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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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701 | 2025-06-12 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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research paper | 该论文介绍了一种基于拉曼流式细胞术的无标记高通量活细胞分选技术,用于代谢特征的基因组范围随机诱变库筛选 | 提出了一种新型的pDEP-DLD-RACS技术,能够以高精度、高通量和高效率分选代谢特征突变的活细胞,相比传统方法具有显著的时间和成本优势 | NA | 开发高效筛选代谢特征突变细胞的技术平台 | 产色素和油脂的酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术(RACS), 正介电泳诱导确定性横向位移(pDEP-DLD) | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机诱变库中超过10^7个酵母突变体 |
702 | 2025-06-12 |
Toehold Switch-Based Approach for Engineering Acid-Tolerance Modules to Enhance Production Robustness of Industrial E. coli Strains at Low pH
2025-Jun, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70175
PMID:40485106
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研究论文 | 本研究提出了一种基于toehold switch的合成生物学方法,用于增强工业大肠杆菌菌株在低pH条件下的酸耐受性 | 利用toehold switch构建酸耐受模块,整合多种酸响应启动子和抗酸基因,显著提高工业菌株在低pH条件下的生产稳定性 | 研究仅针对特定工业赖氨酸生产菌株,未验证在其他工业菌株中的普适性 | 提高工业微生物的酸耐受性以增强发酵效率和可持续性 | 工业大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | toehold switch技术 | NA | 基因表达数据 | 约10个构建模块,包含4种酸响应启动子和18个抗酸基因 |
703 | 2025-06-12 |
A comprehensive review on electrically modulated transport of soft, multiphase systems in microflow: Perspectives on drops and vesicles
2025-May, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0254950
PMID:40488123
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综述 | 本文综述了微流控系统中软物质和多相系统(如液滴和囊泡)在电场调控下的传输动力学 | 系统地研究了电场强度、流体特性和膜特性对软物质传输动力学的耦合影响,并探讨了囊泡与简单液滴在电动力学行为上的独特差异 | 存在稳定性、可扩展性和可重复性等挑战 | 研究电场调控下软物质和多相系统在微流控系统中的传输行为 | 液滴和囊泡 | 微流控 | NA | 高精度成像、微操作和复杂计算建模 | NA | NA | NA |
704 | 2025-06-12 |
Intranodal injection of neoantigen-bearing engineered Lactococcus lactis triggers epitope spreading and systemic tumor regressions
2025-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.02.041
PMID:40486831
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research paper | 该研究开发了一种携带新抗原的工程化乳酸乳球菌(Ag-FOLactis),通过淋巴结注射触发表位扩散和系统性肿瘤消退 | 利用Plug-and-Display系统在FOLactis表面展示肿瘤抗原,显著增强树突状细胞呈递和新抗原特异性细胞免疫,诱导局部反应性T细胞数量增加45倍并引发表位扩散 | NA | 开发一种基于益生菌的个性化肿瘤免疫治疗平台 | 工程化乳酸乳球菌(FOLactis)及其携带的新抗原肽(Ag-FOLactis) | 免疫治疗 | 肿瘤 | Plug-and-Display系统 | 皮下和转移性肿瘤模型 | NA | NA |
705 | 2025-06-12 |
Engineering the future of medicine: Natural products, synthetic biology and artificial intelligence for next-generation therapeutics
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70146
PMID:39856487
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research paper | 探讨利用天然产物、合成生物学和人工智能技术开发下一代治疗方法 | 结合eXchange Unit between Thiolation domains方法和AI驱动工具(如Synthetic Intelligence)改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程,创造新型生物活性化合物 | NA | 解决抗生素耐药性和癌症等关键挑战,扩展化学空间并优化生物合成途径 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶工程 | synthetic biology, artificial intelligence | antibiotic resistance, cancer | eXchange Unit between Thiolation domains approach, Synthetic Intelligence | NA | NA | NA |
706 | 2025-06-12 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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research paper | 该研究利用合成生物学方法开发了一种能够自组装生物玻璃聚硅酸盐涂层的工程细菌,这种细菌能够增强光的聚焦 | 通过工程化细菌表达硅酸盐生物矿化酶,使其能够自组装聚硅酸盐外壳,形成具有可调结构特性的活体微透镜,其光聚焦能力比未修饰细菌强近一个数量级 | NA | 开发一种环境友好、具有可调结构特性的活体微透镜,用于光聚焦和操纵 | 工程化细菌及其自组装的聚硅酸盐外壳 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
