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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-05-02 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Apr-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种RT-qPCR方法,用于测量依赖于环境的核酶活性 | 引入了一种寡核苷酸来抑制核酶活性,从而恢复了RT-qPCR测量的准确性 | 方法依赖于特定的RNA提取和反转录条件,可能不适用于所有环境 | 验证新的核酶序列和基于核酶的生物技术 | 自切割核酶 | 合成生物学 | NA | RT-qPCR | NA | RNA | 一组已知在体外具有环境依赖性切割的自切割RNA |
62 | 2025-05-02 |
Recent advances in synthetic biology toolkits and metabolic engineering of Ralstonia eutropha H16 for production of value-added chemicals
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108516
PMID:39793936
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综述 | 本文综述了针对Ralstonia eutropha H16的合成生物学工具包开发及其代谢工程用于高附加值化学品生产的最新进展 | 整合了最先进的遗传和基因组工程工具与高细胞密度发酵工艺,优化碳通量并扩展生物基产品组合 | NA | 开发Ralstonia eutropha H16的合成生物学工具包,并利用其代谢灵活性生产高附加值化学品 | Ralstonia eutropha H16 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因组序列、组学数据 | NA |
63 | 2025-05-02 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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review | 本文综述了合成脂质生物学这一新兴领域,探讨了如何通过跨学科方法理解和构建脂质及生物膜系统 | 提出了‘合成脂质生物学’这一新概念,整合了化学、生物学、物理学和工程学的方法来研究和操纵脂质及生物膜 | 该领域仍处于起步阶段,尚未形成完整的理论体系和技术框架 | 建立对脂质和生物膜性质、行为及功能的清晰描述 | 细胞中的脂质和生物膜 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA |
64 | 2025-05-02 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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research paper | 研究开发了一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的抗终止微生物全细胞生物传感器,用于体内诊断结肠炎 | 利用抗终止元件设计生物传感器,能够通过响应炎症环境中的硝酸盐和亚硝酸盐来检测结肠炎 | 研究仅在小鼠模型中进行初步评估,尚未在人体中验证 | 开发一种新型生物传感器,用于诊断结肠炎 | Bacteroides thetaiotaomicron和溃疡性结肠炎小鼠模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 微生物全细胞生物传感器技术 | 抗终止微生物全细胞生物传感器 | 生物传感器响应数据 | 化学诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 |
65 | 2025-05-02 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo兼容的低拷贝和中拷贝载体,扩展了现有的MoClo工具包,用于在大肠杆菌中实现模块化蛋白质表达 | 扩展了现有的MoClo工具包,构建了低拷贝和中拷贝载体,实现了蛋白质表达范围的500倍差异,并通过选择性生长实验验证了低拷贝载体在优化生长耦合酶表达中的重要性 | 研究仅针对大肠杆菌系统,未在其他宿主中验证载体的兼容性和表达效果 | 扩展MoClo工具包,实现更广泛的蛋白质表达范围,优化生长耦合酶表达 | 大肠杆菌中的蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆技术 | NA | DNA构建体和荧光输出数据 | 通过随机化Golden Gate Assembly创建的多样化构建体库 |
66 | 2025-05-02 |
CAR-T cell therapy for breast cancer: Current status and future perspective
2025-Feb, Cancer treatment reviews
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.ctrv.2024.102868
PMID:39798230
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在乳腺癌治疗中的当前应用状况及未来发展方向 | 探讨了利用合成生物学优化抗原靶向、逻辑门控CAR构建增强特异性、装甲CAR重塑肿瘤微环境等创新策略 | 目前治疗效果远未达到血液肿瘤的成功水平,主要受限于肿瘤特异性抗原的稀缺和乳腺癌免疫抑制微环境 | 评估CAR-T细胞疗法在乳腺癌治疗中的潜力并探索改进策略 | 乳腺癌(特别是转移性乳腺癌)患者 | 细胞免疫治疗 | 乳腺癌 | CAR-T细胞疗法、合成生物学、基因工程 | NA | 临床前和临床数据 | NA |
67 | 2025-05-02 |
Cardiomyocyte engineering: The meeting point of transcription factors, signaling networks, metabolism and function
2025-Feb, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.14271
PMID:39801134
