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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-12-03 |
Expanding the frontiers of microbial biosynthesis with synthetic microbial communities
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103351
PMID:40886452
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综述 | 本文综述了合成微生物群落在微生物合成领域的最新进展,讨论了其优势、功能,并提出了一个设计框架,重点关注通过微生物相互作用进行种群控制 | 通过理性途径分区和明确的微生物相互作用,合成微生物群落缓解了单一培养的局限性,如代谢负担、途径抑制和副产物积累,从而扩展了微生物生物合成的前沿 | NA | 探讨合成微生物群落在微生物生物合成中的应用,以扩展其前沿 | 合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 62 | 2025-12-03 |
Microbial biomolecular condensates: from conserved principles to synthetic biology opportunities
2025-Dec, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102677
PMID:41086652
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综述 | 本文综述了微生物生物分子凝聚体的普遍存在性、保守的物理原理及其在合成生物学中的应用潜力 | 将生物分子凝聚体视为一种广泛存在于微生物界的模块化区室化策略,并探讨了其保守的物理原理如何通过进化力量适应不同的细胞需求,为合成生物学中可编程凝聚体的设计提供了新视角 | NA | 探讨微生物生物分子凝聚体的运作原理及其在合成生物学中的应用机会 | 微生物生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可编程凝聚体 | 合成生物学 |
| 63 | 2025-12-03 |
Next-Generation Probiotics: From Traditional Strains to Personalized Therapeutics
2025-Dec-01, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70339
PMID:41327880
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综述 | 本文比较了传统益生菌与下一代益生菌(NGPs),探讨了NGPs的特定功能、合成生物学创新以及个性化治疗前景 | 强调下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila和Faecalibacterium prausnitzii)的靶向机制,并整合合成生物学、人工智能和组学技术以实现个性化治疗 | 广泛的临床应用仍处于早期阶段,存在安全性、监管和转化挑战 | 比较传统与下一代益生菌,探索个性化益生菌疗法的潜力 | 传统益生菌(如乳酸杆菌和双歧杆菌)与下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila和Faecalibacterium prausnitzii) | NA | NA | 合成生物学、组学技术、人工智能、微生物组分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 可编程基因电路 | 医学 |
| 64 | 2025-12-03 |
Architects of plant immunity: Structure-informed strategies for engineering plant nucleotide-binding leucine-rich repeat receptors
2025-Nov-30, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102828
PMID:41325717
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综述 | 本文综述了基于结构信息工程化植物NLR受体以增强植物免疫系统的策略 | 结合分子结构理解和合成生物学工具,开发了针对NLR受体的工程化方法,如整合域工程和LRR表面重塑,以扩展病原体识别能力 | NA | 工程化植物核苷酸结合富含亮氨酸重复序列(NLR)受体,以增强植物对病原体的免疫反应 | 植物NLR受体及其结构 | 合成生物学 | 植物病害 | 结构建模、合成生物学工具 | NA | 结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 65 | 2025-12-03 |
Engineering lignin pathway and plant cell wall modification and genome editing for advanced renewable bioenergy and material applications
2025-Nov-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108772
PMID:41325824
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综述 | 本文综述了木质素生物合成、植物细胞壁工程及其在可再生生物能源和可持续生物材料应用中的进展,重点关注CRISPR/Cas基因组编辑等新兴工具 | 整合了木质素生物合成的遗传、转录、表观遗传和代谢网络知识,并提出了结合多组学、单细胞技术、机器学习和田间验证的未来研究方向 | 从实验室到田间的转化仍有限,存在未解决的挑战如单体木质醇运输、代谢通量控制和物种特异性调控差异 | 通过工程化木质素和修饰植物细胞壁,推动可再生生物能源、先进生物材料和循环生物经济的发展 | 木质素生物合成途径、植物细胞壁修饰及基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、合成启动子、代谢重布线 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 代谢途径工程 | 能源, 材料, 医药, 工业生物技术 |
