合成生物学相关文章
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当前共找到 3058 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-01-16 |
Classical and Modern Models for Biofilm Studies: A Comprehensive Review
2024-Dec-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13121228
PMID:39766618
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综述 | 本文全面回顾了用于生物膜研究的经典和现代模型，总结了实验室生物膜模型的各种设计及其优缺点 | 提供了改进生物膜模型的见解，以更接近真实场景，利用增材制造、合成生物学和生物工程中的新技术 | 当前实验室模型存在各种局限性 | 研究生物膜的物理特性、抗微生物剂的抗性机制及其基因和蛋白质表达谱 | 生物膜 | 生物工程 | NA | 增材制造、合成生物学、生物工程 | NA | NA | NA |
| 622 | 2025-01-16 |
An Upstream G-Quadruplex DNA Structure Can Stimulate Gene Transcription
2024-03-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.3c00775
PMID:38417105
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研究论文 | 本文探讨了四链G-四链体（G4）DNA结构在基因启动子中如何影响转录 | 通过合成生物学方法，将G4形成序列稳定整合到合成报告基因的启动子中，并插入人类细胞基因组，首次在细胞基因组环境中展示了G4结构形成对转录的刺激作用 | 研究局限于合成报告基因和特定细胞环境，未涉及更多天然基因和细胞类型 | 理解G4结构如何影响基因转录 | G4 DNA结构及其在基因启动子中的作用 | 分子生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因组数据 | 人类细胞 |
| 623 | 2025-01-15 |
Discovery, Biomanufacture, and Derivatization of Licorice Triterpenoids
2025-Jan-08, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08110
PMID:39644261
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review | 本文综述了甘草三萜类化合物的结构、来源、药理活性，并利用drugCIPHER算法预测其药理活性，同时回顾了利用合成生物学方法生物制造甘草三萜类化合物的进展和策略 | 本文不仅总结了甘草三萜类化合物的整体特性，还预测了其药理活性，并提出了利用合成生物学方法进行生物制造的新策略 | 本文主要集中于甘草三萜类化合物的综述，可能未涵盖所有相关研究的最新进展 | 研究甘草三萜类化合物的结构、药理活性及其生物制造方法 | 甘草三萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | drugCIPHER算法 | NA | NA |
| 624 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Multigene Constructs Using the Modular Cloning System MoClo
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_2
PMID:39363064
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研究论文 | 本文描述了使用模块化克隆系统MoClo组装多基因构建体的协议 | 利用MoClo系统进行多基因构建体的组装，通过一系列的一锅法组装步骤实现，提高了构建效率并促进了构建体变体库的生成 | NA | 开发一种高效的多基因构建体组装方法，以支持生物学研究和合成生物学 | 多基因构建体 | 合成生物学 | NA | MoClo系统 | NA | DNA序列 | NA |
| 625 | 2025-01-15 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
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研究论文 | 本文介绍了一种用于创建SBOL表示的软件工具，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 提出了一个软件工具，用于创建SBOL表示的构建计划，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 未提及具体限制 | 开发一种软件工具，用于标准化Golden Gate组装元数据的表示 | 合成生物学中的DNA组装过程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA |
| 626 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文详细介绍了使用Golden Gate克隆技术克隆MoClo标准部件的协议 | 提供了克隆MoClo标准部件的详细步骤，包括定义部件类型、设计引物、PCR扩增、Golden Gate克隆和测序 | 对于大型标准部件，需要先克隆子部件作为中间体，增加了复杂性 | 开发高效的DNA组装方法以促进合成生物学领域的研究 | MoClo标准部件（level 0模块） | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、PCR | NA | DNA序列 | NA |
| 627 | 2025-01-15 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文介绍了一种使用声波分配器自动化和微型化Golden Gate DNA组装反应的方法 | 利用声波分配器在nL范围内转移液体，实现了Golden Gate克隆反应的微型化和并行化，减少了塑料废物和试剂使用 | NA | 提高Golden Gate克隆反应的效率和可持续性 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
| 628 | 2025-01-15 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重化的纳米孔扩增子测序技术验证Golden Gate组装的方法 | 提出了一种名为DuBA.flow的工作流程，用于从单个菌落到最终易于解读的测序报告的全过程验证 | NA | 验证Golden Gate组装的高阶组合复杂性 | Golden Gate组装的高阶组合 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 629 | 2025-01-15 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron，一个开源的Python包，用于自动化Golden Gate组装，以减少复杂DNA构建的失败率、资源消耗和培训需求 | AssemblyTron提供了低成本的自动化解决方案，使用开源的OpenTrons OT-2实验室机器人，扩展了Golden Gate组装的能力，包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变体库组装和模块化克隆索引质粒库组装 | NA | 提高Golden Gate组装的自动化水平，降低复杂DNA构建的失败率和资源消耗 | Golden Gate组装技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装，易错PCR | NA | NA | NA |
| 630 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并提出了辅助寡核苷酸设计的G-GArden工具 | 提出了基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并开发了辅助设计的G-GArden工具 | NA | 开发一种快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的小RNA（sRNAs） | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 631 | 2025-01-15 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 本文介绍了一种无细胞转录和翻译（TXTL）系统中快速生成线性DNA模板的Golden-Gate辅助工作流程 | 通过Golden-Gate组装和PCR扩增，无需克隆步骤，快速生成功能性DNA模板，显著加速合成生物学中的设计-构建-测试-学习周期 | 未提及具体实验样本量或数据集的详细信息 | 开发一种快速生成线性DNA模板的方法，用于无细胞转录和翻译系统中的基因调控元件和电路测试 | 线性DNA模板，包括启动子、核糖体结合位点（RBS）、编码序列和终止子等基本遗传部分 | 合成生物学 | NA | Golden-Gate组装、PCR扩增 | NA | DNA序列 | NA |
| 632 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
|
研究论文 | 本文描述了在单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii中用于转基因表达的遗传盒的组装 | 使用Golden Gate克隆和模块化克隆（MoClo）标准化合成生物学工作流程，简化了遗传元件的组装 | NA | 开发快速高效的克隆策略，用于组装新的转录单元或整个通路 | 单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆（MoClo） | NA | NA | NA |
| 633 | 2025-01-15 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2025-Jan-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
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综述 | 本文综述了低渗透性土壤中微生物适应和基因工程方法在增强生物修复效果方面的最新知识 | 整合了微生物适应和基因工程策略，提供了全面的概述，指导当前实践和未来研究 | NA | 提高低渗透性土壤中的生物修复效果 | 低渗透性土壤中的微生物 | 环境科学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 634 | 2025-01-15 |
Electro-bioremediation of wastewater: Transitioning the focus on pure cultures to elucidate the missing mechanistic insights upon electro-assisted biodegradation of exemplary pollutants
2025-Jan, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.123726
PMID:39729711
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研究论文 | 本文探讨了通过纯培养研究电生物修复技术对特定污染物的降解机制，以填补现有研究中的知识空白 | 从混合培养转向纯培养研究，以揭示电辅助生物降解的机制，并提出通过基因组注释、转录动力学等方法优化微生物水平的降解效率 | 目前关于纯培养的电生物降解机制研究较少（少于40项），且主要集中在降解潜力而非机制解析 | 研究电生物修复技术在废水处理中的应用，特别是通过纯培养揭示降解机制 | 含氮、磷、硫化合物、碳氢化合物、金属和偶氮染料等典型水污染物 | 环境工程 | NA | 基因组注释、转录动力学、合成生物学、数学建模 | NA | 分子水平数据（基因、酶、蛋白质、代谢物） | 少于40项研究 |
| 635 | 2025-01-15 |
Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00022f
PMID:39129507
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评论 | 本文回顾了诺华公司在天然产物药物发现方面的历史，并介绍了从早期研究到开发及以后的过程中所使用的工具和面临的挑战 | 利用90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物，结合微生物学、计算生物学、合成生物学、化学和工艺开发等多学科方法，寻找新药物 | 未明确提及具体的研究局限性 | 通过天然产物发现新药物，并利用新技术加速药物发现和可持续化合物供应 | 天然产物及其衍生的药物 | 药物发现 | NA | 基因组工程、数据科学、抗体药物偶联物、放射性配体疗法、xRNA药物 | NA | NA | 90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物 |
| 636 | 2025-01-15 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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研究论文 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法，探讨了达托霉素在Streptomyces roseosporus中的生物合成调控，旨在加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 通过比较野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株的基因组序列，发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域有两个突变，这些突变影响了多顺反子mRNA的转录 | 研究主要基于两种菌株的基因组分析，可能无法全面反映所有可能的调控机制 | 提高达托霉素的发酵产量，并促进新型脂肽类抗生素的发现和商业化 | Streptomyces roseosporus菌株及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因组分析、代谢工程、合成生物学、诱变 | NA | 基因组序列 | 两种Streptomyces roseosporus菌株（野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株） |
| 637 | 2025-01-15 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-Dec-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
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综述 | 本文综述了人工细胞的发展及仿生策略，重点讨论了基于仿生材料的人工细胞构建的底层策略 | 从仿生材料出发构建人工细胞，从简单的细胞支架到多室系统，从功能模块的构建到关键代谢行为的模拟，甚至到通信网络的仿生 | 对该领域的瓶颈进行了粗略分析 | 探讨人工细胞的构建及其在材料工程与生命科学之间的桥梁作用 | 人工细胞 | 合成生物学 | NA | 仿生技术 | NA | NA | NA |
| 638 | 2025-01-15 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从石栎的转录组数据中筛选出两个CHS基因（LlCHS1和LlCHS2），并进行了生物信息学分析和功能表征，揭示了它们在查尔酮合成中的功能 | 首次从石栎中克隆并鉴定了两个CHS基因，并通过合成生物学方法验证了它们在催化phloretin生成中的功能 | 研究仅在大肠杆菌中进行了功能验证，未在植物体内进行进一步验证 | 探索石栎中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能 | 石栎中的CHS基因（LlCHS1和LlCHS2） | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、合成生物学 | NA | 转录组数据 | 两个CHS基因（LlCHS1和LlCHS2） |
| 639 | 2025-01-14 |
Cardiomyocyte engineering: The meeting point of transcription factors, signaling networks, metabolism and function
2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.14271
PMID:39801134
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review | 本文综述了直接心脏重编程或转分化在再生治疗、心血管疾病建模和药物发现中的最新进展 | 特别关注了合成生物学，尤其是CRISPR系统在将特定成纤维细胞亚群转化为心肌细胞方面的潜力 | 尽管有多种新方法被开发，获得功能性和代谢成熟的心肌细胞仍然是一个挑战 | 探讨心脏成纤维细胞的功能和多样性，以及体外人类心肌细胞模型的替代细胞来源 | 心脏成纤维细胞和诱导的心肌细胞 | 再生医学 | 心血管疾病 | CRISPR | NA | NA | NA |
| 640 | 2025-01-14 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
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综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins的结构多样性、作用机制及其在抗菌耐药性背景下的治疗潜力 | 强调了cathelicidins作为抗菌肽在抗菌耐药性日益严重的背景下作为传统抗生素替代品的潜力 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的结构多样性、作用机制及其在治疗感染、炎症性疾病和癌症中的潜力 | 农场动物中的cathelicidins | 生物医学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA |