合成生物学相关文章
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当前共找到 3183 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-05-31 |
Directed Evolution of Acoustic Reporter Genes Using High-Throughput Acoustic Screening
2024-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00283
PMID:38981096
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研究论文 | 本文描述了通过定向进化技术改进声学报告基因（ARGs）的过程，以提高其在超声成像中的应用效果 | 首次将定向进化技术应用于声学报告基因的优化，开发了高通量声学筛选方法，显著增强了气体囊泡（GVs）的非线性超声散射信号 | 研究目前仅限于细菌培养体系中的筛选，尚未在哺乳动物细胞或活体动物中进行验证 | 开发更高效的声学报告基因，用于生物成像和合成生物学领域 | 气体囊泡（GVs）蛋白纳米结构及其声学特性 | 合成生物学 | NA | 高通量声学筛选、定向进化 | NA | 超声信号数据 | 细菌培养物中的突变体文库 |
| 62 | 2025-05-30 |
Biofabrication of microstructured bacterial ecosystems using chaotic bioprinting: advancingin vitroresearch for microbial engineering
2025-May-29, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/add568
PMID:40334674
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研究论文 | 本文介绍了一种利用混沌3D打印技术制造具有多层微结构的水凝胶构造物的方法，以模拟自然微生物生态系统中的部分隔离现象 | 使用混沌3D打印技术制造微结构化的细菌生态系统，模拟自然微生物群落的空间组织 | 研究仅使用了简化的肠道微生物群落模型，可能无法完全反映复杂自然生态系统的所有特性 | 开发一种能够精确控制微生物空间分布的技术，以更好地研究微生物相互作用 | 混合微生物群落，特别是人类肠道微生物群落的简化模型 | 微生物工程 | NA | 混沌3D打印、荧光显微镜、菌落计数、定量PCR | NA | 图像、菌落计数数据、PCR数据 | 简化的细菌群落模型（具体菌株未明确说明数量） |
| 63 | 2025-05-30 |
dTAT1: An Unnatural Nucleoside Exhibiting Low Photocytotoxicity for Genetic Code Expansion
2025-May-29, The journal of physical chemistry letters
IF:4.8Q1
DOI:10.1021/acs.jpclett.5c00763
PMID:40401918
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research paper | 该研究探讨了非天然核苷dTAT1在遗传密码扩展中的光物理和细胞毒性行为 | 发现dTAT1在390 nm激发下占据三重态但细胞毒性极低，且产生的单线态氧量子产率仅为17%，三重态寿命比dTPT3短2.7倍 | 未明确说明实验所用细胞类型或具体实验条件 | 评估dTAT1在遗传密码扩展中的安全性和潜在治疗应用 | 非天然核苷dTAT1 | 合成生物学 | NA | 光物理分析、活性氧检测 | NA | 化学分析数据 | NA |
| 64 | 2025-05-30 |
Glyceollin biosynthesis in a plant chassis engineered for isoflavone production
2025-May-28, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-01914-3
PMID:40437134
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research paper | 该研究通过代谢工程策略在烟草叶片中高效生产异黄酮前体，并鉴定了六种细胞色素P450单加氧酶作为glyceollin合成酶，完成了glyceollins的15步生物合成途径 | 首次在工程化植物底盘（Nicotiana benthamiana）中实现glyceollins的高产合成，并鉴定出6个关键P450酶完成其15步生物合成途径 | 研究仅在烟草叶片模型中进行验证，尚未在原始宿主大豆或其他作物中测试该代谢通路的适用性 | 解析glyceollins生物合成途径并建立植物底盘生产系统 | 大豆抗菌异黄酮phytoalexins（glyceollins）及其合成酶 | 合成生物学 | 植物病害（由Phytophthora sojae引起） | 代谢工程、酶筛选鉴定、体外抗菌实验 | 植物代谢工程模型 | 生物化学数据 | 工程化烟草叶片（产量数据：daidzein 7.04 g/kg干重，glyceollins最高5.9 g/kg干重） |
| 65 | 2025-05-30 |
Diverse lineages and adaptations of oxygen-adapted hydrogenases
2025-May-27, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.04.006
PMID:40436686
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research paper | 本文探讨了微生物中适应氧气的氢化酶的多样谱系和适应性 | 揭示了[NiFe]-氢化酶通过多种独立进化策略适应有氧环境，包括通过独特的[4Fe3S]簇将结合的氧还原为水以及通过狭窄的气体通道和活性位点重排防止氧结合 | NA | 研究微生物中适应氧气的氢化酶的多样性和适应性 | 细菌和古菌中的[NiFe]-氢化酶 | 微生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2025-05-30 |
Exploring oxidosqualene cyclases and cytochrome P450s from Aralia elata for the synthesis of diverse pentacyclic triterpene sapogenins in Nicotiana benthamiana
2025-May-19, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110047
PMID:40435688
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研究论文 | 该研究通过系统挖掘和功能表征Aralia elata中的氧化角鲨烯环化酶（OSCs）和细胞色素P450s（CYPs），在Nicotiana benthamiana中合成了多种五环三萜皂苷元（PTSs） | 首次在Aralia elata中鉴定了负责β-香树脂醇C-6、C-16或C-28氧化的CYP716酶，并通过组合生物合成策略在N. benthamiana中合成了19种不同的PTSs，其中14种是A. elata中先前未发现的 | 研究仅限于Aralia elata和Nicotiana benthamiana系统，未在其他植物或系统中验证 | 阐明Aralia elata中PTSs的生物合成途径，并增强其结构多样性以促进工业应用 | Aralia elata中的氧化角鲨烯环化酶（OSCs）和细胞色素P450s（CYPs） | 合成生物学 | NA | 代谢组学、转录组学、农杆菌介导的异源表达 | NA | NA | NA |
| 67 | 2025-05-30 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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research paper | 该研究提出了一种多层自催化反馈策略，用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 利用多层反馈策略实现群体水平的积分反馈和多细胞积分器，控制功能通过不同细胞群体间的协调互动实现 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和复杂环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和多细胞系统 | synthetic biology | NA | autocatalytic integral feedback controllers | multilayer feedback controller | NA | NA |
| 68 | 2025-05-30 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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research paper | 该研究揭示了酒精依赖性半萜途径的广泛特异性，并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 揭示了ADH模块第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性，并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | NA | 探索和扩展异戊二烯生物合成的化学空间 | 酒精依赖性半萜途径及其酶 | 合成生物学 | NA | ADH途径 | NA | NA | NA |
| 69 | 2025-05-30 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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research paper | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包，用于高效且适应性强的Wolfiporia cocos遗传修饰 | 该工具包显著提高了转化效率，支持多基因整合，并通过鸡尾酒式组装多个基因到转座子中，避免了复杂的遗传电路组装 | 研究仅限于Wolfiporia cocos，未在其他真菌菌株中验证其普适性 | 开发高效且适应性强的真菌基因组工程工具包 | Wolfiporia cocos真菌菌株 | 合成生物学 | NA | 转座子工程 | NA | 基因组数据 | NA |
| 70 | 2025-05-30 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的稳健性及其基本性能权衡 | 提出了一个理论框架来量化生物反馈的准确性和稳健性，并使用多目标优化方法研究其性能权衡 | 仅研究了五种特定的生物反馈电路，可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 提高对生物反馈调控的理解，并为合成生物学中的稳健电路设计提供指导 | 五种生物反馈电路：正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈（切换开关） | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
| 71 | 2025-05-30 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 该研究利用新发现的转录后调控机制，设计了一种基于CsrA蛋白浓度的生物后转录带通滤波器 | 利用CsrA蛋白与mRNA 5' UTR + 100 nt CDS序列的异质性相互作用，实现了基于浓度的转录后调控，减少了合成电路组件的数量 | 需要进一步表征天然调控RNA-蛋白质系统以开发更复杂的RNP基电路 | 设计合成生物学中的转录后调控电路 | mRNA转录本和CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA |
| 72 | 2025-05-30 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株的高产无细胞蛋白质合成系统，用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因，开发了无需额外添加T7 RNA聚合酶的高产CFPS系统，并实现了半连续反应模式下超过1100 μg/mL的蛋白质产量 | NA | 开发高产无细胞蛋白质合成系统，用于合成生物学和生物技术应用 | Bacillus subtilis 164T7P菌株及其无细胞提取物 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS) | NA | NA | NA |
| 73 | 2025-05-29 |
Generation of cell-sized liposomes using laser-induced microjets
2025-May-28, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00149h
PMID:40302460
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研究论文 | 本研究提出了一种利用激光诱导微射流穿透含脂油相来生成细胞大小脂质体的新方法 | 采用高速激光诱导微射流技术可靠且可重复地生成细胞大小脂质体，实现了按需生产 | NA | 开发一种新型的细胞大小脂质体生成方法，推动膜科学和合成生物学领域的发展 | 细胞大小脂质体 | 合成生物学 | NA | 激光诱导微射流技术、高速摄像技术、数值分析 | NA | 视频数据（高速摄像）、数值模拟数据 | NA |
| 74 | 2025-05-29 |
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencers
2025-May-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00382-25
PMID:40434115