| 66 | 2025-12-03 |
Perspectives on Synthetic Protein Circuits in Mammalian Cells
2024-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2024.100555
PMID:39372446
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综述 | 本文综述了哺乳动物细胞中合成蛋白质电路的设计原理、工具及其在生物医学领域的应用前景 | 系统梳理了基于蛋白质翻译后修饰(如蛋白水解和磷酸化)的合成生物学工具包,并提出了从工具开发到临床前应用的转化框架 | NA | 探讨合成蛋白质电路在哺乳动物细胞工程化中的应用潜力与设计策略 | 哺乳动物细胞中的合成蛋白质电路 | 合成生物学 | 癌症 | 蛋白质工程、翻译后修饰调控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | 哺乳动物细胞 | 基于蛋白水解、磷酸化或可编程结合的合成蛋白质电路,用于重编程细胞行为 | 医学 |
| 67 | 2025-12-02 |
Engineered Peptide Scrambling for Enhanced Drug Delivery to Resistant Breast Cancer Cells via Small Extracellular Vesicles
2025-Dec-01, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00582
PMID:41321158
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研究论文 | 本研究利用工程化肽序列打乱策略,通过小细胞外囊泡增强药物向耐药乳腺癌细胞的靶向递送 | 开发了基于双报告基因平台的高通量小细胞外囊泡表征方法,并首次通过系统性的氨基酸序列打乱设计,筛选出能增强肿瘤靶向结合能力的肽变体,结合机械刺激增强药物装载,显著提升了耐药癌细胞的杀伤效果 | 研究仅在MDA-MB-231细胞系中进行体外验证,尚未在动物模型或临床样本中测试;仅测试了uPAR结合肽的打乱变体,未探索其他靶向肽 | 优化基于小细胞外囊泡的肿瘤靶向药物递送系统,以克服耐药性 | 小细胞外囊泡、工程化靶向肽、耐药乳腺癌细胞(MDA-MB-231) | 合成生物学 | 乳腺癌 | 双报告基因平台、生物发光检测、荧光显微镜、体外细胞摄取实验 | NA | 体外细胞实验数据、成像数据 | 24种uPAR结合肽的打乱变体,使用HEK293FT细胞生产囊泡,MDA-MB-231细胞进行测试 | 肽工程、细胞外囊泡功能化 | HEK293FT细胞(人胚肾细胞)、MDA-MB-231细胞(人乳腺癌细胞) | 靶向肽功能化的小细胞外囊泡作为药物递送载体,结合机械刺激增强药物被动装载 | 医学 |
| 68 | 2025-12-02 |
Recent Advances in Bio-Based Production of Free Heme Using Microbial Metabolic Engineering
2025-Dec-01, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500434
PMID:41324255
|
综述 | 本文综述了利用微生物代谢工程生物基生产游离血红素的最新进展 | 系统总结了利用代谢工程和合成生物学策略,通过微生物生产血红素这一可持续替代方案,以克服传统生产方法的高成本、伦理和环境问题 | NA | 综述血红素的生物基生产方法,探讨其作为传统生产方法可持续替代方案的潜力 | 血红素及其卟啉中间体 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医药、食品添加剂、生物技术 |
| 69 | 2025-12-02 |
Bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbons contaminated soils/water for environmental remediation
2025-Dec-01, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10229-y
PMID:41324725
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综述 | 本文综述了利用微生物生物修复技术降解土壤/水中多环芳烃(PAHs)污染的研究进展 | 探讨了生物表面活性剂、生物膜及微生物群落协同作用在增强PAHs生物降解效率中的应用,并强调了基因工程、合成生物学和纳米技术等前沿工具在提升降解能力方面的潜力 | NA | 研究利用微生物生物修复技术可持续地去除环境中的PAHs污染 | 多环芳烃(如萘、菲、蒽、芘)及其在土壤/水中的污染 | 环境科学 | NA | 微生物降解、基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | 假单胞菌、分枝杆菌、红球菌、Novosphingobium属海洋物种 | NA | 环境 |
| 70 | 2025-12-02 |
A comprehensive review on marine algal polysaccharide-mediated siRNA delivery systems for biofuel production
2025-Nov-29, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2025.109779
PMID:41319500
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综述 | 本文全面综述了利用海洋藻类多糖(如海藻酸盐、卡拉胶、岩藻聚糖和绿藻多糖)作为siRNA递送载体,用于调控微藻代谢途径以促进生物燃料生产的研究进展 | 系统评估了多种海洋多糖作为siRNA递送载体的结构特性与性能,并探讨了将CRISPR RNAi混合策略、AI辅助纳米载体优化和可编程藻类基因电路等新兴技术整合到该平台中的潜力 | 讨论了物种依赖性摄取差异、生态学考量以及与多糖提取和纳米颗粒配方相关的技术经济限制 | 开发基于海洋多糖的siRNA递送系统,以克服微藻生物燃料生产中的代谢瓶颈,实现可扩展和精准控制的代谢工程 | 海洋藻类(如微拟球藻和衣藻)及其代谢途径 | 合成生物学与代谢工程 | NA | siRNA介导的基因沉默、代谢通量建模、纳米颗粒递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR RNAi混合策略、可编程藻类基因电路 | Nannochloropsis, Chlamydomonas | 动态基因电路设计 | 能源, 工业生物技术 |
