合成生物学相关文章
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当前共找到 3063 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-01-21 |
Directed evolution of an orthogonal transcription engine for programmable gene expression in eukaryotes
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614978
PMID:39386662
|
研究论文 | 本文通过定向进化技术开发了一种适用于真核生物的正交转录引擎，用于可编程基因表达 | 通过将T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶融合，进化出高活性的变体，显著提高了在真核系统中的蛋白表达水平 | NA | 开发一种适用于真核生物的正交基因调控系统，提高合成生物学应用的多样性和效率 | T7 RNA聚合酶与非洲猪瘟病毒的单亚基加帽酶的融合酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化 | NA | NA | NA |
| 622 | 2025-01-21 |
Continuous Fluorescence Assay for In Vitro Translation Compatible with Noncanonical Amino Acids
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00353
PMID:38194520
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的连续荧光检测方法，用于体外翻译实验，该方法与非经典氨基酸（ncAAs）兼容 | 开发了一种基于亲和夹蛋白的连续荧光检测方法，能够快速验证多种非经典氨基酸的掺入并测试多种tRNA的密码子读取特异性 | 该方法依赖于亲和夹蛋白的荧光特性变化，可能对某些特定ncAAs的检测存在局限性 | 开发一种适用于非经典氨基酸的体外翻译连续检测方法，以促进药物发现和合成生物学中的翻译装置工程 | 非经典氨基酸（ncAAs）和tRNA的密码子读取特异性 | 合成生物学 | NA | 连续荧光检测 | NA | 荧光数据 | 384孔板格式的实验 |
| 623 | 2025-01-20 |
Liquid-liquid phase separation in microorganisms: Insights into existence, functions, and applications
2025-Mar, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.128026
PMID:39705832
|
综述 | 本文综述了微生物中液-液相分离（LLPS）的存在、功能及其应用，探讨了LLPS在微生物中的形成和调控机制 | 本文首次系统整合了微生物中LLPS的研究成果，强调了LLPS在环境适应、应激响应和细胞过程中的作用，并提出了LLPS作为合成生物学和病原微生物治疗干预的潜在靶点 | 目前对微生物中LLPS的分子调控机制了解仍有限，且相关研究技术存在挑战，需要进一步研究以揭示详细的分子机制并开发新的应用 | 探讨微生物中液-液相分离的形成、调控机制及其在环境适应和细胞过程中的作用 | 微生物中的液-液相分离现象 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 624 | 2025-01-20 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jan-17, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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综述 | 本文探讨了微生物次级代谢物在微生物过程和关系中的关键作用，以及其在人类健康和农业等经济领域中的价值 | 基因组测序的进展揭示了次级代谢物的生物合成潜力，新的预测工具和分子生物学技术加速了新代谢物的发现 | NA | 加速微生物次级代谢物的发现及其应用 | 微生物次级代谢物及其生物合成基因簇（BGCs） | 生物技术 | NA | 基因组测序、细胞和无细胞表达技术、代谢物检测和鉴定技术 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | NA |
| 625 | 2025-01-19 |
CRISPR/Cas-Based Gene Editing Tools for Large DNA Fragment Integration
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00632
PMID:39680738
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综述 | 本文综述了过去五年中开发的大片段DNA整合方法，特别关注新兴的CRISPR相关技术 | 重点介绍了CRISPR相关的同源定向修复（HDR）、CRISPR-转座酶和CRISPR-重组酶策略，这些策略有望革新复杂疾病的基因治疗 | 现有技术在整合大片段基因时面临效率低、脱靶效应和高成本的问题 | 开发能够精确插入千碱基大小DNA片段到哺乳动物基因组中的高效工具，以支持基因工程、基因治疗和合成生物学应用 | 大片段DNA的整合 | 基因编辑 | 复杂疾病 | CRISPR/Cas, HDR, CRISPR-转座酶, CRISPR-重组酶 | NA | NA | NA |
| 626 | 2025-01-16 |
Synthetic biology for the food industry: advances and challenges
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2340530
PMID:38797660
|
综述 | 本文综述了合成生物学在食品工业中的最新进展和应用，包括传统食品、功能性食品和绿色食品的替代品 | 探讨了合成生物学技术在食品工业中的应用，特别是在创建适合食品工业生产的细胞工厂和将可再生原料转化为重要食品成分、功能性食品添加剂和营养化学品方面的创新 | 未具体提及研究中存在的局限性 | 解决食品工业面临的问题，确保安全、营养和可持续的食品供应 | 食品工业中的传统食品、功能性食品和绿色食品 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 627 | 2025-01-16 |
Recent advances in genome mining and synthetic biology for discovery and biosynthesis of natural products
2025-Feb, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2383754
PMID:39134459
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综述 | 本文综述了基因组挖掘和合成生物学在天然产物发现和生物合成中的最新进展 | 结合基因组测序、生物信息学工具、大数据分析、基因工程、代谢工程和系统生物学，提出了解决天然产物生产中多样性不足、效率低下和产量低等挑战的新方法 | NA | 探讨基因组挖掘和合成生物学在天然产物生产中的应用，以解决传统方法的效率低下和成本高昂问题 | 天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学工具、大数据分析、基因工程、代谢工程、系统生物学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 628 | 2025-01-16 |
Chemical and Biological Investigations of Antiviral Agents Against Plant Viruses Conducted in China in the 21st Century
2024-Dec-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15121654
PMID:39766921
|
综述 | 本文详细综述了21世纪中国在植物病毒抗病毒剂的研究进展，包括抗病毒剂的生物特性、作用模式及未来药物开发的见解 | 本文综合了化学生物学、化学信息学、生物信息学和合成生物学的最新进展，为抗病毒药物的设计、合成、活性评估及作用机制研究提供了新的方法和工具 | 本文主要关注植物病毒抗病毒剂的研究，未涉及人类或动物病毒疾病的抗病毒剂开发 | 深入研究植物病毒抗病毒剂的研发，以应对复杂爆发的植物病毒疾病 | 植物病毒及其抗病毒剂 | 生物信息学 | 植物病毒疾病 | 化学生物学、化学信息学、生物信息学、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 629 | 2025-01-16 |
Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review
2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13121228
PMID:39766618
|
综述 | 本文全面回顾了用于生物膜研究的经典和现代模型，总结了实验室生物膜模型的各种设计及其优缺点 | 提供了改进生物膜模型的见解，以更接近真实场景，利用增材制造、合成生物学和生物工程中的新技术 | 当前实验室模型存在各种局限性 | 研究生物膜的物理特性、抗微生物剂的抗性机制及其基因和蛋白质表达谱 | 生物膜 | 生物工程 | NA | 增材制造、合成生物学、生物工程 | NA | NA | NA |
| 630 | 2025-01-16 |
An Upstream G-Quadruplex DNA Structure Can Stimulate Gene Transcription
2024-03-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00775
PMID:38417105
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研究论文 | 本文探讨了四链G-四链体（G4）DNA结构在基因启动子中如何影响转录 | 通过合成生物学方法，将G4形成序列稳定整合到合成报告基因的启动子中，并插入人类细胞基因组，首次在细胞基因组环境中展示了G4结构形成对转录的刺激作用 | 研究局限于合成报告基因和特定细胞环境，未涉及更多天然基因和细胞类型 | 理解G4结构如何影响基因转录 | G4 DNA结构及其在基因启动子中的作用 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因组数据 | 人类细胞 |
| 631 | 2025-01-15 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
|
review | 本文综述了甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性，并利用drugCIPHER算法预测其药理活性，同时回顾了利用合成生物学方法生物制造甘草三萜类化合物的进展和策略 | 本文不仅总结了甘草三萜类化合物的整体特性，还预测了其药理活性，并提出了利用合成生物学方法进行生物制造的新策略 | 本文主要集中于甘草三萜类化合物的综述，可能未涵盖所有相关研究的最新进展 | 研究甘草三萜类化合物的结构、药理活性及其生物制造方法 | 甘草三萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | drugCIPHER算法 | NA | NA |
| 632 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
|
研究论文 | 本文描述了使用模块化克隆系统MoClo组装多基因构建体的协议 | 利用MoClo系统进行多基因构建体的组装，通过一系列的一锅法组装步骤实现，提高了构建效率并促进了构建体变体库的生成 | NA | 开发一种高效的多基因构建体组装方法，以支持生物学研究和合成生物学 | 多基因构建体 | 合成生物学 | NA | MoClo系统 | NA | DNA序列 | NA |
| 633 | 2025-01-15 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于创建SBOL表示的软件工具，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 提出了一个软件工具，用于创建SBOL表示的构建计划，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 未提及具体限制 | 开发一种软件工具，用于标准化Golden Gate组装元数据的表示 | 合成生物学中的DNA组装过程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA |
| 634 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
|
研究论文 | 本文详细介绍了使用Golden Gate克隆技术克隆MoClo标准部件的协议 | 提供了克隆MoClo标准部件的详细步骤，包括定义部件类型、设计引物、PCR扩增、Golden Gate克隆和测序 | 对于大型标准部件，需要先克隆子部件作为中间体，增加了复杂性 | 开发高效的DNA组装方法以促进合成生物学领域的研究 | MoClo标准部件（level 0模块） | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、PCR | NA | DNA序列 | NA |
| 635 | 2025-01-15 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用声波分配器自动化和微型化Golden Gate DNA组装反应的方法 | 利用声波分配器在nL范围内转移液体，实现了Golden Gate克隆反应的微型化和并行化，减少了塑料废物和试剂使用 | NA | 提高Golden Gate克隆反应的效率和可持续性 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
| 636 | 2025-01-15 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重化的纳米孔扩增子测序技术验证Golden Gate组装的方法 | 提出了一种名为DuBA.flow的工作流程，用于从单个菌落到最终易于解读的测序报告的全过程验证 | NA | 验证Golden Gate组装的高阶组合复杂性 | Golden Gate组装的高阶组合 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 637 | 2025-01-15 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
|
研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron，一个开源的Python包，用于自动化Golden Gate组装，以减少复杂DNA构建的失败率、资源消耗和培训需求 | AssemblyTron提供了低成本的自动化解决方案，使用开源的OpenTrons OT-2实验室机器人，扩展了Golden Gate组装的能力，包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变体库组装和模块化克隆索引质粒库组装 | NA | 提高Golden Gate组装的自动化水平，降低复杂DNA构建的失败率和资源消耗 | Golden Gate组装技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装，易错PCR | NA | NA | NA |
| 638 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并提出了辅助寡核苷酸设计的G-GArden工具 | 提出了基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并开发了辅助设计的G-GArden工具 | NA | 开发一种快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的小RNA（sRNAs） | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 639 | 2025-01-15 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 本文介绍了一种无细胞转录和翻译（TXTL）系统中快速生成线性DNA模板的Golden-Gate辅助工作流程 | 通过Golden-Gate组装和PCR扩增，无需克隆步骤，快速生成功能性DNA模板，显著加速合成生物学中的设计-构建-测试-学习周期 | 未提及具体实验样本量或数据集的详细信息 | 开发一种快速生成线性DNA模板的方法，用于无细胞转录和翻译系统中的基因调控元件和电路测试 | 线性DNA模板，包括启动子、核糖体结合位点（RBS）、编码序列和终止子等基本遗传部分 | 合成生物学 | NA | Golden-Gate组装、PCR扩增 | NA | DNA序列 | NA |
| 640 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 本文描述了在单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii中用于转基因表达的遗传盒的组装 | 使用Golden Gate克隆和模块化克隆（MoClo）标准化合成生物学工作流程，简化了遗传元件的组装 | NA | 开发快速高效的克隆策略，用于组装新的转录单元或整个通路 | 单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆（MoClo） | NA | NA | NA |