本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2025-10-05 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
|
综述 | 本文回顾了CAR-T细胞的现有逻辑功能及其局限性,并探讨了合成生物学工具如何推动合成免疫疗法这一新领域的发展 | 提出“合成免疫疗法”新概念,通过合成生物学技术为免疫细胞编程复杂逻辑功能 | 当前获批的CAR-T细胞仅具备简单逻辑功能,存在对正常组织的毒性和细胞因子毒性等问题 | 探讨如何通过合成生物学改进CAR-T细胞疗法,实现更精准的癌症免疫治疗 | 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)及其合成生物学改造 | 合成生物学 | 癌症 | 细胞免疫疗法、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | T细胞 | 模块化受体、可定制传感器、布尔逻辑门、多抗原识别系统 | 医学 |
| 802 | 2025-10-05 |
Codes across (life)sciences
2025-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
|
综述 | 本文探讨了“代码”概念在不同科学领域的含义、形式化及其在生命科学中的核心作用 | 跨学科视角整合数学、计算机科学到心理文化领域的代码研究,提出基于代码的统一生命理论框架 | 代码概念在不同学科中存在形式化程度差异,部分定义仍显模糊 | 构建跨学科代码研究的整体框架,探索生命系统中代码的通用理论 | 从细胞过程到文化实践的各类生物和社会系统中的代码现象 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 跨学科科学、合成生物学、人工智能 |
| 803 | 2025-10-05 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
|
综述 | 本文系统评述了工程化蛋白质支架在癌症免疫治疗中的双重应用:治疗递送和肿瘤微环境分子成像 | 开发能够同时解决肿瘤穿透性不足和提供实时监测能力的多功能蛋白质支架平台 | 在将这些有前景的平台转化为临床应用方面仍面临持续挑战 | 开发用于癌症免疫治疗的多功能蛋白质支架平台 | 工程化蛋白质支架及其在肿瘤微环境中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | 生成模型、强化学习 | 结构生物学数据、计算模型数据 | NA | 理性工程设计 | 重组表达系统 | 多功能蛋白质支架设计 | 医学 |
| 804 | 2025-10-05 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
|
综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶的分子工程和生物技术进展及其工业应用 | 系统总结了多种酶工程策略(包括异源表达、CRISPR-Cas9、组学方法和纳米固定化)在提升β-葡萄糖苷酶性能方面的创新应用 | 未明确说明现有策略在工业放大过程中的具体实施障碍和成本效益分析 | 改善β-葡萄糖苷酶的催化效率、热稳定性和葡萄糖耐受性以促进生物转化过程的工业应用 | β-葡萄糖苷酶及其工程化改造 | 工业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 使用里氏木霉Pcdna1启动子进行异源表达 | 能源, 食品, 医药 |
| 805 | 2025-10-05 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
|
研究论文 | 本研究在全基因组水平鉴定了蛇根草中与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶,并验证了三个Op10HGOs的酶活性 | 首次在蛇根草中全基因组鉴定15个10HGOs,并证实Op10HGO2和Op10HGO3在喜树碱生物合成中的关键作用 | 仅对三个Op10HGOs进行了酶活性验证,其他12个10HGOs的功能尚未明确 | 鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为异源重建生物合成途径提供基因元件 | 蛇根草(Ophiorrhiza pumila)中的10-羟基香叶醇氧化还原酶 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 15个10HGOs基因,其中3个进行详细功能验证 | 转基因技术 | 蛇根草 | 喜树碱生物合成途径 | 医药 |
| 806 | 2025-10-05 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
|
研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的基因筛选平台,能够高通量评估任意长度的基因构建体并揭示基因部件组合规则 | 结合长短读长NGS测序技术,首次实现了对多kb长度基因电路设计的高通量定量评估 | NA | 加速合成生物学发展,通过筛选多样化基因电路设计并学习'组成-功能'映射关系 | 基因电路设计和遗传部件组合 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS),长短读长测序技术 | 机器学习模型 | 基因序列数据,表达谱数据 | 单次实验可测量超过10^5个基因电路设计 | NA | 人类细胞 | 5-20 kb长度的多样化基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 807 | 2025-10-05 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
|
综述 | 本文探讨利用非哺乳动物酶类作为延缓衰老和年龄相关疾病的潜在工具 | 提出利用异源物种酶类逆转年龄相关代谢变化的新策略,而非直接靶向自身基因 | NA | 探索通过代谢调控延缓衰老和年龄相关疾病的替代策略 | 来自低等生物的影响年龄相关代谢过程的酶类 | 合成生物学 | 老年疾病 | 酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 808 | 2025-10-05 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
|
综述 | 本文探讨调节性T细胞的生物学特性及其在疾病治疗中的应用前景 | 结合纳米医学和合成生物学技术开发新一代T细胞精准调控疗法 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解问题 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的临床应用策略 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 809 | 2025-10-05 |
Architectural engineering of Cyborg Bacteria with intracellular hydrogel
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101226
PMID:39328785
|
研究论文 | 本研究通过调控不同结构的水凝胶实现半机械细菌的物理和生化特性控制 | 首次展示了通过调控细胞内水凝胶组分(不同光引发剂、分子量PEG-DA、4臂PEG-DA和dsDNA-PEG)来调控半机械细菌功能与结构的新策略 | NA | 探索通过细胞内材料工程控制半机械细菌功能的新方法 | 半机械细菌(Cyborg Bacteria) | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细胞内PEG基水凝胶架构 | 工业生物技术 |
| 810 | 2025-10-05 |
Molecular Engineering of Functional SiRNA Agents
2024-06-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00181
PMID:38733599
|
研究论文 | 开发了一种通过细菌发酵高产率大规模生产功能性siRNA药物的创新生物工程平台 | 采用新型tRNA融合pre-miRNA载体在活宿主细胞内生产多种形式的BioRNA/siRNA药物,实现100%成功率的九种目标分子高水平过表达 | NA | 推进合成生物学领域,为研究和药物开发提供新型功能性siRNA药物生物工程平台 | 小干扰RNA(siRNA)药物 | 合成生物学 | NA | 细菌发酵,分子工程 | NA | NA | 九种目标BioRNA/siRNA分子,每0.25升细菌培养物产量3-10毫克 | NA | 细菌 | tRNA融合pre-miRNA载体系统 | 医学,药物开发 |
| 811 | 2025-10-05 |
Emerging Coumestans in Cancer Therapy With Mechanistic Insights and Clinical Potential
2025-Jul, Archiv der Pharmazie
IF:4.3Q1
DOI:10.1002/ardp.70058
PMID:40685808
|
综述 | 本文全面综述了香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的抗癌机制及临床潜力 | 系统阐述香豆雌酚衍生物通过调控多条信号通路抑制癌症的机制,并提出结合合成生物学、生物信息学和人工智能提升疗效的新方法 | 香豆雌酚类化合物存在生物利用度低、水溶性差、代谢快等临床应用挑战 | 探讨香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的机制及临床转化潜力 | 香豆雌酚、蟛蜞菊内酯、异秦皮啶和补骨脂定等香豆雌酚衍生物 | NA | 乳腺癌,卵巢癌,前列腺癌 | 合成生物学,生物信息学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 812 | 2025-10-05 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
|
研究论文 | 开发了一种无需淬灭剂的单染料标记方法用于监测G-四链体DNA的折叠与解折叠过程 | 首次实现了仅使用单染料标记(无需淬灭剂)的FRET类似格式来监测G-四链体结构转变 | NA | 开发低成本高通量监测G-四链体结构折叠转变的技术 | G-四链体形成DNA序列 | 合成生物学 | NA | 荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | NA | NA | G-四链体结构 | 合成生物学 |
| 813 | 2025-10-05 |
Robust genetic codes enhance protein evolvability
2024-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002594
PMID:38754362
|
研究论文 | 通过大规模并行实验分析数百种重编程遗传密码对蛋白质进化能力的影响 | 首次系统证明稳健遗传密码通过创造平滑的适应性景观来增强蛋白质进化能力,并发现标准遗传密码在进化能力方面并非最优 | 进化能力最优化的遗传密码在一定程度上取决于氨基酸序列与蛋白质功能的具体关系 | 探究遗传密码的稳健性对蛋白质进化能力的影响机制 | mRNA序列和蛋白质功能关系 | 合成生物学 | NA | 大规模并行序列到功能分析 | 适应性景观模型 | 序列数据 | 每个景观包含超过1600万条mRNA序列 | 遗传密码重编程 | NA | NA | 蛋白质工程, 合成生物学 |
| 814 | 2025-10-05 |
In situ chromatin interactomics using a chemical bait and trap approach
2020-06, Nature chemistry
IF:19.2Q1
DOI:10.1038/s41557-020-0474-8
PMID:32472103
|
研究论文 | 开发了一种化学诱饵捕获方法用于研究染色质内组蛋白修饰的相互作用组 | 使用合成生物学方法在天然染色质中设置组蛋白修饰控制的光亲和陷阱,能够捕获瞬时相互作用因子 | NA | 探索表观遗传调控和失调的分子机制 | 组蛋白翻译后修饰的相互作用伙伴 | 表观遗传学 | 癌症 | 定量蛋白质组学、原位蛋白质组学、光亲和标记 | NA | 蛋白质组数据 | NA | 合成生物学方法 | NA | 组蛋白修饰控制的光亲和陷阱系统 | 医学 |
| 815 | 2025-10-05 |
Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932
PMID:40609762
|
综述 | 总结微生物合成中链长度二醇的当前进展与未来发展方向 | 提出适用于不同链长的通用生物合成途径,并整合合成生物学与AI驱动的酶设计等前沿技术 | 微生物底盘筛选优化速度较慢,限速酶活性不足,中间体和终产物存在毒性问题 | 开发可持续的中链长度二醇微生物合成方法以替代化石基生产工艺 | 中链长度α,ω-二醇(mcl-diols)的微生物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 基于脂肪酸生物合成或反向β-氧化途径的通用代谢途径 | 工业生物技术,材料,能源 |
| 816 | 2025-10-05 |
Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132936
PMID:40614874
|
综述 | 全面总结酵母中β-胡萝卜素及其衍生物生物合成的最新进展 | 基于结构相关性将衍生物分为叶黄素和脱辅基类胡萝卜素两大类,强调共享的生物合成逻辑 | 未涉及非酵母微生物系统的比较分析 | 开发可持续的微生物生产β-胡萝卜素及其衍生物的方法 | 酿酒酵母和解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母 | β-胡萝卜素生物合成途径及其衍生物代谢工程 | 食品补充剂, 营养保健品, 药品, 色素 |
| 817 | 2025-10-05 |
Biohybrid technologies for CO2 conversion to fuels and chemicals: Advances in bio-electro-, bio-photoelectro-, and bio-photocatalysis
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132949
PMID:40639626
|
综述 | 本文综述了生物混合技术(生物电催化、生物光电催化和生物光催化)在二氧化碳转化为燃料和化学品领域的最新进展 | 系统比较了三种生物混合CO₂转化技术的机理特点和优化策略,强调了界面电子转移、生物相容性等共性挑战的解决方案 | NA | 开发高效可持续的二氧化碳转化技术以实现碳中和目标 | 生物混合二氧化碳转化系统 | 能源与环境生物技术 | NA | 生物电催化(BEC)、生物光电催化(BPEC)、生物光催化(BPC) | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酶系统、微生物系统 | NA | 能源, 环境 |
| 818 | 2025-10-05 |
Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature
2025-Aug-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479
PMID:40482852
|
研究论文 | 本研究通过定量蛋白质组学分析揭示了嗜盐碱热菌Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温三种极端胁迫的交叉和独特适应策略 | 首次系统阐明该菌的碱性适应机制和热适应机制,发现其采用保守的交叉胁迫机制与独特胁迫适应相结合的策略 | 研究主要基于蛋白质组学分析,对具体分子机制的验证和功能研究仍需深入 | 解析多极端微生物对高盐、碱性和高温胁迫的分子适应机制 | 嗜盐碱热菌Natranaerobius thermophilus | 微生物学 | NA | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | Natranaerobius thermophilus | NA | 合成生物学、生物技术 |
| 819 | 2025-10-05 |
A solution to the postantibiotic era: phages as precision medicine
2025-Aug, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102613
PMID:40449069
|
综述 | 探讨噬菌体疗法作为精准医疗手段应对抗生素耐药性危机的解决方案 | 结合基因工程、合成生物学和人工智能技术推动噬菌体疗法向精准医疗方向发展 | NA | 解决抗生素耐药性细菌感染问题 | 病原细菌和噬菌体 | NA | 细菌感染 | 基因工程、合成生物学、人工智能、机器学习 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | 宿主范围扩展、反防御系统编码、调控蛋白表达 | 医学 |
| 820 | 2025-10-05 |
Complex engineering of Solanum alkaloids structural diversity in Nicotiana benthamiana
2025-Jul-20, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70213
PMID:40684353
|
研究论文 | 本研究通过瞬时表达技术在本氏烟草中成功重构了茄科植物甾体糖苷生物碱和甾体皂苷的生物合成途径 | 发现了番茄SlGAME2-NEW酶作为木糖转移酶的功能,并首次在本氏烟草中通过多基因组合表达成功合成了20种甾体代谢产物 | NA | 在异源植物宿主中重构复杂甾体代谢物的生物合成途径 | 番茄和茄子的甾体糖苷生物碱和甾体皂苷 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达技术、多基因组合表达 | NA | NA | NA | 瞬时表达系统 | 本氏烟草 | 甾体糖苷生物碱和甾体皂苷生物合成途径,涉及9-15个基因的组合表达 | 医药 |