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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-09-29 |
Sophisticated Interfaces Between Biosensors and Organoids: Advancing Towards Intelligent Multimodal Monitoring Physiological Parameters
2025-Aug-22, Biosensors
DOI:10.3390/bios15090557
PMID:41002297
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综述 | 本文综述了生物传感器与类器官集成的技术方法及其在药物开发、毒性测试和个性化医疗中的应用 | 系统比较了多种技术集成方法,并提出了通过多模态协作克服单一传感模式局限性的创新方案 | 未涉及具体实验数据验证,主要聚焦技术框架探讨 | 推动类器官传感技术向更高仿生性和智能化方向发展 | 类器官与生物传感器的集成系统 | 生物医学工程 | NA | 微流控集成系统、微电极阵列、光学传感、机械力传感、场效应晶体管传感、合成生物学工具、无标记技术 | NA | 电生理信号、光学信号、机械信号、化学信号 | NA |
42 | 2025-09-29 |
Advances and opportunities in gene editing and gene regulation technology for Yarrowia lipolytica
2019-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-019-1259-x
PMID:31783869
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综述 | 本文总结了针对解脂耶氏酵母的基因编辑与基因调控技术进展及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 系统梳理了CRISPR-Cas9、转座子和TALENs等新型基因编辑工具在解脂耶氏酵母中的应用突破 | NA | 探讨解脂耶氏酵母基因编辑技术的发展现状与未来机遇 | 解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 转座子, TALENs | NA | 文献资料 | NA |
43 | 2025-09-28 |
Harnessing plant agriculture to mitigate climate change: a framework to evaluate synthetic biology (and other) interventions
2025-Sep-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf410
PMID:41004568
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研究论文 | 提出评估植物农业领域合成生物学技术减缓气候变化潜力的分析框架 | 首次通过费米估算量化合成生物学策略的百年碳汇潜力,并与传统方法进行系统对比 | 基于理论估算且依赖长期(100年)假设,未涉及具体技术实施障碍 | 建立植物农业气候减缓技术的优先评估体系 | 合成生物学干预策略(如碳固定增强、生物聚合物沉积)与非工程化方法(生物炭、造林) | 合成生物学 | NA | 费米估算、生命周期评估 | NA | 理论估算数据 | NA |
44 | 2025-09-28 |
Advancing Genetically Encoded Lysine (GEK) Chemistry: From Precision Modulation to Therapeutic Innovation
2025-Sep-26, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.5c00401
PMID:41004624
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研究论文 | 本文系统性地发展了基因编码赖氨酸(GEK)化学技术,通过工程化吡咯赖氨酰-tRNA合成酶变体实现精准蛋白质修饰 | 开发了能够高效整合多样化赖氨酸衍生物的PylRS变体,整合了生物正交手柄、光交联基团和PTM模拟物等新型功能基团 | NA | 推进基因编码赖氨酸化学技术在蛋白质工程和治疗创新中的应用 | 蛋白质工程和赖氨酸定向药物设计 | 合成生物学 | NA | 基因编码赖氨酸化学、蛋白质工程 | NA | NA | NA |
45 | 2025-09-28 |
Coacervate Vesicles as Adaptive Platforms for Synthetic Biology and Smart Materials
2025-Sep-24, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502268
PMID:40827771
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综述 | 介绍凝聚层囊泡作为合成生物学和智能材料自适应平台的特性和应用前景 | 提出基于形成机制和能量景观的凝聚层囊泡分类体系,揭示不同形成路径与原型细胞特性的关联 | 该领域仍处于发展初期,实际应用尚未成熟 | 探讨凝聚层囊泡在合成生物学和智能材料领域的应用潜力 | 凝聚层囊泡(原型细胞) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
46 | 2025-09-28 |
Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening
2025-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00240-5
PMID:40994446
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综述 | 本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用,重点关注m6A介导的调控网络 | 提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学的创新路线图 | 对RNA修饰(尤其是m6A以外的修饰)的分子机制理解仍然有限 | 解析植物表观转录组的调控机制并应用于精准农业 | 植物系统(特别是被子植物)的RNA修饰 | 植物分子生物学 | NA | 表观转录组测序、CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学 | NA | 表观转录组数据 | 跨被子植物物种的比较研究 |
47 | 2025-09-28 |
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c00262
