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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-05-03 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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research paper | 该文章探讨了如何将生物分子模拟与代谢模型相结合,以推动结构引导的合成生物学应用 | 提出了将生物分子模拟和机器学习预测整合到代谢模型中的新方法,以优化和理解代谢途径 | 尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型整合的实际应用效果和具体案例 | 优化和理解代谢途径,以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的细胞代谢 | 合成生物学 | NA | 生物分子模拟, 机器学习 | flux balance analysis, dynamic, kinetic delineations | 代谢网络数据 | NA |
42 | 2025-05-03 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学中的应用 | 结合AI工具(如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN)显著提高了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在设计和应用生物纳米分子组装方面的潜力 | 有限组装(如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构)和扩展组装(如细丝和2D/3D晶格) | 合成生物学、材料科学、生物技术、生物医学 | NA | 蛋白质工程、AI工具(AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN) | NA | NA | NA |
43 | 2025-05-03 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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research paper | 该研究通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径引入水稻,以克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径引入水稻,并发现NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基,获得了具有Fe蛋白活性且抵抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NifH在水稻细胞质中仍不稳定,需要进一步优化以提高其稳定性 | 通过工程化方法实现谷物中的固氮作用,减少化学氮肥的使用 | 水稻 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组数据、蛋白质数据 | 转基因水稻品系L12-13和L8-17 |
44 | 2025-05-03 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
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review | 本文综述了跨学科领域中用于设计响应性生物材料的增材制造策略,并展望了如何将印刷响应性生物材料(PRBs)融入日常物品和建筑中以增强环境和人类健康 | 探讨了增材制造在生物材料科学、生物材料制造、合成生物学、生物医学工程、生物设计和活体建筑中的最新进展,展示了多感官互动的日常产品和建筑环境的新时代 | NA | 探索如何利用增材制造技术设计和集成响应性生物材料,以提升环境和人类健康 | 响应性生物材料及其在日常生活和建筑中的应用 | 生物材料科学 | NA | 增材制造(AM) | NA | NA | NA |
45 | 2025-05-03 |
Artificial intelligence driven innovations in biochemistry: A review of emerging research frontiers
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.11537
PMID:39819459
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综述 | 本文综述了人工智能在生物化学领域的应用及其对研究能力的提升 | 探讨了人工智能在生物化学中的当前及潜在应用,特别是在数据分析、分子建模、酶工程和代谢途径研究方面 | 面临数据质量、模型可解释性和伦理问题等挑战 | 评估人工智能在生物化学领域的应用及其未来潜力 | 生物化学研究中的复杂数据集、分子相互作用、药物发现等 | 生物化学 | NA | 机器学习算法、自然语言处理、基于AI的分子建模 | AlphaFold | 复杂数据集 | NA |
46 | 2025-05-03 |
Mechanisms and applications of bacterial luciferase and its auxiliary enzymes
2025-Mar, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110307
PMID:39824239
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review | 本文综述了细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶的机制和应用 | 最近的研究阐明了C4a-氢过氧黄素形成的机制,并确定了关键催化残基如His44,这些发现有助于理解光生成过程中重要的黄素中间体的产生 | 仍存在一些挑战性问题,如实现红移发射、优化信号强度以及确定与发光物种生成相关的机制 | 深入了解LuxAB反应的机制,并探索其在生物技术和生物医学领域的应用 | 细菌荧光素酶(LuxAB)及其辅助酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
47 | 2025-05-03 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
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综述 | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶(ectoine)的策略,包括野生菌株筛选、突变育种和模型菌株的代谢工程 | 探讨了利用合成生物学和代谢工程技术,通过非嗜盐工程菌株高效生产四氢嘧啶的创新方法 | 未提及具体实验数据或生产规模限制 | 探索更经济高效的四氢嘧啶生产方法以满足市场需求 | 四氢嘧啶及其微生物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
48 | 2025-05-03 |
Maize2035: A decadal vision for intelligent maize breeding
2025-Feb-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.012
PMID:39827366
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Perspective paper | 本文概述了玉米育种的历史成功,并探讨了实现可持续农业的全面性状改良方法 | 讨论了前沿解决方案,包括从单细胞分析到全息生物的多组学方法、智能育种与先进技术和算法,以及合成生物学方法的变革潜力 | 未提及具体的技术实施细节或数据支持 | 探讨玉米育种在可持续农业中的未来发展方向 | 玉米 | 农业生物技术 | NA | 多组学方法、智能育种、合成生物学 | NA | NA | NA |
49 | 2025-05-03 |
Bacillus methanolicus: an emerging chassis for low-carbon biomanufacturing
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.06.013
PMID:39033040
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学方法改造Bacillus methanolicus以提高其在低碳生物制造中的效率 | 提出利用代谢建模和基因组编辑等合成生物学方法优化Bacillus methanolicus,以提升其在低碳生物制造中的应用潜力 | 当前Bacillus methanolicus的效率尚未达到工业化要求 | 提高Bacillus methanolicus在低碳生物制造中的效率 | Bacillus methanolicus | 合成生物学 | NA | 代谢建模, 基因组编辑 | NA | NA | NA |
50 | 2025-05-03 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
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研究论文 | 本文概述了一个旨在为微生物学领域提供公平的高影响力研究经验和课程指导的途径计划 | 提出了一个促进微生物学领域多样化的途径计划,重点包括噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等新兴领域 | NA | 促进微生物学领域的多样化劳动力发展 | 微生物学领域的学生和研究人员 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
51 | 2025-05-03 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
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review | 本文综述了生物分子凝聚体(BMCs)在合成和应用方面的最新进展 | 介绍了合成生物分子凝聚体(SBMCs)的新方法及其在基础和应用研究中的潜力 | 对BMCs的内部组织和外部调控的理解仍处于早期阶段 | 探讨生物分子凝聚体的合成原理、调控方法及其科学应用 | 生物分子凝聚体(BMCs)及其合成版本(SBMCs) | 合成生物学 | NA | 合成生物学、相分离技术 | NA | NA | NA |
52 | 2025-05-03 |
Rational Design of Dual-Targeted Nanomedicines for Enhanced Vascular Permeability in Low-Permeability Tumors
2025-01-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c12808
PMID:39797815
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成生物学的方法,设计双靶向纳米药物以增强低渗透性肿瘤中的血管通透性 | 利用基因工程逻辑门控策略,构建了具有可调比例RGD靶向和固有TfR1靶向配体的双靶向铁蛋白纳米笼(Dt-FTn),并通过机器学习单血管分析揭示了双受体表达谱在低渗透性肿瘤中的关键作用 | 研究仅针对低渗透性肿瘤,未涉及其他类型肿瘤的验证 | 提高双靶向纳米药物在低渗透性肿瘤中的递送效率 | 双靶向铁蛋白纳米笼(Dt-FTn)及其在低渗透性肿瘤中的血管通透性 | 纳米医学 | 结肠癌 | 合成生物学、基因工程、机器学习 | 逻辑门控策略 | 实验数据、单血管分析数据 | 患者来源的结肠癌模型 |
53 | 2025-05-03 |
Evolution of interorganismal strigolactone biosynthesis in seed plants
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp0779
PMID:39818909
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research paper | 研究种子植物中跨生物体独脚金内酯的生物合成进化 | 揭示了CYP722A在非经典独脚金内酯16-OH-CLA合成中的作用,并提出了其在经典独脚金内酯进化中的代谢过渡假说 | 研究主要关注开花植物,未涵盖所有种子植物 | 探究独脚金内酯生物合成的进化路径 | 种子植物中的独脚金内酯生物合成途径 | 植物分子生物学 | NA | 合成生物学 | NA | 分子生物学数据 | 多种开花植物的地上部分组织 |
54 | 2025-05-03 |
S-layers: from a serendipitous discovery to a toolkit for nanobiotechnology
2025-Jan-17, Quarterly reviews of biophysics
IF:7.2Q1
DOI:10.1017/S0033583524000106
PMID:39819733
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综述 | 本文回顾了S层(表面层)研究的早期科学探索,特别关注了'维也纳S层研究组'的贡献,并探讨了S层在生物技术和纳米技术中的应用潜力 | 详细介绍了S层作为最简单的生物膜在进化中的发展及其多功能性,以及在生物技术、纳米技术等领域的应用潜力 | 文章主要基于历史回顾和个人观点,可能缺乏最新的实验数据和应用案例 | 探讨S层的结构、功能及其在生物技术和纳米技术中的应用 | 原核微生物的S层结构 | 纳米生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
55 | 2025-05-03 |
Heterologous Biosynthesis of Terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400712
PMID:39834096
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research paper | 本文主要关注在酿酒酵母中异源表达萜类化合物的研究 | 利用合成生物学和代谢工程技术构建高效的微生物细胞工厂,用于大规模生产萜类化合物 | 当前挑战包括如何进一步优化酵母底盘以提高萜类化合物的生产效率 | 研究萜类化合物的异源生物合成方法 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
56 | 2025-05-03 |
SynNotch CAR-T cell, when synthetic biology and immunology meet again
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1545270
PMID:40308611
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综述 | 本文探讨了合成Notch(synNotch)受体与CAR-T细胞疗法的革命性结合,旨在克服传统方法在实体瘤治疗中的固有局限性 | 引入synNotch受体作为分子逻辑门,实现T细胞活化的精确、多抗原调控,提高特异性和控制性 | 虽然synNotch CAR-T细胞在实体瘤治疗中展现出潜力,但其临床应用仍面临免疫逃避、肿瘤异质性和脱靶效应等挑战 | 探索synNotch系统与CAR-T细胞疗法的整合,以提升靶向癌症治疗的效果和安全性 | CAR-T细胞和synNotch受体 | 合成生物学与免疫学 | 实体瘤 | synNotch受体设计 | NA | NA | NA |
57 | 2025-05-02 |
CYP98A monooxygenases: a key enzyme family in plant phenolic compound biosynthesis
2025-Jun, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf074
PMID:40303436
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review | 本文综述了CYP98A单加氧酶家族在植物酚类化合物生物合成中的关键作用及其分子特征 | 首次系统总结了CYP98A单加氧酶家族的分子特征及其在不同类型酚类化合物生物合成中的功能 | 目前对该氧化酶家族的研究较为分散,缺乏系统性 | 探索植物CYP98A家族酶的功能及其在酚类化合物生物合成中的作用 | CYP98A单加氧酶家族及其介导的酚类化合物生物合成途径 | 植物生物化学 | NA | 代谢工程策略 | NA | NA | NA |
58 | 2025-05-02 |
Elucidation of the Ultrafast Origin of Multiphasic Dynamics in a Far-Red-Sensing Cyanobacteriochrome
2025-May-01, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00487
PMID:40256925
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研究论文 | 本文研究了新发现的远红/橙光吸收蓝藻色素的光异构化动力学,使用飞秒分辨荧光和吸收方法 | 观察到远红和橙光吸收态的活性位点弛豫,并发现了远红吸收态的动态光谱调谐和橙光吸收态的动态斯托克斯位移 | 研究仅限于特定蓝藻色素的动力学,未涉及其他类似蛋白的对比分析 | 阐明蓝藻色素激发态光化学和结构动力学的超快起源 | 远红/橙光吸收蓝藻色素的异构化反应 | 生物物理学 | NA | 飞秒分辨荧光和吸收光谱 | NA | 光谱数据 | NA |
59 | 2025-05-02 |
Revolutionizing Immunotherapy: The Next Frontier in CAR T-Cell Engineering
2025-Apr-28, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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综述 | 本文回顾了嵌合抗原受体(CAR)T细胞疗法的发展历程,从第一代设计到第五代CAR的先进合成生物学整合 | 探讨了第五代CAR整合了复杂的合成生物学技术,包括共刺激域、双信号通路和细胞因子释放机制,以增强T细胞的活化、持久性和疗效 | 在靶向实体瘤方面仍存在挑战,主要由于免疫抑制性肿瘤微环境和抗原异质性 | 探索CAR T细胞疗法在癌症治疗中的发展和应用 | CAR T细胞疗法及其在癌症治疗中的应用 | 免疫治疗 | 血液系统恶性肿瘤 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
60 | 2025-05-02 |
A review on the expanding biotechnological frontier of Pedobacter
2025-Apr-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108588
PMID:40294724
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综述 | 本文综述了Pedobacter属细菌的生物技术应用及其潜在的自然产物 | 强调了通过合成生物学方法解锁Pedobacter属细菌的隐藏潜力,扩展其工业应用 | 目前仅对少数Pedobacter物种及其自然产物进行了表征 | 探索Pedobacter属细菌的生物技术前沿及其工业应用潜力 | Pedobacter属细菌及其自然产物 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | 基因组数据 | NA |