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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-03-22 |
Evolutionary repurposing of a metabolic thiolase complex enables antibiotic biosynthesis
2026-01-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68910-6
PMID:41617701
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研究论文 | 本研究报道了口腔链球菌中的一种三重酶复合物,该复合物通过不寻常的Friedel-Crafts C-乙酰化反应完成抗生素reutericyclin A的生物合成 | 揭示了硫解酶复合物通过关键催化残基重编程实现底物特异性转变,从原始的HMG-CoA合成功能进化获得Friedel-Crafts C-酰化新功能的罕见案例 | NA | 探究初级代谢酶如何进化获得次级代谢中的特殊功能,阐明酶功能多样化的进化机制 | 口腔链球菌来源的三重酶复合物(SmaATase),包含HMGS、ACAT和DUF35蛋白 | NA | NA | 冷冻电镜、生化表征、分子建模、进化分析 | NA | 结构数据、生化数据、进化数据 | NA | NA | 口腔链球菌(Streptococcus macacae) | NA | 合成生物学(为C-C键形成催化剂工程提供模板) |
| 622 | 2026-03-22 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 本文总结了利用酵母工程化生产色氨酸衍生芳香化合物的最新进展 | 聚焦于色氨酸作为关键前体,综述了酵母代谢工程和合成生物学工具在可持续生产芳香化合物中的应用 | NA | 实现色氨酸衍生芳香化合物在酵母中的高效、可扩展且经济可行的生物合成 | 酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药 |
| 623 | 2026-03-22 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-08, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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综述 | 本文综述了21世纪农业中合成生物学的前景,重点介绍了植物合成生物学在增强粮食安全、应对气候变化和促进可持续农业方面的创新应用 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学,精准修饰植物基因组以提升产量、胁迫耐受性和养分利用效率,并结合人工智能优化设计 | 面临监管审批和公众接受度方面的挑战,且需要严格的多领域测试以确保可重复性 | 探讨合成生物学在农业中的应用潜力,以解决全球粮食安全和环境可持续性问题 | 植物基因组及其在光合效率、固氮、耐旱、病原抗性、养分利用效率、生物强化、气候韧性等关键农业性状的工程化改造 | NA | NA | 合成生物学、遗传工程、计算建模、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 合成植物基因组、生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 农业 |
| 624 | 2026-03-22 |
Genetic and molecular mechanisms underlying nitrogen use efficiency in maize
2025-03, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.10.007
PMID:39515641
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综述 | 本文全面综述了玉米氮素吸收、同化和再动员的遗传与分子调控机制,旨在提高氮素利用效率 | 整合了根际微生物组对氮素利用效率的影响以及植物-微生物互作机制,并倡导利用遗传多样性和合成生物学进行综合研究 | NA | 提高玉米氮素利用效率,促进可持续农业发展 | 玉米 | NA | NA | 高通量微生物组研究 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 玉米 | NA | 农业 |
| 625 | 2026-03-22 |
In-Depth Computational Analysis of Natural and Artificial Carbon Fixation Pathways
2021, Biodesign research
DOI:10.34133/2021/9898316
PMID:37849946
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研究论文 | 本文通过计算分析比较了天然和人工碳固定途径的性能,包括特定活性和产率 | 提出了两个全新的碳固定循环(还原性柠檬酰辅酶A循环和2-羟基戊二酸反向三羧酸循环),并采用综合动力学数据集和参数平衡算法进行预测 | 计算模型可能受限于数据可用性和假设,实际应用需实验验证 | 评估和比较天然与人工碳固定途径的性能,以优化工业生物技术和合成生物学应用 | 碳固定途径,包括天然和人工循环,如CBB循环、CETCH循环等 | NA | NA | 计算分析、参数平衡算法、酶成本最小化算法 | NA | 动力学和热力学数据 | NA | NA | NA | 碳固定代谢途径,包括还原性甘氨酸途径、CETCH循环等 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 626 | 2026-03-21 |
Growth factor applications and clinical translation: advances and challenges
2026-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2026.2642893
PMID:41837883
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综述 | 本文系统综述了生长因子的分类、基础研究进展、临床应用现状,并深入分析了其在临床转化中面临的挑战及相应解决方案 | 全面整合了生长因子在神经退行性疾病、骨再生和代谢疾病中的应用现状,并系统总结了通过蛋白质工程、智能递送系统和多因子序贯释放技术等解决临床转化瓶颈的策略 | 本文为综述性文章,未提供原始实验数据,且指出生长因子疗法仍面临体内微环境复杂、大规模生产成本高和精准递送困难等固有挑战 | 旨在为加速下一代生长因子疗法的开发提供全面的路线图和技术参考 | 生长因子及其在再生医学、肿瘤学和代谢调节等领域的应用 | NA | 神经退行性疾病、骨再生、代谢疾病 | 蛋白质工程、化学修饰、细胞外囊泡平台、多因子序贯释放技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 627 | 2026-03-21 |
Biosynthesis of L-Pipecolic Acid and Its Hydroxylated Derivatives: Enzyme, Engineering, and Synthesis Method
2026-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70156
PMID:41532523
|
综述 | 本文综述了L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成进展,重点介绍了酶工程和合成生物学在可持续高效生产这些化合物中的应用 | 强调了通过酶工程和合成生物学方法实现L-哌啶酸及其羟基化衍生物的可持续生产,包括代谢工程策略、酶级联反应和脯氨酸羟化酶的蛋白质工程 | NA | 促进L-哌啶酸及其羟基化衍生物的生物合成生产,以替代传统化学合成方法 | L-哌啶酸及其羟基化衍生物(羟基哌啶酸) | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程、蛋白质工程、酶级联反应、固定化酶策略 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、抗生素、天然产物 |
| 628 | 2026-03-21 |
Golgi-localized mannanases sustain hemicellulose biosynthesis
2026-Apr, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70875
PMID:41555794
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研究论文 | 本文探讨了拟南芥中MAN2和MAN5酶在维持半纤维素生物合成中的作用,通过酵母合成生物学揭示了它们与CSLA的功能互作 | 发现MAN2和MAN5酶在细胞内通过切割不溶性β-甘露聚糖为亲水性对应物,从而维持高尔基体中的半纤维素生产,这揭示了之前未知的生物合成调控机制 | 研究主要基于拟南芥模型,可能需要在其他植物或作物中进行验证以确认普遍性 | 研究β-甘露聚糖生物合成的代谢瓶颈和潜在生物合成参与者,以增强植物中β-甘露聚糖含量 | 拟南芥(Arabidopsis)的MAN2和MAN5酶,以及CSLA基因 | 植物生物学 | NA | 酵母合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 农业 |
| 629 | 2026-03-21 |
Engineered E. coli Nissle 1917 Depletes Branched-Chain Amino Acids to Suppress Colorectal Tumorigenesis
2026-Mar-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00804
PMID:41712535
|
研究论文 | 本文通过工程化改造大肠杆菌Nissle 1917菌株,消耗肠道中的支链氨基酸,从而抑制结直肠癌的发生和发展 | 利用合成生物学方法改造益生菌,靶向支链氨基酸代谢,为癌症治疗提供了一种新的策略 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且具体机制仍需进一步探索 | 探究工程化益生菌通过消耗支链氨基酸来抑制结直肠肿瘤发生的效果 | 结直肠癌小鼠模型及工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 工程化菌株构建、AOM/DSS诱导的CRC小鼠模型 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 支链氨基酸降解或转运途径的工程化改造 | 医学 |
| 630 | 2026-03-21 |
Refactoring two-component systems for tunable gene expression regulation and upgraded bacterial sensing
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101504
PMID:41653915
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研究论文 | 本文通过重构双组分系统(TCSs),系统性地探索了响应调节器(RR)和组氨酸激酶(HK)作为浓度依赖性激活剂和抑制剂的功能特性,以优化基因表达调控和细菌传感性能 | 通过解耦HK表达与原生反馈回路,设计了具有可调检测阈值的超灵敏TCS传感器;利用RR作为转导器,结合单组分系统(OCS)和TCS创建了具有低检测限和高动态范围的协同传感系统(SSS);并证明RR可作为生物低噪声放大器(LNA),显著提升多种基因编码生物传感器的性能 | 未明确提及具体限制,但暗示TCS的可编程性先前未充分探索,可能限制了合成生物学中的广泛应用 | 探索TCS的可塑性和可编程性,以定制合成电路中的基因表达调控,并提供生物传感器优化的模块化工具包 | 双组分系统(TCSs),包括响应调节器(RR)和组氨酸激酶(HK),以及单组分系统(OCS) | 合成生物学 | NA | 基因工程、生物传感技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌(如大肠杆菌) | 双组分系统传感器、协同传感系统(SSS)、生物低噪声放大器(LNA) | 工业生物技术、环境监测 |
| 631 | 2026-03-21 |
Biofilm engineering through c-di-GMP tuning boosts bioleaching efficiency and arsenic tolerance in Acidithiobacillus ferrooxidans
2026-Mar-18, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02288-25
PMID:41705824
|
