合成生物学相关文章
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当前共找到 3181 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2025-03-19 |
Fungi: Pioneers of chemical creativity - Techniques and strategies to uncover fungal chemistry
2025, IMA fungus
IF:5.2Q1
DOI:10.3897/imafungus.16.142462
PMID:40093757
|
review | 本文综述了真菌在药物开发和新型化学物质发现中的重要作用，并探讨了从过去到现在天然产物发现和药物先导物识别的分析及战略框架 | 强调了利用合成生物学系统探索真菌基因组的努力，并提出了合作与协作的必要性以充分利用真菌次级代谢物的潜力 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨真菌在药物开发和新型化学物质发现中的应用及其技术进展 | 真菌及其次级代谢物 | 生物化学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 602 | 2025-03-19 |
Engineering a cell-free biosensor signal amplification circuit with polymerase strand recycling
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.25.591074
PMID:38712145
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研究论文 | 本文介绍了一种名为聚合酶链回收（PSR）的无细胞生物传感信号放大电路，通过利用T7 RNA聚合酶的脱靶转录来回收DNA链置换电路中的核酸输入 | 开发了PSR电路，扩展了无细胞生物传感的能力，实现了高特异性和低检测限的RNA目标直接传感 | NA | 扩展无细胞电路的能力，通过PSR实现信号放大，用于生物技术中的多种应用 | RNA目标和小分子检测 | 合成生物学 | NA | 聚合酶链回收（PSR），DNA链置换电路 | 双平衡模型 | 核酸 | NA |
| 603 | 2025-03-18 |
CasGen: A Regularized Generative Model for CRISPR Cas Protein Design with Classification and Margin-Based Optimization
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640911
PMID:40060553
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研究论文 | 本文提出了一种名为CasGen的新型生成模型，用于设计CRISPR Cas蛋白，通过分类和基于边缘的优化来提高新生成Cas9和Cas12蛋白的质量 | CasGen是一种基于Transformer的深度生成模型，结合了分类、贝叶斯优化和AlphaFold结构验证，以增强新生成Cas蛋白的功能性和结构相似性 | 研究依赖于现有的Cas9和Cas12蛋白序列数据，可能限制了生成蛋白的多样性 | 扩展基因组编辑工具包，设计更多样化的Cas蛋白，以应用于合成生物学和治疗领域 | Cas9和Cas12蛋白 | 合成生物学 | NA | AlphaFold结构预测、BLAST序列比对 | Transformer | 蛋白质序列 | 3,021个Cas9、597个Cas12和597个非Cas蛋白序列 |
| 604 | 2025-03-18 |
Microbial production of 5-epi-jinkoheremol, a plant-derived antifungal sesquiterpene
2024-Oct-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01191-24
PMID:39283105
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研究论文 | 本研究构建了一个微生物平台，用于高效生产具有强杀菌活性的植物源倍半萜5-epi-jinkoheremol | 首次构建了用于可持续生产这种抗真菌倍半萜的高效微生物细胞工厂 | 关键酶TPS18的催化活性限制了5-epi-jinkoheremol的进一步产量 | 开发一种可持续的生物杀菌剂生产方法 | 5-epi-jinkoheremol | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程 | NA | NA | NA |
| 605 | 2025-03-17 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Mar-14, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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评论 | 本文描述了一个分析学术界与产业界在合成生物学领域接口的研讨会 | 强调了从学术研究到成功生物技术企业的转化过程中各组成部分的必要性和协作性 | 未提及具体的研究数据或案例 | 探讨如何将学术研究转化为成功的生物技术企业 | 学术界与产业界在合成生物学领域的合作 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 606 | 2025-03-16 |
Global and gene-specific translational regulation in Escherichia coli across different conditions
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010641
PMID:36264977
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研究论文 | 本文研究了在不同条件下大肠杆菌中全局和基因特异性翻译调控的机制 | 揭示了基因特异性翻译调控的多样性，并发现许多调控翻译的基因自身也受到翻译调控，提出了可能的反馈机制 | 研究主要集中在大肠杆菌，未涉及其他细菌或更复杂的生物系统 | 探讨mRNA转录水平与蛋白质丰度之间的关系，特别是在不同环境下的翻译调控机制 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 全基因组转录组分析 | 随机森林模型 | mRNA和蛋白质数据 | 12种不同条件下的大肠杆菌样本 |
| 607 | 2025-03-15 |
Unleashing the potential of biotechnological strategies for the sustainable production of microalgal polysaccharides
2025-Mar-14, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2475240
PMID:40084718
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综述 | 本文探讨了利用生物技术策略可持续生产微藻多糖的潜力 | 提出了利用合成生物学和代谢工程克服微藻多糖生产中的技术生物复杂性，并实现大规模生产的关键策略 | 尽管合成生物学有进展，但微藻产品的商业化生产仍未被充分利用 | 探索可持续的生物原料，特别是通过光合作用生产多糖的微藻，以实现碳封存和绿色生产有价值的代谢物 | 微藻及其多糖生物合成途径 | 生物技术 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA |
| 608 | 2025-03-15 |
Identification, Characterization, and Catalytic Mechanism of Regioselective UbiA Prenyltransferases in Morus Plants
2025-Mar-13, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504190
PMID:40080387
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研究论文 | 本文研究了桑树中UbiA预酰基转移酶的识别、表征及其催化机制，特别是区域选择性的精确控制 | 通过分子对接、动力学模拟和量子化学计算揭示了底物诱导的构象变化，以及不同MaPTs与moracin M之间的差异结合，并讨论了预酰基供体的识别和区域选择性逆转的潜在机制 | 尽管识别了10种MaPTs，但其催化机制，特别是区域选择性的精确控制仍不完全清楚 | 研究桑树中UbiA预酰基转移酶的催化机制，特别是区域选择性的控制 | 桑树中的UbiA预酰基转移酶及其底物moracin M | 生物化学 | NA | 分子对接、动力学模拟、量子化学计算 | NA | 分子结构数据 | 10种MaPTs |
| 609 | 2025-03-15 |
Design principles of gene circuits for longevity
2025-Mar-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006
PMID:40082090
|
review | 本文探讨了影响寿命的基因回路，并强调了反馈回路在维持细胞平衡中的作用 | 通过系统生物学和合成生物学的方法，提出了稳定单细胞中反馈回路的策略，以增强其对衰老相关损伤的抵抗力 | 主要基于酵母模型，可能不直接适用于其他生物体 | 探索基因回路如何影响寿命，并提出延长寿命的策略 | 基因回路，特别是SIR2-HAP回路 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学 | NA | NA | NA |
| 610 | 2025-03-15 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-Feb-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
|
综述 | 本文探讨了合成生物学和人工智能在作物改良中的应用，包括基因电路设计、基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程和AI等策略 | 首次系统性地综述了AI驱动的合成生物学在植物工程中的应用，并提出了通过AI赋能的合成生物技术开发SMART作物的概念 | 尚未解决合成生物学发展中的挑战，如技术复杂性和伦理问题 | 探讨合成生物学和人工智能在作物改良中的应用，以提高作物产量、营养吸收、抗逆性和营养质量 | 作物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成核酸和蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程 | AI | 基因数据、蛋白质数据、多组学数据 | NA |
| 611 | 2025-03-15 |
Towards the first synthetic eukaryotic cell
2024-Dec, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.11.001
PMID:40078978
|
综述 | 本文全面回顾了合成生物学和合成基因组学领域在实现首个合成真核细胞方面的进展 | 强调了Sc2.0项目在提供关键工具和工程细胞平台方面的贡献，这些工具和平台显著加速了研究和工业进展 | 讨论了合成真核生命带来的伦理和法律问题，但未提出具体解决方案 | 探讨合成真核细胞的设计原则和构建策略，以及其在医学、工业、农业和研究中的潜在应用 | 真核细胞 | 合成生物学 | NA | DNA合成 | NA | NA | NA |
| 612 | 2025-03-15 |
Cyberbiosecurity: Advancements in DNA-based information security
2024-Aug, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2024.06.002
PMID:40078663
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在信息安全和生物安全领域的新应用，特别是DNA作为信息存储和读取媒介的潜力及其带来的网络生物安全威胁 | 提出了DNA作为信息存储媒介的新应用，并探讨了由此引发的网络生物安全问题 | 主要集中于理论探讨，缺乏具体的实验数据或案例研究 | 为网络生物安全研究提供理论支持，并提高对信息安全、生物安全和国家安全风险的认识 | DNA作为信息存储和读取媒介的应用及其安全威胁 | 合成生物学 | NA | DNA合成与测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 613 | 2025-03-15 |
Human biomimetic liver microphysiology systems in drug development and precision medicine
2021-04, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-020-00386-1
PMID:33335282
|
综述 | 本文综述了人类仿生肝脏微生理系统（MPS）在药物开发和精准医学中的应用 | 从简单的2D细胞模型、球体和类器官发展到能够模拟肝脏腺泡结构和功能的复杂系统，以增强对疾病进展机制和治疗候选药物吸收、分布、代谢、排泄和毒性的理解 | NA | 探讨人类仿生肝脏MPS在药物发现、开发和精准医学中的应用 | 人类仿生肝脏微生理系统 | 生物医学工程 | NA | 微流控设备、生物打印、工程基质材料、定义生理和病理生理介质、患者来源的原代细胞、多能干细胞以及合成生物学 | NA | NA | NA |
| 614 | 2025-03-14 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2025-Mar-12, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
|
综述 | 本文综述了Ectoine作为一种后生元治疗剂的潜力，包括其作用机制、应用及未来发展方向 | 探讨了Ectoine在抗衰老、癌症预防及神经系统疾病治疗中的新应用，并提出了利用人工智能优化其药物配方和临床应用的新方向 | Ectoine在真核细胞中的生物利用度低，工业化生产的可扩展性受限，以及合成生物学方法的高成本 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂在多种疾病管理中的有效性和安全性 | Ectoine及其在鼻炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫性疾病和代谢综合征中的应用 | 生物医学 | 鼻炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫性疾病、代谢综合征 | NA | NA | NA | NA |
| 615 | 2025-03-14 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具，用于分析植物生长素激素信号通路的复杂生化特性 | AuxInYeast系统利用酵母作为植物合成生物学底盘，结合荧光蛋白报告基因，通过高通量方法如流式细胞术定量测量信号动态 | NA | 研究玉米生长素激素信号通路的生化特性 | 玉米生长素信号通路的关键组件，包括受体（ZmTIR1/AFB）、阻遏物（ZmIAA）、共阻遏物（REL2）、转录因子（ZmARF）和生长素响应元件（auxRE） | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白报告基因、流式细胞术 | NA | 生化数据 | NA |
| 616 | 2025-03-14 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议，以分析玉米生长素信号通路 | 开发了AuxInYeast系统，利用酵母作为异源表达平台，结合荧光标记，实现了对植物生长素信号通路的高通量定量测量 | 该方法主要适用于实验室环境，可能不适用于所有植物种类或复杂的自然条件 | 研究目的是通过合成生物学方法，解析和工程化植物生长素信号通路，以促进玉米的生长和发育 | 研究对象是AuxInYeast菌株，特别是那些用于测量玉米生长素感知的菌株 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株，具体数量未明确 |
| 617 | 2025-03-14 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
|
综述 | 本文综述了合成生物学方法在玉米信号通路研究中的应用，并提供了在玉米中应用合成原理和方法的指南 | 利用酵母异源表达系统（AuxInYeast）展示异源表达方法在测试信号通路进化、遗传和生化基本属性方面的强大能力 | NA | 研究玉米信号通路的基本生物学问题，并推动育种和植物工程新工具的开发 | 玉米信号通路 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | AuxInYeast系统 | NA | NA |
| 618 | 2025-03-14 |
SubtiToolKit: a bioengineering kit for Bacillus subtilis and Gram-positive bacteria
2025-Mar-11, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.004
PMID:40074634
|
研究论文 | 本文介绍了SubtiToolKit（STK），一种针对枯草芽孢杆菌和革兰氏阳性细菌的高效克隆工具包 | STK是首个专门为革兰氏阳性细菌设计的克隆工具包，填补了该领域的空白 | 目前STK的应用主要集中在枯草芽孢杆菌和少数工业相关菌株，尚未广泛验证于其他革兰氏阳性细菌 | 开发一种适用于革兰氏阳性细菌的高效克隆工具包，以促进合成生物学研究 | 枯草芽孢杆菌和其他革兰氏阳性细菌 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆方法 | NA | DNA序列 | NA |
| 619 | 2025-03-01 |
Next-generation biotechnology inspired by extremes : The potential of extremophile organisms for synthetic biology and for more efficient and sustainable biotechnology
2025-Mar, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00389-6
PMID:40016427
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 620 | 2025-03-14 |
Synthetic gene circuits in plants: recent advances and challenges
2025, Quantitative plant biology
DOI:10.1017/qpb.2025.3
PMID:40070723
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综述 | 本文综述了植物合成生物学领域的最新进展和挑战，特别是合成基因回路在植物基因表达控制中的应用 | 提供了对合成基因回路的全面理解，并讨论了在植物中构建高级合成基因回路以编程控制基因表达的最新进展 | 讨论了开发和有效应用合成基因回路所面临的挑战，包括定量测量、高通量测试和回路建模 | 研究植物合成生物学，特别是合成基因回路在植物基因表达控制中的应用 | 植物 | 合成生物学 | NA | 合成基因回路 | NA | NA | NA |