合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-05-11	Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China 2025-Feb-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26041492 PMID:40003958	研究论文	本文报道了从中国临泽沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇的研究	成功克隆并异源表达了一个完全沉默的隐秘生物合成基因簇，发现了一种新的羊毛硫肽dmxorosin	NA	研究放线菌次级代谢产物的生物合成途径	Streptomyces thermolilacinus SPC6菌株及其次级代谢产物	合成生物学	NA	基因组挖掘、直接克隆、异源表达	NA	基因组数据	1株放线菌(SPC6)
62	2025-05-11	Advanced Technologies for Large Scale Supply of Marine Drugs 2025-Feb-07, Marine drugs IF:4.9Q1 DOI:10.3390/md23020069 PMID:39997193	综述	本文全面探讨了海洋天然产物（MNPs）的生产策略，包括供应、合成和可扩展性方面的挑战，并强调了可能改变当前海洋来源药物工业规模生产方法的最新生物技术进步	结合传统方法与现代合成生物学和生物合成策略，为海洋无脊椎动物MNPs的生产提供了多样化的方法	海洋无脊椎动物MNPs通常自然积累量极少，生产策略面临挑战	确保海洋天然产物的可靠和可持续供应，以转化为商业药物和其他有价值的产品	海洋天然产物（MNPs）及其生产策略	生物技术	NA	合成生物学、生物合成	NA	NA	NA
63	2025-05-11	Public attitudes to potential synthetic cells applications: Pragmatic support and ethical acceptance 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0319337 PMID:40014593	研究论文	本文通过调查13个欧洲国家的公众态度，探讨了合成细胞技术在抗癌治疗、二氧化碳转化为生物燃料和工业废物回收等潜在应用中的公众支持度	首次在13个欧洲国家进行大规模调查，探讨公众对合成细胞技术的态度，并使用数据驱动技术构建决策树模型分析影响因素	研究仅覆盖欧洲国家，可能无法代表全球其他地区的公众态度	探索公众对合成细胞潜在应用的态度和支持程度	来自13个欧洲国家的8,382名具有全国代表性的受访者	合成生物学	癌症	NA	决策树模型	调查数据	8,382名来自13个欧洲国家的受访者
64	2025-05-11	Leaky ribosomal scanning enables tunable translation of bicistronic ORFs in green algae 2024-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.07.24.605010 PMID:39091764	研究论文	本研究通过生物信息学和体内突变分析，探讨了绿藻中多顺反子基因的翻译机制	揭示了绿藻中多顺反子转录本通过漏读核糖体扫描机制实现多ORF翻译的新机制	研究仅针对两种绿藻，结果在其他物种中的普适性有待验证	阐明绿藻中多顺反子基因的翻译调控机制	两种分歧绿藻(未指明具体物种)的多顺反子基因位点	分子生物学	NA	生物信息学分析、体内突变分析、双报告基因系统	NA	基因组序列数据、荧光报告基因数据	两种绿藻的高置信度手动注释双顺反子位点数据集
65	2025-05-10	dTSR enables efficient improvement of heterologous production of spinosad in Saccharopolyspora erythraea 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.003 PMID:40337009	research paper	该研究开发了一种双重转座和位点特异性重组（dTSR）方法，用于提高多杀菌素在Saccharopolyspora erythraea中的异源生产	提出了一种新的dTSR方法，能够高效生成初始异源菌株，并随机整合第二拷贝的多杀菌素生物合成基因簇，显著提高产量	研究仅针对Saccharopolyspora erythraea，未涉及其他稀有放线菌	提高多杀菌素在稀有放线菌中的异源生产效率	Saccharopolyspora erythraea和多杀菌素生物合成基因簇	合成生物学	NA	双重转座和位点特异性重组（dTSR）	NA	NA	NA
66	2025-05-10	Advances in innovative extraction techniques for polysaccharides, peptides, and polyphenols from distillery by-products: Common extraction techniques, emerging technologies, and AI-driven optimization 2025-Jun-01, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.143326 PMID:39986087	review	本文综述了从酿酒副产品中提取多糖、肽和多酚的创新提取技术进展	探讨了超临界流体提取、加压液体提取、脉冲电场和合成生物学等新兴技术，并讨论了机器学习和人工智能在优化提取参数和扩大生产规模中的应用	未提及具体实验数据或案例研究来验证这些新兴技术的实际效果	促进酿酒行业的可持续发展实践，强调经济可行性、环境影响和资源优化	酿酒副产品（如酒糟、废液和酒渣）中的多糖、肽和多酚	生物技术与食品科学	NA	酶法提取、超声波辅助提取、微波辅助提取、超临界流体提取、加压液体提取、脉冲电场、合成生物学	机器学习、人工智能	NA	NA
67	2025-05-10	Engineering advanced bacterial therapy for tumor and inflammatory diseases 2025-May-15, International journal of pharmaceutics IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.ijpharm.2025.125585 PMID:40216039	综述	本文综述了工程化细菌疗法在肿瘤和炎症性疾病治疗中的优势、策略及研究进展	探讨了工程化细菌疗法通过基因重编程和表面化学修饰实现选择性功能重组和精确时空控制的新策略	讨论了当前工程化细菌疗法在应用中的局限性和挑战	探索工程化细菌疗法在疾病治疗中的潜力与前景	肿瘤和炎症性疾病	合成生物学与生物医学	肿瘤和炎症性疾病	基因重编程和表面化学修饰	NA	NA	NA
68	2025-05-10	Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control 2025-May-08, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00871 PMID:40339164	研究论文	该研究开发了一种基于生物分子凝聚物的人工细胞器，用于实现模块化途径区室化以精确控制代谢通量	利用工程化的生物分子凝聚物创建可编程人工细胞器，实现代谢途径的空间组织以提高生物合成效率	研究仅以2'-岩藻糖基乳糖的生物合成途径为模型系统，未在其他代谢途径中验证	开发合成生物学平台以优化区室化生物合成途径	工程化的大肠杆菌细胞	合成生物学	NA	蛋白质工程、代谢工程	NA	生物分子相互作用数据、代谢通量数据	未明确说明样本数量
69	2025-05-10	Microbiome catalog and dynamics of the Chinese liquor fermentation process 2025-May-05, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132620 PMID:40334798	research paper	该研究构建了中国白酒发酵过程中微生物的基因目录，揭示了发酵食品的独特性和高代谢潜力	建立了最大的发酵食品基因资源库MTFGC，发现了20%的新物种和新基因，以及25,625个生物合成基因簇（BGCs）	研究主要关注中国白酒发酵过程，可能不适用于其他类型的发酵食品	揭示发酵食品中微生物的多样性和动态变化，推动传统发酵向精准合成生物学的转变	中国白酒发酵过程中的微生物群落	microbiology	NA	metagenome sequencing	NA	genomic data	5,159 metagenome-assembled genomes
70	2025-05-10	Recent progress on glucose dehydrogenase: multifaceted applications in industrial biocatalysis, cofactor regeneration, glucose sensors, and biofuel cells 2025-May-02, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143842 PMID:40319965	综述	本文总结了葡萄糖脱氢酶（GDH）在工业生物催化、辅因子再生、葡萄糖传感器和生物燃料电池等多方面的最新研究进展	重点关注酶的分子工程和性能增强、新型固定化策略以及在生物传感器、生物催化和生物燃料电池中的最新应用	NA	总结葡萄糖脱氢酶研究的最新进展，探索其在人类健康诊断、工业生物催化升级和生物能源开发等全球性挑战中的贡献	葡萄糖脱氢酶（GDH）	生物技术	NA	分子工程、固定化技术	NA	NA	NA
