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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-05-12 |
Elucidation and de novo reconstitution of glyceollin biosynthesis
2025-05-05, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.003
PMID:40211535
|
研究论文 | 揭示了甘草素完全生物合成途径,并通过合成生物学方法在酵母中实现从简单碳源的从头重建 | 首次完整阐明甘草素生物合成途径,特别是氧化环化步骤,并鉴定出之前未表征的还原酶和五个P450酶基因 | 未提及具体局限性 | 阐明甘草素生物合成途径并实现其可持续生产 | 甘草素生物合成途径及相关酶基因 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达、体外酶表征、酵母喂养实验、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 本氏烟草、酿酒酵母 | 甘草素从头生物合成途径 | 农业、生物学 |
| 722 | 2026-05-12 |
Maize2035: A decadal vision for intelligent maize breeding
2025-02-03, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.01.012
PMID:39827366
|
综述论文 | 概述玉米育种的历史成功、当前挑战及未来十年智能育种的愿景与前沿解决方案 | 提出集成单细胞分析、全生物组、智能育种算法和合成生物的理性设计等跨学科方法,推动数据驱动的精准农业变革 | 未详细讨论各技术路线的实际验证数据或潜在实施障碍 | 提出面向2035年玉米智能育种的发展愿景和协同目标 | 玉米育种体系及其相关技术策略 | 农业科技 | NA | 多组学分析、单细胞分析、智能育种算法、合成生物学 | NA | 多组学数据、农业大数据 | NA | 合成生物学 | 玉米 | 理性设计合成生物回路 | 农业 |
| 723 | 2026-05-11 |
Meta-analysis of fruit waste-derived single-cell protein for programmable nutrition via synthetic biology in sustainable food systems
2026-May-09, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-026-00850-3
PMID:42106370
|
meta-analysis | 通过荟萃分析系统评估水果废弃物来源的单细胞蛋白在可持续食品系统中的生产潜力,并探讨合成生物学在可编程营养中的应用 | 首次通过荟萃分析整合水果废弃物单细胞蛋白生产数据,结合合成生物学框架提出可编程营养系统概念 | 工程菌株验证缺乏水果废渣直接数据,人类临床或体内数据缺失,底物异质性和高能耗预处理影响结果泛化 | 评估水果废弃物单细胞蛋白作为可持续蛋白质替代品的潜力,并探索合成生物学在优化营养方面的应用 | 水果加工残渣及微生物单细胞蛋白生产系统 | 机器学习 | NA | meta分析 | NA | NA | 来源多个同行评审研究的生物量0.24-37.40克/升和蛋白质含量20.58-54.74%数据 | NA | 多种微生物平台 | NA | 食品, 环境, 农业 |
| 724 | 2026-05-11 |
Genetic basis of phytoalexin-mediated chemical defense in plants
2026-May-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.04.021
PMID:42105761
|
研究论文 | 该文章揭示了植物中基于植物抗毒素的化学防御机制的遗传基础 | 首次阐明了debneyol的完整生物合成途径及其关键调控因子MCD1,并证明了MCD1能增强酶活性从而提升植物对多种病原体的抗性 | 未涉及MCD1在非模型植物中的适用性或大规模田间验证 | 解析植物抗毒素介导的化学防御的遗传机制 | 烟草等植物中的debneyol生物合成途径及其调控因子 | 分子生物学 | 植物病害 | 生物合成途径分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物(烟草等) | NA | 农业,生物技术 |
| 725 | 2026-05-11 |
Plant formins pave the way for endosymbiosis
2026-May-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.04.017
PMID:42106252
|
研究论文 | 本文揭示了formin蛋白在豆科植物根瘤菌侵染和多种植物菌根共生中协调细胞骨架重排的机制 | 发现单个formin蛋白能同时协调根瘤菌侵染和菌根形成两种不同的内共生过程,为工程化微生物进入作物提供新靶点 | 未提供具体实验数据或工程应用验证,仅基于Qiao等人研究进行概念阐述 | 阐明植物formin蛋白在有益微生物内共生中的核心作用机制 | 豆科植物和多种植物的根细胞,涉及根瘤菌和丛枝菌根真菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 豆科植物、多种植物 | 内共生信号通路调控模块(formin介导的细胞骨架重排途径) | 农业, 合成生物学 |
| 726 | 2026-05-11 |
Deciphering GB1's Single Mutational Landscape: Insights from MuMi Analysis
2024-08-22, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c04916
