合成生物学相关文章
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当前共找到 3054 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-01-15 |
Standardized Golden Gate Assembly Metadata Representation Using SBOL
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_6
PMID:39363068
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研究论文 | 本文介绍了一种用于创建SBOL表示的软件工具，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 提出了一个软件工具，用于创建SBOL表示的构建计划，以模拟类型IIS介导的组装反应并存储相关元数据 | 未提及具体限制 | 开发一种软件工具，用于标准化Golden Gate组装元数据的表示 | 合成生物学中的DNA组装过程 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | 元数据 | NA |
| 622 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of MoClo Standard Parts
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_1
PMID:39363063
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研究论文 | 本文详细介绍了使用Golden Gate克隆技术克隆MoClo标准部件的协议 | 提供了克隆MoClo标准部件的详细步骤，包括定义部件类型、设计引物、PCR扩增、Golden Gate克隆和测序 | 对于大型标准部件，需要先克隆子部件作为中间体，增加了复杂性 | 开发高效的DNA组装方法以促进合成生物学领域的研究 | MoClo标准部件（level 0模块） | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、PCR | NA | DNA序列 | NA |
| 623 | 2025-01-15 |
Automation and Miniaturization of Golden Gate DNA Assembly Reactions Using Acoustic Dispensers
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_9
PMID:39363071
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研究论文 | 本文介绍了一种使用声波分配器自动化和微型化Golden Gate DNA组装反应的方法 | 利用声波分配器在nL范围内转移液体，实现了Golden Gate克隆反应的微型化和并行化，减少了塑料废物和试剂使用 | NA | 提高Golden Gate克隆反应的效率和可持续性 | Golden Gate DNA组装反应 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA |
| 624 | 2025-01-15 |
Validation of Golden Gate Assemblies Using Highly Multiplexed Nanopore Amplicon Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_10
PMID:39363072
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研究论文 | 本文介绍了一种使用高度多重化的纳米孔扩增子测序技术验证Golden Gate组装的方法 | 提出了一种名为DuBA.flow的工作流程，用于从单个菌落到最终易于解读的测序报告的全过程验证 | NA | 验证Golden Gate组装的高阶组合复杂性 | Golden Gate组装的高阶组合 | 合成生物学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 625 | 2025-01-15 |
Biofoundry-Assisted Golden Gate Cloning with AssemblyTron
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_8
PMID:39363070
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研究论文 | 本文介绍了AssemblyTron，一个开源的Python包，用于自动化Golden Gate组装，以减少复杂DNA构建的失败率、资源消耗和培训需求 | AssemblyTron提供了低成本的自动化解决方案，使用开源的OpenTrons OT-2实验室机器人，扩展了Golden Gate组装的能力，包括模块化克隆载体组装、易错PCR组合突变体库组装和模块化克隆索引质粒库组装 | NA | 提高Golden Gate组装的自动化水平，降低复杂DNA构建的失败率和资源消耗 | Golden Gate组装技术及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装，易错PCR | NA | NA | NA |
| 626 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning of Expression Plasmids for Synthetic Small RNAs in Bacteria
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_17
PMID:39363079
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并提出了辅助寡核苷酸设计的G-GArden工具 | 提出了基于Golden Gate组装的快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，并开发了辅助设计的G-GArden工具 | NA | 开发一种快速高效构建合成小RNA表达质粒的方法，以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的小RNA（sRNAs） | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装 | NA | NA | NA |
| 627 | 2025-01-15 |
Modular Golden Gate Assembly of Linear DNA Templates for Cell-Free Prototyping
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_11
PMID:39363073
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研究论文 | 本文介绍了一种无细胞转录和翻译（TXTL）系统中快速生成线性DNA模板的Golden-Gate辅助工作流程 | 通过Golden-Gate组装和PCR扩增，无需克隆步骤，快速生成功能性DNA模板，显著加速合成生物学中的设计-构建-测试-学习周期 | 未提及具体实验样本量或数据集的详细信息 | 开发一种快速生成线性DNA模板的方法，用于无细胞转录和翻译系统中的基因调控元件和电路测试 | 线性DNA模板，包括启动子、核糖体结合位点（RBS）、编码序列和终止子等基本遗传部分 | 合成生物学 | NA | Golden-Gate组装、PCR扩增 | NA | DNA序列 | NA |
| 628 | 2025-01-15 |
Golden Gate Cloning for the Standardized Assembly of Gene Elements with Modular Cloning in Chlamydomonas
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4220-7_25
PMID:39363087
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研究论文 | 本文描述了在单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii中用于转基因表达的遗传盒的组装 | 使用Golden Gate克隆和模块化克隆（MoClo）标准化合成生物学工作流程，简化了遗传元件的组装 | NA | 开发快速高效的克隆策略，用于组装新的转录单元或整个通路 | 单细胞模型藻类Chlamydomonas reinhardtii | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆（MoClo） | NA | NA | NA |
| 629 | 2025-01-15 |
Microbial adaptation and genetic modifications for enhanced remediation in low-permeability soils
2025-Jan-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2024.177916
PMID:39647202
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综述 | 本文综述了低渗透性土壤中微生物适应和基因工程方法在增强生物修复效果方面的最新知识 | 整合了微生物适应和基因工程策略，提供了全面的概述，指导当前实践和未来研究 | NA | 提高低渗透性土壤中的生物修复效果 | 低渗透性土壤中的微生物 | 环境科学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
| 630 | 2025-01-15 |
Electro-bioremediation of wastewater: Transitioning the focus on pure cultures to elucidate the missing mechanistic insights upon electro-assisted biodegradation of exemplary pollutants
2025-Jan, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2024.123726
PMID:39729711
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研究论文 | 本文探讨了通过纯培养研究电生物修复技术对特定污染物的降解机制，以填补现有研究中的知识空白 | 从混合培养转向纯培养研究，以揭示电辅助生物降解的机制，并提出通过基因组注释、转录动力学等方法优化微生物水平的降解效率 | 目前关于纯培养的电生物降解机制研究较少（少于40项），且主要集中在降解潜力而非机制解析 | 研究电生物修复技术在废水处理中的应用，特别是通过纯培养揭示降解机制 | 含氮、磷、硫化合物、碳氢化合物、金属和偶氮染料等典型水污染物 | 环境工程 | NA | 基因组注释、转录动力学、合成生物学、数学建模 | NA | 分子水平数据（基因、酶、蛋白质、代谢物） | 少于40项研究 |
| 631 | 2025-01-15 |
Scaling up for success: from bioactive natural products to new medicines
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00022f
PMID:39129507
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评论 | 本文回顾了诺华公司在天然产物药物发现方面的历史，并介绍了从早期研究到开发及以后的过程中所使用的工具和面临的挑战 | 利用90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物，结合微生物学、计算生物学、合成生物学、化学和工艺开发等多学科方法，寻找新药物 | 未明确提及具体的研究局限性 | 通过天然产物发现新药物，并利用新技术加速药物发现和可持续化合物供应 | 天然产物及其衍生的药物 | 药物发现 | NA | 基因组工程、数据科学、抗体药物偶联物、放射性配体疗法、xRNA药物 | NA | NA | 90,000种微生物菌株和20,000种分离的天然产物 |
| 632 | 2025-01-15 |
Regulation of daptomycin biosynthesis in Streptomyces roseosporus: new insights from genomic analysis and synthetic biology to accelerate lipopeptide discovery and commercial production
2024-Dec-11, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00024b
PMID:39279757
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研究论文 | 本文通过基因组分析和合成生物学方法，探讨了达托霉素在Streptomyces roseosporus中的生物合成调控，旨在加速脂肽类抗生素的发现和商业化生产 | 通过比较野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株的基因组序列，发现高产菌株在达托霉素生物合成基因簇的大启动子区域有两个突变，这些突变影响了多顺反子mRNA的转录 | 研究主要基于两种菌株的基因组分析，可能无法全面反映所有可能的调控机制 | 提高达托霉素的发酵产量，并促进新型脂肽类抗生素的发现和商业化 | Streptomyces roseosporus菌株及其达托霉素生物合成基因簇 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因组分析、代谢工程、合成生物学、诱变 | NA | 基因组序列 | 两种Streptomyces roseosporus菌株（野生型低产菌株和MNNG诱变高产菌株） |
| 633 | 2025-01-15 |
Biomimetic Materials to Fabricate Artificial Cells
2024-Dec-11, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00241
PMID:39591535
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综述 | 本文综述了人工细胞的发展及仿生策略，重点讨论了基于仿生材料的人工细胞构建的底层策略 | 从仿生材料出发构建人工细胞，从简单的细胞支架到多室系统，从功能模块的构建到关键代谢行为的模拟，甚至到通信网络的仿生 | 对该领域的瓶颈进行了粗略分析 | 探讨人工细胞的构建及其在材料工程与生命科学之间的桥梁作用 | 人工细胞 | 合成生物学 | NA | 仿生技术 | NA | NA | NA |
| 634 | 2025-01-15 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从石栎的转录组数据中筛选出两个CHS基因（LlCHS1和LlCHS2），并进行了生物信息学分析和功能表征，揭示了它们在查尔酮合成中的功能 | 首次从石栎中克隆并鉴定了两个CHS基因，并通过合成生物学方法验证了它们在催化phloretin生成中的功能 | 研究仅在大肠杆菌中进行了功能验证，未在植物体内进行进一步验证 | 探索石栎中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能 | 石栎中的CHS基因（LlCHS1和LlCHS2） | 合成生物学 | NA | 生物信息学分析、合成生物学 | NA | 转录组数据 | 两个CHS基因（LlCHS1和LlCHS2） |
| 635 | 2025-01-14 |
Cardiomyocyte engineering: The meeting point of transcription factors, signaling networks, metabolism and function
2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.14271
PMID:39801134
|
review | 本文综述了直接心脏重编程或转分化在再生治疗、心血管疾病建模和药物发现中的最新进展 | 特别关注了合成生物学，尤其是CRISPR系统在将特定成纤维细胞亚群转化为心肌细胞方面的潜力 | 尽管有多种新方法被开发，获得功能性和代谢成熟的心肌细胞仍然是一个挑战 | 探讨心脏成纤维细胞的功能和多样性，以及体外人类心肌细胞模型的替代细胞来源 | 心脏成纤维细胞和诱导的心肌细胞 | 再生医学 | 心血管疾病 | CRISPR | NA | NA | NA |
| 636 | 2025-01-14 |
Cathelicidins in farm animals: Structural diversity, mechanisms of action, and therapeutic potential in the face of antimicrobial resistance
2025-Jan, Veterinary immunology and immunopathology
IF:1.4Q2
DOI:10.1016/j.vetimm.2024.110866
PMID:39708585
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综述 | 本文综述了农场动物中cathelicidins的结构多样性、作用机制及其在抗菌耐药性背景下的治疗潜力 | 强调了cathelicidins作为抗菌肽在抗菌耐药性日益严重的背景下作为传统抗生素替代品的潜力 | NA | 探讨cathelicidins在农场动物中的结构多样性、作用机制及其在治疗感染、炎症性疾病和癌症中的潜力 | 农场动物中的cathelicidins | 生物医学 | 感染性疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 637 | 2025-01-14 |
A Linear Mixed Effects Model for Evaluating Synthetic Gene Circuits
2024-Dec-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.30.630778
PMID:39803539
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研究论文 | 本文提出了一种线性混合效应模型，用于评估合成基因电路的性能 | 首次将线性混合效应模型应用于合成基因电路的统计分析，提出固定效应β作为电路性能的描述符 | 未提及具体局限性 | 标准化用于评估合成基因电路性能的统计方法 | 合成基因电路的布尔逻辑门性能 | 合成生物学 | NA | 线性混合效应模型、k-means聚类、蒙特卡洛模拟 | 线性混合效应模型 | 实验数据 | 144个已发布的布尔逻辑门 |
| 638 | 2025-01-14 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于开源硬件的微流体工作流程，用于通过培养单细胞在凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落来分析质粒保留 | 采用开源硬件实现精确的流量控制和温度管理，提高了工作流程的易用性、鲁棒性和可访问性 | 研究主要使用大肠杆菌作为实验模型，尽管方法具有广泛适用性，但尚未在其他生物体中验证 | 分析质粒保留，以支持合成生物学中无抗生素选择的功能性质粒维持 | 质粒和大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 微流体技术、荧光显微镜 | NA | 图像数据 | 大量微滴和微菌落 |
| 639 | 2025-01-13 |
Expression of Viral DNA Polymerase in Synthetic Recombinant Adeno-Associated Virus Producer Cell Line Enhances Full Particle Productivity
2025-Feb, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28885
PMID:39578398
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研究论文 | 本文介绍了一种通过表达HSV-1 DNA聚合酶来提高重组腺相关病毒（rAAV）生产效率和完整颗粒含量的合成生物学策略 | 通过将HSV-1的DNA聚合酶复合物编码序列整合到HEK293细胞系中，显著提高了rAAV基因组的扩增效率和完整颗粒含量 | 研究仅针对rAAV2和rAAV8两种血清型，未验证其他血清型的效果 | 提高重组腺相关病毒的生产效率和完整颗粒含量，以满足基因治疗中日益增长的临床需求 | 重组腺相关病毒（rAAV） | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略，HSV-1 DNA聚合酶表达 | NA | NA | HEK293细胞系及其衍生细胞系（如GX6B） |
| 640 | 2025-01-13 |
Engineering Saccharomyces cerevisiae for medical applications
2025-Jan-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02625-5
PMID:39789534
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综述 | 本文综述了工程化酿酒酵母在医学领域的主要应用，包括作为药物和疫苗的细胞工厂、诊断和仿生测定的生物传感器，以及用于智能原位治疗肠道疾病的活体生物治疗产品 | 探讨了酿酒酵母从食品工业工具到医疗应用的转变，特别是在合成生物学推动下的创新应用 | 该领域仍面临挑战，尽管发展迅速，但仍需克服一些主要障碍 | 研究工程化酿酒酵母在医学领域的应用潜力 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | 肠道疾病 | 基因工程 | NA | NA | NA |