707 | 2025-06-11 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台,用于在大肠杆菌中实现模块化和信号响应的转录调控 | 整合了转录因子生物传感器与FnCas12a CRISPR系统,利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应的mRNA转录物处理crRNA,实现了精确的信号依赖性转录调控 | NA | 克服现有转录调控工具的局限性,扩展合成生物学中转录调控工具的功能 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a CRISPR系统 | NA | NA | NA |
708 | 2025-06-11 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
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研究论文 | 本研究展示了在Komagataella phaffii中通过T7 RNAP/CRISPRa系统构建合成遗传电路的潜力 | 利用T7转录系统有效表达sgRNA,并通过插入tRNA序列增强转录激活效率,设计了能进行布尔逻辑运算的基因电路 | NA | 探索在工业Komagataella phaffii菌株中构建基因调控工具包 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa, T7转录系统, Tet-on诱导系统, split-T7系统, HH-HDV RNA切割处理 | NA | NA | NA |
709 | 2025-06-11 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
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review | 本文系统总结了碱基编辑技术的发展历史、最新进展及其在工业微生物构建中的应用 | 全面概述了多种主要碱基编辑器(如CBEs、ABEs、CRISPR-free碱基编辑器等)及其优化策略,并探讨了其在工业微生物构建中的应用 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 工业微生物(如枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒状杆菌、酿酒酵母等) | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术(如CBEs、ABEs、CGBEs等) | NA | NA | NA |
710 | 2025-06-11 |
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204920
PMID:40493005
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研究论文 | 该研究介绍了一套小分子和细胞接触诱导系统,用于控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 | 开发了新的小分子和细胞接触诱导系统,用于模拟发育过程 | NA | 研究发育生物学的原理 | 小鼠胚胎干细胞 | 合成生物学 | NA | 小分子和细胞接触诱导系统 | NA | NA | NA |
711 | 2025-06-11 |
Harnessing iron‑sulfur enzymes for synthetic biology
2024-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2024.119718
PMID:38574823
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综述 | 本文探讨了利用铁硫(Fe-S)酶进行合成生物学的核心挑战及解决方案 | 总结了Fe-S酶在工程代谢途径中的三个核心挑战,并提出了克服这些挑战的方法 | 尚未实现工业规模应用,仍处于研究阶段 | 开发工业级Fe-S酶依赖的生物合成途径 | 铁硫(Fe-S)酶及其在生物合成途径中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白结构预测与设计 | NA | NA | NA |
712 | 2025-06-10 |
Dynamical mechanisms of growth-feedback effects on adaptive gene circuits
2025-Jun-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89170
PMID:40470804
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研究论文 | 本文研究了工程基因电路在宿主细胞中的动态机制,特别是生长反馈对电路性能的影响 | 系统研究了400多种拓扑结构,揭示了电路失败的三种动态机制,并发现了一种电路鲁棒性度量与生长反馈强度之间的比例关系 | 研究主要基于计算模拟,需要进一步的实验验证 | 理解基因电路与宿主细胞间的相互作用机制,特别是生长反馈对电路性能的影响 | 工程基因电路的拓扑结构和动态行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控电路 | NA | 计算模拟数据 | 400多种拓扑结构 |
713 | 2025-06-10 |
From molecular mechanisms to clinical translation: Silk fibroin-based biomaterials for next-generation wound healing
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144266
PMID:40381758
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综述 | 本文系统总结了丝素蛋白(SF)及其复合材料在伤口愈合中的制备策略、功能修饰和多维应用机制 | 整合了SF分子机制和材料设计的最新进展,并强调其在精准医学中的潜力,如开发基因工程SF用于定制免疫调节网络 | 当前SF材料开发面临的挑战包括机械稳定性、降解可控性以及大规模生产的标准化 | 开发高效、多功能且可临床转化的SF基材料用于伤口愈合 | 丝素蛋白(SF)及其复合材料 | 生物材料 | 伤口愈合 | 3D生物打印和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
714 | 2025-06-10 |
Thiotemplated Polyketide Chain Fusion and Reductive Cyclization Build the Reactive Butenolide Core of Malleicyprol
