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当前共找到 5109 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-05-03 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
|
research paper | 提出一个标准化工作流程，用于动力学代谢模型的构建、注释、可视化和共享 | 整合社区标准和开源工具，确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | NA | 提高动力学代谢模型的可重复性和实用性 | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 602 | 2026-05-03 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 重点介绍超快技术在生物技术中的应用，包括实时可视化和精确操纵生物分子过程 | 整合了飞秒激光、超快光谱、泵浦-探针显微镜、CARS及阿秒光谱等多种超快技术，并探讨了其与人工智能和纳米技术的结合，推动诊断、个性化医疗和合成生物学发展 | 面临光损伤、与复杂生物系统整合困难以及伦理考量等挑战 | 综述超快技术在生物技术中的变革性应用及潜力 | 涉及蛋白质折叠路径、酶活性、能量转移机制、CRISPR基因编辑实时监测、细胞动力学、神经活动等生物分子过程和动态 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 飞秒激光, 超快光谱, 泵浦-探针显微镜, 相干反斯托克斯拉曼散射, 阿秒光谱 | NA | 图像, 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 603 | 2026-05-03 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-04-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种通过cDNA合成抑制核酶催化活性以实现准确RT-qPCR测量上下文依赖性核酶活性的方法 | 在样本制备工作流程中引入寡核苷酸以抑制核酶活性，恢复RT-qPCR测量的准确性，首次解决了RNA提取和逆转录条件诱发核酶裂解导致测量不准确的问题 | 研究仅在体外已知上下文依赖性核酶裂解的RNA组上验证，未涉及体内复杂环境或多种核酶类型，潜在限制于实际应用场景的泛化能力 | 准确测量不同遗传和环境上下文中的核酶活性，以验证新核酶序列及基于核酶的生物技术 | 自裂解核酶及其上下文依赖性活性 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA提取, cDNA合成 | NA | RNA定量数据 | 一组已知体外上下文依赖性裂解的RNA样本 | NA | NA | 自裂解核酶（自切割RNA） | 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗 |
| 604 | 2026-05-03 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 开发了一种主动学习方法，用于训练区分增强子和沉默子的模型，并在发育中的神经视网膜中应用 | 将主动学习与合成生物学及不确定性采样相结合，迭代训练模型以区分功能相反的转录因子结合位点 | 未明确说明局限性 | 训练能够区分增强子和沉默子的模型，解释相同转录因子在不同上下文中激活或抑制转录的机制 | 发育中的神经视网膜中的增强子和沉默子 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告分析 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 几乎全部CRX结合位点及多轮合成生物学数据 | NA | NA | NA | 医学 |
| 605 | 2026-05-02 |
Engineering Plant-Derived P450 Enables the Efficient Production of Berberine through a Concise and Modular Enzymatic Cascade in E. coli
2026-Apr-27, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.6c00169
PMID:42063854
|
研究论文 | 通过工程化植物来源的P450酶，设计模块化酶促级联反应在大肠杆菌中高效生产小檗碱 | 优化设计了绕过多个天然步骤的简明模块化途径，并结合表达优化、结构指导设计、共识突变和机器学习综合工程化CYP719A1，获得活性提高8.9倍且热稳定性改善的变体 | NA | 解决植物膜结合细胞色素P450酶催化瓶颈，实现植物天然产物小檗碱的可持续高效生产 | 植物来源的CYP719A1酶及其工程化变体 | 合成生物学、代谢工程 | NA | 蛋白质工程、机器学习、酶级联反应 | 机器学习模型 | 序列和结构数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 模块化酶促级联途径（包含P450依赖步骤） | 医药、工业生物技术 |
| 606 | 2026-05-02 |
Engineered commensal Bacteroides thetaiotaomicron enables targeted drug delivery to colorectal tumors
2026-Apr-24, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114945
PMID:42036032
