合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-05-07	Future-proofing ornamental plants: Cutting-edge strategies for drought resistance and sustainability 2025 May-Jun, Physiologia plantarum IF:5.4Q1 DOI:10.1111/ppl.70255 PMID:40325615	review	本文综述了观赏植物抗旱性研究的最新进展，探讨了干旱胁迫对植物形态、生理、生化及美学价值的影响，并介绍了CRISPR/Cas9、合成生物学和数字表型分析等前沿技术在培育抗旱观赏植物中的应用	整合了多组学方法、先进育种技术和数字工具，加速关键抗旱基因和性状的鉴定，并探讨了表观遗传工程、合成生物学和高通量表型分析在培育更具抗逆性和美学价值的观赏植物中的潜力	虽然对植物干旱胁迫响应的理解取得了显著进展，但如何将这些知识有效转化为观赏植物的实际育种策略仍存在空白	开发抗旱观赏植物，以应对干旱胁迫对观赏园艺的挑战，满足对美观且可持续景观日益增长的需求	观赏植物	园艺学	NA	CRISPR/Cas9, 合成生物学, 数字表型分析, 多组学方法	NA	NA	NA
62	2025-05-07	QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion 2025-Apr-28, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/chem.202500817 PMID:40296212	研究论文	本研究通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白在亚硝酸盐还原过程中的分子机制	揭示了活性位点的结构重组对亚硝酸盐还原机制的关键作用，特别是氢键网络和HONO中间体配位转换的影响	研究主要基于计算模拟，缺乏实验验证	阐明YtfE蛋白在亚硝酸盐还原中的催化机制	大肠杆菌铁中心修复蛋白(YtfE)	计算生物学	NA	QM/MM, QM/MM MD, QM计算	NA	计算模拟数据	NA
63	2025-05-07	Robust and highly efficient transformation method for a minimal mycoplasma cell 2025-Mar-20, Journal of bacteriology IF:2.7Q3 DOI:10.1128/jb.00415-24 PMID:39903184	研究论文	本文报道了一种针对最小细胞JCVI-syn3B的稳健且高效的转化方法	开发了一种高效的转化方法，显著提高了转化效率，并减少了所需的DNA和受体细胞数量	NA	改进最小细胞的转化方法，以促进基因工程和生物学研究	最小细胞JCVI-syn3B	合成生物学	NA	转化方法	NA	NA	小于0.2 mL的培养物，约1×10^10细胞和10 ng质粒DNA
64	2025-05-07	A new flavor of synthetic yeast communities sees the light 2025-Mar-12, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.02008-23 PMID:39912663	综述	本文综述了利用合成生物学策略构建人工酵母群落的最新进展，特别是光遗传学在调控群落表型中的应用	强调了光遗传学技术在合成酵母群落中实现时空调控的创新应用	NA	探索合成微生物群落的构建及其在生态动力学和代谢工程中的应用	合成酵母群落	合成生物学	NA	光遗传学	NA	NA	NA
65	2025-05-07	Innovative logic "AND" gate gene circuits for bladder cancer treatment: preclinical study 2025-Mar-01, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002270 PMID:39903549	research paper	该研究开发了一种名为LAG-DTGC的合成基因电路，用于膀胱癌的精准治疗	创新性地设计了逻辑'AND'门双靶点基因电路，能够整合多个信号以实现膀胱癌细胞信号通路的全面重编程	目前仅进行了临床前研究，尚未进行人体试验	开发针对膀胱癌的精准、低毒治疗方法	膀胱癌细胞	合成生物学	膀胱癌	生物信息学分析	逻辑'AND'门双靶点基因电路(LAG-DTGC)	基因表达数据	NA
66	2025-05-07	Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells 2025-Feb-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00569 PMID:39898483	研究论文	本研究通过合理设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶，探索了其在人类细胞系和原代人类T细胞中的甲基化和基因沉默活性	扩展了对哺乳动物DNMT3A甲基转移酶催化核心的合理设计，并测试了三种dCas9-DNMT3A/3L变体在不同人类细胞系和原代T细胞中的表现	研究主要局限于细胞系和原代T细胞，可能限制了在其他细胞类型或体内环境中的应用和机制理解	扩展表观遗传编辑的合成生物学工具包，并为工程化dCas基础的DNMT在原发性哺乳动物细胞类型中的应用提供路线图	人类细胞系和原代人类T细胞	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9, DNA甲基转移酶技术	dCas9-DNMT3A/3L变体	基因表达和DNA甲基化数据	多种人类细胞系和原代人类T细胞
67	2025-05-07	DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA 2025-Feb-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00649 PMID:39902634	研究论文	介绍了一种名为DRIMS的合成生物学平台，能够高效地进行DNA的删除、替换、插入、突变和合成	开发了一种基于PCR的新型平台DRIMS，通过recA非依赖的重组途径，在单一扩增步骤中完成多种DNA修饰和合成，无需DNA模板	未明确说明平台在大规模或复杂DNA序列处理中的效率限制	加速合成生物学领域的发展及治疗方法的开发	DNA序列的修饰与合成	合成生物学	癌症	PCR, recA非依赖的重组途径	NA	DNA序列	进行了多种DNA操作，包括4次删除、64次替换、4次嵌合抗原受体组件替换、51次人工microRNA插入、5种点突变及8段DNA合成
68	2025-05-07	Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers 2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.4c15442 PMID:39902740	research paper	该研究开发了一种名为IMPACT的新框架，通过合成生物学和生物材料方法实现CAR T细胞的空间控制激活	提出了IMPACT框架，首次实现了通过聚合物介导的解剖学控制IF-THEN门控CAR T细胞	目前仅在鼠类肿瘤模型中进行了验证，尚未在人体中测试	提高CAR T细胞疗法的特异性，减少脱靶毒性	CAR T细胞和肿瘤归巢聚合物	合成生物学	肿瘤	合成生物学和生物材料方法	IF-THEN门控CAR T细胞	NA	鼠类肿瘤模型
69	2025-05-07	Innovations and challenges in collagen and gelatin production through precision fermentation 2025-Feb-06, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2 DOI:10.1007/s11274-025-04276-z PMID:39910024	综述	本文全面综述了通过精密发酵生产胶原蛋白和明胶的创新与挑战	介绍了精密发酵技术在生产重组胶原蛋白和明胶中的应用，减少环境影响并提高产量	面临规模化生产、成本效益和市场整合等挑战	探索更可持续和伦理的生产方法以替代传统动物组织提取	胶原蛋白和明胶	生物技术	NA	精密发酵(PF)、重组技术、合成生物学、生物过程优化	NA	NA	NA
70	2025-05-07	An inorganic mineral-based protocell with prebiotic radiation fitness 2023-12-05, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-023-43272-5 PMID:38052788	research paper	该研究提出了一种基于无机矿物共聚物液滴的耐辐射原始细胞模型，探讨其在极端前生物条件下的适应性	首次构建了具有辐射抗性的分区化原始细胞模型，利用非酶抗氧化系统清除活性氧	未验证该模型在真实前生物环境中的长期稳定性与进化潜力	探索原始细胞在早期地球辐射环境中的生存适应机制	由多聚磷酸盐-锰液滴和三肽液滴组成的复合原始细胞系统	合成生物学	NA	共聚物液滴组装技术	分区化原始细胞模型	生化实验数据	两种共聚物液滴系统（polyP-Mn和polyP-三肽）
71	2025-05-06	Living therapeutics: Precision diagnosis and therapy with engineered bacteria 2025-Oct, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2025.123342 PMID:40252271	综述	本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展，包括理论基础、基因工程和化学修饰技术的应用，以及未来的挑战和前景	总结了合成生物学和化学工程在开发可控性更强、靶向性更高且毒性更低的工程化细菌平台方面的最新进展	未提及具体的临床研究数据或样本量，可能缺乏实际应用的详细评估	探讨工程化细菌在精准肿瘤学中的诊断和治疗潜力	工程化细菌及其在癌症治疗中的应用	合成生物学	癌症	基因工程和化学修饰技术	NA	NA	NA
72	2025-05-06	Synthetic biology of Fusarium for the sustainable production of valuable bioproducts 2025 Jul-Aug, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108579 PMID:40222460	综述	本文综述了利用合成生物学优化镰刀菌属作为可持续生产多种生物制品的高效平台	综述了CRISPR/Cas9、RNA干扰和合成启动子等先进工程技术在优化镰刀菌代谢途径中的应用，以及下一代测序和组学技术对镰刀菌代谢网络理解的扩展	代谢瓶颈、监管复杂性和菌株稳定性等挑战仍是工业规模应用的主要障碍	探索镰刀菌作为可持续细胞工厂的潜力，以生产生物燃料、药品、酶和其他有价值的化合物	镰刀菌属	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9, RNA干扰, 合成启动子, 下一代测序, 组学技术	NA	NA	NA
73	2025-05-06	Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment 2025-May-05, Annals of the New York Academy of Sciences IF:4.1Q1 DOI:10.1111/nyas.15352 PMID:40320966	review	本文提出了一种通过工程化人工微生物群落来个性化调节肠道微生物组并治疗疾病的新方法	整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术，设计定制化微生物群落以执行特定功能	需要进一步的临床试验来评估其安全性、有效性和长期影响	通过精确调控肠道微生物组来治疗代谢紊乱、炎症性疾病和胃肠道感染等疾病	人工微生物群落及其在肠道微生物组中的应用	合成生物学	代谢紊乱、炎症性疾病、胃肠道感染	合成生物学、系统生物学、先进培养技术	NA	NA	NA
74	2025-05-06	Microbial Biosensor for Sensing and Treatment of Intestinal Inflammation 2025-May-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504364 PMID:40323169	研究论文	本文介绍了一种优化的钙卫蛋白生物传感器，用于检测和治疗肠道炎症	开发了一种结合锌摄取调节器（Zur）控制启动子和记忆电路的生物传感器，能够检测并记录体内肠道炎症，同时具备诊断和治疗功能	研究仅在两种独立的小鼠结肠炎模型中进行验证，尚未在人类临床试验中应用	开发用于肠道疾病诊断和治疗的合成生物体	肠道炎症及其生物标志物钙卫蛋白	合成生物学	肠道炎症	合成生物学技术、生物传感器技术	NA	生物标志物数据	两种独立的小鼠结肠炎模型
75	2025-05-06	Semantical and geometrical protein encoding toward enhanced bioactivity and thermostability 2025-May-02, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.98033 PMID:40314227	research paper	提出了一种新的预训练框架，整合了蛋白质一级和三级结构的序列和几何编码器，以提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测	整合了序列和几何编码器，模拟自然选择指导突变方向，并在三个基准测试中展示了卓越性能	现有方法主要依赖蛋白质序列，难以高效编码氨基酸局部环境的几何方面，且缺乏对蛋白质热稳定性预测的基本评估	提高蛋白质工程的功能性和热稳定性预测的准确性和全面性	蛋白质序列和结构	synthetic biology	NA	deep learning	pre-training framework with sequential and geometric encoders	protein sequence and structure data	over 300 deep mutational scanning assays
76	2025-05-06	Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells 2025-May-02, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842 PMID:40319965	综述	本文总结了葡萄糖脱氢酶（GDH）在工业生物催化、辅因子再生、葡萄糖传感器和生物燃料电池等领域的最新研究进展	重点关注了通过分子工程或新型固定化技术提高酶的性能，以及扩展其应用领域	NA	提升葡萄糖脱氢酶在全球性挑战中的贡献，如人类健康诊断、工业生物催化升级和生物能源开发	葡萄糖脱氢酶（GDH）	分子生物学	NA	分子工程、固定化技术	NA	NA	NA
77	2025-05-06	Improved biosynthesis of C4 derivatives by Engineered thiolase 2025-May-02, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001 PMID:40320002	研究论文	通过工程化硫解酶改进C4衍生物的生物合成	开发了一种新型代谢途径，利用大肠杆菌作为宿主，从乙二醇等二碳底物生物合成四碳化合物，并通过定向进化提高了关键酶的催化效率	NA	开发可持续的生物制造策略，将塑料废弃物转化为高价值化学品	乙二醇、1,4-丁二醇、1,2,4-丁三醇和琥珀酸	合成生物学	NA	定向进化、代谢工程	NA	NA	NA
78	2025-05-06	Biotechnological approaches for the production of neuroactive huperzine A 2025-Apr-29, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.04.020 PMID:40311807	综述	本文综述了石杉碱甲（HupA）的神经保护特性及其在治疗神经退行性疾病中的潜力，并探讨了提高其产量的生物技术策略	强调了生物技术在提高HupA产量中的应用，包括化学合成、微生物发酵、植物组织培养和合成生物学方法	目前对HupA生物合成的认识仍存在知识空白，需要进一步研究以开发经济高效的可持续生产方法	探讨HupA在神经退行性疾病治疗中的潜力及提高其产量的生物技术策略	石杉碱甲（HupA）及其在神经退行性疾病中的应用	生物技术	阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化症、癫痫、重症肌无力	化学合成、微生物发酵、植物组织培养、合成生物学	NA	文献综述数据	NA
79	2025-05-04	Construction of P450 scaffold biocatalysts for the biodegradation of five chloroanilines 2025-May-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137305 PMID:39854990	研究论文	本研究通过工程化改造P450BM3单加氧酶的活性位点，开发出新型人工生物催化剂，用于高效降解五种氯苯胺类环境污染物	通过将P450BM3中高度保守的苏氨酸268替换为天冬氨酸，成功诱导了过氧化物酶活性，显著提升了催化效率	NA	开发无需NAD(P)H或双功能小分子辅助的高效生物催化剂，用于环境污染物降解	五种氯苯胺类化合物（4-氯苯胺、2-氯苯胺、2,4-二氯苯胺、3,4-二氯苯胺和3,5-二氯苯胺）	合成生物学	NA	蛋白质工程、UPLC-MS分析	NA	化学分析数据	五种氯苯胺类化合物
80	2025-05-04	Developing a multi-modular assembled prime editing (mPE) system improved precise multi-base insertion efficiency in dicots 2025-May, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.06.021 PMID:38942381	research paper	本研究开发了一种多模块组装的prime editing (mPE)系统，显著提高了双子叶植物中多碱基插入的精确编辑效率	提出了一种新型的多模块组装mPE系统，相比原始PE2系统，在多个基因位点上实现了1.3至1288.5倍的编辑效率提升，特别在多碱基插入方面平均提高了197.9倍	研究主要局限于双子叶模式植物拟南芥和本氏烟草，尚未在其他植物或实际农作物中验证	解决prime editing在双子叶植物中编辑效率低下的问题，开发系统性优化方案	双子叶植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana)	合成生物学	NA	农杆菌介导转化、深度扩增子测序(0.2-0.5 million clean total reads)	prime editing系统优化模型	基因组测序数据	大规模转化实验（具体数量未明确说明）