生产菌株的基因编辑效率，简化操作流程，实现无疤痕修饰，并探索细菌纤维素合酶的功能 | Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955及其细菌纤维素合酶 | 合成生物学 | NA | SacB介导的基因编辑系统 | NA | NA | NA |
| 44 | 2025-08-09 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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综述 | 本文综述了基因组记录领域的最新进展，特别是基于CRISPR的基因组编辑技术在细胞事件记录中的应用 | 探讨了构建多样化传感器的新策略，并探索新兴合成生物学工具如何帮助构建用于记录多样化细胞事件的分子电路 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限，其在揭示细胞命运决定新见解方面的潜力尚未实现 | 开发新的传感模块和遗传电路架构，将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中 | 细胞事件 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based genome editing | NA | 基因组数据 | NA |
| 45 | 2025-08-09 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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review | 本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用 | 探讨了机器学习与合成生物学结合在生物制造中的创新应用，包括化学生产、人类健康和环境修复 | NA | 为生物制造与人工智能交叉领域的未来研究提供有价值的指导 | 微生物细胞工厂 | machine learning | NA | synthetic biology | NA | NA | NA |
| 46 | 2025-08-09 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 本研究开发了一种能够持续产生硫化氢（H₂S）以实现治疗性血管舒张的红细胞微反应器 | 通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中，创建了一种新型微反应器，能够持续产生H₂S并有效诱导血管舒张 | 研究仅在体外实验中验证了微反应器的效果，尚未进行体内实验 | 开发一种能够模拟天然细胞执行重要代谢过程并与生物系统相互作用的治疗性微反应器 | 红细胞微反应器及其在H₂S产生和血管舒张中的应用 | 合成生物学与生物工程 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法、荧光成像 | NA | 体外实验数据、荧光成像数据 | 体外实验使用分离的胸主动脉环 |
| 47 | 2025-08-09 |
Exploring the Application and Prospects of Synthetic Biology in Engineered Living Materials
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202305828
PMID:37677048
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程活性材料（ELMs）中的应用与前景，探讨了其在环境修复、生态建筑和可持续能源等领域的潜力 | 全面概述了ELMs的最新研究进展和新兴设计策略，并探讨了不同种类ELMs之间的协同应用可能性 | 未提及具体实验数据或案例研究，主要基于文献综述 | 探讨合成生物学在工程活性材料中的应用及未来发展 | 细菌、真菌和植物衍生的工程活性材料（ELMs） | 合成生物学与材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2025-08-09 |
Protein structure prediction and design for high-throughput computing
2025-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.18.665594
PMID:40777508
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研究论文 | 本文介绍了针对高吞吐量计算的蛋白质结构预测和设计工具，并提出了容器化解决方案以优化这些工具在不同计算架构上的部署 | 开发了针对AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2和RFdiffusion的容器化解决方案，并提出了OmniFold平台，优化了这些工具在GPU系统上的使用效率 | 这些算法的采用受到高计算需求和部署难度的影响 | 优化蛋白质结构预测和设计工具在高吞吐量计算环境中的部署和使用 | 蛋白质结构预测和设计工具（AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2、RFdiffusion） | 分子生物学 | NA | 机器学习、容器化技术 | AlphaFold3、Chai-1、Boltz-2、RFdiffusion | 蛋白质结构数据 | NA |
| 49 | 2025-08-08 |
Engineering DNA nanopores: from structural evolution to sensing and transport
2025-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102137
PMID:40761509
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综述 | 本文回顾了DNA纳米孔的结构演变及其在分子传感和跨膜运输中的应用 | 整合了DNA纳米孔的结构演变与关键局限性分析，并突出了单分子传感和受控跨膜运输的突破 | 稳定性、可扩展性和噪声等问题 | 探讨DNA纳米孔在合成生物学和纳米医学中的优化路径 | DNA纳米孔 | 纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-08-08 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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research paper | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的前景及其在提高粮食安全、应对气候变化和实现可持续农业实践方面的潜力 | 整合先进的遗传工具、计算模型和系统生物学，精确修改植物基因组以增强产量、胁迫耐受性和养分利用效率等性状 | 面临监管审批和公众接受的挑战，需要严格的跨领域测试以确保可重复性 | 探讨植物合成生物学在农业中的应用，以解决全球粮食安全挑战 | 植物基因组及其在农业中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传工具、计算模型、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA |
| 51 | 2025-08-08 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文综述了模块化聚酮合酶（PKSs）的结构见解和理性工程策略，特别关注顺式酰基转移酶（AT）PKSs的设计和改造 | 系统总结了基于结构和机制见解的模块化构建块选择和催化域设计策略，为合成生物学和天然产物发现提供了新思路 | 对单个结构域的微小改变可能在整个组装线上传播结构和功能变化，这对理性设计提出了重大挑战 | 探索顺式AT PKS的多维设计，以增强产品产量并扩大可获得的聚酮化合物库 | 顺式酰基转移酶（AT）聚酮合酶（PKSs） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2025-08-08 |
[Research progress in the fungal bioluminescence pathway]
2025-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250138
PMID:40769542
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综述 | 本文综述了真菌生物发光途径（FBP）的研究进展及其在植物基因工程中的应用 | 通过基因工程将FBP引入植物，创造出具有自主发光能力的转基因植物，克服了传统报告系统的底物限制，为园艺生产、环境保护和生物工程应用提供了新的机会 | NA | 探讨植物FBP工程的最新进展以及如何利用机器学习方法优化自主发光表型，以加速农业生物技术、环境传感和合成生物学应用的创新 | 真菌生物发光途径（FBP）及其在转基因植物中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、机器学习 | NA | NA | NA |
| 53 | 2025-08-08 |
Regulatory helix plays a key role in genetic ON-OFF switching for the 2'-deoxyguanosine-sensing mRNA element
2025-Jul, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110282
PMID:40412519
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研究论文 | 本文研究了2'-脱氧鸟苷感知mRNA元素的遗传开关调控机制 | 揭示了2'-脱氧鸟苷感知核糖开关在转录中间体阶段的调控机制，而非简单的二元开关 | 研究主要基于体外实验，未涉及体内复杂环境的影响 | 探究核糖开关在转录过程中的动态调控机制 | 2'-脱氧鸟苷感知核糖开关（dGsw）及其转录中间体 | 分子生物学 | NA | 化学探测、荧光淬灭实验 | NA | 生化实验数据 | NA |
| 54 | 2025-08-08 |
A new mRNA structure prediction based approach to identifying improved signal peptides for bone morphogenetic protein 2
2024-05-23, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00858-1
PMID:38783306
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研究论文 | 提出了一种基于mRNA结构预测的新方法，用于筛选改进的骨形态发生蛋白2（BMP2）信号肽 | 结合mRNA结构预测和氨基酸序列分析，系统筛选信号肽序列，为信号肽工程提供新工具 | mRNA结构预测的准确性有待提高，且筛选的信号肽在C2C12细胞中表现不佳 | 开发一种基于计算工具的系统方法，改进BMP2信号肽以提高其分泌效率 | 骨形态发生蛋白2（BMP2）的信号肽 | 合成生物学 | 骨再生 | SignalP, DeepLoc, MXFold2 | NA | 核苷酸序列, 氨基酸序列 | 2,611个TGF-β超家族信号肽 |
| 55 | 2025-08-07 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
|
综述 | 本文综述了红酵母作为可持续食品生物技术潜在底盘的研究进展 | 探讨了红酵母在多组学生物学、细胞工厂创建及合成生物学工具箱方面的最新进展 | 红酵母代谢工程仍面临多组学信息挖掘不足、遗传工具箱效率低下及独特代谢特征理解不充分等挑战 | 探索红酵母作为食品成分生产细胞工厂的潜力 | 红酵母(Rhodotorula spp.) | 食品生物技术 | NA | 多组学分析、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 56 | 2025-08-07 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法全面研究了丝状真菌中大黄素葡萄糖苷的生物合成，并开发了一种高效生产策略 | 评估了十种高效的大黄素UDP-葡萄糖基转移酶（EUGTs），并开发了一种全细胞催化系统，实现了78.9%的高转化率 | 植物源蛋白在丝状真菌中表达的挑战阻碍了进一步优化 | 开发大黄素葡萄糖苷的高效生产策略 | 大黄素-6-β-d-葡萄糖苷（E6G）和大黄素-8-β-d-葡萄糖苷（E8G） | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法，全细胞催化系统 | NA | NA | 十种大黄素UDP-葡萄糖基转移酶（EUGTs） |
| 57 | 2025-08-07 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2025-Aug-06, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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review | 本文综述了植物异戊二烯基转移酶（PTs）的多样性、催化活性、机制及其在异源生产异戊二烯化天然产物（PNPs）中的应用 | 系统总结了160多种已报道的植物UbiA型PTs和代表性异戊二烯二磷酸合成酶（IDSs），并探讨了它们的分类、功能、催化机制及酶工程策略 | 植物PTs的功能多样性仍未得到充分理解 | 推进PTs的表征和应用，为基于PNPs的药物开发奠定基础 | 植物异戊二烯基转移酶（PTs）和异戊二烯化天然产物（PNPs） | 合成生物学 | NA | 基因组学和合成生物学 | NA | NA | 超过160种植物UbiA型PTs和代表性IDSs |
| 58 | 2025-08-07 |
Iterative recombinase technologies for efficient and precise genome engineering across kilobase to megabase scales
2025-Aug-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.07.011
PMID:40763736
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研究论文 | 介绍两种可编程染色体编辑系统PCE和RePCE，实现植物和人类细胞中无疤痕的千碱基到兆碱基DNA操作 | 开发了Lox位点的高通量工程和AI辅助重组酶工程方法(AiCE)，显著提高了重组效率和编辑精度 | 未提及在更复杂生物体中的应用效果 | 扩大基因组编辑在分子育种、治疗开发和合成生物学中的应用范围 | 植物和人类细胞 | 合成生物学 | NA | AI辅助重组酶工程(AiCE)、Re-pegRNA介导的无疤痕策略 | NA | DNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括水稻和人类细胞 |
| 59 | 2025-08-07 |
A framework for complex signal processing via synthetic biological operational amplifiers
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62464-9
PMID:40745425
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研究论文 | 本研究提出了一种通过合成生物操作放大器处理复杂生物信号的框架 | 整合正交操作放大器到标准化生物过程中，实现高效信号分解和放大，并通过工程σ/anti-σ对、改变RBS强度以及使用开环和闭环配置设计可扩展的操作放大器 | NA | 提高遗传电路的精确性、适应性和信噪比，实现复杂生物网络中的信号处理 | 合成生物操作放大器、遗传电路、全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | σ/anti-σ对工程、RBS强度调整、开环和闭环配置 | NA | 生物信号 | NA |
| 60 | 2025-08-07 |
Codon usage and antibiotic resistance: A hidden evolutionary mechanism
2025-Jul-31, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2025.07.027
PMID:40752602
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综述 | 本文探讨了密码子使用与抗生素耐药性之间的隐藏进化机制 | 揭示了密码子优化在增强病原体耐药性决定因素合成中的关键作用，并提出了新的诊断生物标志物和治疗策略的潜在途径 | 未具体提及研究的局限性 | 解析密码子使用与抗生素耐药性之间的复杂相互作用，为减轻多重耐药病原体的影响提供信息 | 病原体如鲍曼不动杆菌、淋病奈瑟菌和肺炎克雷伯菌 | 生物信息学 | 抗生素耐药性 | 比较基因组分析、生物信息学和机器学习方法 | NA | 基因组数据 | NA |