| 71 | 2025-12-02 |
Nanobody CAR-T cells in cancer: From molecular design to clinical translation
2025-Nov-29, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118819
PMID:41319516
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综述 | 本文综述了基于纳米抗体的嵌合抗原受体T细胞疗法,从分子设计到临床转化的全过程 | 利用单域抗体设计结构上的进步,增强了肿瘤靶向性、安全性和可制造性,为开发双特异性、三价和逻辑门控CAR形式提供了灵活平台 | 面临肿瘤异质性、免疫逃逸和T细胞耗竭等挑战 | 探讨纳米抗体CAR-T细胞疗法在癌症治疗中的应用潜力 | 纳米抗体CAR-T细胞 | NA | 血液系统恶性肿瘤、实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | T细胞 | 双特异性、三价、逻辑门控CAR形式 | 医学 |
| 72 | 2025-12-02 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2025-Nov-28, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
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研究论文 | 本研究开发了一个基于酵母转化相关重组(TAR)技术的伪狂犬病毒(PRV)基因组组装平台,成功从头合成并拯救了功能性病毒 | 利用TAR技术构建PRV基因组组装平台,结合体外CRISPR/Cas9编辑插入egfp基因,实现了对高GC含量、复杂重复序列病毒基因组的快速灵活修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在体外表现出病毒滴度降低和噬斑尺寸减小,且在BALB/c小鼠中仍能引起致死性感染,毒力未完全减弱 | 开发伪狂犬病毒(PRV)的基因组编辑平台,以促进病毒减毒和疫苗载体开发 | 伪狂犬病毒(PRV),特别是基因型II变异株PRV-GX-2011 | 合成生物学 | 伪狂犬病(由伪狂犬病毒引起) | 酵母转化相关重组(TAR),CRISPR/Cas9基因组编辑,噬斑纯化 | NA | 基因组序列数据 | 一个病毒株(PRV-GX-2011)及其衍生合成病毒(PRV-GX-Syn1),使用Vero细胞和BALB/c小鼠进行实验 | CRISPR-Cas9, TAR | 酿酒酵母(用于TAR组装),Vero细胞(哺乳动物细胞,用于病毒拯救) | NA | 医学(疫苗开发) |
| 73 | 2025-12-02 |
Optogenetic tools for optimizing key signalling nodes in synthetic biology
2025-Nov-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108770
PMID:41317977
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综述 | 本文综述了光遗传学工具在合成生物学中调控关键信号节点的应用,包括其在微生物代谢、植物科学和疾病治疗中的最新进展 | 将光遗传学工具按不同应用分为五类,系统阐述了其在时空精确调控酶活性或基因表达方面的创新潜力,超越了传统的化学诱导或基因过表达/敲除策略 | NA | 为合成生物学领域的基础研究和生物产业提供全面的光遗传学策略概述 | 光遗传学工具及其在微生物、植物和动物系统中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 微生物, 植物, 动物 | 光诱导基因表达调控、光触发液-液相分离模块、光诱导亚细胞定位光感受器、光调控酶、光门控离子通道和泵 | 工业生物技术, 农业, 医学 |
| 74 | 2025-12-02 |
Artificial cells with liquid-liquid phase separation-regulated cell-free protein synthesis
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511283122
PMID:41269793
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研究论文 | 本文通过液-液相分离调控无细胞蛋白质合成,构建了具有可控蛋白质表达的人工细胞 | 利用含多价关联基团的工程聚合物,通过液-液相分离诱导蛋白质聚集,实现无细胞蛋白质合成活性的可逆调控和精确时间控制 | 未明确提及具体限制,但暗示在工程化人工细胞调控蛋白质表达方面仍存在显著局限 | 开发能够调控蛋白质表达的人工细胞,并探索其在生物医学应用中的潜力 | 人工细胞、无细胞蛋白质合成系统、工程聚合物、微流控平台制备的巨型单层囊泡 | 合成生物学 | 肝损伤 | 液-液相分离、微流控技术、无细胞蛋白质合成 | NA | 实验数据 | 使用胆管结扎小鼠模型进行体内研究 | NA | NA | 基于液-液相分离的蛋白质聚集调控机制,用于可控反应过程 | 医学 |
| 75 | 2025-12-02 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIONEER的模块化平台,用于在酵母的周质空间中展示肽、蛋白质和纳米抗体,以直接研究膜蛋白功能 | PIONEER平台通过优化分泌信号和展示支架,实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导,标志着从单纯结合筛选向功能优先筛选的关键进步 | 尽管已应用于GPCRs,但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白目标的适应性仍需进一步验证 | 开发一种用于合成生物学筛选的周质展示平台,以研究遗传编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体以及人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 周质展示技术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 自分泌信号传导系统 | 医学 |
| 76 | 2025-12-02 |
The International Risk Governance Council: Reflections on a 20-Year Experiment in Support of Improved Risk Governance
2025-Nov, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.70117
PMID:41047369
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评论 | 本文回顾了国际风险治理理事会(IRGC)20年的历史、活动及其在多个新兴风险领域的工作成果 | 通过六个案例研究(如太阳辐射管理、合成生物学等)系统总结了IRGC在风险治理方面的贡献,并强调了中立召集机构的重要性 | NA | 评估IRGC作为风险治理支持机构的历史作用与影响 | 国际风险治理理事会(IRGC)及其在多个风险领域的治理活动 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2025-12-02 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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研究论文 | 本文介绍了一种基于正介电泳诱导确定性横向位移的拉曼激活细胞分选技术,用于无标记高通量分选基因组范围随机诱变库中的代谢性状细胞 | 开发了pDEP-DLD-RACS技术,首次实现了对快速移动单细胞的高精度、高通量、长时稳定分选,并直接应用于基因组范围诱变库的代谢性状筛选 | NA | 开发一种无标记、非侵入性的高通量细胞分选平台,用于筛选代谢性状 | 色素和油脂生产酵母细胞,以及基因组范围随机诱变库中的突变体 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术,正介电泳诱导确定性横向位移 | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机诱变库中超过10个物种的突变体 | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 78 | 2025-12-01 |
Synthetic bacterium-facilitated colonization of nitrogen-fixing bacteria for remodeling the rhizosphere microbiome and improving plant yield
2025-Nov-29, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02189-5
PMID:41318663
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研究论文 | 本研究开发了一种合成细菌EcCMC,通过表达多糖识别蛋白增强固氮菌在豆科植物根际的定殖能力,从而提高土壤肥力和植物产量 | 首次利用合成生物学方法设计表达多糖结合蛋白的工程菌,显著增强固氮菌在植物根系的定殖效率 | 研究仅针对两种豆科植物进行测试,样本量较小(n=3),且未评估长期生态影响 | 通过合成生物学方法改善根际微生物组,增强生物固氮作用和提高作物产量 | 紫云英(Astragalus sinicus)和紫花苜蓿(Medicago sativa)及其根际微生物组 | 合成生物学 | NA | 16S rRNA基因扩增子测序,代谢组学分析,固氮酶活性测定 | NA | 微生物组测序数据,代谢组数据,生化指标数据 | 每组3个重复,共9个样本 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(E. coli) | 表达表面展示多糖识别蛋白Cmc的合成细菌系统 | 农业 |
| 79 | 2025-12-01 |
Microbial computing: Review and perspectives
2025-Nov-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
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综述 | 回顾微生物计算的发展历程,分析当前面临的挑战,并提出基于储层计算的新研究视角 | 提出采用自上而下的储层计算框架,利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 当前自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探索微生物计算在生物生产、生物修复和生物医学等领域的应用潜力 | 微生物计算机和生物计算系统 | 合成生物学 | NA | NA | 数字逻辑、模拟架构、神经形态架构、储层计算 | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 微生物 | 逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器 | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 80 | 2025-12-01 |
Construction of an mKate-based fluorescent protein reporting system in Limosilactobacillus reuteri
2025-Nov-26, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107347
PMID:41314353
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研究论文 | 本研究在罗伊氏乳杆菌中建立了mKate红色荧光蛋白报告系统 | 首次在罗伊氏乳杆菌中构建基于mKate的荧光报告系统,实现了细菌定位和基因表达的实时监测 | NA | 开发适用于罗伊氏乳杆菌的合成生物学工具平台 | 罗伊氏乳杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传转化系统、荧光蛋白报告系统 | NA | 荧光成像数据 | NA | 遗传转化 | 罗伊氏乳杆菌 | mKate红色荧光蛋白报告系统 | 工业生物技术 |