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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-04-22 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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research paper | 该文章探讨了利用合成生物学和代谢工程优化微生物细胞工厂生产萜类食品添加剂的方法 | 提出了通过优化异源合成途径、整合合成调控电路以及提高遗传和代谢稳定性来提升萜类食品添加剂的生产效率 | 未提及具体的实验数据或案例研究,可能缺乏实际应用的验证 | 提高微生物生产萜类食品添加剂的效率和规模 | 微生物细胞工厂和萜类食品添加剂 | 合成生物学 | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA |
62 | 2025-04-22 |
Development and construction of a novel Bacillus subtilis autoinducible extracellular expression system based on a LuxI/R device
2025-Apr-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02719-8
PMID:40251612
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研究论文 | 开发了一种基于LuxI/R型群体感应系统的新型枯草芽孢杆菌自诱导胞外表达系统 | 首次通过改造感应模块启动子SPluxI序列和响应模块启动子RPluxIR6的lux盒拷贝数,增强了lux系统在枯草芽孢杆菌中的自诱导表达 | NA | 开发高效的枯草芽孢杆菌自诱导胞外表达系统,用于重组蛋白的工业生产 | 枯草芽孢杆菌和LuxI/R型群体感应系统 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统(QS)、启动子工程、发酵 | NA | NA | 摇瓶和3-L发酵罐发酵 |
63 | 2025-04-22 |
Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida
2025-Apr-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08039-2
PMID:40251395
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法,显著提高了恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 提出了一种分子和宿主无关的主动学习过程,用于培养基优化,并通过可解释的人工智能技术发现盐是影响产量的关键因素 | 未明确说明该方法在其他微生物或化学物质生产中的适用性 | 优化培养基以提高恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 恶臭假单胞菌KT2440 | 合成生物学 | NA | 机器学习,半自动化流程 | 主动学习 | 实验数据 | 三个不同的黄酮醇生产实验 |
64 | 2025-04-21 |
Current application and future prospects of CRISPR-Cas in lactic acid Bacteria: A review
2025-May, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.116315
PMID:40253208
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综述 | 本文综述了CRISPR-Cas系统在乳酸菌工程中的当前应用及未来前景 | 探讨了CRISPR-Cas系统在乳酸菌基因组编辑、代谢工程和合成生物学中的革命性应用及其在食品科学中的创新潜力 | 当前基因组编辑工具耗时且劳动密集型,限制了乳酸菌作为发酵食品功能增强剂的潜力开发 | 利用CRISPR-Cas系统推动乳酸菌研究及食品科学创新 | 乳酸菌(LABs) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |
65 | 2025-04-21 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Apr-18, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 本文综述了光合内共生系统的分子和生化特征,重点关注内共生体和宿主在进化过程中的分子变化 | 讨论了自然存在的光合内共生系统与现代叶绿体的共同特征,并探讨了实验室工程内共生的尝试及其意义 | 未提及具体实验数据的局限性,更多是理论探讨 | 探讨光合内共生系统的进化特征及其在合成生物学中的应用 | 线粒体、叶绿体等内共生体及其宿主细胞 | 进化生物学与合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
66 | 2025-04-21 |
Engineering electrogenetic interfaces for mammalian cell control
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.01.003
PMID:39879984
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研究论文 | 本文概述了设计直接电遗传接口以控制治疗工程哺乳动物细胞行为的努力 | 提出了电遗传学这一新兴概念,通过电子设备产生的电子编程活细胞内的电子响应生物单元 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 探索如何设计电遗传接口以控制哺乳动物细胞行为,用于治疗工程 | 治疗工程哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 电遗传学 | NA | NA | NA |
67 | 2025-04-21 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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研究论文 | 本文探讨了如何利用高通量突变筛选技术理解、抑制和设计膜转运蛋白 | 提出利用高通量筛选方法研究多特异性转运蛋白,并探讨其在设计抑制剂和合成生物学中的应用 | 高通量筛选方法在转运蛋白领域的应用和影响有限 | 研究多特异性膜转运蛋白的功能和分子基础 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学与生物技术 | NA | 高通量遗传筛选 | NA | 遗传变异数据 | NA |