PMID:40313816
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研究论文 | 首次报道微生物通过中心硫代谢和非酶化学反应形成P=S和P=Se键 | 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究,并首次利用微生物代谢物实现化学合成中的P=Se键形成 | NA | 探索微生物代谢物在化学合成中的应用潜力 | 多种细菌及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 微生物代谢工程、非酶化学反应 | NA | 生化实验数据 | 多种细菌菌株 |
48 | 2025-09-28 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 通过基因可用性的可编程时序控制实现生物传感器电路中的数字切换 | 利用位点特异性重组酶通过可编程时序控制多基因电路中基因的可用性,显著降低传感器本底泄漏 | NA | 提高合成生物学中瞬时基因电路应用的稳健性 | 内源性microRNA比例传感器和细胞类型分类 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术 | NA | 基因表达数据 | NA |
49 | 2025-09-27 |
Glyceollin biosynthesis in a plant chassis engineered for isoflavone production
2025-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-01914-3
PMID:40437134
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研究论文 | 本研究通过代谢工程策略在本氏烟草叶片中重构了大豆抗菌化合物glyceollin的生物合成途径 | 首次鉴定出6个glyceollin合成酶并完成15步生物合成途径解析,实现了异源植物底盘的高产合成 | 研究局限于本氏烟草模型系统,尚未在作物中验证应用效果 | 解析glyceollin生物合成途径并建立植物底盘生产平台 | 大豆glyceollin生物合成途径及相关酶系 | 合成生物学 | 植物病害 | 代谢工程、酶功能鉴定、病原体抑制实验 | NA | 代谢组学数据、酶活性数据 | 本氏烟草叶片表达系统,产量达7.04 g/kg干重(前体)和5.9 g/kg干重(终产物) |
50 | 2025-09-27 |
In Situ Plant Sensors: Toward Real-Time, High-Resolution Monitoring
2025-Sep-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01494
PMID:40830763
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综述 | 本文综述了柔性可穿戴设备和基因编码传感器在植物实时原位监测中的最新进展与应用潜力 | 强调柔性可穿戴设备与基因编码传感器的协同创新,实现组织水平和细胞内分子的高分辨率实时监测 | 存在适应性、传感稳定性、空间分辨率、参数覆盖范围有限以及多模态集成等技术挑战 | 开发新一代植物传感系统以推动高通量表型分析、精准农业和植物基础生物学研究 | 植物生理状态和应激反应 | 植物传感技术 | NA | 柔性可穿戴传感、基因编码传感器(GESs) | NA | 生理参数(生长、微气候、水运输等)、分子信号(钙、活性氧、植物激素等) | NA |
51 | 2025-09-27 |
An Engineered Probiotic Consortium Based on Quorum-Sensing for Colorectal Cancer Immunotherapy
2025-Sep-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512744
PMID:40999885
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研究论文 | 设计了一种基于群体感应的工程益生菌联合体,用于结直肠癌免疫治疗 | 开发了能够整合多种肿瘤微环境信号并通过正交群体感应系统协调多治疗载荷释放的工程益生菌联合体 | NA | 开发用于癌症治疗的工程化活体生物治疗产品 | 工程益生菌联合体及其在结直肠癌治疗中的应用 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学、正交群体感应系统 | NA | 实验数据 | 使用hPD-L1 MC38肿瘤的人源化PD-1小鼠模型和携带HT-29肿瘤的人源化外周血单核细胞小鼠模型 |
52 | 2025-09-27 |
Strategies to improve photosynthesis by modifying the RuBisCO system and its limitations
2025-Sep-26, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11075-0
PMID:41003756
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综述 | 本文综述了通过改造RuBisCO系统提高光合效率的策略及其局限性 | 系统整合了从蛋白质工程到合成生物学等多学科策略,并探讨了人工智能在预测突变和指导蛋白质设计中的应用 | 讨论了各种改良方法的固有局限性 | 提高RuBisCO酶的光合效率以增强作物生产力 | RuBisCO酶系统及其相关调控机制 | 合成生物学/植物生物技术 | NA | 蛋白质工程、合成生物学、人工智能预测 | 机器学习 | 文本/综述分析 | NA |
53 | 2025-09-27 |
Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules
2025-Sep-25, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc02423d
PMID:40905114
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研究论文 | 开发了一种能够模拟细胞区室化的动态多相凝聚系统,实现选择性分子分配 | 通过动态膜化形成核壳结构凝聚体,可根据极性选择性定位颗粒和小分子 | NA | 构建仿生化学系统用于催化作用和合成生物学应用 | 多相凝聚体系统 | 合成生物学 | NA | pH响应平台技术 | NA | NA | NA |
54 | 2025-09-27 |
Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials
2025-Sep-25, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00620
PMID:40999683
