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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-04-07 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 本文开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增方法,通过机器学习模型优化预测精度,应用于DNA数据存储和临床诊断 | 提出了一种通过引物标签补偿策略解耦序列特异性和杂交能量调控的方法,实现了高分辨率(33%对比81%)的可编程扩增,并利用机器学习模型将预测精度从0.62提升至0.86 | 未明确提及具体局限性,但暗示该方法可扩展至单细胞测序和空间转录组学,表明当前应用范围可能有限 | 开发一种可动态调控扩增效率的方法,以提升分子诊断和DNA数据存储的性能 | 核酸扩增过程,包括DNA数据存储和临床RNA变异分析 | 机器学习 | 宫颈癌 | 核酸扩增技术,机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据(2483个数据点) | 2483个实验数据点,用于构建机器学习模型 | NA | NA | NA | 医学,数据存储 |
| 802 | 2026-04-07 |
Transitions in development - an interview with Nika Shakiba
2024-03-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202748
PMID:38421607
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访谈 | 本文是对加拿大英属哥伦比亚大学研究组长Nika Shakiba的访谈,探讨其如何运用合成生物学技术研究干细胞竞争的基础 | 通过工程学视角将干细胞视为可编程单元的研究方法,以及将合成生物学与干细胞生物学交叉融合的研究方向 | NA | 探索干细胞竞争的基础机制 | 干细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 803 | 2026-04-06 |
Advances in vehicles for in situ delivery: From classical vectors to biologically inspired structures
2026-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2026.02.013
PMID:41884229
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综述 | 本文系统总结了蛋白质和核酸递送系统的最新进展,包括病毒载体、非病毒载体及新型递送工具 | 全面评估了从经典载体到生物启发结构(如Arc、PNMA2、SEND、PVC和凝聚层系统)的递送工具发展,并对作用机制、应用进展和未来前景进行了系统分析 | NA | 为合成生物学和基因治疗领域的技术发展和理论研究提供参考 | 蛋白质和核酸的递送系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 804 | 2026-04-06 |
Focused Ultrasound-activated Extracellular Vesicles-nanoparticle Hybrids for Targeted Brain Drug Delivery: Engineering Strategies and Translational Outlook
2026-Apr-02, CNS & neurological disorders drug targets
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综述 | 本文全面探讨了聚焦超声激活的细胞外囊泡-纳米颗粒杂合体用于靶向脑部药物递送的工程策略、分子机制及转化前景 | 结合聚焦超声的可逆血脑屏障开放能力与细胞外囊泡-纳米颗粒杂合体的生物相容性及可控特性,实现高效、精准的脑部药物递送 | 大规模生产、标准化及长期安全性与可重复性仍面临挑战 | 开发一种非侵入性、靶向性的脑部药物递送系统,以克服血脑屏障的限制 | 聚焦超声激活的细胞外囊泡-纳米颗粒杂合体 | 生物医学工程 | 神经系统疾病 | 聚焦超声、声学空化、合成生物学、微流控、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 805 | 2026-04-06 |
Recent advances on fermentation of mustard plant (Brassica juncea L.): microbial community, fermentation processing and sensorial quality: a review
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1784857
PMID:41883800
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综述 | 本文系统综述了芥菜发酵过程中微生物群落、加工工艺与感官品质的最新研究进展 | 整合了多组学与合成生物学技术作为未来研究方向,以阐明风味形成机制并开发标准化工艺 | NA | 总结芥菜发酵领域的研究进展,以支持发酵芥菜产品风味一致、质量提升与安全生产的可持续发展 | 芥菜(Brassica juncea L.)及其发酵产品 | NA | NA | 多组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 806 | 2026-04-06 |