研究论文 | 通过调控Acidithiobacillus ferrooxidans中的c-di-GMP信号增强生物膜形成、生物浸出效率和砷耐受性 | 通过靶向调控全局调控分子c-di-GMP,同时提升生物浸出效率和重金属抗性,克服了传统基因工程单次仅修饰单一性状的限制 | NA | 提高生物浸出效率和砷耐受性,以促进可持续金属生产 | Acidithiobacillus ferrooxidans(一种模型生物浸出微生物) | 合成生物学 | NA | 基因工程、转录组分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acidithiobacillus ferrooxidans | 通过过表达diguanylate cyclase基因(如S-222、S-306、S-651)调控c-di-GMP水平,以编程生物膜基质组成 | 环境、工业生物技术 |
| 632 | 2026-03-21 |
Dynamics of genetic circuits in Pseudomonas protegens
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101513
PMID:41763221
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研究论文 | 本研究开发了一种实验-理论结合的流程,用于评估土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 中的 NOT 逻辑电路,并探索其作为合成生物学新宿主的潜力 | 首次在 Pseudomonas protegens Pf-5 中评估 NOT 逻辑电路,利用数学模型推断动态原理,并设计验证了串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 研究主要聚焦于 NOT 逻辑电路,可能未全面评估其他电路类型或更复杂系统在 Pf-5 中的表现 | 扩展合成生物学宿主选择,评估 Pseudomonas protegens Pf-5 作为环境合成生物学新宿主的适用性 | 土壤细菌 Pseudomonas protegens Pf-5 及其中的 NOT 逻辑电路(逆变器) | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程、数学建模 | 数学模型 | 实验数据、模型参数 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Pseudomonas protegens Pf-5 | NOT 逻辑电路(逆变器)、串联兼容逆变器以实现 YES 逻辑响应 | 环境 |
| 633 | 2026-03-21 |
The BAHD Acyltransferase Gene Family: Evolutionary Dynamics, Biochemical Mechanisms, and Roles in Plant Stress Adaptation
2026-Mar-11, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70597
PMID:41810805
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综述 | 本文综述了BAHD酰基转移酶基因家族的进化动态、生化机制及其在植物胁迫适应中的作用 | 整合了进化、结构和调控方面的见解,突出了BAHD酰基转移酶在植物适应中的核心作用及其在可持续农业和生物技术中的转化机遇 | 讨论了功能冗余、底物混杂性和生物安全性考虑相关的挑战 | 探讨BAHD酰基转移酶基因家族的进化、功能及其在植物胁迫适应和生物技术中的应用 | BAHD酰基转移酶基因家族 | NA | NA | 比较基因组分析、结构研究、生化研究、组学调查 | NA | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | 植物 | NA | 农业、生物技术 |
| 634 | 2026-03-21 |
Engineering Plant-Based Platforms for Saccharide Biosynthesis: Progress and Prospects
2026-Mar-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c14582
PMID:41805344
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综述 | 本文综述了利用植物底盘系统进行糖类生物合成的关键技术进展、研究现状、技术挑战及优化策略 | 系统总结了植物底盘在糖类合成生物学中的独特优势,即结合光合固碳与天然糖类生物合成代谢,为可持续大规模生产提供新平台 | NA | 为合成生物学发展提供见解,并挖掘植物底盘在糖类生物合成中的商业潜力 | 植物底盘系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物系统 | 糖类生物合成与代谢途径 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 635 | 2026-03-21 |
Engineering and Evaluation of Sinorhizobium meliloti Nodulation (nod) Gene Reporter Systems in Rhizobia and Non-Rhizobia
2026-Mar, Environmental microbiology
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/1462-2920.70284
PMID:41858307
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研究论文 | 本研究开发了基于Sinorhizobium meliloti nod基因的报告系统,用于筛选能表达nod基因的根瘤菌和非根瘤菌,以促进非豆科植物的生物固氮 | 开发了包含可诱导nod box启动子、植物信号依赖性激活因子和组成型标记的nod基因报告系统,首次实现在根瘤菌和非根瘤菌中高通量筛选能识别豆科植物信号分子的细菌 | NA | 增强非豆科植物的生物固氮能力,减少对合成肥料的依赖 | 根瘤菌和非根瘤菌微生物 | 合成生物学 | NA | 基因报告系统构建、体外和植物内诱导实验 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Sinorhizobium meliloti, 根瘤菌, 非根瘤菌 | nod基因报告系统,包含PnodA启动子控制的超折叠GFP报告基因、nodD1和nodD2激活因子以及组成型mScarlet-I标记 | 农业, 环境 |
| 636 | 2026-03-21 |
Engineering plasmids with synthetic origins of replication
2026-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68907-1
