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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-05-02 |
Cardiomyocyte engineering: The meeting point of transcription factors, signaling networks, metabolism and function
2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.14271
PMID:39801134
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review | 本文综述了直接心脏重编程或转分化的最新进展,包括转录因子、信号网络、代谢和功能在心肌细胞工程中的交汇点 | 探讨了合成生物学,特别是CRISPR系统在将特定成纤维细胞亚群定向转化为心肌细胞中的潜力 | 尽管有多种新方法,但获得功能和代谢成熟的心肌细胞仍然是一个挑战 | 总结当前关于人类心脏成纤维细胞功能和多样性的知识,以及体外人类心肌细胞模型的替代细胞来源 | 心肌细胞、成纤维细胞、转录因子、信号网络、代谢 | 再生医学 | 心血管疾病 | CRISPR | NA | NA | NA |
62 | 2025-05-02 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
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研究论文 | 本文构建了一个由信号响应性DNA纳米筏、生物源孔和巨型单层囊泡(GUVs)组成的合成细胞模型,展示了纳米尺度DNA筏的重塑如何与微尺度GUVs的重塑相耦合 | 通过可重构DNA纳米筏实现了合成细胞的形态重塑和膜通道形成,扩展了DNA纳米技术在合成生物学中的潜力 | NA | 探索DNA纳米结构与合成细胞的界面,实现细胞形态的程序化重塑 | 合成细胞模型(DNA纳米筏、生物源孔、巨型单层囊泡) | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
63 | 2025-05-02 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-Jan-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本文研究了利用量子隧道传输和机器学习技术对八种人工合成DNA碱基进行电学识别 | 结合量子隧道纳米间隙结和机器学习技术,实现了对人工合成DNA碱基的高精度电学识别,预测准确率高达100% | 研究仅针对八种特定的人工合成DNA碱基,未涉及更复杂的DNA序列或自然DNA | 开发一种高灵敏度、高精度的电学识别方法,用于人工合成DNA碱基的快速准确识别 | 八种人工合成的DNA碱基 | 机器学习 | NA | 量子隧道传输 | 机器学习模型 | 电传输信号 | 八种人工合成DNA碱基的数据集 |
64 | 2025-05-02 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
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综述 | 本文综述了遗传工程技术在提高曲霉属真菌有机酸产量方面的最新进展和未来方向 | 重点介绍了CRISPR生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用和挑战 | 未提及具体实验数据或样本量 | 提高曲霉属真菌在工业有机酸生产中的效率 | 曲霉属真菌 | 合成生物学 | NA | 遗传工程技术、CRISPR | NA | NA | NA |
65 | 2025-05-02 |
A cross-species inducible system for enhanced protein expression and multiplexed metabolic pathway fine-tuning in bacteria
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1315
PMID:39797735
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研究论文 | 本研究设计并展示了一个跨物种诱导系统的稳健工作流程,用于增强蛋白质表达和多路代谢途径的精细调控 | 开发了两种重建的诱导系统(PphlF3R1和Ptet2R2*),并在三种模型微生物中验证其功能,进一步用于开发单输入遗传电路 | NA | 开发跨物种诱导系统,用于蛋白质表达和代谢途径控制 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒状杆菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 三种模型微生物 |
66 | 2025-05-02 |
Engineered Bacteria for Disease Diagnosis and Treatment Using Synthetic Biology
2025-Jan, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70080
PMID:39801378
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术改造细菌作为微型机器人用于疾病诊断和治疗的研究现状 | 利用合成生物学技术改造细菌,使其能够作为微生物联合体提高诊断准确性和治疗效果 | 细菌的长期存活和安全性、非模型菌株的底盘微生物和基因编辑技术开发、潜在毒性最小化以及与宿主微生物群的相互作用理解仍存在挑战 | 研究工程化细菌在疾病诊断和治疗中的应用 | 工程化细菌和微生物联合体 | 合成生物学 | 癌症、肠道疾病、代谢紊乱 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
67 | 2025-05-02 |
Mining metagenomes from extremophiles as a resource for novel glycoside hydrolases for industrial applications
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.02.008
PMID:40288852
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review | 该综述探讨了从极端微生物的宏基因组中挖掘新型糖苷水解酶(GHs)及其工业应用潜力 | 利用宏基因组学技术直接从环境DNA中识别新型GH编码基因,避免实验室培养极端微生物的需求 | 极端微生物来源基因在常温宿主中的表达、活性产量低以及规模化生产仍面临挑战 | 探索极端微生物宏基因组作为新型糖苷水解酶的资源,以促进绿色工业应用 | 极端微生物及其产生的糖苷水解酶 | 合成生物学与蛋白质工程 | NA | 高通量测序与生物信息学分析 | 机器学习(用于预测功能注释) | 环境DNA序列数据 | NA |
68 | 2025-05-02 |
Biochemical evaluation of molecular parts for flavonoid production using plant synthetic biology
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1528122
PMID:40303856
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review | 本文综述了利用植物合成生物学优化黄酮类化合物生产所需的分子部件和酶 | 总结了不同植物来源的天然和工程化分子部件的酶动力学,为黄酮类化合物的可持续生产提供了分子部件选择、设备设计和途径重构的见解 | 未提及具体的实验验证或生产量数据 | 通过植物合成生物学优化黄酮类化合物的生产 | 黄酮类化合物的生物合成途径及其分子部件 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 文献数据 | NA |
69 | 2025-05-02 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 介绍了一种基于开放硬件的微流体工作流程,用于通过培养单细胞在凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落来分析质粒保留 | 采用开源硬件微流体工作流程,提供精确的流量控制和温度管理,增强易用性、稳健性和可访问性 | 研究以大肠杆菌为实验模型,方法的普适性有待进一步验证 | 分析质粒保留,为合成生物学提供技术支持 | 质粒和单细胞微菌落 | 合成生物学 | NA | 微流体技术、荧光显微镜 | NA | 图像数据 | 大量微滴和微菌落 |
70 | 2025-05-02 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从石栎属植物中克隆了查尔酮合成酶基因,并进行了生物信息学分析和功能表征 | 首次从石栎属植物中鉴定出两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2),并验证了其催化合成根皮素的功能 | 仅在大肠杆菌中验证了基因功能,未在植物体内进行验证 | 探索石栎属植物中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能 | 石栎属植物的CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | 合成生物学 | NA | 转录组数据分析、生物信息学分析、大肠杆菌异源表达 | NA | 基因序列数据 | 2个CHS基因 |
71 | 2025-05-01 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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research paper | 该文章探讨了利用合成生物学和代谢工程优化微生物细胞工厂生产萜类食品成分的方法 | 提出了通过优化异源合成途径、底盘前体供应和整合合成调控电路来提升萜类食品成分的生产效率 | 未提及具体的实验数据或样本规模,可能缺乏实际应用的验证 | 提高萜类食品成分的微生物生产效率 | 微生物细胞工厂和萜类食品成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA |
72 | 2025-05-01 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-Apr-30, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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research paper | 提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相生成细胞大小脂质体的新方法 | 采用高速激光诱导微射流技术可靠且重复地生成细胞大小脂质体,实现了按需生产 | 未提及方法的具体产量和成本效益分析 | 开发一种新型细胞大小脂质体生成技术 | 细胞大小脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术 | NA | 高速摄像数据 | 未明确说明样本数量 |
73 | 2025-05-01 |
Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation
2025-Apr-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101268
PMID:40300599
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research paper | 介绍了一种通过细菌接合实现基于整合酶的细胞间DNA信息传递的策略 | 首次利用整合酶通过细菌接合实现细胞间DNA信息传递及其调控 | 未提及具体实验规模或应用场景的限制 | 探索整合酶在细胞间DNA信息传递和系统合成生物学中的应用 | 细菌(E. coli)及其接合质粒 | 合成生物学 | NA | 细菌接合、整合酶介导的DNA重组 | 布尔逻辑门 | DNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量 |
74 | 2025-05-01 |
Structural dynamics of a designed peptide pore under an external electric field
2025-Mar, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2024.107380
PMID:39752811
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研究论文 | 研究通过分子动力学模拟和实验记录探讨了设计肽孔在外部电场下的结构动态 | 在GENESIS MD模拟包中实现了均匀外部电场功能,用于研究设计肽孔的结构动态 | NA | 研究膜电位对设计肽孔结构稳定性和动态的影响 | 设计肽孔 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟(MD), 单通道电流记录实验 | NA | 模拟数据, 实验数据 | NA |
75 | 2025-05-01 |
Orthogonal RNA replication enables directed evolution and Darwinian adaptation in mammalian cells
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01783-2
PMID:39753704
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研究论文 | 开发了一种正交RNA复制系统,用于在哺乳动物细胞中进行定向进化和达尔文适应 | 设计了一个正交的RNA复制系统,克服了现有哺乳动物定向进化方法的瓶颈,如宿主基因组干扰、文库规模小和不可控突变 | 未提及具体的技术限制或应用范围限制 | 推进合成生物学和细胞工程应用 | 哺乳动物细胞中的RNA设备 | 合成生物学 | NA | 正交RNA复制系统 | NA | RNA序列数据 | 未提及具体样本数量 |
76 | 2025-05-01 |
Advances in bacterial glycoprotein engineering: A critical review of current technologies, emerging challenges, and future directions
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108514
PMID:39755221
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review | 本文综述了细菌糖蛋白工程领域的最新进展,重点关注合成生物学和代谢工程视角下的新技术、挑战及未来方向 | 强调了利用合成生物学技术开发微生物糖工厂和无细胞系统进行高效糖蛋白生产的新方法 | 未具体提及当前技术的具体局限性,但指出了天然糖基化途径的不足 | 探讨细菌糖蛋白工程在合成生物学应用中的潜力,特别是在新型糖蛋白治疗药物和疫苗开发方面 | 细菌糖基化系统及其在糖蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白糖偶联技术 | NA | NA | NA |
77 | 2025-05-01 |
New insights of advanced biotechnological engineering strategies for tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza
2025-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112384
PMID:39756484
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review | 本文综述了丹参中丹参酮生物合成的生物技术工程策略的最新进展 | 总结了丹参酮的生物活性、生物合成途径及调控、转录调控网络、表观遗传修饰和合成生物学的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证研究支持 | 提高丹参中丹参酮的产量,开发高质量的丹参资源 | 丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)及其主要生物活性成分丹参酮 | 生物技术 | 心血管和脑血管疾病 | 合成生物学、表观遗传修饰 | NA | NA | NA |
78 | 2025-05-01 |
Customized design of host-independent T7 expression system (HITES) for a broad host range
2025-Feb, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.12.012
PMID:39778814
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研究论文 | 本文开发了一种定制设计方法,利用宿主独立的T7表达系统(HITES),促进T7表达系统的合理设计和快速构建 | 发现了EL值在T7表达系统成功构建中的关键作用,并提出了测量EL值的方法,同时展示了在不同宿主菌株中高效表达蛋白质的能力 | 研究主要集中在E. coli DH5α宿主菌株,对其他宿主菌株的应用可能还需要进一步验证 | 开发一种通用的T7表达系统构建方法,以促进合成生物学和代谢工程中的蛋白质表达和目标化学品生产 | T7表达系统及其在不同宿主菌株中的应用 | 合成生物学 | NA | T7表达系统构建 | NA | NA | 13种宿主菌株 |
79 | 2025-05-01 |
Genetic Code Expansion: Recent Developments and Emerging Applications
2025-Jan-22, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00216
PMID:39737807
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review | 本文综述了遗传密码扩展(GCE)技术在化学和合成生物学领域的最新发展和应用 | 详细介绍了GCE技术的优化和进展,包括aaRS/tRNA系统的优化、筛选方法的改进以及非经典氨基酸的生物合成 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据或样本分析 | 探讨GCE技术在生物学和医学研究中的应用潜力 | 遗传密码扩展技术及其在合成生物学和医学中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传密码扩展(GCE)技术 | NA | NA | NA |
80 | 2025-05-01 |
Fine-Tuning Genetic Circuits via Host Context and RBS Modulation
2025-Jan-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00551
PMID:39754601
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研究论文 | 本研究通过改变核糖体结合位点组成和宿主环境,探索了遗传开关的设计空间,并展示了如何通过这些变化来精细调节开关的性能 | 将宿主环境重新概念化为合成生物学家工具箱中的重要部分,展示了通过结合核糖体结合位点和宿主环境调节来精细调节遗传开关性能的新方法 | 仅测试了9种核糖体结合位点组成和3种宿主环境,设计空间的探索可能不够全面 | 探索遗传开关的设计空间,并开发精细调节其性能的方法 | 遗传开关(toggle switch) | 合成生物学 | NA | 遗传电路工程 | NA | 遗传性能数据 | 27种电路变体(9种核糖体结合位点×3种宿主环境) |