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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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601 | 2025-01-25 |
Synthetic Cell Lines for Inducible Packaging of Influenza A Virus
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00526
PMID:38259154
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研究论文 | 本文通过系统设计和合成生物学方法,设计了可诱导生产除血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)外所有病毒成分的细胞系,用于生产甲型流感病毒(IAV) | 首次展示了创建用于生产细胞病变性负链RNA病毒的包装细胞系的可能性,并提供了制造病毒疫苗的新方法 | 病毒RNA合成效率低以及宿主对病毒感染反应的基因表达上调可能是限制因素 | 开发一种新的方法来生产甲型流感病毒疫苗 | 甲型流感病毒(IAV) | 合成生物学 | 流感 | RNA-Seq转录组分析 | NA | RNA序列数据 | NA |
602 | 2025-01-25 |
A Comprehensive Review of the Diversity of Fungal Secondary Metabolites and Their Emerging Applications in Healthcare and Environment
2024, Mycobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.1080/12298093.2024.2416736
PMID:39845176
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综述 | 本文全面分析了真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业、环境可持续性和营养品中的新兴应用 | 综述了基因工程、代谢途径操作和合成生物学的最新进展,以提高次级代谢产物的产量,并强调了组学技术在理解次级代谢产物调控和生物合成中的重要性 | NA | 探讨真菌次级代谢产物的多样性及其在医疗保健、农业和环境可持续性中的应用 | 真菌及其次级代谢产物 | 生物技术 | NA | 基因工程、代谢途径操作、合成生物学、组学技术 | NA | NA | NA |
603 | 2025-01-25 |
Bacterial carrier-mediated drug delivery systems: a promising strategy in cancer therapy
2024, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2024.1526612
PMID:39845371
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综述 | 本文总结了细菌载体在抗癌药物递送中的应用及其优缺点,并强调了细菌载体递送系统在临床转化中的潜力 | 细菌载体递送系统利用细菌的趋化性和抗肿瘤免疫反应激活能力,结合纳米医学和合成生物学技术,为克服传统癌症治疗方案的局限性提供了新的策略 | 细菌载体递送系统在临床应用中仍面临安全性、稳定性和规模化生产等挑战 | 探索细菌载体递送系统在癌症治疗中的应用潜力 | 细菌载体递送的抗癌药物 | 生物医学工程 | 癌症 | 纳米医学、合成生物学 | NA | NA | NA |
604 | 2025-01-25 |
RecJ 5' Exonuclease Digestion of Oligonucleotide Failure Strands: A "Green" Method of Trityl-On Purification
2017-05-09, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.7b00010
PMID:28459543
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研究论文 | 本文介绍了一种使用RecJ 5'核酸酶纯化寡核苷酸失败链的绿色方法,旨在解决合成生物学中基因组装后错误过滤和校正的瓶颈问题 | 利用RecJ酶特异性消化未封闭的失败链,结合单链DNA结合蛋白(SSBP)增强RecJ的加工性,提供了一种简单、低成本且环保的寡核苷酸纯化方法 | 该方法在实验室环境下的应用效果尚未在大规模生产中验证,且对特定实验条件(如温度、酶量)有较高要求 | 开发一种高效、低成本且环保的寡核苷酸纯化方法,以替代现有的昂贵且劳动密集型技术 | 寡核苷酸失败链 | 合成生物学 | NA | RecJ 5'核酸酶消化 | NA | NA | 53 pmol的5'羟基化单链DNA |
605 | 2025-01-24 |
Exchange, promiscuity, and orthogonality in de novo designed coiled-coil peptide assemblies
2025-Jan-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d4sc06329e
PMID:39720134
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研究论文 | 本文探讨了在设计的卷曲螺旋肽组装体中肽交换的动态特性,并开发了一种荧光报告检测方法 | 开发了一种简便的荧光报告检测方法,用于研究肽交换,并提出了两种设计策略以提高不同寡聚体的正交性 | 研究主要关注肽交换的动态特性,对其他动态特性的探讨较少 | 研究设计的卷曲螺旋肽组装体中的肽交换动态特性 | 卷曲螺旋肽组装体,包括从二聚体到七聚体的不同寡聚体 | 合成生物学 | NA | 荧光报告检测 | NA | 实验数据 | NA |
606 | 2025-01-23 |
Environment signal dependent biocontainment systems for engineered organisms: Leveraging triggered responses and combinatorial systems
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.12.005
PMID:39830078
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综述 | 本文评估了环境信号依赖的生物遏制系统在工程生物中的应用,重点是利用触发响应和组合系统来提高安全性 | 本文创新地探讨了如何利用化学、光、温度和pH等环境信号设计生物遏制系统,并强调组合生物遏制系统的重要性 | 本文主要基于理论分析和案例研究,缺乏实验验证和大规模应用的数据支持 | 评估环境信号依赖的生物遏制系统在工程生物中的应用,以提高生物安全性 | 基因工程生物(GEOs)及其生物遏制系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
607 | 2025-01-23 |
A Rapid and Reversible Molecular "Switch" Regulating Protein Expression in Chlamydomonas reinhardtii
2025-Jan-22, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15360
PMID:39838873
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研究论文 | 本研究利用DD/Shield-1系统在Chlamydomonas reinhardtii中实现了外源基因表达的快速、稳定和可逆调控 | 首次在微藻中应用DD/Shield-1系统,展示了其作为分子开关的潜力,并成功构建了基因编辑蛋白LbCas12a的诱导表达菌株 | 研究中未提及该系统在其他微藻或更广泛生物系统中的适用性 | 开发一种在Chlamydomonas reinhardtii中调控外源基因表达的新方法 | Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | DD/Shield-1系统 | NA | NA | NA |
608 | 2025-01-23 |
Metabolic Engineering of Yeast
2025-Jan-21, Annual review of biophysics
IF:10.4Q1
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综述 | 本文综述了酵母代谢工程的最新进展和前景,包括用于生产燃料、化学品、蛋白质和肽的酵母菌株的开发,以及合成生物学工具和数学建模的进展 | 本文强调了合成生物学和代谢模型在加速代谢工程设计-构建-测试-学习周期中的重要作用,展示了酵母菌株在复杂表型开发中的潜力 | 本文主要关注酵母代谢工程,未涉及其他微生物细胞工厂的应用和比较 | 探讨酵母作为工业生物技术平台细胞工厂的代谢工程进展 | 酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具和数学建模 | NA | NA | NA |
609 | 2025-01-23 |
Constructing mechanosensitive signalling pathways de novo in synthetic cells
2025-Jan-21, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20231285
PMID:39838922
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研究论文 | 本文讨论了在合成细胞中从头构建机械敏感信号通路的最新进展 | 将机械敏感通道整合到合成细胞中,创建新的机械敏感信号通路 | NA | 研究机械转导的机制,并开发新的生物技术应用 | 合成细胞和机械敏感信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
610 | 2025-01-23 |
Biological Switches: Past and Future Milestones of Transcription Factor-Based Biosensors
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00689
PMID:39709556
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review | 本文回顾了自1961年Jacob和Monod描述操纵子以来,基于转录因子的生物传感器的发展历程,并探讨了其未来的前景和挑战 | 分析了从1960年代到2000年代的基础研究里程碑以及2000年代以后的工程策略,提供了对未来视角的深入见解 | 尽管取得了许多进展,但仍有许多障碍需要克服,以充分发挥生物传感器技术的潜力 | 回顾和总结基于转录因子的生物传感器的发展历程,并探讨其未来的应用前景 | 基于转录因子的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 高通量分析工具、DNA随机化策略、正向工程、高级蛋白质工程工作流程 | NA | NA | NA |
611 | 2025-01-23 |
A parallel bioreactor strategy to rapidly determine growth-coupling relationships for bioproduction: a mevalonate case study
2025-Jan-17, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-024-02599-x
PMID:39825460
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研究论文 | 本文介绍了一种利用平行生物反应器快速绘制特定产物形成速率、特定底物利用速率和特定生长速率之间生长耦合关系的方法,并以甲羟戊酸为例进行了研究 | 使用平行生物反应器快速评估生产力和生长速率与产物收率系数之间的生长耦合关系,并通过基因编辑消除有毒副产物乙酸盐的形成 | 研究中形成的乙酸盐可能会减缓生长并在下游处理中引起问题 | 研究生物制造的经济可行性,特别是通过工程微生物从可再生原料生产化合物 | 甲羟戊酸的生产 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | 实验数据 | 使用大肠杆菌BW25113进行实验 |
612 | 2025-01-23 |
Salmonella-based therapeutic strategies: improving tumor microenvironment and bringing new hope for cancer immunotherapy
2024-Dec-12, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-024-02578-0
PMID:39666238
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综述 | 本文综述了沙门氏菌在癌症免疫治疗中的应用,特别是其在改善肿瘤微环境(TME)方面的潜力 | 沙门氏菌因其广谱抗肿瘤活性、肿瘤靶向能力、免疫调节作用、溶瘤特性、遗传可编程性和工程灵活性,成为癌症免疫治疗中的领先候选者 | 开发更安全、更有效的基于沙门氏菌的癌症免疫疗法仍面临挑战 | 探讨沙门氏菌在调节肿瘤微环境(TME)中的应用,以增强癌症免疫治疗的疗效 | 沙门氏菌及其在癌症免疫治疗中的应用 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA |
613 | 2025-01-23 |
Engineering Cyborg Pathogens through Intracellular Hydrogelation
2024-Nov-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00420
PMID:39413025
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研究论文 | 本文通过细胞内水凝胶化技术,将非复制但代谢活跃的Cyborg细菌扩展到病原菌,探索其在生物医学应用中的潜力 | 将细胞内水凝胶化技术从实验室菌株扩展到病原菌,并验证其在巨噬细胞中的摄取和表型响应 | 仅研究了特定病原菌株,未涵盖所有可能的病原菌类型 | 探索通过细胞内水凝胶化技术改造病原菌,以应用于生物医学领域 | 不同菌株的病原菌 | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶化技术 | NA | 实验数据 | 多种病原菌株 |
614 | 2025-01-22 |
A synthetic biology approach for identifying de-SUMOylation enzymes of substrates
2025-Jan-21, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13838
PMID:39835880
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研究论文 | 本文介绍了一种合成生物学方法,通过在大肠杆菌中建立的重构系统,识别负责从特定蛋白质底物上去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶 | 利用合成生物学方法在大肠杆菌中建立重构系统,用于识别植物SUMO化酶 | NA | 识别负责去除SUMO翻译后修饰的植物泛素样蛋白酶 | 植物泛素样蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
615 | 2025-01-22 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Jan-15, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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研究论文 | 本文介绍了一种名为hDIRECT的平台,用于使用人类来源的蛋白质控制细胞因子的活性,以支持基于细胞的疗法 | 开发了hDIRECT平台,利用人类蛋白酶及其FDA批准的抑制剂来控制细胞因子的活性,实现了人类化合成生物学在人类健康中的应用 | 研究仍处于概念验证阶段,尚未进行大规模临床试验 | 开发一种能够控制细胞因子活性的平台,以支持基于细胞的疗法 | 细胞因子(IL-2、IL-6和IL-10)及其活性控制 | 合成生物学 | 癌症免疫疗法 | 人类蛋白酶及其抑制剂的使用 | NA | 蛋白质数据 | NA |
616 | 2025-01-22 |
Heterologous Biosynthesis of Terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202400712
PMID:39834096
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研究论文 | 本文主要探讨了在酿酒酵母中异源表达萜类化合物的方法,以提高其大规模生产的效率 | 利用合成生物学和代谢工程技术,构建高效的微生物细胞工厂,通过细胞微区室、关键P450酶的高效表达策略以及宿主代谢的调控和优化来增强萜类化合物的合成 | 当前仍面临一些挑战,需要进一步优化酵母底盘以提高萜类化合物的生产效率 | 提高萜类化合物的大规模生产效率 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
617 | 2025-01-22 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576308
PMID:39484520
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研究论文 | 本文介绍了一种名为hDIRECT的平台,用于使用人类来源的蛋白质控制细胞因子的活性,以支持基于细胞的治疗 | 开发了hDIRECT平台,利用人类蛋白酶及其FDA批准的抑制剂,通过蛋白水解切割激活和消除细胞因子的活性,实现了人类化合成生物学在人类健康中的应用 | 未提及具体的临床实验结果或长期效果评估 | 开发一种能够控制细胞因子活性的人类化合成生物学平台,以支持基于细胞的治疗 | 人类细胞因子(IL-2, IL-6, IL-10)及其活性控制 | 合成生物学 | 癌症免疫治疗 | 蛋白水解切割 | NA | 蛋白质数据 | 未提及具体样本数量 |
618 | 2025-01-22 |
Engineered Platforms for Maturing Pluripotent Stem Cell-Derived Liver Cells for Disease Modeling
2023, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2023.01.013
PMID:36738860
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研究论文 | 本文介绍了用于成熟多能干细胞来源的肝细胞的工程平台,用于疾病建模 | 使用先进技术(如蛋白质微图案化、控制大小的球体、多细胞类型和层次的类器官、3D生物打印、微流体设备和合成生物学)显著改善肝细胞样细胞(HLCs)的成熟 | 传统方法产生的HLCs表型不成熟,需要进一步改进 | 开发用于疾病建模的成熟多能干细胞来源的肝细胞平台 | 多能干细胞来源的肝细胞样细胞(HLCs) | 生物医学工程 | 肝病 | 蛋白质微图案化、3D生物打印、微流体设备、合成生物学 | NA | 细胞数据 | NA |
619 | 2025-01-21 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2025-Jan-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111541
PMID:39811667
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研究论文 | 本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎,用于可编程基因表达 | 通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合,进化出高活性变体,显著提高了蛋白质表达水平 | 未提及具体局限性 | 开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统,提高合成生物学应用的多样性和效率 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化技术 | NA | NA | NA |
620 | 2025-01-21 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2024-Dec-29, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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review | 本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展,重点介绍了两种研究策略及其在生物合成酶发现中的应用 | 提出了基于天然产物优先和酶优先的两种策略,用于发现Kitasatospora来源的肽类天然产物及其生物合成酶 | 未提及具体的研究局限性 | 探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究策略及其生物合成机制 | Kitasatospora来源的肽类天然产物及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具 | NA | 基因组数据、酶序列数据 | NA |