PMID:41629321
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研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数的合成复制起点(SynORI)质粒,实现了独立拷贝控制和环境信号响应 | 首次创建了基于合成RNA调节器的兼容复制起点,实现了质粒拷贝数的独立调控和模块化信号响应 | NA | 开发可调谐、兼容且模块化的合成质粒复制起点,以克服天然复制机制的限制 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 合成复制起点(SynORI),包括可调拷贝数机制、基于RNA的独立拷贝控制逻辑门和信号响应生物传感器 | 工业生物技术 |
| 637 | 2026-03-21 |
The Cross-Species Implantable ATP Battery Inspired by Photosynthesis for Application in Diseases
2026, International journal of nanomedicine
IF:6.6Q1
DOI:10.2147/IJN.S569114
PMID:41858590
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综述 | 本文探讨了一种受光合作用启发的跨物种可植入ATP电池技术,旨在通过光能驱动在受损人体细胞内自主再生ATP,以治疗多种疾病 | 提出了一种模仿自然光合作用的人工光合系统,能够在细胞水平上实现光驱动的持续ATP合成,并将合成生物学、材料科学和靶向递送策略整合到一个治疗平台中 | NA | 探索跨物种可植入ATP电池在疾病治疗中的应用潜力,旨在通过恢复细胞生物能量学来治疗疾病 | 人工光合系统及其在缺氧肿瘤微环境、代谢受损组织再生和能量缺陷神经元等病理环境中的应用 | NA | 多种疾病(包括肿瘤、组织损伤、神经元疾病等) | 人工光合作用技术 | NA | NA | NA | NA | 人体细胞 | 人工光合系统,包括光氧化模块(将光能转化为电化学质子梯度)、光磷酸化模块(利用梯度驱动ATP合成)和封装系统(用于空间组织、功能完整性和靶向细胞递送) | 医学 |
| 638 | 2026-03-20 |
Structure-coevolution dual-guided engineering of C-glycosyltransferase enables high-level biosynthesis of vitexin in Yarrowia lipolytica
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.011
PMID:41852688
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研究论文 | 本研究通过结构-共进化双引导工程策略改造C-糖基转移酶,显著提升了其催化活性和热稳定性,并在Yarrowia lipolytica中实现了杜荆素的高效生物合成 | 提出了结构-共进化双引导的协同框架来指导C-糖基转移酶工程,通过改造底物结合腔和优化相互作用,大幅提升了酶活性和热稳定性,并构建了高效的微生物细胞工厂 | 未明确说明该工程策略在其他C-糖基转移酶或宿主系统中的普适性,也未详细讨论大规模工业化生产可能面临的其他技术挑战 | 开发高效的C-糖基转移酶工程策略,实现黄酮类C-糖苷的高效生物合成 | 来自T. cuspidata的C-糖基转移酶TcCGT1及其工程变体,以及Yarrowia lipolytica宿主系统 | 合成生物学 | NA | 结构-共进化双引导工程策略、分子动力学模拟、结构分析、代谢工程、补料分批发酵 | NA | NA | NA | 代谢工程 | Yarrowia lipolytica | 杜荆素合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 639 | 2026-03-20 |
Versatile 2-Oxoglutarate-Dependent Dioxygenases Catalyze Radical-Mediated Multifunctional Skeleton Reconstructions and Oxidation Modifications of Taxoids
2026-Mar-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.6c01169
PMID:41746272
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研究论文 | 本文表征了两种新型2-氧戊二酸依赖性双加氧酶TcOGD1和TcOGD2,它们催化紫杉烷类化合物的骨架重构和氧化修饰,揭示了紫杉烷结构多样性的形成机制 | 首次报道了具有催化多功能性的2-氧戊二酸依赖性双加氧酶,能够介导从6/8/6到5/7/6、-5/7/6和6/12框架的骨架重构,以及多种氧化修饰,通过自由基介导的C-C键断裂构建新骨架 | NA | 探索5/7/6紫杉烷类化合物的化学多样性和生物合成途径 | 紫杉烷二萜类化合物,特别是5/7/6框架的紫杉烷如taxuspine J | NA | NA | 酶促反应、NMR光谱学、酶工程 | NA | NA | NA | 酶工程、合成生物学 | NA | NA | 医药 |
| 640 | 2026-03-20 |
Exogenous biostimulants: mechanisms and innovations for enhancing seed germination and resilience under abiotic stress
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.023
PMID:41831683
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综述 | 本文综述了外源生物刺激剂在缓解非生物胁迫(如干旱、盐分和极端温度)对种子萌发抑制的生理生化机制,并探讨了利用纳米材料、植物激素、代谢物等外源物质增强种子耐受性的潜力与挑战 | 提出了一个整合合成生物学、可生物降解纳米材料和刺激响应型纳米递送系统的多学科策略路线图,旨在实现活性成分的靶向、按需释放,以跨越实验室研究与田间应用的鸿沟 | 从实验室成果到田间应用仍面临成本效益、环境安全性和作用周期短等重大障碍 | 增强种子在非生物胁迫下的萌发能力和恢复力,以应对气候变化对作物建植和粮食安全的威胁 | 种子萌发过程及其对干旱、盐分、极端温度等非生物胁迫的响应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 农业 |