2025-May-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504485
PMID:40401345
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研究论文 | 本文揭示了Burkholderia pseudomallei病原体毒力因子malleicyprol中反应性丁烯内酯核心的生物合成机制 | 首次阐明通过两个聚酮链的头对头融合和还原环化构建丁烯内酯核心的非经典生物合成途径 | NA | 解析malleicyprol毒力因子中丁烯内酯核心的生物合成机制 | Burkholderia pseudomallei病原体的毒力因子malleicyprol | 合成生物学 | 细菌感染 | 化学合成、体外生物转化重构、突变分析、生化测定 | NA | 实验数据 | NA |
715 | 2025-06-10 |
Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies
2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04342-6
PMID:40289223
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综述 | 本文综述了利用耐盐微生物和先进技术修复盐渍土壤的创新策略 | 整合耐盐微生物与基因组编辑、合成生物学、高级组学工具及数字技术(如机器学习和AI)以优化土壤修复过程 | 需要未来研究协调这些技术和方法,以最大化植物-微生物相互作用并建立可持续农业系统 | 缓解盐分胁迫,修复盐渍土壤,保障粮食安全 | 耐盐微生物及其与植物的协同作用 | 农业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9、合成生物学、宏基因组学、宏转录组学、微生物挥发性有机化合物(mVOCs)、纳米技术 | NA | NA | NA |
716 | 2025-06-10 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-10-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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review | 本文全面综述了蛇毒研究中的尖端技术进展,重点关注蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 介绍了合成生物学和多组学方法(统称为毒液组学)在蛇毒研究中的革命性应用,为毒液功能及其治疗潜力提供了更深入的见解 | 毒素功能表征和成本效益抗蛇毒血清开发等挑战仍然存在 | 探索蛇毒的分子组成、进化驱动力及其生物医学应用潜力 | 蛇毒及其毒素 | 生物医学研究 | NA | 蛋白质组学, 基因组学, 转录组学, 生物信息学, 合成生物学, 多组学方法, 冷冻电子显微镜 | NA | 分子数据 | NA |
717 | 2025-06-10 |
Effects of growth feedback on adaptive gene circuits: A dynamical understanding
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543915
PMID:37333159
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research paper | 研究工程基因回路在宿主细胞中整合时,由于回路与宿主相互作用(如生长反馈)导致的动态失败机制及其拓扑结构的韧性 | 系统地研究了四百多种拓扑结构,识别了三类回路失败的动态机制,并发现了一种回路稳健性度量与生长反馈强度之间的比例关系 | 仅关注了转录调控回路中的适应性问题,未涉及其他类型的基因回路或更复杂的宿主环境 | 理解工程基因回路在宿主细胞中整合时的动态行为,识别对生长反馈具有韧性的拓扑结构 | 工程基因回路及其在宿主细胞中的整合 | synthetic biology | NA | transcriptional regulation circuits | NA | NA | over four hundred topological structures |
718 | 2025-06-10 |
Protocol for in vitro phospholipid synthesis combining fatty acid synthesis and cell-free gene expression
2024-06-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.103051
PMID:38700978
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研究论文 | 本文提出了一种体外合成和定量磷脂的协议 | 结合脂肪酸合成和无细胞基因表达系统在体外合成磷脂 | 未提及该协议在不同条件下的适用性或效率问题 | 开发一种体外合成和定量磷脂的方法 | 磷脂 | 合成生物学 | NA | 液相色谱-质谱联用技术(LC-MS) | NA | NA | NA |
719 | 2025-06-09 |
Biotechnological approaches for the production of neuroactive huperzine A
2025-Aug, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.04.020
PMID:40311807
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综述 | 本文综述了石杉碱甲(HupA)的神经保护特性及其在治疗神经退行性疾病中的潜力,并探讨了提高HupA产量的生物技术策略 | 强调了HupA在神经退行性疾病治疗中的多靶点潜力,并讨论了通过生物技术方法提高HupA产量的最新进展 | HupA生物合成途径中的知识空白仍需填补,以实现经济高效且可持续的生产方法 | 探讨HupA的神经保护作用及其在神经退行性疾病治疗中的应用,以及提高其产量的生物技术策略 | 石杉碱甲(HupA)及其在神经退行性疾病治疗中的应用 | 生物技术 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化症、癫痫、重症肌无力 | 化学合成、微生物发酵、植物组织培养、合成生物学 | NA | 文献调查数据(体外、体内及临床研究数据) | NA |
720 | 2025-06-09 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路,用于在原始细胞与活细胞群落中实现自我调节的双向通信 | 开发了一种包含识别模块、激活模块和反馈模块的DNA电路,使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号来自主调节与活细胞的相互作用 | NA | 开发合成生物学工具以控制细胞间信号传导,从而编程所需的细胞行为 | 原始细胞与活细胞群落的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |