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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-06-26 |
Transcriptome-Guided Identification of N-Acetyltransferases Involved in Melatonin Biosynthesis in a Streptomyces-Based Cell Factory
2026-May-27, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.70390
PMID:42178992
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研究论文 | 通过转录组引导挖掘,在链霉菌细胞工厂中鉴定参与褪黑素生物合成的N-乙酰转移酶,并优化产量 | 首次利用转录组引导策略在链霉菌中鉴定参与褪黑素合成的内源N-乙酰转移酶,并通过工程改造显著提高褪黑素产量 | 未提及具体局限性 | 实现微生物中褪黑素的高效生物合成 | 工程链霉菌白色亚种菌株 | 合成生物学 | NA | 转录组测序、基因工程 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因敲除、基因过表达 | 链霉菌白色亚种 | 褪黑素从头合成途径 | 医药,工业生物技术 |
| 702 | 2026-06-26 |
Spatial Regulation of CAR Signaling Enables Logic-Gated Activity
2026-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.22.726983
PMID:42239424
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研究论文 | 设计了一种通过空间调控CAR信号实现逻辑门控活性的新型受体MANTIS | 利用细胞外受体维度差异来空间调控CAR信号,通过空间位阻和抗原顺序结合实现AND门控逻辑 | 可能涉及复杂的工程化设计及体内应用的潜在挑战 | 开发一种新型AND门控受体,使CAR T细胞更特异性识别癌细胞,减少对正常细胞的杀伤 | CAR T细胞及其对癌细胞的杀伤活性 | 合成生物学 | 癌症 | CAR技术 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 逻辑门控受体MANTIS | 医学 |
| 703 | 2026-06-26 |
Emerging Applications of CAR-T Cell Therapy in Overcoming Resistance and Expanding Targets in Hematologic Malignancies: Insights from Recent Research
2026-May-23, Current treatment options in oncology
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s11864-025-01371-z
PMID:42176091
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综述 | 总结CAR-T细胞疗法在克服血液恶性肿瘤耐药性和扩展靶点方面的最新研究进展 | 提出CRISPR增强型CAR和基于合成生物学的异体系统以提高CAR-T疗法的疗效和可及性 | 未明确说明具体局限性,但指出抗原逃逸、T细胞耗竭及在急性髓系白血病和T细胞白血病中疗效有限等问题仍存在 | 总结2015年以来的人类试验成果,重点关注近两年创新,探讨克服耐药性策略及提升安全性和可及性的方法 | 血液恶性肿瘤患者,包括B细胞急性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 多靶点CAR、下一代构建体、合成生物学异体系统 | 医学 |
| 704 | 2026-06-26 |
The interaction between the RNA aptamer Dap1 and DasR mirrors DNA operator site recognition in GntR repressors
2026-May-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag489
PMID:42165134
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研究论文 | 研究RNA适配体Dap1与细菌阻遏蛋白DasR的相互作用机制,揭示其模拟DNA操纵子位点识别,并指导新型适配体设计 | 首次解析SELEX衍生适配体Dap1与GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR的复合物晶体结构,发现RNA适配体与蛋白的相互作用高度模仿DNA-蛋白识别模式,并基于结构信息设计出靶向同源蛋白NagR的新型适配体 | 未明确提及在更广泛的阻遏蛋白家族中的适用性验证,适配体设计策略的普适性有待进一步探索 | 阐释RNA适配体与细菌阻遏蛋白的分子识别机制,推动合成生物学中新型适配体-蛋白互作对的设计 | RNA适配体Dap1及其突变体Dap1m1、GntR/HutC家族阻遏蛋白DasR和NagR | 合成生物学 | NA | 晶体结构解析、SELEX、定点突变 | NA | 结构数据、序列数据 | NA | SELEX | 细菌(未明确具体菌种) | 基因表达调控回路(基于适配体诱导的阻遏蛋白去抑制) | 合成生物学、生物技术 |
| 705 | 2026-06-26 |
Viruses that heal: harnessing bacteriophages in the era of antibiotic resistance
2026-Apr-30, Voprosy virusologii
DOI:10.36233/0507-4088-366
PMID:42187217
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综述 | 探讨噬菌体作为抗生素替代疗法在应对抗菌素耐药性中的应用 | 结合基因组学、合成生物学和靶向医学进展,系统阐述噬菌体治疗的多机制作用(如裂解酶)和基因工程新技术(如CRISPR-Cas、噬菌体重组工程和合成基因组重启) | 未详细讨论噬菌体治疗在临床推广中面临的具体监管障碍和规模化生产挑战 | 综述噬菌体生物学、多样性及其在治疗多重耐药菌感染中的应用潜力 | 噬菌体(特别是感染和破坏细菌的病毒) | 机器学习 | 抗菌素耐药性相关感染 | CRISPR-Cas, 噬菌体重组工程, 合成基因组重启 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | NA | 医学, 农业, 环境, 食品, 工业生物技术 |
| 706 | 2026-06-26 |
Advances in protein engineering
2026, International review of cell and molecular biology
DOI:10.1016/bs.ircmb.2025.11.002
PMID:42191275
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在多种医学、食品和环境领域的最新进展,重点关注人类疾病和生物医学科学中的应用 | 重点介绍了蛋白质工程在CRISPR/Cas系统、高通量数据和合成生物学中的关键成果,以及进化、理性设计、半理性设计和混合方法等创新技术 | 讨论了蛋白质工程当前面临的挑战和伦理考虑 | 综述蛋白质工程在人类疾病治疗,特别是癌症治疗中的转化潜力 | 蛋白质工程及其在疾病治疗中的应用 | 机器学习和合成生物学 | 人类疾病,特别是癌症 | 蛋白质工程、CRISPR/Cas系统、高通量数据 | NA | 高通量数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学、食品、环境 |
| 707 | 2026-06-26 |
Microbial Ecology at the Nexus of Food Safety and Biotechnology With Ecological Mechanisms, Risks, and Emerging Innovations
2026, International journal of food science
IF:2.7Q3
DOI:10.1155/ijfo/6618960
PMID:42344006
|
综述 | 综述了微生物生态学在食品安全与生物技术交叉领域的作用、生态机制、风险及新兴创新 | 将微生物生态学作为整合框架,系统连接食品安全和生物技术,并强调生态机制在两者中的应用 | 由于微生物复杂性、数据整合限制和安全考虑,将生态见解转化为可靠的工业和监管实践仍面临挑战 | 综合当前关于微生物生态学在食品安全与食品生物技术交叉领域的文献,并识别关键研究空白和未来方向 | 食品安全和食品生物技术中的微生物群落 | 微生物生态学 | NA | 高通量测序, 全基因组测序, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | 文献 | NA | NA | NA | NA | 食品, 生物技术 |
| 708 | 2026-06-26 |
Ensemble techniques for predictive modeling of leishmanial activity via molecular fingerprints
2025-10-14, BMC medical informatics and decision making
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s12911-025-03041-4
PMID:41088199
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研究论文 | 利用集成学习技术基于分子指纹预测利什曼病活性 | 首次引入集成模型方法用于利什曼病药物发现,结合三种分子指纹算法和多种机器学习模型,实现了83.65%的高精度预测 | 数据集仅来自PubChem数据库,且依赖Alamar Blue法评估,可能限制化合物的多样性;模型尚未经过体外或体内实验验证 | 开发基于机器学习和化学信息学的计算方法,预测化合物抗利什曼原虫前鞭毛体的活性 | 65,057个分子(来自PubChem数据库)以及其抗利什曼原虫活性数据 | 机器学习 | 利什曼病 | 分子指纹编码(Avalon、MACCS Key、Pharmacophore)、Alamar Blue法 | 随机森林、多层感知器、梯度提升、决策树、集成模型 | 分子结构数据(SMILES符号) | 65,057个分子 | NA | NA | NA | 医学 |
| 709 | 2026-06-26 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-08-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 开发了一种具有多酶纳米酶活性的仿生脂质体,用于调节外源植入物引起的促炎因子,从而促进组织再生 | 首次将CeO纳米颗粒与人工膜自组装形成仿生脂质体,兼具抗血液成分粘附和调节生化微环境稳态的双重功能 | NA | 设计并构建能在初始移植阶段复制天然细胞功能的治疗性脂质体,用于组织工程中的合成生物学 | 多酶纳米酶脂质体及CeO纳米颗粒 | NA | NA | 自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 710 | 2026-06-26 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-08-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
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研究论文 | 开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法,解析多因素条件下三链DNA的热稳定性和pH稳定性 | 首次预测了不同温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性,并揭示了离子强度对Hoogsteen氢键的双重作用机制 | 未明确提及 | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA稳定性,并建立预测模型 | 三链DNA结构 | 分子生物学、核酸结构生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光信号、熔解温度数据 | 414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 基因靶向治疗、合成生物学应用 |
| 711 | 2026-06-26 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 通过体外重建和突变分析,揭示了两种聚酮链通过非经典缩合结构域融合形成马来环丙醇活性丁烯内酯核心的机制 | 首次阐明硫模板介导的聚酮链头对头融合及还原环化构建丁烯内酯的非常规生物合成途径,扩展了合成生物学工具箱 | 未明确提及该反应在体内的效率或对病原菌整体毒力的定量影响 | 揭示马来环丙醇中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 类鼻疽伯克霍尔德菌群的毒力因子马来环丙醇及其生物合成酶系 | 合成生物学 | 类鼻疽伯克霍尔德菌感染 | 化学合成、体外重构、突变分析、生化测定 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9(用于突变分析) | NA | 由PKS-NRPS杂合合成酶催化的聚酮链融合及还原环化丁烯内酯形成途径 | 医学(抗毒力策略开发) |
| 712 | 2026-06-26 |
Light-Responsive DNA Droplets for Controlling Enzyme Cascade Pathways by Dynamic Phase Separation
2025-07-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202505316
PMID:40410127
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研究论文 | 通过光响应DNA液滴动态相分离控制酶级联途径 | 提出利用光响应DNA液滴通过液-液相分离选择性隔离酶,实现紫外光和可见光调控酶级联反应,无需改变总酶浓度 | 未提及在复杂生物环境中的稳定性和长期应用效果 | 开发光响应DNA液滴用于精确调控酶级联途径 | 光响应DNA液滴和酶级联系统(GOx、HRP、CAT和GAO、MPO、CAT) | 合成生物学 | NA | 液-液相分离 | NA | NA | NA | NA | NA | 光响应DNA液滴(Y-motif序列与偶氮苯修饰的粘性末端)和酶级联途径 | 合成生物学, 微反应器设计, 生物工程 |
| 713 | 2026-06-26 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-06-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路,用于实现原始细胞与活细胞群落中的自我调节双向通信 | 设计了包含识别、激活和反馈模块的DNA电路,使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号,自我调节与活细胞的相互作用,并具备可再生能力,能连续与多个目标活细胞互动 | 仅描述了原理验证,未提及在复杂生物环境中的应用限制或长期稳定性问题 | 开发合成生物学工具,控制细胞间信号传递,实现原始细胞与活细胞群落中的动态信号传播调控 | 原始细胞(非生物细胞模拟物)与活细胞(目标细胞) | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA | DNA组装技术 | 原始细胞(非生物) | 信号电路,包含识别模块、激活模块和反馈模块,用于自我调节双向通信 | 医学(细胞疗法) |
| 714 | 2026-06-26 |
Measuring XNA polymerase fidelity in a hydrogel particle format
2025-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf038
PMID:39878216
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研究论文 | 开发了一种基于水凝胶颗粒的无纯化方法,用于测量合成人工遗传聚合物(XNA)的聚合酶保真度 | 通过在磁性水凝胶颗粒基质内进行XNA转录和逆转录步骤,避免了传统方法中耗时的聚丙烯酰胺凝胶电泳纯化步骤 | NA | 简化XNA聚合酶保真度测量流程 | XNA聚合酶 | NA | NA | 水凝胶颗粒技术, DNA/RNA合成 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 715 | 2026-06-26 |
Choreographing root architecture and rhizosphere interactions through synthetic biology
2024-02-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45272-5
PMID:38355570
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综述 | 通过合成生物学方法调控根系结构及其与根际微生物的互作,以应对气候变化对农业的挑战 | 首次系统阐述将合成遗传电路从微生物扩展到多细胞植物,用于调控根系形态、分泌物及根际微生物活动的创新策略 | NA | 探索利用合成生物学工具设计气候适应型作物的根系功能及根际互作 | 植物根系及其相关微生物群落 | 合成生物学 | NA | 合成遗传电路 | NA | NA | NA | NA | 植物(多细胞物种) | 用于调控根系结构、分泌作用和根表面微生物活动的合成遗传电路 | 农业, 环境 |
| 716 | 2026-06-25 |
Synthetic biology of oncolytic bacteria: Comparative microbial chassis and precise killing strategies
2026-Dec, Toxicology reports
DOI:10.1016/j.toxrep.2026.102292
PMID:42339179
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综述 | 综述利用合成生物学工程改造溶瘤细菌的最新进展,包括不同微生物底盘及精确杀灭策略 | 系统比较了多种微生物底盘(沙门氏菌、李斯特菌、大肠杆菌、梭菌、双歧杆菌、酵母等)在癌症治疗中的应用,并总结了CRISPR/Cas9基因编辑、遗传逻辑电路和自杀开关等合成生物学技术增强安全性和特异性的方法 | NA | 为开发具有精确靶向能力和增强治疗稳定性的溶瘤细菌提供合成生物学视角 | 溶瘤细菌及其微生物底盘 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 沙门氏菌, 李斯特菌, 大肠杆菌, 梭菌, 双歧杆菌, 酵母 | 遗传逻辑电路, 自杀开关 | 医学 |
| 717 | 2026-06-25 |
Haplotype-resolved T2T genome and population resequencing provide insights into the domestication and mogroside biosynthesis of Siraitia grosvenorii (Cucurbitaceae)
2026-Jul, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhag103
PMID:42338566
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研究论文 | 通过单倍型解析的T2T基因组和群体重测序,揭示了罗汉果的驯化历史及其罗汉果甜苷生物合成机制 | 首次构建了罗汉果单倍型解析的端粒到端粒无缺口基因组,并结合群体基因组分析阐明了驯化瓶颈和选择性清除对基因组结构的影响 | 未明确提及,但可能受限于样本量(173个重测序基因组)和功能验证实验的缺失 | 解析罗汉果的驯化过程及罗汉果甜苷V的生物合成机制,为分子育种和合成生物学提供基因组基础 | 罗汉果(Siraitia grosvenorii)及其基因组、群体和转录组数据 | 基因组学 | NA | T2T基因组组装、群体重测序、比较基因组学、转录组分析 | NA | 基因组序列、重测序数据、转录组数据 | 单倍型基因组(2个单倍型)及173个重测序基因组 | NA | NA | NA | 农业、食品 |
| 718 | 2026-06-25 |
Genetically engineered outer membrane vesicles as next-generation bionanomaterials for therapeutic and diagnostic applications
2026-Jun-23, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d6tb00650g
PMID:42300204
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综述 | 本文系统综述了基因工程外膜囊泡作为下一代生物纳米材料在治疗和诊断应用中的设计策略与转化前景 | 整合合成生物学与基因工程技术将天然外膜囊泡转化为可编程智能生物纳米平台,并系统阐述表面展示、货物装载及膜调控三大工程策略 | 临床转化面临规模化生产、安全性评估和监管路径等关键挑战 | 探讨基因工程外膜囊泡在精准治疗与诊断中的设计原则及未来发展方向 | 基因工程外膜囊泡(geOMVs) | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 革兰氏阴性菌 | 表面展示、货物封装、膜调控 | 医学 |
| 719 | 2026-06-25 |
Expanding the genetic toolset: using serine recombinases to integrate riboregulatory elements into industrially relevant microbial chassis
2026-Jan-08, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuag015
PMID:42228948
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研究论文 | 本论文展示了联合使用顺式抑制子(CR)与丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE)技术,将核糖调控元件整合到工业相关微生物底盘中的方法。 | 创新点在于实现了两种合成生物学工具(顺式抑制子和丝氨酸重组酶辅助基因组工程)的联合应用,成功将核糖调控元件高效整合到多种工业微生物中,并验证了其在不同遗传背景下的高度可移植性。 | 限制因素可能包括对更多微生物宿主的适用性需进一步验证,以及顺式抑制子调控效果的绝对范围可能受限于特定宿主基因表达环境。 | 旨在扩展生物制造中工业微生物的基因操作工具集,实现多种宿主简便的基因组操作和精确基因表达调控。 | 工业相关微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌和富养罗尔斯通氏菌。 | 合成生物学 | NA | 顺式抑制子、丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | NA | 荧光报告基因表达数据 | 三种微生物宿主:恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌,每种宿主整合多种顺式抑制子,但未明确样本数量 | 丝氨酸重组酶辅助基因组工程(SAGE) | 恶臭假单胞菌、谷氨酸棒杆菌、富养罗尔斯通氏菌 | 顺式抑制子(CR)核糖调控元件整合至染色体 | 工业生物技术、生物制造 |
| 720 | 2026-06-24 |
Evaluating Malat1-derived 3'end sequences for functional transgene expression in human cells using synthetic mRNA delivery
2026-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2026.2670832
PMID:42093635
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研究论文 | 评估基于Malat1衍生3'末端序列在人类细胞中通过合成mRNA递送实现功能性转基因表达的效果 | 首次系统比较了长链非编码RNA Malat1衍生的3'端基序(包含保守三螺旋结构)与经典poly(A)尾在合成报告RNA中的表达效能 | 测试的Malat1衍生基序表达效率持续低于经典poly(A)尾,且未优化三螺旋序列折叠 | 探索poly(A)尾替代策略在合成mRNA表达中的应用潜力 | Malat1衍生的3'端基序与经典poly(A)尾在编码绿色荧光蛋白的合成报告RNA中的表达比较 | 分子生物学 | NA | 合成mRNA递送 | NA | NA | NA | NA | 人类细胞 | NA | 合成生物学,RNA治疗 |