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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2026-04-10 |
Chemistry and biology of imidazole, oxazole and thiazole alkaloids
2026, The Alkaloids. Chemistry and biology
DOI:10.1016/bs.alkal.2025.12.002
PMID:41951284
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综述 | 总结了含咪唑、噁唑和噻唑环的五元氮杂环天然产物的最新研究进展,包括其来源、分离、结构表征、生物活性、化学合成及合成生物学应用 | 系统性地将相关生物碱按共同结构特征或生物来源进行分类,并涵盖了最新的合成生物学研究进展 | NA | 综述含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱的化学与生物学研究 | 含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现 |
| 782 | 2026-04-10 |
Advancements and expanding applications of CAR-T cell therapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1802718
PMID:41953032
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在肿瘤学及免疫介导疾病中的进展与应用,包括其机制基础、工程策略、安全控制系统及面临的挑战 | 探讨了CAR-T疗法从血液恶性肿瘤扩展到自身免疫疾病和慢性病毒感染的新应用领域,并分析了通用型、同种异体工程策略及新型基因递送平台等前沿技术 | 存在可扩展性、制造标准化和长期免疫持久性等转化障碍,以及生物学和物流方面的重大挑战 | 评估CAR-T细胞疗法在肿瘤学和免疫介导疾病中的进展、应用潜力及未来发展方向 | CAR-T细胞疗法,包括其工程策略、安全控制系统和基因递送平台 | NA | 血液恶性肿瘤,自身免疫疾病(如多发性硬化症、系统性红斑狼疮),慢性病毒感染(如HIV、乙型肝炎) | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 逻辑门控和可诱导系统 | 医学 |
| 783 | 2026-04-10 |
Deep learning on protein language model embeddings unlocks accurate prediction of protein solubility
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1716930
PMID:41953440
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研究论文 | 本文提出了一种名为DeepSolNet的深度学习模型,利用蛋白质语言模型嵌入来准确预测蛋白质溶解度 | 首次将先进的蛋白质语言模型ESM Cambrian与双向LSTM、CNN和注意力机制相结合,构建多模块架构用于溶解度预测,在独立测试集上达到最先进性能 | 模型在独立测试集上的准确率为0.53,仍有提升空间;未明确说明训练数据的具体来源和规模限制 | 开发准确预测蛋白质溶解度的工具,以解决原核表达系统中蛋白质错误折叠的问题 | 异源蛋白质,特别是大肠杆菌表达系统中的蛋白质 | 机器学习 | NA | 深度学习,蛋白质语言模型 | 双向LSTM,CNN,注意力机制 | 蛋白质序列 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学,蛋白质工程 |
| 784 | 2026-04-10 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体必需的tRNA修饰酶,揭示了其最小翻译系统的组成与功能 | 首次系统鉴定了顶质体定位的tRNA修饰酶,并证明其中6个催化反密码子环修饰的酶对寄生虫生存和细胞器维持至关重要 | 有两个基因无法被敲除,其中一个可能具有顶质体外的必需功能,另一个的作用机制尚未完全阐明 | 阐明恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其对细胞器维持的影响 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 785 | 2026-04-10 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
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综述 | 本文探讨了土壤微生物群落中基因转移的预测与理解,旨在为合成生物学技术在土壤应用中的风险评估提供路线图 | 提出通过建立土壤标准和利用新兴技术测量基因转移宿主范围,以构建社区尺度、环境特异性模型来预测生物技术风险 | NA | 提高对土壤微生物群落中基因转移过程的理解,以评估合成DNA在环境中的无意转移风险 | 土壤微生物群落和工程微生物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境微生物 | NA | 环境, 农业, 能源, 食品安全 |
| 786 | 2026-04-10 |
Genetic Engineering Approaches for the Microbial Production of Vanillin
2024-11-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111413
PMID:39595589
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综述 | 本文综述了利用基因工程和合成生物学方法提高微生物生产香兰素的研究进展 | 总结了通过基因工程和合成生物学在微生物中增强或构建香兰素生物合成途径的创新策略 | NA | 开发生物技术方法以替代化学合成,满足对天然香兰素的需求 | 香兰素生物合成途径、相关基因与酶、微生物底盘 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 天然产香兰素微生物、微生物底盘 | 香兰素生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 787 | 2026-04-10 |
Identification, Design, and Application of Noncoding Cis-Regulatory Elements
2024-08-05, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14080945
PMID:39199333
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综述 | 本文综述了非编码顺式调控元件的识别、设计与应用,强调了其在生物功能调控中的核心作用及技术进展 | 整合了ENCODE项目、高通量检测技术(如大规模并行报告基因分析)和深度学习算法(特别是大型语言模型),用于顺式调控元件的预测与从头设计 | NA | 探讨顺式调控元件的识别、功能解析及其在基因治疗、育种和合成生物学中的应用 | 顺式调控元件及其与转录因子、RNA结合蛋白和非编码RNA的相互作用 | 计算生物学 | NA | 大规模并行报告基因分析、深度学习算法、大型语言模型 | 大型语言模型 | 功能基因组数据、核苷酸序列 | NA | NA | NA | NA | 医学、农业、工业生物技术 |
| 788 | 2026-04-10 |
Utilizing Plant Synthetic Biology to Improve Human Health and Wellness
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.691462
PMID:34504505
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在改善人类健康和福祉方面的潜力,包括生产药物、营养素和营养保健品,并讨论了相关技术挑战 | 利用植物合成生物学工具将代谢途径转移到更易培养的植物中,以增强复杂药物的生产能力,并强化作物的营养和营养保健品含量 | 存在技术挑战,阻碍了植物生产促进健康的小分子化合物的能力 | 探讨植物合成生物学如何通过生成生产药物、营养素和营养保健品的植物来改善人类健康 | 植物及其代谢途径,用于生产生物活性化学品 | 合成生物学 | NA | 植物合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 代谢途径转移 | 医学, 农业 |
| 789 | 2026-04-09 |
CO2-driven biosurfactant synthesis by bacteria within CCUS
2026-Feb-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-026-13761-w
PMID:41741775
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综述 | 本文综述了微生物在CCUS框架内通过CO2捕获驱动生物表面活性剂合成的代谢与工程方面,探讨了其工业应用及合成生物学进展 | 整合了CO2利用、生物技术和数字创新,提出了通过合成生物学将碳固定模块与生物表面活性剂途径连接的新策略 | 面临技术和经济挑战,具体实施细节和规模化可行性未详细讨论 | 探讨微生物CO2捕获与生物表面活性剂生产相结合的策略,以实现温室气体减排和可持续生物制造 | 微生物(细菌)在CCUS系统中的代谢过程及生物表面活性剂合成 | 合成生物学 | NA | 基因工程、合成生物学、系统级建模、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌(具体种类未指定) | 碳固定模块与生物表面活性剂生物合成途径的连接 | 环境, 工业生物技术 |
| 790 | 2026-04-09 |
Causes and consequences of experimental variation in Nicotiana benthamiana transient expression
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69458-1
PMID:41690913
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研究论文 | 本研究系统分析了本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源,并建立了变异模型以指导实验设计 | 首次对本氏烟草农杆菌浸润瞬时表达系统的实验变异进行全面建模分析,并基于三年纵向数据提出降低变异性的实用指南 | 研究主要针对本氏烟草系统,结论可能不完全适用于其他植物瞬时表达体系 | 探究本氏烟草瞬时表达实验中的变异来源及其影响,建立减少变异性的实验设计框架 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana)农杆菌浸润瞬时表达系统 | 合成生物学 | NA | 农杆菌浸润瞬时表达技术 | 变异统计模型 | 植物基因表达数据 | 1915株植物(三年纵向数据) | 农杆菌介导的基因递送 | 本氏烟草 | 瞬时基因表达系统 | 农业, 工业生物技术 |
| 791 | 2026-04-09 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Dec-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来方向,重点探讨了其作为新型治疗平台的潜力 | 利用工程化细菌选择性定植肿瘤微环境,作为局部递送治疗剂和激发抗肿瘤免疫反应的创新平台 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用,以克服传统疗法的局限性 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计和应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 可编程生产抗癌有效载荷的合成生物电路 | 医学 |
| 792 | 2026-04-09 |
Plasmid Stability Analysis with Open-Source Droplet Microfluidics
2024-12-27, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67659
PMID:39803963
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于开源硬件的微流控工作流程,用于分析质粒保留,通过培养单细胞于凝胶微滴中并使用荧光显微镜量化微菌落 | 采用开源硬件微流控技术,结合荧光蛋白表达和非特异性DNA染色,实现高通量质粒稳定性分析,相比传统平板计数具有更高统计能力 | 研究主要聚焦于大肠杆菌作为实验模型,方法虽具通用性但需进一步验证于其他生物体 | 开发一种开源微流控工作流程,用于分析质粒在无抗生素选择下的保留情况 | 质粒在单细胞中的表达和保留,以及微菌落的量化 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、荧光显微镜、DNA染色 | NA | 图像数据 | NA | 开源硬件 | 大肠杆菌 | 质粒表达荧光蛋白,用于构建生物传感器或标记系统 | 工业生物技术、环境、医学 |
| 793 | 2026-04-08 |
Precision-engineered starch: Integrating metabolic engineering and cell-free synthetic biology for sustainable bioplastics and functional foods
2026-Jun-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2026.125146
PMID:41943368
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综述 | 本文综述了通过代谢工程和无细胞合成生物学技术,从下游修饰转向精确生物合成设计,以开发可持续生物塑料和功能性食品用淀粉的最新进展 | 整合了植物代谢工程(特别是CRISPR-Cas基因组编辑)和无细胞合成生物学平台,将淀粉开发从传统下游修饰转向精确的生物合成工程,实现结构可控、高纯度、可重复生产的淀粉设计 | NA | 开发具有特定营养品质、技术功能和可持续性目标的下一代生物基材料——工程化淀粉 | 淀粉生物合成途径、淀粉颗粒结构(直链淀粉-支链淀粉比例、链长分布、磷酸酯化等)及其与理化性质、消化性、血糖反应和抗性淀粉形成的关系 | NA | NA | 代谢工程、CRISPR-Cas基因组编辑、无细胞合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 植物(主要作物) | 淀粉生物合成途径(涉及颗粒结合淀粉合酶、可溶性淀粉合酶、淀粉分支酶和脱支酶的协调作用) | 农业, 食品, 材料, 工业生物技术 |
| 794 | 2026-04-08 |
Biosilicification across Biological Hierarchies
2026-Apr-07, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c22206
PMID:41888096
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综述 | 本文探讨了生物硅化作用在分子、细胞和组织层面的进展,强调了其在增强生物材料性能、保护生命系统以及整合合成与生物物质方面的潜力 | 挑战了硅在生物学中惰性的传统观点,并提供了工程化硅-生物界面的分子蓝图,利用合成生物学和材料科学实现超越进化时间尺度的可编程硅化调控 | NA | 研究生物硅化作用作为平台,以提升生物材料性能、保护生命系统并整合合成与生物物质 | 硅在生物系统中的化学形式、海洋生物(如硅藻)的硅化途径,以及硅在骨骼和结缔组织生物学中的作用 | 材料科学 | NA | 合成生物学、诱变、材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学、材料、工业生物技术 |
| 795 | 2026-04-08 |
Crosslinking intermodular condensation in non-ribosomal peptide biosynthesis
2025-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08306-y
PMID:39663458
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研究论文 | 本研究开发了位点选择性交联探针,用于解析非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域之间的相互作用,并报告了高分辨率冷冻电镜结构 | 首次应用四嗪点击化学捕获载体蛋白在缩合结构域活性位点的交联,揭示了模块间识别事件和载体蛋白在催化步骤间的过程性移动机制 | 研究主要聚焦于酪氨酸素生物合成的前两个模块,可能未完全反映其他非核糖体肽合成酶系统的结构动态 | 阐明非核糖体肽合成酶中载体蛋白与酶结构域相互作用的分子机制 | 酪氨酸素生物合成途径中的载体蛋白和缩合结构域 | 结构生物学 | NA | 位点选择性交联、四嗪点击化学、冷冻电镜、X射线晶体学 | NA | 结构数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 796 | 2026-04-08 |
Route to Measure Exact Parameters of Bio-Nanostructures Self-Assembly
2024-10-31, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14111388
PMID:39595566
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研究论文 | 本文介绍了一种新方法,用于测量生物纳米结构自组装的关键参数,首次实现了对自催化与自抑制参数的精确计算 | 首次提出一种能够精确计算生物纳米结构自组装过程中自催化与自抑制参数的方法 | NA | 研究生物纳米结构自组装机制,以优化其在纳米技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质基生物纳米涂层 | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 生物传感, 生物活性表面制造 |
| 797 | 2026-04-08 |
Mycoplasma pneumoniae Genome Editing Based on Oligo Recombineering and Cas9-Mediated Counterselection
2020-07-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00022
PMID:32502342
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研究论文 | 本研究开发了一种基于寡核苷酸重组工程和CRISPR/Cas9反选择技术的支原体基因组编辑方法 | 首次在支原体中建立了基于GP35单链DNA重组酶的寡核苷酸重组工程系统,并结合CRISPR/Cas9反选择技术显著提高了编辑效率 | 基因删除效率随编辑片段增大而降低,对于超过1.8kb的染色体删除可能需要进一步优化 | 开发高效的支原体基因组编辑工具以推动其作为合成生物学底盘菌株的应用 | 肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae) | 合成生物学 | NA | 寡核苷酸重组工程、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | NA | CRISPR-Cas9, GP35重组酶 | 肺炎支原体 | NA | 工业生物技术 |
| 798 | 2026-04-08 |
Situating anticipation in everyday life: Using sensory methods to explore public expectations of synthetic biology
2019-04, Public understanding of science (Bristol, England)
DOI:10.1177/0963662518808694
PMID:30355070
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研究论文 | 本文探讨了如何通过感官方法将公众对合成生物学的期望融入日常生活实践,以接地气地预测社会技术未来 | 采用感官方法论,将技术预期置于日常实践中,而非抽象化,并通过社会历史方法分析两个实践领域以展示生物合成未来如何改变人、物与观念的关系 | NA | 探索公众对合成生物学的期望,并研究如何通过感官方法将技术预测融入日常生活 | 公众的日常体验,特别是家庭护理与个人卫生护理两个实践领域 | 社会科学与合成生物学交叉 | NA | 感官方法论,社会历史分析 | NA | 定性数据(如感官体验描述) | NA | NA | NA | NA | 消费品(如香料与香水市场) |
| 799 | 2026-04-08 |
Informational laws of genome structures
2016-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep28840
PMID:27354155
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研究论文 | 本研究探讨了在基因组分析中,基于k-mer和信息论概念选择最佳k值,以揭示基因组结构的内在规律,并提出了五个信息定律和一个基因组复杂性度量 | 确定了k = lg2(n)作为最佳k值,用于定义基因组信息指数,并提出了所有基因组都遵循的五个信息定律,以及一个基于广义逻辑映射的基因组复杂性度量 | 研究仅基于七十个基因组进行分析,可能未覆盖所有基因组类型,且应用部分仅简要概述 | 研究基因组结构的基本机制和设计原则,通过信息论概念表达基因组的内在方面 | 七十个基因组 | 计算生物学 | NA | k-mer分析,信息熵计算 | 广义逻辑映射 | 基因组序列数据 | 七十个基因组 | NA | NA | NA | 计算合成生物学 |
| 800 | 2026-04-07 |
Engineering aminoacyl-tRNA synthetase activity to enhance branched-chain amino acid biosynthesis
2026-Mar-31, Biochimie
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.biochi.2026.03.014
PMID:41933685
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研究论文 | 本文探讨通过工程化支链氨基酸特异性氨酰-tRNA合成酶活性来增强微生物中支链氨基酸的生物合成 | 提出利用aaRS-tRNA对工程化创建生长偶联选择系统,并整合tRNA修饰、靶向aaRS诱变和合成生物学工具,以直接工程化BCAA aaRS,这是当前研究中较少探索的途径 | 直接工程化BCAA aaRS的研究仍较为罕见,相关应用潜力尚未充分开发 | 增强微生物细胞工厂中支链氨基酸的生物合成,以支持工业规模生产 | 支链氨基酸(缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸)及其特异性氨酰-tRNA合成酶 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、靶向诱变、tRNA修饰 | NA | NA | 涉及大肠杆菌和谷氨酸棒状杆菌的微生物细胞工厂 | 合成生物学工具 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒状杆菌 | 生长偶联选择系统,基于aaRS-tRNA对的工程化设计 | 工业生物技术 |