本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-05-08 |
HySimODE: a hybrid stochastic-deterministic simulation framework for multiscale models of biological systems
2026-May-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag185
PMID:41999207
|
研究论文 | 提出了HySimODE,一个用于生物系统多尺度模型的混合随机-确定性仿真框架 | 利用机器学习分类器自动将物种分配到随机或确定性区域,无需手动指定或修改模型,实现了数据驱动的混合仿真 | NA | 开发一种自动化的混合仿真框架,以处理混合低拷贝随机动态和高丰度确定性过程的生物化学模型 | 生物化学系统的多尺度模型 | 机器学习 | NA | 混合随机-确定性仿真 | 机器学习分类器 | NA | 训练和验证数据集包括多种动态区域的生物化学ODE模型 | NA | NA | NA | 合成生物学, 神经生物学 |
| 602 | 2026-05-08 |
Specialized proresolving mediator-loaded extracellular vesicles mitigate pulmonary inflammation
2026-May-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0398OC
PMID:41124277
|
研究论文 | 本文提出一种基于合成生物学的新策略,将促消退脂质介质装载到细胞外囊泡中,以减轻肺部炎症 | 首次利用合成生物学方法选择性装载促消退脂质介质(如resolvin D和E系列)到细胞外囊泡中,通过共表达三种生物合成酶(COX-2、5-LOX、15-LOX)实现 | 未明确提及,但可能存在规模化生产及体内递送效率的挑战 | 开发一种可扩展的装载促消退脂质介质的细胞外囊泡平台,用于治疗急性肺损伤等炎症性疾病 | 人胚胎肾293T细胞、THP-1来源的巨噬细胞、脂多糖处理的小鼠 | 合成生物学 | 急性肺损伤 | 多基因表达载体、细胞外囊泡装载技术 | NA | NA | NA | 合成生物学, 多基因表达载体 | 人胚胎肾293T细胞 | 共表达环氧化酶2、5-脂氧合酶和15-脂氧合酶的代谢通路,用于合成resolvin系列脂质介质 | 医学 |
| 603 | 2026-05-08 |
Functional Characterization and Mutagenesis Studies of a Microbial-like Diterpene Synthase from Huperzia serrata
2026-Apr-17, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules31081329
PMID:42076007
|
research paper | 首次鉴定并表征了蛇足石杉中的微生物样二萜合酶MTPSL1,揭示其多产物特性和关键氨基酸残基对骨架多样性的调控机制 | 首次报道蛇足石杉中的微生物样萜类合酶,通过结构导向的诱变研究揭示了酶功能多样性的分子基础,并发现S224A突变使特定二萜产量提升11.6倍 | 未明确说明该酶的底物特异性和体内代谢网络,以及突变体对其他底物和产物的影响未全面评估 | 探究蛇足石杉中微生物样二萜合酶的存在及其功能,并验证突变工程对产物产量的调控潜力 | 蛇足石杉(Huperzia serrata)中的微生物样二萜合酶MTPSL1及其诱变突变体 | 植物功能基因组学、酶工程、天然产物生物合成 | NA | 转录组分析、异源表达、分子克隆、定点诱变、质谱分析、核磁共振 | NA | 转录组数据、化合物结构数据 | 1个MTPSL1酶及其S224A突变体 | 定点诱变、异源表达 | 大肠杆菌(E. coli) | 二萜生物合成途径(针对spatane、prenylkelsoene型和biflorane三类骨架) | 天然产物生物合成、蛋白质工程、合成生物学 |
| 604 | 2026-05-08 |
Identification and characterization of two novel Acinetobacter species capable of degrading polyester
2026-Apr-09, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02491-25
PMID:41954411
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了两株能够降解多种聚酯塑料的新型不动杆菌菌株 | 发现并描述了两个新型不动杆菌分类单元(新种CAAS 2-6和新亚种CAAS 2-13),它们能利用五种主要商品聚酯作为唯一碳源,并鉴定了关键解聚酶多铜氧化酶和烷烃羟化酶 | NA | 鉴定和表征具有聚酯降解能力的新型不动杆菌菌株,扩展其降解塑料的代谢能力并提供生物修复候选菌 | 两株从垃圾渗滤液和草莓农田分离的不动杆菌菌株CAAS 2-6和CAAS 2-13 | 微生物学 | NA | 系统发育分析,基因组比较,酶解聚合实验 | NA | 基因组序列数据 | 两株细菌菌株 | NA | 不动杆菌 | NA | 环境生物修复,工业生物技术 |
| 605 | 2026-05-08 |
A Clozapine-Responsive GPCR-Based Gene Switch for Pharmacological Control of Gene Expression in Mammalian Cells and In Vivo
2026-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083381
