合成生物学相关文章
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当前共找到 5216 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-05-19 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
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研究论文 | 本文设计了一种名为EPDA的合成受体，能够识别材料表面的肽配体，实现三维材料中细胞的可逆响应和空间剂量调控 | 开发了新型计算算法PETEI用于筛选单抗体，设计了可逆激活的跨膜受体平台，实现了三维水凝胶中基于肽配体空间分布的细胞激活和失活控制 | NA | 设计能够感知生物材料结合肽配体并介导细胞可逆响应的合成受体系统 | 哺乳动物细胞、硫醇-降冰片烯水凝胶、单抗体受体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图像 | 构建了超过2000个候选单抗体并测试了前30个 | NA | 哺乳动物细胞 | EPDA受体对（刺激性或抑制性）；细胞内磷酸化/去磷酸化驱动的蛋白拆分与融合开关 | 生物学研究, 再生医学 |
| 622 | 2026-05-19 |
Efficient De Novo Assembly of 100 kb-Scale Human Functional Immunoglobulin Heavy Variable (IGHV) Gene Fragments In Vitro
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00011
PMID:40135783
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研究论文 | 提出一种基于吉布森等温组装的高效体外组装方法，成功合成高达100千碱基的人类功能性免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 首次实现无痕（无外源序列残留）组装人类复杂高重复区域的IGHV基因片段，并构建30-100 kb大小的细菌人工染色体 | 未提及 | 开发高效、无痕、低成本的体外DNA组装方法，用于合成功能性IGHV基因片段 | 人类功能性免疫球蛋白重链可变区（IGHV）基因片段 | 合成生物学 | NA | 吉布森等温组装 | NA | DNA序列 | 高达100千碱基大小的IGHV基因片段 | 吉布森组装 | 大肠杆菌 | 细菌人工染色体载体构建IGHV基因片段 | 医学, 合成生物学 |
| 623 | 2026-05-19 |
In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00862
PMID:40499137
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研究论文 | 提出一种基于合成微生物联合体的体内多细胞反馈控制架构，实现基因表达的稳定精准调控 | 通过分布式多细胞反馈环路实现跨细胞群体的分工协作，克服传统单细胞生物分子控制策略在资源竞争和化学反应不兼容方面的局限 | 未明确说明该控制架构在复杂体内环境或长期运行中的稳定性及潜在副作用 | 实现合成微生物联合体中基因表达的稳定精准调控 | 两种大肠杆菌菌株构成的微生物联合体 | 合成生物学 | NA | 基因工程、微生物联合体构建 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 分布式多细胞反馈控制回路 | 生物技术、医药 |
| 624 | 2026-05-19 |
Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00026
PMID:40536055
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研究论文 | 本研究通过改良cDICE方法生成大小可调的巨型单层囊泡，并优化其尺寸分布 | 系统性地改变腔室旋转时间、角频率和内溶液密度等关键参数以优化GUV尺寸分布，并得到物理模型支持 | NA | 开发一种实用性方法，用于选择囊泡大小，以促进具有生物相关特性的细胞大小隔室的构建 | 巨型单层囊泡 | NA | NA | 改良cDICE方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 625 | 2026-05-19 |
Establishment of a Visible Reporter System in Zymomonas mobilis through Random Mutagenesis and Rational Design of a Chromoprotein eforRed
2025-07-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00872
PMID:40590208
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研究论文 | 通过随机突变和理性设计，在运动发酵单胞菌中建立了一种可见报告系统，利用色素蛋白eforRed实现表型筛选和定量分析 | 首次在非模式乙醇生产革兰阴性菌中建立基于色素蛋白的可见报告系统，并通过随机易错PCR和理性设计增强其光谱特性，特别是双突变K201H-T24V能同时提高内在荧光和蛋白表达水平 | 未明确讨论该报告系统在复杂代谢工程应用中的稳定性和通用性，且可能对强启动子依赖性较强 | 在运动发酵单胞菌中建立可见报告基因系统，以促进非模式微生物的合成生物学和生物技术应用 | 运动发酵单胞菌（Zymomonas mobilis）及色素蛋白eforRed | 合成生物学 | NA | 随机易错PCR、蛋白质理性设计 | NA | 荧光强度数据、蛋白表达水平数据 | 涉及多个突变体，但未给出具体样本数量 | 随机易错PCR、蛋白质理性设计 | 运动发酵单胞菌 | 可见报告系统（含强启动子P-4S或P和突变eforRed色素蛋白） | 工业生物技术、合成生物学 |
| 626 | 2026-05-18 |
