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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-04-23 |
Metabolic Engineering of Aureobasidium melanogenum for Efficient Production of Gluconic Acid
2026-Apr-22, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c13595
PMID:42017485
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Aureobasidium melanogenum菌株,实现了葡萄糖酸的高效生产 | 通过敲除普鲁兰多糖、聚苹果酸、利亚莫辛和黑色素合成关键基因以减少副产物,并过表达内源性葡萄糖氧化酶基因,构建了高产菌株PPLMPG-6,获得了目前报道的最高葡萄糖酸产量 | NA | 开发高效生产葡萄糖酸的微生物菌株 | Aureobasidium melanogenum TSYW-58菌株 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学、微生物发酵 | NA | NA | NA | 基因敲除、基因过表达 | Aureobasidium melanogenum | 通过改造葡萄糖酸合成途径,减少副产物合成并增强葡萄糖氧化酶表达 | 食品添加剂、制药、化学制造 |
| 62 | 2026-04-23 |
Epigenetic Control of Toehold-Mediated Strand Displacement for Programmable Molecular Circuit Regulation and Enhanced microRNA Detection
2026-Apr-21, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01658
PMID:41952075
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研究论文 | 本文提出了一种利用N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰调控toehold介导的链置换反应的方法,实现了对DNA分子电路的可编程动力学控制,并应用于microRNA检测 | 首次将单碱基表观遗传修饰(mA)引入toehold结构域,实现了对链置换反应动力学的可逆、精确调控,突破了传统方法依赖固定toehold稳定性的限制 | 未明确说明该技术在其他类型核酸电路或更复杂生物环境中的普适性及长期稳定性 | 开发一种可编程调控分子电路动力学的新方法,并提高microRNA检测的灵敏度与特异性 | toehold介导的DNA链置换反应、催化发夹组装电路、癌症相关microRNA-21 | 合成生物学 | 癌症 | 单碱基N-甲基腺苷(mA)表观遗传修饰、脱甲基酶FTO调控、细胞内成像 | NA | 实验数据与理论分析 | NA | NA | NA | 表观遗传调控的toehold介导链置换系统、催化发夹组装电路 | 生物传感、分子计算、合成生物学 |
| 63 | 2026-04-23 |
Synthetic mechanobiology
2026-Apr-20, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2026.03.005
PMID:42013804
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综述 | 本文综述了合成机械生物学这一新兴领域,探讨如何将机械传感通路重新编程以实现特定功能,并展望其在疾病治疗中的应用 | 将机械生物学与合成生物学工具相结合,将力传感视为可编程的设计问题,提出通过重新连接机械信号通路来实现有用结果并作为研究策略 | NA | 探讨如何将机械调控通路作为可编程的输入-输出关系,构建能够感知并响应组织力学的工程化细胞 | 细胞的机械传感分子机制、模块化机械遗传部件、工程化细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 工程化细胞 | 机械信号通路重连 | 医学 |
| 64 | 2026-04-23 |
NUPACK: Computational Nucleic Acid Analysis and Design
2026-Apr-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00817
PMID:41926704
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研究论文 | 本文介绍了NUPACK软件套件,用于核酸结构、设备和系统的分析与设计,服务于核酸纳米技术、分子编程、合成生物学等领域的研究需求 | NUPACK 4引入了增强的物理模型(如共轴和悬挂堆叠子系综)、显著的速度提升(试管分析速度提高20-120倍)、支持大规模复合物(如30,000 nt)、混合材料(核苷酸分辨率指定)以及多样化的序列约束设计 | NA | 开发一个用于核酸结构分析和设计的计算工具,以支持核酸纳米技术、分子编程和合成生物学等领域的研究 | 核酸结构、设备和系统,包括多试管系综和动态杂交级联 | 合成生物学 | NA | 计算分析算法,包括试管系综处理和序列设计约束 | NA | 核酸序列和结构数据 | NA | NA | NA | 包括动态杂交级联和结构工程(如假结)的反应路径工程 | 医学, 工业生物技术 |
| 65 | 2026-04-23 |
Engineering Rapamycin-Induced Dimerization for Control of Gene Expression in Plants
2026-Apr-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6c00125
PMID:41990133
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研究论文 | 本研究开发了一种基于雷帕霉素诱导的FKBP-FRB分裂转录因子系统,用于在植物中实现精确的基因表达调控 | 开发了适用于植物的雷帕霉素诱导二聚化系统,通过系统优化设计显著降低了基础活性并提高了诱导活性,实现了87倍的基因表达诱导倍数 | 未在多种植物物种中进行广泛测试,长期使用雷帕霉素可能产生的副作用未充分评估 | 开发一种高效、精确的化学诱导基因表达系统用于植物合成生物学 | 植物基因表达调控系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、转录因子系统设计、化学诱导 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因融合、启动子工程 | 植物 | 雷帕霉素诱导的FKBP-FRB二聚化转录因子系统,包含DNA结合域和转录激活域的分裂设计 | 农业, 工业生物技术 |
| 66 | 2026-04-23 |
mRNA medicine for cardiovascular disease
2026-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00804-8
PMID:41981145
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综述 | 本文综述了mRNA技术在心血管疾病治疗中的进展,包括mRNA修饰、递送平台、基因组编辑及免疫细胞工程等应用 | 整合了mRNA修饰、纳米技术、基因组编辑和RNA合成生物学的最新进展,为心血管疾病提供了新的治疗策略 | NA | 探讨mRNA技术在心血管疾病治疗中的应用潜力和发展方向 | 心血管疾病,包括高胆固醇血症、动脉粥样硬化、缺血性心脏损伤、心脏纤维化和心脏淀粉样变性 | NA | 心血管疾病 | mRNA技术、纳米技术、基因组编辑、RNA合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 67 | 2026-04-23 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种在Escherichia coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统,用于环境生物传感和合成生物学应用 | 实现了紧密调控、可滴定且具有低重组率和最小基础活性的Cre重组酶系统,并成功应用于缺氧环境下的砷酸盐生物传感 | NA | 开发一种可调控的低速率基因组重组工具,以增强环境生物传感和合成生物学的应用能力 | Escherichia coli(大肠杆菌)中的Cre-lox重组系统 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 可调控的低速率基因组重组系统,用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 68 | 2026-04-23 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 本研究开发了一种名为SNIPR的合成受体平台,能够响应可溶性配体并激活定制细胞功能,用于增强工程化治疗细胞的特异性 | 首次将SNIPR受体架构改造为可被可溶性配体激活的平台,实现了低基线活性与高倍数激活,并通过内吞和pH依赖性切割机制工作 | 未明确说明受体平台在复杂生理环境中的长期稳定性及潜在免疫原性问题 | 开发模块化合成受体以响应可溶性配体,用于精准调控工程化治疗细胞功能 | 合成受体平台(SNIPR)、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA | SNIPR平台 | 哺乳动物细胞 | 可溶性配体激活的合成受体、正交于天然信号通路的细胞间通信网络 | 医学 |
| 69 | 2026-04-23 |
[Preface for special column on iGEM (2018)]
2018-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.180521
PMID:30584697
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前言 | 本文为2018年iGEM特刊的前言,介绍iGEM竞赛作为合成生物学领域的重要平台,并展示国内最新研究项目 | NA | NA | 推广iGEM竞赛,讨论其在中国的发展及对学生科研能力的启发 | iGEM竞赛及其相关研究项目 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | iGEM | NA | NA | 教育, 工业生物技术 |
| 70 | 2026-04-22 |
A standardized workflow for kinetic metabolic model curation and dissemination
2026-Apr-20, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014227
PMID:42008579
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研究论文 | 本文介绍了一种用于构建、注释、可视化和共享动力学代谢模型的标准化工作流程 | 整合社区标准和开源工具,确保模型的可重复性、互操作性和用户可访问性 | NA | 提高动力学代谢模型的再现性和实用性,支持合成生物学、代谢工程和系统生物学应用 | 动力学代谢模型 | 系统生物学 | NA | NA | 动力学代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 系统生物学 |
| 71 | 2026-04-22 |
Plant-derived indole alkaloids in chronic inflammatory diseases: molecular mechanisms, therapeutic potential and translational challenges
2026-Apr-20, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-026-02244-z
PMID:42009998
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综述 | 本文综述了植物来源吲哚生物碱在慢性炎症性疾病中的分子机制、治疗潜力及转化挑战 | 系统整合了植物来源吲哚生物碱的化学、来源及作用机制,强调了其对NF-κB、JAK/STAT、MAPK、PI3K/AKT、NLRP3炎症小体和AhR信号通路等多靶点的调控作用,并指出了其在微生物群和器官选择性治疗方面的前景 | 主要基于临床前证据,临床证据不足,且存在转化障碍 | 评估植物来源吲哚生物碱作为多靶点支架在慢性炎症性疾病中的治疗潜力 | 植物来源的吲哚生物碱 | NA | 慢性炎症性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 72 | 2026-04-22 |
Synthetic control of implanted engineered liver tissue growth
2026-Apr-17, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz8362
PMID:41996502
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学和工程组织技术,在体内植入后诱导小规模工程肝组织生长扩增的策略 | 整合合成生物学与组织工程工具,实现植入后按需驱动工程肝组织在体内扩增,通过YAP和生长因子信号轴控制 | NA | 解决工程组织植入物在治疗相关尺寸上的扩增障碍,促进临床转化 | 工程肝组织和人肝细胞 | 合成生物学 | 器官衰竭 | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人类肝细胞 | 通过YAP和生长因子信号轴控制组织扩增的合成生物电路 | 医学 |
| 73 | 2026-04-22 |
Synthetic Control of Implanted Engineered Liver Tissue Growth
2026-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693527
PMID:41427324
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学工具控制植入后工程肝组织生长的策略,以解决组织工程植入物规模扩大的临床转化难题 | 结合合成生物学和组织工程技术,首次实现植入后通过合成触发因子按需诱导工程肝组织生长 | NA | 开发一种通过植入后诱导生长来扩大工程组织规模的方法,以治疗器官衰竭 | 工程肝组织和人肝细胞 | 组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、YAP和生长因子信号通路调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人肝细胞 | 通过合成生物学工具控制YAP和生长因子信号轴,以驱动组织扩张 | 医学 |
| 74 | 2026-04-22 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-06-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统综述了2004年至2023年间报道的105个大环内酰胺,涵盖其来源、结构、生物活性及17种已知生物合成途径,并深入分析了相关基因簇、关键酶机制及其在生物合成中的作用 | 首次系统讨论大环内酰胺家族的最新进展,特别关注结构-活性关系及偏离传统共线性规则的新生物合成途径 | NA | 为大环内酰胺的发现及其通过合成生物学方法的可持续生产提供参考 | 105种由微生物菌株产生的大环内酰胺,这些菌株分离自海洋沉积物、土壤、植物和动物等多样环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 105种大环内酰胺 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2026-04-22 |
A size filter at the Golgi regulates apical membrane protein sorting
2024-Oct, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-024-01500-0
PMID:39237743
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法探究高尔基体是否存在尺寸筛选机制,以调控顶端膜蛋白的排序 | 首次发现高尔基体存在尺寸筛选机制,并揭示Pals1蛋白的及时解离对Crb3正常分选的关键作用 | 研究主要基于三种代表性顶端蛋白(Crb3、Ace2、Muc1),尚未验证是否适用于所有顶端膜蛋白 | 探究顶端膜蛋白分选的分子机制,特别是细胞质结构域尺寸对分选的影响 | 上皮细胞膜蛋白(Crb3、Ace2、Muc1)及其与Pals1蛋白的相互作用 | 细胞生物学 | NA | 合成生物学方法、生物素触发释放系统、蛋白质定位追踪 | NA | 蛋白质定位图像、时间序列运输数据 | 三种代表性顶端膜蛋白(Crb3、Ace2、Muc1)及其修饰变体 | 链霉亲和素结合肽标记系统 | 哺乳动物细胞 | 内质网滞留-生物素触发释放系统,用于同步研究蛋白质从高尔基体到细胞皮层的运输 | 基础细胞生物学研究 |
| 76 | 2026-04-21 |
Functional identification of key enzymes in calycosin biosynthesis in Astragalus membranaceus and establishment of heterologous expression system
2026-Dec, Pharmaceutical science advances
DOI:10.1016/j.pscia.2026.100118
PMID:42005051
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研究论文 | 本研究鉴定了黄芪中毛蕊异黄酮生物合成的三个关键酶,并成功在酵母和烟草中建立了异源表达系统 | 揭示了毛蕊异黄酮的新型合成途径,发现AmOMT2的多功能性拓宽了AmIFS的底物范围 | NA | 阐明黄芪中毛蕊异黄酮的生物合成途径并建立异源生产系统 | 黄芪(Astragalus membranaceus)及其关键生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组织特异性表达分析 | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 酵母, 烟草 | 毛蕊异黄酮生物合成途径(涉及AmIFS、AmOMT2、AmI3'H三个关键酶) | 医药 |
| 77 | 2026-04-21 |
Deep learning revolutionizes protein research: Advances in structure prediction, functional annotation, and engineered design
2026-Jun, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2026.03.012
PMID:41839238
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综述 | 本文综述了深度学习如何通过连接结构预测、功能注释和理性设计,形成一个协同循环,从而彻底改变蛋白质研究 | 提出了一个统一的“预测-理解-创造”范式,展示了深度学习在蛋白质结构预测、功能注释和从头设计中的突破性进展,并阐述了这些领域如何相互促进,形成一个自我强化的循环 | 在数据稀缺性、模型可解释性以及分布外泛化方面仍存在挑战 | 阐述深度学习如何变革蛋白质研究,并展示结构预测、功能注释和理性设计之间的协同循环 | 蛋白质(特别是单域、球状蛋白质) | 机器学习 | NA | 深度学习,生成式AI,逆向折叠模型,混合实验-计算工作流(如与AI集成的冷冻电镜) | 端到端深度学习模型(如AlphaFold2),多模态模型,生成式AI | 序列数据,3D坐标,相互作用数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发,合成生物学 |
| 78 | 2026-04-21 |
Microbial lipids for a sustainable future: the growing potential of synthetic microbial engineering for consumer oils
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615047
PMID:41692578
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综述 | 本文探讨了合成微生物工程在可持续生产消费油脂方面的潜力,以应对传统作物依赖带来的环境问题 | 利用合成生物学和自动化生物铸造技术,开发微生物作为可持续油脂来源的新方法 | NA | 推动消费油脂产业向可持续微生物生物制造经济转型 | 微生物油脂及其在食品、营养品、塑料、化妆品、燃料等产品中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成酵母基因组学、自动化生物铸造 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | NA | 食品, 营养品, 塑料, 动物饲料, 化妆品, 药品, 燃料 |
| 79 | 2026-04-21 |
Engineering non-ribosomal peptide synthesis: tuning the antibiotics engine of the microbial world
2026-May, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2026.2615819
PMID:41771683
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法工程化改造非核糖体肽合成酶以提高抗生素产量和生物活性的主要进展 | 系统总结了通过代谢工程、启动子调控和异源表达等合成生物学策略优化非核糖体肽生产的创新方法 | NA | 利用合成生物学技术优化非核糖体肽合成酶,以提高抗生素类肽的产量和生物活性 | 非核糖体肽合成酶及其产生的抗生素肽类 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、代谢工程、异源表达 | NA | NA | NA | 启动子工程、代谢通路重定向 | 微生物 | 生物合成基因簇、代谢通路工程 | 医药 |
| 80 | 2026-04-21 |
High-performance bioimaging and biosensing via nucleobase-editing enzymes
2026-Apr-17, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d5cs00678c
PMID:41773995
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综述 | 本文综述了核苷碱基编辑酶在生物成像和生物传感中的高性能应用,包括其催化原理、集成模式以及未来发展方向 | 将核苷碱基编辑酶重新用作可编程执行器,实现高特异性、高效放大和生理条件兼容的敏感监测 | NA | 探讨核苷碱基编辑酶在生物传感和生物成像中的应用潜力 | 核苷碱基编辑酶(如脱氨酶、甲基转移酶/去甲基化酶和DNA糖基化酶)及其在核酸、蛋白质和细胞过程监测中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 诊断, 治疗监测, 合成生物学 |