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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-07-03 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
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评论文章 | 综述了色蛋白在合成生物学中的最新进展,包括其理化性质、分类、工程策略和新兴应用 | 系统阐述了色蛋白作为可见报告因子的独特优势,并展望其通过理性设计推动合成生物学平台发展的潜力 | 当前色蛋白变体的发现和设计仍需进一步推进,以满足更模块化和可及的应用需求 | 总结色蛋白研究进展并探索其在合成生物学中的应用 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 原核生物, 真核生物 | 可见报告因子 | NA |
| 622 | 2026-07-03 |
CRISPR as a next-generation environmental biosurveillance tool for air, land, and water
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.014
PMID:41421891
|
综述 | 本文综述了CRISPR技术在环境生物监测中的应用,提出其作为下一代空气、土地和水体监测工具的发展路线图 | 整合CRISPR技术、计算科学、合成生物学和生物监测领域的交叉进展,提出战略路线图以建立CRISPR-eBx作为一线生物监测解决方案 | 文中指出的关键挑战包括部署到新颖生物/基因靶标和环境源时需解决的问题 | 评估CRISPR在环境生物监测中的潜力并构建战略路线图 | 环境核酸中的生物体,包括病原体、入侵物种和濒危物种 | 机器学习 | NA | CRISPR | NA | 环境核酸数据 | NA | CRISPR-Cas | NA | 生物传感器 | 环境监测, 生物监测 |
| 623 | 2026-07-03 |
A synthetic biology roadmap for sustainable production of the plant-originated anti-cancer drug paclitaxel
2026-Jul, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.013
PMID:41506928
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综述 | 探讨合成生物学在可持续生产植物源抗癌药物紫杉醇中的应用路线图 | 提出利用非常规底盘(如植物相关蓝细菌和丝状真菌)增强P450兼容性,并构建融合无细胞系统、合成微生物群落、杂合化学酶合成和机器学习等先进工具的实用框架 | 尚未通过实验验证所提策略的可行性,且紫杉醇生物合成途径的复杂性仍是主要瓶颈 | 提出合成生物学路线图以实现紫杉醇的可持续生产 | 紫杉醇及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、无细胞系统、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物相关蓝细菌, 丝状真菌 | 代谢途径、生物传感器 | 医学 |
| 624 | 2026-07-03 |
Inorganic nanomaterials empowering bacteria: a new paradigm for biomedical applications
2026-Jul-01, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00687f
PMID:42301118
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综述 | 本文综述了利用无机纳米材料赋予细菌新功能以构建杂合系统的策略及其在生物医学中的应用 | 提出了通过无机纳米材料为细菌提供物理保护、增强多模态成像和引入光热/磁热协同治疗等新机制,构建功能性杂合系统,推动了细菌疗法向临床转化 | 目前杂合系统的生物安全性和临床转化仍面临挑战,需进一步研究 | 探讨无机纳米材料赋能细菌构建智能杂合系统,用于诊断和治疗应用,为下一代生物医学平台奠定基础 | 无机纳米材料与细菌构建的杂合系统 | 机器学 | 肿瘤、耐药菌感染、肠道菌群失调 | NA | NA | NA | NA | 表面修饰、细胞内矿化、微胶囊包封 | 细菌 | NA | 医学 |
| 625 | 2026-07-03 |
Advances and prospects in cell therapy for cancer: explorations from T cells to stem cells
2026-Jul-01, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02780-8
PMID:42380095
|
综述 | 系统概述了从T细胞到干细胞的各种癌症细胞治疗策略的最新进展、作用机制和临床转化 | 综合性分析了细胞治疗从自体到通用型、从血液肿瘤到实体瘤、从体外到体内工程化的扩展趋势,并纳入新兴技术如多组学、人工智能和合成生物学的整合 | 肿瘤异质性、免疫抑制微环境和治疗相关毒性仍是主要挑战 | 总结癌症细胞治疗领域的最新进展并展望未来方向 | T细胞(CAR-T、TCR-T、TILs、γδT细胞)、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞、B细胞和干细胞 | 数字病理学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 626 | 2026-07-03 |
Acoustic cavitation-enhanced lymphatic trafficking of inhaled bacterial-sourced biohybrid vaccines for antitumor immunity
2026-Jul-01, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2026.06.007
PMID:42386468