PMID:39115184
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研究论文 | 利用MuMi分析解读GB1蛋白单点突变景观及其对IgG-Fc结合的影响 | 提出MuMi(Mutation and Minimization)作为一种可靠且计算高效的蛋白质适应度景观预测工具,相比传统方法具有显著优势 | NA | 揭示GB1蛋白单点突变影响其与IgG-Fc结合亲和力的分子基础 | 链球菌蛋白G的C2片段(GB1)及其与人类IgG Fc域的结合 | 计算生物学 | NA | MuMi分析,分子动力学模拟(MD) | NA | 蛋白质序列与结构数据 | 所有可能的单点突变(数量未明确)及野生型GB1的2微秒分子动力学模拟 | NA | NA | NA | 药物设计,合成生物学 |
| 727 | 2026-05-11 |
Plasmid Vectors for in Vivo Selection-Free Use with the Probiotic E. coli Nissle 1917
2021-01-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00466
PMID:33301298
|
研究论文 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体系统 | 将天然质粒pMUT1和pMUT2改造为稳健的工程平台,结合CRISPR-Cas9系统移除天然质粒,实现无抗生素选择下的稳定维持和功能性蛋白分泌 | 未提及 | 开发用于益生菌大肠杆菌Nissle 1917的无选择标记体内质粒载体平台 | 益生菌大肠杆菌Nissle 1917及其天然质粒pMUT1和pMUT2 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 小鼠胃肠道实验 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 质粒载体含选择标记、荧光标记、温度敏感表达和curli分泌系统 | 医学 |
| 728 | 2026-05-10 |
Prediction of gene expression levels in Saccharomyces cerevisiae based on chromatin accessibility using multiple machine learning models
2026-Aug, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 基于染色质可及性使用多种机器学习模型预测酿酒酵母基因表达水平 | 首次使用染色质可及区域的k-mer特征通过监督机器学习模型预测基因表达,并发现与mRNA剪接相关的关键基序 | NA | 从染色质可及区域预测基因表达水平 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的染色质可及区域和基因表达 | 机器学习 | NA | 机器学习建模、染色质可及性分析 | 监督机器学习模型(Yeast-Gene) | 序列数据(k-mer特征) | NA | NA | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 合成生物学 |
| 729 | 2026-05-10 |
Bioconversion of carotenoids into high-value crocins using a marine sponge carotenoid cleavage dioxygenase
2026-Jun, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.71118
PMID:41889127
|
研究论文 | 研究发现海绵来源的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO)能裂解番茄红素和β-胡萝卜素生成藏花素前体,实现藏花素在番茄果实中的积累 | 首次揭示海洋海绵来源的CCD酶具有意外的酶促可塑性,能够将植物类胡萝卜素代谢重定向至藏花素生物合成途径,而非预期的视黄醇生成 | 未明确探讨SdCDO在天然海绵宿主中的生理功能,且研究仅在单一种植物(番茄)中进行验证 | 探索海洋海绵中类胡萝卜素裂解双加氧酶的功能多样性及其在合成生物学和作物生物强化中的应用潜力 | 海洋海绵Suberites domuncula的类胡萝卜素裂解双加氧酶(SdCDO) | 合成生物学 | NA | 异源表达、代谢组学分析、超微结构分析、转录组学分析 | NA | 代谢物数据、转录组数据 | 大肠杆菌和番茄果实样本 | NA | 大肠杆菌, 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 730 | 2026-05-10 |
Profiling Selectivity for the Shigella Virulence Factor OspF
2026-May-05, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.6c00109
PMID:42018782
|
研究论文 | 本研究通过合成磷酸肽和化学蛋白质组学方法,探究了志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性,发现其不仅能修饰MAPK家族蛋白,还能作用于多种细胞靶标 | 首次揭示OspF对MAPK家族内部的底物选择性,并发现其修饰范围远超MAPK家族,包括Rab1A和酪蛋白激酶2β等新靶标 | 未完全阐明OspF在志贺氏菌感染中的全部功能角色,需要进一步研究 | 研究志贺氏菌毒力因子OspF的底物选择性及其在宿主细胞中的修饰靶标 | 志贺氏菌分泌的磷酸苏氨酸裂合酶OspF | 微生物学, 化学生物学 | 细菌感染性疾病 | 合成磷酸肽分析, 化学蛋白质组学, 亲核膦化学探针 | NA | 蛋白质组数据 | 细胞裂解液样本和志贺氏菌感染样本 | NA | 志贺氏菌, 宿主细胞(被感染细胞) | NA | 医学, 化学生物学, 合成生物学 |
| 731 | 2026-05-07 |
Followers' Choice: The Trends Transforming Precision Medicine, Synthetic Biology, and Sustainable Microbiology
2026-May, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70370
PMID:42087404
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 732 | 2026-05-10 |
Subcellular localization of enzymes involved in the biosynthesis of digoxin in Digitalis lanata
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1703671
PMID:41884437
|
研究论文 | 本文鉴定了毛地黄中地高辛生物合成三种已知酶的亚细胞定位 | 首次揭示了地高辛生物合成途径中P450酶定位在内质网,而3HSD和P5R2定位在细胞质,并发现毛地黄P450与哺乳动物同源酶(CYP11A1)的线粒体定位不同 | 研究仅限于烟草叶片中的瞬时表达,未在毛地黄原生细胞中验证;仅覆盖三种已知酶,途径的其他未知酶尚未涉及 | 阐明地高辛生物合成途径的空间组织,为合成生物学和代谢工程提供指导 | 毛地黄中地高辛生物合成的三种酶(P450、3HSD、P5R2) | 合成生物学 | 心血管疾病 | 荧光标记与共聚焦显微镜 | NA | 图像 | 烟草叶片中的瞬时表达实验 | NA | 烟草 | 地高辛生物合成途径 | 医药 |
| 733 | 2026-05-10 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
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综述 | 综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用潜力 | 系统总结了粘细菌基因组多样性和裂解酶挖掘的最新进展,强调了粘细菌作为工业细胞工厂的未充分利用潜力 | 基因工程改造困难、生长缓慢、代谢重塑和表达策略限制等挑战尚未解决 | 探讨粘细菌及其酶在农业和工业生物制造中的应用前景 | 粘细菌及其裂解酶 | 机器学习 | NA | NA | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学策略 | 粘细菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 734 | 2026-05-10 |
Beyond pigments and perfumes: engineering in the carotenoid and apocarotenoid spectrum, novel enzymes, and synthetic biology strategies
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1716709
PMID:41625067
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综述 | 探讨类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径的工程化策略,涵盖酶工程、合成生物学工具及宿主范围,并展望未来研究方向 | 采用通路模块化视角,系统梳理从前体供应到氧化裂解的每个酶促步骤,重点突出新发现酶变体、诱变研究、融合策略及区室化方法对代谢调控的贡献 | 仅聚焦近期文献,未对工业放大和具体产量指标进行量化比较,缺乏对经济性与规模化瓶颈的深入分析 | 为推进类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素生物合成提供层次化路径理解与工程策略整合 | 类胡萝卜素与脱辅基类胡萝卜素代谢途径中的酶、宿主(植物、真菌、藻类、酵母、细菌)及合成生物学工具 | NA | NA | NGS、RNA-seq、CRISPR-Cas9、Golden Gate Assembly | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 植物、真菌、藻类、酵母、细菌 | 类胡萝卜素生物合成通路(前体供应→GGPP→八氢番茄红素→脱饱和/异构化→环化→羟基化→酮基化→环氧化→氧化裂解) | 医学、农业、食品、工业生物技术 |
| 735 | 2026-05-09 |
Engineering Corynebacterium glutamicum as a multifunctional biofactory for living therapeutic materials and controlled ectoine delivery
2026-Aug, Biomaterials advances
IF:5.5Q2
DOI:10.1016/j.bioadv.2026.214847
PMID:41950672
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研究论文 | 将谷氨酸棒杆菌工程化为多功能生物工厂,用于活体治疗材料和受控的依克多因递送 | 首次将谷氨酸棒杆菌作为多功能平台开发用于活体治疗材料,整合了生物感应、报告和依克多因生产功能,并实现了在聚合物基质中的封装与受控释放 | 未明确讨论在体内环境中的长期稳定性和免疫原性等潜在挑战 | 设计和构建工程化谷氨酸棒杆菌,用于活体治疗材料的开发及相关应用 | 谷氨酸棒杆菌菌株及基于聚合物的活体材料(膜-凝胶贴片和核壳水凝胶系统) | 合成生物学 | 炎症及应激相关疾病 | 合成生物学 | NA | 生物传感数据 | NA | 合成生物学 | Corynebacterium glutamicum | 生物传感器、报告系统、依克多因合成通路 | 医学, 环境 |
| 736 | 2026-05-09 |
Reprogramming probiotic for uric acid modular degradation and hyperuricemia treatment by synthetic biology regulation
2026-May-07, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-026-03022-w
PMID:42098719
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研究论文 | 通过合成生物学调控构建重组益生菌株,实现对尿酸的模块化降解,并用于高尿酸血症治疗 | 创新性地通过调节不同强度的核糖体结合位点实现尿酸降解模块的优化,并过表达尿酸转运蛋白和过氧化氢降解酶以提高降解效率 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化尚需进一步验证 | 开发安全有效的微生物策略用于高尿酸血症治疗 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917菌株及其对高尿酸血症小鼠模型的治疗作用 | 机器学 | 高尿酸血症 | 合成生物学 | NA | 基因序列 | 小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 尿酸降解模块 | 医学 |
| 737 | 2026-05-09 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
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研究论文 | 文章讨论混合人工智能在合成生物学中应用于农业的潜力 | 提出混合AI能够更有效地处理多组学复杂性,用于工程化气候智能、高产量作物,超越传统数据驱动方法 | 发挥全部潜力需要清晰的流程、精选的数据集和自动化平台 | 探索混合AI在合成生物学中推动农业转型的作用 | 多基因组、多性状、多环境数据以及作物工程 | 机器学习 | NA | NA | 混合AI | 多组学数据 | NA | NA | 作物 | NA | 农业 |
| 738 | 2026-05-09 |
Rewiring holobiont systems with synthetic biology
2026-May, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.09.017
PMID:41109795
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综述 | 本文综述了合成生物学如何帮助理解和操控全生物体(宿主及其微生物群组成的复杂群落)中的相互作用 | 提出了de novo全生物设计这一新领域,整合全生物研究与合成生物学,并重点介绍了细菌生物传感器、跨王国通讯工程、表面展示及CRISPR系统等前沿技术 | 未提及具体局限性 | 探索合成生物学在解析和操控全生物体相互作用中的应用,推动生物技术新前沿 | 全生物体(宿主与微生物群)及其相互作用 | 合成生物学 | NA | 细菌生物传感器设计、跨王国通讯工程、表面展示、CRISPR系统 | NA | NA | NA | CRISPR系统 | NA | 细菌生物传感器、跨王国通讯回路 | 生物技术 |
| 739 | 2026-05-09 |
Transforming toxic element remediation: a necessary path for 21st-century food security
2026-May, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.10.008
PMID:41139567
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综述论文 | 探讨利用基因编辑、合成生物学和混合技术修复有毒元素污染,以保障21世纪粮食安全 | 提出基因编辑和合成生物学等新兴技术可实现可扩展、永久性的土壤解毒和污染土地恢复,超越传统临时修复方法 | NA | 阐述新兴修复技术在应对全球有毒元素污染和保障粮食安全方面的潜力和必要性 | 有毒元素污染的土壤和农业系统 | 数字病理学 | NA | 基因编辑、合成生物学 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物 | 修复途径、生物传感器 | 农业, 环境 |
| 740 | 2026-05-09 |
Context-aware synthetic promoter design using neural networks enables rewiring of eukaryotic transcriptional networks
2026-Mar-17, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00684-5
PMID:41844670
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研究论文 | 提出一种基于人工神经网络(ANN)的框架,用于酿酒酵母中情境感知的合成启动子设计,实现转录网络的重新编程 | 首次实现启动子与转录因子结合位点的情境感知重组,无需先验实验表征即可实现高达98.4%的抑制率,并成功重编程酵母转录网络 | 未提及模型的可推广性至其他物种或复杂多转录因子系统的验证,且筛选的启动子数量有限 | 开发可扩展的预测方法用于工程化调控序列和重编程转录逻辑 | 酿酒酵母天然启动子与TetR和Mig1转录因子结合位点的兼容性 | 合成生物学 | NA | 人工神经网络(ANN) | ANN | 序列数据 | 共筛选6,011个天然酵母启动子 | 启动子工程 | 酿酒酵母 | 合成启动子-转录因子结合位点重组,葡萄糖依赖性基因调控回路 | 工业生物技术 |