本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-10-05 |
Biosynthesis of Two Types of Exogenous Antigenic Polysaccharides in a Single Escherichia coli Chassis Cell
2025-May-26, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15060858
PMID:40566513
|
研究论文 | 本研究在单个大肠杆菌底盘细胞中同时构建了两种外源抗原多糖的生物合成途径 | 首次在单一宿主中实现Wzy/Wzx依赖和ABC转运蛋白依赖两种不同生物合成途径的多糖同时生产 | 共表达水平中等程度降低,诱导初期存在弱竞争相互作用 | 开发针对耐药病原体的多价结合疫苗的生产平台 | 大肠杆菌W3110细胞 | 合成生物学 | 抗菌素耐药性感染 | 全细胞蛋白质组分析、MFUZZ聚类、基因本体分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA | Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 双途径生物合成系统:Wzy/Wzx依赖途径和ABC转运蛋白依赖途径 | 医药 |
| 742 | 2025-10-05 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
|
研究论文 | 开发了一个高效的基因组基础模型GenomeOcean,通过大规模宏基因组组装数据训练,提升对稀有微生物物种的表征能力 | 直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练,采用字节对编码(BPE)标记化策略,实现150倍更快的序列生成速度,同时保持高生物保真度 | NA | 开发高效的基因组基础模型,改进对稀有微生物物种的表征能力 | 宏基因组数据集中的微生物物种和蛋白质编码基因 | 机器学习 | NA | 宏基因组测序,字节对编码(BPE) | 生成式基础模型 | 基因组序列数据 | 220TB宏基因组数据集,包含超过600Gbp的高质量重叠群 | NA | NA | NA | 医学,合成生物学 |
| 743 | 2025-10-05 |
Degradable living plastics programmed by engineered spores
2025-Jul, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01713-2
PMID:39169270
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学和聚合物工程开发了可降解的活性塑料 | 利用工程化孢子构建可编程降解的活性塑料系统,孢子能在材料加工过程中保持活性并在触发后释放降解酶 | 未明确说明该技术的规模化生产成本和实际应用环境中的降解效率 | 开发可生物降解的环保塑料材料 | 枯草芽孢杆菌孢子和聚己内酯塑料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、基因电路工程 | NA | NA | NA | 基因电路 | 枯草芽孢杆菌 | 木糖诱导型分泌表达伯克霍尔德菌脂肪酶的基因电路 | 环境,材料 |
| 744 | 2025-10-05 |
Autonomous chemo-metabolic construction of anisotropic cell-in-shell nanobiohybrids in enzyme-powered cell microrobots
2025-Jun-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu5451
PMID:40561036
|
研究论文 | 提出一种化学代谢耦合策略,在细胞生长培养基中自主构建细胞-外壳纳米生物杂合体 | 利用乙醇发酵与酶级联反应自主驱动聚多巴胺纳米壳形成,实现细胞增殖与外壳构建的同步进行 | NA | 开发具有生物自主性的细胞-外壳结构构建方法 | 细胞-外壳纳米生物杂合体 | 合成生物学 | NA | 乙醇发酵、酶级联反应(醇氧化酶和辣根过氧化物酶) | NA | NA | NA | NA | NA | 化学代谢耦合系统 | 合成生物学, 细胞治疗 |
| 745 | 2025-10-05 |
Bioproduction of a Large-Scale Library of Tryptamine Derivatives for Neuropsychiatric Drug Screening
2025-Jun-20, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.4c00857
PMID:40375477
|
研究论文 | 本研究通过微生物代谢工程构建了一个大规模色胺衍生物库,用于神经精神疾病药物筛选 | 开发了基于生物合成的色胺衍生物大规模生产策略,克服了传统合成化学在通量和多样性方面的限制 | 有63种目标化合物未被检测到,且仅对17种新型N-乙酰化衍生物进行了放大培养和纯化 | 建立生物发酵平台用于神经精神疾病药物的大规模筛选 | 色胺衍生物及其在神经精神疾病相关受体和转运体上的生物活性 | 合成生物学 | 神经精神疾病 | 微生物代谢工程、发酵技术、酶工程 | NA | 生物活性筛选数据 | 344种推测的生物转化,产生279种产物,17种新型N-乙酰化衍生物进行放大培养 | 代谢工程、合成生物学 | 大肠杆菌 | 色胺生物合成途径,包含脱羧酶、卤化酶、甲基转移酶、异戊烯基转移酶等多种酶的组合 | 医药 |
| 746 | 2025-10-05 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
|
研究论文 | 本研究开发并验证了pXpressome质粒工具包,用于稳健表达和改造α-羧酶体 | 开发了首个能够稳健表达完整功能性α-羧酶体的质粒工具包,通过荧光标记构建体实现了更均匀的表达和更好的细胞健康 | NA | 开发合成生物学工具包以促进羧酶体研究和重新设计 | α-羧酶体及其结构蛋白 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、荧光标记、蛋白质纯化 | NA | 蛋白质表达数据、形态学观察数据 | NA | 质粒工具包 | 微生物 | α-羧酶体表达系统,包含顶点帽蛋白和面形成蛋白的调控元件 | 环境,能源,工业生物技术 |
| 747 | 2025-10-05 |
Microbial Metabolites: A Sustainable Approach to Combat Plant Pests
2025-Jun-19, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15060418
PMID:40559442
|
综述 | 探讨微生物代谢物作为生物活性化合物在植物病虫害综合治理中的应用潜力 | 系统阐述微生物代谢物的分类、生物合成途径及生态功能,并提出利用合成生物学工具增强代谢物生产的创新策略 | NA | 研究微生物代谢物在可持续农业病虫害防治中的应用 | 微生物(细菌、真菌、放线菌)产生的代谢物 | 农业生物技术 | 植物病虫害 | 合成生物学、代谢途径工程 | NA | 文献综述数据 | NA | 合成生物学工具 | 细菌, 真菌, 放线菌 | 代谢途径工程 | 农业 |
| 748 | 2025-10-05 |
SubtiToolKit: a bioengineering kit for Bacillus subtilis and Gram-positive bacteria
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.004
PMID:40074634
|
研究论文 | 开发了用于枯草芽孢杆菌和革兰氏阳性菌的高效克隆工具包SubtiToolKit | 首个专门针对革兰氏阳性菌的Golden Gate克隆工具包,填补了该领域空白 | NA | 为革兰氏阳性菌提供标准化合成生物学工具 | 枯草芽孢杆菌及其他革兰氏阳性菌 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | Bacillus subtilis, Escherichia coli, Geobacillus, Parageobacillus | 转录单元、操纵子、基因敲入/敲除部件,包含启动子、核糖体结合位点、荧光蛋白、蛋白标签、终止子、基因组整合部件等模块化DNA部件库 | 工业生物技术 |
| 749 | 2025-10-05 |
Base modifications reshape RNA folding landscapes and structure-function relationships in synthetic and natural RNAs
2025-May-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6465433/v1
PMID:40502763
|
研究论文 | 研究碱基修饰如何影响RNA三维结构的折叠和功能 | 首次揭示碱基修饰通过改变堆叠能量而非碱基配对来驱动RNA构象变化 | 仅研究了5mC和N1Ψ两种修饰类型 | 探索碱基修饰对RNA结构折叠和功能的影响机制 | 工程化RNA折纸纳米结构和天然核酶 | 合成生物学 | NA | 冷冻电镜, FRET | NA | 结构数据, 能量数据 | 两种RNA结构(合成和天然) | RNA折纸技术 | NA | RNA纳米结构 | 医学, 合成生物学 |
| 750 | 2025-10-05 |
Cyanobacterial Peptides in Anticancer Therapy: A Comprehensive Review of Mechanisms, Clinical Advances, and Biotechnological Innovation
2025-May-29, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23060233
PMID:40559642
|
综述 | 本文全面综述蓝藻来源多肽作为抗癌药物的作用机制、临床进展与生物技术创新 | 系统整合蓝藻多肽的靶向递送技术、联合治疗策略及合成生物学生产方案 | 存在肿瘤选择性有限、系统毒性和生产可扩展性等挑战 | 挖掘蓝藻多肽在肿瘤治疗领域的临床应用潜力 | 蓝藻来源的生物活性多肽 | NA | 癌症 | 合成生物学、基因组挖掘 | NA | 临床研究数据、临床前研究数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 751 | 2025-10-05 |
The specificity of intermodular recognition in a prototypical nonribosomal peptide synthetase depends on an adaptor domain
2024-06-21, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm9404
PMID:38896613
|
研究论文 | 本研究通过核磁共振和质谱技术揭示了tomaymycin非核糖体肽合成酶中模块间识别与载体蛋白特异性偶联的机制 | 发现了一个适配器结构域可直接将负载的载体蛋白从起始模块招募至延伸模块,并揭示了其作用机制 | NA | 探索非核糖体肽合成酶中模块间识别的生物物理原理 | tomaymycin非核糖体肽合成酶 | 合成生物学 | NA | 核磁共振光谱, 质谱 | NA | 光谱数据 | NA | NA | NA | 非核糖体肽合成酶工程化设计 | 医药 |
| 752 | 2025-10-05 |
Beyond the Organism versus Machine Dichotomy: A Review of Ethical Concerns in Synthetic Biology
2024-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00456
PMID:38070167
|
综述 | 本文系统回顾并分析了合成生物学引发的伦理问题,重点关注生命干预的道德考量与生物安全风险 | 突破传统有机体与机器的二元对立框架,首次系统梳理合成生物学伦理研究的关注点分布与缺失 | 缺乏对实验室日常研究中实际伦理问题的系统性调查 | 探讨合成生物学的伦理与社会影响 | 合成生物学伦理研究文献 | NA | NA | 系统综述、主题分析 | NA | 文本数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 753 | 2025-10-05 |
A path to perpetual chemical synthesis via photocatalytic cofactor regeneration
2025-Jun-25, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc02770e
PMID:40453794
|
综述 | 探讨通过光催化辅因子再生实现可持续化学合成的设计原则与前景 | 提出将光催化辅因子再生与天然酶循环整合以实现连续化学生产的新范式 | 集成系统存在现有技术限制,需多学科协同解决 | 开发可持续的化学合成方法以降低碳足迹 | 辅因子再生系统与酶催化循环 | 合成生物学 | NA | 光催化、生物催化 | NA | NA | NA | NA | NA | 辅因子再生循环系统 | 工业生物技术, 能源 |
| 754 | 2025-10-05 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
|
研究论文 | 本研究开发了分支卷积神经网络结合微流控荧光激活细胞分选技术,用于合成酵母启动子的理性设计与高通量筛选 | 提出分支卷积神经网络学习天然启动子的序列组成和结构特性,结合微流控FACS系统实现高通量单细胞分选,筛选效率达7000细胞/秒 | NA | 开发酵母合成启动子的理性设计与高通量筛选方法 | 酵母启动子(特别是乙醇氧化酶1启动子P) | 合成生物学 | NA | 微流控荧光激活细胞分选(μFACS),分支卷积神经网络(B-CNN) | 分支卷积神经网络(B-CNN),遗传算法 | DNA序列数据,荧光图像数据 | NA | 遗传算法 | 酵母 | 合成启动子设计,代谢途径工程 | 工业生物技术,医药 |
| 755 | 2025-10-05 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
|
研究论文 | 开发了一种基于完全翻译后修饰的合成磷酸化网络平台SPN-FLUX,用于快速实时报告细胞信号事件 | 首次将合成磷酸化网络与分裂荧光/发光蛋白整合,创建了不依赖转录过程的快速响应平台 | 目前仅在哺乳动物细胞模型中验证,尚未在其他生物系统中测试 | 开发能够快速实时监测细胞信号事件的合成生物学工具 | 合成磷酸化网络、分裂荧光蛋白、分裂发光蛋白、哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 合成磷酸化网络、荧光蛋白成像、发光蛋白检测 | NA | 荧光信号、发光信号 | NA | 合成生物学平台设计 | 哺乳动物细胞 | 膜结合受体配体诱导二聚化激活、组成型活性细胞内生物传感器、缺氧响应生物传感器 | 生物医学研究,环境监测 |
| 756 | 2025-10-05 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
|
研究论文 | 开发了一套用于革兰氏阴性细菌的标准化群体感应工具系统 | 基于SEVA质粒架构开发了包含发送器和接收器模块的三种标准化群体感应系统,提供了数学模型和速率参数支持 | 主要针对合成生物学底盘细菌进行测试,在其他细菌物种中的应用可能需要进一步验证 | 开发标准化的群体感应工具以促进合成微生物联盟的工程化 | 革兰氏阴性细菌和合成微生物联盟 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统构建、数学建模 | NA | 实验数据、数学模型参数 | NA | SEVA质粒系统 | 合成生物学底盘细菌 | 群体感应发送器和接收器模块、微生物联盟通信系统 | 工业生物技术 |
