合成生物学相关文章
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当前共找到 4708 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-01-17 |
Advances in Machine Learning Models for Predicting Enzyme Kinetic Parameters
2026-Jan-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02428
PMID:41406463
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综述 | 本文综述了机器学习模型在预测酶动力学参数方面的最新进展，包括全局和局部模型的应用 | 通过机器学习模型替代传统实验和计算方法，提高酶动力学参数预测的效率和准确性，并应用于酶工程和代谢建模 | 数据稀缺是主要限制，但可通过高通量数据生成和半监督学习等新兴机会来克服 | 利用机器学习提升酶动力学参数预测的性能、鲁棒性和范围，以准确注释蛋白质序列的目标功能 | 酶动力学参数（如Km、Vmax、kcat/Km） | 机器学习 | NA | 机器学习 | NA | 蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 722 | 2026-01-17 |
Oral live microbial therapeutics: A synthetic biology roadmap toward durable oral microbiome-based therapies
2026-Jan-09, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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综述 | 本文是一篇关于口服活微生物疗法（LMTs）的叙述性综述，旨在通过整合临床证据和工程学原理，为开发持久有效的口腔微生物疗法提供合成生物学路线图 | 将合成生物学工程工具（如粘附载体、多层生物防护和逻辑门控/CRISPR杀灭开关）系统性地应用于口腔LMTs的开发，并提出了一个包含定植曲线下面积、表观半衰期等指标的位点解析测量框架，以量化微生物在口腔内的持久性 | 这是一篇叙述性综述，而非原始研究，其结论基于现有文献的综合分析，可能受到已发表研究偏倚和异质性的限制；此外，文中提出的工程策略大多处于概念或早期开发阶段，尚未经过大规模临床验证 | 为开发持久、安全的口服活微生物疗法提供合成生物学指导框架，并推动临床转化 | 口服活微生物疗法（LMTs）及其在口腔疾病（如口臭、龋齿、牙周病）中的应用 | 合成生物学 | 口腔疾病（包括口臭、龋齿、牙周病） | NA | NA | NA | NA | CRISPR, 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计 | NA | 逻辑门控杀灭开关, 合成营养缺陷型设计, 多层生物防护系统 | 医学 |
| 723 | 2026-01-17 |
Rewiring central metabolism in Komagataella phaffii for efficient mannose synthesis
2025-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02886-8
PMID:41366679
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，优化其中心代谢途径，实现了高效甘露糖合成 | 采用双碳源系统（甘油用于生物质生成，葡萄糖用于甘露糖合成），通过敲除和下调关键基因（如pfk2、pfk1、zwf1）来重定向碳通量，并过表达大肠杆菌来源的磷酸酶基因yniC以促进甘露糖生物合成，最终在发酵中达到约121.1 g/L的甘露糖产量，创下微生物发酵的最高纪录 | NA | 通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，实现高效甘露糖生产 | Komagataella phaffii酵母及其甘露糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因敲除、基因下调、过表达、高细胞密度补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 甘露糖生物合成途径的重构，包括碳通量重定向至果糖-6-磷酸积累、抑制副产物生成 | 工业生物技术 |
| 724 | 2026-01-17 |
[A review of security, safety, and duality issues in the field of biology]
2025-Nov-18, Comptes rendus biologies
IF:0.7Q4
DOI:10.5802/crbiol.188
PMID:41251134
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综述 | 本文综述了生物学领域中的安全、安保及双重用途问题，并评估了法国为限制这些风险所采取的措施 | 在当前生物研究繁荣和地缘政治不稳定的背景下，系统性地审视了生物风险，特别是结合合成生物学和测序技术发展带来的新挑战 | NA | 评估生物学研究中可接受的风险，平衡研究对健康、环境和生活质量的重要性与安全、安保及双重用途问题的考量 | 生物学研究中的安全、安保及双重用途问题，以及法国的风险管理措施 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 725 | 2026-01-17 |
Active learning of enhancers and silencers in the developing neural retina
2025-Jan-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2024.12.004
PMID:39778579
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研究论文 | 本文开发了一种主动学习方法，用于训练能够区分由光感受器转录因子CRX结合位点组成的增强子和沉默子的模型 | 结合合成生物学和不确定性采样，通过多轮大规模平行报告基因检测迭代训练模型，解决了传统模型无法解释同一转录因子在不同背景下激活或抑制转录的问题 | NA | 开发能够区分具有相同序列但相反功能的CRX结合位点的调控DNA模型 | 光感受器转录因子CRX的结合位点 | 机器学习 | NA | 大规模平行报告基因检测 | 深度学习模型 | 基因组序列 | 基因组中几乎所有结合的CRX位点 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 726 | 2026-01-17 |
Harnessing microbes to pioneer environmental biophotoelectrochemistry
2024-12, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.005
PMID:39095256
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综述 | 本文综述了微生物生物光电化学系统在环境可持续性策略中的应用，强调其从传统生物能源系统向高级应用的转变 | 强调了从传统生物能源系统向复杂BPEC应用的转变，利用太阳能进行生化转化，并整合系统设计与合成生物学以扩展环境清洁和能源生成潜力 | NA | 探索微生物生物光电化学系统在环境可持续策略中的应用，包括碳氮固定、污染物降解和废水能源回收 | 微生物生物光电化学系统及其在环境修复和能源生成中的应用 | NA | NA | 微生物生物光电化学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 环境, 能源 |
| 727 | 2026-01-17 |
Ogataea polymorpha as a next-generation chassis for industrial biotechnology
2024-11, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.007
PMID:38622041
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综述 | 本文综述了Ogataea polymorpha作为下一代工业生物技术底盘菌株的独特特性、合成生物学工具开发、化学品生产进展及系统生物学研究 | 将O. polymorpha定位为基于甲醇原料的下一代生物制造平台，并系统整合了其合成生物学工具与代谢工程进展 | NA | 评估O. polymorpha作为工业生物技术底盘菌株的潜力与应用前景 | Ogataea polymorpha酵母菌及其合成生物学工具 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具（未具体说明） | Ogataea polymorpha（汉逊酵母） | 细胞代谢网络重编程 | 工业生物技术 |
| 728 | 2026-01-17 |
Killer yeasts: expanding frontiers in the age of synthetic biology
2024-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.03.003
PMID:38575438
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综述 | 本文探讨了合成生物学技术如何推动酵母杀手系统在抗真菌耐药性和粮食安全等领域的应用潜力 | 提出利用合成生物学技术改造酵母杀手毒素及其来源的dsRNA真菌病毒，以开发新型抗真菌工具和生物技术平台 | NA | 探讨合成生物学技术对酵母杀手系统生物技术应用的推动作用 | 酵母杀手毒素及其来源的双链RNA真菌病毒 | 合成生物学 | 真菌感染 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 医药, 农业, 食品 |
| 729 | 2026-01-17 |
Measuring the economic efficiency of laboratory automation in biotechnology
2024-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.001
PMID:38402137
|
研究论文 | 本文提出实验价格指数（EPI）来量化比较时间、成本和样本数量等因素，以衡量实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的效率 | 引入实验价格指数（EPI）作为量化工具，首次系统评估实验室自动化在合成生物学中的经济影响 | 未提供具体实验数据或案例研究来验证EPI的实用性，且可能未考虑所有影响经济效率的因素 | 评估实验室自动化在合成生物学和生物分子工程中的经济效率 | 实验室自动化过程，包括时间、成本和样本数量等经济因素 | NA | NA | 实验室自动化与机器人辅助过程 | NA | 经济数据（时间、成本、样本数量） | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 730 | 2026-01-17 |
Transforming drug development with synthetic biology and AI
2024-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.008
PMID:38383215
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综述 | 本文探讨了合成生物学和人工智能如何共同变革药物开发过程 | 结合合成生物学和AI技术，以应对药物候选物识别中的挑战，特别是在RNA平台药物开发领域 | NA | 利用合成生物学和AI技术革新药物开发流程 | 药物候选物识别，特别是基于RNA平台的药物开发 | 机器学习 | NA | NA | AI模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 731 | 2026-01-17 |
Reduction-to-synthesis: the dominant approach to genome-scale synthetic biology
2024-08, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.02.008
PMID:38423803
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综述 | 本文综述了基因组规模合成生物学中自上而下缩减和自下而上合成的双轨方法，重点讨论了基于工业菌株构建缩减基因组及其在生物技术应用中的潜力 | 提出了缩减至合成的主导方法，并整合了自上而下缩减和自下而上合成的双轨策略，以构建合成表型用于生物技术应用 | NA | 探讨缩减基因组的构建方法及其在生物技术中的应用前景 | 细菌基因组，特别是工业常用菌株的缩减基因组 | 合成生物学 | NA | 基因组缩减与合成技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌，包括工业菌株 | NA | 工业生物技术 |
| 732 | 2026-01-17 |
Context-dependent redesign of robust synthetic gene circuits
2024-07, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.01.003
PMID:38320912
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综述 | 本文综述了合成基因电路在细胞环境中的上下文依赖性性能，以及如何通过宿主感知和资源感知设计来减轻不良影响 | 强调了新兴的电路-宿主相互作用（如生长反馈和资源竞争）对电路行为的影响，并总结了最新的控制策略 | NA | 理解合成基因电路与宿主细胞之间的复杂关系，并设计策略以优化电路性能 | 合成基因电路及其在细胞宿主中的行为 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细胞（泛指，未指定具体生物体） | 合成基因电路，包括逻辑门、振荡器等，但未详细描述具体设计 | 工业生物技术 |
| 733 | 2026-01-17 |
Expanding the structural diversity of terpenes by synthetic biology approaches
2024-06, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.12.006
PMID:38233232
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法扩展萜类化合物结构多样性的策略，包括组合生物合成、化学生物学合成和人工金属酶技术 | 系统探索了利用非经典构建模块（如MVA途径与C-甲基转移酶共表达或LMVA途径）以及化学生物学方法（如FPP类似物和人工金属酶环丙烷化）来创造非天然萜类化合物 | NA | 扩展萜类化合物的结构多样性，以增加其生物活性和应用潜力 | 萜类化合物及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 组合生物合成、化学生物学合成、人工金属酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌、酿酒酵母、枯草芽孢杆菌 | 代谢途径（如MVA途径、LMVA途径）、生物传感器 | 医药、农业、工业生物技术 |
| 734 | 2026-01-17 |
Synthetic biology for Taxol biosynthesis and sustainable production
2024-06, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.04.001
PMID:38609783
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综述 | 本文综述了紫杉醇生物合成途径的最新进展，特别是氧杂环丁烷环形成步骤的发现，并探讨了这些发现如何通过合成生物学促进紫杉醇的可持续生产 | 揭示了紫杉醇生物合成途径中的缺失步骤，尤其是氧杂环丁烷环的形成，为代谢工程提供了关键信息 | NA | 促进紫杉醇的可持续生产 | 紫杉醇的生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 紫杉醇生物合成途径 | 医药 |
| 735 | 2026-01-17 |
Designing RNA switches for synthetic biology using inverse-RNA-folding
2024-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.11.005
PMID:38040620
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综述 | 本文探讨了如何利用逆RNA折叠技术来精确设计合成生物学中的RNA开关 | 提出将逆RNA折叠技术应用于RNA开关的精确设计，为合成生物学提供新的设计策略 | NA | 开发用于合成生物学应用的RNA开关精确设计方法 | RNA开关及其在基因表达控制中的应用 | 合成生物学 | NA | 逆RNA折叠 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA开关（配体响应型基因表达控制系统） | 医学, 工业生物技术 |
| 736 | 2026-01-17 |
Ethics and engagement: steering China's synbio future
2024-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2023.10.013
PMID:37968158
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评论 | 本文探讨了公众参与和伦理准则在中国合成生物学发展中的关键作用 | 强调公众讨论与伦理强化在合成生物学领域的互联性，以促进负责任和透明的进步 | NA | 分析公众参与和伦理指南如何塑造中国合成生物学的未来轨迹 | 中国合成生物学领域的公众参与和伦理框架 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 737 | 2026-01-16 |
From Cellular Organization to Synthetic Platforms: Liquid-Liquid Phase Separation as a Framework for Functional Biomolecular Condensates
2026-Jan-14, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c20923
PMID:41480717
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综述 | 本文综述了液-液相分离（LLPS）作为功能性生物分子凝聚物形成的框架，从细胞组织到合成平台的应用 | 利用LLPS原理设计具有可控组成、性质和活性的合成凝聚物，结合结构洞察、定量相行为和合成生物学工具 | NA | 总结LLPS介导的凝聚物的分子机制、设计策略和转化前景 | 生物分子凝聚物，包括天然和合成系统 | 生物物理学与生物工程 | NA | 液-液相分离（LLPS） | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | 医学（靶向药物递送、生物传感）、工业生物技术（增强催化、代谢控制） |
| 738 | 2026-01-16 |
Establishing synthetic ribbon-type active zones in a heterologous expression system
2026-Jan-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98254
PMID:41528127
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研究论文 | 本研究采用合成生物学方法，在HEK293细胞中重建了类似带状活性区的结构，以探究其最小分子需求并研究突触前钙通道的聚集 | 首次在异源表达系统中成功重建了模拟带状活性区的合成结构，结合超分辨率STED显微镜和冷冻相关电子断层扫描技术验证其与天然带状结构的相似性 | 研究基于异源细胞系统，可能不完全反映神经元原生环境中的复杂相互作用 | 探究带状突触活性区的最小分子组成和钙通道聚集机制 | 带状突触活性区的重建结构及其分子组件 | 合成生物学 | NA | STED超分辨率显微镜、冷冻相关电子断层扫描、钙成像、膜片钳技术 | NA | 图像数据、功能分析数据 | 使用HEK293细胞作为异源表达系统 | 合成生物学方法 | 人类胚胎肾293细胞（HEK293） | 带状活性区模拟结构，涉及Bassoon蛋白膜锚定版本和RIBEYEB蛋白共表达 | 医学 |
| 739 | 2026-01-16 |
Decoding necrosome assembly: harmonizing signal amplification and attenuation through optimal RIP3 stoichiometry
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67098-5
PMID:41436733
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研究论文 | 本研究通过定量STORM和数学建模揭示了坏死小体组装中RIP3与RIP1的最优化学计量比约为3:1，以调控坏死性凋亡的信号放大与衰减 | 首次定义了坏死小体中RIP3与RIP1的最优化学计量比，并发现过度RIP3寡聚化可作为内在尺寸控制机制来衰减信号 | NA | 探究坏死小体组装的时空规则及其在坏死性凋亡中的作用机制 | 坏死小体、RIP3、RIP1、MLKL、Caspase-8、c-FLIP | 分子生物学 | 神经退行性疾病、缺血性损伤、炎症性疾病 | 定量STORM、数学建模 | NA | 成像数据、数学模型 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 740 | 2026-01-16 |
Reconstituting transcription-translation-coupled DNA replication within complex in vitro biological systems
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67411-2
PMID:41398169
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研究论文 | 本研究开发了一种名为LoopReX的无细胞系统，利用大肠杆菌粗提物重建了转录-翻译耦合的DNA复制过程，为合成生命构建提供了新平台 | 首次使用粗提物而非纯化组分重建TTcDR，引入机器学习优化系统效率，并利用CipB介导的区室化形成人工核样结构 | 系统仍依赖外源添加的phi29和T7聚合酶，且长期稳定性和遗传保真度有待进一步验证 | 在人工系统中重建转录-翻译耦合的DNA复制过程以推进合成生命构建 | 无细胞转录翻译系统与DNA复制机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统构建、机器学习优化 | NA | 实验性能数据 | NA | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 转录-翻译耦合的DNA复制系统、人工核样区室化结构 | 合成生物学、生物技术、生物混合系统 |