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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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781 | 2024-12-02 |
Genetic engineering of Nannochloropsis oceanica to produce canthaxanthin and ketocarotenoids
2024-Nov-29, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02599-4
PMID:39609835
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研究论文 | 通过基因工程改造Nannochloropsis oceanica以生产角黄素和酮类胡萝卜素 | 通过基因重设计和异源转化,显著增加了酮类胡萝卜素和角黄素的含量 | 在较高光照强度下,bkt品系的生长速度较慢 | 开发可持续的生产生物分子的过程,利用Nannochloropsis oceanica的光合作用和碳同化特性 | Nannochloropsis oceanica | NA | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
782 | 2024-12-02 |
Computation-driven redesign of an NRPS-like carboxylic acid reductase improves activity and selectivity
2024-Nov-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp6775
PMID:39612335
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研究论文 | 本文通过计算方法重新设计了一种非核糖体肽合成酶(NRPS)样羧酸还原酶的“守门员”腺苷化域,显著提高了其催化效率和底物特异性 | 通过近似机制的几何标准和Rosetta能量评分,成功重新设计了NRPS样酶的腺苷化域,显著提高了催化效率和底物特异性 | NA | 通过计算方法重新设计NRPS样酶的腺苷化域,以提高其催化效率和底物特异性 | 非核糖体肽合成酶(NRPS)样羧酸还原酶的腺苷化域 | 合成生物学 | NA | 计算设计 | NA | NA | 涉及CAR3突变体ACA-1和ACA-4,以及G418K |
783 | 2024-12-02 |
A massively parallel reporter assay library to screen short synthetic promoters in mammalian cells
2024-Nov-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54502-9
PMID:39609378
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研究论文 | 介绍了一种包含6144个合成启动子的文库,用于在哺乳动物细胞中筛选短合成启动子 | 开发了一种大规模并行报告基因分析文库,能够精确检测和放大转录活性,适用于多种细胞系和刺激响应 | NA | 开发一种工具,用于在哺乳动物细胞中筛选和分析合成启动子的转录活性 | 合成启动子及其在不同细胞系和刺激响应中的功能 | 合成生物学 | NA | 大规模并行报告基因分析 | NA | 转录活性数据 | 6144个合成启动子,适用于多种细胞系和刺激响应 |
784 | 2024-12-01 |
An efficient and easily obtainable butelase variant for chemoenzymatic ligation and modification of peptides and proteins
2024-Nov-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-024-02598-5
PMID:39614317
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研究论文 | 本文介绍了一种新型Butelase 1变体Butelase AY,通过突变提高其稳定性和产量,适用于多种蛋白质和肽的工程化任务 | 通过突变Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基,成功开发出一种高效且易于获得的Butelase AY变体,适用于生物正交应用 | NA | 开发一种高效且易于获得的Butelase 1变体,用于蛋白质和肽的化学酶法连接和修饰 | Butelase 1的Val237Ala和Thr238Tyr残基突变,以及其在肽和蛋白质工程中的应用 | 生物技术 | NA | 蛋白质工程 | NA | 蛋白质和肽 | 肽GLGKY、球状蛋白质GFP和内在无序蛋白质α-synuclein |
785 | 2024-12-01 |
Self-organized spatial targeting of contractile actomyosin rings for synthetic cell division
2024-Nov-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54807-9
PMID:39614082
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研究论文 | 本文展示了在巨型单层脂质体(GUVs)中重组肌动蛋白-肌球蛋白环和细菌MinDE蛋白系统的结合,实现了肌动蛋白环的自组织赤道组装和脂质体的变形 | 通过结合肌动蛋白-肌球蛋白环和MinDE蛋白系统,实现了肌动蛋白环在脂质体中的自组织定位和变形,展示了不同生物功能机制在体外结合的可能性 | NA | 工程化合成细胞的自分裂最小模块 | 肌动蛋白-肌球蛋白环和细菌MinDE蛋白系统在巨型单层脂质体(GUVs)中的重组 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白-肌球蛋白环和MinDE蛋白系统的重组 | NA | NA | NA |
786 | 2024-12-01 |
Deep learning revealed the distribution and evolution patterns for invertible promoters across bacterial lineages
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae966
PMID:39460615
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepInverton的深度学习模型,用于识别细菌中的可逆启动子(invertons),并分析了其在不同细菌谱系中的分布和进化模式 | 首次使用深度学习模型DeepInverton在不需要测序读取的情况下识别细菌中的可逆启动子,并揭示了其在病原体中的普遍性和在环境适应中的作用 | NA | 研究可逆启动子在细菌中的分布和进化模式 | 细菌基因组和宏基因组中的可逆启动子 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组和宏基因组数据 | 分析了68,733个细菌基因组和9,382个宏基因组,识别出超过200,000个非冗余的可逆启动子 |
787 | 2024-12-01 |
Synthetic translational coupling element for multiplexed signal processing and cellular control
2024-Nov-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae980
PMID:39526390
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研究论文 | 本文介绍了一种模块化的合成翻译耦合元件(synTCE),并将其与从头设计的核糖调节器和脚趾开关集成,用于多路信号处理和细胞控制 | 引入了一种新的合成翻译耦合元件(synTCE),并展示了其在逻辑计算和信号传导中的应用 | NA | 开发定制化的生物系统功能,增强核糖调节器的计算能力和应用性 | 合成翻译耦合元件(synTCE)及其在生物系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
788 | 2024-12-01 |
New-to-nature CO2-dependent acetyl-CoA assimilation enabled by an engineered B12-dependent acyl-CoA mutase
2024-Nov-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53762-9
PMID:39592584
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研究论文 | 本文开发了一种新的自然界不存在的新途径,通过工程化的B12依赖性酰基-CoA变位酶实现CO2依赖的乙酰-CoA同化 | 本文首次提出了一种新的自然界不存在的新途径,称为Lcm模块,该模块直接连接乙酰-CoA和丙酮酸,并且能够固定CO2而不是释放它 | 本文主要在体外证明了Lcm模块的功能,尚未在体内环境中进行全面验证 | 开发一种新的CO2依赖的乙酰-CoA同化途径,以提高生物量产量并减少碳损失 | 乙酰-CoA和丙酮酸的代谢途径 | 代谢工程 | NA | 定向超突变和适应性进化 | NA | NA | NA |
789 | 2024-12-01 |
Cinnamaldehyde in Focus: Antimicrobial Properties, Biosynthetic Pathway, and Industrial Applications
2024-Nov-18, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics13111095
PMID:39596788
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综述 | 本文综述了肉桂醛(TCA)的抗菌特性、生物合成途径及其在工业中的应用 | 本文探讨了肉桂醛在破坏微生物膜、抑制生物膜形成和调节病原体关键代谢途径中的作用,并介绍了其在化妆品中的应用 | NA | 综述肉桂醛的抗菌潜力及其在工业中的应用 | 肉桂醛的抗菌机制、生物合成途径及其市场和工业应用 | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
790 | 2024-11-28 |
Route to Measure Exact Parameters of Bio-Nanostructures Self-Assembly
2024-Oct-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111388
PMID:39595566
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法来确定生物纳米结构自组装机制的关键参数 | 首次实现了对自组装过程中自催化与自抑制参数的精确计算 | NA | 深入理解生物纳米结构的自组装机制 | 生物纳米结构的自组装过程 | 纳米技术 | NA | 数学建模 | NA | NA | NA |
791 | 2024-12-01 |
Current Technologies in Snake Venom Analysis and Applications
2024-Oct-25, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins16110458
PMID:39591213
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综述 | 本文综述了蛇毒研究领域的最新进展,重点介绍了蛋白质组学、基因组学、转录组学和生物信息学的整合应用 | 本文介绍了合成生物学和多组学方法(统称为venomics)在蛇毒研究中的革命性影响,提供了对蛇毒功能及其治疗潜力的更深入理解 | 尽管取得了显著进展,但毒素的功能表征和成本效益型抗蛇毒血清的开发仍然是挑战 | 探讨蛇毒研究的最新技术和应用,强调跨学科合作和新技术的必要性 | 蛇毒及其毒素的分子组成、进化机制和治疗潜力 | 生物信息学 | NA | 蛋白质组学、基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | NA | NA |
792 | 2024-12-01 |
The Importance of Biosecurity in Emerging Biotechnologies and Synthetic Biology
2024 Oct-Dec, Avicenna journal of medical biotechnology
DOI:10.18502/ajmb.v16i4.16738
PMID:39606684
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综述 | 本文综述了合成生物学领域的生物安全、生物安保和网络生物安保问题 | 探讨了合成生物学在设计和开发病原性生物武器方面的潜在风险,并提出了标准化和监管的必要性 | 未提供具体的解决方案或技术细节,主要集中在问题识别和政策建议上 | 评估新兴生物技术和合成生物学中的生物安全风险,并提出标准化和监管的建议 | 合成生物学技术及其在生物安全、生物安保和网络生物安保方面的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
793 | 2024-08-07 |
Specifications of standards in systems and synthetic biology: status, developments, and tools in 2024
2024-Mar-01, Journal of integrative bioinformatics
IF:1.5Q3
DOI:10.1515/jib-2024-0015
PMID:39026464
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
794 | 2024-12-01 |