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review | 本文综述了直接心脏重编程或转分化的最新进展,包括转录因子、信号网络、代谢和功能在心肌细胞工程中的交汇点 | 探讨了合成生物学,特别是CRISPR系统在将特定成纤维细胞亚群定向转化为心肌细胞中的潜力 | 尽管有多种新方法,但获得功能和代谢成熟的心肌细胞仍然是一个挑战 | 总结当前关于人类心脏成纤维细胞功能和多样性的知识,以及体外人类心肌细胞模型的替代细胞来源 | 心肌细胞、成纤维细胞、转录因子、信号网络、代谢 | 再生医学 | 心血管疾病 | CRISPR | NA | NA | NA |
68 | 2025-05-02 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
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研究论文 | 本文构建了一个由信号响应性DNA纳米筏、生物源孔和巨型单层囊泡(GUVs)组成的合成细胞模型,展示了纳米尺度DNA筏的重塑如何与微尺度GUVs的重塑相耦合 | 通过可重构DNA纳米筏实现了合成细胞的形态重塑和膜通道形成,扩展了DNA纳米技术在合成生物学中的潜力 | NA | 探索DNA纳米结构与合成细胞的界面,实现细胞形态的程序化重塑 | 合成细胞模型(DNA纳米筏、生物源孔、巨型单层囊泡) | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
69 | 2025-05-02 |
Machine Learning Recognition of Artificial DNA Sequence with Quantum Tunneling Nanogap Junction
2025-Jan-23, The journal of physical chemistry. B
DOI:10.1021/acs.jpcb.4c06270
PMID:39788925
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研究论文 | 本文研究了利用量子隧道传输和机器学习技术对八种人工合成DNA碱基进行电学识别 | 结合量子隧道纳米间隙结和机器学习技术,实现了对人工合成DNA碱基的高精度电学识别,预测准确率高达100% | 研究仅针对八种特定的人工合成DNA碱基,未涉及更复杂的DNA序列或自然DNA | 开发一种高灵敏度、高精度的电学识别方法,用于人工合成DNA碱基的快速准确识别 | 八种人工合成的DNA碱基 | 机器学习 | NA | 量子隧道传输 | 机器学习模型 | 电传输信号 | 八种人工合成DNA碱基的数据集 |
70 | 2025-05-02 |
Synthetic biology meets Aspergillus: engineering strategies for next-generation organic acid production
2025-Jan-13, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-024-04246-x
PMID:39800796
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综述 | 本文综述了遗传工程技术在提高曲霉属真菌有机酸产量方面的最新进展和未来方向 | 重点介绍了CRISPR生物传感器在有机酸发酵中的潜在应用和挑战 | 未提及具体实验数据或样本量 | 提高曲霉属真菌在工业有机酸生产中的效率 | 曲霉属真菌 | 合成生物学 | NA | 遗传工程技术、CRISPR | NA | NA | NA |
71 | 2025-05-02 |
A cross-species inducible system for enhanced protein expression and multiplexed metabolic pathway fine-tuning in bacteria
2025-Jan-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1315
PMID:39797735
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研究论文 | 本研究设计并展示了一个跨物种诱导系统的稳健工作流程,用于增强蛋白质表达和多路代谢途径的精细调控 | 开发了两种重建的诱导系统(PphlF3R1和Ptet2R2*),并在三种模型微生物中验证其功能,进一步用于开发单输入遗传电路 | NA | 开发跨物种诱导系统,用于蛋白质表达和代谢途径控制 | 大肠杆菌、枯草芽孢杆菌和谷氨酸棒状杆菌 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 三种模型微生物 |
72 | 2025-05-02 |
Engineered Bacteria for Disease Diagnosis and Treatment Using Synthetic Biology
2025-Jan, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70080
PMID:39801378
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学技术改造细菌作为微型机器人用于疾病诊断和治疗的研究现状 | 利用合成生物学技术改造细菌,使其能够作为微生物联合体提高诊断准确性和治疗效果 | 细菌的长期存活和安全性、非模型菌株的底盘微生物和基因编辑技术开发、潜在毒性最小化以及与宿主微生物群的相互作用理解仍存在挑战 | 研究工程化细菌在疾病诊断和治疗中的应用 | 工程化细菌和微生物联合体 | 合成生物学 | 癌症、肠道疾病、代谢紊乱 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
73 | 2025-05-02 |
Mining metagenomes from extremophiles as a resource for novel glycoside hydrolases for industrial applications
2025, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2025.02.008
PMID:40288852
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review | 该综述探讨了从极端微生物的宏基因组中挖掘新型糖苷水解酶(GHs)及其工业应用潜力 | 利用宏基因组学技术直接从环境DNA中识别新型GH编码基因,避免实验室培养极端微生物的需求 | 极端微生物来源基因在常温宿主中的表达、活性产量低以及规模化生产仍面临挑战 | 探索极端微生物宏基因组作为新型糖苷水解酶的资源,以促进绿色工业应用 | 极端微生物及其产生的糖苷水解酶 | 合成生物学与蛋白质工程 | NA | 高通量测序与生物信息学分析 | 机器学习(用于预测功能注释) | 环境DNA序列数据 | NA |
74 | 2025-05-02 |
Biochemical evaluation of molecular parts for flavonoid production using plant synthetic biology
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1528122
PMID:40303856
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review | 本文综述了利用植物合成生物学优化黄酮类化合物生产所需的分子部件和酶 | 总结了不同植物来源的天然和工程化分子部件的酶动力学,为黄酮类化合物的可持续生产提供了分子部件选择、设备设计和途径重构的见解 | 未提及具体的实验验证或生产量数据 | 通过植物合成生物学优化黄酮类化合物的生产 | 黄酮类化合物的生物合成途径及其分子部件 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | 文献数据 | NA |
75 | 2025-05-02 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-Dec-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 介绍了一种基于开放硬件的微流体工作流程,用于通过培养单细胞在凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落来分析质粒保留 | 采用开源硬件微流体工作流程,提供精确的流量控制和温度管理,增强易用性、稳健性和可访问性 | 研究以大肠杆菌为实验模型,方法的普适性有待进一步验证 | 分析质粒保留,为合成生物学提供技术支持 | 质粒和单细胞微菌落 | 合成生物学 | NA | 微流体技术、荧光显微镜 | NA | 图像数据 | 大量微滴和微菌落 |
76 | 2025-05-02 |
[Cloning and application in synthetic biology of chalcone synthase gene from Lithocarpus litseifolius]
2024-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本研究从石栎属植物中克隆了查尔酮合成酶基因,并进行了生物信息学分析和功能表征 | 首次从石栎属植物中鉴定出两个CHS基因(LlCHS1和LlCHS2),并验证了其催化合成根皮素的功能 | 仅在大肠杆菌中验证了基因功能,未在植物体内进行验证 | 探索石栎属植物中CHS基因家族在查尔酮合成中的功能 | 石栎属植物的CHS基因(LlCHS1和LlCHS2) | 合成生物学 | NA | 转录组数据分析、生物信息学分析、大肠杆菌异源表达 | NA | 基因序列数据 | 2个CHS基因 |
77 | 2025-05-01 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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research paper | 该文章探讨了利用合成生物学和代谢工程优化微生物细胞工厂生产萜类食品成分的方法 | 提出了通过优化异源合成途径、底盘前体供应和整合合成调控电路来提升萜类食品成分的生产效率 | 未提及具体的实验数据或样本规模,可能缺乏实际应用的验证 | 提高萜类食品成分的微生物生产效率 | 微生物细胞工厂和萜类食品成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA |
78 | 2025-05-01 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-Apr-30, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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research paper | 提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相生成细胞大小脂质体的新方法 | 采用高速激光诱导微射流技术可靠且重复地生成细胞大小脂质体,实现了按需生产 | 未提及方法的具体产量和成本效益分析 | 开发一种新型细胞大小脂质体生成技术 | 细胞大小脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术 | NA | 高速摄像数据 | 未明确说明样本数量 |
79 | 2025-05-01 |
Integrase enables synthetic intercellular logic via bacterial conjugation
2025-Apr-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101268
PMID:40300599
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research paper | 介绍了一种通过细菌接合实现基于整合酶的细胞间DNA信息传递的策略 | 首次利用整合酶通过细菌接合实现细胞间DNA信息传递及其调控 | 未提及具体实验规模或应用场景的限制 | 探索整合酶在细胞间DNA信息传递和系统合成生物学中的应用 | 细菌(E. coli)及其接合质粒 | 合成生物学 | NA | 细菌接合、整合酶介导的DNA重组 | 布尔逻辑门 | DNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量 |
80 | 2025-05-01 |
Structural dynamics of a designed peptide pore under an external electric field
2025-Mar, Biophysical chemistry
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.bpc.2024.107380
PMID:39752811
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研究论文 | 研究通过分子动力学模拟和实验记录探讨了设计肽孔在外部电场下的结构动态 | 在GENESIS MD模拟包中实现了均匀外部电场功能,用于研究设计肽孔的结构动态 | NA | 研究膜电位对设计肽孔结构稳定性和动态的影响 | 设计肽孔 | 合成生物学 | NA | 分子动力学模拟(MD), 单通道电流记录实验 | NA | 模拟数据, 实验数据 | NA |