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型CRISPR/dCas介导的反沉默（CRISPRcosi）方法，通过使用无核酸酶活性的dCas酶来对抗Lsr2样异源沉默蛋白CgpS或Lsr2 | 提出CRISPRcosi方法，无需启动子工程即可有效反沉默异源沉默蛋白的靶启动子 | 在缺乏异源沉默蛋白CgpS的菌株中，反沉默效果因靶位点和链的不同而有所差异 | 研究如何通过CRISPR/dCas技术对抗异源沉默蛋白的抑制作用 | Lsr2样异源沉默蛋白CgpS和Lsr2 | 合成生物学 | NA | CRISPR/dCas | NA | 基因组数据 | NA |
| 75 | 2025-05-29 |
Metabolite-Responsive Control of Transcription by Phase Separation-Based Synthetic Organelles
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00633
PMID:39954260
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研究论文 | 本文通过基于液-液相分离的合成细胞器，将代谢信号转化为基因转录调控 | 利用液-液相分离技术构建合成细胞器，实现代谢信号对基因转录的可逆和剂量依赖性调控 | 未提及具体应用场景或体内实验验证 | 开发具有生命感知和适应能力的合成生物材料 | 基于液-液相分离的合成细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA |
| 76 | 2025-05-29 |
Engineering a New Generation of Gene Editors: Integrating Synthetic Biology and AI Innovations
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00686
PMID:39999982
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research paper | 该文章探讨了如何通过合成生物学和人工智能创新来设计新一代基因编辑器 | 整合AI和机器学习技术优化基因编辑酶的发现与设计，提高活性、特异性和免疫原性预测 | 未提及具体实验验证结果或临床转化时间表 | 开发更安全高效的基因组编辑工具并推动其临床转化 | CRISPR-Cas基因编辑系统及其衍生工具 | synthetic biology | NA | AI/ML, rational design, mutagenesis screens, directed evolution | machine learning models | biological sequence data | NA |
| 77 | 2025-05-29 |
Improving Bacillus subtilis as Biological Chassis Performance by the CRISPR Genetic Toolkit
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00844
PMID:40040244
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review | 本文讨论了利用CRISPR基因工具包提高枯草芽孢杆菌作为生物底盘性能的最新进展 | 介绍了CRISPR技术在枯草芽孢杆菌中的应用，包括基因编辑、转录调控和酶调节等方面的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 提高枯草芽孢杆菌作为工业底盘菌的性能，使其能与传统工业微生物如大肠杆菌和酵母相媲美 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR | NA | NA | NA |
| 78 | 2025-05-29 |
Synthetic Biology Strategies for the Production of Natural Colorants and Their Non-Natural Derivatives
2025-03-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00799
PMID:40066730
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review | 本文综述了合成生物学策略在天然色素及其非天然衍生物生产中的应用 | 讨论了通过合成生物学方法提高天然色素产量及扩展其非天然衍生物颜色谱的策略 | 天然色素的稳定性、颜色谱有限以及从自然资源中提取的低产量问题尚未完全解决 | 探索利用合成生物学方法生产天然色素及其非天然衍生物的策略 | 天然色素及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
| 79 | 2025-05-29 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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research paper | 本研究开发了一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的抗终止微生物全细胞生物传感器，用于检测小鼠结肠炎 | 利用抗终止元件设计硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子，优化了生物传感器对炎症环境中硝酸盐和亚硝酸盐的敏感性和特异性响应 | 研究仅在小鼠模型中进行初步评估，尚未在人体中进行验证 | 开发一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的生物传感器，用于体内诊断结肠炎 | Bacteroides thetaiotaomicron和小鼠溃疡性结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 合成生物学技术、微生物全细胞生物传感器 | 微生物全细胞生物传感器(MWCB) | 生物传感器响应数据 | 化学诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型 |
| 80 | 2025-05-29 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo兼容的低拷贝和中拷贝载体，扩展了现有的MoClo工具包，用于在大肠杆菌中实现模块化蛋白质表达 | 扩展了现有的MoClo工具包，增加了低拷贝(p15A)和中拷贝(pBR322)载体，实现了蛋白质表达范围覆盖500倍的荧光输出差异 | 研究仅限于大肠杆菌系统，未在其他宿主中验证载体的适用性 | 开发兼容MoClo的载体系统，优化蛋白质表达水平 | 大肠杆菌中的蛋白质表达 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆, MoClo技术 | NA | DNA构建体, 荧光输出数据 | NA |