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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-10-05 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2025-Sep-01, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
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综述 | 本文综述了微生物来源抗癌化合物的发现、生物工程改造及治疗应用的最新进展 | 整合人工智能与纳米技术加速微生物来源抗癌药物的发现和递送系统开发 | 缺乏体内验证和全面的药代动力学数据,临床转化面临挑战 | 加速微生物来源抗癌化合物的发现和临床应用 | 微生物代谢产物及其衍生的抗癌化合物 | 机器学习 | 癌症 | 人工智能、机器学习、分子对接、定量构效关系建模 | QSAR模型 | 化学结构数据、生物活性数据 | NA | 合成生物学 | 微生物菌株 | 生物活性化合物增强生产途径 | 医药 |
| 602 | 2025-10-05 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671382
PMID:40894645
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研究论文 | 开发了一种基于机器学习的细胞游离生物传感器优化方法,用于饮用水铅检测 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离基因表达工作流程,通过定向标记捕获aTF突变对性能的影响 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器性能,用于环境监测和人类健康 | PbrR变构转录因子及其在铅检测中的应用 | 合成生物学 | 重金属污染相关健康风险 | 机器学习,细胞游离基因表达,定向进化 | 机器学习模型 | 序列到功能数据 | NA | 细胞游离系统 | 无细胞表达系统 | 基于aTF的生物传感器,铅检测电路 | 环境,医疗诊断 |
| 603 | 2025-10-05 |
Toward a monocot SynBio toolkit: assessing regulatory element performance and eudicot compatibility
2025-Aug-08, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03583-x
PMID:40779074
|
研究论文 | 本研究构建并评估了一个包含80个遗传调控元件的组合库,用于单子叶植物的合成生物学应用 | 开发了新颖的CaMV 35S启动子与病毒5'UTR序列组合,其表达水平接近强病毒启动子融合;新发现的植物小热休克蛋白3'UTR序列能显著增强报告基因表达 | 研究主要基于玉米原生质体和本氏烟的瞬时表达系统,尚未在完整植株中进行长期验证 | 解决禾谷类作物和禾草遗传工程中合适调控元件相对缺乏的问题 | 玉米原生质体和本氏烟叶片 | 合成生物学 | NA | 原生质体转化、农杆菌浸润、荧光测定 | NA | 荧光表达数据 | 80个遗传调控元件组合,在两种植物系统中测试 | 农杆菌浸润 | 玉米, 本氏烟 | 遗传调控元件组合库,包括启动子、5'UTR、启动子-5'UTR融合和3'UTR序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 604 | 2025-10-05 |
Advancements in DNA-Driven Precision Modulation of Cell Surface Receptor for Programmable Cellular Functions
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505073
PMID:40588818
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综述 | 本文系统总结了基于DNA的受体工程策略在精确调控细胞表面受体功能方面的最新进展 | 整合遗传和非遗传DNA工程策略,利用DNA纳米结构、功能性核酸和可编程动态DNA反应实现受体功能的多维调控 | NA | 开发精确调控细胞表面受体的DNA工程策略,推动智能细胞系统发展 | 细胞表面受体及其信号传导机制 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、DNA折纸、功能性核酸 | NA | NA | NA | DNA纳米结构、DNA逻辑电路、DNA纳米机器人 | 哺乳动物细胞 | DNA逻辑电路、DNA纳米机器人、受体二聚化和寡聚化调控 | 医学 |
| 605 | 2025-10-05 |
A simple and universal quasi-modular cloning system using NEBuilder® HiFi DNA assembly kit
2025 May-Jun, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2542012
PMID:40819309
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研究论文 | 开发了一种基于NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒的准模块化克隆系统,用于非模式生物的基因工具开发 | 将NEBuilder HiFi DNA组装试剂盒扩展为使用单链寡核苷酸桥接的准模块化系统,无需限制性内切酶即可组装可重复使用的DNA片段 | NA | 开发适用于非模式生物系统的通用准模块化克隆方法 | 厌氧肠道真核生物ST7-B | 合成生物学 | NA | NEBuilder HiFi DNA组装 | NA | NA | NA | NEBuilder HiFi DNA Assembly Kit | ST7-B | 启动子-终止子组合载体 | 工业生物技术 |
| 606 | 2025-10-05 |
Mapping variation in dual use risk assessments of synthetic biology projects
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1620678
PMID:40895722
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研究论文 | 本研究通过评估合成生物学项目的双重用途风险,揭示了专家和学生评审员在风险评估和管理策略上的显著差异 | 首次对现实世界合成生物学项目进行双重用途风险评估的实证研究,揭示了评审员间风险评估和管理策略的显著不一致性 | 样本量相对有限(18名专家和49名学生),仅评估了四个合成生物学项目 | 研究合成生物学项目双重用途风险评估的一致性和准确性 | 四个现实世界合成生物学项目的风险评估和管理策略 | 生物安全与风险管理 | NA | 风险评估框架 | NA | 专家评审数据 | 18名经验丰富的DURC评审员和49名合成生物学学生 | NA | NA | NA | 生物安全 |
| 607 | 2025-10-05 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-Sep-04, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
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综述 | 本文综述了通过拓扑工程化向导RNA实现CRISPR/Cas系统可编程控制的最新进展 | 开发具有明确结构架构(聚合物、环状和树状拓扑)的拓扑工程化gRNA,实现精确空间控制、可逆性和可编程激活 | NA | 克服传统线性gRNA在CRISPR/Cas系统控制中的局限性,实现精确时空调控 | 拓扑工程化向导RNA(TE-gRNAs) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 通过物理或化学响应连接器和刺激敏感基团实现可编程激活的基因编辑系统 | 医学, 合成生物学, 功能基因组学 |
| 608 | 2025-10-05 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-Sep, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
|
综述 | 本文综述真菌挥发性有机物在采后病害生物防治中的化学多样性、作用机制及应用前景 | 系统探讨真菌挥发性有机物作为生物熏蒸剂的潜力,并提出通过定向诱变、合成生物学和人工智能提升防治效率的新方向 | NA | 开发基于真菌挥发性有机物的环保型采后病害生物防治策略 | 真菌挥发性有机物及其与病原菌、农产品的相互作用 | 农业生物技术 | 采后病害 | 生物熏蒸、定向诱变、合成生物学、人工智能分析化学 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 农业 |
| 609 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven optoelectronic biosensor for rapid and highly sensitive norovirus detection in fecal samples
2025-Nov-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117787
PMID:40674850
|
研究论文 | 开发了一种合成生物学驱动的光电生物传感器,用于快速高灵敏度检测粪便样本中的诺如病毒 | 整合诺如病毒样颗粒和高亲和力单链抗体作为生物受体,无需核酸扩增即可在45分钟内完成检测,灵敏度比传统比色生物传感器提高10-100倍 | 仅使用20例临床样本进行验证,样本规模有限 | 开发快速高灵敏度的诺如病毒检测平台 | 人类粪便样本中的诺如病毒 | 生物传感 | 诺如病毒感染 | 杆状病毒-昆虫细胞表达系统、噬菌体展示技术 | NA | 生物传感信号 | 20例人类粪便样本 | 噬菌体展示 | 昆虫细胞 | 生物传感器 | 医学诊断 |
| 610 | 2025-10-05 |
Potentials of RNA biosensors in developmental biology
2025-Oct, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.07.011
PMID:40721002
|
综述 | 探讨RNA生物传感器在发育生物学中的应用潜力及前景 | 首次系统阐述RNA生物传感器在发育生物学领域的跨学科应用潜力,强调其对RNA时空动态监测的独特优势 | NA | 推动RNA生物传感器在发育生物学分子机制研究中的应用 | RNA生物传感器(荧光RNA适配体、CRISPR-Cas系统、核糖开关、催化RNA传感器) | 合成生物学 | NA | RNA生物传感技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 模式生物 | 生物传感器(包括核糖开关、逻辑门等) | 医学, 环境科学 |
| 611 | 2025-10-05 |
Development of a DNA endonuclease I-SceI-based scarless genome editing system for Cupriavidus necator
2025-Oct, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.07.020
PMID:40721107
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研究论文 | 开发了一种基于DNA内切酶I-SceI的无疤痕基因组编辑系统,用于Cupriavidus necator的高效基因操作 | 构建了双质粒I-SceI同源重组系统,通过优化复制起点和诱导系统实现了无需大型数据库的精确无疤痕编辑,并开发了高温消除质粒的方法 | 未与其他基因组编辑工具进行系统性效率比较 | 开发高效、精确的Cupriavidus necator基因组编辑工具 | Cupriavidus necator细菌 | 合成生物学 | NA | DNA内切酶I-SceI介导的同源重组 | NA | NA | NA | I-SceI, 同源重组 | Cupriavidus necator | 双质粒系统:pOUO-1用于接合介导的基因组整合(第一次HR),pOH-4用于表达I-SceI诱导第二次HR | 工业生物技术 |
| 612 | 2025-10-05 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-Sep-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
|
研究论文 | 本研究开发了一种合成大肠杆菌菌群,通过SCRaMbLE方法进化关键基因,显著增强了菲的降解效率 | 首次将SCRaMbLE方法应用于合成菌群的工程化改造,通过模块化设计和实验室进化协同提升多环芳烃降解能力 | 研究仅在实验室条件下验证,未在真实环境污染物中测试 | 开发高效降解菲的合成微生物菌群,用于环境生物修复 | 工程化大肠杆菌BL21(DE3)菌群及其对菲的降解能力 | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE, 实验室进化 | NA | NA | 三种工程化大肠杆菌菌株,在含100mg/L菲的最小盐培养基中测试 | SCRaMbLE, pET-28(a)质粒 | 大肠杆菌BL21(DE3) | 模块化代谢通路,包含17个菲降解关键基因,分为三个独立功能模块 | 环境 |
| 613 | 2025-10-05 |
Plant cytochrome P450 enzymes for bioactive metabolites biosynthesis, growth regulation, and stress adaptation
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf297
PMID:40623215
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综述 | 本文综述了植物细胞色素P450酶在生物活性代谢物合成、生长调控和胁迫适应中的最新研究进展 | 聚焦2020-2025年最新研究进展,系统阐述CYPs在植物重要生物活性化合物合成及其生理功能中的关键作用 | 仅涵盖近五年研究进展,且目前仅有不到0.2%的CYPs完成功能表征 | 增强对植物CYPs功能的理解,为生物技术育种和合成生物学领域的创新应用提供基础 | 植物细胞色素P450酶(CYPs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | 数据库记录超过300,000个CYPs | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 614 | 2025-10-05 |
Iterative recombinase technologies for efficient and precise genome engineering across kilobase to megabase scales
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.07.011
PMID:40763736
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研究论文 | 开发了两种可编程染色体编辑系统PCE和RePCE,实现植物和人类细胞中无痕的千碱基到兆碱基尺度DNA操作 | 通过高通量工程获得逆转性降低10倍的Lox位点,利用AI辅助重组酶工程方法生成重组效率提高3.5倍的Cre变体,结合Re-pegRNA介导的无痕策略增强编辑精度 | NA | 解决基因组编辑技术在高等生物中实现精确、大规模DNA操作面临的挑战 | 植物和人类细胞 | 合成生物学 | NA | 可编程染色体编辑系统,AI辅助重组酶工程,Re-pegRNA介导的无痕策略 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 重组酶技术 | 水稻, 人类细胞 | 染色体水平编辑系统,支持插入、删除、替换、倒位和易位操作 | 分子育种, 治疗开发, 合成生物学 |
| 615 | 2025-10-05 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究开发了基于FMV 34S启动子变体的CRISPRi正交抑制系统,用于植物细胞中基因表达的精确调控 | 首次系统评估33种34S启动子变体在CRISPRi中的抑制效率,发现相同sgRNA结合位点比异质位点具有更高抑制效率,并成功构建了与Cre/loxP RNA支架正交系统组合的遗传开关 | 研究采用农杆菌浸润叶片的瞬时转基因表达系统,尚未在稳定转基因植物中进行验证 | 开发植物合成生物学工具箱中的逻辑门元件,实现基因表达的精确调控 | FMV 34S启动子变体库、CRISPRi系统、植物细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPRi、农杆菌浸润、瞬时转基因表达 | NA | 基因表达数据 | 33种启动子变体 | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 遗传开关、正交抑制系统、逻辑门 | 农业 |
| 616 | 2025-10-05 |
Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00199
PMID:40670299
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综述 | 本文综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展 | 探索了人工智能和机器学习在菌株设计与过程控制中的整合应用,为克服代谢瓶颈和扩大生产提供新方案 | 面临代谢负担等挑战 | 开发可持续和可扩展的化妆品成分生物合成方法 | 酿酒酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程、途径模块化、发酵优化 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 代谢途径工程 | 化妆品工业 |
| 617 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00333
PMID:40676857
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研究论文 | 开发了一种在解脂耶氏酵母中实现大规模基因组装和基因组整合的新策略 | 实现了数十个基因(超过30kb)的稳定组装和整合,突破了目前最多只能组装整合5个外源基因(约13kb)的限制 | NA | 提高解脂耶氏酵母的遗传操作和代谢工程能力 | 解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 大规模基因组装和基因组整合 | NA | NA | 构建了包含35个外源基因(总计93.5kb)的底盘细胞,优化菌株包含15个外源基因 | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢工程途径,用于调控番茄红素的异源合成 | 工业生物技术 |
| 618 | 2025-10-05 |
Harnessing synthetic biology to empower a circular plastics economy
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0053
PMID:40638940
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综述 | 本文概述了利用合成生物学和微生物群落工程技术降解和升级回收塑料废物的策略 | 整合合成生物学与微生物群落工程,提出增强塑料生物处理效率的互补策略 | NA | 探讨生物技术如何支持循环塑料经济发展 | 塑料废物处理与升级回收 | 合成生物学 | NA | 微生物群落工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 生物降解与升级回收通路 | 环境, 工业生物技术 |
| 619 | 2025-10-05 |
Endosymbionts as hidden players in tripartite pathosystem of interactions and potential candidates for sustainable viral disease management
2025-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2449403
PMID:39848650
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综述 | 探讨内共生菌在植物-病毒-媒介昆虫三方互作系统中的作用及其在可持续病毒病害管理中的潜力 | 系统阐述内共生菌通过调控宿主反应、影响杀虫剂抗性和病毒传播等机制参与三方互作,并提出利用基因工程改造内共生菌的创新病害控制策略 | NA | 阐明内共生菌在植物病毒病害传播中的作用机制并探索可持续管理策略 | 植物-病毒-节肢动物媒介的三方互作系统及其内共生菌 | 植物病理学 | 植物病毒病 | 基因改造、生物技术、RNA干扰、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 节肢动物媒介 | NA | 农业 |
| 620 | 2025-10-05 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Sep, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 本研究开发了一种名为DASH的高容量基因堆叠系统,用于植物合成生物学应用 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种高容量且多功能的基因组装系统,用于植物合成生物学 | 基因组装系统和植物合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、重组工程、位点特异性重组 | NA | DNA序列数据 | NA | GoldenBraid, PhiC31整合酶, FLP重组酶, CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因堆叠系统,包含35个转录单元的97kb货物DNA | 农业 |