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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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741 | 2024-12-12 |
Blue-Purple evaluation: Chromoproteins facilitate the identification of BioBrick compatibility
2025-Jan, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28862
PMID:39402779
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研究论文 | 本文介绍了一种利用色蛋白(chromoproteins)在单锅反应中评估BioBrick兼容性的新方法BP(Blue/Purple, Ban/Pick) | 提出了BP评估方法,通过可视化和量化蓝紫色大肠杆菌菌落的比率来验证BioBrick构建的兼容性 | NA | 开发一种简单、快速且可靠的方法来评估BioBrick的兼容性 | BioBrick的兼容性评估 | 合成生物学 | NA | 色蛋白(chromoproteins) | NA | 菌落图像 | 使用了包含抗毒素-毒素对ccdA-ccdB、裂解蛋白E或异源蛋白sfGFP的BioBrick组装体进行验证 |
742 | 2024-12-12 |
Sphingomonas arvum sp. nov.: A promising microbial chassis for high-yield and sustainable zeaxanthin biomanufacturing
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127938
PMID:39509922
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研究论文 | 本研究通过基因组挖掘和液相色谱/质谱分析,鉴定了新型类胡萝卜素玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010的生物合成基因簇,并验证了其高产玉米黄质的能力 | 首次报道了Sphingomonas arvum strain BN140010这一新型菌株,其玉米黄质产量在Sphingomonas属中最高,为可持续的玉米黄质生物制造提供了新的微生物底盘 | NA | 寻找新的微生物和遗传底盘,以满足全球对高附加值玉米黄质的快速增长需求 | 新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、液相色谱/质谱分析 | NA | 基因组数据、质谱数据 | 1株新型玉米黄质产生菌Sphingomonas sp. strain BN140010 |
743 | 2024-12-12 |
Microbial chemotaxis in degradation of xenobiotics: Current trends and opportunities
2025-Jan, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127935
PMID:39476517
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综述 | 本文综述了微生物趋化性在降解异生物质中的作用,重点介绍了基于趋化性的细菌和微流控生物传感器在环境监测中的应用 | 本文探讨了基因组学、蛋白质组学和合成生物学在理解和控制微生物趋化性降解异生物质过程中的新趋势,并提出了开发具有定制趋化反应和降解能力的工程微生物的潜力 | 尽管在解码细菌趋化性调控机制方面取得了显著突破,但仍存在一些知识空白需要解决,以充分利用其在环境中的污染物感知和降解潜力 | 探讨微生物趋化性在降解异生物质中的作用及其在环境监测中的应用 | 微生物趋化性在降解农药、工业化学品和药品等异生物质中的作用 | NA | NA | 基因组学、蛋白质组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
744 | 2024-12-12 |
Ultrahigh yields of giant vesicles obtained through mesophase evolution and breakup
2024-Dec-11, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01109k
PMID:39618312
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研究论文 | 本文报道了一种通过脂质自组装和膜断裂途径获得超高产率巨型单层囊泡的新方法 | 发现了一种新的脂质自组装途径,称为“剪切诱导的碎片化”,能够实现超过50%的超高产率巨型单层囊泡 | NA | 探索和优化巨型单层囊泡的制备方法,以提高其产率和应用潜力 | 巨型单层囊泡及其在生物物理模型、软材料、合成生物学和生物医学应用中的应用 | NA | NA | 脂质自组装 | NA | 图像 | 包含3 mol% PEG2000-DSPE的脂质膜和不同脂质混合物 |
745 | 2024-12-12 |
AuxSynBio: synthetic biology tools to understand and engineer auxin
2024-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103194
PMID:39255527
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综述 | 本文综述了植物激素生长素在合成生物学中的应用及其在植物生长发育中的关键作用 | 通过在酵母中重现信号通路和设计正交生长素受体对,深入理解生长素通路的调控机制 | NA | 探讨生长素在合成生物学中的双重角色,即作为研究对象和工具 | 植物激素生长素及其信号通路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
746 | 2024-12-12 |
T7 phage-assisted evolution of riboswitches using error-prone replication and dual selection
2024-01-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-52049-9
PMID:38287027
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研究论文 | 本文展示了利用T7噬菌体辅助进化技术,通过错误倾向复制和双重选择系统,成功进化了茶碱核开关 | 本文创新性地设计了T7AE技术,通过双重选择系统实现了对功能性核开关的有效筛选和富集 | NA | 开发一种新的技术来进化和改进基因开关,特别是基于非编码RNA的开关 | 茶碱核开关及其在T7噬菌体中的进化 | 合成生物学 | NA | 错误倾向复制 | NA | DNA | 65,536个工程化的T7噬菌体 |
747 | 2024-12-12 |
Harnessing synthetic biology to engineer organoids and tissues
2023-01-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.12.013
PMID:36608674
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研究论文 | 本文探讨了利用合成生物学工程化类器官和组织的方法 | 本文引入了合成生物学工具,通过基因操作细胞通讯、粘附和细胞命运,以改进类器官模型和组织设计 | NA | 深入理解发育原理,改进类器官模型,并增强再生组织设计的能力 | 类器官和组织 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
748 | 2024-12-12 |
Quantifying heterologous gene expression during ectopic MazF production in Escherichia coli
2022-May-13, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-022-06061-9
PMID:35562780
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研究论文 | 本研究量化了在Escherichia coli中异位过表达MazF对异源基因表达的影响 | 首次量化了MazF过表达对异源蛋白表达的影响,并探讨了不同mRNA结构对表达的影响 | 研究结果表明MazF过表达会增加细菌群体的异质性,需要在实验中优化过表达的强度和持续时间 | 探讨MazF过表达对异源蛋白表达的影响 | Escherichia coli中异源蛋白的表达 | 合成生物学 | NA | 流式细胞术 | NA | 荧光蛋白表达水平 | 使用了包含ACA序列和不含ACA序列的mRNA作为报告基因 |
749 | 2024-12-11 |
Development of a specific biosensor for sesquiterpene based on SELEX and directed evolution platforms
2025-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.127186
PMID:39522280
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SELEX和定向进化平台的特定生物传感器,用于检测倍半萜烯化合物amorpha-4,11-二烯 | 首次开发了一种对倍半萜烯amorpha-4,11-二烯具有特异响应的riboswitch生物传感器 | NA | 开发一种用于检测和调控小分子的生物传感器,应用于合成生物学中的菌株工程、途径调控和代谢优化 | 倍半萜烯amorpha-4,11-二烯 | 合成生物学 | NA | SELEX, 定向进化, 分子对接, 分子动力学模拟 | NA | 序列数据 | 81,520个序列的高亲和力aptamer库 |
750 | 2024-12-10 |
Synthetic biology of metabolic cycles for Enhanced CO2 capture and Sequestration
2024-Dec, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107774
PMID:39260160
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研究论文 | 本文描述了在Escherichia coli中使用改良的三羧酸循环(THETA循环)进行碳固定和氨基酸合成的研究 | 提出了THETA循环,这是一个改良的三羧酸循环,用于增强CO2捕获和封存 | NA | 研究改良的三羧酸循环在碳固定和氨基酸合成中的应用 | Escherichia coli中的THETA循环及其在碳固定和氨基酸合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 酶优化、路径重设计和异源表达 | NA | NA | NA |
751 | 2024-12-10 |
Toolbox of Characterized Genetic Parts for Staphylococcus aureus
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00325
PMID:38064657
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研究论文 | 本文报道了首个用于金黄色葡萄球菌的标准化遗传部件工具箱,包括来自多种细菌的启动子、核糖体结合位点、终止子和质粒复制子,用于精确控制基因表达 | 首次为金黄色葡萄球菌建立了标准化的遗传部件工具箱,并展示了其在理性设计和工程化中的应用 | NA | 开发适用于金黄色葡萄球菌的合成生物学工具 | 金黄色葡萄球菌的遗传部件 | 合成生物学 | NA | DNA组装策略 | NA | 基因表达数据 | 24个组成型启动子,金黄色葡萄球菌ATCC 12600 |
752 | 2024-12-09 |
Engineering biology approaches to modulate bacterial biofilms
2024-Dec-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.002
PMID:39643528
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研究论文 | 本文探讨了利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜的最新进展 | 本文介绍了利用工程生物学方法赋予细菌生物膜新功能的创新方法 | NA | 探索利用工程生物学方法控制和改造细菌生物膜 | 细菌生物膜 | 合成生物学 | NA | 工程生物学方法 | NA | NA | NA |
753 | 2024-12-09 |
Interplay of emerging and established technologies drives innovation in natural product antibiotic discovery
2023-10, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2023.102359
PMID:37517368
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研究论文 | 本文探讨了新兴技术和现有技术在天然产物抗生素发现中的相互作用,强调了这些技术在推动新型抗生素开发中的关键作用 | 本文介绍了近期在筛选方法、微生物学、生物信息学、代谢组学技术以及天然产物启发合成和合成生物学领域的创新,这些创新在过去两年中推动了新型天然产物抗生素的发现 | NA | 探讨新兴技术和现有技术在天然产物抗生素发现中的相互作用,推动新型抗生素的开发 | 天然产物抗生素及其对抗耐药病原体的新作用机制 | 生物信息学 | NA | 筛选方法、微生物学、生物信息学、代谢组学技术、天然产物启发合成、合成生物学 | NA | NA | NA |
754 | 2024-12-09 |
Stability, robustness, and containment: preparing synthetic biology for real-world deployment
2023-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2022.102880
PMID:36621221
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研究论文 | 本文探讨了合成生物学领域在实际应用中稳定性和鲁棒性的策略 | 提出了多层传感电路、遗传上下文和资源控制电路等工具,以增强微生物系统在复杂环境中的鲁棒性和功能稳定性 | NA | 探讨合成生物学在实际应用中的稳定性和鲁棒性策略 | 工程化微生物在人类健康和生物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
755 | 2024-12-09 |
Construction of à la carte QconCAT protein standards for multiplexed quantification of user-specified target proteins
2021-09-08, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-021-01135-9
PMID:34496840
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研究论文 | 本文介绍了一种基于合成生物学原理的新方法,用于构建QconCAT蛋白质标准,以实现用户指定目标蛋白质的多重定量 | 提出了一种基于合成生物学原理的ALACAT策略,允许快速编辑和改进QconCAT,并支持替换表现不佳的肽标准 | NA | 开发一种灵活的方法来构建和改进QconCAT蛋白质标准 | QconCAT蛋白质标准及其在蛋白质组学应用中的定量 | 蛋白质组学 | NA | 合成生物学 | NA | DNA | NA |
756 | 2024-12-08 |
An independent biosynthetic route to frame a xanthanolide-type sesquiterpene lactone in Asteraceae
2024-Dec-06, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.17199
PMID:39642193
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研究论文 | 本文揭示了从germacrene A酸通过氧化重排生成12,8-xanthanolide的完整生物合成途径 | 首次阐明了xanthanolide类倍半萜内酯的生物合成途径,与之前统一的12,6-guaianolide生物合成途径形成对比 | NA | 揭示xanthanolide类倍半萜内酯的生物合成途径 | xanthanolide类倍半萜内酯的生物合成机制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
757 | 2024-12-08 |
Facile and versatile PDMS-glass capillary double emulsion formation device coupled with rapid purification toward microfluidic giant liposome generation
2024-Dec-05, Microsystems & nanoengineering
IF:7.3Q1
DOI:10.1038/s41378-024-00815-0
PMID:39632792
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研究论文 | 本文介绍了一种用于形成双乳液的PDMS-玻璃毛细管混合装置,并展示了其在微流控巨型脂质体生成中的应用 | 提出了一种无需表面处理的PDMS-玻璃毛细管混合装置,简化了双乳液的形成过程,并开发了一种连续快速的无操作员处理分离芯片 | NA | 开发一种简便且多功能的微流控装置,用于生成巨型脂质体,并探索其在生物膜研究和合成生物学中的应用 | 双乳液的形成和分离,以及巨型脂质体的生成 | NA | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA |
758 | 2024-12-08 |
Transcriptional response of Methanosarcina acetivorans to repression of the energy-conserving methanophenazine: CoM-CoB heterodisulfide reductase enzyme HdrED
2024-Oct-29, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.00957-24
PMID:39472004
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研究论文 | 研究了甲烷产生菌Methanosarcina acetivorans在能量保存酶HdrED抑制下的转录响应 | 揭示了甲烷产生菌通过未知机制将甲烷生成与基因调控通过CoM-S-S-CoB和ATP可用性高效耦合 | NA | 探究细胞如何感知和响应终端电子受体的可用性 | Methanosarcina acetivorans细胞在HdrED酶缺失下的转录变化 | 代谢网络 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
759 | 2024-12-08 |
Combining culture optimization and synthetic biology to improve production and detection of secondary metabolites in Myxococcus xanthus: application to myxoprincomide
2024-Oct-21, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01740-24
PMID:39431896
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研究论文 | 本文介绍了一种名为2PRIM-BOOST的新策略,通过结合底盘菌株工程和生长介质优化,提高Myxococcus xanthus中非核糖体肽合成酶(NRPS)/聚酮合成酶(PKS)次级代谢产物的生产与检测 | 提出了2PRIM-BOOST策略,结合底盘菌株工程和生长介质优化,显著提高了myxoprincomide等次级代谢产物的生产 | NA | 开发一种新策略以提高Myxococcus xanthus中次级代谢产物的生产与检测 | Myxococcus xanthus中的次级代谢产物,特别是myxoprincomide | 合成生物学 | NA | 底盘菌株工程、生长介质优化 | NA | NA | NA |
760 | 2024-12-08 |
A Synthetic Biology Approach to Transgene Expression in Insects
2024-Sep-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00250
PMID:39198266
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研究论文 | 本文介绍了一种合成生物学方法,用于控制昆虫中的转基因表达 | 开发了一种系统方法,通过修改翻译起始序列和3'非翻译区来调节转基因表达,为蚊子和其他昆虫提供了一个基因表达调控工具箱 | NA | 解决非模式和害虫昆虫物种中基因表达调控的预测性问题 | 蚊子和其他昆虫的转基因表达调控 | 合成生物学 | NA | RNA聚合酶II启动子 | NA | 基因序列 | 多种细胞系和5'调控序列 |