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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-20 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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研究论文 | 本文揭示了一种人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 通过结合ADH模块和芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,首次在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物,扩展了异戊二烯类化合物的化学空间 | 未明确提及具体实验规模或下游酶应用的限制 | 研究人工酒精依赖性半萜途径的广泛特异性及其在异戊二烯生物合成中的应用 | ADH模块中的酸磷酸酶PhoN、异戊烯基激酶IPK和下游芳香族异戊二烯基转移酶 | 合成生物学 | NA | 体内生物合成途径工程 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 酒精依赖性半萜途径,包括PhoN和IPK酶模块,用于生产烷基焦磷酸盐 | 工业生物技术 |
| 62 | 2026-04-20 |
Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast
2025-01-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516
PMID:39561540
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程酵母去除工业废水中铅的新方法,通过基因改造和工艺优化实现了低成本、高效率的铅去除 | 提出基于工程酵母生物调控机制的成本控制和工艺放大新技术方案,开发了低成本工程培养基,并采用响应面法优化工业培养系统 | 未明确说明工程酵母的长期稳定性、大规模应用中的生物安全性评估以及与其他重金属共存时的选择性 | 解决工程酵母在重金属污染治理中应用的高成本和工艺放大难题 | 工业废水中的铅污染 | 合成生物学 | NA | 基因敲除技术、响应面优化方法 | NA | 实验数据 | 铅酸电解液和工业含铅废水 | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 通过敲除编码O-乙酰-L-高丝氨酸巯基酶的基因构建产硫化氢的工程酵母菌株 | 环境 |
| 63 | 2026-04-20 |
Development of a C18 Supercritical Fluid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry Methodology for the Analysis of Very-Long-Chain Polyunsaturated Fatty Acid Lipid Matrices and Its Application to Fish Oil Substitutes Derived from Genetically Modified Oilseeds in the Aquaculture Sector
2020-Sep-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.0c02631
PMID:32923786
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研究论文 | 开发了一种基于C18超临界流体色谱-串联质谱的方法,用于分析含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质基质,并将其应用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的效果 | 首次将高强度的硅胶C18柱与超临界流体色谱-串联质谱联用,实现了对复杂脂质组中脂质类别的离散分离及同类别内异构体的选择性分析,特别适用于合成生物学改造产物的脂质组学研究 | 方法主要针对含超长链多不饱和脂肪酸的复杂脂质组,对于其他类型脂质基质的适用性未进行广泛验证 | 开发一种快速、环保且高效的脂质组学分析方法,用于评估转基因油籽来源的鱼油替代品在鲑鱼养殖中的营养效果 | 鲑鱼肉中的复杂脂质组,特别是含有18:3、20:5和22:6等超长链多不饱和脂肪酸的三酰甘油和磷脂 | NA | NA | 超临界流体色谱-串联质谱、主动扫描四极杆技术、数据非依赖性采集 | NA | 质谱数据 | 饲喂转基因油籽补充饲料的鲑鱼与对照饲料鲑鱼的肉质样本 | NA | 转基因油籽(陆地油籽作物) | NA | 农业、水产养殖、工业生物技术 |
| 64 | 2026-04-19 |
RNA-templated diversity generation via reverse transcription and homologous recombination: an evolutionary hypothesis
2026-Apr-17, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
DOI:10.1007/s12064-026-00469-8
PMID:41995898
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研究论文 | 本文提出了一种名为“通过逆转录酶生成多样性”的互补机制,用于解释基因组多样化的新途径 | 提出DGbyRT机制,通过逆转录和同源重组整合RNA到基因组,偏向转录组已有区域,改变序列探索的统计分布 | NA | 探讨基因组多样化的进化机制,特别是基于RNA模板的逆转录和重组过程 | 细胞或外源RNA、逆转录酶、同源重组过程、转录的假基因和重复序列 | NA | NA | 逆转录、同源重组 | NA | NA | NA | AutoDiMe | NA | NA | NA |
| 65 | 2026-04-19 |
Microfluidic platforms for precision delivery of therapeutic cells in regenerative and personalized medicine
2026-Apr-02, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2026.115865
PMID:41935637
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综述 | 本文综述了微流控技术在再生与个性化医学中用于治疗性细胞精准递送的最新进展 | 强调了微流控平台如何通过精确操控流体、生物材料和细胞,改善细胞活力、定位精度和植入持久性,并结合CRISPR基因编辑与合成生物学开发“智能”治疗细胞 | 仍面临监管标准化、大规模生产和临床工作流程整合的挑战 | 推动精准再生医学的发展,解决治疗性细胞临床转化中的递送难题 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、工程化细胞构建体、CAR-T细胞等治疗性细胞 | NA | NA | 微流控技术、软光刻、热塑性塑料加工、3D打印、水凝胶集成、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 66 | 2026-04-19 |
A century of vitamin E research: The innovative journey from basic biology to synthetic bio-manufacturing
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70235
PMID:41866783
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综述 | 本文回顾了维生素E研究一个世纪以来的进展,从基础生物学到合成生物制造 | 揭示了种子特异性酯酶VTE7,建立了叶绿素降解与生育酚合成的直接联系,并探讨了合成生物学方法生产天然维生素E的新范式 | NA | 探索维生素E的化学组成、功能、生物合成途径及生产策略 | 维生素E及其生物活性分子 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物平台 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 67 | 2026-04-19 |
Design and engineering of photorespiratory bypasses in plants
2026-Feb-12, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.007
PMID:41687960
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法设计和工程化植物光呼吸旁路,以克服光呼吸导致的碳损失并提高光合效率 | 将光呼吸旁路分为三类:叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路,并强调通过重编程乙醇酸代谢生产高价值代谢物的策略 | NA | 克服C3植物光呼吸的碳损失限制,提高光合效率 | 植物光呼吸旁路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物 | 光呼吸旁路,包括叶绿体定位的碳释放旁路、碳中性旁路和碳正性旁路 | 农业 |
| 68 | 2026-04-19 |
Model-guided design of regulatable promoters for synthetic biology
2026-Feb, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102701
PMID:41485423
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综述 | 本文综述了在大肠杆菌中通过模型引导设计可调控启动子的方法,结合简单实验与热力学框架优化启动子功能 | 提出了一种基于上下文最小化和测量优先的方法,将简单实验与单一转录因子的热力学模型结合,以优化启动子的动态范围、泄漏性和敏感性 | NA | 设计具有特定功能输出的可调控启动子,以应用于合成生物学 | 大肠杆菌中的启动子序列设计,特别是以LacI为例的转录因子调控机制 | 合成生物学 | NA | 热力学模型、序列-占据测量、拷贝数竞争分析 | 热力学框架模型 | 序列数据、实验测量数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 可调控启动子设计,涉及转录因子占据、功能调控和诱导剂变构 | 工业生物技术 |
| 69 | 2026-04-18 |
Engineering Microbial Particles for Next-Generation Biomedical Platforms
2026-Apr-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202600012
PMID:41995096
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综述 | 本文系统综述了微生物衍生颗粒(MDPs)的类别、生物合成途径、理化特性及其在生物医学领域的应用,并探讨了其未来发展方向 | 系统整合了MDPs作为生物启发纳米材料的多样化类别、生物工程调控方法及其在药物递送、疫苗设计等领域的应用,并展望了合成生物学与材料科学结合开发下一代智能生物平台的前景 | NA | 综述微生物衍生颗粒(MDPs)的生物学特性、工程化方法及其在生物医学平台中的应用 | 微生物衍生颗粒(MDPs),包括细胞外囊泡、外膜囊泡、包涵体、多糖颗粒和病毒样颗粒 | NA | NA | 组学分析、先进成像技术 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 医学 |
| 70 | 2026-04-18 |
Toward sustainable production of bulnesol and elemol enabled by synthetic biology in Saccharomyces cerevisiae
2026-Apr-16, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-026-04893-8
PMID:41989556
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2026-04-18 |
Growth versus Decline: Root Aging and Plant Performance
2026-Apr-16, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag115
PMID:41990352
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综述 | 本文综述了根生长与衰老的分子生理机制,并探讨了延缓根衰老以提升作物生产力的策略 | 将根生长与衰老机制联系起来,并提出利用遗传和合成生物学方法干预根衰老的创新思路 | 根衰老研究因技术挑战(如老根采样分析困难)而受限,现有知识可能不全面 | 探讨根衰老对植物性能的影响,并研究通过延缓衰老来增强作物产量和气候适应性的方法 | 植物根系,特别是作物根系 | 植物生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 植物 | NA | 农业, 环境 |
| 72 | 2026-04-18 |
A biosynthetic survey of hypocrealean biocontrol fungi
2026-Apr-16, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-026-02201-5
PMID:41991721
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研究论文 | 本研究通过系统调查82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌的生物合成能力,揭示了其生物合成基因簇的多样性和未知产物,为农业可持续害虫控制提供了基础 | 首次大规模整合系统基因组学、代谢组学和异源表达技术,全面编目肉座菌目真菌的生物合成基因簇,并发现约80%的基因簇编码未知产物,结合合成生物学表征了新型非核糖体肽合成酶样合成酶 | 研究中约80%的生物合成基因簇产物功能未知,需要进一步实验验证其生物活性和应用潜力 | 探索肉座菌目真菌的生物合成能力,以开发可持续的农业害虫控制策略 | 82种与植物和昆虫相关的肉座菌目真菌物种 | 合成生物学 | NA | 系统基因组学、代谢组学、异源表达、代谢基因组学工作流 | NA | 基因组数据、代谢物数据 | 82种真菌物种 | 合成生物学 | 真菌(肉座菌目) | 生物合成基因簇分析,涉及吡啶酮、脱硫类司莫斯特林和埃弗拉肽等天然产物的生物合成途径 | 农业 |
| 73 | 2026-04-18 |
How custom polymerases are driving innovation in synthetic biology
2026-Apr-15, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2026.102682
PMID:41990559
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综述 | 本文综述了定制聚合酶如何推动合成生物学创新,特别是在扩展遗传信息化学边界方面的应用 | 定制聚合酶突破了天然聚合酶对DNA、RNA及其有限化学修饰类似物的限制,实现了RNA的引物延伸合成和具有非天然骨架结构的合成遗传聚合物(XNAs) | NA | 探讨定制聚合酶在合成生物学、生物技术和分子医学领域的创新驱动作用 | 定制聚合酶及其在合成生物学中的应用 | 合成生物学 | NA | 聚合酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 分子医学 |
| 74 | 2026-04-18 |
Negative design enables cell-free expression and folding of designed transmembrane β-barrels
2026-Apr-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2528772123
PMID:41950096
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研究论文 | 本研究利用无细胞表达系统研究跨膜β桶蛋白的设计与折叠,提出通过负设计策略抑制聚集倾向以改善膜组装 | 发现抑制聚集倾向中间体(通过β链局部去稳定化的“负设计”)能显著改善膜组装,即使通常认为高度去稳定的取代(如脯氨酸或暴露于双层核心的极性苏氨酸)在策略性定位时也能改善折叠 | 研究主要针对理想化的小型跨膜β桶蛋白,其发现向更复杂膜蛋白设计的普适性仍需验证 | 探究序列特征如何影响设计的跨膜β桶蛋白在合成膜中的热力学驱动组装,以推动膜蛋白的从头设计 | 设计的跨膜β桶蛋白变体 | 合成生物学 | NA | 无细胞表达系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 跨膜β桶蛋白的合成设计 | 工业生物技术 |
| 75 | 2026-04-18 |
The horizontally transferred gene, CsMTAN, rewired purine traffic to build caffeine factories in tea leaves
2026-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13957
PMID:40607640
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和基因组关联分析,揭示了茶树中水平转移基因CsMTAN如何调控嘌呤代谢和咖啡因生物合成 | 首次鉴定出CsMTAN基因通过水平转移事件进入植物基因组,并发现其F179Y突变显著影响酶活性和嘌呤代谢流量 | 研究主要基于体外酶活实验和瞬时过表达,缺乏稳定的转基因茶树验证;样本量183个虽具多样性但可能未覆盖所有自然变异 | 探究茶树嘌呤代谢和嘌呤生物碱(如咖啡因)生物合成的遗传与分子机制 | 茶树(Camellia sinensis)的183个遗传多样性种质及其叶片组织 | 植物代谢组学与合成生物学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联研究(GWAS)、体外酶活测定、系统发育分析、蛋白质结构建模 | NA | 代谢物数据、基因组数据 | 183个茶树种质的幼叶和成熟叶组织 | 瞬时过表达(在烟草中) | 茶树(Camellia sinensis)、本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | NA | 农业(分子育种)、工业生物技术(合成生物学) |
| 76 | 2026-04-18 |
Design-driven optimization of low-cost reagent formulations for reproducible and high-yielding cell-free gene expression
2026-Mar-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69605-8
PMID:41786720
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研究论文 | 本研究通过多维度确定性筛选设计,优化了无细胞基因表达系统的试剂配方,显著降低了成本并提高了蛋白质产量和可重复性 | 采用多维度确定性筛选设计从1231种配方中筛选出仅含12种组分的简化配方,实现了95%的成本降低,并首次证明该配方能从含氮碱基和核糖直接合成核苷三磷酸 | 未明确说明该配方对极端温度或pH条件的稳定性,也未涉及大规模工业化生产的详细验证 | 开发低成本、高产量且可重复的无细胞基因表达系统 | 无细胞基因表达系统的试剂配方 | 合成生物学 | NA | 多维度确定性筛选设计、无细胞基因表达 | NA | 实验数据 | 1231种不同试剂配方,测试超过20种不同蛋白质 | NA | 无细胞系统(基于细胞裂解液) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 77 | 2026-04-18 |
Deciphering substrate promiscuity and specificity of indolethylamine N-methyltransferase family enzymes from amphibian toads
2024-12, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2024.107950
PMID:39522428
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研究论文 | 本研究从两栖动物蟾蜍中鉴定出七种具有不同催化特性的吲哚乙胺N-甲基转移酶家族酶,并解析了其底物混杂性和特异性的分子机制 | 首次在蟾蜍中系统鉴定INMT家族酶,揭示了其底物混杂性与特异性的多样性,并通过分子对接和突变实验阐明了相关机制 | 研究主要基于体外酶学实验,未在活体系统中验证酶的功能;样本来源仅限于一种蟾蜍物种,可能缺乏普适性 | 探究INMT家族酶的底物混杂性和特异性机制,为天然产物生物合成和合成生物学应用提供基础 | 从Bufo gargarizan蟾蜍中鉴定的七种INMT家族酶(BNMT 1, 3, 4, 5, 6, 7, 11) | 合成生物学 | NA | 分子对接、定点突变、酶学活性测定 | NA | 酶学数据、分子模拟数据 | 七种酶蛋白 | NA | Bufo gargarizan(蟾蜍) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 78 | 2026-04-17 |
Artificial allosteric protein switches with machine-learning-designed receptors
2026-Apr-15, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03081-9
PMID:41986695
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研究论文 | 本文展示了利用机器学习设计的受体构建人工变构蛋白开关,用于小分子、肽和蛋白质的生物传感,并应用于逻辑门和生物电子设备 | 利用机器学习工程化的最小配体结合域作为单组分变构开关中的高效受体,无需全局构象变化,并开发了完全合成的人工变构开关 | NA | 开发人工变构蛋白开关,用于合成生物学和生物技术中的信息与能量处理 | 人工变构蛋白开关、生物传感器、逻辑门、生物电子设备 | 机器学习 | NA | 机器学习、氢/氘交换质谱、F核磁共振分析 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 单组分变构开关、分子内YES和AND逻辑门 | 生物技术、医学 |
| 79 | 2026-04-17 |
seq2ribo: Structure-aware integration of machine learning and simulation to predict ribosome location profiles from RNA sequences
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.08.700508
PMID:41726975
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研究论文 | 本文介绍了一种名为seq2ribo的混合模拟与机器学习框架,用于仅基于mRNA序列预测核糖体A位点位置 | 首次结合结构感知的TASEP模拟和机器学习抛光模型,实现了仅从序列预测核糖体位置的高保真度,无需表达数据或基因组背景 | NA | 开发一种工具,用于合成生物学中的mRNA序列理性设计与优化,特别是针对mRNA疫苗等新序列设计 | mRNA序列及其对应的核糖体位置分布 | 机器学习 | NA | 核糖体分析(Ribo-seq)、RNA-seq、结构感知TASEP模拟 | 混合框架(包括sTASEP和抛光模型) | 序列数据(mRNA序列) | 多种细胞类型(iPSC、HEK293、LCL、RPE-1) | NA | NA | NA | 医学(如mRNA疫苗设计)、合成生物学 |
| 80 | 2026-04-17 |
Biodesulfurization: Back on-stage through synthetic biology and metabolic engineering approaches
2026-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2026.103449
PMID:41687421
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和代谢工程方法复兴生物脱硫技术,重点关注4S途径及其在红球菌和革兰氏阴性菌平台中的应用 | 整合了红球菌和假单胞菌平台的最新进展,包括操作子重构、底盘设计以及过程级约束的融合,并讨论了与加氢脱硫的整合策略 | NA | 探索生物脱硫技术,以解决中馏分燃料中持久性有机硫化合物的脱除问题 | 红球菌(野生型性能、调控、系统生物学和基因工程)和革兰氏阴性菌平台(尤其是假单胞菌) | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学、基因工程 | NA | NA | NA | 操作子重构、底盘设计 | Rhodococcus, Pseudomonas | 4S途径(生物脱硫途径),涉及C-S键断裂而保留烃骨架 | 能源, 工业生物技术 |