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研究论文 | 工程化肠道共生菌多形拟杆菌实现结直肠肿瘤靶向药物递送 | 基于天然肠道共生菌多形拟杆菌构建新型细菌递送系统，通过筛选表面锚定蛋白实现肿瘤靶向蛋白展示，并整合治疗模块实现双重抗肿瘤效果 | 尚需进一步评估临床安全性和长期免疫反应 | 开发基于肠道共生菌的靶向肿瘤治疗新策略 | 多形拟杆菌 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 微生物工程 | NA | NA | AOM/DSS诱导的结直肠癌小鼠模型 | NA | 多形拟杆菌 | 肿瘤靶向蛋白展示系统及溶血素E治疗模块 | 医学 |
| 607 | 2026-05-02 |
Ornithine lipids and other acyloxyacyl amino lipids: the coming-of-age story of a group of non-canonical membrane lipids
2026-Mar-08, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13777-2
PMID:41794944
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综述 | 本文综述了鸟氨酸脂及其他酰氧基酰基氨基脂的研究进展，包括其合成途径、功能及其在合成生物学中的潜在应用 | 首次系统分析了编码鸟氨酸脂合酶的基因在细菌分类中的分布，并讨论了鸟氨酸脂修饰对膜性质的生物物理影响及其与Toll样受体4的相互作用 | 未提供实验数据验证预测，且综述范围限于已发表研究，可能遗漏未报道的数据 | 总结鸟氨酸脂的生物合成、修饰、功能及应用进展，促进其在合成生物学中的利用 | 细菌中的鸟氨酸脂及类似脂类 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 基因序列数据 | NA | NA | 大肠杆菌（E. coli） | 代谢通路：鸟氨酸脂生物合成与修饰 | 合成生物学 |
| 608 | 2026-05-02 |
Mass spectrometry integrates protein design into structural biology method development
2026, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2025.10018
PMID:42063620
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综述 | 概述了质谱如何通过验证多种设计目标来补充蛋白质设计，并探讨了工程蛋白作为方法开发测试平台的价值 | 提出将机器学习与原生质谱整合形成反馈循环的新观点，即新设计挑战分析技术，改进的方法提供更丰富数据以指导未来预测 | 未提及具体实验数据或量化分析，缺乏对整合方法实际效能的评估 | 阐述质谱在蛋白质设计验证中的作用及其与机器学习的协同关系 | 人工设计蛋白质及其结构特征（寡聚化、折叠、配体结合、动态构象变化） | 机器学习 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工原细胞开发 |
| 609 | 2026-05-02 |
PSMA-directed CAR-T cell therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer: a next-generation engineering perspective on stem cell-derived immune effectors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819701
PMID:42064077
|
综述 | 这篇综述回顾了针对转移性去势抵抗性前列腺癌（mCRPC）的PSMA导向CAR-T细胞疗法的临床翻译现状，并提出了一种三重协同框架来克服TME免疫抑制、抗原异质性和T细胞适应性等核心挑战 | 提出了三重协同框架系统解构实体瘤障碍，并聚焦于干细胞衍生免疫效应器（如iPSC衍生CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞）作为新一代细胞产品范式，同时纳入基于证据的等级评估提升学术严谨性 | NA | 为PSMA-CAR-T疗法提供战略蓝图，以将其推进至mCRPC的治愈性治疗，并广泛适用于新一代干细胞衍生免疫疗法 | PSMA导向CAR-T细胞疗法及其在mCRPC中的临床应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | 人 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 610 | 2026-05-01 |
Combining model-based and data-driven models: An application to synthetic biology resource competition
2026-Jun, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2026.109649
PMID:41791590
|
研究论文 | 该研究探索了机器学习和机理模型的整合方法，并应用于合成生物学资源竞争问题 | 提出了部分不确定模型结构（PUMS）概念和嵌入式物理信息神经网络（ePINNs），通过两个共享损失函数神经网络无缝融合ML和MM组件，并防止ML忽视机理约束 | 机理模型构建耗时且依赖简化假设，可能无法完全捕捉现实复杂性 | 结合机器学习和机理模型以实现更鲁棒的预测和增强的系统洞察 | 机器学习模型与机理模型的整合方法 | 机器学习 | NA | NA | 嵌入式物理信息神经网络（ePINNs） | NA | NA | NA | 活细胞 | 基因网络模型 | 合成生物学 |