68 | 2025-04-21 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-Apr-16, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
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review | 本文综述了2014年至2024年间合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的应用 | 重点介绍了合成生物学在蓝藻系统中的最新创新,包括BGC克隆、组合生物合成、转录和翻译调控以及宿主工程等方面的进展 | 文章未明确提及具体的研究限制 | 旨在通过合成生物学策略促进蓝藻天然产物的发现和生产 | 蓝藻系统及其天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、BGC克隆、组合生物合成 | NA | 基因组数据 | NA |
69 | 2025-04-21 |
Living therapeutics: Precision diagnosis and therapy with engineered bacteria
2025-Apr-15, Biomaterials
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展,包括理论基础、基因工程和化学修饰技术的应用,以及未来的挑战和前景 | 总结了合成生物学和化学工程在开发可控性更强、靶向性更高且毒性更低的工程化细菌平台方面的最新进展 | 未提及具体的临床实验数据或样本量,可能缺乏实际应用效果的详细分析 | 探讨工程化细菌在精准肿瘤学中的诊断和治疗潜力 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和化学修饰 | NA | NA | NA |
70 | 2025-04-21 |
Activation of Caged Functional RNAs by An Oxidative Transformation
2025-Apr-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202401056
PMID:39740778
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research paper | 该研究展示了通过氧化处理激活含有2-硫尿苷(2sU)修饰的功能性RNA(适配体和核酶)的能力 | 首次证明RNA可以作为环境响应性功能聚合物,通过氧化脱硫激活2-硫尿苷修饰的RNA,挑战了RNA不具有氧化还原敏感性的传统观点 | 研究仅针对2-硫尿苷修饰的RNA进行了验证,未探索其他可能的修饰方式 | 探索RNA作为环境响应性功能聚合物的潜力,并开发通过氧化还原调控RNA功能的方法 | 含有2-硫尿苷修饰的功能性RNA(适配体和核酶) | 合成生物学 | NA | 氧化脱硫 | NA | NA | NA |
71 | 2025-04-20 |
Paving the way for bacteria-based drug delivery: biohybrid microrobots emerging from microrobotics and synthetic biology
2025-Apr-16, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115577
PMID:40250568
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综述 | 本文探讨了微机器人学和合成生物学的融合如何促进生物混合细菌微型机器人的发展,用于药物递送 | 结合微机器人学和合成生物学的优势,开发出生物混合细菌微型机器人,通过外部控制方式(如光、超声波和磁场)提高靶向治疗的精确性和有效性 | 需要解决生物与合成组件之间的兼容性、规模化制造过程以及针对活体治疗剂的监管路径等关键挑战 | 探索微机器人学和合成生物学在药物递送中的创新应用 | 细菌作为治疗系统的工程化应用 | 合成生物学 | NA | 光、超声波和磁场控制 | NA | NA | NA |
72 | 2025-04-20 |
p-Hydroxycinnamic Acids: Advancements in Synthetic Biology, Emerging Regulatory Targets in Gut Microbiota Interactions, and Implications for Animal Health
2025-Apr, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.01.034
PMID:39900184
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综述 | 本文综述了对羟基肉桂酸(p-HCAs)在合成生物学中的进展、与肠道微生物群的相互作用及其对动物健康的影响 | 强调了对羟基肉桂酸与肠道微生物群相互作用的复杂机制及其对动物健康的显著影响,并探讨了合成生物学在对羟基肉桂酸生产中的进展 | NA | 探讨对羟基肉桂酸的生物活性、与肠道微生物群的相互作用及其对动物健康的影响 | 对羟基肉桂酸(p-HCAs)及其与肠道微生物群的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
73 | 2025-04-20 |
Pepticombisomes: Biomimetic Vesicles Crafted From Recombinant Supercharged Polypeptides with Uniformly Distributed Side-Chains
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411497
PMID:39985267
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research paper | 该论文介绍了一种新型仿生囊泡pepticombisomes,由重组超带电多肽与均匀分布的侧链构成,用于模拟细胞膜的功能和特性 | 提出了pepticombs这一新型超分子构建块家族,通过精确控制分子拓扑结构,实现了对膜厚度和灵活性的精确模拟,超越了传统的聚合物囊泡 | NA | 开发一种能够更精确模拟天然细胞膜特性的仿生囊泡 | 由重组弹性蛋白样超带电展开多肽(SUPs)与阴离子表面活性剂构成的pepticombs | 合成生物学 | NA | 显微镜技术和分子动力学模拟 | NA | NA | NA |
74 | 2025-04-20 |
Integrated Metabolomic and Transcriptomic Analysis Reveals the Molecular Regulatory Mechanism of Gamma-Aminobutyric Acid Accumulation in White Quinoa (Chenopodium quinoa Willd.) in Response to Dark and Ultrasound Stress
2025-Mar-28, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14071186
PMID:40238367
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研究论文 | 该研究通过整合代谢组学和转录组学分析,揭示了白藜麦在黑暗和超声波胁迫下γ-氨基丁酸(GABA)积累的分子调控机制 | 首次阐明了藜麦在黑暗和超声波胁迫下GABA积累的分子途径,并鉴定了两条GABA合成途径 | 研究仅针对白藜麦,未验证其他品种或植物中的适用性 | 探究藜麦在胁迫条件下GABA积累的分子机制 | 白藜麦(Chenopodium quinoa Willd.) | 植物分子生物学 | NA | 代谢组学分析、转录组学分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | 经受不同胁迫处理的藜麦样本 |
75 | 2025-04-19 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica for Enhanced De Novo Biosynthesis of Icaritin
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00754
PMID:40106718
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了一种微生物细胞工厂,用于从头合成具有抗癌特性的天然黄酮类化合物淫羊藿素(ICT) | 通过优化代谢途径和截断策略提高EsPT的表达和催化效率,将ICT产量显著提升至247.02 mg/L,创下目前微生物合成ICT的最高产量纪录 | 未提及实验规模的限制或可能的生产成本问题 | 开发一种高效、环保的微生物合成方法替代传统的植物提取和化学合成法生产淫羊藿素 | 解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | 肝癌 | 代谢工程、合成生物学 | 微生物细胞工厂 | NA | NA |
76 | 2025-04-19 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文介绍了一种人工酒精依赖性半萜(ADH)途径,用于在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 | 揭示了ADH模块的第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,并展示了其组合特异性足以在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 | NA | 通过人工ADH途径扩展异戊二烯生物合成的化学空间 | 酒精依赖性半萜途径及其酶 | 合成生物学 | NA | 人工酒精依赖性半萜(ADH)途径 | NA | NA | NA |
77 | 2025-04-19 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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研究论文 | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包,用于高效且适应性强的茯苓遗传修饰 | 该工具包显著提高了转化效率,支持多基因整合和快速灵活的原型设计,无需复杂的遗传电路组装 | 工具包仅针对茯苓进行了优化,可能不适用于其他真菌物种 | 开发一种高效的基因组工程工具包,用于真菌系统的遗传修饰 | 茯苓(Wolfiporia cocos) | 合成生物学 | NA | 转座子技术 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA |
78 | 2025-04-19 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 该研究利用新发现的mRNA转录本与CsrA蛋白的转录后相互作用,设计了一种生物转录后带通滤波器 | 利用CsrA蛋白在mRNA的5' UTR + 100 nt CDS序列上的异质性靶向作用,实现了基于浓度的激活和抑制调控,开发了一种新型的转录后调控策略 | 研究依赖于特定的mRNA序列和CsrA蛋白的相互作用,可能限制了其在其他系统中的普适性 | 设计并实现一种减少合成调控元件负担的转录后调控系统 | mRNA转录本(5' UTR + 100 nt CDS序列)与CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA |
79 | 2025-04-19 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株的高产无细胞蛋白合成系统,用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因,开发了一种无需补充纯化T7 RNA聚合酶的高产无细胞蛋白合成系统,并实现了sfGFP的高效合成 | NA | 开发高产无细胞蛋白合成系统,用于合成生物学和生物技术应用 | 工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株及其无细胞蛋白合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成(CFPS) | NA | NA | NA |
80 | 2025-04-19 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Apr-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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research paper | 开发并验证了一种RT-qPCR方法,用于测量依赖于环境的核酶活性,并引入寡核苷酸以抑制核酶活性,提高测量准确性 | 引入寡核苷酸抑制核酶活性,解决了RNA提取和反转录过程中核酶活性测量不准确的问题 | 方法在特定核酶上验证,可能不适用于所有类型的核酶 | 开发一种准确测量依赖于环境的核酶活性的方法 | 自切割核酶 | 合成生物学 | NA | RT-qPCR | NA | RNA | 一组已知在体外具有环境依赖性切割的自切割RNA |