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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-09-20 |
Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00368
PMID:40844977
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研究论文 | 本研究在构巢曲霉中鉴定并验证了翻译延伸因子1-α基因启动子(含第一内含子)作为目前最强启动子,开发了高效报告系统 | 发现了比常用启动子活性高20倍以上的新型强启动子,并成功应用于多基因共表达和核定位信号鉴定 | NA | 开发用于真菌合成生物学的高性能遗传工具 | 构巢曲霉 | 合成生物学 | NA | 甲基伞形酮报告基因检测、荧光蛋白报告系统、P2A肽共表达系统 | NA | 荧光信号、染色信号 | NA |
62 | 2025-09-20 |
Progress in the Synthesis of Sterols and Related Natural Products by Manipulating the Ergosterol Biosynthetic Pathway in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00438
PMID:40859817
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综述 | 本文系统评述了利用合成生物学方法在酿酒酵母中通过工程化麦角固醇生物合成途径生产固醇及相关天然产物的研究进展 | 通过异源途径整合和代谢通量系统性增强,实现真核平台从头合成多种高价值类固醇 | NA | 促进固醇类化合物在农业和制药工业中的应用 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA |
63 | 2025-09-20 |
Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00379
PMID:40891340
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研究论文 | 提出一种通过催化残基重编程增强酶在碱性pH下活性的策略,利用酚盐介导的质子转移机制 | 将保守的通用碱基替换为更高pKa的可电离残基,实现从羧酸盐到酚盐介导催化的机制转变 | NA | 开发在极端pH条件下实现高效酶催化的工程策略 | TEM β-内酰胺酶及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 理性重设计、定向进化、稳态动力学分析、分子动力学模拟 | NA | 酶活性数据、动力学参数、模拟数据 | 工程酶变体YR5-2及其亲本变体 |
64 | 2025-09-20 |
Microbial therapeutics for cancer: emerging strategies and biomedical applications
2025-Sep-18, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc03618f
PMID:40891348
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综述 | 本文全面概述了工程微生物在癌症治疗中的设计、功能化及生物医学应用 | 聚焦基因编辑和表面修饰等前沿策略,提升微生物特异性、免疫相容性和治疗潜力 | 临床转化面临挑战,需跨学科整合 | 开发基于工程微生物的下一代癌症疗法,克服传统治疗局限 | 工程微生物及其在肿瘤微环境中的应用 | 合成生物学与纳米技术交叉领域 | 癌症 | 基因编辑、表面修饰、纳米技术整合 | NA | NA | NA |
65 | 2025-09-20 |
Pathway crosstalk enables degradation of aromatic compounds in marine Roseobacter clade bacteria
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00978-25
PMID:40793766
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研究论文 | 本研究揭示了海洋Roseobacter分支细菌通过途径串扰降解芳香化合物的完整代谢路径 | 发现了β-酮己二酸途径与β-氧化途径在最终硫解步骤的独特串扰机制,并建立了新型海洋平台用于系统生物学研究 | NA | 解析海洋细菌中芳香化合物的生物降解途径,推动生物修复和碳循环应用 | 海洋Roseobacter分支细菌及其芳香化合物降解代谢途径 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、CRISPR-Cas基因组编辑 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA |
66 | 2025-09-20 |
Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00741-25
PMID:40801494
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研究论文 | 本研究在酿酒酵母中开发并评估了一种基于RelE毒素的kill switch生物安全系统,旨在建立有效的生物封闭策略并解析逃逸机制 | 通过高分辨率分析平台系统评估了kill switch在不同菌株中的表现,首次揭示了cam-TA和RelE毒素突变驱动的逃逸机制及脱靶突变的影响 | 多拷贝整合虽显著降低逃逸频率但仍无法实现持续生物封闭,工业菌株与实验室菌株的差异响应尚未完全解析 | 开发安全可靠的基因工程微生物生物封闭策略,防止其逃逸到自然环境中 | 酿酒酵母实验室菌株和工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR介导的基因整合、基因组重测序、遗传工程 | NA | 基因组测序数据、表型数据 | 多种实验室和工业酿酒酵母菌株(具体数量未明确说明) |
67 | 2025-09-20 |
Bacteria-mediated cancer therapy (BMCT): Therapeutic applications, clinical insights, and the microbiome as an emerging hallmark of cancer
2025-Sep-17, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118559
PMID:40967079
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综述 | 本文探讨了宿主微生物群在癌症治疗中的多面作用,包括细菌介导的癌症疗法(BMCT)的机制、应用及临床转化潜力 | 提出微生物组作为癌症的新兴标志性特征,并系统总结工程化细菌在免疫调节和联合免疫检查点抑制剂中的协同作用 | 安全性、递送特异性及监管问题尚未完全解决 | 综述细菌介导癌症疗法的机制、临床应用及微生物组在癌症治疗中的角色 | 共生及工程化细菌(如梭菌属、双歧杆菌属、李斯特菌属等)及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 合成生物学、精准微生物组工程、粪便微生物移植 | NA | 临床实验数据、微生物组数据 | NA(涉及多种临床试验,但未明确样本数量) |
68 | 2025-09-20 |
Synthetic Antimicrobial Peptides: Combatting Antibiotic Resistance for Sustainable Aquaculture
2025-Sep-16, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108029
PMID:40967516
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综述 | 本文综述了合成抗菌肽作为可持续水产养殖中抗生素替代品的必要性、设计策略及环境影响 | 整合合成生物学与计算建模方法,开发具有增强稳定性、效力和靶向抗菌作用的合成抗菌肽 | NA | 探讨合成抗菌肽作为抗生素替代品在水产养殖疾病控制中的应用 | 抗菌肽(AMPs)及其合成类似物 | 计算生物学 | 细菌感染 | 机器学习、计算工具 | NA | NA | NA |
69 | 2025-09-20 |
Automated and Programmable Cell-Free Systems for Scalable Synthetic Biology with a Focus on Biofoundry Integration
2025-Sep-16, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2507.07019
PMID:40967915
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综述 | 本文综述了无细胞蛋白质合成(CFPS)技术与自动化生物铸造厂集成在合成生物学中的进展与应用 | 强调CFPS与自动化生物铸造厂及机器学习结合,实现可编程、可扩展和分布式生物工程 | NA | 推动合成生物学中可编程和可扩展生物工程平台的发展 | 无细胞蛋白质合成系统及自动化生物铸造厂 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、液体处理机器人技术、数字微流控 | 机器学习 | NA | NA |
70 | 2025-09-20 |
Structure prediction and engineering of de novo proteins
2025-Sep-15, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics
DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100
PMID:40962101
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综述 | 本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义及研究方法,涵盖自然进化与人工设计两类 | 强调自然进化过程与理性蛋白质工程日益融合的趋势及其在生物发现与人类创新中的重要性 | NA | 概述从头蛋白质研究领域的定义、方法及挑战 | 自然进化与人工设计的从头蛋白质 | 合成生物学 | NA | 计算与实验方法 | NA | NA | NA |
71 | 2025-09-20 |
Probiotic Bacteria as Therapeutics and Biohybrid Drug Carriers: Advances, Design Strategies, and Future Outlook
2025-Sep-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00959
PMID:40888536
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综述 | 本文综述了益生菌作为药物递送平台的多样化策略及其在精准医疗中的应用前景 | 探讨了将益生菌整合到纳米颗粒递送系统的策略,并强调合成生物学和生物杂交涂层等前沿技术优化治疗效果的潜力 | NA | 分析益生菌作为药物载体在靶向治疗中的应用进展和未来发展方向 | 益生菌及其衍生物(如细菌幽灵、外膜囊泡等)作为药物递送平台 | 生物医学工程 | 癌症、胃肠道疾病 | 纳米技术、基因工程(质粒表达、基因组整合)、合成生物学 | NA | NA | NA |
72 | 2025-09-20 |
Cephalotaxus-Derived Homoharringtonine: Biosynthesis, Mechanism of Action, and Role in Modern Cancer Therapy
2025-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70122
PMID:40970823
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综述 | 本文综述了三尖杉属植物来源的高三尖杉酯碱的生物合成、作用机制及其在现代癌症治疗中的应用 | 批判性评估了三尖杉生物碱在实体瘤中的未充分研究机制、转化障碍及创新策略,并探讨合成生物学和精准医学等未来方向 | 存在相关代谢物生物活性知识缺口,面临化学复杂性、监管障碍和毒性特征等挑战 | 评估三尖杉生物碱作为抗癌药物的潜力及其在精准肿瘤学中的应用 | 三尖杉属植物及其生物碱(如高三尖杉酯碱) | NA | 白血病、癌症 | 合成生物学、先进药物递送系统 | NA | NA | NA |
73 | 2025-09-20 |
Compartmentalized Terpenoid Production in Plants Using Agrobacterium-Mediated Transient Expression
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3658-9_2
PMID:38468080
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研究论文 | 本文介绍了利用农杆菌介导的瞬时表达技术在植物中区室化生产萜类化合物的方法 | 采用合成生物学方法在亚细胞水平区室化萜类生物合成,包括质体、细胞质和脂滴表面 | NA | 快速开发和区室化萜类生物合成途径 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中的萜类化合物生产 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导的瞬时表达 | NA | NA | NA |
74 | 2025-09-19 |
Engineered implementations of spatial computation in biological systems
2025-Oct, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.103631
PMID:40712326
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综述 | 探讨空间分布式和区室化框架在工程化生物计算中的应用,超越传统单细胞逻辑系统 | 通过模拟形态发生素梯度和细胞区室化等自然现象,实现可扩展性、鲁棒性和适应性的合成空间计算系统 | NA | 整合空间与自适应计算,解决超越传统计算架构的复杂计算挑战 | 工程化生物系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
75 | 2025-09-19 |
Using transcription and translation regulators to improve recombinant protein expression in CHO cells
2025-Sep-18, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025160
PMID:40963405
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综述 | 本文总结了通过转录和翻译调控因子提高CHO细胞中重组治疗蛋白表达的策略 | 整合合成生物学方法和基因组学进展,提出定制化转录因子及翻译因子的优化策略 | NA | 提高重组治疗蛋白在CHO细胞中的表达效率并降低生产成本 | 中国仓鼠卵巢(CHO)细胞 | 合成生物学 | NA | 转录因子工程、启动子设计、翻译调控 | NA | 基因组数据 | NA |
76 | 2025-09-19 |
Broad-Host-Range Synthetic Biology: Rethinking Microbial Chassis as a Design Variable
2025-Sep-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00308
PMID:40964802
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观点文章 | 本文探讨了广宿主范围合成生物学如何将微生物宿主选择重新定义为设计变量,超越传统模式生物的限制 | 提出将宿主选择作为关键设计参数,通过资源分配、代谢互作和调控串扰影响工程遗传设备行为,拓展了合成生物学的设计空间 | NA | 推动合成生物学从有限宿主向广宿主范围发展,提升工程生物系统的功能多样性和应用潜力 | 微生物宿主系统及其在遗传设计中的角色 | 合成生物学 | NA | 模块化载体、宿主无关遗传设备 | NA | NA | NA |
77 | 2025-09-19 |
Insights into microalgal biotechnology: Current applications, key challenges, and future prospects
2025-Sep-16, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.127263
PMID:40961787
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综述 | 本文综述了微藻生物技术的当前应用、主要挑战和未来前景,强调其在碳捕获、可再生能源生产和环境修复等方面的多功能性 | 整合了生物絮凝、磁性分离、合成生物学和光生物反应器设计等最新进展,提出模块化生物精炼系统和智能过程控制等未来发展方向 | 大规模部署仍受技术经济障碍限制,特别是生物质收获和脱水的高成本 | 探讨微藻生物技术的潜力和实现可持续循环生物经济的关键策略 | 微藻及其在碳捕获、能源生产和环境修复中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、生物絮凝、磁性分离、太阳能辅助干燥 | NA | NA | NA |
78 | 2025-09-19 |
A highly biosimilar synthetic Calculus Bovis enhances cerebral blood flow and provides neuroprotection against ischemic stroke
2025-Sep-11, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120602
PMID:40945882
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研究论文 | 本研究评估了一种高仿生合成牛黄在缺血性脑卒中后减轻脑损伤和增强脑血流的效果 | 首次通过合成生物学方法制备高仿生合成牛黄,并证实其在4小时治疗时间窗内具有与天然牛黄相似的神经保护作用和改善脑血流机制 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或更复杂的临床前模型 | 评估高仿生合成牛黄治疗缺血性脑卒中的疗效和机制 | C57BL/6J雄性小鼠(经tMCAO手术诱导缺血性脑卒中模型) | 药理学 | 缺血性脑卒中 | 合成生物学、色谱指纹图谱、激光散斑对比成像、FJB染色、尼氏染色 | 动物模型(小鼠tMCAO模型) | 生物化学数据、影像数据、行为学数据 | 使用不同剂量组(35.95, 71.9, 143.8 mg/kg)和多时间点给药的小鼠样本 |
79 | 2025-09-19 |
Design of strictly orthogonal biosensors for maximizing renewable biofuel overproduction
2025-Sep-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.015
PMID:40939890
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的模型BT,用于预测转录因子BmoR的关键残基区域,以实现严格配体正交性,并应用于生物燃料高产菌株筛选 | 首次提出BSH(BmoR-信号分子氢键)计数在TF-SM相互作用中的主导作用,并建立机器学习指导的TF进化框架 | NA | 实现转录因子BmoR的严格配体正交性设计,用于生物传感器构建和生物燃料高产筛选 | 转录因子BmoR及其突变体,信号分子复合物 | 合成生物学 | NA | 随机森林算法,Discovery Studio分子模拟,MicroScale Thermophoresis (MST) 亲和力测定 | Random Forest | 分子模拟数据,实验验证数据 | 245个TF-SM复合物实验验证,5,700个BmoR突变体与4种SMs的22,800个复合物模拟 |
80 | 2025-09-19 |
Developmental regulatory factors promote the efficiency of crop genetic transformation
2025-Sep, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-345
PMID:40962472
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综述 | 本文系统探讨了发育调控因子在提高作物遗传转化效率中的应用与前景 | 深入分析了发育调控因子在克服基因型依赖性和提升再生能力方面的创新应用 | NA | 提升作物遗传转化技术的效率并克服现有瓶颈 | 作物遗传转化方法与发育调控因子 | 农业生物技术 | NA | 农杆菌介导转化、基因枪技术 | NA | NA | NA |