71	2025-05-10	Improved biosynthesis of C4 derivatives by engineered thiolase 2025-May-02, Metabolic engineering IF:6.8Q1 DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001 PMID:40320002	研究论文	本研究开发了一种利用大肠杆菌作为宿主，从乙二醇等二碳底物生物合成四碳化合物的新型代谢途径	通过定向进化技术改良了β-酮酰基硫解酶B的催化效率，并成功构建了将PET衍生的乙二醇转化为高价值四碳化合物的生物合成途径	NA	开发可持续的生物制造策略，将塑料废物转化为高价值化学品	大肠杆菌代谢途径、PET衍生的乙二醇	合成生物学	NA	定向进化、代谢工程	NA	NA	NA
72	2025-05-10	Biosynthesis and bioactivities of triterpenoids from Centella asiatica: Challenges and opportunities 2025 May-Jun, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108541 PMID:39978422	综述	本文综述了积雪草中三萜类化合物的生物合成、生物活性以及生物技术生产方法	总结了积雪草三萜类化合物的生物合成途径及生物技术生产方法，提出了未来工程化生产的指导方针	当前提取方法无法满足市场需求，生物技术生产仍面临挑战	探讨积雪草三萜类化合物的生物合成、生物活性及可持续生产方法	积雪草及其三萜类化合物（如积雪草酸、羟基积雪草酸、积雪草苷和羟基积雪草苷）	合成生物学	NA	合成生物学、微生物细胞工厂	NA	NA	NA
73	2025-05-10	Emerging biotechnological strategies advancing biological lignin valorization towards polyhydroxyalkanoates 2025-May, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132278 PMID:39986625	综述	本文综述了将木质素转化为聚羟基脂肪酸酯（PHA）的生物技术策略，强调了微生物过程在PHA合成和木质素生物升级中的优势	整合微生物PHA合成与木质素生物转化，促进木质素的高值化利用和PHA的可持续生产	木质素的顽固性和异质性给微生物降解和高值化利用带来挑战	探讨木质素转化为高价值产品的生物技术策略，特别是PHA的生物合成	木质素和聚羟基脂肪酸酯（PHA）	生物技术	NA	合成生物学技术和代谢调控策略	NA	NA	NA
74	2025-05-10	A review of MicroRNAs and flavonoids: New insights into plant secondary metabolism 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142518 PMID:40157676	review	该综述全面分析了miRNA的生物合成及其分子机制，重点探讨了miRNA介导的黄酮类化合物生物合成的调控	提出了'miRNA-多因素协同网络'的概念，并探讨了利用人工miRNA设计、CRISPR/Cas技术以及人工智能优化黄酮类代谢的新策略	NA	理解和改善黄酮类化合物的代谢，为代谢工程提供新的理论框架和技术路线	植物次级代谢产物黄酮类化合物及其调控机制	合成生物学	NA	CRISPR/Cas技术、合成生物学、多组学技术、人工智能	NA	NA	NA
75	2025-05-10	Rational design of terminal deoxynucleotidyl transferase for RNA primer elongation 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142712 PMID:40174852	研究论文	该论文通过合理设计末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）的引物识别位点，实现了RNA引物的高效延伸	通过工程化改造TdT的引物识别位点，将RNA延伸活性从20%提升至90%以上，并开发了两种微量microRNA检测的原理验证方法	未提及具体的临床应用验证或大规模生产可行性	改进酶促DNA合成技术，拓展其在RNA合成和分析中的应用	末端脱氧核苷酸转移酶（TdT）及其RNA引物延伸能力	合成生物学	NA	酶工程、RNA-primed聚合	NA	酶活性数据、RNA序列分析数据	多种RNA引物（具体数量未明确说明）
76	2025-05-10	Silaffins as functional biomacromolecules in regulating frustule morphogenesis and biosilica properties 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143105 PMID:40222518	研究论文	研究硅藻中硅蛋白（silaffins）在硅壳形态发生和生物硅特性调节中的功能	首次通过基因过表达和CRISPR/Cas9介导的敲除方法，揭示了TpSil1和TpSil3在硅藻硅壳形态发生中的具体作用	无法生成双等位TpSil3敲除突变体，可能因为TpSil3是必需基因，完全敲除会导致致死	探究硅蛋白在硅藻硅壳形态发生和生物硅特性中的功能	硅藻Thalassiosira pseudonana中的硅蛋白TpSil1和TpSil3	合成生物学	NA	基因过表达、CRISPR/Cas9敲除	NA	形态学分析、生理学数据	NA
77	2025-05-10	The CpG Landscape of Protein Coding DNA in Vertebrates 2025-May, Evolutionary applications IF:3.5Q1 DOI:10.1111/eva.70101 PMID:40330995	研究论文	研究探讨了DNA甲基化对脊椎动物基因组进化中CpG二核苷酸含量的影响及其在蛋白质编码DNA中的特异性	揭示了蛋白质编码序列中CpG含量显著高于非编码区域，并发现CpG位点在调控功能和应激反应相关基因中富集	研究仅涉及六种脊椎动物，可能无法全面代表所有脊椎动物的CpG分布模式	探讨CpG偏倚对蛋白质编码DNA的具体影响及其在脊椎动物基因组进化中的作用	六种脊椎动物（人类、小鼠、鸡、大山雀、青蛙和刺鱼）的基因组	基因组学	NA	全基因组分析	NA	基因组数据	六种脊椎动物的基因组数据
78	2025-05-10	The structure of the Vibrio natriegens 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1-17) 2025-Apr-22, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf324 PMID:40331629	research paper	该研究通过冷冻电镜技术解析了Vibrio natriegens 70S核糖体与富含脯氨酸的抗菌肽Bac5(1-17)复合物的结构	揭示了Bac5与核糖体出口通道的独特相互作用模式，不同于其他I型PrAMPs	仅研究了Vibrio natriegens这一种细菌的核糖体结构	阐明Bac5抗菌肽与细菌核糖体的结合方式及其抑制蛋白质合成的分子机制	Vibrio natriegens 70S核糖体与Bac5(1-17)抗菌肽复合物	结构生物学	细菌感染	冷冻电镜(cryo-EM)	NA	冷冻电镜图像数据	单个复合物结构
79	2025-05-10	Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways 2025-Apr, Molecular medicine reports IF:3.4Q2 DOI:10.3892/mmr.2025.13465 PMID:39981899	研究论文	研究重组人类胶原蛋白XVII（RHCXVII）在保护皮肤基底膜完整性方面的功效和作用机制	首次阐明RHCXVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的机制	研究仅基于体外HaCaT细胞模型，未涉及体内实验或临床验证	探究RHCXVII在皮肤基底膜保护中的作用及其分子机制	UVB照射的人HaCaT角质形成细胞	合成生物学	皮肤损伤	逆转录定量PCR、蛋白质印迹、磷酸化抗体阵列	UVB诱导的皮肤损伤模型	分子生物学数据	体外培养的HaCaT细胞系
80	2025-05-10	MultiCRISPR-EGA: Optimizing Guide RNA Array Design for Multiplexed CRISPR Using the Elitist Genetic Algorithm 2025-Mar-21, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00860 PMID:39976310	研究论文	开发了一种基于Elitist Genetic Algorithm (EGA)的图形用户界面工具MultiCRISPR-EGA，用于优化多路CRISPR引导RNA阵列的设计	利用EGA算法优化多路gRNA阵列设计，提高了效率和特异性，并提供了实时设计进度控制的GUI界面	未提及实验验证结果或在实际生物系统中的性能表现	优化多路CRISPR引导RNA阵列设计，提高基因组编辑的效率和成本效益	多路CRISPR引导RNA阵列	合成生物学	NA	CRISPR-Cas系统	Elitist Genetic Algorithm (EGA)	基因组数据	NA