PMID:42074026
|
研究论文 | 报道一种基于氯氮平响应性GPCR的基因开关,用于在哺乳动物细胞和体内实现药物可控的基因表达 | 首次将设计药物特异性激活受体与信号依赖性转录控制耦合,构建出临床相关的人源GPCR基因调控平台,并利用口服氯氮平实现体内低剂量有效调控 | 该基因开关的长期稳定性、免疫原性及在复杂疾病模型中的治疗效果尚需进一步验证 | 开发一种安全、临床兼容的药物调控基因表达系统,用于哺乳动物合成生物学和细胞治疗 | 哺乳动物细胞及C57BL/6J小鼠体内的工程化报告细胞 | 合成生物学 | NA | GPCR信号通路、cAMP/钙响应合成启动子 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠体内植入的藻酸盐包封报告细胞 | NA | 哺乳动物细胞、C57BL/6J小鼠 | 氯氮平响应性基因开关,耦合GPCR与cAMP或钙响应合成启动子 | 医学 |
| 606 | 2026-05-08 |
Remote Sensing of Endogenous Pigmentation by Inducible Synthetic Circuits in Grasses
2026-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70480
PMID:41351300
|
研究论文 | 本研究成功在C4单子叶植物狗尾草中构建了配体诱导合成电路,通过远程传感技术检测内源性色素生成 | 首次在单子叶植物中实现配体诱导的内源性花青素通路激活,并结合高光谱成像与判别性目标表征方法进行非破坏性远程检测 | 尚未在更大范围单子叶作物或田间环境中验证系统稳定性和普适性,配体渗透效率可能受物理屏障影响 | 探索单子叶植物中诱导型合成电路的应用,实现内源性色素生成的可控诱导与远程传感 | 狗尾草(Setaria viridis)原生质体及整株植物 | 合成生物学 | NA | 高光谱成像,判别性目标表征 | NA | 高光谱图像 | 狗尾草原生质体及整株植物样本 | 传感器电路构建 | 狗尾草(Setaria viridis) | 配体诱导型传感器电路,激活内源性花青素通路 | 农业 |
| 607 | 2026-05-08 |
Bioorthogonal and synthetic biology-engineered bacterial outer membrane vesicles for enhanced photo-immunotherapy
2026-04, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.044
PMID:41740694
|
研究论文 | 工程化细菌外膜囊泡用于增强光免疫治疗 | 结合合成生物学与生物正交化学,双重改造细菌外膜囊泡,同时实现基因工程表达IL-2、载光敏剂ICG及生物正交靶向,形成协同抗肿瘤免疫平台 | 未提及长期安全性评估、大规模制备工艺及临床转化可行性验证 | 开发兼具免疫激活、光热治疗与精准肿瘤靶向的多功能OMV纳米载体,用于增强乳腺癌的光免疫治疗 | 细菌外膜囊泡(OMVs) | 合成生物学 | 乳腺癌 | 电穿孔、代谢糖工程 | NA | NA | NA | 合成生物学、生物正交化学 | 细菌 | IL-2表达模块、N3/DBCO生物正交标记系统 | 医学 |
| 608 | 2026-05-08 |
3D Expansion-PALM (PhotoActivated Localization Microscopy) Dissects Protein-Protein Interactions Down to the Molecular Scale in Bacteria
2026-Mar-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms14040772
PMID:42075168
|
研究论文 | 通过结合膨胀显微镜和光激活定位显微镜,在细菌中实现约3纳米空间分辨率的双色三维单分子定位,用于研究蛋白质-蛋白质相互作用 | 优化细菌中的膨胀显微镜方案实现4倍各向同性膨胀,最小化色差和信号串扰,通过高选择性斜入射照明提高单分子灵敏度 | NA | 发展一种有效方法,用于原核生物和高密度样品中分子组织的研究 | 参与组氨酸生物合成的HisF和HisH蛋白质 | 计算机视觉 | NA | 三维膨胀光激活定位显微镜 | NA | 图像 | 细菌细胞中的HisF和HisH蛋白质 | NA | 细菌 | NA | 微生物学, 合成生物学, 细胞生物物理学 |
| 609 | 2026-05-08 |
Next-Generation Immune Checkpoints and Tumor Microenvironment Modulation in Cancer Immunotherapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/7864229
PMID:41811823
|
综述 | 全面探讨下一代免疫检查点和肿瘤微环境调节在癌症免疫治疗中的应用,包括共抑制和共刺激通路、联合治疗策略及精准免疫肿瘤学框架 | 系统总结下一代免疫检查点(如LAG-3、TIM-3、TIGIT等共抑制分子和ICOS、OX40等共刺激分子)的机制与临床证据,并整合免疫代谢、先天免疫感应、细胞因子信号、维生素D和肠道菌群等TME调节策略,提出基于多组学、系统生物学和人工智能的精准免疫肿瘤学框架 | 治疗效益仍局限于部分患者,主要由于免疫逃逸、肿瘤异质性和肿瘤微环境的免疫抑制特性 | 综述下一代免疫检查点和肿瘤微环境调节在癌症免疫治疗中的进展、挑战和未来方向 | 下一代免疫检查点(共抑制和共刺激通路)、肿瘤微环境调节策略(免疫代谢、先天免疫、细胞因子、维生素D、肠道菌群)、临床试验数据 | NA | 多种恶性肿瘤 | 多组学分析、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 610 | 2026-05-08 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
