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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-11-06 |
Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening
2025-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00240-5
PMID:40994446
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综述 | 本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用,重点关注m6A介导的调控网络 | 提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学方法的创新路线图,用于精准农业应用 | 对RNA修饰的分子机制理解仍有限,特别是m6A以外的其他修饰类型 | 解析植物表观转录组的调控机制并开发精准农业应用 | 植物RNA修饰网络及其在发育和果实成熟中的功能 | 植物分子生物学 | NA | 表观转录组测序,CRISPR,单细胞空间表观转录组学 | NA | 表观转录组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物系统 | RNA修饰依赖的翻译控制系统,RNA表观遗传编辑工具 | 农业 |
| 622 | 2025-11-05 |
Ultrasensitive Multiplexed Detection of Protein Biomarkers via Aptamer-Driven T7 RNA Polymerase Amplification
2025-Nov-04, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04805
PMID:41123957
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研究论文 | 开发了一种基于适配体驱动T7 RNA聚合酶级联放大的超灵敏蛋白质生物标志物检测系统 | 首次将适配体识别与T7 RNA聚合酶等温扩增相结合,实现蛋白质生物标志物的可视化双通道检测 | NA | 建立一种简单、高灵敏度、无干扰的蛋白质生物标志物同时检测方法 | 血清中的蛋白质生物标志物(以甲胎蛋白和人血清白蛋白为模型) | 合成生物学 | NA | 适配体识别、T7 RNA聚合酶等温扩增、荧光RNA-染料复合物检测 | NA | 荧光信号 | 加标样品和临床样品 | NA | NA | 蛋白质响应性核酸电路、信号放大系统 | 医学诊断、即时检测 |
| 623 | 2025-11-05 |
Efficiency of Digital Photolithographic Synthesis of Large, High-Quality DNA Libraries and Microarrays using a Guanine O6 Dephosphitylation Strategy
2025-Oct-31, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-025-01755-0
PMID:41174019
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研究论文 | 本研究通过数字无掩膜光刻方法结合鸟嘌呤O6去磷酸化策略,提高了大型DNA文库和微阵列的合成效率 | 采用标准封端试剂引入极短的去分支步骤,有效抑制脱嘌呤导致的片段化,显著提高合成产率 | NA | 解决DNA微阵列合成中的寡核苷酸片段化问题,提高大规模核酸合成质量 | DNA文库和微阵列 | 合成生物学 | NA | 数字无掩膜光刻合成 | NA | NA | NA | 光刻合成 | NA | NA | 基因组学, 核酸治疗, 合成生物学 |
| 624 | 2025-11-05 |
Efficient Sampling of Genetically Encoded Biosensor Design Space Enabled with a Design of Experiments and Automation Workflow
2025-Oct-17, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68448
PMID:41182995
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研究论文 | 提出结合实验设计与自动化工作流程的高效采样方法,用于优化基因编码生物传感器的设计空间 | 开发了结合实验设计算法与高通量自动化的计算框架,能够高效采样基于变构转录因子的生物传感器组合设计空间 | NA | 优化基因编码生物传感器的性能并开发通用设计框架 | 基于变构转录因子的基因编码生物传感器 | 合成生物学 | NA | 实验设计算法、高通量自动化平台、效应物滴定分析 | NA | 基因表达数据 | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 微生物细胞 | 生物传感器电路(包含转运蛋白、输入输出模块)、数字和模拟剂量响应曲线 | 工业生物技术, 医药 |
| 625 | 2025-11-04 |
Next-generation stress-inducible Komagataella phaffii promoter variants
2025-Oct-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02825-7
PMID:41168757
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研究论文 | 本研究通过系统突变方法开发了新一代甲醇非依赖型且生长解耦的Komagataella phaffii启动子变体 | 采用半理性区块扫描方法系统鉴定了PDH启动子的激活位点,开发出活性高达亲本启动子250%的多组合变体 | NA | 扩展Komagataella phaffii启动子工具箱,实现甲醇非依赖和生长解耦的蛋白生产 | Komagataella phaffii PDH启动子及其突变变体 | 合成生物学 | NA | 单碱基突变、序列区块步行突变、半理性区块扫描方法 | NA | 荧光强度数据、酶活性数据 | 152个系统生成的启动子变体 | 定点突变 | Komagataella phaffii | 启动子工程、多基因平衡表达系统 | 工业生物技术 |
| 626 | 2025-11-03 |
Codon usage and antibiotic resistance: A hidden evolutionary mechanism
2025-Nov, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2025.07.027
PMID:40752602
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综述 | 本文综述了密码子使用在抗生素耐药性进化中的关键作用及其潜在应用价值 | 揭示了传统上被视为遗传编码沉默特征的密码子使用如何通过优化耐药基因合成成为抗生素耐药性的新型进化机制 | NA | 解析密码子使用与抗生素耐药性之间的复杂相互作用机制 | 鲍曼不动杆菌、淋病奈瑟菌和肺炎克雷伯菌等病原体 | 生物信息学 | 细菌感染性疾病 | 比较基因组分析、密码子适应指数(CAI)、有效密码子数(ENC)、相对同义密码子使用度(RSCU)、生物信息学、机器学习 | 机器学习 | 基因组数据 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | 医学 |
| 627 | 2025-11-03 |
Study on the adjuvant activity and mechanism of action of a novel Monophosphoryl Lipid A
2025-Nov, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.08.019
PMID:40907461
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研究论文 | 本研究利用合成生物学技术开发了一种新型单磷酸脂质A佐剂,并评估其免疫活性和作用机制 | 首次通过结构修饰开发了新型单磷酸脂质A(N-MPL),发现不同剂型可分别诱导细胞免疫和体液免疫,并阐明其通过TLR4-MyD88-NF-κB信号通路调控Th1/Th2反应的机制 | NA | 开发高效、低成本且适合广泛应用的疫苗佐剂 | 新型单磷酸脂质A(N-MPL)及其两种剂型 | 合成生物学 | 传染病 | 合成生物学技术 | NA | 实验数据 | ICR小鼠 | 合成生物学 | 大肠杆菌 | 脂质A结构修饰:去除C-1位磷酸基团,在3'-次级脂肪酸链引入羟基 | 医药 |
| 628 | 2025-11-03 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
|
综述 | 本文综述癌症干细胞(CSCs)的特性、研究挑战及新兴治疗策略 | 整合单细胞测序、空间转录组学与多组学数据揭示CSCs异质性,提出双代谢抑制与合成生物学干预等创新疗法 | 缺乏普适性CSCs生物标志物,难以靶向CSCs同时不影响正常干细胞 | 探讨CSCs在肿瘤治疗抵抗中的作用机制及靶向治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学整合, CRISPR筛选, AI驱动分析 | 3D类器官模型 | 多组学数据 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 629 | 2025-11-03 |
Development of a UHPLC-MS method to avoid the in-source dissociation interference in characterization of crocins from Buddlejae flos and its dyeing yellow rice
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1659907
PMID:41169721
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研究论文 | 开发了一种避免源内解离干扰的UHPLC-MS方法,用于表征密蒙花中的藏花素及其染色黄米 | 通过优化色谱分离开发了避免源内解离干扰的UHPLC-MS方法,首次在密蒙花中鉴定出28种藏花素及其衍生物 | NA | 建立可靠的藏花素分析方法以提升密蒙花质量控制和促进藏花素合成生物学研究 | 密蒙花、栀子果实和藏红花中的藏花素成分 | 分析化学 | NA | 超高效液相色谱-质谱联用(UHPLC-MS) | NA | 色谱质谱数据 | 21批密蒙花样品 | NA | NA | NA | 医药,食品 |
| 630 | 2025-11-02 |
A highly biosimilar synthetic Calculus Bovis enhances cerebral blood flow and provides neuroprotection against ischemic stroke
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120602
PMID:40945882
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研究论文 | 本研究评估了高度生物相似性合成牛黄在缺血性脑卒中中的神经保护作用及改善脑血流的效果 | 首次通过合成生物学方法制备高度生物相似性合成牛黄,并证实其在缺血性脑卒中治疗中的有效性和作用机制 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型,未涉及其他物种或性别差异研究 | 评估合成牛黄对缺血性脑损伤的治疗效果及改善脑血流的作用 | 雄性C57BL/6J小鼠的缺血性脑卒中模型 | 生物医学工程 | 缺血性脑卒中 | 色谱指纹图谱分析、Fluoro-Jade B染色、尼氏染色、激光散斑对比成像 | NA | 生物化学数据、组织学图像、血流动力学数据 | 使用不同剂量合成牛黄处理的tMCAO模型小鼠 | 合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 631 | 2025-11-02 |
Mining Microbial Dark Matter: Advanced Cultivation Techniques for Bioactive Compound Discovery
2025-Oct-20, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101583
PMID:41155696
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综述 | 本文综述了利用先进培养技术挖掘未培养微生物资源以发现生物活性化合物的最新进展 | 结合宏基因组学、单细胞基因组学和合成生物学等先进技术开发新型培养策略,突破了传统实验室培养技术的限制 | NA | 探索和开发未培养微生物中的生物活性天然产物资源 | 环境中的未培养微生物及其天然产物 | 合成生物学 | NA | 宏基因组学, 单细胞基因组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 化学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 632 | 2025-11-02 |
Heterologous Biosynthesis of Crocin I in Solanum lycopersicum L
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209984
PMID:41155278
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研究论文 | 本研究在番茄中实现了藏花素I的异源生物合成 | 首次在番茄中成功构建藏花素I的异源生物合成途径,使藏花素I占总藏花素含量的97-99% | NA | 开发藏花素I的新型生物合成平台 | 转基因番茄植物 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、In-fusion技术、2A自切割肽 | NA | NA | NA | 农杆菌介导转化,In-fusion技术 | 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 医药,食品,个人护理产品 |
| 633 | 2025-11-02 |
Key Technologies of Synthetic Biology in Industrial Microbiology
2025-Oct-13, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13102343
PMID:41156802
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综述 | 本文探讨了合成生物学在工业微生物领域的关键技术及其应用前景 | 系统阐述了合成生物学如何通过基因编辑、代谢工程等技术革新工业微生物领域 | 该领域仍面临诸多挑战,需要跨学科合作推动发展 | 讨论合成生物学在工业微生物中的关键技术及应用前景 | 工业微生物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术、代谢工程、高通量筛选、自动化平台、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工业微生物 | 代谢通路优化与重构 | 生物制造, 能源生产, 环境保护, 药物开发 |
| 634 | 2025-11-02 |
Expanding the Terpene Universe: Synthetic Biology and Non-Natural Chemistry in Engineered Microorganisms
2025-Oct-13, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30204065
PMID:41157082
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和非天然化学在工程微生物中扩展萜类化合物多样性的策略 | 将非生物化学转化整合到工程生物合成途径中,利用人工金属酶催化非天然卡宾转移反应,超越自然界合成能力 | NA | 开发微生物细胞工厂以实现萜类化合物的可持续生产并扩展其结构多样性 | 萜类化合物及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、非天然化学转化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 甲羟戊酸途径、甲基赤藓糖醇磷酸途径、萜类合酶系统 | 医药、香料、生物燃料 |
| 635 | 2025-11-02 |
Unleashing the potential of biotechnological strategies for the sustainable production of microalgal polysaccharides
2025, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2475240
PMID:40084718
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综述 | 探讨利用生物技术策略实现微藻多糖可持续生产的方法与前景 | 提出通过合成生物学和代谢工程解决微藻多糖生物合成复杂性的关键技术策略 | 微藻多糖生物合成回路存在技术-生物学复杂性,且合成生物学在商业化生产中尚未充分应用 | 开发微藻作为可持续多糖生产原料的生物技术策略 | 光合自养微藻及其多糖生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 多糖生物合成回路 | 食品,化妆品,制药,工业生物技术 |
| 636 | 2025-10-31 |
Kinetically Programmed Signaling Cascades for Molecular Detection
2025-Oct-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c12059
PMID:41094711
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研究论文 | 本研究利用DNA化学开发了一种基于动力学编程的信号级联系统,用于分子检测和生物传感 | 首次系统研究动力学编程对信号级联系统性能的影响,并展示了其在多种分子检测中的应用 | NA | 开发可编程的DNA信号级联系统并研究其动力学特性 | DNA分子信号级联系统 | 合成生物学 | NA | DNA化学,电化学传感 | NA | 实验数据,模拟数据 | NA | NA | NA | 四模块信号级联系统(输入、受体、处理器、输出) | 医学,生物传感,分子计算,药物递送 |
| 637 | 2025-10-31 |
Ultrafast Conversion of CO2 into C3-C4 Diols in a Synergistic Electrochemical and AI-Assisted Biosynthesis System
2025-Oct-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c14039
PMID:41100764
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研究论文 | 开发了一种电化学生物合成级联系统,将CO2高效转化为C3-C4二醇 | 结合电催化与AI辅助生物设计的协同系统,实现安培级电流密度下的高效转化 | 未明确说明系统长期运行的稳定性和规模化成本 | 开发可持续的二氧化碳转化技术生产高价值化学品 | C3-C4二醇(1,3-丙二醇和1,3-丁二醇) | 合成生物学 | NA | 电化学还原、AI辅助设计、分子动力学模拟、原位光谱分析 | NA | 光谱数据、动力学数据 | NA | 理性设计 | NA | 电化学生物合成级联系统,包含CO还原和C-C键延伸模块 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 638 | 2025-10-31 |
Bio-digital feedback loop systems: a synergistic integration of predictive genomics, genome editing, and AI-driven phenomic synthesis for next-generation edible and medicinal mushroom breeding
2025-Oct-10, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-025-02176-8
PMID:41073589
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综述 | 提出一种生物-数字反馈循环系统框架,整合多组学、CRISPR工程底盘菌株和AI驱动的表型组学,用于精准食用菌育种 | 首次提出将预测基因组学、基因组编辑和AI驱动的表型组学协同整合的生物-数字反馈循环系统,实现蘑菇的可编程设计 | NA | 开发下一代食用和药用蘑菇的精准育种方法 | 食用和药用蘑菇 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、CRISPR-Cas9、合成生物学工具、人工智能 | AI算法 | 基因组数据、表型组数据、图像数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蘑菇底盘菌株 | 模块化基因电路、即插即用底盘菌株设计 | 农业, 医药, 环境 |
| 639 | 2025-10-31 |
Kinetics and Activation Strategies in Toehold-Mediated and Toehold-Free DNA Strand Displacement
2025-Oct-09, Biosensors
DOI:10.3390/bios15100683
PMID:41149335
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综述 | 本文综述了DNA链置换反应中动力学特性及激活策略的最新进展 | 强调链邻近性作为核心驱动力,系统总结了基于邻近性的多种激活策略及其在构建动态DNA网络中的应用 | NA | 总结DNA链置换反应动力学调控策略的基本原理和最新进展 | DNA链置换反应及其激活策略 | DNA纳米技术 | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 链置换反应网络、动态网络 | 生物传感,合成生物学,生物计算,医学诊断 |
| 640 | 2025-10-31 |
Fungal Innovations-Advancing Sustainable Materials, Genetics, and Applications for Industry
2025-Oct-06, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11100721
PMID:41149911
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综述 | 本文综述了真菌在可持续材料开发、遗传工程和工业应用中的创新潜力 | 重点关注合成生物学工具在真菌工程化中的应用,包括可编程调控器、CRISPR基因组编辑和组合通路优化 | 真菌复杂生物系统的控制和优化能力仍存在局限 | 探索真菌在可持续生物基技术中的潜力,促进各行业可持续发展 | 丝状真菌及其产生的刚性和柔性材料 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、组合通路优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 丝状真菌 | 可编程调控器、代谢通路优化 | 材料,能源,工业生物技术,环境 |