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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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721 | 2024-12-18 |
Bacterial 5' UTR: A treasure-trove for post-transcriptional regulation
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108478
PMID:39551455
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综述 | 本文综述了细菌5' UTR在转录后调控中的作用及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 本文整合了当前对5' UTR调控功能的理解,展示了5' UTR元件设计和筛选的最新进展,并更新了开发的工具和调控策略 | 本文强调了未来建立可靠的生物信息学分析方法和非模式细菌底盘的挑战和必要性 | 探讨细菌5' UTR衍生的调控元件及其在合成生物学和代谢工程中的应用 | 细菌5' UTR及其调控元件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
722 | 2024-12-18 |
Harnessing microbial heterogeneity for improved biosynthesis fueled by synthetic biology
2025, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.11.004
PMID:39686977
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综述 | 本文综述了微生物异质性对生物合成的影响,并探讨了合成生物学工具和策略如何通过调控微生物异质性来提高生物合成效率 | 提出了利用微生物异质性(IHP-RHR)的工作流程,通过增加遗传异质性筛选高产菌株,并在生产过程中减少异质性以获得高稳健性菌株 | 未具体讨论实际应用中的挑战和解决方案 | 探讨如何通过合成生物学和单细胞技术调控微生物异质性,以提高微生物细胞工厂的效率和稳健性 | 微生物异质性及其对生物合成的影响 | 合成生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA |
723 | 2024-12-18 |
Engineered bacteria that self-assemble bioglass polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Dec-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409335121
PMID:39656206
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研究论文 | 本文利用合成生物学方法,通过工程化细菌表达来自海生海绵的硅酸盐生物矿化酶silicatein,使其自组装形成多硅酸盐“生物玻璃”涂层,从而增强光聚焦能力 | 本文首次利用工程化细菌自组装形成多硅酸盐涂层,并展示了其显著的光聚焦能力,亮度比未修饰的细菌高出近一个数量级 | 本文未详细讨论该技术的实际应用场景和大规模生产的可能性 | 探索合成生物学在生产具有独特光学特性的光子组件中的应用 | 工程化细菌及其自组装形成的多硅酸盐涂层 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
724 | 2024-12-18 |
Exploring the Promoter Generation and Prediction of Halomonas spp. Based on GAN and Multi-Model Fusion Methods
2024-Dec-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms252313137
PMID:39684846
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研究论文 | 本文提出了基于生成对抗网络(GAN)和多模型融合方法的极端微生物Halomonas spp.启动子生成与预测方法 | 首次为极端微生物Halomonas spp.构建了启动子强度数据库,并提出了基于GAN和多模型融合的启动子设计与预测方法 | 需要进一步验证该方法在其他极端微生物中的适用性 | 探索极端微生物Halomonas spp.的启动子生成与预测方法,推动工业生物技术的发展 | 极端微生物Halomonas spp.的启动子序列及其强度预测 | 合成生物学 | NA | 生成对抗网络(GAN),多模型融合 | 生成对抗网络(GAN),双向长短期记忆网络(BiLSTM),卷积神经网络(CNN) | 序列数据 | 未明确说明具体样本数量 |
725 | 2024-12-18 |
Cutting-edge developments in plastic biodegradation and upcycling via engineering approaches
2024-Dec, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2024.e00256
PMID:39687771
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综述 | 本文综述了通过工程方法促进塑料降解和升级回收的最新进展 | 本文介绍了通过合成生物学和代谢工程构建高性能微生物和酶用于塑料去除和生物升级回收的创新方法 | 本文主要集中在工程方法的综述,未提供具体的实验数据或案例研究 | 探讨通过工程方法促进塑料降解和升级回收的潜力,并展望可持续循环塑料经济的发展 | 塑料降解和升级回收的微生物、酶及其应用 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
726 | 2024-12-18 |
Positions of cysteine residues reveal local clusters and hidden relationships to Sequons and Transmembrane domains in Human proteins
2024-10-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-77056-8
PMID:39468182
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研究论文 | 本文研究了人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 发现了半胱氨酸残基在蛋白质中的频率与长度相关,并且CC间隙的频率可以作为区分具有特殊结构和功能的蛋白质的分类器 | 讨论了计算预测中缺乏的蛋白质结构动力学,但未提供具体的改进方法 | 研究人类蛋白质中半胱氨酸残基的位置与N-糖基化位点和跨膜结构域之间的关系 | 人类蛋白质中的半胱氨酸残基、N-糖基化位点和跨膜结构域 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 蛋白质序列 | 整个人类蛋白质组 |
727 | 2024-12-18 |
Engineered bacteria that self-assemble "bioglass" polysilicate coatings display enhanced light focusing
2024-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.03.597164
PMID:38895271
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法,利用细菌自组装形成生物玻璃多硅酸盐涂层,展示了增强的光聚焦能力 | 本文创新性地利用细菌表达来自海生海绵的硅酸盐生物矿化酶silicatein,使其自组装形成生物玻璃涂层,并展示了比未修饰细菌更强的光聚焦能力 | NA | 开发环境友好且具有可调结构特性的活体微透镜,并探索其在光学和光子技术中的应用潜力 | 表达silicatein酶的工程细菌及其自组装的生物玻璃涂层 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
728 | 2024-12-18 |
In vitro generation of genetic diversity for directed evolution by error-prone artificial DNA synthesis
2024-05-24, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06340-0
PMID:38789612
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研究论文 | 本文介绍了一种通过易错人工DNA合成(epADS)在体外生成遗传多样性的方法,用于定向进化的应用 | 提出了通过易错人工DNA合成(epADS)生成遗传多样性的新方法,丰富了定向进化的工具箱 | NA | 探索在合成生物学中用于定向进化的遗传多样性生成方法 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物对卡贝西林的耐受性 | 合成生物学 | NA | 易错人工DNA合成(epADS) | NA | DNA序列 | 基因编码的荧光蛋白、调控遗传元件、合成基因回路以及微生物样本 |
729 | 2024-12-17 |
Synthetic biology approaches to improve tolerance of inhibitors in lignocellulosic hydrolysates
2025 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108477
PMID:39551454
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研究论文 | 本文探讨了通过合成生物学方法提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性 | 本文提出了多种合成生物学策略,包括氧化还原平衡、膜工程、组学引导技术、保护剂和转录因子的表达、非理性工程、细胞絮凝和其他新技术,以提高微生物的耐受性 | 本文未详细讨论具体的技术实现细节和实验验证结果 | 提高微生物对木质纤维素水解液中抑制剂的耐受性,促进可持续发展和工业生产 | 木质纤维素水解液中的抑制剂和微生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分子生物学、高通量测序、人工智能 | NA | NA | NA |
730 | 2024-12-17 |
Perspectives of cyanobacterial cell factories
2024-Dec, Photosynthesis research
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s11120-023-01056-4
PMID:37966575
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综述 | 本文综述了蓝藻作为细胞工厂在生产异戊二烯和高价值蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 强调了蓝藻在特殊化学品和蛋白质生产中的挑战与前景,特别是异戊二烯产品和生物制药蛋白质 | 未提及具体的技术限制或实验挑战 | 探讨蓝藻在生产有用化学品和蛋白质方面的潜力及放大生产方法 | 蓝藻、异戊二烯、高价值蛋白质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
731 | 2024-12-17 |
Synthetic Biology Toolbox for Nitrogen-Fixing Soil Microbes
2023-12-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00414
PMID:37988619
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研究论文 | 本文验证了在三种固氮土壤细菌中合成生物学工具箱的有效性 | 开发了适用于非模式微生物的合成生物学工具箱,并成功应用于固氮土壤细菌中,实现了基因编辑和异源基因的表达 | 研究仅限于三种固氮土壤细菌,尚未广泛应用于其他微生物 | 开发和验证适用于非模式微生物的合成生物学工具箱,以增强农业作物的性能 | 三种固氮土壤细菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | NA | 三种固氮土壤细菌 |
732 | 2024-12-16 |
Chemically Driven Division of Protocells by Membrane Budding
2024-Dec-11, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c08226
PMID:39603809
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研究论文 | 本研究探讨了通过化学能量驱动的膜出芽机制实现原细胞分裂的过程 | 本研究首次展示了通过化学燃料驱动简单脂肪酸基囊泡出芽分裂的机制,类似于现有生命的分裂方式,为原细胞自主复制提供了新的可能性 | 本研究主要集中在实验室条件下的小规模实验,尚未在大规模或自然环境中验证其可行性 | 探索原细胞分裂的机制,并为合成细胞的发展提供基础 | 脂肪酸基囊泡及其在化学能量驱动下的分裂行为 | NA | NA | NA | NA | NA | 不同脂肪酸基囊泡的多种样本 |
733 | 2024-12-16 |
Harnessing microbes to pioneer environmental biophotoelectrochemistry
2024-Dec, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.07.005
PMID:39095256
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综述 | 本文综述了微生物生物光电化学系统(BPEC)在环境可持续性策略中的应用 | 强调了从传统生物能源系统向复杂BPEC应用的转变,并展示了其在利用太阳能进行重要生化转化方面的潜力 | 讨论了环境BPEC系统在性能改进和未来应用方面的挑战 | 探讨微生物生物光电化学系统在环境可持续性中的应用 | 微生物生物光电化学系统及其在碳氮固定、污染物降解和废水能源回收中的应用 | NA | NA | 微生物生物光电化学(BPEC) | NA | NA | NA |
734 | 2024-12-16 |
Reconstitution of the Mevalonate Pathway for Improvement of Isoprenoid Production and Industrial Applicability in Escherichia coli
2024-Nov-28, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2408.08053
PMID:39467704
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研究论文 | 本文通过在Escherichia coli中重构甲羟戊酸(MVA)途径,提高了异戊二烯类化合物的生产及其工业应用性 | 引入了来自生物安全等级1(BSL 1)生物体的新基因组合,重构了MVA途径,并显著提高了类胡萝卜素和番茄红素的产量及细胞特异性生产力 | 未提及具体的局限性 | 通过代谢工程和合成生物学策略,提高微生物生产高附加值异戊二烯类化合物的能力 | Escherichia coli中的异戊二烯类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
735 | 2024-12-16 |
Assembly of functional microbial ecosystems: from molecular circuits to communities
2024-Nov-23, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuae026
PMID:39496507
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法从头构建功能性微生物生态系统的策略 | 提出了一个更全面的设计-构建-测试-学习流程,用于设计和优化微生物生态系统 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 总结和推进基于不同调控电路的微生物生态系统构建策略 | 微生物生态系统中的种内和种间相互作用及正交调控模块 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
736 | 2024-12-16 |
Landscape of human organoids: Ideal model in clinics and research
2024-May-06, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2024.100620
PMID:38706954
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综述 | 本文综述了人类类器官领域的现状和未来发展趋势,涵盖了其在临床和研究中的应用 | 本文首次提供了对类器官领域全面且准确的概述,结合了学术研究、工业应用和临床实践的经验 | 本文主要为综述性质,未涉及具体的实验数据或技术细节 | 旨在填补类器官领域缺乏全面概述的空白,并为研究人员、临床医生和患者提供有价值的见解 | 类器官技术及其在个性化医疗、肿瘤学、药物发现等领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
737 | 2024-12-16 |
Proteins from an unevolved library of de novo designed sequences bind a range of small molecules
2012-Apr-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/sb200018e
PMID:23651114
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研究论文 | 本文研究了从非进化的新设计序列库中获得的蛋白质与一系列小分子结合的能力 | 本文首次展示了非进化的新设计蛋白质能够自发地与小分子结合,表明这种能力并非仅通过生物选择或计算设计产生 | 本文仅研究了三种新设计蛋白质与小分子的结合能力,样本量较小 | 探讨新设计蛋白质是否具有与小分子结合的能力,以及这种能力是否仅通过生物选择或计算设计产生 | 从非进化的新设计序列库中获得的蛋白质与小分子的结合能力 | 合成生物学 | NA | 小分子微阵列 | NA | 蛋白质序列 | 三种新设计蛋白质,筛选了10,000种化合物 |
738 | 2024-12-15 |
Unlocking the potential of Cupriavidus necator H16 as a platform for bioproducts production from carbon dioxide
2024-Nov-22, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04200-x
PMID:39572451
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综述 | 探讨了Cupriavidus necator H16作为将二氧化碳转化为多种产品的宿主平台的潜力 | 综述了合成生物学工具包、气体发酵技术和工程方法的进展,并提出了提高C. necator H16二氧化碳固定能力的建议 | 讨论了C. necator H16在转化效率和产品种类范围方面的局限性 | 探索如何利用C. necator H16将二氧化碳转化为有价值的产品,以应对气候变化 | 研究对象为Cupriavidus necator H16及其代谢工程 | NA | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
739 | 2024-12-15 |
Incorporation of photosynthetically active algal chloroplasts in cultured mammalian cells towards photosynthesis in animals
2024-Nov-11, Proceedings of the Japan Academy. Series B, Physical and biological sciences
DOI:10.2183/pjab.100.035
PMID:39477444
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研究论文 | 本研究将来自原始红藻Cyanidioschyzon merolae的光合活性叶绿体引入培养的哺乳动物细胞中,并验证了其在细胞内的光合作用活性 | 首次成功将光合活性叶绿体引入哺乳动物细胞并维持其光系统II的电子传递活性 | 仅在体外培养的哺乳动物细胞中进行了短期实验,未验证在完整动物体内的长期效果 | 探索在哺乳动物细胞中实现人工光合作用的可能性 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 | NA | NA | 共培养技术 | NA | 细胞 | 来自Cyanidioschyzon merolae的叶绿体和培养的哺乳动物细胞 |
740 | 2024-12-15 |
Advances and challenges in synthetic biology for mosquito control
2024-01, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2023.11.001
PMID:38000957
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综述 | 本文综述了利用合成生物学控制蚊媒疾病的现状、未来目标以及基因编辑在全球健康防御中的重要性 | 探讨了利用合成生物学增强蚊子对病原体的抵抗力或消除蚊媒的创新方法 | 未具体讨论合成生物学方法的实际应用效果或局限性 | 探讨利用合成生物学控制蚊媒疾病的创新方法及其在全球健康防御中的重要性 | 蚊媒疾病及其传播媒介蚊子 | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |