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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-01-07 |
Harnessing microalgae for bioproducts: innovations in synthetic biology
2025-Dec-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04727-7
PMID:41359128
|
综述 | 本文综述了合成生物学在微藻工程中的应用,以促进可持续生物燃料和高价值生物产品的生产 | 整合CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库和动态环境响应调控电路等最新合成生物学工具,提升微藻代谢途径的精确重编程能力 | 菌株鲁棒性和生物过程转化方面仍存在挑战 | 推动微藻作为可持续生物制造平台的发展,以支持低碳生物经济 | 微藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库、动态调控电路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化克隆系统 | 微藻 | 动态环境响应调控电路,用于控制脂质和色素生物合成 | 能源, 工业生物技术 |
| 622 | 2026-01-07 |
Exploiting Salmonella typhimurium as a novel cancer therapeutic agent: from tumor colonization to metabolic engineering
2025-Nov-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04716-w
PMID:41307628
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综述 | 本文综述了利用鼠伤寒沙门氏菌作为新型癌症治疗剂的机制、代谢工程进展及临床转化挑战 | 首次系统整合鼠伤寒沙门氏菌的多重抗癌机制(凋亡诱导、自噬诱导、免疫调节等),并从代谢工程与合成生物学角度提出增强治疗特异性的统一视角 | 细菌介导的癌症疗法仅能作为现有癌症治疗的补充手段,无法完全替代传统疗法,且存在生物安全性与临床转化挑战 | 探讨利用细菌天然靶向肿瘤特性开发新型癌症治疗策略 | 鼠伤寒沙门氏菌及其代谢工程改造菌株 | NA | 癌症 | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 鼠伤寒沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 623 | 2026-01-07 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-Oct-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
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研究论文 | 本研究提出了一种结合机器学习和化学信息学的新方法,利用分子指纹预测化合物对利什曼原虫前鞭毛体的活性,以加速抗利什曼病药物的发现 | 首次将Avalon、MACCS Key和Pharmacophore三种分子指纹算法与随机森林、多层感知器、梯度提升和决策树等多种机器学习算法结合,并引入了集成模型,用于针对利什曼病的化合物活性预测 | 研究仅针对利什曼原虫的前鞭毛体阶段进行活性预测,未涵盖无鞭毛体阶段;模型性能仍有提升空间(最高准确率83.65%) | 开发一种高效的计算方法来预测和筛选具有抗利什曼病活性的化合物,以应对现有疗法副作用大和耐药性上升的挑战 | 来自PubChem数据库的65,057个化合物分子,针对利什曼原虫前鞭毛体 | 机器学习 | 利什曼病 | 化学信息学、分子指纹编码(基于SMILES)、Alamar Blue检测法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 化学结构数据(分子指纹) | 65,057个化合物分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 624 | 2026-01-06 |
Beyond Tanacetum cinerariifolium: Advances in Pyrethrins Biosynthesis and Prospects for Engineered Cell Factories
2026-Jan-04, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01549-8
PMID:41485148
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综述 | 本文综述了除虫菊酯生物合成的研究进展,并探讨了利用合成生物学和代谢工程构建工程细胞工厂以实现规模化、可持续生产的潜力 | 提出了从传统花卉种植转向工程细胞工厂的新生产策略,以解决除虫菊酯农业生产的限制 | NA | 探讨除虫菊酯生物合成途径及利用合成生物学实现可持续生产的可能性 | 除虫菊酯的生物合成途径、关键酶及其异源合成 | 合成生物学 | NA | 异源合成、代谢工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |
| 625 | 2026-01-06 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Jan-03, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法,结合简单实验与热力学框架来优化启动子功能 | 提出了一种基于转录因子的上下文最小化、测量优先的方法,通过序列占用和功能概念来设计可调控启动子 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子,以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计 | 合成生物学 | NA | 热力学框架、简单实验 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计,涉及动态范围、泄漏性和敏感性等特征 | 工业生物技术 |
| 626 | 2026-01-06 |
Long noncoding RNA regulation of immunity
2026-Jan, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02355-9
PMID:41482550
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综述 | 本文综述了长链非编码RNA(lncRNA)在哺乳动物免疫系统中的调控作用,包括其在免疫细胞分化、功能及疾病关联中的机制 | 文章强调了lncRNA在代谢途径、细胞表面糖基化非编码RNA及抗原性细胞外核糖核蛋白复合物中的新型调控机制,并特别关注了女性特异性lncRNA XIST在自身免疫性疾病中的性别偏向作用 | NA | 探讨lncRNA在免疫系统调控中的角色及其在免疫相关疾病中的影响 | 长链非编码RNA(lncRNA)及其在免疫细胞和免疫反应中的功能 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 高通量功能基因组学、人类遗传学、分子互作图谱、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 627 | 2026-01-06 |
Structure-Guided Engineering of 2-Oxoglutarate-Dependent Oxygenases: Principles, Case Studies, and Emerging Opportunities
2026, Chemical & pharmaceutical bulletin
IF:1.5Q3
DOI:10.1248/cpb.c25-00652
PMID:41485885
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综述 | 本文综述了2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)的结构引导工程原理、案例研究及新兴机遇 | 系统总结了基于2OGX保守结构基序(如CLip、CLid、SL、DL及β-折叠框架)进行理性重编程以改变反应性的策略,展示了将羟化酶转化为卤化酶、重定向真菌酶构建非天然萜类支架等创新案例 | NA | 探讨如何通过结构引导的蛋白质工程策略,理性改造2OGX酶的功能,拓展其在生物催化中的应用 | 2-酮戊二酸依赖性非血红素铁加氧酶(2OGX)及其结构-功能关系 | 合成生物学 | NA | 结构生物学、计算设计、蛋白质工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、天然产物发现、药物开发 |
| 628 | 2026-01-06 |
Dietary Saponins as Antiaging Agents: A Systematic Review of Molecular Mechanisms, Nutritional Intervention, and Product Development
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12207
PMID:41288460
|
综述 | 本文系统综述了膳食皂苷作为抗衰老剂的分子机制、营养干预及产品开发 | 系统总结了膳食皂苷通过多种信号通路(如Nrf2/HO-1、PI3K/Akt等)实现抗衰老的分子机制、构效关系及产品开发,并提出了未来研究方向 | NA | 探讨膳食皂苷的抗衰老作用及其应用潜力 | 膳食皂苷 | NA | 衰老相关疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药, 食品 |
| 629 | 2026-01-06 |
Pseudomonas spp. and antimicrobial resistance: unlocking new horizons with 1-hydroxyphenazine
2025-Dec, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-025-01355-4
PMID:41045408
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综述 | 本文综述了1-羟基吩嗪(1-HP)作为应对抗菌素耐药性(AMR)的新型抗菌策略的潜力,涵盖其历史、作用机制、生物合成及在农业、生物技术和医学中的应用前景 | 系统整合了1-HP作为毒力因子和治疗支架的双重角色,并强调通过合成生物学、代谢工程和纳米载体递送系统实现规模化生产与毒性降低的创新策略 | NA | 探索应对抗菌素耐药性的新型抗菌策略,重点关注吩嗪类化合物特别是1-HP的潜力 | 1-羟基吩嗪(1-HP)及其作为抗菌剂和抗癌先导化合物的特性 | NA | NA | 合成生物学,代谢工程,纳米载体递送系统,结构修饰(如卤化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业,生物技术,医学 |
| 630 | 2026-01-05 |
The role of gut microbiome in aging-associated diseases: where do we stand now and how technology will transform the future
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2607076
PMID:41454672
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综述 | 本文综述了肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用,并探讨了新兴技术如何推动该领域的研究和干预措施开发 | 提出了整合微生物组科学、衰老生物学和新兴技术的PRIME框架,为推进精准医学和促进健康老龄化提供了全面蓝图 | NA | 探讨肠道微生物组在衰老相关疾病中的作用,以及如何利用技术推动相关研究和临床干预 | 肠道微生物组及其与衰老相关疾病的关联 | NA | 衰老相关疾病(包括感染性疾病、自身免疫病、神经退行性疾病、精神疾病、癌症、代谢性疾病、肾脏疾病、心血管疾病、骨骼和肌肉疾病等) | 功能多组学、合成生物学、人工智能驱动分析、生物样本库、自体粪便微生物群移植 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 631 | 2026-01-05 |
Enhancing delta-tocotrienol production in Saccharomyces cerevisiae via metabolic engineering strategies in conjunction with the mutagenesis of tocopherol cyclase
2026-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.11.013
PMID:41480008
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研究论文 | 本研究通过代谢工程和酶工程策略,成功提高了酿酒酵母中δ-生育三烯酚的产量 | 结合酶融合构建底物通道、优化转运蛋白表达以及通过半理性蛋白质设计突变关键限速酶,显著提升了δ-生育三烯酚的微生物异源生产 | NA | 构建高效的微生物细胞工厂以生产δ-生育三烯酚,补充或替代维生素E供应链 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶工程、半理性蛋白质设计、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 通过PaCrtE和SyHPT酶的顺序融合构建底物通道,优化MGGBQ前体供应;表达转运蛋白PDR1以增强产物外排 | 食品、化妆品、制药 |
| 632 | 2026-01-05 |
Advances in nanorobotics for gastrointestinal surgery: a new frontier in precision medicine and minimally invasive therapeutics
2025-Jul-14, Journal of robotic surgery
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s11701-025-02550-8
PMID:40660043
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综述 | 本文综述了纳米机器人技术在胃肠外科手术中的最新进展,探讨其在精准医疗和微创治疗领域的应用前景 | 将纳米工程、合成生物学与智能计算相结合,推动静态结构向能动态导航胃肠环境的智能代理发展,实现分子水平的智能微创手术 | 面临自主性控制、脱靶效应、伦理法律框架等重大挑战,临床转化仍需跨学科协作 | 探讨纳米机器人技术在胃肠外科精准医疗和微创治疗中的应用与发展路径 | 手术纳米机器人及其在胃肠环境中的应用 | NA | NA | 纳米工程、合成生物学、智能计算 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 633 | 2026-01-05 |
Polymer sailing on rafts within lipid membranes
2025-Jul-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503203122
PMID:40608678
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研究论文 | 通过流体动力学模拟和单分子追踪实验,研究了线性聚合物在二元脂质膜上的动力学行为 | 发现纳米尺寸聚合物优先吸附于膜筏形成组分,可诱导并稳定单个脂筏,且聚合物吸附物可作为膜异质性的生物传感器 | 研究基于简化模型和实验条件,实际生物膜环境更复杂,需进一步验证 | 阐明细胞膜上大分子吸附动力学及其在生物技术和细胞过程中的作用 | 线性聚合物在二元脂质膜上的吸附与扩散行为 | 生物物理学 | NA | 流体动力学模拟、单分子追踪实验 | Saffman-Delbrück扩散模型、Zimm模型、Stokes-Einstein模型 | 模拟数据、实验追踪数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、生物传感、治疗、合成生物学 |
| 634 | 2026-01-04 |
A Review of Receptor Recognition Mechanisms in Coronaviruses
2025-Dec-16, Viruses
DOI:10.3390/v17121628
PMID:41472297
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综述 | 本文综述了冠状病毒家族中不同属的宿主受体识别机制,并总结了病毒受体的鉴定和阐明方法 | 整合结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学和人工工程化病毒受体,为阐明冠状病毒-受体相互作用提供了一个强大的框架 | NA | 阐明冠状病毒的受体识别机制,以更好地理解病毒感染、传播和发病机制,并支持广谱抗病毒药物、智能生物传感器和针对新兴冠状病毒的干预策略的开发 | 冠状病毒家族及其宿主受体 | NA | 冠状病毒感染 | 结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 635 | 2026-01-04 |
CRISPR Treatments for AI-Designed Synthetic Viruses: Rapid Programmable Countermeasures for Emerging and Engineered Viruses
2025-Dec-05, Viruses
DOI:10.3390/v17121588
PMID:41472258
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综述 | 本文综述了利用可编程CRISPR技术对抗新兴及人工合成病毒的快速应对策略 | 提出将实时测序、AI辅助gRNA筛选与多重CRISPR盒设计相结合的快速响应管线,并强调多gRNA鸡尾酒疗法、持续基因组监测及自适应gRNA轮换等创新策略 | NA | 构建基于CRISPR的抗病毒对策以应对自然爆发和人工智能设计的生物威胁 | 新兴及人工合成的DNA与RNA病毒 | 合成生物学 | 病毒性疾病 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13, 实时测序, AI辅助设计 | NA | 基因组序列 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13 | NA | 多重CRISPR盒设计 | 医学 |
| 636 | 2026-01-04 |
A Bioorthogonal and Programmable Bacterial Delivery System for Spatiotemporally Targeted Therapy of Solid Tumors
2025-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240396
PMID:41476656
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研究论文 | 本文设计了一种基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的时空靶向递送系统,用于实体瘤治疗,通过叠氮修饰的透明质酸水凝胶和近红外辐射控制,实现安全有效的肿瘤靶向治疗 | 开发了一种结合温度驱动基因状态开关和生物正交水凝胶的时空靶向系统,能精准控制细菌在肿瘤微环境中的治疗输出,增强肿瘤浸润淋巴细胞活性 | NA | 开发一种安全、可编程的细菌递送系统,用于实体瘤的时空靶向治疗,以克服传统细菌疗法对健康组织的潜在危害 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917、叠氮修饰的透明质酸水凝胶、近红外辐射诱导系统 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学工程、温度驱动基因开关、近红外辐射诱导 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 温度驱动的遗传状态开关,用于控制治疗性输出的产生和释放 | 医学 |
| 637 | 2026-01-04 |
Bioengineering hybrid artificial life
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1676359
PMID:41477590
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综述 | 本文探讨了生物工程与人工生命(ALife)的融合,旨在通过标准化生物部件设计适应性、进化性的人工生命系统,以解决实际问题 | 提出了一种混合合成人工生命设计方法论,结合数字和生物进化设计方法,以克服当前合成人工生命在进化适应性和任务适应性方面的限制 | 当前合成人工生命在定向进化、适应度景观映射和适应度近似方面存在显著不足,导致其无法持续进化并适应变化的任务和环境 | 旨在解决合成人工生命在定向进化中的开放挑战,推动生物工程化问题解决型人工生命的实现 | 人工生命系统,特别是通过生物工程和合成生物学方法设计的适应性、进化性系统 | 合成生物学 | NA | 定向进化、遗传多样性生成、适应度映射、适应度估计 | NA | NA | NA | 标准化生物部件(如启动子、核糖体) | 微生物(如用于环境清理或抗体生产的工程微生物) | 问题解决型人工生命系统,可能涉及逻辑门、生物传感器或代谢途径 | 环境、医学、工业生物技术 |
| 638 | 2026-01-03 |
Programmable bacteria-driven biohybrid triggers spatiotemporal-controlled STING activation to potentiate cuproptosis-based cancer therapy
2026-May, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究提出了一种创新的生物杂交系统DB@CSCN,通过工程化大肠杆菌和CuS纳米颗粒协同诱导铜死亡并激活STING通路,用于高效肿瘤靶向精准免疫治疗 | 利用合成生物学方法构建了可时空控制释放STING激动剂的工程菌-纳米颗粒生物杂交系统,首次揭示了STING激活通过破坏肿瘤糖酵解代谢来增强铜死亡的协同机制 | 研究未明确说明动物模型的具体类型及样本量细节,且激光照射的临床转化可行性有待进一步验证 | 开发协同诱导铜死亡和激活STING通路的肿瘤靶向精准免疫治疗新策略 | 工程化大肠杆菌(DacA-Bac菌株)、CuS纳米颗粒及其构建的生物杂交系统DB@CSCN | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、基因工程、纳米技术、激光控制释放 | 生物杂交系统(工程菌-纳米颗粒复合体系) | 实验数据(包括体外细胞实验和体内动物模型数据) | NA | 合成生物学方法(具体工具未明确说明) | 大肠杆菌(Escherichia coli) | 基因编程工程菌生产STING激动剂cDA,并与CuS纳米颗粒功能化构建靶向释放系统 | 医学(肿瘤免疫治疗) |
| 639 | 2026-01-03 |
Advances in the engineering of living probiotics for cancer immunotherapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125301
PMID:41355950
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综述 | 本文综述了工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的应用进展,包括细菌与肿瘤的复杂关系、细菌修饰的工程方法及其在增强癌症疗法中的应用 | 探讨了利用合成生物学等工程方法改造细菌以创建先进的基于细菌的药物递送系统,并展望了组合疗法、个性化医疗和微生物组在提高治疗效果中的潜力 | NA | 概述工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的发展,以增强治疗疗效和安全性 | 细菌(特别是活益生菌)及其与肿瘤微环境和免疫系统的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 测序技术、物理化学方法、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌(如益生菌) | 基于细菌的药物递送系统 | 医学 |
| 640 | 2026-01-03 |
Biosensors for Cancer and Inflammation: Whole-Cell Biosensors for Soluble Molecules
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4901-5_25
PMID:41478986
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综述 | 本章节介绍了利用合成转录因子构建全细胞生物传感器,用于检测炎症和癌症生物标志物(如唾液中的神经氨酸)的流程 | 提出了一种基于定制转录因子的原核生物传感器菌株构建方法,以神经氨酸作为口腔癌生物标志物检测为例 | NA | 开发用于检测可溶性小分子(如癌症和炎症生物标志物)的全细胞生物传感器 | 全细胞生物传感器(WCBs),特别是基于合成转录因子的原核生物传感器菌株 | 合成生物学 | 口腔癌 | 合成生物学方法,包括遗传电路设计和转录因子工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 大肠杆菌(Escherichia coli MG1655) | 集成定制转录因子的遗传电路,用于检测神经氨酸 | 医学 |