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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-06-09 |
Bioinformatics analysis and molecular cloning of squalene synthase from Simaroubaceae
2025-May-30, Protein expression and purification
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.pep.2025.106751
PMID:40451315
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和分子克隆技术,研究了苦木科植物中角鲨烯合酶(SQS)的功能及其在苦木素生物合成中的作用 | 首次从苦木科植物的转录组数据中筛选并分析了多种SQS,揭示了其与甘草SQS的高序列相似性,并通过克隆和功能分析验证了AaSQS的催化功能及其关键氨基酸残基 | 研究仅针对苦木科植物中的SQS,未涉及其他植物家族,且功能验证主要在体外进行,未在植物体内验证 | 研究苦木科植物中角鲨烯合酶的功能及其在苦木素生物合成中的作用 | 苦木科植物中的角鲨烯合酶(SQS) | 生物信息学 | NA | 转录组分析、分子克隆、生物信息学分析、分子对接、突变分析 | NA | 序列数据、蛋白质结构数据 | 6种苦木科植物的SQS(AaSQS, BjSQS, AeSQS, QaSQS, ElSQS, SaSQS) |
62 | 2025-06-09 |
Towards the computational design of protein post-translational regulation
2015-Jun-15, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2015.04.056
PMID:25956846
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综述 | 本文综述了蛋白质翻译后修饰(PTMs)的功能确定方法、蛋白质变构控制以及PTM调控的理性设计实例 | 探讨了利用PTMs这一尚未充分探索的调控层次推动合成生物学发展的机会 | NA | 推动蛋白质翻译后调控的理性设计 | 蛋白质翻译后修饰(PTMs) | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学 | NA | NA | NA |
63 | 2025-06-09 |
Synthetic biology for the directed evolution of protein biocatalysts: navigating sequence space intelligently
2015-Mar-07, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/c4cs00351a
PMID:25503938
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review | 本文综述了合成生物学在蛋白质定向进化中的应用,特别是如何智能地导航蛋白质序列空间以开发新型生物催化剂 | 结合设计策略与经典定向进化方法,利用合成生物学技术高效探索蛋白质序列空间,开发具有新颖功能的酶 | 蛋白质序列空间庞大,难以全面测试所有可能的变体,且功能联系和酶动力学难以预测 | 改进酶的性质,开发高活性和稳健的新型生物催化剂 | 蛋白质序列及其结构与功能 | 合成生物学 | NA | 定向进化(DE), 合成生物学 | NA | 蛋白质序列数据 | NA |
64 | 2025-06-09 |
Discovery of the lomaiviticin biosynthetic gene cluster in Salinispora pacifica
2014-Jul-08, Tetrahedron
IF:2.1Q2
DOI:10.1016/j.tet.2014.03.009
PMID:25045187
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研究论文 | 本文描述了在Salinispora pacifica菌株DPJ-0016和DPJ-0019中发现lomaiviticin生物合成基因簇的过程 | 首次鉴定了lomaiviticin生物合成的基因簇,并揭示了其核心聚酮骨架的生物合成基础 | NA | 阐明lomaiviticin的生物合成逻辑,并为生物催化和合成生物学提供分子工具 | Salinispora pacifica菌株DPJ-0016和DPJ-0019 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、比较基因组学、细菌遗传学 | NA | 基因组数据 | 2个菌株(DPJ-0016和DPJ-0019) |
65 | 2025-06-09 |
The phosphopantetheinyl transferases: catalysis of a post-translational modification crucial for life
2014-Jan, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/c3np70054b
PMID:24292120
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综述 | 本文全面综述了磷酸泛酰巯基乙胺转移酶(PPTases)的研究进展,包括其鉴定、表征、结构解析、突变、抑制及在合成生物学中的应用 | 首次全面总结了PPTases的所有现有知识,包括其催化机制和在合成生物学中的工程应用 | 仅涵盖截至2013年的研究,可能缺少最新进展 | 探讨PPTases的催化机制及其在生命科学中的重要性 | 磷酸泛酰巯基乙胺转移酶(PPTases)及其催化的翻译后修饰 | 生物化学 | NA | NA | NA | NA | NA |
66 | 2025-06-09 |
Taking stock of security concerns related to synthetic biology in an age of responsible innovation
2014, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2014.00079
PMID:25072048
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
67 | 2025-06-09 |
Synthetic biology: tools to design, build, and optimize cellular processes
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/130781
PMID:20150964
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review | 本文综述了合成生物学在设计和优化细胞过程中的工具和方法 | 提出了将合成生物学分为三个层次的框架,并讨论了如何整合这些层次以实现细胞全面优化 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 探讨合成生物学在控制细胞系统方面的进展和未来方向 | 细胞过程和调控机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
68 | 2025-06-09 |
Biology by design: from top to bottom and back
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/232016
PMID:21052559
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研究论文 | 合成生物学是一门新兴技术学科,旨在设计和构建新型生物系统以满足紧迫的社会需求 | 提出了一个概念模型,用于开发与现有生物组件以可预测方式功能和交互的新型生物系统 | 工程生物学仍需要大量试错,缺乏将基本'部件'连接成按预期行为的高阶网络的有效方法 | 开发策略以提高设计的性能和复杂性,推动生物学设计时代的到来 | 生物系统 | 合成生物学 | NA | NA | 概念模型 | NA | NA |
69 | 2025-06-07 |
A review on the expanding biotechnological frontier of Pedobacter
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108588
PMID:40294724
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review | 本文综述了Pedobacter属细菌的生物技术应用及其潜在的自然产物 | 强调了通过合成生物学方法解锁Pedobacter属细菌隐藏潜力的前景 | 目前仅对少数Pedobacter物种及其自然产物进行了表征 | 探讨Pedobacter属细菌的生物技术应用及其潜在的自然产物 | Pedobacter属细菌及其衍生的自然产物 | 生物技术 | NA | 合成生物学、基因组分析 | NA | 基因组数据 | NA |
70 | 2025-06-07 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
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review | 本文综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用及其潜力 | 强调粘细菌作为未充分开发的工业资源,在生物技术和生物制造中的新兴应用 | 粘细菌在基因工程、生长速度慢以及代谢重塑和表达策略方面的限制 | 探索粘细菌及其酶在农业和工业中的潜在应用 | 粘细菌及其产生的酶 | 生物技术 | NA | 生物勘探和计算方法 | NA | NA | NA |
71 | 2025-06-07 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
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综述 | 本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势,重点介绍了定向进化和高通量策略在工程化蛋白酶底物特异性中的应用 | 讨论了新兴的蛋白酶工程策略,如抗体-蛋白酶融合实现邻近催化,以及通过外源蛋白-蛋白相互作用驱动的蛋白酶底物特异性转换 | NA | 探讨蛋白酶工程的最新进展,重点介绍能够精确控制蛋白酶活性和特异性的方法和策略 | 蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量筛选 | NA | NA | NA |
72 | 2025-06-07 |
Exploring oxidosqualene cyclases and cytochrome P450s from Aralia elata for the synthesis of diverse pentacyclic triterpene sapogenins in Nicotiana benthamiana
2025-Sep, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110047
PMID:40435688
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研究论文 | 本研究从辽东楤木中挖掘并功能表征了氧化角鲨烯环化酶(OSCs)和细胞色素P450(CYPs),用于在烟草中合成多样的五环三萜皂苷元(PTSs) | 通过组合生物合成策略,成功合成了19种不同的PTSs,其中14种是首次在辽东楤木中发现 | 辽东楤木中PTSs的积累有限且生物合成复杂,限制了其大规模生产 | 探索辽东楤木中OSCs和CYPs的功能,以合成多样化的PTSs | 辽东楤木中的OSCs和CYPs | 合成生物学 | NA | 代谢组学和转录组学分析,农杆菌介导的异源表达 | NA | NA | NA |
73 | 2025-06-07 |
Synergistic potential of halophytes and halophilic/halotolerant plant growth-promoting bacteria in saline soil remediation: Adaptive mechanisms, challenges, and sustainable solutions
2025-Sep, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128227
PMID:40440870
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综述 | 本文综述了盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌在盐渍土壤修复中的协同潜力及其适应机制、挑战和可持续解决方案 | 探讨了盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及其在盐渍土壤修复中的创新应用 | 对盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及特定盐适应策略的理解仍有限 | 研究盐胁迫耐受机制及其在可持续农业中的应用 | 盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌 | 可持续农业 | NA | 多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学、化学计量学和合成生物学 | NA | NA | NA |
74 | 2025-06-07 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-Jun-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
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research paper | 介绍了一种名为SPN-FLUX的全翻译后平台,该平台整合了合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白,用于快速可调地报告细胞过程 | SPN-FLUX是一种不依赖转录介导的报告过程,能够在1小时内响应细胞外刺激,为合成生物学和生物传感提供了新的工具 | NA | 开发一种快速、实时动态的细胞信号事件报告平台 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 合成磷酸化网络与分裂荧光或发光蛋白整合技术 | NA | 细胞信号数据 | NA |
75 | 2025-06-07 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-Jun-06, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
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研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应(QS)工具,用于革兰氏阴性细菌之间的通信 | 使用SEVA质粒集合构建了三个QS系统,提高了质粒特征的互换性,并提供了数学模型和速率参数以支持设计工作 | 当前QS工具箱在模型物种以外的细菌中缺乏标准化实现 | 开发标准化的群体感应工具,以促进细菌间的通信和合成联盟的工程化 | 革兰氏阴性细菌 | 合成生物学 | NA | 群体感应(QS)系统 | 数学模型 | NA | NA |
76 | 2025-06-07 |
Current AI technologies in cancer diagnostics and treatment
2025-Jun-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02369-9
PMID:40457408
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综述 | 本文系统回顾了当前人工智能技术在癌症诊断和治疗中的应用现状 | 强调了深度学习在早期癌症检测中的日益重要作用,并探讨了AI在基因组学、生物标志物发现、液体活检和非侵入性诊断中的应用 | 讨论了数据隐私、可解释性和监管问题等重要挑战 | 评估人工智能在癌症诊疗领域的应用潜力 | 癌症诊断和治疗技术 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 多模态医学影像(CT、MRI、PET、超声)和数字病理数据 | NA |
77 | 2025-06-07 |
A systems view of cellular heterogeneity: Unlocking the "wheel of fate"
2025-Jun-02, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101300
PMID:40472847
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review | 本文通过系统生物学的视角探讨细胞异质性的问题,并提出了一个从细胞角度概念化异质性的框架 | 提出了一个从细胞角度概念化异质性的框架,并应用该框架研究了人类多能干细胞培养和β细胞分化中的异质性 | 未提及具体的技术或数据限制 | 探讨细胞异质性的生物学意义及其在干细胞研究中的应用 | 人类多能干细胞(hPSC)培养和β细胞分化 | 系统生物学 | NA | 单细胞技术 | NA | NA | NA |
78 | 2025-06-07 |
CRISPR-Cas: a game-changer in vaccine development and the fight against viral infections
2025-Jun, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.02.006
PMID:40069074
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review | 本文综述了CRISPR-Cas系统在病毒-宿主相互作用研究、抗病毒治疗及疫苗开发中的最新进展 | 探讨了CRISPR-Cas系统在识别病毒关键受体和宿主因子以及作为抗病毒策略和疫苗开发工具的创新应用 | 未具体提及CRISPR-Cas技术在临床应用中的潜在限制或挑战 | 推进对病毒-宿主相互作用的理解并开发有效的抗病毒策略 | 病毒-宿主相互作用、抗病毒治疗及疫苗开发 | synthetic biology | viral infections | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
79 | 2025-06-07 |
SubtiToolKit: a bioengineering kit for Bacillus subtilis and Gram-positive bacteria
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.004
PMID:40074634
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research paper | 介绍SubtiToolKit(STK),一种针对枯草芽孢杆菌和革兰氏阳性菌的高效克隆工具包 | 填补了革兰氏阳性菌在合成生物学工具包领域的空白,提供模块化标准DNA部件库,支持转录单元、操纵子及基因敲入/敲除应用 | 未提及具体实验验证数据或与其他工具包的性能对比 | 开发适用于革兰氏阳性菌的标准化DNA构建工具,推动合成生物学研究 | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)及其他革兰氏阳性菌(如Geobacillus和Parageobacillus工业菌株) | 合成生物学 | NA | Golden Gate(GG)克隆方法 | NA | DNA序列 | 未明确说明具体菌株数量,但包含多类标准化DNA部件(启动子、RBS、荧光蛋白等) |
80 | 2025-06-07 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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research paper | 本文描述了一个分析合成生物学在学术界与产业界交界处应用的研讨会 | 探讨了如何将学术研究成功转化为生物技术企业,并讨论了支持这一转化的基础设施 | NA | 分析学术研究向生物技术企业转化的过程及所需支持 | 合成生物学在学术界与产业界的交界处 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |