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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-04-30 |
A Combinatorial Strategy of Semirational Screening and Rational Design for Engineering an α-1,2-Fucosyltransferase toward Efficient 2'-Fucosyllactose Biosynthesis
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.6c00566
PMID:41983305
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研究论文 | 通过半理性筛选和理性设计组合策略工程化α-1,2-岩藻糖基转移酶,实现高效无副产物的2'-岩藻糖基乳糖生物合成 | 结合理性计算设计(结构、进化和稳定性预测)与半理性筛选(基于L-岩藻糖响应生物传感器),首次获得五重突变体M5,实现了124.25 g/L的2'-FL产量且无副产物DFL | 未明确讨论该策略对其他岩藻糖基转移酶或不同底物的普适性,也未评估长期工业生产的稳定性 | 开发无副产物的高效2'-FL微生物合成平台 | α-1,2-岩藻糖基转移酶BKHT及其突变体 | 合成生物学 | NA | 定点饱和突变、理性计算设计、生物传感器筛选 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | L-岩藻糖响应生物传感器(FcsR-P) | 工业生物技术、食品 |
| 622 | 2026-04-30 |
Biological Detoxification of Gossypol: Enzymatic Mechanisms, System Engineering, and Prospects for Green Valorization
2026-Apr-29, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c17645
PMID:41989489
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综述 | 本文综述了棉酚的生物解毒机制,包括酶学原理、系统工程策略以及绿色高值化利用的前景 | 将棉酚活性酶分为四个功能模块(官能团修饰、芳环裂解、增溶缀合和自由基介导环化),并提出产物解析验证方法以明确定义解毒终点 | 现有解毒方法主要依据总棉酚减少而非产物解析证据,缺乏解毒转化的明确验证 | 系统阐述棉酚的生物解毒机制,并提出绿色高值化利用的策略 | 棉酚及其解毒酶与微生物系统 | NA | NA | 酶工程, 多酶级联, 人工智能辅助酶/通路挖掘, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 解毒代谢通路(包括棉酚活性酶的功能模块) | 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 623 | 2026-04-30 |
Co-Immobilization of SpyTag-Cyclized Enzymes on a γPFD-SpyCatcher Hydrogel to Address Broad Specificity
2026-Apr-21, Gels (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/gels12040348
PMID:42042186
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研究论文 | 开发了一种基于自组装γPFD-SpyCatcher水凝胶的可编程蛋白质支架,用于体内共固定SpyTag环化级联酶,以解决酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | 通过SpyTag环化酶与γPFD-SpyCatcher水凝胶的共固定策略,实现级联酶的空间有序组织,显著提高产物产量 | 未明确提及,但可能包括体内支架稳定性或适用酶类型的限制 | 解决工程代谢途径中酶广底物特异性导致的副反应和产量降低问题 | SpyTag环化酶和γPFD-SpyCatcher水凝胶空间组织方法 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | 工程微生物(未具体说明,可能是大肠杆菌或酵母) | 基于γPFD-SpyCatcher水凝胶的级联酶共固定支架 | 合成生物学, 工业生物技术 |
| 624 | 2026-04-30 |
Metabolic Engineering of Rhodotorula toruloides for Biosynthesis of Retinal
2026-Apr-02, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12040258
PMID:42042353
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研究论文 | 通过代谢工程改造圆红冬孢酵母NP11以生产视黄醛 | 首次在圆红冬孢酵母中引入并优化多种来源的β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因,并结合多基因过表达和发酵条件优化,实现了视黄醛的高效生物合成 | 未进行详细的代谢流分析或基因调控网络优化,产量仍有提升空间 | 实现视黄醛的微生物合成,为萜类化合物的生物制造提供细胞工厂 | 圆红冬孢酵母NP11 | 合成生物学 | NA | 代谢工程, 发酵优化 | NA | 浓度数据 | 工程菌株Rt13及多种基因改造菌株 | NA | 圆红冬孢酵母 | 视黄醛合成途径:包含β-胡萝卜素15,15'-双加氧酶基因以及IDI1、BTS1、CARRP、CARB过表达 | 医药, 食品, 化妆品 |
| 625 | 2026-04-30 |
Functional Diversity of Probiotic Effector Molecules: Insights into Their Role in Improving Gut Health
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
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综述 | 本文综述了益生菌效应分子的功能多样性及其在改善肠道健康中的作用 | 系统总结了益生菌效应分子的主要类别和作用机制,并提出了高通量鉴定和合成生物学等新兴方法在解锁其治疗潜力方面的应用 | 益生菌效应分子的高通量鉴定和体内验证及有效剂量确定仍面临挑战 | 阐明益生菌效应分子的多样性及其功能,以促进靶向益生菌疗法和功能性食品的设计 | 益生菌效应分子,包括细菌多糖聚合物、表面蛋白、分泌肽和酶、细胞外囊泡及小分子代谢物 | 肠道微生物组与益生菌研究 | 肠道健康相关疾病 | 比较基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | NA | 医学、食品 |
| 626 | 2026-04-30 |
Synthetic Biology Approaches in Reducing Mycotoxin Contamination and Enhancing Food System Sustainability
2026-Apr, Annual review of food science and technology
IF:10.6Q1
|
综述 | 综述合成生物学在减少真菌毒素污染和增强食品系统可持续性方面的应用 | 整合人工智能与多组学技术开发识别元件、抗菌剂和降解酶,并强调CRISPR多重编辑和微生物细胞工厂等新兴技术 | NA | 探讨合成生物学在真菌毒素控制和食品副产物可持续利用中的解决方案 | 产毒真菌、真菌毒素、食品及加工副产物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物细胞 | 微生物细胞工厂、生物传感器 | 农业, 食品, 环境 |
| 627 | 2026-04-30 |
Radiation-Responsive Promoters: Molecular Mechanisms, Screening Strategies, and Translational Applications as Radiation Biomarkers
2026-Mar-26, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48040348
PMID:42042008
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综述 | 系统分析了辐射响应启动子的分子机制、筛选策略及其作为辐射生物标志物的转化应用 | 首次将辐射响应启动子分为五大类并系统比较其调控逻辑、剂量响应特征及临床部署证据,提出了区分生物标志物导向与工具导向的报告基因系统的双轨框架 | 缺乏临床级验证、标准化剂量响应曲线缺失、可重复性不足 | 系统梳理辐射响应启动子的分子机制与筛选策略,评估其在辐射生物标志物开发中的转化潜力 | 辐射响应启动子 | 数字病理学 | NA | 功能基因组学与转录组学、表观遗传修饰分析、合成生物学启动子工程 | NA | 文本 | NA | 合成生物学启动子工程 | NA | 辐射响应启动子回路 | 医学 |
| 628 | 2026-04-30 |
Minor groove tetrads: a potent and versatile capping interaction for i-motif structures
2026-Feb, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-026-01406-1
PMID:41909615
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review | 综述了小沟四联体(MGTs)作为i-motif结构封盖相互作用的强效多功能机制 | 揭示了MGT能稳定i-motif结构,使其在中性pH下折叠,并仅用两个C:C⁺对形成紧凑构型,同时可逆pH响应且不扭曲B-DNA几何结构 | 尚未提供体内应用的长期稳定性数据或在复杂生物环境中的直接验证 | 探索小沟四联体在i-motif工程中的稳定机制及其在纳米技术和合成生物学中的应用潜力 | 小沟四联体与i-motif DNA结构的相互作用 | 合成生物学 | NA | 荧光光谱、化学修饰(2'-氟取代、荧光胞苷类似物) | NA | NA | NA | NA | NA | i-motif纳米结构(含MGT封盖) | 生物传感, 纳米技术, 合成生物学 |
| 629 | 2026-04-30 |
AI-Driven De Novo Binder Design: From Structure Prediction to Closed-Loop Optimization
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0070
PMID:42052042
|
综述 | 总结了人工智能驱动从头设计蛋白结合物的标准化技术栈,涵盖从结构预测到闭环优化的实用工作流程 | 系统整合了结构预测、蛋白质语言模型和扩散生成建模等前沿技术,提出了从计算设计到实验反馈的完整闭环优化框架 | 面临诱导契合、负设计和数据集偏差等关键挑战,端到端复合物生成尚未实现 | 综述人工智能驱动的从头蛋白结合物设计方法,建立标准化技术栈 | 蛋白结合物(包括抗体和非抗体支架,如单抗体和设计的锚蛋白重复蛋白) | 机器学习 | NA | 结构预测、蛋白质语言模型、扩散生成建模 | 扩散模型、蛋白质语言模型 | 蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 630 | 2026-04-30 |
Artificial intelligence and synthetic biology in traditional Chinese medicine: revolutionizing public health applications
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1789960
PMID:42052276
|
综述 | 探讨人工智能与合成生物学在中医药现代化中的应用,以推动公共卫生领域的革新 | 首次系统综述人工智能与合成生物学的协同作用,提出将中医药从经验实践转化为标准化、循证公共卫生干预的路径 | 综述性质缺乏实验验证,未来需增强AI可解释性、扩展生物数据库及优化跨学科协作 | 分析人工智能与合成生物学如何解决中医药面临的资源不可持续、多靶点机制模糊及标准化不足等挑战 | 中医药的活性化合物、临床诊疗体系及公共卫生应用 | 机器学习 | COVID-19 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 制药 |
| 631 | 2026-04-30 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
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综述 | 综述合成免疫学在编程免疫细胞以实现新型复杂逻辑功能方面的进展,特别是针对CAR T细胞疗法的局限性提出合成生物学解决方案 | 提出“合成免疫疗法”这一新子领域概念,强调通过合成生物学工具赋予T细胞更高级的布尔逻辑能力,如多抗原识别和增强持久性 | CAR T细胞疗法仍不成熟,存在对表达抗原的正常组织的毒性以及细胞因子毒性等严重局限性 | 探讨如何利用合成生物学解决CAR T细胞疗法的局限性,推动免疫疗法向合成免疫疗法方向发展 | 嵌合抗原受体(CAR)T细胞 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 632 | 2026-04-30 |
Budding yeast as a factory to engineer partial and complete microbial genomes
2020-Dec, Current opinion in systems biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.coisb.2020.09.003
PMID:33015421
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综述 | 该论文综述了利用芽殖酵母作为工厂来工程化部分和完整微生物基因组的最新进展 | 总结了酵母在合成生物学中作为宿主进行高效基因组编辑的新方法,以及快速合成、组装和修改病毒与细菌基因组以应对新兴病原体的潜力 | 大型DNA分子(超过2百万碱基对)难以克隆、细菌基因组的拯救困难,以及技术的双重用途潜力需谨慎考虑 | 探讨酵母细胞在微生物基因组工程中的应用及其生物学意义 | 芽殖酵母及微生物基因组(包括病毒和细菌基因组) | 合成生物学 | NA | 基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 芽殖酵母 | 基因组合成与组装 | 医学、工业生物技术 |
| 633 | 2026-04-30 |
Synthetic Biology of Small RNAs and Riboswitches
2018-05, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
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综述 | 综述小RNA和核糖开关在合成生物学中的应用 | 涵盖了从小RNA和核糖开关的基础研究到代谢工程、正交基因控制、生物传感器、逻辑门及RNA-RNA相互作用测定等最新应用 | 这些RNA调控机制的理解和表征尚不完整,基础研究带来挑战 | 总结小RNA和核糖开关的合成生物学应用及未来发展方向 | 小RNA和核糖开关 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌和古菌 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 工业生物技术 |
| 634 | 2026-04-29 |
Microbial lipases: Catalyzing sustainable solutions for industrial innovations
2026-Jul, Enzyme and microbial technology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.enzmictec.2026.110869
PMID:41946009
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综述 | 该综述文章全面回顾了微生物脂肪酶在工业创新中的应用,涵盖其来源、筛选、生产、纯化及表征等方面 | 强调了合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas技术、酶工程及AI辅助建模在识别和定制具有所需特性的脂肪酶中的革命性作用 | 未明确说明,但作为综述可能缺乏对特定系统验证的深度讨论 | 探讨微生物脂肪酶在可持续工业创新和绿色化学中的关键作用 | 微生物脂肪酶,包括来自细菌、真菌和酵母的脂肪酶 | 机器学习 | NA | CRISPR-Cas, 宏基因组学, 酶工程 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, 酶工程 | 芽孢杆菌属, 无色杆菌属, 产碱菌属, 节杆菌属, 假单胞菌属, 青霉属 | NA | 工业生物技术, 医药, 食品与饮料, 纺织, 皮革, 洗涤剂, 生物燃料 |
| 635 | 2026-04-29 |
WRKY Transcription Factors: Integral Regulators of Defence Responses to Biotic Stress in Crops
2026-May, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70542
PMID:41524271
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综述 | 综述WRKY转录因子在作物生物胁迫防御反应中的核心调控作用 | 系统总结了WRKY在多种生物胁迫(真菌、细菌、卵菌、病毒、害虫)中的调控机制,并探讨了利用多组学与精准基因编辑、合成生物学、基因驱动和人工智能整合提升作物抗性的新方向 | 未具体讨论WRKY在不同作物或不同胁迫条件下的功能特异性差异及潜在副作用 | 阐明WRKY转录因子在作物生物胁迫防御中的调控网络及其在抗性育种中的应用潜力 | WRKY转录因子家族及其在作物生物胁迫响应中的调控模块 | 机器学习 | NA | 多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 作物 | NA | 农业 |
| 636 | 2026-04-29 |
Reconstitution of Archaeal Membrane Lipid Biosynthesis in Bacterial and Eukaryotic Hosts
2026-Apr-28, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500981
PMID:42046273
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综述 | 介绍在细菌和真核宿主中重构古菌膜脂生物合成的研究进展 | 系统综述了通过合成生物学和代谢工程实现古菌脂质合成途径的跨域重构,并发现细菌和真核酶对古菌脂质前体具有显著的底物混杂性,从而无需古菌酶即可合成多种古菌脂质 | 未明确提及现有研究的局限性 | 研究古菌膜脂生物合成途径的重构、宿主系统及工程策略,探讨脂质分界的演化含义及生物技术应用 | 古菌膜脂生物合成途径及其在细菌和真核宿主中的重构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌(Escherichia coli), 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 古菌脂质生物合成途径,包括核心古菌酶的表达和异戊二烯前体供应的增强 | 工业生物技术、医药 |
| 637 | 2026-04-29 |
GAN-GA: A Deep-Evolutionary Approach for Synthesizing Functionally Similar Heat Shock Proteins
2026-Apr-27, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3688058
PMID:42043999
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研究论文 | 提出GAN-GA混合框架,结合生成对抗网络与遗传算法以设计功能相似的热激蛋白 | 将Wasserstein GAN与多目标遗传算法NSGA-II结合,在蛋白质序列生成后加入理化性质优化阶段,克服传统生成方法缺乏功能验证的局限 | 未详细说明对生成蛋白质的湿实验验证结果,论文仅描述序列优化阶段未提及实际蛋白质表达与功能测试 | 开发一种无需天然模板的从头蛋白质设计方法,生成具有生物学相关性的功能蛋白序列 | 合成热激蛋白HSP70和HSP90的序列设计 | 机器学习 | NA | 蛋白质序列生成 | Wasserstein GAN, NSGA-II, ProtBert, ESM, 变分自编码器, 强化学习 | 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 638 | 2026-04-29 |
Photoperiod-dependent regulation of secondary growth by auxin flux: how it occurs and how to benefit from it
2026-Apr-27, Biological reviews of the Cambridge Philosophical Society
DOI:10.1002/brv.70175
PMID:42046427
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综述 | 综述光周期通过生长素流调控树木次生生长的机制及其潜在应用 | 提出生长素流作为光周期调控次生生长的关键机制,并探讨合成生物学方法调控光周期-生长素流关系以优化树木性能 | 现有证据尚不充分,部分分子机制(如FT/TFL1样和CCA1/LHY样因子)的作用未完全明确 | 阐述光周期通过生长素流调控次生生长的机制,并探索利用该机制增强树木生长和干旱抗性的策略 | 温带森林树木(尤其杨树)的次生生长过程 | 植物生物学、森林科学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 杨树(Populus) | 设计光周期不敏感的生长素生物合成回路 | 环境(碳封存)、农业(林木优化)、工业生物技术 |
| 639 | 2026-04-29 |
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-026-02201-5
PMID:41991721
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研究论文 | 利用系统发育组学、代谢组学和异源表达方法,调查了82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成基因簇及其天然产物 | 首次系统性地对肉座菌目生防真菌的生物合成能力进行大规模调查,揭示了约80%的基因簇编码未知产物,并表征了四种参与未知产物合成的非核糖体肽合成酶样合成酶 | 仅涉及82种真菌,样品量有限,且主要关注生物合成基因簇与分子的关联,未能覆盖所有潜在生物活性化合物 | 探索肉座菌目真菌作为生物防治剂的生物合成潜力,为可持续农业害虫防治奠定基础 | 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌及其生物合成基因簇 | 数字病理学 | NA | 系统发育组学, 代谢组学, 异源表达 | NA | 基因组数据, 代谢组数据 | 82种真菌物种 | 异源表达 | NA | 生物合成基因簇 | 农业 |
| 640 | 2026-04-29 |
Single Molecule Force Measurements Reveal Energy Stabilization of Theophylline Aptamer RNA Switch Required for Gene Control
2026-Mar-25, ACS physical chemistry Au
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsphyschemau.5c00109
PMID:41909145
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研究论文 | 利用单分子力谱测量茶碱适体RNA开关的能量稳定化机制及其在基因调控中的作用 | 首次通过光镊单分子力谱技术量化了茶碱结合对RNA适体折叠动力学的影响,发现茶碱通过稳定结构而非诱导构象重排来调控基因表达 | 未提及实验局限性或应用中的潜在挑战 | 揭示茶碱适体RNA开关的折叠动力学和能量稳定化机制,为合成生物学中适体工具的设计提供依据 | 茶碱适体RNA | 合成生物学 | NA | 光镊单分子力谱(optical tweezers single-molecule force spectroscopy) | NA | 单分子力曲线 | 单分子级别的RNA分子样本 | NA | NA | 茶碱适体RNA开关(theophylline aptamer RNA switch) | 合成生物学, 医学(治疗) |