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研究论文 | 提出一种结合合成生物学与声学工程的生物杂交纳米疫苗平台,实现非侵入性气道至淋巴结的疫苗接种策略以增强抗肿瘤免疫 | 利用工程化非致病性大肠杆菌作为活体抗原工厂,结合超声响应性锰螯合细菌膜纳米囊泡,通过低频超声触发声学液滴汽化,实现空化增强的淋巴转运,克服肺部生理屏障 | 可能涉及工程菌株的安全性和超声设备的临床转化挑战 | 开发下一代个性化免疫治疗的吸入式疫苗 | 工程化大肠杆菌TOP10菌株、肿瘤抗原、小鼠肺部淋巴结 | 合成生物学 | 癌症 | 声学液滴汽化、纳米囊泡包裹 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌TOP10 | 细菌膜纳米囊泡作为抗原递送载体 | 医学 |
| 627 | 2026-07-03 |
Bacterial degradation of aromatic ester pollutants in agro-ecosystems: implications for bioremediation
2026-Jul-01, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13916-9
PMID:42387175
|
综述 | 本文综述了农业生态系统中芳香酯类污染物的细菌降解机制及其在生物修复中的应用 | 结合合成生物学方法和细菌生态生理特性,提出增强原位降解的新策略 | 未提供具体的实验数据或定量分析,缺乏实际应用案例验证 | 阐述细菌降解芳香酯类污染物的遗传、代谢和进化机制,以及合成生物学在修复中的应用前景 | 芳香酯类污染物(芳香酸酯和芳香醇酯)及降解细菌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 农业, 环境 |
| 628 | 2026-07-03 |
Towards the construction of a virtual yeast
2026-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10574-9
PMID:42387167
|
研究论文 | 提出一个名为“虚拟酵母”的AI驱动智能体,通过整合多模态生物数据、机制推理和主动实验,模拟真核细胞行为 | 首次将大语言模型协调层与多个领域特定AI模块结合,构建闭环学习管道自主设计和执行实验,实现细胞行为的计算模拟 | 尚处于概念验证阶段,实际计算复杂度高,依赖数据质量和完整性 | 推进细胞生命计算模拟,优化生物合成途径,加速靶点发现和假设生成 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)作为遗传可操作和数据丰富的模式系统 | 机器学习, 合成生物学 | NA | NA | 大语言模型, 生成式模型, 表示学习模型 | 多模态生物数据(包括机制知识、亚细胞结构和动态状态) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 虚拟细胞模型(功能模块包括遗传、代谢和结构系统) | 合成生物学, 生物技术 |
| 629 | 2026-07-03 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
|
研究论文 | 通过合成生物学调控,重组工程益生菌用于尿酸模块化降解及高尿酸血症治疗 | 首次构建表达PucL和PucM酶的重组益生菌株,并通过模块化优化RBS强度、过表达尿酸转运蛋白基因ygfU和过氧化氢降解酶基因katG,显著提高了尿酸降解效率,同时在小鼠模型中验证了其通过调节肠道菌群改善高尿酸血症的机制 | 仅限于体外实验和小鼠模型验证,未进行人体临床试验,且工程菌的长期安全性及稳定性需进一步评估 | 开发一种更安全有效的工程益生菌疗法,用于尿酸降解和高尿酸血症的治疗 | 重组益生菌Escherichia coli Nissle 1917及高尿酸血症小鼠模型 | 合成生物学 | 高尿酸血症 | 合成生物学、RBS优化、基因过表达 | NA | 实验数据 | 小鼠模型,具体数量未说明 | CRISPR-Cas9 | Escherichia coli Nissle 1917 | 尿酸降解模块(pucL和pucM基因)、尿酸转运模块(ygfU基因)和过氧化氢降解模块(katG基因) | 医学 |
| 630 | 2026-07-03 |
A Bacteroides synthetic biology toolkit to build an in vivo malabsorption biosensor
2026-Feb-19, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.052
PMID:41610848
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研究论文 | 本文开发了一套用于脆弱拟杆菌的合成生物学工具包,并构建了体内吸收不良生物传感器,以非侵入方式监测肠道渗透压变化 | 首次为拟杆菌属构建了模块化的合成生物学工具包,包括可抑制启动子、DNA调控系统、模块化荧光转录报告电路及替代质粒整合模式,并验证其在哺乳动物肠道中的长期非侵入性监测能力 | 该生物传感器目前仅针对渗透压诱导的吸收不良模型验证,对其他肠道环境变化(如pH、氧气)的监测能力尚未探索;小鼠模型与人体肠道环境的差异可能限制直接转化 | 开发用于肠道健康诊断的非侵入性监测工具,利用遗传可操作的共生菌构建生物传感器 | 脆弱拟杆菌及小鼠模型中的肠道环境 | 合成生物学 | 吸收不良综合征、渗透性腹泻 | 荧光报告系统、质粒整合 | NA | 荧光数据 | 小鼠模型(泻药诱导渗透性腹泻) | CRISPR-Cas9 | 脆弱拟杆菌 | 可抑制启动子、荧光转录报告电路 | 医学 |
| 631 | 2026-07-03 |
Molecular Lego in the Green Factory: Engineering Plant Metabolism with Golden Gate Assembly
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5384-5_8
PMID:42390748
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研究论文 | 本文报告了一种利用Golden Gate组装技术模块化构建和优化植物代谢途径的合成生物学框架 | 提出了Golden Gate组装在植物代谢工程中的标准化应用方案,能够高效、无缝地同时组装10-20个DNA片段,显著优于传统克隆方法 | 未明确讨论组装效率在更大规模片段或复杂基因组背景下的潜在限制,以及瞬态表达系统的长期稳定性问题 | 开发一种可扩展且通用的策略,用于提高植物中高价值特化代谢物的产量 | 植物特化代谢物的生物合成途径,特别是通过本氏烟草瞬态表达验证 | 合成生物学、植物代谢工程 | NA | Golden Gate组装 | NA | DNA序列、代谢物数据 | 本氏烟草瞬态表达实验,具体样本数量未提及 | Golden Gate Assembly | 本氏烟草、大肠杆菌、酵母 | 植物代谢途径的模块化构建,包括启动子、非翻译区、编码序列和调控元件 | 医药、营养保健品、工业生物技术、农业 |
| 632 | 2026-07-03 |
Divergent multifunctional P450s-empowered biosynthesis of bioactive tripterifordin and cryptic atiserenoids in Aconitum implies convergent evolution
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61188-0
PMID:40595667
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研究论文 | 通过挖掘乌头转录组,发现多功能P450酶驱动二萜类化合物结构多样化和功能分化,实现生物活性化合物tripterifordin和隐存atiserenoids的合成 | 首次揭示多功能P450酶催化二萜骨架七个不同位点的氧化,并发现关键残基调控P450活性和产物谱,同时发现tripterifordin在乌头中的趋同进化合成 | 未进一步探索下游二萜途径的详细机制,且体内功能验证可能受限于异源表达系统 | 研究细胞色素P450单加氧酶如何驱动二萜类化合物的结构多样化和功能分化 | 乌头(Aconitum carmichaelii 和 Aconitum coreanum)中的二萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 转录组测序,功能验证,蛋白质分析,定点诱变,组合生物合成 | NA | 序列数据 | 两个乌头物种的转录组样本 | NA | NA | 组合生物合成途径,用于生产tripterifordin、guan-fu二萜类化合物A和14种新atiserenoids | 医药 |
| 633 | 2026-07-03 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-06, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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综述 | 提出通过工程化人工微生物群落实现个性化肠道微生物组调控和疾病治疗的方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计精确的微生物群落以执行特定功能,实现个性化精准治疗 | 需要严格的临床试验来评估工程化微生物群落在不同人群中的安全性、有效性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组来根治代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落 | 合成生物学 | 代谢紊乱, 炎症性疾病, 胃肠道感染 | NA | NA | NA | NA | NA | 人体肠道微生物组 | 人工微生物群落(包含治疗分子产生、免疫调节和抗病原菌等功能模块) | 医学 |
| 634 | 2026-07-03 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-12-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
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综述 | 系统回顾21世纪中国在植物病毒抗病毒剂方面的化学与生物学研究进展 | 整合化学、化学生物学、合成生物学等多学科方法,深入分析植物病毒靶标生物学特征及药物-靶标互作机制 | 未明确指出具体研究局限,可能缺乏对现有药剂抗性问题的讨论 | 综述植物病毒抗病毒剂研发的生物学基础、靶标特性及未来药物开发方向 | 植物病毒及其抗病毒剂 | 植物病毒学 | 植物病毒病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 农作物 | NA | 农业 |
| 635 | 2026-07-03 |
pLxIS-containing domains are biochemically flexible regulators of interferons and metabolism
2024-07-11, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.030
PMID:38925114
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研究论文 | 揭示含pLxIS基序的蛋白在干扰素信号传导和代谢调控中的多功能性 | 通过合成生物学平台鉴定出两个孤儿pLxIS蛋白,发现其通过独立于已知模式识别受体途径激活干扰素反应,并揭示pLxIS基序作为多基序信号实体的一部分,具有激活IRF3、TRAF6、IκB激酶、MAPK及代谢活动的灵活功能 | 未提及具体局限性 | 探索pLxIS基序在干扰素信号传导和代谢中的新功能及调控机制 | 含pLxIS基序的蛋白质 | 合成生物学 | 病毒感染 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学平台 | 人细胞 | pLxIS基序信号调控回路 | 医学, 免疫学 |
| 636 | 2026-07-03 |
A high-throughput synthetic biology approach for studying combinatorial chromatin-based transcriptional regulation
2024-06-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.05.025
PMID:38906116
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research paper | 开发了一个高通量筛选平台,用于研究酵母中染色质调控因子对转录活性的影响 | 构建了包含1900多对染色质调控因子的组合文库,并结合低维氨基酸嵌入的机器学习模型预测共招募对转录活性的影响 | NA | 研究染色质调控因子对转录活性的组合影响 | 酵母细胞中的染色质调控因子对 | 机器学习 | NA | 高通量筛选 | 监督机器学习模型 | 基因表达数据 | 1900多对染色质调控因子 | NA | S. cerevisiae | 组合染色质调控回路 | 合成生物学 |
| 637 | 2026-07-03 |
A Directed Evolution Protocol for Engineering Minimal Transcription Factors, Based on CIS Display
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3718-0_1
PMID:38441754
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研究论文 | 提出一种基于CIS展示的定向进化方法,用于工程化最小转录因子 | 首次将CIS展示技术应用于DNA结合蛋白的选择,突破了传统质粒克隆方法在库容量上的限制,实现大于10^10变体的库规模 | 仅以Cro转录因子为例验证方法,其他DNA结合蛋白的适用性尚未充分证明 | 开发一种高效定向进化DNA结合蛋白的体外展示方法 | 最小转录因子Cro | 合成生物学 | NA | CIS展示 | NA | NA | 从10^6的起始频率中富集1个Cro蛋白 | CIS展示系统 | NA | NA | 合成生物学、医学 |
| 638 | 2026-07-02 |
Advances in the HAK/KUP/KT Potassium Transporter Family in Regulating Na+/K+ Homeostasis and Salt Tolerance in Plants
2026-Jul-01, Annals of botany
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/aob/mcag193
PMID:42384214
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综述 | 系统综述了植物中HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在维持Na+/K+稳态和耐盐性中的作用 | 全面阐述了该转运蛋白家族在分类、进化关系和功能特化方面的最新进展,特别关注了盐生植物中特定转运蛋白的功能多样性和适应性进化,以及其在糖植物中可能产生的矛盾效应 | 未提及具体实验验证或定量分析结果,主要基于已有文献总结,缺乏原创性实验数据支持 | 总结HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族在植物耐盐性中的调控机制,为遗传改良提供潜在靶点 | HAK/KUP/KT钾转运蛋白家族及其在多种植物物种中的功能 | 植物生物学 | NA | 基因编辑、合成启动子、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9,合成生物学 | 农作物,木本植物,盐生植物 | NA | 农业 |
| 639 | 2026-07-02 |
Cell-free synthesis and characterization of Salmonella, Escherichia coli, and Shigella-specific bacteriophages
2026-Jun-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03049-z
PMID:42380887
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研究论文 | 利用基于大肠杆菌的无细胞基因表达系统成功合成并表征了七种针对沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌的噬菌体 | 首次报道了五种噬菌体在无细胞系统中的成功合成,并展示了使用无内毒素菌株生产感染性噬菌体的能力,以及完全体外组装噬菌体基因组的可行性 | 无细胞合成噬菌体与宿主来源噬菌体在宿主依赖性感染效率上存在显著差异,可能限制了其在某些应用中的直接替代使用 | 评估基于大肠杆菌的无细胞平台合成多种与食品安全和合成生物学应用相关的噬菌体的能力 | 七种来自四个不同科、针对沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌的噬菌体 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达系统 | NA | 噬菌体滴度、感染效率、热稳定性数据 | 七种噬菌体,涉及多个沙门氏菌、大肠杆菌和志贺氏菌宿主菌株 | NA | 大肠杆菌、ClearColi | NA | 食品, 医学 |
| 640 | 2026-07-02 |
A genetic manipulation tool based on the GP35 recombinase for targeted gene editing in mycoplasmas of ruminants
2026-Jun, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.113096
PMID:42055338
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研究论文 | 介绍了一种基于GP35重组酶的质粒方法,用于实现对反刍动物支原体(如牛支原体)的靶向基因编辑 | 首次将噬菌体SPP1的GP35重组酶用于支原体的长单链DNA重组工程,实现精确的基因插入和缺失,规避了随机脱氨风险,且编辑率高达77.78%-100% | 未明确提及限制条件,可能需进一步验证在其它反刍动物病原中的通用性 | 开发有效的遗传操作工具以促进反刍动物支原体的致病机制研究和疫苗开发 | 反刍动物支原体(如牛支原体Mycoplasma bovis) | 基因编辑 | 牛支原体病、羊支原体病 | 重组工程、质粒构建 | NA | 基因序列、突变体数据 | 牛支原体突变体系列(含代谢与毒力基因),编辑率样本覆盖77.78%-100% | GP35重组酶(来自噬菌体SPP1) | 牛支原体(Mycoplasma bovis) | 质粒介导的长单链DNA重组路线 | 农业、医学 |