合成生物学相关文章
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当前共找到 5109 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-05-06 |
Special Issue "Synthetic Biology for Biosensing in Health and Environmental Applications"
2023-Oct-19, Biosensors
DOI:10.3390/bios13100937
PMID:37887130
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评论 | 本期特刊专注于合成生物学在健康与环境应用中的生物传感技术 | 通过合成生物学方法设计和构建高灵敏度、高特异性的生物传感器，以应对健康和环境监测中的挑战 | NA | 探讨合成生物学在生物传感领域的最新进展及其在健康与环境中的应用 | 生物传感器及其在健康和环境监测中的靶标分析物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物传感器 | 医学, 环境 |
| 582 | 2026-05-06 |
Genetic context effects can override canonical cis regulatory elements in Escherichia coli
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac787
PMID:36134716
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研究论文 | 在大肠杆菌中，遗传背景效应可以超越经典的顺式调控元件对基因转录的影响 | 发现侧翼非编码合成序列的GC含量能独立于启动子等调控序列，显著影响报告基因的表达水平，揭示了转录倾向性的关键决定因素 | 未阐明低GC侧翼序列影响转录的分子机制，且研究仅在大肠杆菌中进行，尚未在其他宿主中验证 | 探究大肠杆菌中遗传背景对转录的影响机制及其与经典顺式调控元件的关系 | 大肠杆菌中不同GC含量侧翼序列对报告基因表达的影响 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 表达量数据 | 涉及多种GC含量（低、中、高）的侧翼序列构建 | NA | 大肠杆菌 | 报告基因表达系统 | NA |
| 583 | 2026-05-05 |
Deep learning architectures achieve state-of-the-art (SOTA) accuracy in protein secondary structure prediction
2026-May-03, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-026-11570-x
PMID:42071121
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综述 | 本文综述了深度学习架构在蛋白质二级结构预测中达到最先进精度的最新进展 | 系统总结了混合模型设计、基准数据集和评估指标的最新进展，并讨论了未来方向如跨物种验证、不确定性感知建模和异构生物数据整合 | 当前方法存在数据依赖性和数据集偏差问题 | 综述深度学习在蛋白质二级结构预测领域的进展并指出未来方向 | 蛋白质二级结构预测方法 | 深度学习 | NA | NA | CNN, RNN, Transformer, AlphaFold2 | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 药物开发, 疾病研究 |
| 584 | 2026-05-05 |
Osmotic signaling governs sunscreen biosynthesis to safeguard desert cyanobacteria against desiccation
2026-Apr, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.70075
PMID:42079446
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研究论文 | 揭示了渗透信号通过调控防晒霜类菌胞素样氨基酸的生物合成来保护沙漠蓝细菌免受干燥胁迫 | 首次发现类菌胞素样氨基酸在干旱条件下作为渗透保护剂的双重功能，并鉴定出Dsp1-OrrA信号通路介导渗透诱导的MAA生物合成 | 未详细探讨MAA在其他胁迫条件下的具体功能，以及该信号通路在其他生物中的保守性 | 研究类菌胞素样氨基酸在沙漠蓝细菌应对干燥胁迫中的作用及其调控机制 | 沙漠蓝细菌（一种沙漠适应性的蓝细菌） | 合成生物学, 微生物学 | 不适用 | 基因破坏、生化分析、系统发育基因组分析 | 不适用 | 基因组数据、生化实验数据 | 不适用 | 不适用 | 沙漠蓝细菌 | 不适用 | 环境生物技术, 合成生物学 |
| 585 | 2026-05-05 |
Applications of Metabolomics in the Development of Biomedicine and Biotechnology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_21
PMID:42071157
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综述 | 探讨代谢组学从早期谱分析到与先进分析平台、计算生物学和精准医学整合的发展过程，并强调其在癌症、心血管疾病、糖尿病等疾病中的生物标志物发现、机制阐明和个性化治疗中的应用 | 系统阐述了代谢组学在生物医学和生物技术领域的整合应用，包括单细胞代谢组学和机器学习等新兴工具，及其在代谢流追踪和人工途径设计中的实践驱动作用 | 未明确提及具体局限性 | 概述代谢组学在生物医学和生物技术开发中的应用进展 | 代谢物和代谢途径，用于疾病机制和生物过程研究 | 生物信息学 | 癌症， 心血管疾病， 糖尿病 | 代谢组学， 单细胞代谢组学， 机器学习 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | NA | 人工代谢途径 | 医学， 生物技术， 合成生物学 |
| 586 | 2026-05-05 |
Levels of autonomy in synthetic biology engineering
2020-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202010019
PMID:33331138
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综述 | 探讨合成生物学工程中的自主性层次，分析标准化与自动化在工程生物体中的应用现状与挑战 | 系统梳理其他工程领域标准化与自动化经验，对比分析合成生物学领域尚未实现全流程自动化的核心障碍 | 未提供具体实验数据或定量分析，属于概念性综述，缺乏对现有自主性层次划分的实证验证 | 评估合成生物学工程中自主性水平的现状与发展方向 | 合成生物学工程过程及自主化设计方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 587 | 2026-05-04 |
Efficient cell factory design by combining meta-heuristic algorithm with enzyme-constrained metabolic models
2026-Aug, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2026.134706
PMID:42034297
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研究论文 | 提出MetaStrain框架，将酶约束代谢模型与元启发式算法结合，用于高效设计微生物细胞工厂 | 首次将元启发式算法与酶约束模型整合，通过降维预筛选和数值编码策略高效探索组合基因编辑空间，实现非直觉组合靶点的快速识别 | 未提供实验验证中脱靶效应的分析，且对大型代谢网络的计算复杂度评估不充分 | 开发一种计算框架以优化微生物细胞工厂中多基因靶点设计，提高目标产物产量 | 酿酒酵母和大肠杆菌的代谢网络模型 | NA | NA | 酶约束代谢模型 | 元启发式算法 | NA | 通过计算模拟涉及酿酒酵母的2-苯乙醇和亚精胺生物合成，实验验证使用大肠杆菌的五靶点组合菌株 | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 组合基因编辑策略，包括敲除、过表达和酶修饰 | 工业生物技术 |
| 588 | 2026-05-04 |
The tryptophan prenyltransferase ComQ from Bacillus subtilis 168 can prenylate daptomycin at Trp1
2026-May-02, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70578
PMID:42068243
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研究论文 | 本研究首次证明来自枯草芽孢杆菌168的色氨酸异戊二烯转移酶ComQ能够异戊二烯化环状抗菌肽达托霉素，显示出其作为合成生物学工具的潜力 | 首次发现ComQ不仅修饰线性肽，还能异戊二烯化环状肽，扩大了底物范围，为生物活性化合物的生物合成工程提供了新工具 | 未提及体内应用或工程化ComQ变体的具体效果 | 探究ComQ作为合成生物学工具异戊二烯化环状抗菌肽的可行性 | 枯草芽孢杆菌168的异戊二烯转移酶ComQ及其底物ComX和信息素和达托霉素 | 合成生物学 | NA | 克隆、蛋白纯化、AlphaFold建模 | AlphaFold | 蛋白质结构 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 医学、工业生物技术 |
| 589 | 2026-05-04 |
Parabiotics as Next-Generation Microbiome Therapeutics: Insights into Mechanisms, Evidence, and Therapeutic Potential
2026-May-02, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-026-04942-x
PMID:42069941
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综述 | 综述了后生元作为下一代微生物组疗法的机制、证据和治疗潜力 | 首次系统总结后生元（非活性微生物或其组分）在安全性、稳定性和功能食品应用中的优势，并整合组学技术（如宏基因组学、CRISPR-Cas）对其研发的加速作用 | 标准化和监管协调仍面临挑战 | 探讨后生元在微生物组靶向干预中的应用及其转化潜力 | 后生元（非活性微生物细胞或其组分） | NA | 儿科腹泻、肌肉衰减、肠易激综合征、特应性皮炎、呼吸道感染、代谢性疾病 | 宏基因组学、下一代测序、蛋白质组学、代谢组学、CRISPR-Cas系统、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | 医学、食品 |
| 590 | 2026-05-04 |
RNA sensors and actuators for dynamic cellular regulation
2026-Apr-30, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.04.005
PMID:42067429
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综述 | 本文综述了用于动态细胞调控的RNA传感器和致动器的工程化进展 | 从RNA结构动力学角度强调其与蛋白质系统相比的优势，并整合了合成生物学、RNA治疗学的最新进展 | 未提及具体实验验证或量化比较与蛋白质系统的性能差异 | 推动RNA在合成细胞控制方案中的应用，提升微生物生物合成和靶向基因治疗 | RNA传感器和致动器 | 合成生物学 | NA | RNA工程 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器与致动器 | 医学, 工业生物技术 |
| 591 | 2026-05-04 |
Synthetic Biology Approaches to Enzymology in Food and Agriculture Systems
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c16525
PMID:41962132
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综述 | 探讨合成生物学方法在食品与农业系统中酶学应用的研究进展 | 系统综述了合成生物学在酶工程领域的最新进展，重点讨论了如何将其他行业的技术改造应用于食品与农业系统 | 当前存在的局限性及监管问题，需要进一步探索合成生物学在全球食品系统中的整合方向 | 探索合成生物学在食品与农业系统中通过酶介导解决方案应对全球粮食不安全问题的应用 | 食品与农业系统中的酶及其工程化改造方法 | 合成生物学 | NA | 酶工程、生物催化、计算设计 | NA | NA | NA | NA | NA | 酶介导的代谢途径和生物催化通路 | 食品, 农业 |
| 592 | 2026-05-04 |
OptoChaperone─A Biohybrid Tool for Regulating Protein Condensates in Cells and In Vitro
2026-Apr-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c04074
PMID:42002974
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研究论文 | 报道了一种名为OptoChaperone的光控生物杂合系统，用于在体外和活细胞中调控蛋白质凝聚体 | 利用光响应开关控制分子伴侣活性，实现蛋白质凝聚体的可逆、精准、时空可控调节，无需化学添加剂或基因修饰 | 未提及在体内长期应用的稳定性或可能的免疫原性 | 开发一种可逆且高效的光控工具来操纵蛋白质凝聚体，以研究其在细胞生理和病理中的作用 | 蛋白质凝聚体，包括融合肉瘤蛋白、TAR DNA结合蛋白43和热休克因子1 | 合成生物学 | 神经退行性疾病（如肌萎缩侧索硬化、额颞叶痴呆） | 光控分子伴侣系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 光控分子伴侣系统（OptoChaperone） | 医学、合成生物学、生物分子工程 |
| 593 | 2026-05-04 |
Decoding nucleic acid contributions to phase separation and ordering in biomolecular condensates
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag253
PMID:41909948
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研究论文 | 研究核酸在生物分子凝聚体中调控相分离和有序化的作用 | 系统揭示了核酸长度和杂交程度对相变行为的影响，并提出生物凝聚体稳定性的评价指标，同时表征液晶有序形成的条件 | 仅关注模型系统（寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合），未涉及天然复杂环境中的多组分相互作用 | 填补核酸在液-液相分离中作用的研究空白，指导合成含核酸凝聚体的设计 | 具有不同长度和杂交程度的寡核苷酸与中度电荷无序肽的混合体系 | 计算生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | 实验数据与模拟轨迹 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物医学 |
| 594 | 2026-05-04 |
Programmable, target-induced fluorogenic CRISPR-tDeg platform for live-cell RNA visualization
2026-Mar-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag279
PMID:41909946
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研究论文 | 开发了一种名为CtDeg的模块化RNA成像平台，通过目标诱导荧光和degron介导的降解机制实现活细胞RNA的高特异性可视化 | 首次将Pepper RNA基序嵌入crRNA支架，利用degron介导的降解有效抑制背景信号，实现目标RNA识别驱动的荧光激活，显著提高信噪比 | 未提及具体的局限性 | 开发一种低背景、高特异性的活细胞RNA成像平台 | 活细胞中的RNA分子，包括paraspeckle装配动态和SARS-CoV-2基因组RNA | 合成生物学 | NA | CRISPR-dCas13, 荧光成像 | NA | 图像 | NA | CRISPR-Cas13, degron | 哺乳动物细胞 | 目标诱导荧光CRISPR-tDeg电路 | 合成生物学, RNA生物学 |
| 595 | 2026-05-04 |
Steps Toward Recapitulating Endothelium: A Perspective on the Next Generation of Hemocompatible Coatings
2024-10, Macromolecular bioscience
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/mabi.202400152
PMID:39072925
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综述 | 讨论如何通过合成生物学和涂层技术模拟内皮细胞功能，以改善血液接触医疗设备的血液相容性 | 提出将自下而上的合成生物学（特别是合成细胞）与被动和活性生物表面涂层相结合，协同模拟内皮细胞的三种关键功能，以克服血液相容性挑战 | 未具体说明当前技术的局限性，但隐含地指出了实现内皮功能模拟的复杂性及协同集成功能的必要性 | 开发新一代仿生内皮涂层，用于血液接触医疗设备以增强血液相容性 | 血液接触医疗设备及其表面的内皮模拟涂层 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | 自下而上的合成生物学（合成细胞） | 哺乳动物细胞 | 模拟内皮细胞的三重功能：保护血液成分、调节凝血和促进纤维蛋白溶解 | 医学 |
| 596 | 2026-05-03 |
The gut-tumor connection: the role of microbiota in cancer progression and treatment strategies
2026-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.038
PMID:40850681
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综述 | 探讨肠道微生物群在癌症进展和治疗策略中的作用 | 系统总结了肠道微生物群、肿瘤相关微生物群与肿瘤微环境之间的复杂相互作用，并评估其作为癌症治疗靶点的潜力 | 缺乏标准化方案、先进的测序技术和改进的动物模型，限制了微生物群-癌症相互作用研究的发展 | 探索肠道微生物群与肿瘤微环境的关系及其对个性化癌症治疗的启示 | 肠道微生物群、肿瘤相关微生物群及肿瘤微环境 | 自然语言处理 | NA | 二代测序 | NA | 综述数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 597 | 2026-05-03 |
Advances and opportunities for computational interrogation of plant proteins
2026-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70899
PMID:42055456
|
综述 | 综述了计算分析方法在植物蛋白质研究中的进展与机遇 | 强调了计算工具在加速植物蛋白质功能发现方面的潜力，并整合了新兴方法与传统实验手段的优势 | 植物内研究仍受限于遗传转化方法的可用性和效率 | 推动计算与实验结合，以克服植物蛋白质研究瓶颈，促进农业、生态和气候韧性进展 | 植物蛋白质 | 机器学习 | NA | 蛋白质结构预测、动力学模拟、相互作用分析 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 生态, 气候韧性 |
| 598 | 2026-05-03 |
Harnessing synthetic circuits to illuminate microbial electron transfer: a perspective on engineered metabolism
2026-Apr-30, Journal of microbiology & biology education
IF:1.6Q2
DOI:10.1128/jmbe.00290-25
PMID:41627025
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研究论文 | 该视角文章聚焦于一项利用合成基因电路促进微生物电子传递的研究，展示了通过工程化代谢生产氧化还原活性代谢物增强胞外电子传递和发电的能力 | 创新点在于通过合成生物电路控制氧化还原介质的产生，为理解微生物电子流和生物电子设计提供新视角，并作为教育案例整合多学科知识 | NA | 探讨合成电路在微生物电子传递中的应用，并强调其在教育中促进跨学科学习的潜力 | 微生物电子传递和工程化代谢 | 合成生物学 | NA | 合成基因电路 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 合成基因电路用于生产并释放吩嗪-1-羧酸（一种氧化还原活性代谢物） | 生物技术, 教育 |
| 599 | 2026-05-03 |
From fundamental understanding to engineering carboxysomes for biotechnological applications
2026-Apr-30, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101882
PMID:42068046
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综述 | 综述了从基础理解到工程化改造羧基体用于生物技术应用的最新进展 | 系统总结了羧基体在合成生物学和生物工程中的设计原理，包括可编程结构、货物封装、半渗透性和模块化组装，并提出了将其改造为高效固碳引擎和多功能纳米材料的新策略 | 实现壳渗透性的精确控制和货物封装的高效性，以及将羧基体整合到异源宿主中仍面临挑战 | 探讨羧基体的分子机制及其在生物技术中的应用潜力 | 羧基体（一种自组装蛋白质微区室） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | 固碳通路、纳米材料 | 工业生物技术、环境 |
| 600 | 2026-05-03 |
From CRISPR functional genomics to synthetic interventions: engineering antiviral strategies
2026-04-21, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00057-26
PMID:41910274
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综述 | 本文综述了从CRISPR功能基因组学到合成生物学干预的进展，旨在工程化抗病毒策略 | 将CRISPR功能基因组学筛选与合成生物学设计相结合，提出可编程干预手段（如受体诱饵、基因电路和工程化免疫细胞） | 讨论从筛选机制转化为安全有效抗病毒策略时面临的约束条件 | 连接CRISPR功能基因组学与合成抗病毒设计，总结跨病毒家族通用原则 | 病毒与宿主相互作用中的宿主依赖性因子和限制因子 | 功能基因组学, 合成生物学 | 病毒相关疾病 | CRISPR扰动筛选, 单细胞测序, 成像技术, 空间表型分析, 类器官模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 受体诱饵及结合分子、条件性蛋白降解系统、感染感应基因电路、可调抗病毒功能免疫细胞 | 医学 |