| 757 | 2025-10-05 |
Synthetic CRISPR Networks Driven by Transcription Factors via Structure-Switching DNA Translators
2025-Jun-18, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c06913
PMID:40491004
|
研究论文 | 开发了一种通过转录因子调控CRISPR-Cas12a活性的合成生物学平台 | 首次利用工程化DNA转换器实现转录因子对CRISPR-Cas12a反式切割活性的调控 | 仅测试了TATA结合蛋白和Myc-Max两种转录因子模型 | 建立转录因子调控CRISPR-Cas系统的新型合成生物学平台 | CRISPR-Cas12a系统、转录因子、DNA转换器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas12a、DNA结构转换技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a, CRISPR-Cas13a | NA | TF调控的CRISPR网络、人工多分子通讯通路、荧光RNA适体激活系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 758 | 2025-10-05 |
Smart coacervate microdroplets: biomimetic design, material innovations, and emerging applications in biomacromolecule delivery
2025-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.06.016
PMID:40547321
|
综述 | 系统探讨凝聚微滴的设计原理、材料创新及其在生物大分子递送中的前沿应用 | 提出多室结构凝聚系统的仿生设计理念,开发具有环境响应功能的智能递送平台 | 存在热力学不稳定性、载物泄漏和免疫原性等技术瓶颈 | 开发新一代凝聚微滴系统用于生物大分子和活细胞递送 | 凝聚微滴的物理化学特性及功能化材料 | 生物材料 | NA | 液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 多室结构设计 | 医学, 合成生物学 |
| 759 | 2025-10-05 |
Biosynthesis, characterisation and biocompatibility of a unique and elastomeric medium chain-length polyhydroxyalkanoates for kidney glomerular tissue engineering
2025-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.101932
PMID:40547486
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法生产了一种中链长度聚羟基脂肪酸酯(mcl-PHA),并评估其在肾小球组织工程中的生物相容性 | 首次报道了由CH50菌株通过葡萄糖发酵生产的具有独特弹性和低熔点的mcl-PHA,并验证其在肾小球细胞培养中的适用性 | 在增殖条件下胶原IV表达降低,且仅测试了两种肾小球细胞类型 | 开发用于肾小球组织工程的生物相容性生物材料 | 中链长度聚羟基脂肪酸酯(mcl-PHA)及其与人肾小球细胞的相互作用 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 批量发酵、溶剂浇铸薄膜制备、resazurin测定法 | NA | 材料特性数据、细胞代谢活性数据、蛋白质表达数据 | 使用条件性永生化人足细胞(CiHP)和条件性永生化人肾小球内皮细胞(CiGEnC)进行测试 | 合成生物学方法 | CH50菌株 | 通过葡萄糖作为唯一碳源的代谢途径生产mcl-PHA | 医学 |
| 760 | 2025-10-05 |
Bacterial Autonomous Intelligent Microrobots for Biomedical Applications
2025 Mar-Apr, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.70011
PMID:40235203
|
综述 | 本文综述了细菌自主智能微机器人在生物医学领域的传感控制机制、工程设计与应用前景 | 提出利用合成生物学技术将具有自主运动智能的细菌改造为可实现闭环控制的微机器人 | NA | 探讨细菌微机器人在生物医学领域的闭环控制机制与应用发展 | 细菌微机器人的传感控制系统与生物医学应用 | 生物医学工程 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 细菌 | 输入传感器、信号响应与记忆系统 | 医学 |