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综述 | 本文探讨了合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何推动具有环境响应功能的可编程绿色纳米材料的发展 | 将生物相容性从静态属性重新定义为动态可编程特性,使纳米材料能够像复杂生物实体一样自主响应生物信号 | 在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在重大挑战 | 开发具有动态生物界面和自适应功能的新一代绿色纳米材料 | 可编程纳米材料 | 纳米医学 | NA | 合成生物学、DNA纳米技术、人工智能、4D生物打印、代谢工程 | 机器学习 | NA | NA |
55 | 2025-09-27 |
Probiotic-Based Materials as Living Therapeutics
2025-Sep-25, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508500
PMID:40999775
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综述 | 本文综述了基于基因工程益生菌的益生菌活性材料在生物医学应用中的潜力与挑战 | 提出了益生菌活性材料这一新概念,区别于传统活体生物治疗产品,整合了合成生物学与材料科学 | 缺乏稳健的益生菌基因工程工具包、存在生物安全问题、临床转化困难以及监管框架不明确 | 探讨PLMs作为靶向动态疗法的生物医学应用前景 | 基因工程益生菌与基质材料结合的活性材料系统 | 合成生物学与生物材料 | 多疾病领域(感染、骨骼修复、伤口愈合、阴道失衡、肠道疾病、癌症等) | 基因工程技术与材料合成技术 | NA | 文献综述数据 | NA |
56 | 2025-09-27 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-Sep-24, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
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研究论文 | 本研究结合全细胞模型和机器学习技术,加速了大肠杆菌简化基因组的设计过程 | 利用机器学习代理模型将全细胞模型的计算时间减少95%,并成功设计出基因减少40%的大肠杆菌简化基因组 | 全细胞模型本身存在运行时间长的局限性 | 开发加速基因组设计的计算方法 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 全细胞模型、机器学习、基因本体分析 | 机器学习代理模型 | 计算模拟数据 | 计算机模拟的大肠杆菌细胞 |
57 | 2025-09-27 |
RNA Polymerase III Promoters Compatible with CRISPR Gene Regulation in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00122
PMID:40824237
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研究论文 | 本研究鉴定并表征了20个RNA聚合酶III启动子在酿酒酵母中用于CRISPR基因调控的适用性 | 首次系统评估跨物种来源的Pol III启动子在酵母CRISPR系统中的功能,发现支架介导的效应子招募可挽救部分启动子功能 | 研究仅限于酿酒酵母模型,未在其他真核生物中验证启动子兼容性 | 开发适用于酵母CRISPR系统的多基因同步调控工具 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的基因调控系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | 基因表达数据 | 20个来自不同物种的RNA Pol III启动子 |
58 | 2025-09-27 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2025-Sep-19, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于嗜热菌Acetivibrio thermocellus的L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在嗜热非模式微生物中构建了热稳定的L-阿拉伯糖诱导系统,将诱导倍数从5.4倍提升至175倍 | NA | 开发适用于嗜热菌的精确基因表达调控工具 | Acetivibrio thermocellus(热纤梭菌) | 合成生物学 | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | 实验数据 | NA |
59 | 2025-09-27 |
Systematic Optimization Enables Near-Perfect In Vitro Transformation Efficiencies for Spirodela polyrhiza (Greater Duckweed)
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675371
PMID:41000642
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研究论文 | 本研究系统优化了浮萍(Spirodela polyrhiza)的体外转化流程,实现了接近完美的转化效率 | 首次实现浮萍体外转化全流程的系统优化,在各关键步骤达到90%-100%的高效率,并将转化周期从数月缩短至数周 | 研究主要针对浮萍单一物种,未验证在其他植物物种的适用性 | 优化浮萍的体外遗传转化技术,克服转化过程中的技术瓶颈 | 浮萍(Spirodela polyrhiza,大浮萍)植物材料 | 植物生物技术 | NA | 体外遗传转化技术、愈伤组织诱导、转基因筛选、植物再生 | NA | 实验数据 | 转化植株稳定表达超过100代 |
60 | 2025-09-27 |
Recent Advances in Heterologous Protein Expression and Natural Product Synthesis by Aspergillus
2025-Jul-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11070534
PMID:40985424
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综述 | 本文综述了曲霉属真菌作为异源表达底盘在异源蛋白表达和天然产物合成方面的最新研究进展 | 重点探讨了CRISPR-Cas9技术在曲霉遗传改造中的应用现状及在萜类化合物异源生物合成中的创新应用 | NA | 总结曲霉平台在异源蛋白表达和天然产物生物合成领域的技术发展 | 曲霉属真菌(包括米曲霉、黑曲霉等) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | 文献资料 | NA |