Electrochemical biosensor for ultrasensitive thrombin detection based on aptamer-modulated transcriptional inhibition of cell-free synthetic biology
2026-Sep-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2026.129898
PMID:42068939
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研究论文 | 本研究开发了一种结合适配体门控无细胞合成生物学与电化学分析的超灵敏凝血酶检测方法 | 首次将适配体与无细胞合成生物学中的转录抑制机制整合到电化学生物传感器中，实现信号“开-关”模式，具有高灵敏度和通用性 | 未明确讨论在更复杂生物基质中的长期稳定性和大规模应用潜力 | 开发一种基于适配体调控无细胞合成生物学转录抑制的电化学生物传感器，用于超灵敏凝血酶检测 | 凝血酶作为模型靶标蛋白 | 生物传感器 | NA | 电化学分析 | NA | NA | 20倍稀释人血清进行加标回收测试，具体样本数未提及 | NA | 无细胞系统 | 适配体门控的转录抑制分子开关：DNA模板嵌入凝血酶适配体，结合后抑制T7 RNA聚合酶转录RNA报告链 | 医学,临床诊断 |
| 627 | 2026-05-18 |
Advances in biotechnological methods for genetic and metabolic engineering in Methylomonas sp. DH-1
2026-May-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-026-00700-6
PMID:42143386
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综述 | 综述了用于Methylomonas sp. DH-1遗传和代谢工程的生物技术方法进展 | 总结了针对该菌株优化的转化方法、无质粒基因组工程、可调启动子文库和合成小调控RNA平台等新型遗传工具，以及适应性实验室进化、合成菌群和系统生物学等互补策略 | NA | 概述Methylomonas sp. DH-1的遗传和代谢工程方法进展，为甲烷氧化菌的代谢工程和合成生物学奠定基础 | Methylomonas sp. DH-1（一种革兰氏阴性甲烷氧化细菌） | 合成生物学 | NA | 基因组工程， 转化， 可调启动子文库， 合成小调控RNA， 适应性实验室进化 | NA | NA | NA | Cre重组酶 | Methylomonas sp. DH-1 | 合成小调控RNA平台， 可调启动子文库 | 工业生物技术， 环境 |
| 628 | 2026-05-18 |
Discovery and engineering of polymerases and ligases for the synthesis of modified nucleic acids
2026-May-15, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102697
PMID:42143538
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综述 | 本文综述了利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的最新方法 | 聚焦于工程化聚合酶和连接酶在非天然寡核苷酸合成中的应用，并提供了加速核酸修饰酶发现与工程化的计算工具及网络应用程序 | 未明确提及具体局限性 | 综述利用工程化聚合酶和连接酶合成含非天然构建块的寡核苷酸的研究进展 | 工程化聚合酶和连接酶 | 合成生物学 | NA | 酶促合成 | NA | NA | NA | NA | NA | 非天然核酸聚合物合成通路 | 医学, 诊断, 合成生物学 |
| 629 | 2026-05-18 |
Broad-Host-Range Synthetic Biology: Rethinking Microbial Chassis as a Design Variable
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00308
PMID:40964802
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述评 | 探讨广宿主范围合成生物学将微生物底盘视为可调设计变量的新视角 | 突破传统局限于少数模式宿主的框架，提出宿主选择作为影响基因回路行为的主动设计参数 | NA | 阐明将微生物底盘从被动平台转变为可调组件的设计原理 | 广宿主范围合成生物学工具与微生物多样性 | 合成生物学 | NA | 模块化载体、宿主无关基因器件 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物 | NA | 生物制造, 环境修复, 医疗 |
| 630 | 2026-05-18 |
HinZip: Combining Hin Recombinase and FosW to Mimic HD-Zip Plant Proteins
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00386
PMID:40977316
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研究论文 | 设计了一种名为HinZip的嵌合蛋白，通过融合Hin重组酶DNA结合域与FosW亮氨酸拉链，模拟植物HD-Zip转录因子的功能，实现高亲和力和特异性结合DNA序列 | 首次将原核生物的Hin重组酶与真核生物的FosW亮氨酸拉链融合，构建出能模拟植物特异性HD-Zip转录因子功能的嵌合蛋白，无需结构指导即可设计功能性DNA结合蛋白 | 未提供结构指导，且仅在体外和细胞内验证了结合活性，尚未探索其在基因回路调控或治疗应用中的实际效果 | 开发一种能够高特异性和高亲和力结合特定DNA序列的定制化蛋白工具，用于合成生物学和精准治疗 | HinZip嵌合蛋白及其与29碱基对反向回文序列的相互作用 | 合成生物学 | NA | 电泳迁移率变动分析、圆二色谱、动态光散射、细菌单杂交检测 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | HinZip嵌合蛋白设计及其与特异性DNA序列的结合回路 | 合成生物学，医学 |
| 631 | 2026-05-18 |
Structure-Guided Design of Artificial Transcription Factor for a Progesterone Biosensor
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00488
PMID:40977514
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研究论文 | 通过结构引导设计了一种响应孕酮的人工转录因子，并构建了全细胞孕酮生物传感器 | 首次将真核生物转录因子组件引入原核生物，通过分子动力学模拟设计人工转录因子ProB，并利用细菌富集策略优化生物传感器性能 | 未明确说明，摘要中无相关描述 | 设计非天然转录因子并构建在孕酮检测中具有高灵敏度和快速响应的生物传感器 | 人工转录因子ProB和孕酮生物传感器 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 由QF、配体结合域、连接子及QF组成的人工转录因子ProB，结合合成启动子QT（含QUAS、10 bp间隔区、T7和RBS）控制GFP表达 | 医学 |
| 632 | 2026-05-18 |
Neural CRNs: A Natural Implementation of Learning in Chemical Reaction Networks
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00099
PMID:40981009
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研究论文 | 提出一种基于连续时间浓度演化的神经CRN框架，实现化学反应网络中的自然学习 | 通过连续时间动力学模拟神经网络计算，避免离散层架构；仅用单分子和双分子反应实现线性和非线性模型；原生集成一阶梯度近似使非线性模型复杂度随输入维度线性增长 | 未提及实际实验验证，仅通过模拟验证电路设计 | 实现化学反应网络中嵌入式学习行为 | 神经化学反应用网络（Neural CRNs） | 合成生物学 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | 监督学习管道，线性与非线性建模电路，一阶梯度近似 | 生物工程，合成生物学 |
| 633 | 2026-05-18 |
Computational Pipeline for Targeted Integration and Variable Payload Expression in Bacteriophage Engineering
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00450
PMID:40982657
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研究论文 | 开发一种基于机器学习的计算管线，用于在噬菌体工程中实现靶向整合和可变有效载荷表达 | 结合机器学习启动子预测工具PhagePromoter，识别具有有利表达谱的基因间位点，实现噬菌体基因组的合理设计和高通量自动化修饰 | 仅在裂性噬菌体K中验证三种位点，未探讨有毒有效载荷或更复杂宿主反应的影响 | 拓展噬菌体工程中可行的基因插入位点，提升个性化噬菌体治疗的开发效率 | 裂性噬菌体K及其基因组中的基因间位点 | 计算生物学 | NA | 同源重组、机器学习启动子预测 | 机器学习（PhagePromoter） | 基因组序列数据 | 三种重组噬菌体（每种携带不同报告基因位点） | 同源重组 | 噬菌体K | 靶向整合电路：将生物发光报告基因插入预测的基因间位点 | 医学 |
| 634 | 2026-05-18 |
Trusted Codon Fingerprint: A Streamlined Platform for Deep and Reversible Bacterial Cell Labeling
2025-10-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00263
PMID:40983931
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研究论文 | 介绍了一种称为信任密码指纹（TCF）的平台，利用同义密码子替换在质粒抗生素抗性基因开放阅读框中嵌入标识信息，实现深度可逆的细菌细胞标记 | 通过抗生素选择和纠错码的双重机制消除验证步骤，实现100%写入效率；利用温度敏感质粒实现循环写入和擦除细胞标签 | 未明确讨论标记系统对细胞生长或代谢的潜在影响 | 开发一种精简、可擦除且高效的细菌细胞标记工具，便于合成生物学中工程菌株的身份管理 | 大肠杆菌工程菌株 | 合成生物学 | NA | 同义密码子替换、长读长测序 | NA | 基因组序列数据 | 数千个克隆 | 温度敏感质粒 | 大肠杆菌 | 信任密码指纹（TCF）标记系统 | 工业生物技术 |
| 635 | 2026-05-18 |
Advancing Genetically Encoded Lysine (GEK) Chemistry: From Precision Modulation to Therapeutic Innovation
2025-10-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.5c00401
PMID:41004624
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研究论文 | 通过工程化吡咯赖氨酰-tRNA合成酶变体，系统推进了基因编码赖氨酸化学，实现了精确且位点特异性的蛋白质修饰 | 开发了高效掺入多种具有定制化学反应的赖氨酸衍生物的工程化PylRS变体，整合了生物正交手柄、酰基和亲电弹头、光交联基团及PTM模拟物，建立了一套强大的蛋白质标记、功能研究和赖氨酸导向药物设计工具包 | NA | 推进基因编码赖氨酸化学，实现蛋白质的精确调控并推动治疗创新 | 基因编码的赖氨酸衍生物及其工程化工具 | 化学生物学 | NA | 基因编码赖氨酸化学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 化学生物学 |
| 636 | 2026-05-18 |
CELLM: Bridging Natural Language Processing and Synthetic Genetic Circuit Design with AI
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00391
PMID:40905372
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研究论文 | 整合自然语言处理与合成基因电路设计的人工智能系统 | 首个将语言模型与Cello等合成生物学设计工具整合的系统，实现自然语言指令到功能性生物设计的自动翻译 | 未说明 | 降低基因电路设计门槛，使非生物工程专家也能通过简单指令进行基因电路原型设计 | 基因电路 | 自然语言处理, 合成生物学 | NA | NA | DeepSeek-R1, Phi-4 | 文本 | NA | Cello v2.1 | NA | 基因电路 | 合成生物学, 生物工程 |
| 637 | 2026-05-18 |
Intelligent Design of Escherichia coli Terminators by Coupling Prediction and Generation Models
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00429
PMID:40905909
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研究论文 | 本研究通过结合预测模型和生成模型，实现大肠杆菌终止子的智能设计 | 首次将生成对抗网络应用于终止子序列生成，并构建了整合序列和热力学特征的终止子强度预测模型 | 现有预测方法未能充分考虑终止子相关序列或热力学信息，缺乏高精度预测模型 | 开发大肠杆菌终止子的智能设计工具，提升基因回路中终止子设计的精确性和模块化 | 大肠杆菌内在终止子 | 机器学习 | NA | NA | 生成对抗网络 | 序列数据 | 实验中选取了18个终止子序列 | NA | 大肠杆菌 | 基因回路终止子 | 合成生物学 |
| 638 | 2026-05-18 |
Genome-Wide Simplification of the AcMNPV Genome Using Synthetic Biology
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00156
PMID:40910264
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研究论文 | 利用合成生物学方法系统性简化AcMNPV基因组，获得能产生出芽病毒的最小功能基因组 | 基于合成生物学的“设计-构建-测试-学习”框架，采用共转染线性化基因组片段的策略，快速迭代评估基因组缺失，最终获得删除约28 kb、涵盖39个非必需基因的最小功能基因组AcMNPV-Syn-mini | 未提及具体局限性 | 实现AcMNPV基因组的大规模简化，开发高容量杆状病毒载体，并加深对杆状病毒功能基因组学的理解 | 苜蓿银纹夜蛾多核型多角体病毒（AcMNPV） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组简化、共转染 | NA | 基因组序列、病毒滴度数据 | 35个不同大小的简化基因组 | 合成生物学设计-构建-测试-学习框架 | 昆虫细胞 | NA | 生物技术、医学 |
| 639 | 2026-05-18 |
Engineering Noncanonical Cofactors To Expand Cellular Functions
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00473
PMID:40923492
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综述 | 探讨利用非经典辅因子扩展细胞功能的方法与应用 | 通过使用非经典辅因子隔离特定代谢反应，无需物理屏障即可实现与宿主细胞天然机制的独立运行 | 对非经典辅因子依赖型酶的工程化进展及实际应用潜力仍需进一步实验验证 | 综述非经典辅因子的类型、合成方法、酶工程进展及其在合成生物学中的应用前景 | 非经典辅因子及其依赖性酶和利用细胞 | 合成生物学 | NA | 酶工程, 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 非经典辅因子依赖代谢通路 | 合成生物学 |
| 640 | 2026-05-18 |
Engineering of a Complex of the DNase Domain of Colicin E9 with the Immunity Protein Im9 Activated by the Protease pS273R of African Swine Fever Virus
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00398
PMID:40925015
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研究论文 | 设计了一种由ASFV pS273R蛋白酶激活的DNase E9与Im9蛋白复合物，作为病毒触发型杀灭开关 | 通过将病毒蛋白酶切割位点插入免疫蛋白Im9的暴露环中，构建了仅当ASFV蛋白酶存在时才释放DNase活性的蛋白质开关，提供了一种可推广的利用病毒编码蛋白酶触发休眠效应物的合成生物学策略 | 尚未在活体细胞或动物模型中验证该开关的有效性和安全性，且对非靶标蛋白酶的特异性需进一步评估 | 开发一种针对非洲猪瘟病毒的合成限制系统，通过病毒DNA降解使猪细胞对ASFV不具允许性 | 大肠杆菌素E9的DNase结构域及其免疫蛋白Im9的复合物 | 合成生物学 | 非洲猪瘟 | 蛋白质工程，蛋白酶切割位点插入，体外酶活测定 | NA | NA | NA | NA | NA | 蛋白开关（蛋白酶切割激活的DNase） | 农业，医学 |