|
综述 | 本文综述了用于基因组记录细胞事件的分子电路的发展策略 | 提出了构建能忠实将过去细胞状态编码到基因组DNA记录中的新传感模块和遗传电路架构的需求 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其揭示细胞命运决定新见解的潜力尚未实现 | 探索构建用于基因组记录多种细胞事件的分子电路 | 基于CRISPR的基因组编辑技术和合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 传感模块和遗传电路架构 | NA |
| 611 | 2026-05-08 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-01-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
|
研究论文 | 本研究利用量子隧穿纳米间隙结和机器学习技术,对八种人工合成DNA碱基进行了电识别研究 | 首次将量子隧穿传输与机器学习结合用于人工DNA碱基的高精度电识别,实现了高达100%的碱基识别准确率 | 未提及实际生物样本中的验证或系统级应用限制 | 实现人工合成DNA碱基的快速精确电识别,推动遗传研究、DNA数据存储和合成生物学发展 | 八种人工合成DNA碱基(DNA和DNA碱基) | 机器学习 | NA | 量子隧穿传输 | 机器学习模型 | 序列 | 八种人工合成DNA碱基数据 | NA | NA | NA | 合成生物学, 遗传学, DNA数据存储, 诊断 |
| 612 | 2026-05-08 |
Smartphone-controlled optogenetically engineered cells enable semiautomatic glucose homeostasis in diabetic mice
2017-04-26, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aal2298
PMID:28446682
|
研究论文 | 该论文通过结合电子工程、软件工程和合成生物学,开发了一套智能手机辅助的半自动糖尿病治疗方案 | 首次将智能手机控制与光遗传工程细胞相结合,实现远红光响应的小鼠血糖稳态半自动调节 | 需要进一步验证该方法在人体中的安全性和有效性,且依赖无线设备和植入式水凝胶胶囊的稳定性 | 开发基于智能手机控制的半自动细胞治疗系统,用于糖尿病管理 | 糖尿病模型小鼠及工程化光遗传细胞 | 合成生物学 | 糖尿病 | 光遗传学 | NA | NA | 糖尿病小鼠若干 | NA | 小鼠 | 远红光响应光遗传开关,控制人胰高血糖素样肽-1(shGLP-1)或小鼠胰岛素的产生 | 医学 |
| 613 | 2026-05-07 |
Proanthocyanidins: structure, biosynthesis, regulation, and structure-activity relationships
2026-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.abiote.2026.100047
PMID:42088953
|
综述 | 综述了原花青素的结构多样性、生物合成途径、调控网络及应用前景 | 系统阐述了原花青素聚合的非酶促机制、MYB-bHLH-WD40核心转录复合物的调控作用,并指出了结构-活性关系的关键知识空白 | 未阐明聚合反应的细胞定位、聚合机制及精确的结构-活性关系 | 总结原花青素研究最新进展,明确未来研究方向 | 原花青素 | NA | NA | 基因编辑, 合成生物学, 纯化技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 医疗, 食品, 动物营养 |
| 614 | 2026-05-07 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-May-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
|
research paper | 通过代谢工程改造出芽短梗霉菌高效生产葡萄糖酸 | 首次通过敲除普鲁兰、聚苹果酸、liamocin和黑色素关键基因并结合过表达内源葡萄糖氧化酶基因,构建出目前报道产量最高的葡萄糖酸生产菌株 | 未提及该工程菌株在工业规模化生产中的长期稳定性和经济性评估 | 高效生产葡萄糖酸 | 出芽短梗霉菌株TSYW-58 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | 一个出发菌株和多个工程菌株 | CRISPR-Cas9等基因编辑工具(未明确说明具体工具) | Aureobasidium melanogenum(出芽短梗霉) | 葡萄糖氧化酶过表达及副产物合成通路敲除 | 工业生物技术 |
| 615 | 2026-05-07 |
Optimizing Bispecific Antibody Expression via Multi-Omics Analysis and Vector Redesign
2026-May-06, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70228
PMID:42089360
|
