合成生物学相关文章
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当前共找到 4035 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-12-09 |
Discovery of a Heme-Dependent Enzyme Catalyzing Nitrogen-Nitrogen Bond Formation in Kinamycin Biosynthesis
2025-Dec-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202513778
PMID:41137433
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研究论文 | 本文报道了在kinamycin生物合成中，发现了一种依赖血红素的新酶Alp1J，它催化氮-氮键的形成，并与伴侣铁氧还蛋白Alp1I形成稳定复合物以保护辅因子 | 首次鉴定出属于血红素依赖酶新家族的Alp1J，能催化kinamycin生物合成中的氮-氮键形成，并揭示其与伴侣铁氧还蛋白Alp1I的复合物对活性的关键作用 | NA | 探究kinamycin和lomaiviticin等天然产物中氮-氮键形成的生物合成机制 | kinamycin生物合成途径中的酶Alp1J及其伴侣铁氧还蛋白Alp1I | NA | NA | 定点诱变、生化研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 62 | 2025-12-09 |
Liposome array on a power-free microfluidic device for analysis of nanopore formation
2025-Dec-08, The Analyst
DOI:10.1039/d5an01113b
PMID:41358853
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研究论文 | 本文提出了一种基于脂质体阵列的无动力微流控设备，用于分析由两性霉素B与麦角固醇相互作用引起的纳米孔形成，并评估了增强剂shodoamide C的效果 | 首次开发了通过浓度依赖性释放曲线测量两性霉素B及其增强剂或抑制剂活性的分析系统，为膜活性治疗剂的开发提供了新工具 | NA | 研究纳米孔在脂质体膜上的形成特性，并开发一种用于分析膜活性化合物的新系统 | 脂质体膜、两性霉素B、麦角固醇、shodoamide C | 合成生物学 | NA | 水包油包水乳液法、无动力泵送微流控技术、荧光观察 | NA | 荧光图像数据 | NA | NA | NA | 基于脂质体膜的纳米孔形成生物传感器 | 药物发现、合成生物学 |
| 63 | 2025-12-09 |
Harnessing microalgae for bioproducts: innovations in synthetic biology
2025-Dec-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04727-7
PMID:41359128
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综述 | 本文综述了合成生物学在微藻工程中的应用进展，探讨了其在可持续生产生物燃料和高价值生物产品方面的潜力 | 系统总结了CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库和动态环境响应调控回路等最新合成生物学工具在微藻工程中的创新应用 | 微藻菌株的鲁棒性和生物工艺转化仍存在挑战，工业化规模应用的经济可行性有待进一步验证 | 推动微藻作为可持续生物制造平台的发展，促进低碳生物经济的发展 | 微藻及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆、合成启动子设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化克隆系统 | 微藻（包括模式种和顽固物种） | 动态环境响应调控回路、代谢通路重编程 | 能源, 工业生物技术, 环境 |
| 64 | 2025-12-09 |
Next-Generation Probiotics in Allergy Therapy: Scientific Evidence and Clinical Applications
2025-Dec-04, Anti-inflammatory & anti-allergy agents in medicinal chemistry
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综述 | 本文综述了下一代益生菌在过敏性疾病治疗中的科学证据和临床应用 | 探讨了下一代益生菌（如Akkermansia muciniphila、Faecalibacterium prausnitzii）相比传统益生菌更具靶向性的免疫调节和肠道屏障修复作用 | 存在菌株特异性、剂量、免疫受损个体安全性以及监管分类问题 | 评估益生菌在过敏性疾病免疫调节和肠道屏障功能恢复中的治疗潜力 | 过敏性疾病（如特应性皮炎、过敏性鼻炎、哮喘、食物过敏）及其免疫失调机制 | NA | 过敏性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 65 | 2025-12-09 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Dec, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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综述 | 本文综述了将原始细胞组装成原始组织的方法，以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 系统探讨了多种原始细胞模型的构建及其组装成具有通信、集体行为等功能的原始组织的化学与物理方法，为合成生物学和再生医学提供了设计思路 | NA | 探索原始细胞组装成原始组织的构建方法、特性及其在生物医学中的应用潜力 | 原始细胞模型（如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层、乳液液滴）及其组装形成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 再生医学 |
| 66 | 2025-12-09 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2025-Nov-07, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
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综述 | 本文综述了2020年至2025年间，人工智能和机制建模在表征天然产物生物合成途径中的应用与进展 | 整合人工智能预测方法和机制模拟，以加速天然产物的发现、工程化及应用，特别是在药物发现和生物技术领域 | NA | 加速天然产物的发现、工程化及其在药物发现、生物技术和合成生物学中的应用 | 天然产物的生物合成途径 | 机器学习 | NA | 人工智能、机制建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |
| 67 | 2025-12-09 |
Halogenases and dehalogenases: mechanisms, engineering, and applications
2025-Nov-03, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00055f
PMID:41181914
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综述 | 本文综述了卤化酶和脱卤酶在机制、工程改造及应用方面的最新进展，重点关注其在生物合成和生物修复中的集成应用 | 系统总结了不同类型卤化酶和脱卤酶的最新工程化进展，并探讨了将其整合到可扩展平台中的合成生物学策略 | NA | 探讨卤化酶和脱卤酶在生物催化卤化与脱卤反应中的机制、工程改造潜力及其工业与环境应用 | 卤化有机化合物、卤化酶（包括卤过氧化物酶、黄素依赖型、α-酮戊二酸依赖型、SAM依赖型等）和脱卤酶（还原型、水解型、氧化型） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶工程、生物催化 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 68 | 2025-12-09 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2025-Sep-09, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文全面分析了2004年至2024年间超过450项关于在链霉菌宿主中异源表达生物合成基因簇的研究，探讨了其在天然产物发现和合成生物学中的应用 | 首次从数据驱动角度提供了该领域二十年来的定量趋势分析，包括BGC类型、供体物种和宿主菌株偏好，并整合了合成生物学工具和基因组工程进展 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成中的潜力和应用 | 链霉菌宿主和来自不同微生物来源的生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、合成生物学工具 | NA | 文本（文献综述） | 超过450项同行评审研究 | CRISPR-Cas9, 基因组工程 | 链霉菌 | 生物合成基因簇的异源表达、组合生物合成 | 药物发现、工业生物技术 |
| 69 | 2025-12-09 |
Toward a unified pipeline for natural product discovery: tools and strategies for NRPS and PKS pathway exploration and engineering
2025-Jul-28, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00041f
PMID:40719200
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综述 | 本文综述了将非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统转化为理性设计平台的最新进展 | 整合基因组挖掘、高通量筛选、合成生物学工具和计算建模（包括深度学习方法），以加速定制天然产物类似物的发现与组装 | NA | 探索和改造非核糖体肽合成酶和聚酮合酶生物合成途径，以发现和设计新型天然产物 | 非核糖体肽合成酶和聚酮合酶系统及其产生的天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、高通量筛选、同源建模、分子对接、分子动力学模拟、深度学习 | 深度学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 70 | 2025-12-09 |
Manipulating the 3D organization of the largest synthetic yeast chromosome
2023-12-07, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.10.015
PMID:37944526
|
研究论文 | 本文报道了合成酵母染色体synIV的从头合成，并探索了其三维结构对基因调控的影响 | 开发了megachunk组装结合分层整合策略，首次合成最大的真核染色体，并通过操纵三维结构实现染色体范围的转录调控 | 研究发现酵母核质内定位对基因调控作用较小，可能限制了空间调控的应用范围 | 探索合成基因组能否支持生命活动，并研究三维结构在基因调控中的作用 | 合成的酵母染色体synIV | 合成生物学 | NA | megachunk组装、分层整合策略、loxPsym位点锚定 | NA | 基因组序列数据、基因表达数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 酵母 | 通过loxPsym位点将染色体锚定至核内膜，实现转录抑制的合成生物电路 | 工业生物技术 |
| 71 | 2025-12-09 |
Engineered gut symbiont inhibits microsporidian parasite and improves honey bee survival
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2220922120
PMID:37307477
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研究论文 | 本研究通过工程化改造蜜蜂肠道共生菌，使其表达靶向微孢子虫寄生虫必需基因的双链RNA，从而抑制寄生虫增殖并提高蜜蜂存活率 | 首次利用合成生物学方法，工程化蜜蜂肠道共生菌来靶向抑制微孢子虫寄生虫，并通过RNA干扰机制实现长期保护 | NA | 开发一种替代小分子药物的长期策略，以对抗蜜蜂微孢子虫寄生虫感染，防止蜂群崩溃 | 蜜蜂及其肠道共生菌，以及微孢子虫寄生虫 | 合成生物学 | 寄生虫感染 | RNA干扰（RNAi），双链RNA（dsRNA）表达 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 蜜蜂肠道共生菌 | 工程化共生菌表达靶向寄生虫必需基因的dsRNA，激活寄生虫的RNAi通路 | 农业 |
| 72 | 2025-12-08 |
Creating a novel halotolerant whole-cell biosensor for efficient degradation and precise quantification of p-nitrophenol-substituted organophosphate pesticides in hypersaline ecosystems
2026-Feb-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118240
PMID:41285662
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研究论文 | 本研究构建了一种新型耐盐全细胞生物传感器，用于高盐环境中对硝基酚取代的有机磷农药的高效降解和精确定量 | 首次利用耐盐底盘Halomonas cupida J9构建了耐盐全细胞生物传感器，通过动态调控PobR表达水平显著降低了背景荧光，并将优化的生物传感电路引入具有降解功能的底盘，实现了检测与降解的双重功能 | 生物传感器仅对pNP取代的有机磷农药（如甲基对硫磷和杀螟硫磷）具有特异性，对非pNP取代的有机磷农药（如毒死蜱）无响应 | 开发适用于高盐环境的有机磷农药检测与降解技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药（如甲基对硫磷） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、全细胞生物传感器构建、HPLC分析 | NA | 荧光信号、浓度测量数据 | 海水、高盐度河水、盐碱土样品 | BioBrick | Halomonas cupida J9 | 基于pNP响应转录调节因子PobR及其同源启动子与GFP报告基因融合的生物传感电路，结合有机磷农药降解通路 | 环境 |
| 73 | 2025-12-08 |
Directed evolution-driven reprogramming of PD-L1 for compact and tunable checkpoint modulation
2025-Dec-05, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00577-x
PMID:41345880
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研究论文 | 本研究通过酵母表面展示定向进化技术，开发了一种紧凑且可调控的PD-L1变体，用于增强PD-1结合亲和力并改善免疫检查点抑制剂的治疗潜力 | 利用定向进化技术改造PD-L1，获得双突变体（DM），其PD-1结合亲和力比野生型提高173倍，同时保持低免疫原性，并通过结构建模揭示了亲和力增强的分子机制 | NA | 开发一种紧凑、可调控的PD-L1变体，以克服传统IgG类检查点抑制剂的局限性，如分子尺寸大和Fc效应介导的T细胞耗竭 | PD-L1蛋白变体及其与PD-1的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 酵母表面展示定向进化、计算机免疫原性分析、结构建模、功能测定 | NA | 蛋白质序列、结构模型、细胞培养数据 | NA | 定向进化 | 酵母 | NA | 医学 |
| 74 | 2025-12-08 |
Molecular approaches to increasing plant root carbon
2025-Dec-05, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.006
PMID:41353042
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综述 | 本文综述了利用分子和合成生物学方法增强植物根系碳储存的策略，以应对温室气体减排挑战 | 整合分子途径与合成生物学工具，系统探讨提高作物根系碳含量的工程化方法 | 可能面临碳分配增加导致作物产量降低的挑战，且根系碳储存效果需进一步验证 | 开发通过植物根系进行地下碳封存的技术，以减少大气二氧化碳水平 | 植物根系碳储存的分子机制与作物工程化 | 合成生物学 | NA | 分子途径操纵与合成生物学工程 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 作物植物 | 根系碳储存相关性状的工程化设计 | 环境 |
| 75 | 2025-12-08 |
A Modular T7 RNA Polymerase Toolbox Linking Selective miRNA Detection to Signal Amplification and Protein Expression
2025-Dec-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c16214
PMID:41258773
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研究论文 | 本文介绍了一种基于T7 RNA聚合酶的工具箱，用于选择性miRNA检测、信号放大和蛋白质表达 | 开发了无泄漏的T7 RNAP工具箱，通过模块化T7-Locks实现选择性寡核苷酸检测和门控转录，具有高正交性和超过100的开关比 | NA | 构建一个可编程的合成生物学平台，连接输入感知、放大和输出合成 | miRNA检测、转录调控和蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | T7 RNA聚合酶工具箱、细胞无转录-翻译系统 | NA | 寡核苷酸序列、蛋白质表达数据 | NA | T7 RNAP工具箱、T7-Locks、C12间隔子 | 细胞无系统 | 模块化T7-Locks、正反馈信号放大电路、门控转录系统 | 医学、工业生物技术 |
| 76 | 2025-12-08 |
Advances in the microbial biosynthesis of therapeutic terpenoids
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103374
PMID:41161185
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程在微生物中生物合成治疗性萜类化合物的最新进展 | 总结了利用自动化、机器学习和人工智能等新兴方法加速微生物生物合成研究的新兴策略 | NA | 促进治疗性萜类化合物的微生物生物合成，以实现规模化生产和经济可行的成本目标 | 天然及新型萜类化合物（如青蒿素、紫杉醇、长春花碱、QS-21和环巴胺） | NA | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌，酿酒酵母 | NA | 医药 |
| 77 | 2025-12-08 |
Designing novel peptides with amyloid-β binding and clearance potential using BiLSTM and molecular dynamics
2025, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2025.1709505
PMID:41346856
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研究论文 | 本研究提出了一种基于双向长短期记忆网络（BiLSTM）和分子动力学的两阶段框架，用于设计具有与淀粉样蛋白-β结合和清除潜力的新型肽段 | 开发了一种新颖的两阶段BiLSTM框架，该框架在具有特定基因本体（GO）注释的全长蛋白质上进行训练，并在实验验证的肽段片段上进行微调，以生成针对特定靶点（如Aβ42）的功能性短肽 | 训练数据包含了与Aβ清除相关的蛋白质，但计算验证仅涉及结合相互作用；清除潜力仍是一个有待未来实验验证的假设 | 开发一种可推广的、人工智能驱动的功能性肽段设计流程，用于治疗发现和合成生物学 | 针对阿尔茨海默病关键病理因子Aβ42的新型肽段 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 分子动力学模拟，AlphaFold2结构建模，pyDockWEB对接 | BiLSTM | 序列数据（蛋白质和肽段序列） | 从1000个AI生成的序列中筛选出25个候选，最终优先考虑11个（ADNP1-ADNP11） | NA | NA | NA | 医学 |
| 78 | 2025-12-08 |
Digital switching in a biosensor circuit via programmable timing of gene availability
2014-Dec, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/nchembio.1680
PMID:25306443
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研究论文 | 本研究通过可编程的基因可用性时序控制，利用位点特异性重组酶优化合成生物学基因电路的性能，显著提高了microRNA传感器的动态范围和特异性 | 首次将位点特异性重组酶用于基因电路的时序控制，通过解耦阻遏蛋白与其靶标的表达时间，大幅降低传感器的基础泄漏并提升动态范围 | 研究主要基于体外细胞实验，尚未在活体动物或临床环境中验证其长期稳定性和安全性 | 开发一种通过时序控制基因可用性来优化合成生物学基因电路性能的新方法 | 基于microRNA的内源性生物标志物传感器和细胞类型分类系统 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组酶技术、基因电路工程 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | 位点特异性重组酶 | 哺乳动物细胞 | 比例式microRNA生物传感器、具有时序控制功能的多基因电路 | 医学诊断、细胞工程 |
| 79 | 2025-12-07 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
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研究论文 | 本文通过构建启动子库和设计新型混合启动子，扩展了群体感应工具箱，用于动态遗传电路的优化与应用 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库，并设计了一种新型混合启动子，需要两种自诱导剂激活，实现了多阶段遗传开关的动态控制 | NA | 扩展群体感应工具箱，优化动态遗传电路的设计与调谐 | 群体感应系统、启动子库、混合启动子、遗传电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | NA | 多阶段遗传开关，包括生长阶段和两个顺序生产阶段，使用混合启动子实现动态控制 | 工业生物技术 |
| 80 | 2025-12-07 |
Characterization and orthogonality assessment of two quorum sensing systems for synthetic biology applications
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.08.001
PMID:40835148
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研究论文 | 本研究全面表征了LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统在大肠杆菌中的功能，并评估了它们的正交性以避免交叉干扰 | 首次在模型宿主大肠杆菌中全面表征这两种群体感应系统，并通过突变策略解决了系统间的交叉干扰问题，实现了功能正交 | 研究仅在大肠杆菌中进行，未在其他宿主中验证，且突变体可能影响系统在其他环境下的性能 | 优化和标准化群体感应系统以扩展合成生物学应用范围 | LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 理性设计突变 | 大肠杆菌 | 群体感应系统，包括启动子、信号分子和合酶组件 | 工业生物技术 |