Smart control of CAR-T cells: emerging strategies for safer and more effective cancer immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1746673
PMID:41884842
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综述 | 本文综述了用于实现CAR-T细胞智能控制的最新策略,旨在提高癌症免疫疗法的安全性和有效性 | 聚焦于通过可调控、可逆和情境依赖的机制来增强CAR-T疗法安全性和精确性的新兴智能控制系统,包括可诱导CAR表达、逻辑门控受体以及利用药物、光或生物材料的外部控制系统 | NA | 总结旨在以高精度调控CAR-T细胞活化、持久性和细胞毒性的关键分子、遗传和合成方法 | CAR-T细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 传感器电路、反馈回路、逻辑门控受体 | 医学 |
| 807 | 2026-04-06 |
Recent Progress in Sequence Optimization of mRNA Vaccine: Biological Mechanism, Quantitative Metrics, and Computational Model
2026, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322261431255
PMID:41883679
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综述 | 本文深入分析了mRNA疫苗序列优化的最新进展,综述了该领域的最新计算和生物学方法,并提出了当前模型的局限性 | 综合探讨mRNA疫苗序列优化的生物机制、定量指标和计算模型,为有效mRNA疫苗设计提供新见解 | 当前模型难以应对生物系统的复杂性,需要进一步研究以优化不同生物背景和治疗应用中的mRNA序列 | 优化mRNA疫苗序列以提升其效力、稳定性和免疫原性 | mRNA疫苗序列 | 合成生物学与计算生物学 | 传染病 | 合成生物学方法和计算模型 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 808 | 2026-04-06 |
Immunometabolic Circuits in Infection for Advancing Host Directed Therapies
2024-09-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66980
PMID:39345111
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研究论文 | 本研究开发了一种基于四环素诱导(TetON)的合成生物学回路,用于递送琥珀酸脱氢酶以消除细胞内利什曼原虫 | 首次将合成生物学回路设计与聚复合物纳米颗粒递送系统结合,靶向宿主免疫代谢通路治疗利什曼病 | 研究仅在鼠巨噬细胞系中进行验证,尚未开展体内动物模型实验 | 开发靶向宿主免疫代谢通路的合成生物学疗法以消除细胞内利什曼原虫 | 利什曼原虫感染的鼠巨噬细胞系 | 合成生物学 | 利什曼病 | 合成生物学回路设计、聚复合物纳米颗粒递送、四环素诱导系统 | TetON诱导表达系统 | 细胞实验数据、细胞因子表达数据 | 鼠巨噬细胞系(具体数量未明确说明) | TetON系统、质粒载体构建 | 鼠巨噬细胞系 | 四环素诱导的合成生物学回路,用于表达琥珀酸脱氢酶作为治疗剂 | 医学 |
| 809 | 2026-04-05 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
|
综述 | 本文提出了一个整合逆合成规划与生物学约束的概念框架,以改进细胞代谢途径重建的生物可行性 | 将逆合成规划与生物学约束相结合,并利用大语言模型驱动代谢网络的理解、设计、评估与优化 | NA | 改进合成生物学中细胞代谢途径的重建方法 | 细胞代谢网络 | 合成生物学 | NA | 逆合成规划,大语言模型 | 大语言模型 | NA | NA | NA | NA | 代谢网络 | 工业生物技术 |
| 810 | 2026-04-05 |
Frontiers in polysaccharide biosynthesis: Decoding the catalytic logic of enzymes for future applications
2026-Mar-27, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2026.109907
PMID:41931921
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综述 | 本文系统分析了不同生物来源中天然多糖生物合成的分子机制,并综述了利用合成生物学策略重建和优化这些天然网络的最新进展 | 聚焦于从底物前体激活、糖链聚合到组装后修饰的完整过程,并探讨了人工智能和系统生物学等新兴技术在该领域的整合应用前景 | NA | 理解多糖的生物合成机制,并为未来在工程化系统中可控生产结构明确的多糖提供理论基础 | 动物、植物和微生物中的多糖生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 811 | 2026-04-05 |
In vivo self-assembled SOD1-siRNAs mitigate muscle atrophy and denervation in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf291
PMID:40795306
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过重编程肝脏作为组织底盘,在体内自组装封装SOD1-siRNA的小细胞外囊泡,以靶向脊髓神经元并特异性沉默突变SOD1,从而缓解肌萎缩侧索硬化症小鼠模型的肌肉萎缩和去神经支配 | 提出了一种创新的合成生物学策略,利用肝脏作为组织底盘在体内自组装靶向性小细胞外囊泡,实现了突变SOD1基因的特异性沉默,并设计了基于AAV的长期自组装系统 | 研究仅在Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证;长期安全性和潜在免疫原性未充分评估 | 开发针对肌萎缩侧索硬化症(ALS)的新型基因沉默治疗策略 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型(模拟家族性ALS) | 合成生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | siRNA基因沉默技术、小细胞外囊泡递送系统、AAV载体技术 | NA | 动物实验数据、蛋白质水平检测、行为学评估 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠(具体数量未在摘要中说明) | AAV(腺相关病毒)载体 | 小鼠(肝脏细胞) | CMV启动子驱动的合成构建体,编码SOD1-siRNA及sEV表面RVG靶向标签,形成靶向性基因沉默递送系统 | 医学(神经退行性疾病治疗) |
| 812 | 2026-04-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因,在不同细胞类型中产生强磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激,且不影响多种细胞固有生物学功能,解决了其作为深层组织报告基因的安全性质疑 | 研究主要基于体外细胞系实验,尚未在完整生物体内验证长期安全性 | 评估Aqp1作为遗传编码磁共振报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 影像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 哺乳动物细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 813 | 2026-04-04 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
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研究论文 | 本文探讨了利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食物的技术路径 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂,用于精密发酵,超越单一细胞蛋白生产,并以重组乳蛋白分泌为案例研究 | NA | 开发可持续、独立于农业的食物生产方式,实现碳中和与碳捕获 | 氢氧化细菌(HOBs) | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计,用于精密发酵与重组蛋白分泌 | 食品、工业生物技术 |
| 814 | 2026-04-04 |
Are amyloid-based materials conducive to tissue engineering?
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.009
PMID:40975651
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综述 | 本文综述了基于淀粉样蛋白的生物材料在组织工程中的应用潜力,包括其作为细胞培养支架、伤口愈合和类器官开发的材料 | 强调了淀粉样蛋白的独特性质(如稳定性、机械强度和结构多样性)与结构及合成生物学进展的结合,使其成为创新生物材料的有前景候选者 | NA | 探讨淀粉样蛋白基材料在组织工程中的适用性和应用前景 | 淀粉样蛋白原纤维及其作为生物材料的特性 | NA | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 815 | 2026-04-04 |
Fighting citrus Huanglongbing with evolutionary principles
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.004
PMID:41330792
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综述 | 本文综述了基于进化原理的害虫管理策略,并结合人工智能和合成生物学技术,以柑橘黄龙病为例,探讨了可持续农业解决方案 | 提出了进化信息害虫管理(EIPM)框架,将进化原理与人工智能、合成生物学相结合,用于设计持久的生物防治工具 | NA | 开发可持续的农业害虫管理策略,特别是针对柑橘黄龙病 | 柑橘黄龙病(HLB)及其防治 | 农业生物技术 | 柑橘黄龙病 | 人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 816 | 2026-04-04 |
Discovery, characterization, and application of chromosomal integration sites in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus islandicus
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.003
PMID:41330849
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研究论文 | 本研究系统性地鉴定并表征了嗜热古菌Sulfolobus islandicus中的染色体整合位点,并利用CRISPR-Cas系统实现了外源基因的整合与表达 | 首次系统性地鉴定并表征了S. islandicus中的8个染色体整合位点,利用CRISPR-COPIES流程和多组学计算工作流程开发了13个人工CRISPR RNAs,并利用内源性CRISPR-Cas系统实现了基因整合 | 研究中发现整合位点存在显著的位置效应,可能影响外源基因的表达效率 | 扩展S. islandicus的遗传工具,推动其作为古菌合成生物学和工业生物技术平台的潜力 | 嗜热古菌Sulfolobus islandicus | 合成生物学 | NA | CRISPR-COPIES流程、多组学计算工作流程、β-半乳糖苷酶测定 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas | Sulfolobus islandicus | 基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 817 | 2026-04-04 |
Techno-economic assessment-guided biofoundry for microbial strain development
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.002
PMID:41330850
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研究论文 | 本文提出了一种基于实验价格指数(EPI)和机器人辅助模块(RAM)的标准化方法,用于评估和优化生物铸造厂中的自动化工作流程,以提高微生物菌株开发的经济效率 | 引入了实验价格指数(EPI)作为结合时间和成本的标准化指标来量化自动化工作流程效率,并提出了机器人辅助模块(RAM)作为即插即用单元来构建工作流程 | 未明确说明该方法在不同类型生物技术应用中的普适性验证程度,也未详细讨论实际部署中可能遇到的技术或操作挑战 | 开发一种标准化方法来评估和优化生物铸造厂中自动化工作流程的经济效率,以加速微生物菌株开发 | 生物铸造厂中的自动化工作流程,特别是用于微生物菌株开发的四个工作流程:gRNA克隆、基因组编辑、DNA组装和样品分析 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习(DBTL)工作流程、机器人辅助自动化 | NA | 实验时间和成本数据 | NA | CRISPR-Cas9(用于基因组编辑)、DNA组装技术 | 微生物(具体种类未指定) | NA | 工业生物技术 |
| 818 | 2026-04-04 |
Molecular approaches to increasing plant root carbon
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.006
PMID:41353042
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综述 | 本文综述了通过分子途径和合成生物学方法增加植物根系碳储存以应对温室气体问题的策略 | 探讨利用合成生物学工程化作物根系以增强地下碳储存的创新分子途径 | 增加根系碳分配可能面临产量降低的挑战,且根系碳储存效果需进一步测试验证 | 研究如何通过分子和合成生物学方法提高植物根系碳含量,以促进碳封存 | 植物根系,特别是作物植物 | 合成生物学 | NA | 分子途径工程,合成生物学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 作物植物 | NA | 环境,农业 |
| 819 | 2026-04-04 |
A reversible small-molecule-switchable self-amplifying RNA expression platform
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151436
PMID:41839281
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研究论文 | 本研究开发了一种可逆的小分子开关自扩增RNA表达平台,用于精确调控基因表达 | 首次将自扩增RNA设计为可编程基因电路,实现小分子控制的基因表达开关,并整合多重调控模块实现独立可逆调控 | NA | 开发可控的RNA治疗和合成生物学应用平台 | 自扩增RNA构建体及其在基因表达调控中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程、脂质纳米颗粒封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 可编程RNA基因电路,包含多重调控模块如去稳定化结构域、RNA结合蛋白、四环素响应阻遏蛋白和k-turn RNA基序 | 医学 |
| 820 | 2026-04-04 |
Structures of pentatricopeptide repeat proteins
2026-Apr-01, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
DOI:10.1107/S2053230X26002311
PMID:41919993
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综述 | 本文系统综述了已解析的pentatricopeptide repeat (PPR)蛋白晶体结构,分析了其结晶学特性、结构特征及其对理解PPR功能的作用 | 首次对PPR蛋白的所有晶体结构进行全面编目和综合分析,揭示了PPR识别密码、RNA结合时的构象变化以及模块化结构基础 | NA | 系统整理和分析PPR蛋白的晶体结构数据,以促进对其结构和功能的理解 | PPR蛋白的晶体结构(包括天然和设计蛋白) | 结构生物学 | NA | 晶体学、冷冻电镜 | NA | 结构数据 | 113个PPR蛋白结构(30个PPR和83个核糖体PPR结构) | NA | NA | NA | 合成生物学 |