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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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721 | 2024-12-16 |
Landscape of human organoids: Ideal model in clinics and research
2024-May-06, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100620
PMID:38706954
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综述 | 本文综述了人类类器官领域的现状和未来发展趋势,涵盖了其在临床和研究中的应用 | 本文首次提供了对类器官领域全面且准确的概述,结合了学术研究、工业应用和临床实践的经验 | 本文主要为综述性质,未涉及具体的实验数据或技术细节 | 旨在填补类器官领域缺乏全面概述的空白,并为研究人员、临床医生和患者提供有价值的见解 | 类器官技术及其在个性化医疗、肿瘤学、药物发现等领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
722 | 2024-12-16 |
Proteins from an unevolved library of de novo designed sequences bind a range of small molecules
2012-Apr-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb200018e
PMID:23651114
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研究论文 | 本文研究了从非进化的新设计序列库中获得的蛋白质与一系列小分子结合的能力 | 本文首次展示了非进化的新设计蛋白质能够自发地与小分子结合,表明这种能力并非仅通过生物选择或计算设计产生 | 本文仅研究了三种新设计蛋白质与小分子的结合能力,样本量较小 | 探讨新设计蛋白质是否具有与小分子结合的能力,以及这种能力是否仅通过生物选择或计算设计产生 | 从非进化的新设计序列库中获得的蛋白质与小分子的结合能力 | 合成生物学 | NA | 小分子微阵列 | NA | 蛋白质序列 | 三种新设计蛋白质,筛选了10,000种化合物 |
723 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
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综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展,并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品,以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
724 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中,并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验,未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 |
725 | 2024-12-15 |
Advances and challenges in synthetic biology for mosquito control
2024-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2023.11.001
PMID:38000957
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综述 | 本文综述了利用合成生物学控制蚊媒疾病的现状、未来目标以及基因编辑在全球健康防御中的重要性 | 探讨了利用合成生物学增强蚊子对病原体的抵抗力或消除蚊媒的创新方法 | 未具体讨论合成生物学方法的实际应用效果或局限性 | 探讨利用合成生物学控制蚊媒疾病的创新方法及其在全球健康防御中的重要性 | 蚊媒疾病及其传播媒介蚊子 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
726 | 2024-12-14 |
A colorimetric biosensor composed of split aptamers and mannan oligosaccharide nanozyme to monitor synthetic His-tagged food biomolecules
2025-Feb-28, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2024.142108
PMID:39612832
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研究论文 | 本文开发了一种基于分裂适配体和甘露聚糖低聚糖纳米酶的比色生物传感器,用于监测合成His标签食品生物分子 | 提出了生成高亲和力分裂适配体的策略,并开发了一种新型的比色生物传感器 | NA | 开发一种用于监测合成His标签食品生物分子的分析方法 | His标签、His标签蛋白和His标签肽 | 生物传感器 | NA | 比色法 | NA | 生物分子 | NA |
727 | 2024-12-14 |
Herbal Multiomics Provide Insights into Gene Discovery and Bioproduction of Triterpenoids by Engineered Microbes
2024-Dec-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c08372
PMID:39666531
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综述 | 本文综述了通过多组学技术揭示三萜类化合物生物合成途径及其在工程微生物中的异源生产的研究进展 | 本文介绍了通过多组学技术在药用植物中识别新的三萜类化合物生物合成途径,并讨论了代谢工程策略以提高底盘细胞中三萜类化合物的生产水平 | NA | 探讨三萜类化合物生物合成途径及其在工程微生物中的生产 | 三萜类化合物及其生物合成途径 | 代谢工程 | NA | 多组学技术 | NA | NA | NA |
728 | 2024-12-14 |
Genetically Engineered Liposwitch-Based Nanomaterials
2024-Dec-09, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.4c01388
PMID:39495202
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研究论文 | 本文探讨了使用基因工程脂开关调控无序蛋白驱动的纳米组装 | 提出了“脂开关”概念,通过结合别构效应和翻译后修饰来调控融合蛋白的组装 | NA | 开发一种新的策略来控制无序蛋白驱动的纳米组装 | 无序蛋白和球状蛋白的融合纳米材料 | 合成生物学 | NA | 动态光散射、冷冻透射电子显微镜 | NA | 蛋白质 | NA |
729 | 2024-12-14 |
Towards AI-designed genomes using a variational autoencoder
2024-Dec, Proceedings. Biological sciences
DOI:10.1098/rspb.2024.1457
PMID:39657811
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研究论文 | 本文开发了一个概念验证框架,利用变分自编码器训练机器学习算法来建模细菌基因组组成 | 提出了DeepGenomeVector模型,能够有效捕捉基因组网络中的复杂依赖关系,并通过定性和定量指标验证了其性能 | 本文仅展示了概念验证,尚未实现AI设计完整基因组的能力 | 探索机器学习在合成生物学中的应用,展示AI设计基因组的可能性 | 细菌基因组及其编码的基因网络 | 机器学习 | NA | 变分自编码器 | 变分自编码器 | 基因组数据 | NA |
730 | 2024-12-14 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-Dec, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
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研究论文 | 研究从蟾蜍中鉴定出的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的底物多样性和特异性 | 通过分子对接和关键氨基酸突变,解释了这些酶的底物多样性和特异性机制 | NA | 探讨蟾蜍中吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶的催化机制 | 蟾蜍中的七种吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶 | 生物化学 | NA | 分子对接,氨基酸突变 | NA | 蛋白质 | 七种酶 |
731 | 2024-12-13 |
Harnessing the polysaccharide production potential to optimize and expand the application of probiotics
2025-Feb-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2024.122951
PMID:39643409
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综述 | 本文综述了利用益生菌生产多糖的潜力,优化和扩展其在食品、制药和医疗领域的应用 | 本文总结了益生菌底盘和用于多糖生产的遗传工具,并介绍了通过调整代谢途径和整合表达元件来制备高产、可控分子量或非天然多糖的策略 | NA | 探讨益生菌在多糖生产中的潜力及其在工业和生物医学领域的应用 | 益生菌及其多糖生产机制 | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
732 | 2024-12-13 |
Network for knowledge Organization (NEKO): An AI knowledge mining workflow for synthetic biology research
2025-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2024.11.006
PMID:39580108
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研究论文 | 介绍了一种名为NEKO的工作流程,利用大型语言模型Qwen从科学文献中提取知识,生成知识图谱并提供全面的文献总结 | NEKO增强了大型语言模型的能力,提供更具体、可操作的知识,并支持灵活的本地部署,使科学基础模型更易于访问 | NA | 开发一种能够从科学文献中提取知识并生成知识图谱的工作流程,以增强大型语言模型的能力 | 科学文献中的知识提取和知识图谱生成 | 机器学习 | NA | 大型语言模型(LLM) | LLM Qwen | 文本 | NA |
733 | 2024-12-13 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-Dec-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
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研究论文 | 本文研究了诱导型双稳态系统中命运决定的动态过程 | 本文提出了稳态参数决定命运决定景观的观点,并强调了动态过程在命运决定中的重要性 | 本文主要关注理论模型,未涉及实验验证 | 探讨基因调控网络中命运决定的动态过程 | 诱导型双稳态系统中的命运决定过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
734 | 2024-12-13 |
Multiplex Expression Cassette Assembly: A flexible and versatile method for building complex genetic circuits in conventional vectors
2024-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14454
PMID:39175411
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Multiplex Expression Cassette Assembly (MECA)的方法,用于在常规载体中构建复杂的遗传电路 | MECA方法通过修改与Golden Gate Assembly兼容的载体,使用嵌入连接语法的引物放大功能元件,能够在不需要专用载体和标准化模块库的情况下,通过两轮Golden Gate组装反应构建复杂结构 | NA | 开发一种灵活且通用的方法来构建复杂的遗传电路,以在合成生物学中实现多种功能,并在作物育种中提高生产力和整体性能 | 复杂的遗传电路构建,以及在烟草和番茄中的基因编辑和代谢产物生产 | 合成生物学 | NA | Golden Gate Assembly | NA | NA | 涉及烟草、番茄和Escherichia coli等多种植物和微生物样本 |