| 611 | 2026-05-01 |
Engineered live bacteria for liver diseases and gut-liver axis disorders: from genetic modification to advanced delivery systems
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04483-2
PMID:42057131
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综述 | 本文综述了工程化活菌在肝脏疾病及肠肝轴疾病中的应用，从基因修饰到先进递送系统的进展 | 系统总结了工程化活菌在肝脏疾病治疗中的内部基因修饰与外部共价连接策略，并讨论了多种递送系统（胶囊、微囊、纳米制剂）和给药方式 | 面临挑战包括工程化活菌的临床转化难度、安全性及稳定性问题 | 探讨工程化活菌在肝脏疾病治疗中的潜力，推动其临床应用并减轻肝脏疾病的全球负担 | 双歧杆菌、大肠杆菌Nissle 1917、枯草芽孢杆菌、布拉酵母菌、罗伊氏乳杆菌等工程化活菌 | 数字病理学 | 肝细胞癌、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病 | 基因工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌, 酿酒酵母 | 生物传感器, 代谢通路 | 医学 |
| 612 | 2026-04-28 |
Ultra-rapid and high-titer biomanufacturing of trehalose 6-phosphate by an in vitro synthetic biology platform
2026-Apr-27, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-026-01057-w
PMID:42043645
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 613 | 2026-05-01 |
LinkCraft: An interactive tool for the design of flexible linkers
2026-Apr-17, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169814
PMID:42001978
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研究论文 | LinkCraft是一个用于设计多结构域蛋白质中柔性连接子的交互式计算工具 | 将连接子视为可调节的分子功能决定因素，支持基于理化性质的序列生成和系综建模评估 | 未明确讨论实验验证结果或与其他设计工具的性能比较 | 为多结构域蛋白质的柔性连接子提供理性设计工具 | 多结构域蛋白质中的固有结构无序连接子 | 合成生物学 | NA | 计算建模 | 系综模型 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | 多结构域蛋白质连接子设计 | 合成生物学, 生物技术 |
| 614 | 2026-05-01 |
PANoptosis as a drug discovery framework: integrating cell death architecture with clinical translation
2026-04, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00388-0
PMID:41776350
|
综述 | 整合PANoptosis的分子架构与临床转化，提出以细胞死亡架构为基础的药物发现框架 | 首次提出PANoptosis作为药物发现框架，集成细胞死亡架构与临床试验转化，并引入临床极性与时序模型指导PANoptosis的诱导或抑制 | PANoptosis的分子机制尚未完全阐明，临床转换中组织特异性调控和长期安全性数据仍有限 | 综述PANoptosis的分子架构、调节机制及药物干预策略，推动其在感染、炎症、癌症和神经退行性疾病中的临床转化 | PANoptosis通路及其相关蛋白（ZBP1、AIM2、NLRP3、Pyrin、ASC、RIPK1、FADD、caspase-1/8、RIPK3-MLKL、gasdermins）和临床疾病模型 | 机器学 | 癌症，感染性疾病，炎症性疾病，神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 615 | 2026-05-01 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-01-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
|
研究论文 | 利用合成生物学重构DELTA-NOTCH信号通路，研究分节时钟中细胞间振荡通讯的动态机制 | 首次通过合成生物学方法重建DELTA-NOTCH通路，并结合光遗传学验证配体呈现动态对细胞通讯的关键作用 | 结果主要基于小鼠PSM类器官模型，需进一步在体内验证 | 验证DELTA-NOTCH信号在分节时钟中耦合细胞间振荡的作用 | 小鼠前体节中胚层类器官中的DELTA缺陷细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学构建、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成DELTA-NOTCH通路 | 小鼠 | DELTA-NOTCH信号振荡回路 | 发育生物学 |
| 616 | 2026-05-01 |
Microbial response and resistance mechanisms against diverse anthropogenic pollutants
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1775529
PMID:42057789
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综述 | 本文综述了微生物对人类活动产生的多种污染物的响应和抗性机制 | 整合微生物天然抗性、实验室适应性进化及组学技术，揭示污染物特异性与生物特异性适应策略 | 群落水平多组学研究不足、真菌相关数据相对有限以及混合培养研究面临的挑战 | 增强对微生物响应与抵抗人为污染物机制的理解 | 细菌、微藻、真菌等微生物 | 机器学习 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、真菌 | NA | 环境, 生物修复, 生物监测, 合成生物学 |
| 617 | 2026-05-01 |
Biosecurity in the age of synthetic nucleic acids: modernizing the law to manage emerging threats
2026 Jan-Jun, Journal of law and the biosciences
IF:2.5Q1
DOI:10.1093/jlb/lsag005
PMID:42058498
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综述 | 本文分析了合成核酸技术带来的生物安全挑战，并建议更新国际法以加强监管 | 提出结合具有约束力的国际义务与协调技术标准的跨国新治理方法来管理合成核酸风险 | 未提供实证研究或定量评估，主要基于法律和政策分析 | 评估当前生物安全框架对合成核酸的适用性并提出法律改革建议 | 合成核酸技术及相关的国际法律和监管框架 | NA | NA | 合成核酸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物安全、法律 |
| 618 | 2026-05-01 |
Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering
2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.05.622105
PMID:39574612
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研究论文 | 提出底物依赖性酶自聚集提高代谢效率的机制 | 揭示相分离酶可通过局部底物可用性调节‘粘性’实现近乎最优的聚类组织和间距，使代谢通量提升50-1000倍，毒性代谢物降低10-100倍 | 主要基于理论模型和数学模拟，缺乏体内实验验证 | 探索通过底物调控酶粘性实现代谢途径中酶的自组织优化策略 | 代谢途径中的相分离酶及底物系统 | 合成生物学, 代谢工程 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | 底物依赖性酶聚类系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 619 | 2026-05-01 |
Decoding biology with massively parallel reporter assays and machine learning
2024-10-16, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351800.124
PMID:39362779
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综述 | 本文综述了大规模并行报告基因检测与机器学习在解码生物学中的应用 | 结合大规模并行报告基因检测和机器学习，系统解析调控基因表达的顺式调控密码 | 未详细讨论方法的计算复杂度和实验验证挑战 | 通过MPRA和机器学习量化序列变异对基因表达的影响，并预测新序列功能 | 顺式调控元件、基因表达调控机制 | 机器学习 | NA | 大规模并行报告基因检测、高通量测序 | 机器学习模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、mRNA和基因治疗 |
| 620 | 2026-05-01 |
Artificial Diploid Escherichia coli by a CRISPR Chromosome-Doubling Technique
2023-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202205855
PMID:36642845
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研究论文 | 利用CRISPR染色体加倍技术构建人工二倍体大肠杆菌细胞 | 首次通过CRISPR技术构建稳定的人工二倍体大肠杆菌单细胞，并验证其特性 | 二倍体大肠杆菌生长显著减慢，且仅限于细菌中应用 | 探索合成生物学中人工多倍体细胞构建方法及其基础生命科学问题 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR、流式细胞术、定量PCR、荧光原位杂交、第三代基因组测序 | NA | 基因组序列、细胞图像 | 多个大肠杆菌菌株样本 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 染色体加倍电路 | 基础生命科学、工业生物技术 |