Development of modular expression across phylogenetically distinct diazotrophs
2024-Jan-09, Journal of industrial microbiology & biotechnology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jimb/kuae033
PMID:39257030
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研究论文 | 本文报道了优化协议和质粒,用于操纵系统发育多样的固氮菌,以实现合成生物学和基因工程 | 开发了三种广宿主范围的质粒,其中一种特定质粒在测试的细菌中表现出最高的兼容性,并展示了模块化表达和基因组编辑 | 仅在少数固氮菌中进行了测试,尚未广泛应用于农业应用 | 开发用于固氮菌的基因操作工具,以减少对合成肥料的需求 | 系统发育多样的固氮菌 | NA | NA | 基因组编辑 | NA | NA | 测试了三种固氮菌和一种Klebsiella michiganensis M5al |
795 | 2024-12-01 |
Molecular Imaging with Aquaporin-Based Reporter Genes: Quantitative Considerations from Monte Carlo Diffusion Simulations
2023-10-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00372
PMID:37793076
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研究论文 | 本文开发了一种蒙特卡罗模型,用于分析细胞半径和细胞内体积分数如何定量影响基于水通道蛋白的报告基因信号 | 提出了基于两个扩散时间信号相减的差分成像方法,以提高信号特异性,并使用蒙特卡罗模拟分析了扩散性与水通道蛋白表达细胞百分比之间的关系 | NA | 开发一种定量框架,用于非侵入性地监测活体动物中基因工程设备的定位和功能 | 水通道蛋白信号与组织背景的区分 | 生物医学合成生物学 | NA | 蒙特卡罗模拟 | NA | NA | NA |
796 | 2024-11-30 |
EcNikA, a versatile tool in the field of artificial metalloenzymes
2025-Jan, Journal of inorganic biochemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jinorgbio.2024.112740
PMID:39426332
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综述 | 本文综述了使用EcNikA(一种镍转运蛋白)在合成生物学中设计人工金属酶作为替代催化剂的多重优势 | 重点讨论了从头活性位点重建的策略,并详细介绍了蛋白质骨架对人工活性位点及其最终催化性能的影响 | NA | 探讨EcNikA在人工金属酶设计中的应用及其在合成生物学中的潜力 | EcNikA蛋白及其在人工金属酶设计中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
797 | 2024-11-30 |
Pathway to industrial application of heterotrophic organisms in critical metals recycling from e-waste
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108438
PMID:39218325
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综述 | 本文综述了异养生物在电子废弃物中回收关键金属的工业应用途径 | 讨论了如何通过简单的优化方法和先进的生物技术克服当前的障碍,并展示了新兴技术在生物浸出溶液中进行低成本、低影响、选择性和高级金属回收的潜力 | NA | 探讨异养生物在生物采矿中的应用及其在工业应用中的障碍和解决方案 | 异养微生物及其分泌的金属结合生物分子 | NA | NA | 生物浸出 | NA | NA | NA |
798 | 2024-11-30 |
The biosynthesis of L-phenylalanine-derived compounds by engineered microbes
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108448
PMID:39260779
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综述 | 本文综述了通过工程微生物合成L-苯丙氨酸衍生物的研究进展 | 本文总结了提高L-苯丙氨酸衍生物产量的主要策略,并展望了通过微生物方法合成L-苯丙氨酸衍生物的发展趋势 | 本文主要讨论了L-苯丙氨酸衍生物合成的挑战,如低产量和生产率 | 探讨通过工程微生物合成L-苯丙氨酸衍生物的研究进展及其应用前景 | L-苯丙氨酸及其衍生物,包括苯基丙酮酸衍生物、反式肉桂酸衍生物、对香豆酸衍生物和其他L-苯丙氨酸衍生物(如黄酮类化合物) | NA | NA | 代谢工程和合成生物学 | NA | NA | NA |
799 | 2024-11-30 |
Advances in multi-enzyme co-localization strategies for the construction of microbial cell factory
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108453
PMID:39278372
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综述 | 本文综述了多酶共定位策略在构建微生物细胞工厂中的最新进展和应用 | 探讨了酶共定位策略在提高天然产物产量中的应用,并展望了未来结合多种策略与先进技术的研究方向 | 未提及具体实验数据或模型验证 | 探讨多酶共定位策略在生物制造中的应用及其未来发展方向 | 微生物细胞工厂及天然产物生产 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
800 | 2024-11-30 |
Bioengineered heparin: Advances in production technology
2024-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108456
PMID:39326809
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综述 | 本文综述了肝素生物工程生产技术的最新进展 | 介绍了通过代谢工程和合成生物学在原核和真核系统中生产生物工程肝素的新方法 | 生物工程肝素生产中控制分子量和硫酸化模式的挑战 | 探讨肝素生物工程生产技术的最新进展及其在医学研究中的潜力 | 肝素的生产技术及其在治疗炎症、癌症和传染病中的应用 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |