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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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581 | 2025-05-31 |
Towards Self-regeneration: Exploring the Limits of Protein Synthesis in the Protein Synthesis Using Recombinant Elements (PURE) Cell-free Transcription-Translation System
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00304
PMID:39066734
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研究论文 | 探索在PURE无细胞转录翻译系统中蛋白质合成的自我再生极限 | 显著降低非核糖体PURE蛋白质浓度达97.3%,同时提高蛋白质合成效率,并发现6%右旋糖酐在高度稀释的PURE配方中能显著增加蛋白质合成速率和总产量 | 未明确提及具体局限性 | 开发支持蛋白质自我再生的无细胞合成生物学系统,为构建通用生化构造器和活体合成细胞迈出关键一步 | PURE无细胞转录翻译系统中的蛋白质合成 | 合成生物学 | NA | PURE无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA |
582 | 2025-05-31 |
Artificial Intelligence Methods and Models for Retro-Biosynthesis: A Scoping Review
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00091
PMID:39047143
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review | 本文总结了人工智能在逆合成和逆生物合成路径设计中的应用进展 | 探讨了人工智能在推动绿色化学和环境友好型生物生产中的新前沿 | 讨论了该领域的局限性和未来研究方向 | 促进与绿色化学更契合的生物生产,提升环境实践 | 逆合成和逆生物合成路径设计 | synthetic biology | NA | AI-based methods | generative models | chemical data | NA |
583 | 2025-05-31 |
Toward Practical Applications of Engineered Living Materials with Advanced Fabrication Techniques
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00259
PMID:39002162
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综述 | 本文综述了工程活材料(ELMs)的制备方法、特性及其在医疗、环境保护和制造等领域的应用 | 将合成生物学与材料科学相结合,创造出具有自修复、自复制和环境适应性的动态响应材料 | NA | 探讨ELMs的制备技术及其实际应用潜力 | 工程活材料(ELMs) | 材料科学 | NA | 3D生物打印、电纺丝 | NA | NA | NA |
584 | 2025-05-31 |
Development of a Recombineering System for the Acetogen Eubacterium limosum with Cas9 Counterselection for Markerless Genome Engineering
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00253
PMID:39033464
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研究论文 | 开发了一种基于Cas9反选择的Recombineering系统,用于无标记基因组工程改造Eubacterium limosum | 利用RecT重组酶开发了高效的寡核苷酸重组系统,结合Cas9反选择实现无疤痕和无标记的基因组点突变 | NA | 开发一种快速精确的基因组修饰系统,以促进Eubacterium limosum的合成生物学和代谢工程研究 | Eubacterium limosum | 合成生物学 | NA | Recombineering, Cas9 counterselection | NA | 基因组数据 | NA |
585 | 2025-05-31 |
Chloroplast Cell-Free Systems from Different Plant Species as a Rapid Prototyping Platform
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00117
PMID:39028299
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研究论文 | 本文介绍了一种从多种植物物种中提取高活性叶绿体无细胞基因表达(CFE)系统的通用协议,用于快速原型设计和基因表达调控序列的详细表征 | 开发了一种跨物种兼容的叶绿体无细胞基因表达系统,支持使用T7 RNA聚合酶和叶绿体内源聚合酶,实现了对调控序列在转录和翻译水平的详细表征 | NA | 开发快速原型设计工具以促进植物合成生物学发展,应对气候变化对农业的威胁 | 小麦(单子叶植物)、菠菜和杨树(双子叶植物)的叶绿体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达(CFE)系统 | NA | 基因表达数据 | 23个5'UTR、10个3'UTR和6个叶绿体启动子 |
586 | 2025-05-31 |
Engineering a Novel Probiotic Toolkit in Escherichia coli Nissle 1917 for Sensing and Mitigating Gut Inflammatory Diseases
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00036
PMID:39115381
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917的系统,用于感知和缓解肠道炎症性疾病 | 开发了一个模块化系统,包含炎症生物标志物传感器、分泌系统和治疗性纳米抗体库,并首次在EcN中表征了所采用的分泌系统 | 系统对NO的敏感性有所降低 | 开发一种靶向特异性系统来潜在治疗炎症性肠病(IBD) | 工程化益生菌大肠杆菌Nissle 1917 (EcN) | 合成生物学 | 炎症性肠病(IBD) | 酶联免疫吸附试验(ELISA)和体外试验 | 数学框架用于评估工程益生菌系统的关键参数 | 实验数据 | NA |
587 | 2025-05-31 |
Bioinformatic Prediction and High Throughput In Vivo Screening to Identify Cis-Regulatory Elements for the Development of Algal Synthetic Promoters
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00199
PMID:38986010
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研究论文 | 本研究通过生物信息学预测和高通量体内筛选,识别顺式调控元件以开发藻类合成启动子 | 结合POWRS、STREME和PhyloGibbs算法预测1511个CREs,并通过高通量方法评估4533种合成启动子的转基因表达能力 | 需要具有测序基因组和转录组数据的藻类物种才能应用该流程 | 开发先进的遗传工具以促进藻类生物技术的发展 | 六种不同藻类物种中高表达基因的启动子区域 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、荧光激活细胞分选 | NA | 基因组和转录组数据 | 4533种合成启动子,数百个转基因株系 |
588 | 2025-05-31 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00283
PMID:38981096
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研究论文 | 本文描述了通过定向进化技术改进声学报告基因(ARGs)的过程,以提高其在超声成像中的应用效果 | 首次将定向进化技术应用于声学报告基因的优化,开发了高通量声学筛选方法,显著增强了气体囊泡(GVs)的非线性超声散射信号 | 研究目前仅限于细菌培养体系中的筛选,尚未在哺乳动物细胞或活体动物中进行验证 | 开发更高效的声学报告基因,用于生物成像和合成生物学领域 | 气体囊泡(GVs)蛋白纳米结构及其声学特性 | 合成生物学 | NA | 高通量声学筛选、定向进化 | NA | 超声信号数据 | 细菌培养物中的突变体文库 |
589 | 2025-05-30 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering
2025-May-29, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
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研究论文 | 本文介绍了一种利用混沌3D打印技术制造具有多层微结构的水凝胶构造物的方法,以模拟自然微生物生态系统中的部分隔离现象 | 使用混沌3D打印技术制造微结构化的细菌生态系统,模拟自然微生物群落的空间组织 | 研究仅使用了简化的肠道微生物群落模型,可能无法完全反映复杂自然生态系统的所有特性 | 开发一种能够精确控制微生物空间分布的技术,以更好地研究微生物相互作用 | 混合微生物群落,特别是人类肠道微生物群落的简化模型 | 微生物工程 | NA | 混沌3D打印、荧光显微镜、菌落计数、定量PCR | NA | 图像、菌落计数数据、PCR数据 | 简化的细菌群落模型(具体菌株未明确说明数量) |
590 | 2025-05-30 |
dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion
2025-May-29, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763
PMID:40401918
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research paper | 该研究探讨了非天然核苷dTAT1在遗传密码扩展中的光物理和细胞毒性行为 | 发现dTAT1在390 nm激发下占据三重态但细胞毒性极低,且产生的单线态氧量子产率仅为17%,三重态寿命比dTPT3短2.7倍 | 未明确说明实验所用细胞类型或具体实验条件 | 评估dTAT1在遗传密码扩展中的安全性和潜在治疗应用 | 非天然核苷dTAT1 | 合成生物学 | NA | 光物理分析、活性氧检测 | NA | 化学分析数据 | NA |
591 | 2025-05-30 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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research paper | 该研究提出了一种多层自催化反馈策略,用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 利用多层反馈策略实现群体水平的积分反馈和多细胞积分器,控制功能通过不同细胞群体间的协调互动实现 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和复杂环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和多细胞系统 | synthetic biology | NA | autocatalytic integral feedback controllers | multilayer feedback controller | NA | NA |
592 | 2025-05-30 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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research paper | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包,用于高效且适应性强的Wolfiporia cocos遗传修饰 | 该工具包显著提高了转化效率,支持多基因整合,并通过鸡尾酒式组装多个基因到转座子中,避免了复杂的遗传电路组装 | 研究仅限于Wolfiporia cocos,未在其他真菌菌株中验证其普适性 | 开发高效且适应性强的真菌基因组工程工具包 | Wolfiporia cocos真菌菌株 | 合成生物学 | NA | 转座子工程 | NA | 基因组数据 | NA |
593 | 2025-05-30 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的稳健性及其基本性能权衡 | 提出了一个理论框架来量化生物反馈的准确性和稳健性,并使用多目标优化方法研究其性能权衡 | 仅研究了五种特定的生物反馈电路,可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 提高对生物反馈调控的理解,并为合成生物学中的稳健电路设计提供指导 | 五种生物反馈电路:正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈(切换开关) | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
594 | 2025-05-30 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 该研究利用新发现的转录后调控机制,设计了一种基于CsrA蛋白浓度的生物后转录带通滤波器 | 利用CsrA蛋白与mRNA 5' UTR + 100 nt CDS序列的异质性相互作用,实现了基于浓度的转录后调控,减少了合成电路组件的数量 | 需要进一步表征天然调控RNA-蛋白质系统以开发更复杂的RNP基电路 | 设计合成生物学中的转录后调控电路 | mRNA转录本和CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA |
595 | 2025-05-30 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株的高产无细胞蛋白质合成系统,用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因,开发了无需额外添加T7 RNA聚合酶的高产CFPS系统,并实现了半连续反应模式下超过1100 μg/mL的蛋白质产量 | NA | 开发高产无细胞蛋白质合成系统,用于合成生物学和生物技术应用 | Bacillus subtilis 164T7P菌株及其无细胞提取物 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS) | NA | NA | NA |
596 | 2025-05-29 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 本研究提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 采用高速激光诱导微射流技术可靠且可重复地生成细胞大小脂质体,实现了按需生产 | NA | 开发一种新型的细胞大小脂质体生成方法,推动膜科学和合成生物学领域的发展 | 细胞大小脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像技术、数值分析 | NA | 视频数据(高速摄像)、数值模拟数据 | NA |
597 | 2025-05-29 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 本文通过基于液-液相分离的合成细胞器,将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器,实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 未提及具体应用场景或体内实验验证 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液-液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA |
598 | 2025-05-29 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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research paper | 该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计,提高活性、特异性和免疫原性预测 | 未提及具体实验验证结果或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | synthetic biology | NA | AI/ML, rational design, mutagenesis screens, directed evolution | machine learning models | biological sequence data | NA |
599 | 2025-05-29 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了利用CRISPR基因工具包提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能的最新进展 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的应用,包括基因编辑、转录调控和酶调节等方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能,使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
600 | 2025-05-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其非天然衍生物颜色谱的策略 | 天然色素的稳定性、颜色谱有限以及从自然资源中提取的低产量问题尚未完全解决 | 探索利用合成生物学方法生产天然色素及其非天然衍生物的策略 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |