合成生物学相关文章
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当前共找到 3783 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-24 |
Computational Pipeline for Targeted Integration and Variable Payload Expression in Bacteriophage Engineering
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00450
PMID:40982657
|
研究论文 | 开发了一种结合计算工具和经典基因组分析的噬菌体工程方法，用于靶向基因组有效载荷整合 | 使用基于机器学习的启动子预测工具PhagePromoter识别具有有利表达特征的基因间位点，建立了计算辅助的工程流程 | 仅在严格裂解性噬菌体K中验证了该方法，尚未在其他噬菌体系统中测试 | 扩展可行的遗传插入位点范围，增强噬菌体的治疗潜力 | 噬菌体基因组和生物发光报告基因 | 机器学习 | NA | 同源重组，启动子预测 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 三个重组噬菌体 | 同源重组 | 噬菌体K | 靶向基因组有效载荷整合系统 | 医药 |
| 62 | 2025-10-24 |
Recent advances and perspectives in biosynthesis of paclitaxel: key enzymes and intermediates
2025-Oct-01, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148049
PMID:41043740
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综述 | 本文综述紫杉醇生物合成的最新进展，重点关注关键酶和中间体的研究 | 系统总结紫杉醇生物合成途径中关键酶的最新研究进展及合成生物学策略新趋势 | NA | 探讨紫杉醇可持续生产的替代策略 | 紫杉醇生物合成途径中的关键酶和中间体 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、微生物发酵技术、生物信息学 | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 微生物 | 紫杉醇生物合成途径 | 医药 |
| 63 | 2025-10-24 |
A functional and applied perspective of Vitreoscilla hemoglobin: from oxygen carriage to biotechnological innovation
2025-Sep-04, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03635-y
PMID:40908439
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综述 | 本文从功能和应用角度全面综述了透明颤菌血红蛋白的分子特性及其在生物技术领域的创新应用 | 整合了VHb转录因子相互作用、氧化还原偶联电子传递和定点诱变揭示的结构-功能关系等最新机制见解，并系统总结了vgb启动子作为强调控元件的新兴应用 | NA | 系统梳理透明颤菌血红蛋白的研究进展并展望其未来发展方向 | 透明颤菌血红蛋白(VHb)及其相关生物技术应用 | 合成生物学 | NA | 定点诱变、CRISPR调控表达平台、高细胞密度发酵 | NA | NA | NA | CRISPR | 哺乳动物系统、微生物 | 基于VHb的模块化组件 | 环境修复、精准农业、工业生物技术 |
| 64 | 2025-10-24 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
|
综述 | 本文全面综述了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成途径及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识为甘草属研究提供独特而全面的视角，系统梳理活性成分生物合成途径与代谢工程策略 | NA | 为甘草分子育种和合成生物学领域的研究开发提供资源基础和理论支撑 | 甘草属植物及其活性成分（三萜类、黄酮类和多糖） | NA | NA | 多组学研究、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 医药 |
| 65 | 2025-10-24 |
Engineering microalgal cell wall-anchored proteins using GP1 PPSPX motifs and releasing with intein-mediated fusion
2025-Jul-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634604
PMID:39896471
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研究论文 | 本研究开发了一种基于GP1糖蛋白PPSPX基序和pH敏感内含肽的蛋白质锚定与可控释放系统 | 发现PPSPX基序是蛋白质锚定微藻细胞壁的关键信号，并首次将pH敏感内含肽用于可控释放锚定蛋白 | NA | 开发蛋白质空间定位和可控释放的技术平台 | 微藻细胞壁锚定蛋白系统 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、荧光动力学、Western blot分析 | NA | 荧光数据、蛋白质印迹数据 | NA | 内含肽介导的蛋白质融合 | 微藻 | 基于GP1 PPSPX基序的蛋白质锚定系统和pH敏感内含肽介导的释放系统 | 靶向药物递送,环境生物传感,生物催化剂部署 |
| 66 | 2025-10-24 |
Bioactive compounds from deep-sea extremophiles: emerging potential in cosmeceuticals and nutraceuticals
2025-Jan-10, FEMS microbiology letters
IF:2.2Q3
DOI:10.1093/femsle/fnaf102
PMID:40996452
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综述 | 系统探讨深海极端微生物生物活性化合物在化妆品和营养保健品领域的应用潜力 | 聚焦深海极端微生物这一未充分开发的生物资源，阐明其活性成分在抗衰老和健康促进方面的独特作用机制 | 规模化生物加工存在技术瓶颈，商业化应用面临法规合规性挑战 | 评估深海极端微生物在化妆品和营养保健品领域的生物技术应用潜力 | 深海极端微生物产生的生物活性化合物（极端酶、胞外多糖、微生物色素等） | 生物技术 | NA | 宏基因组学、高通量筛选、合成生物学、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 化妆品 |
| 67 | 2025-10-22 |
HUH endonuclease-mediated DNA-protein conjugates: sequence-specific tools and cellular applications
2025-Oct-21, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc04628a
PMID:41032013
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综述 | 本文综述了HUH内切核酸酶作为自标记蛋白标签在序列特异性共价连接未修饰ssDNA方面的最新进展及其在细胞研究中的应用 | 利用HUH内切核酸酶实现序列特异性、生物正交且生理条件下稳健的DNA-蛋白质共价连接 | NA | 开发基于HUH内切核酸酶的DNA-蛋白质偶联工具及其在细胞研究中的应用 | HUH内切核酸酶及其DNA-蛋白质偶联物 | 合成生物学 | NA | HUH内切核酸酶技术、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | DNA-蛋白质偶联系统 | 医学, 合成生物学 |
| 68 | 2025-10-21 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台，实现高效双DNA负载单拷贝整合到人诱导多能干细胞 | 首次实现同时、等位基因特异性、单拷贝整合两个DNA负载，效率达100%，且一周内完成 | NA | 开发高效基因工程平台用于干细胞精准工程 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs) | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 基因表达数据 | NA | STRAIGHT-IN平台 | 人诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导型synZiFTR系统，四环素诱导系统，基因回路设计 | 医学 |
| 69 | 2025-10-21 |
From Knallgas Bacterium to Promising Biomanufacturing Host: The Evolution of Cupriavidus necator
2025, Advances in biochemical engineering/biotechnology
DOI:10.1007/10_2024_269
PMID:39363001
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综述 | 深入探讨了Cupriavidus necator从克纳尔加斯细菌发展为有前景的生物制造宿主的演化历程 | 系统总结了C. necator在过去十年中在分子生物学工具、代谢工程和创新发酵策略领域取得的显著技术进步 | NA | 推动从化石燃料经济向可持续生物经济的转型，促进可持续生物加工和生物产品开发的未来发展 | Cupriavidus necator微生物及其在生物制造中的应用 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程、发酵策略 | NA | NA | NA | NA | Cupriavidus necator | NA | 工业生物技术 |
| 70 | 2025-10-20 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可悬浮培养的重组腺相关病毒生产细胞系，并分析了其转录组功能特征 | 首次将HEK293为基础的rAAV生产细胞系成功适应于无血清悬浮培养，并通过转录组分析揭示了不同培养条件下细胞对病毒生产的响应差异 | 悬浮培养的细胞系病毒滴度显著降低，即使优化后生产力也只能恢复到贴壁培养的25%-50% | 开发可规模化生产的重组腺相关病毒生产系统 | 重组腺相关病毒生产细胞系GX6B及其悬浮适应株GX6Bs | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | HEK293衍生细胞系 | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 整合了AAV和腺病毒辅助组件编码基因的合成基因回路 | 医学 |
| 71 | 2025-10-18 |
HinZip: Combining Hin Recombinase and FosW to Mimic HD-Zip Plant Proteins
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00386
PMID:40977316
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研究论文 | 本研究设计了一种名为HinZip的新型DNA结合蛋白，通过融合Hin重组酶DNA结合域和FosW亮氨酸拉链来模拟植物HD-Zip转录因子功能 | 首次成功将不相关的蛋白质模块（Hin重组酶DNA结合域和FosW亮氨酸拉链）整合设计出功能性的'融合蛋白'，能够高亲和力特异性结合24+碱基对的DNA序列 | 缺乏结构指导的蛋白质设计方法，可能限制设计的精确性和效率 | 开发定制化DNA结合蛋白用于合成生物学和疾病治疗应用 | HinZip融合蛋白及其DNA结合特性 | 合成生物学 | NA | 电泳迁移率变动分析、圆二色谱、动态光散射、细菌单杂交实验 | NA | 蛋白质-DNA相互作用数据、光谱数据 | NA | 蛋白质工程 | 细菌（用于单杂交实验） | DNA结合蛋白设计，模拟HD-Zip转录因子的DNA识别和二聚化功能 | 医学, 合成生物学 |
| 72 | 2025-10-18 |
Structure-Guided Design of Artificial Transcription Factor for a Progesterone Biosensor
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00488
PMID:40977514
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研究论文 | 通过结构引导设计人工转录因子开发孕酮生物传感器 | 将真核生物转录因子逆向转移到原核生物，并通过MD模拟和连接子优化设计人工转录因子ProB | NA | 开发高灵敏度的孕酮生物传感器 | 人工转录因子ProB及其在合成启动子QT上的作用 | 合成生物学 | NA | MD模拟、细菌富集策略 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 由QF、配体结合域、连接子和QF组装的人工转录因子ProB，作用于由QUAS、10-bp间隔区、T7和RBS组成的合成启动子QT | 医学 |
| 73 | 2025-10-18 |
Neural CRNs: A Natural Implementation of Learning in Chemical Reaction Networks
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00099
PMID:40981009
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研究论文 | 提出了一种基于化学动力学连续时间演化的神经网络计算方法，可实现合成生化系统中的自主学习 | 将神经网络计算建模为分子浓度的连续时间演化，与化学动力学计算自然契合，实现了仅需两个顺序阶段的端到端监督学习流程 | NA | 开发能够在合成生化系统中实现自主学习行为的分子电路 | 化学反应网络和分子电路 | 合成生物学 | NA | 化学动力学模拟 | 连续时间神经网络 | 分子浓度数据 | NA | NA | NA | 使用单分子和双分子反应实现线性和非线性建模电路 | 生物工程, 合成生物学 |
| 74 | 2025-10-18 |
Trusted Codon Fingerprint: A Streamlined Platform for Deep and Reversible Bacterial Cell Labeling
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00263
PMID:40983931
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研究论文 | 开发了一种名为可信密码子指纹(TCF)的平台，通过同义密码子替换在质粒抗生素抗性基因中集成识别信息，实现细菌细胞的深度可逆标记 | 利用同义密码子替换在抗生素抗性基因中建立独特密码子指纹，结合抗生素选择和纠错码实现无需验证步骤的高效细胞标记 | NA | 开发高效精确的合成生物学细胞标记和识别平台 | 工程化细菌细胞 | 合成生物学 | NA | 长读长测序，同义密码子替换 | NA | 基因组测序数据 | 数千个克隆 | 温度敏感质粒，基因组修饰 | 细菌 | 密码子指纹标记系统，可逆细胞标签 | 工业生物技术 |
| 75 | 2025-10-18 |
Programmable Biointerfaces and Adaptive Functionality in Next-Generation Green Nanomaterials
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00620
PMID:40999683
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综述 | 探讨合成生物学、DNA纳米技术、人工智能和先进制造等融合创新如何推动具有环境响应功能的可编程纳米材料发展 | 将生物相容性从静态属性重新定义为动态可编程特性，实现纳米材料像复杂生物实体一样自主响应生物信号 | 在稳定性、灵敏度和制造可扩展性方面仍存在重大挑战 | 开发具有动态生物界面和自适应功能的下一代绿色纳米材料 | 可编程纳米材料及其生物界面 | 纳米医学 | NA | 无细胞合成生物学、DNA纳米技术、代谢工程、4D生物打印 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 工程微生物系统 | 遗传电路驱动响应、刺激响应结构、分子计算、逻辑运算 | 医学 |
| 76 | 2025-10-18 |
A Decade of SBOL Visual: Growing Adoption of a Diagram Standard for Engineering Biology
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00417
PMID:41016059
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综述 | 回顾SBOL Visual标准在过去十年中的发展历程及其在合成生物学领域的应用 | 首次系统总结SBOL Visual标准从21个简单符号发展为完整图解语言的演进过程 | 尚未实现完全合规性和最佳实践的普遍采用 | 分析SBOL Visual标准的采用趋势和发展历程 | SBOL Visual标准及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 图解数据 | NA | SBOL Visual | NA | 遗传设计图解表示标准 | 工业生物技术 |
| 77 | 2025-10-18 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-Oct-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
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研究论文 | 本研究结合全细胞模型和机器学习加速大肠杆菌简化基因组的设计 | 使用机器学习代理模型将全细胞模型的计算时间减少95%，并成功设计出移除40%基因的简化大肠杆菌基因组 | 全细胞模型运行时间较长是主要限制因素 | 开发加速基因组设计的计算方法 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 全细胞建模、机器学习 | 机器学习代理模型 | 计算模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 简化基因组设计 | 工业生物技术 |
| 78 | 2025-10-18 |
Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa
2025-Oct, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70151
PMID:40458033
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研究论文 | 本研究对铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶进行了克隆、生化和结构表征 | 首次报道了二聚体氯酸歧化酶在原子分辨率(0.99Å)下的晶体结构，并对其催化机制提供了新见解 | NA | 表征铜绿假单胞菌氯酸歧化酶的生化特性和结构特征 | 铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学、稳态动力学 | NA | 结构数据、动力学数据 | NA | 克隆 | 铜绿假单胞菌 | NA | 环境、生物医学、合成生物学 |
| 79 | 2025-10-15 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程 | 首次将微流控调制光谱和饱和转移差NMR结合用于研究PAS结构域蛋白-配体相互作用 | 仅使用了约760种化合物的片段库，可能遗漏其他潜在配体 | 寻找细菌孤儿受体CU228的新型配体并研究其稳定机制 | CU228蛋白（一种推测的PAS-HTH转录因子） | 合成生物学 | NA | 差异扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差NMR | NA | 生物物理数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库 | NA | 细菌 | NA | 生物技术 |
| 80 | 2025-10-15 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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研究论文 | 开发基于人类蛋白酶调控细胞因子分泌的合成生物学平台hDIRECT | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交性细胞因子调控系统，避免免疫原性风险 | 仅提供概念验证，尚未进行临床前或临床试验 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人类细胞因子（IL-2、IL-6、IL-10）和人源蛋白酶 | 合成生物学 | 癌症，肌肉再生疾病 | 蛋白质工程，蛋白酶调控技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 人类细胞 | 基于蛋白酶切割的细胞因子活性调控回路，包含激活和失活机制 | 医学 |