研究论文 | 通过多组学分析和载体重设计优化双特异性抗体的表达 | 提出了整合序列级生物信息学和合成生物学诊断的方法,直接提高了复杂生物制品的可制造性,为解决隐蔽表达缺陷提供通用框架 | NA | 解决双特异性抗体在中国仓鼠卵巢细胞中表达效率低的问题 | 三种IgG-scFv格式的双特异性抗体 | 机器学习 | NA | RNA测序、剪接预测、密码子优化评估、基序筛选 | NA | 文本、序列数据 | 三种双特异性抗体候选物 | NA | 中国仓鼠卵巢细胞 | NA | 医学 |
| 616 | 2026-05-07 |
Genetic code expansion: Bridging synthetic biology precision and cellular complexity to decipher molecular mechanisms of diseases
2026-May-04, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102690
PMID:42085977
|
综述 | 本文概述了遗传密码扩展技术在生理相关背景下研究疾病生物学的进展、挑战和新兴方法 | 将GCE定位为转化合成生物学平台,用于机制性解析疾病过程,强调其在越来越接近生理环境中的应用 | 该技术广泛实施的主要挑战仍待解决,但具体局限性文中未详细说明 | 利用遗传密码扩展技术解析疾病的分子机制 | 动态蛋白质相互作用、翻译后修饰和信号事件 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 617 | 2026-05-07 |
Multi-Targeting Non-Specific Genome Engineering in Bacteria
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521532
PMID:41801001
|
研究论文 | 开发了一种基于多靶向整合酶系统的通用基因组工程方法MNGE,用于在多种细菌中高效整合代谢基因或途径 | 提出MNGE方法,基于多靶向整合酶系统实现多拷贝、高度随机(仅需核心TT二核苷酸)的基因整合,适用于革兰氏阳性和阴性菌,并显著提高异源宿主中化合物产量 | NA | 开发一种宿主独立的通用基因组工程方法,以高效整合和表达代谢基因或途径 | 多种细菌,包括革兰氏阳性菌(链霉菌、糖多孢菌)和革兰氏阴性菌(伯克霍尔德菌、紫色杆菌) | NA | NA | MNGE, 多靶向整合酶系统 | NA | NA | NA | NA | 链霉菌 (Streptomyces albus), 伯克霍尔德菌 (Burkholderia gladioli) | 代谢途径整合 | 代谢工程,合成生物学,工业生物技术 |
| 618 | 2026-05-07 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cells
2026-Apr-30, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-026-01677-9
PMID:42062565
|
研究论文 | STRAIGHT-IN Dual平台能够在人诱导多能干细胞中高效同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台,实现一周内同时进行两个DNA构建体的等位基因特异性单拷贝整合,并支持近无疤痕载荷整合和组件循环利用 | NA | 开发高效的双基因整合平台,加速干细胞中合成生物学的设计-构建-测试循环 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的神经元、运动神经元和内皮细胞 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 人诱导多能干细胞, 神经元, 运动神经元, 内皮细胞 | 四环素诱导型控制与格拉佐普瑞韦诱导型合成基因开关 | 医学, 生物技术 |
| 619 | 2026-05-07 |
An in vitro approach for simulating divergent Golgi O-glycosylation of tumor-associated MUC1 from normal MUC1
2026-04-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72151-y
PMID:42020444
|
研究论文 | 通过体外合成生物学方法模拟肿瘤相关MUC1与正常MUC1的差异性高尔基体O-糖基化 | 首次采用体外一锅合成生物学方法模拟癌症相关的糖基化通路差异,结合动力学和计算机反应动态模拟解析酶定位和底物特异性 | NA | 解析肿瘤相关MUC1异常糖基化的分子机制 | MUC1黏蛋白及其糖基化过程 | 合成生物学 | 肿瘤 | 体外一锅合成生物学方法,动力学模拟,计算机反应动态模拟 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 620 | 2026-05-07 |
Improving governance in the age of synthetic biology, artificial intelligence, and diverging threats
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1705143
PMID:42088837
|
研究论文 | 探讨合成生物学和人工智能时代如何改进治理以应对生物安全威胁 | 提出了一个包含四个相互关联组件的混合治理框架,并结合专家共识制定政策建议 | 依赖于少数专家的意见,可能无法涵盖所有视角 | 在合成生物学和人工智能时代改进治理,降低生物武器开发与扩散风险 | 生物威胁优先事项及治理框架 | NA | NA | Delphi过程 | NA | 定性数据 | 13位来自不同相关领域的专家 | 合成生物学 | NA | NA | 生物安全, 治理 |