合成生物学相关文章
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当前共找到 3054 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2024-12-19 |
Quantitative Characterization of Gene Regulatory Circuits Associated With Fungal Secondary Metabolism to Discover Novel Natural Products
2024-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407195
PMID:39467708
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研究论文 | 本文利用微流控平台结合数学模型，在单细胞水平上精确表征了与真菌次级代谢相关的基因调控回路 | 首次将微流控平台与数学模型结合，用于单细胞水平上精确表征真菌基因调控回路，并成功重构了生物活性分子的生物合成途径 | 研究仅限于两种代表性真菌基因调控回路，样本量较小 | 探索真菌基因调控回路在次级代谢中的作用，发现新的天然产物 | 真菌基因调控回路及其在次级代谢中的表达强度和时序 | 合成生物学 | NA | 微流控平台 | 数学模型 | 基因表达数据 | 30个转录因子-启动子组合，来自两种代表性真菌基因调控回路，使用模式真菌Aspergillus nidulans |
| 702 | 2024-12-19 |
Accurate RNA 3D structure prediction using a language model-based deep learning approach
2024-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02487-0
PMID:39572716
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研究论文 | 本文提出了一种基于语言模型的深度学习方法RhoFold+，用于准确预测RNA的三维结构 | RhoFold+通过集成预训练的RNA语言模型和解决数据稀缺问题，提供了一个全自动的端到端RNA三维结构预测管道，并在多个评估中表现优于现有方法 | NA | 开发一种能够准确预测RNA三维结构的方法，以促进RNA功能研究和RNA靶向药物开发 | 单链RNA的三维结构 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 语言模型 | 序列 | 约2370万条RNA序列 |
| 703 | 2024-12-19 |
Advanced Antibacterial Strategies for Combatting Biomaterial-Associated Infections: A Comprehensive Review
2024 Nov-Dec, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.2018
PMID:39654369
|
综述 | 本文综述了生物材料相关感染的挑战及其预防策略，重点探讨了抗菌涂层和多功能抗菌生物材料的应用 | 本文讨论了多功能抗菌生物材料的最新进展，并提出了合成生物学作为应对抗菌耐药性的新方法 | 本文主要为综述性质，未提供具体的实验数据或模型 | 旨在指导高效且生物相容的抗菌生物材料的设计与开发 | 生物材料相关感染及其预防策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 704 | 2024-12-19 |
Efficient and markerless gene integration with SlugCas9-HF in Kluyveromyces marxianus
2024-07-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06487-w
PMID:38956406
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9的多位点基因整合方法，用于在非传统酵母Kluyveromyces marxianus中组装多个外源基因 | 使用高保真Cas9核酸酶SlugCas9-HF提高了基因编辑的精确度，并开发了一种CRISPR-based的生物合成工具包，能够实现大基因模块的基因组整合和多位点同时整合 | NA | 开发一种高效的基因整合方法，促进Kluyveromyces marxianus在工业生产中的应用 | 非传统酵母Kluyveromyces marxianus | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因组 | NA |
| 705 | 2024-12-18 |
Carotenoids: resources, knowledge, and emerging tools to advance apocarotenoid research
2025-Jan, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2024.112298
PMID:39442633
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综述 | 本文综述了类胡萝卜素及其衍生物阿朴类胡萝卜素的生物合成、调控及其在植物发育、应激反应和植物-有机体相互作用中的作用 | 本文强调了异源表达平台和合成生物学工具在扩展阿朴类胡萝卜素发现、知识和应用方面的价值，并提出了未来研究的新方向 | NA | 探讨类胡萝卜素生物合成的调控及其对阿朴类胡萝卜素形成和生物活性效应的影响 | 类胡萝卜素及其衍生物阿朴类胡萝卜素 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 706 | 2024-12-18 |
Bacterial 5' UTR: A treasure-trove for post-transcriptional regulation
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108478
PMID:39551455
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综述 | 本文综述了细菌5' UTR在转录后调控中的作用及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 本文整合了当前对5' UTR调控功能的理解，展示了5' UTR元件设计和筛选的最新进展，并更新了开发的工具和调控策略 | 本文强调了未来建立可靠的生物信息学分析方法和非模式细菌底盘的挑战和必要性 | 探讨细菌5' UTR衍生的调控元件及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 细菌5' UTR及其调控元件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 707 | 2024-12-18 |
Harnessing microbial heterogeneity for improved biosynthesis fueled by synthetic biology
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.11.004
PMID:39686977
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综述 | 本文综述了微生物异质性对生物合成的影响，并探讨了合成生物学工具和策略如何通过调控微生物异质性来提高生物合成效率 | 提出了利用微生物异质性（IHP-RHR）的工作流程，通过增加遗传异质性筛选高产菌株，并在生产过程中减少异质性以获得高稳健性菌株 | 未具体讨论实际应用中的挑战和解决方案 | 探讨如何通过合成生物学和单细胞技术调控微生物异质性，以提高微生物细胞工厂的效率和稳健性 | 微生物异质性及其对生物合成的影响 | 合成生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA |
| 708 | 2024-12-18 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 本文利用合成生物学方法，通过工程化细菌表达来自海生海绵的硅酸盐生物矿化酶silicatein，使其自组装形成多硅酸盐“生物玻璃”涂层，从而增强光聚焦能力 | 本文首次利用工程化细菌自组装形成多硅酸盐涂层，并展示了其显著的光聚焦能力，亮度比未修饰的细菌高出近一个数量级 | 本文未详细讨论该技术的实际应用场景和大规模生产的可能性 | 探索合成生物学在生产具有独特光学特性的光子组件中的应用 | 工程化细菌及其自组装形成的多硅酸盐涂层 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 709 | 2024-12-18 |
Exploring the Promoter Generation and Prediction of Halomonas spp. Based on GAN and Multi-Model Fusion Methods
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313137
PMID:39684846
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研究论文 | 本文提出了基于生成对抗网络（GAN）和多模型融合方法的极端微生物Halomonas spp.启动子生成与预测方法 | 首次为极端微生物Halomonas spp.构建了启动子强度数据库，并提出了基于GAN和多模型融合的启动子设计与预测方法 | 需要进一步验证该方法在其他极端微生物中的适用性 | 探索极端微生物Halomonas spp.的启动子生成与预测方法，推动工业生物技术的发展 | 极端微生物Halomonas spp.的启动子序列及其强度预测 | 合成生物学 | NA | 生成对抗网络（GAN），多模型融合 | 生成对抗网络（GAN），双向长短期记忆网络（BiLSTM），卷积神经网络（CNN） | 序列数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 710 | 2024-12-18 |
Cutting-edge developments in plastic biodegradation and upcycling via engineering approaches
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00256
PMID:39687771
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综述 | 本文综述了通过工程方法促进塑料降解和升级回收的最新进展 | 本文介绍了通过合成生物学和代谢工程构建高性能微生物和酶用于塑料去除和生物升级回收的创新方法 | 本文主要集中在工程方法的综述，未提供具体的实验数据或案例研究 | 探讨通过工程方法促进塑料降解和升级回收的潜力，并展望可持续循环塑料经济的发展 | 塑料降解和升级回收的微生物、酶及其应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 711 | 2024-12-18 |
Positions of cysteine residues reveal local clusters and hidden relationships to Sequons and Transmembrane domains in Human proteins
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77056-8
PMID:39468182
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研究论文 | 本文研究了人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 发现了半胱氨酸残基在蛋白质中的频率与长度相关，并且CC间隙的频率可以作为区分具有特殊结构和功能的蛋白质的分类器 | 讨论了计算预测中缺乏的蛋白质结构动力学，但未提供具体的改进方法 | 研究人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 人类蛋白质中的半胱氨酸残基、N-糖基化位点和跨膜结构域 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | 整个人类蛋白质组 |
| 712 | 2024-12-18 |
Engineered bacteria that self-assemble "bioglass" polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597164
PMID:38895271
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法，利用细菌自组装形成生物玻璃多硅酸盐涂层，展示了增强的光聚焦能力 | 本文创新性地利用细菌表达来自海生海绵的硅酸盐生物矿化酶silicatein，使其自组装形成生物玻璃涂层，并展示了比未修饰细菌更强的光聚焦能力 | NA | 开发环境友好且具有可调结构特性的活体微透镜，并探索其在光学和光子技术中的应用潜力 | 表达silicatein酶的工程细菌及其自组装的生物玻璃涂层 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 713 | 2024-12-18 |
In vitro generation of genetic diversity for directed evolution by error-prone artificial DNA synthesis
2024-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06340-0
PMID:38789612
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研究论文 | 本文介绍了一种通过易错人工DNA合成（epADS）在体外生成遗传多样性的方法，用于定向进化的应用 | 提出了通过易错人工DNA合成（epADS）生成遗传多样性的新方法，丰富了定向进化的工具箱 | NA | 探索在合成生物学中用于定向进化的遗传多样性生成方法 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物对卡贝西林的耐受性 | 合成生物学 | NA | 易错人工DNA合成（epADS） | NA | DNA序列 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物样本 |
| 714 | 2024-12-17 |
Synthetic biology approaches to improve tolerance of inhibitors in lignocellulosic hydrolysates
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108477
PMID:39551454
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性 | 本文提出了多种合成生物学策略，包括氧化还原平衡、膜工程、组学引导技术、保护剂和转录因子的表达、非理性工程、细胞絮凝和其他新技术，以提高微生物的耐受性 | 本文未详细讨论具体的技术实现细节和实验验证结果 | 提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性，促进可持续发展和工业生产 | 木质纤维素水解液中的抑制剂和微生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分子生物学、高通量测序、人工智能 | NA | NA | NA |
| 715 | 2024-12-17 |
Perspectives of cyanobacterial cell factories
2024-Dec, Photosynthesis research
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s11120-023-01056-4
PMID:37966575
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综述 | 本文综述了蓝藻作为细胞工厂在生产异戊二烯和高价值蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 强调了蓝藻在特殊化学品和蛋白质生产中的挑战与前景，特别是异戊二烯产品和生物制药蛋白质 | 未提及具体的技术限制或实验挑战 | 探讨蓝藻在生产有用化学品和蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 蓝藻、异戊二烯、高价值蛋白质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 716 | 2024-12-17 |
Synthetic Biology Toolbox for Nitrogen-Fixing Soil Microbes
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00414
PMID:37988619
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研究论文 | 本文验证了在三种固氮土壤细菌中合成生物学工具箱的有效性 | 开发了适用于非模式微生物的合成生物学工具箱，并成功应用于固氮土壤细菌中，实现了基因编辑和异源基因的表达 | 研究仅限于三种固氮土壤细菌，尚未广泛应用于其他微生物 | 开发和验证适用于非模式微生物的合成生物学工具箱，以增强农业作物的性能 | 三种固氮土壤细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 三种固氮土壤细菌 |
| 717 | 2024-12-16 |
Chemically Driven Division of Protocells by Membrane Budding
2024-Dec-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c08226
PMID:39603809
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研究论文 | 本研究探讨了通过化学能量驱动的膜出芽机制实现原细胞分裂的过程 | 本研究首次展示了通过化学燃料驱动简单脂肪酸基囊泡出芽分裂的机制，类似于现有生命的分裂方式，为原细胞自主复制提供了新的可能性 | 本研究主要集中在实验室条件下的小规模实验，尚未在大规模或自然环境中验证其可行性 | 探索原细胞分裂的机制，并为合成细胞的发展提供基础 | 脂肪酸基囊泡及其在化学能量驱动下的分裂行为 | NA | NA | NA | NA | NA | 不同脂肪酸基囊泡的多种样本 |
| 718 | 2024-12-16 |
Harnessing microbes to pioneer environmental biophotoelectrochemistry
2024-Dec, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.005
PMID:39095256
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综述 | 本文综述了微生物生物光电化学系统（BPEC）在环境可持续性策略中的应用 | 强调了从传统生物能源系统向复杂BPEC应用的转变，并展示了其在利用太阳能进行重要生化转化方面的潜力 | 讨论了环境BPEC系统在性能改进和未来应用方面的挑战 | 探讨微生物生物光电化学系统在环境可持续性中的应用 | 微生物生物光电化学系统及其在碳氮固定、污染物降解和废水能源回收中的应用 | NA | NA | 微生物生物光电化学（BPEC） | NA | NA | NA |
| 719 | 2024-12-16 |
Reconstitution of the Mevalonate Pathway for Improvement of Isoprenoid Production and Industrial Applicability in Escherichia coli
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2408.08053
PMID:39467704
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研究论文 | 本文通过在Escherichia coli中重构甲羟戊酸（MVA）途径，提高了异戊二烯类化合物的生产及其工业应用性 | 引入了来自生物安全等级1（BSL 1）生物体的新基因组合，重构了MVA途径，并显著提高了类胡萝卜素和番茄红素的产量及细胞特异性生产力 | 未提及具体的局限性 | 通过代谢工程和合成生物学策略，提高微生物生产高附加值异戊二烯类化合物的能力 | Escherichia coli中的异戊二烯类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
| 720 | 2024-12-16 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-Nov-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法从头构建功能性微生物生态系统的策略 | 提出了一个更全面的设计-构建-测试-学习流程，用于设计和优化微生物生态系统 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 总结和推进基于不同调控电路的微生物生态系统构建策略 | 微生物生态系统中的种内和种间相互作用及正交调控模块 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |