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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-10-05 |
Review on Advancement of AI in Cell Engineering and Molecular Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_10
PMID:40553333
|
综述 | 本文综述了人工智能在分子生物学和细胞工程领域的最新进展与应用 | 展示了AI在组织工程研究中通过自动识别组织水平模式和设计原则带来的全新研究范式 | NA | 探讨人工智能在分子生物学和细胞工程领域的应用潜力 | 分子生物学机制和细胞工程应用 | 机器学习 | NA | NA | 机器学习 | 分子数据、生物医学图像 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 762 | 2025-10-05 |
Artificial Intelligence in CRISPR-Cas Systems: A Review of Tool Applications
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_14
PMID:40553337
|
综述 | 本文综述了人工智能在CRISPR-Cas系统工具应用中的整合与发展 | 将人工智能与CRISPR-Cas系统相结合,为基因工程研究开辟新视角 | NA | 探讨人工智能在基因编辑工具中的应用潜力 | CRISPR-Cas系统与人工智能的整合应用 | 机器学习 | NA | 深度学习、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 763 | 2025-10-05 |
Review on Advancement of AI in Synthetic Biology
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4690-8_26
PMID:40553349
|
综述 | 探讨人工智能在合成生物学领域的最新进展及其应用 | 系统阐述AI技术如何推动合成生物学在预测建模、系统优化和生物系统设计方面的革新 | 高质量生物数据集匮乏,计算与实验科学家之间存在跨学科鸿沟 | 分析人工智能与合成生物学交叉融合的发展现状与未来前景 | 合成生物学中的基因组编辑、代谢通路优化和生物电路设计 | 机器学习 | NA | 深度学习,机器学习 | NA | 生物数据集 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 基因电路开发 | 医学, 生物技术, 环境 |
| 764 | 2025-10-05 |
Advanced Antibacterial Strategies for Combatting Biomaterial-Associated Infections: A Comprehensive Review
2024 Nov-Dec, Wiley interdisciplinary reviews. Nanomedicine and nanobiotechnology
DOI:10.1002/wnan.2018
PMID:39654369
|
综述 | 全面探讨生物材料相关感染的抗菌策略及其机制 | 系统分析多功能抗菌生物材料的集成机制,并提出合成生物学作为对抗抗菌耐药性的新途径 | NA | 指导高效生物相容性抗菌生物材料的设计与开发 | 生物材料表面细菌粘附和生物膜形成机制 | 生物医学工程 | 植入物感染 | NA | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 765 | 2025-10-05 |
Bioengineering tools for the production of pharmaceuticals: current perspective and future outlook
2019-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2019.1682108
PMID:31656120
|
综述 | 本文综述了生物工程工具在药物生产中的应用现状与未来展望 | 系统分析了植物、动物和微生物生物工程工具的最新进展,并提出通过系统生物学和合成生物学结合纳米生物工程工具提升药物生产经济可行性的新途径 | NA | 探讨生物工程工具在药物生物制品生产中的当前应用和未来发展前景 | 植物、动物和微生物生物工程工具 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、纳米生物工程 | NA | NA | NA | NA | 植物,动物,微生物 | NA | 医药 |
| 766 | 2025-10-05 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器平台,用于实现模块化途径区室化以提升生物合成效率 | 利用工程化生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器,通过空间组织酶促反应克服扩散限制反应 | NA | 开发合成生物学平台实现精确通量控制 | 生物分子凝聚物、人工细胞器、2'-岩藻糖基乳糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、途径区室化 | NA | NA | NA | FUSLCD、GCN4支架蛋白 | 大肠杆菌 | 人工细胞器、模块化途径区室化、生物传感器 | 工业生物技术 |
| 767 | 2025-10-05 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
|
研究论文 | 本研究通过在酿酒酵母中构建弗雷德林从头合成途径,结合代谢工程和脂滴工程显著提高了弗雷德林产量 | 首次在酿酒酵母中实现弗雷德林的从头生物合成,通过代谢通路优化和脂滴工程使产量达到创纪录的1500 mg/L | 研究仅在摇瓶发酵规模进行,尚未进行大规模发酵验证 | 开发高效可持续的弗雷德林微生物生产方法 | 弗雷德林(五环三萜类化合物)及其生物合成途径 | 合成生物学 | 癌症 | 代谢工程、脂滴工程、摇瓶发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 弗雷德林从头生物合成途径,包括弗雷德林合酶基因表达、关键酶活性增强、竞争通路代谢流减少 | 医药 |
| 768 | 2025-10-05 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
|
研究论文 | 本研究开发了一种在植物中可预测编程的遗传开关装置 | 首次在植物中实现了基于定量表征遗传元件和计算机模型指导的遗传开关电路设计 | 需要更广泛的遗传元件定量表征和数学建模支持 | 开发可预测和可编程的植物遗传装置 | 植物遗传元件和遗传开关电路 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计、数学建模 | 计算机模型 | 遗传元件定量数据 | 稳定工程化植物 | 遗传电路组装 | 植物 | 遗传开关(相互抑制基因调控装置) | 农业, 环境 |
| 769 | 2025-10-05 |
Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101268
PMID:40300599
|
研究论文 | 提出了一种基于整合酶的细菌接合介导的细胞间DNA信息传递策略 | 首次将整合酶应用于通过水平基因转移实现细胞间DNA信息传递和逻辑控制 | NA | 开发基于整合酶的细胞间DNA信息传递系统 | 大肠杆菌菌株和接合质粒 | 合成生物学 | NA | 细菌接合 | 布尔逻辑门 | NA | NA | 整合酶 | 大肠杆菌 | 双层布尔逻辑门、四层单处理通路、双层多处理系统 | 合成生物学 |
| 770 | 2025-10-05 |
A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate"
2025-Jun-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101300
PMID:40472847
|
综述 | 通过系统生物学视角探讨细胞异质性,提出从细胞角度概念化异质性的框架并总结相关研究工具 | 提出将细胞视为'命运之轮'的系统生物学框架,强调细胞异质性的生物学意义而非技术变异 | NA | 探索细胞异质性的本质及其在干细胞研究和再生医学中的意义 | 人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化 | 系统生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 再生医学, 发育生物学 |
| 771 | 2025-10-05 |
BTG13-related metalloenzymes: Atypical non-heme iron-dependent dioxygenases with unusual coordination patterns and catalytic mechanisms
2025-Mar, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2024.100188
PMID:40538716
|
研究论文 | 本文报道了一种新型非血红素铁依赖性双加氧酶BTG13,其具有独特的四组氨酸和羧化赖氨酸配位中心及非典型催化机制 | 发现具有独特四组氨酸-羧化赖氨酸配位中心的非典型非血红素铁双加氧酶,揭示了修饰Kcx在促进C-C键断裂中的关键作用 | NA | 研究BTG13相关金属酶的配位模式和催化机制及其在合成生物学中的应用潜力 | BTG13相关金属酶及其催化机制 | NA | NA | 分子动力学模拟、量子化学计算、系统发育分析 | NA | NA | NA | NA | 多种生物体 | NA | 合成生物学 |
| 772 | 2025-10-05 |
Structural prediction of potent non-coding RNAs
2025, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.05.002
PMID:40543912
|
综述 | 探讨非编码RNA的结构预测方法及其在生物医学中的功能与应用 | 整合计算与实验技术推进非编码RNA结构预测,并展望多组学数据融合与伦理考量 | 复杂RNA结构建模精度不足,对RNA动态折叠机制理解有限 | 解析非编码RNA结构以理解其生物功能并开发治疗策略 | microRNAs、小干扰RNA、长链非编码RNA等非编码RNA分子 | 计算生物学 | NA | 计算方法与实验技术结合 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 773 | 2025-10-05 |
Harnessing biotechnology for bee pollinator health
2025-Jun-21, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.027
PMID:40545407
|
综述 | 探讨生物技术在应对蜜蜂种群威胁、保护传粉服务方面的创新解决方案 | 提出结合人工智能的组学工具、分子生物处理及合成生物学技术(如工程化肠道微生物组)来增强蜜蜂适应能力 | 未提及具体技术实施的生态风险评估或规模化应用挑战 | 通过生物技术手段保护蜜蜂种群健康以维持全球粮食安全和生物多样性 | 蜜蜂种群及其传粉服务系统 | 生物技术 | NA | 组学工具、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蜜蜂肠道微生物 | 工程化肠道微生物组、人工饲料生物合成通路 | 农业,环境 |
| 774 | 2025-10-05 |
Metabolic engineering for microbial production of sugar acids
2025-May-13, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-025-00973-7
PMID:40361067
|
综述 | 本文综述了微生物生产糖酸的代谢工程策略及其在不同工业领域的应用 | 系统总结了合成生物学工具(如CRISPR-Cas和动态调控回路)在优化糖酸生物生产中的应用进展 | NA | 探讨通过代谢工程优化微生物菌株实现高效糖酸生物合成的策略 | C5和C6糖酸及其生产微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、酶转化、全细胞生物转化、发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | 动态调控回路 | 食品, 建筑, 医疗, 纺织, 聚合物工业 |
| 775 | 2025-10-05 |
Logical regulation of endogenous gene expression using programmable, multi-input processing CRISPR guide RNAs
2024-Aug-12, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae549
PMID:38943344
|
研究论文 | 开发基于可编程多输入处理CRISPR引导RNA的内源基因逻辑调控系统 | 设计条件性gRNA实现高达130倍动态范围和三输入逻辑门(A OR (B AND C))的基因调控 | 未在其他Cas效应器或宿主生物中全面验证系统兼容性 | 实现内源基因的精确逻辑调控以控制代谢过程和细胞形态 | 大肠杆菌内源代谢基因(lacZ、malT、poxB)和细胞骨架基因(ftsZ、mreB) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统, RNA合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 逻辑门电路(包括三输入逻辑门A OR (B AND C)和三种两输入逻辑门), 生物传感器 | 工业生物技术 |
| 776 | 2025-10-05 |
A systematic review on the implementation of advanced and evolutionary biotechnological tools for efficient bioremediation of organophosphorus pesticides
2023-Feb, Chemosphere
IF:8.1Q1
|
综述 | 系统综述先进生物技术工具在有机磷农药生物修复中的应用前景与挑战 | 建立了多种生物修复技术的比较分析框架,提出组合修复策略的协同优势 | NA | 评估高效生物修复有机磷农药的先进生物技术工具实施策略 | 微生物、植物、酶系统及合成生物系统 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学、系统生物学、生物信息学、结构生物学 | NA | NA | NA | 基因编辑、全细胞生物传感器、酶生物传感器 | 植物根际促生菌(PGPR)、微生物 | 代谢通路工程、酶表达调控系统、生物传感系统 | 环境 |
| 777 | 2025-10-05 |
Parsing patterns: Emerging roles of tissue self-organization in health and disease
2024-Jun-20, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.05.016
PMID:38906093
|
综述 | 探讨生物组织自组织模式在胚胎发育和成体组织中的形成机制及其在健康与疾病中的作用 | 提出自组织模式生成是组织稳态和修复的核心机制,并探索通过工程化模式驱动分子回路应用于合成生物学和类器官构建 | NA | 综述组织自组织模式的形成原理及其在生理和病理条件下的作用 | 胚胎组织和成体组织的自组织模式 | 发育生物学 | 炎症性皮肤病、肿瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 模式驱动分子回路 | 医学、合成生物学 |
| 778 | 2025-10-05 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
|
研究论文 | 开发了针对高产细菌纤维素菌株Kosakonia oryzendophytica的合成生物学工具包 | 首次在该底盘菌中系统表征调控元件库并建立高效CRISPR/Cas9无疤痕基因组编辑系统 | NA | 构建用于遗传操作的合成生物学工具包以开发新一代纤维素基功能材料 | Kosakonia oryzendophytica菌株及其细菌纤维素合成机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑、λ Red重组、扫描电子显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | NA | CRISPR-Cas9, λ Red重组系统 | Kosakonia oryzendophytica | 可调表达模块(启动子、核糖体结合位点、终止子)和精确基因组编辑系统 | 材料, 工业生物技术 |
| 779 | 2025-10-05 |
Progress and prospects in metabolic engineering approaches for isoprenoid biosynthesis in microalgae
2025-Jun-18, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02665-y
PMID:40533766
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综述 | 本文综述了微藻中萜类化合物生物合成的代谢工程研究进展与前景 | 系统总结了利用代谢工程工具和合成生物学策略优化微藻天然萜类生物合成途径的最新进展 | NA | 探讨代谢工程方法在微藻萜类化合物生物合成中的应用 | 微藻及其萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、途径工程 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 萜类化合物生物合成途径、碳流向重定向 | 医药、营养保健品、工业生物技术 |
| 780 | 2025-10-05 |
Addressing challenges in microbial manufacturing: Systematic microbial biotechnology
2025-Jun-02, Innovation (Cambridge (Mass.))
DOI:10.1016/j.xinn.2025.100871
PMID:40528882
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研究论文 | 提出系统微生物生物技术框架以解决微生物制造中的挑战 | 提出系统化方法整合多学科技术,通过流程简化、步骤重组和耦合来整体优化微生物制造过程 | NA | 开发定制化技术框架以解决微生物制造工业应用中的瓶颈问题 | 微生物制造过程 | 工业生物技术 | NA | 酶学、合成生物学、代谢工程、发酵、分离工程、人工智能技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 工业生物技术, 环境, 能源 |