合成生物学相关文章
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当前共找到 5201 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-05-11 |
Plasmid Vectors for in Vivo Selection-Free Use with the Probiotic E. coli Nissle 1917
2021-01-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00466
PMID:33301298
|
研究论文 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体系统 | 将天然质粒pMUT1和pMUT2改造为稳健的工程平台，结合CRISPR-Cas9系统移除天然质粒，实现无抗生素选择下的稳定维持和功能性蛋白分泌 | 未提及 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体平台 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917及其天然质粒pMUT1和pMUT2 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 小鼠胃肠道实验 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 质粒载体含选择标记、荧光标记、温度敏感表达和curli分泌系统 | 医学 |
| 702 | 2026-05-10 |
Prediction of gene expression levels in Saccharomyces cerevisiae based on chromatin accessibility using multiple machine learning models
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 基于染色质可及性使用多种机器学习模型预测酿酒酵母基因表达水平 | 首次使用染色质可及区域的k-mer特征通过监督机器学习模型预测基因表达，并发现与mRNA剪接相关的关键基序 | NA | 从染色质可及区域预测基因表达水平 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的染色质可及区域和基因表达 | 机器学习 | NA | 机器学习建模、染色质可及性分析 | 监督机器学习模型(Yeast-Gene) | 序列数据(k-mer特征) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 合成生物学 |
| 703 | 2026-05-10 |
Amino acids in yeast fermentation: A review of their roles from nutrients to modulators
2026-Jul-02, International journal of food microbiology
IF:5.0Q1
|
综述 | 系统综述了酵母发酵中氨基酸从营养物质到调节因子的多重作用 | 首次全面整合了氨基酸在发酵体系中作为酵母性能关键调节因子的认识，涵盖其来源、摄取机制及对风味代谢和胁迫耐受性的调控作用 | 关于非酵母属酵母和真实发酵环境异质性的研究仍存在显著知识空白 | 系统阐明氨基酸与酵母的互作机制以优化发酵品质和效率 | 酵母发酵系统中的氨基酸及其对酿酒酵母和非酿酒酵母的影响 | 微生物学 | NA | 多组学、合成生物学、生态建模 | NA | 文献数据 | NA | NA | 酿酒酵母、非酵母属酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 704 | 2026-05-10 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
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研究论文 | 研究发现海绵来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶（SdCDO）能裂解番茄红素和β-胡萝卜素生成藏花素前体，实现藏花素在番茄果实中的积累 | 首次揭示海洋海绵来源的CCD酶具有意外的酶促可塑性，能够将植物类胡萝卜素代谢重定向至藏花素生物合成途径，而非预期的视黄醇生成 | 未明确探讨SdCDO在天然海绵宿主中的生理功能，且研究仅在单一种植物（番茄）中进行验证 | 探索海洋海绵中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能多样性及其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶（SdCDO） | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢组学分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录组数据 | 大肠杆菌和番茄果实样本 | NA | 大肠杆菌, 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 705 | 2026-05-10 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 本研究通过合成磷酸肽和化学蛋白质组学方法，探究了志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性，发现其不仅能修饰MAPK家族蛋白，还能作用于多种细胞靶标 | 首次揭示OspF对MAPK家族内部的底物选择性，并发现其修饰范围远超MAPK家族，包括Rab1A和酪蛋白激酶2β等新靶标 | 未完全阐明OspF在志贺氏菌感染中的全部功能角色，需要进一步研究 | 研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在宿主细胞中的修饰靶标 | 志贺氏菌分泌的磷酸苏氨酸裂合酶OspF | 微生物学, 化学生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析, 化学蛋白质组学, 亲核膦化学探针 | NA | 蛋白质组数据 | 细胞裂解液样本和志贺氏菌感染样本 | NA | 志贺氏菌, 宿主细胞（被感染细胞） | NA | 医学, 化学生物学, 合成生物学 |
| 706 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 707 | 2026-05-10 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
|
研究论文 | 本文鉴定了毛地黄中地高辛生物合成三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中P450酶定位在内质网，而3HSD和P5R2定位在细胞质，并发现毛地黄P450与哺乳动物同源酶（CYP11A1）的线粒体定位不同 | 研究仅限于烟草叶片中的瞬时表达，未在毛地黄原生细胞中验证；仅覆盖三种已知酶，途径的其他未知酶尚未涉及 | 阐明地高辛生物合成途径的空间组织，为合成生物学和代谢工程提供指导 | 毛地黄中地高辛生物合成的三种酶（P450、3HSD、P5R2） | 合成生物学 | 心血管疾病 | 荧光标记与共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 烟草叶片中的瞬时表达实验 | NA | 烟草 | 地高辛生物合成途径 | 医药 |
| 708 | 2026-05-10 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
|
综述 | 综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用潜力 | 系统总结了粘细菌基因组多样性和裂解酶挖掘的最新进展，强调了粘细菌作为工业细胞工厂的未充分利用潜力 | 基因工程改造困难、生长缓慢、代谢重塑和表达策略限制等挑战尚未解决 | 探讨粘细菌及其酶在农业和工业生物制造中的应用前景 | 粘细菌及其裂解酶 | 机器学习 | NA | NA | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学策略 | 粘细菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 709 | 2026-05-10 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
|
综述 | 探讨类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径的工程化策略，涵盖酶工程、合成生物学工具及宿主范围，并展望未来研究方向 | 采用通路模块化视角，系统梳理从前体供应到氧化裂解的每个酶促步骤，重点突出新发现酶变体、诱变研究、融合策略及区室化方法对代谢调控的贡献 | 仅聚焦近期文献，未对工业放大和具体产量指标进行量化比较，缺乏对经济性与规模化瓶颈的深入分析 | 为推进类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素生物合成提供层次化路径理解与工程策略整合 | 类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径中的酶、宿主（植物、真菌、藻类、酵母、细菌）及合成生物学工具 | NA | NA | NGS、RNA-seq、CRISPR-Cas9、Golden Gate Assembly | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 植物、真菌、藻类、酵母、细菌 | 类胡萝卜素生物合成通路（前体供应→GGPP→八氢番茄红素→脱饱和/异构化→环化→羟基化→酮基化→环氧化→氧化裂解） | 医学、农业、食品、工业生物技术 |
| 710 | 2026-05-09 |
Engineering Corynebacterium glutamicum as a multifunctional biofactory for living therapeutic materials and controlled ectoine delivery
2026-Aug, Biomaterials advances
IF:5.5Q2
DOI:10.1016/j.bioadv.2026.214847
PMID:41950672
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研究论文 | 将谷氨酸棒杆菌工程化为多功能生物工厂，用于活体治疗材料和受控的依克多因递送 | 首次将谷氨酸棒杆菌作为多功能平台开发用于活体治疗材料，整合了生物感应、报告和依克多因生产功能，并实现了在聚合物基质中的封装与受控释放 | 未明确讨论在体内环境中的长期稳定性和免疫原性等潜在挑战 | 设计和构建工程化谷氨酸棒杆菌，用于活体治疗材料的开发及相关应用 | 谷氨酸棒杆菌菌株及基于聚合物的活体材料（膜-凝胶贴片和核壳水凝胶系统） | 合成生物学 | 炎症及应激相关疾病 | 合成生物学 | NA | 生物传感数据 | NA | 合成生物学 | Corynebacterium glutamicum | 生物传感器、报告系统、依克多因合成通路 | 医学, 环境 |
| 711 | 2026-05-09 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
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研究论文 | 通过合成生物学调控构建重组益生菌株，实现对尿酸的模块化降解，并用于高尿酸血症治疗 | 创新性地通过调节不同强度的核糖体结合位点实现尿酸降解模块的优化，并过表达尿酸转运蛋白和过氧化氢降解酶以提高降解效率 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化尚需进一步验证 | 开发安全有效的微生物策略用于高尿酸血症治疗 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株及其对高尿酸血症小鼠模型的治疗作用 | 机器学 | 高尿酸血症 | 合成生物学 | NA | 基因序列 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 尿酸降解模块 | 医学 |
| 712 | 2026-05-09 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
|
研究论文 | 文章讨论混合人工智能在合成生物学中应用于农业的潜力 | 提出混合AI能够更有效地处理多组学复杂性，用于工程化气候智能、高产量作物，超越传统数据驱动方法 | 发挥全部潜力需要清晰的流程、精选的数据集和自动化平台 | 探索混合AI在合成生物学中推动农业转型的作用 | 多基因组、多性状、多环境数据以及作物工程 | 机器学习 | NA | NA | 混合AI | 多组学数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 713 | 2026-05-09 |
Rewiring holobiont systems with synthetic biology
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.017
PMID:41109795
|
综述 | 本文综述了合成生物学如何帮助理解和操控全生物体（宿主及其微生物群组成的复杂群落）中的相互作用 | 提出了de novo全生物设计这一新领域，整合全生物研究与合成生物学，并重点介绍了细菌生物传感器、跨王国通讯工程、表面展示及CRISPR系统等前沿技术 | 未提及具体局限性 | 探索合成生物学在解析和操控全生物体相互作用中的应用，推动生物技术新前沿 | 全生物体（宿主与微生物群）及其相互作用 | 合成生物学 | NA | 细菌生物传感器设计、跨王国通讯工程、表面展示、CRISPR系统 | NA | NA | NA | CRISPR系统 | NA | 细菌生物传感器、跨王国通讯回路 | 生物技术 |
| 714 | 2026-05-09 |
Transforming toxic element remediation: a necessary path for 21st-century food security
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.10.008
PMID:41139567
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综述论文 | 探讨利用基因编辑、合成生物学和混合技术修复有毒元素污染，以保障21世纪粮食安全 | 提出基因编辑和合成生物学等新兴技术可实现可扩展、永久性的土壤解毒和污染土地恢复，超越传统临时修复方法 | NA | 阐述新兴修复技术在应对全球有毒元素污染和保障粮食安全方面的潜力和必要性 | 有毒元素污染的土壤和农业系统 | 数字病理学 | NA | 基因编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物 | 修复途径、生物传感器 | 农业, 环境 |
| 715 | 2026-05-09 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出一种基于人工神经网络（ANN）的框架，用于酿酒酵母中情境感知的合成启动子设计，实现转录网络的重新编程 | 首次实现启动子与转录因子结合位点的情境感知重组，无需先验实验表征即可实现高达98.4%的抑制率，并成功重编程酵母转录网络 | 未提及模型的可推广性至其他物种或复杂多转录因子系统的验证，且筛选的启动子数量有限 | 开发可扩展的预测方法用于工程化调控序列和重编程转录逻辑 | 酿酒酵母天然启动子与TetR和Mig1转录因子结合位点的兼容性 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络（ANN） | ANN | 序列数据 | 共筛选6,011个天然酵母启动子 | 启动子工程 | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组，葡萄糖依赖性基因调控回路 | 工业生物技术 |
| 716 | 2026-05-09 |
Multichannel genomic recording of biological information with ENGRAM
2026-Feb-11, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01322-w
PMID:41673323
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protocol | 提供ENGRAM实验的逐步操作协议及数据分析方法，阐述其设计要点、优势与局限，并展示在多路信号记录和高通量CRE筛选中的应用 | ENGRAM利用引物编辑介导的插入记录顺式调控元件活性，支持高多重性（如4碱基对插入可代表多达256种不同CRE），并与DNA Typewriter兼容以捕获信号顺序 | 未明确提及自身局限，但可能包括对分子生物学和细胞培养技能的要求，以及实验周期约5-6周 | 通过ENGRAM实现生物信息的多通道基因组记录，为研究时间动态生物学提供新范式 | 顺式调控元件及其在哺乳动物细胞中的活性 | 合成生物学 | NA | 引物编辑、DNA测序 | NA | 基因组序列数据 | NA | 引物编辑 | 哺乳动物细胞 | ENGRAM记录电路（增强子介导的多路活动基因组记录） | 分子记录、高通量筛药 |
| 717 | 2026-05-09 |
Leveraging AI for cell biology discovery
2026-01-08, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253023
PMID:41502213
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综述 | 本文探讨了人工智能在细胞生物学发现中的应用，涵盖显微镜、成像、药物发现和合成生物学等领域 | 系统总结了AI在单细胞分辨率分析、复杂模式识别和细胞行为预测方面的进展 | 数据质量要求高、模型可解释性不足以及AI工具普及性有限 | 综述AI在细胞生物学中的应用与未来方向 | 细胞生物学数据、显微图像、转录组数据等 | 机器学习和数字病理学交叉领域 | 不适用 | 深度学习、单细胞转录组分析 | CNN | 图像、文本、基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 医学, 基础研究 |
| 718 | 2026-05-09 |
The renaissance of Salmonella-based cancer therapy: convergence of AI, synthetic circuits, and TME remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1790215
PMID:42099610
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综述 | 综述沙门氏菌癌症治疗领域的复兴，探讨人工智能、合成电路和肿瘤微环境重塑如何克服历史障碍 | 提出从静态减毒到动态理性设计的转变，强调合成生物学和人工智能工具（如Cello和SHASI-ML）如何使沙门氏菌成为智能微机器人，实现安全递送和精准免疫刺激 | 未明确讨论免疫原性-安全性权衡中仍存在的挑战或大规模临床转化的潜在障碍 | 阐述下一代工程沙门氏菌作为免疫调节因子将冷肿瘤转变为热环境，增强检查点抑制剂和化疗效果的潜力 | 减毒沙门氏菌及其在肿瘤微环境中的工程化应用 | 合成生物学, 人工智能 | 癌症 | 合成生物学, 人工智能 | Cello, SHASI-ML | NA | NA | CRISPR-Cas9, Cello | 沙门氏菌 | 同步裂解系统、缺氧响应逻辑门、代谢通路（如天冬酰胺耗竭） | 医学 |
| 719 | 2026-05-09 |
BPP Bioportide™-mediated (genetic) transformation in cyanobacteria: a rapid and simplified approach for efficient molecular translocation and genome modification
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1812316
PMID:42100039
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研究论文 | 本文系统评估了一种基于蛋白质的DNA递送系统BPP Bioportide™在多种蓝藻菌株中的转化效率，并优化了关键因素 | 首次将BPP Bioportide™蛋白递送系统应用于蓝藻基因工程，实现低DNA输入量（10 ng）下的高效转化，并成功改造了非模式菌株 | DNA摄取窗口较窄，且转化效率受DNA类型、宿主倍性和筛选条件等多因素影响 | 开发一种快速、简化且广谱的蓝藻遗传转化方法 | 蓝藻菌株包括集胞藻PCC 6803、聚球藻PCC 7942和蓝丝藻UTEX 3153 | 合成生物学 | NA | BPP Bioportide™介导的DNA递送、同源重组、菌落PCR | NA | NA | 三种蓝藻菌株 | BPP Bioportide™蛋白递送系统 | 集胞藻PCC 6803, 聚球藻PCC 7942, 蓝丝藻UTEX 3153 | NA | 工业生物技术, 碳中和生物技术 |
| 720 | 2026-05-09 |
Plant microbiome engineering: from inoculation to genome editing
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1781381
PMID:42100688
|
综述 | 整合分子遗传学、微生物生态学和系统级微生物组设计，将植物及其微生物组视为可工程化的全生物，并探讨从接种到基因组编辑的微生物组工程策略 | 首次在一个统一的概念框架内整合CRISPR介导的植物-微生物工程、微生物组的生态稳定性以及气候适应性农业应用，并提出AI辅助决策框架和全生物工程化视角 | 生态稳定性、性状权衡、生物安全和监管挑战限制了大规模部署 | 提出一个从经验性接种向预测性、可持续和社会责任性农业生物技术转变的整合框架 | 植物相关微生物组及其与植物的相互作用 | 机器学习, 数字农业 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, RNA干扰, 合成微生物群落设计, 多组学分析, 机器学习和生态建模 | 机器学习模型, 生态模型 | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, RNA干扰 | 植物, 微生物 | NA | 农业 |