735 | 2024-12-13 |
Securing Commercial Nucleic Acid Synthesis
2024-Dec, Rand health quarterly
PMID:39664983
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综述 | 本文综述了商业核酸合成的安全问题,评估了当前的筛查状态,并提出了加强筛查的建议 | 本文提出了加强商业核酸合成筛查的建议,扩展并强化了政府沟通、行业联盟规则和最佳实践 | 本文主要基于现有文献和政策建议,缺乏实证研究 | 评估当前商业基因合成筛查的现状,并提出加强筛查的建议 | 商业核酸合成的安全问题 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
736 | 2024-12-13 |
Harnessing regulatory networks in Actinobacteria for natural product discovery
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae011
PMID:38569653
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综述 | 本文综述了放线菌中调控网络在天然产物发现中的应用 | 提出了基于调控指导的基因组挖掘方法,以激活生物合成基因簇(BGCs)的表达,并优先选择特定BGCs进行表达 | 当前随机筛选生物活性化合物的投资回报率低,且难以预测哪些BGCs应优先考虑 | 探讨如何优先选择和激活放线菌中的生物合成基因簇,以促进天然产物的发现 | 放线菌中的生物合成基因簇及其调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
737 | 2024-12-13 |
Expanding the synthetic biology toolbox of Cupriavidus necator for establishing fatty acid production
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae008
PMID:38366943
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研究论文 | 本文开发并优化了Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱,以促进脂肪酸生产 | 验证并表征了一组诱导性和组成性启动子,设计并测试了RBS库,研究了密码子优化对基因表达的影响 | 仍需克服一些障碍,使C. necator广泛用于生物合成过程 | 开发和优化Cupriavidus necator的基因表达和基因组工程工具箱 | Cupriavidus necator中的启动子、RBS和密码子优化 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | 基因表达数据 | 一组诱导性和组成性启动子,一个RBS库,gfp和mCherry基因的密码子优化变体 |
738 | 2024-12-13 |
Using Euf1 transcription factor as a titrator of erythritol-inducible promoters in Yarrowia lipolytica; insight into the structure, splicing, and regulation mechanism
2024-Jan-09, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foae027
PMID:39169472
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研究论文 | 本研究使用Euf1转录因子作为调节因子,探索其在Yarrowia lipolytica中对赤藓糖醇诱导型启动子的调控机制 | 通过使用Euf1转录因子作为启动子调节因子,扩展了合成启动子的可调性,并提出了Euf1调控启动子作用的新机制 | 研究中Euf1的过表达导致启动子的赤藓糖醇诱导特性丧失 | 探索合成生物学中可控调节元件的调控机制 | Euf1转录因子及其在Yarrowia lipolytica中的调控作用 | 合成生物学 | NA | 转录因子调控 | NA | 转录组数据 | NA |
739 | 2024-12-13 |
Metabolic engineering for the production of plant isoquinoline alkaloids
2016-06, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12494
PMID:26503307
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研究论文 | 本文综述了通过代谢工程提高植物异喹啉生物碱(PIA)生产的研究进展 | 利用系统生物学和合成生物学方法,通过代谢工程和异源微生物培养提高PIA的生产 | 目前对PIA代谢途径的了解有限,限制了生产改进的努力 | 提高植物异喹啉生物碱的生产 | 植物异喹啉生物碱及其代谢途径 | 生物化学 | NA | 下一代测序技术,高通量蛋白质组学和代谢组学分析,生物信息学 | NA | 代谢数据 | NA |
740 | 2024-12-13 |
Transcript profiling of jasmonate-elicited Taxus cells reveals a β-phenylalanine-CoA ligase
2016-Jan, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.12359
PMID:25899320
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研究论文 | 研究通过cDNA-AFLP技术分析茉莉酸诱导的紫杉细胞转录组,揭示了与紫杉醇侧链合成相关的β-苯丙氨酸-CoA连接酶基因 | 首次鉴定了与紫杉醇侧链合成相关的TB768基因,并验证了其在紫杉醇生物合成途径中的功能 | 研究主要集中在细胞培养水平,尚未在植物体内验证该基因的功能 | 揭示紫杉醇生物合成途径中未知步骤的相关基因 | 茉莉酸诱导的紫杉细胞及紫杉醇生物合成途径 | 代谢工程 | 癌症 | cDNA-AFLP | NA | 基因表达数据 | 紫杉细胞培养物 |