合成生物学相关文章
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当前共找到 3555 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-09-02 |
In silico encounters: harnessing metabolic modelling to understand plant-microbe interactions
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf030
PMID:40705360
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综述 | 本文综述了利用基因组尺度代谢模型研究植物-微生物相互作用的方法与应用 | 系统整合代谢模型与多组学数据，推动对植物-微生物holobiont系统的量化理解，并探索合成微生物群落的计算机设计 | NA | 通过代谢建模理解植物-微生物相互作用的机制，以支持可持续农业和粮食安全 | 植物宿主及其共生、致病和微生物群落系统中的相关微生物 | 计算生物学 | NA | 基因组尺度代谢建模、基因组学、宏基因组学、表型组学、合成生物学 | 代谢网络模型 | 多组学数据 | NA |
| 62 | 2025-08-30 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
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综述 | 本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势，重点介绍了定向进化、高通量策略以及新型工程策略 | 涵盖了抗体-蛋白酶融合、外源蛋白互作驱动的特异性切换以及分裂和自抑制蛋白酶的设计原则 | NA | 探讨蛋白酶工程的方法论和策略，以实现对蛋白酶活性和特异性的精确控制 | 蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量筛选 | NA | NA | NA |
| 63 | 2025-08-30 |
SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05386
PMID:40787351
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研究论文 | 通过SpyRing系统及AlphaFold指导对TEV蛋白酶进行环化，显著提升其热稳定性 | 结合SpyTag/SpyCatcher介导的异肽键环化与AlphaFold结构预测，成功实现远端N/C末端蛋白的理性环化设计 | NA | 开发一种计算引导的蛋白质环化策略以增强酶的热稳定性 | 烟草蚀纹病毒蛋白酶（TEVp）及其工程变体 | 蛋白质工程 | NA | SpyTag/SpyCatcher环化系统，AlphaFold结构预测 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
| 64 | 2025-08-30 |
Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c03077
PMID:40787363
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综述 | 本文回顾了巴西合成生物学的发展现状，并介绍了国家合成生物学网络的建立及其在推动生物技术能力方面的作用 | 首次系统梳理巴西合成生物学生态系统，并强调利用国家生物多样性优势引领可持续解决方案的创新潜力 | 巴西的科学和监管环境国际认知度低，且国内存在基础设施和关键材料供应不足的限制 | 探讨巴西合成生物学发展机遇与挑战，推动国家生物技术创新 | 巴西合成生物学研究群体及国家网络建设 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 65 | 2025-08-30 |
An old dog with new tricks-the value of photorespiration as a central metabolic hub with implications for environmental acclimation
2025-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf258
PMID:40515676
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综述 | 本文探讨光呼吸作为核心代谢枢纽的新功能及其在植物环境适应中的价值 | 揭示了光呼吸与气孔代谢调控的关联，并展示了合成生物学改造光呼吸路径以提升光合效率的新策略 | NA | 阐明光呼吸在代谢调控和环境适应中的新作用 | 光养生物（主要为植物） | 植物生理学 | NA | 同位素标记、反向遗传学、合成生物学 | NA | 代谢数据、遗传数据 | NA |
| 66 | 2025-08-30 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-Aug, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文综述了5'-O-P-N磷酰胺核苷酸的化学合成方法及其生物学影响 | 聚焦新兴的5'-O-P-N磷酰胺核苷酸类别，探讨其合成策略与生物功能应用 | NA | 探讨磷酰胺核苷酸的合成方法、生物功能及在医药和生物技术中的应用 | 5'-O-P-N磷酰胺核苷酸 | 药物化学 | NA | 磷酰胺化策略、催化方法、绿色化学技术 | NA | NA | NA |
| 67 | 2025-08-30 |
Analysis of Poly-3-Hydroxybutyrate Production with Different Microorganisms Using the Dynamic Simulations for Evaluation of Economic Potential Approach
2025-Jul-08, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c11178
PMID:40657095
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研究论文 | 提出一种名为DySEEP的动态模拟方法，用于评估不同微生物生产PHB的经济潜力 | 开发了结合动态通量平衡分析和经济指标的新方法DySEEP，用于系统评估生物产品生产的经济可行性 | 由于DFBA模拟的性质，无法预测某些关键聚合物特性 | 优化聚-3-羟基丁酸酯(PHB)生物生产工艺的经济性 | 重组大肠杆菌、洋葱伯克霍尔德菌和罗尔斯通氏菌 | 生物过程工程 | NA | 动态通量平衡分析(DFBA) | 代谢网络模型 | 代谢通量数据 | 三种微生物菌株的比较分析 |
| 68 | 2025-08-30 |
Engineered receptors for soluble cellular communication and disease sensing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08366-0
PMID:39542025
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研究论文 | 开发一种可被可溶性配体激活的模块化合成受体平台SNIPR，用于调控工程化治疗细胞功能 | 首次将SNIPR受体架构适配于可溶性配体激活，实现低基线活性和高折叠激活，并通过内吞pH依赖性切割机制工作 | NA | 创建模块化合成受体以响应可溶性配体并激活定制细胞功能 | 合成受体SNIPR、CAR-T细胞、可溶性疾病相关因子 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成受体工程、细胞信号网络设计 | NA | NA | NA |
| 69 | 2025-08-30 |
Engineering plant holobionts for climate-resilient agriculture
2025-Jan-02, The ISME journal
DOI:10.1093/ismejo/wraf158
PMID:40748243
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综述 | 本文提出了一个整合微生物生态学、合成生物学和计算建模的框架，用于理性设计农业合成微生物群落（SynComs）以增强气候韧性 | 引入可编程全息生物概念，整合CRISPR干扰、生物传感器电路和群体感应模块等技术实现动态反馈和跨界信号传导 | NA | 通过微生物组工程提升农业对气候胁迫、土壤退化和产量停滞的韧性 | 植物全息生物（宿主与其微生物组的整合单元） | 合成生物学 | NA | CRISPR干扰、生物传感器电路、群体感应模块、基因组尺度代谢模型、动态通量平衡分析、机器学习 | 机器学习 | NA | NA |
| 70 | 2025-08-30 |
Harnessing synthetic biology to empower a circular plastics economy
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0053
PMID:40638940
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和微生物群落工程降解和升级回收塑料废物的策略，以支持循环塑料经济 | 整合合成生物学与微生物群落工程，提出预处理塑料材料和改造顽固乙烯基聚合物的互补策略，以提升生物处理效率 | NA | 探讨生物技术如何通过低强度生物过程缓解和升级回收塑料废物，推动循环塑料经济的发展 | 塑料废物，特别是工业与环境背景下的塑料材料 | 合成生物学 | NA | 合成生物学，微生物群落工程 | NA | NA | NA |
| 71 | 2025-08-30 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2024-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576308
PMID:39484520
|
研究论文 | 开发了一种基于人源化蛋白质的合成电路平台hDIRECT，用于控制细胞因子活性 | 首次使用完全人源化的蛋白质组件构建正交性分泌信号控制系统，降低免疫原性风险 | 目前仅为概念验证研究，尚未进行大规模临床验证 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人源蛋白酶、细胞因子（IL-2, IL-6, IL-10）及其FDA批准抑制剂 | 合成生物学 | 癌症免疫治疗、肌肉再生 | 蛋白质工程、蛋白酶调控技术 | NA | 蛋白质活性数据 | NA |
| 72 | 2025-08-30 |
Toward the clinical development of synthetic immunity to cancer
2023-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13245
PMID:37491719
|
评论 | 本文提出五项原则以指导合成生物学细胞疗法在癌症治疗中的临床转化开发 | 提出基于免疫学基础、预测性临床前模型、效力与安全性平衡、临床发现指导及多机制应对的五项下一代细胞疗法设计原则 | 原则主要基于癌症免疫治疗背景，在其他疾病领域的适用性需进一步验证 | 推动合成免疫在癌症治疗中的临床开发与转化 | 合成生物学工具（如CARs）设计的细胞疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术、细胞疗法 | NA | NA | NA |
| 73 | 2025-08-30 |
Synthesizing a Smarter CAR T Cell: Advanced Engineering of T-cell Immunotherapies
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0962
PMID:37429007
|
综述 | 本文探讨了合成生物学在改进CAR T细胞免疫疗法中的应用与前景 | 整合合成生物学最新进展以增强CAR T细胞的安全性、效能和治疗范围 | NA | 提升T细胞免疫疗法的精准性和适用疾病范围 | CAR T细胞及工程化免疫细胞 | 合成生物学 | 血液癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 74 | 2025-08-29 |
Reinforcement Learning-Based Target-Specific De Novo Design of Cyclic Peptide Binders
2025-Aug-28, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00789
PMID:40824037
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研究论文 | 提出一种基于强化学习的框架CYC_BUILDER，用于靶向特异性从头设计环肽结合剂 | 采用强化学习和蒙特卡洛树搜索指导片段选择、肽链生长和结构优化，实现高效环化 | NA | 开发计算设计环肽结合剂的新方法 | 环肽-蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | reinforcement learning, Monte Carlo Tree Search | RL | 分子结构数据 | 9个设计肽的实验验证（其中4个显示活性） |
| 75 | 2025-08-29 |
Microbial proteases as emerging anti-inflammatory therapeutics: a comprehensive review
2025-Aug-19, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04409-w
PMID:40828296
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综述 | 本文全面探讨微生物蛋白酶作为新兴抗炎治疗剂的潜力，包括其分子机制、生产策略及临床转化前景 | 系统评估微生物蛋白酶替代传统抗炎药物的优势，并首次重点探讨未充分研究的细菌属及生产挑战 | 存在免疫系统敏感性、生理条件下稳定性差、缺乏与其他酶源的性能对比数据、监管审批和靶向递送难题 | 评估微生物蛋白酶在炎症管理中的治疗潜力及临床转化路径 | 微生物蛋白酶及其抗炎机制 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 发酵技术、基因改造、菌株工程、封装技术、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
| 76 | 2025-08-29 |
Recent advances of muconic acid production using microbial synthetic biology
2025-Aug-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04419-8
PMID:40788366
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综述 | 本文重点介绍了利用合成生物学技术生产粘康酸的关键进展及优化策略 | 探讨了辅因子工程、模块化共培养和人工智能辅助酶优化等新型生物合成策略 | NA | 提升粘康酸的微生物合成效率与经济可行性 | 粘康酸生物合成体系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、辅因子工程、人工智能辅助优化 | NA | NA | NA |
| 77 | 2025-08-29 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
|
综述 | 本文全面回顾了利用合成生物学和代谢工程工具（以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例）对肠道微生物组进行治疗的工程化方法 | 重点介绍了通过酶工程和代谢通路改造实现精准肠道治疗的最新进展，特别是针对苯丙酮尿症的工程菌应用 | NA | 探讨基于微生物组的治疗干预方法的发展，特别是合成生物学在肠道健康中的应用 | 肠道微生物组、工程化细菌（特别是大肠杆菌Nissle 1917）、宿主生理和代谢功能 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢功能障碍、结直肠癌、苯丙酮尿症(PKU) | 生物催化、代谢工程、酶工程、基因工程 | NA | 文献证据、工程代谢回路数据、治疗效果指标 | NA |
| 78 | 2025-08-29 |
Advancing fungal phylogenetics: integrating modern sequencing, dark taxa discovery, and machine learning
2025-Jul-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04392-2
PMID:40643763
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综述 | 本文综述了现代分子技术（如NGS、TGS）和机器学习在真菌系统发育研究中的整合应用，推动物种鉴定、进化分析和疾病管理 | 整合第三代测序技术、多组学方法与机器学习算法，提出解决真菌隐秘物种鉴定和抗药性预测的创新框架 | 存在基因组内变异解析困难、基因树不一致性协调挑战以及大规模研究流程标准化不足的问题 | 提升真菌系统发育分析的精度与效率，推动病原体监测和精准治疗策略发展 | 真菌物种（包括Aspergillus、Fusarium、Penicillium等属）及其与环境、临床样本的相互作用 | 生物信息学 | 真菌感染性疾病 | NGS（Illumina/PacBio/Oxford Nanopore）、TGS、CRISPR诊断、多组学整合分析 | 机器学习算法 | 基因组序列、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 涉及环境与临床样本中的广泛真菌多样性（未提供具体数量） |
| 79 | 2025-08-29 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-12-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
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研究论文 | 本文通过数学建模探讨了诱导型双稳态系统中基因调控步骤延迟和外部诱导时间尺度对细胞命运决定动态过程的影响 | 揭示了稳态分析未能捕捉的瞬态现象，提出生化相互作用的不等延迟和外部诱导时间尺度会导致分化轨迹偏离并形成长期存在的瞬态分布 | NA | 研究基因调控网络中细胞命运决定的动态过程 | 诱导型双稳态系统 | 系统生物学 | NA | 常微分方程建模与稳态分析 | NA | 理论模型数据 | NA |
| 80 | 2025-08-12 |
Synthetic biology approaches for restoring gut microbial balance and engineering disease-specific microbiome therapeutics
2025-Oct, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.107931
PMID:40716471
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综述 | 探讨合成生物学方法在恢复肠道微生物平衡及设计疾病特异性微生物组疗法中的应用 | 提出了一种结合区域微生物组生态型、饮食响应模块化设计和自适应代谢模型的生态精准工程框架，以确保跨人群兼容性和稳定性 | NA | 开发可重复、适应性强且包容性广的微生物组干预措施，作为精准医学的一部分 | 人类肠道微生物组 | 合成生物学 | 炎症性肠病(IBD)、肥胖、糖尿病、神经退行性疾病 | CRISPR基因组编辑、代谢工程、多组学整合 | 人工微生物群落(AMCs) | NA | NA |