合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 4570 篇文献，本页显示第 821 - 840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-12-07 |
In silico approaches for discovering microbial antiviral defense systems
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf619
PMID:41348595
|
综述 | 本文综述了用于发现微生物抗病毒防御系统的计算策略，包括序列同源性、结构引导、基因组上下文和人工智能方法 | 将计算方法分为四大策略，并讨论了新兴工具如保守基因簇发现工具和基因组基础模型，以支持合成模块的生成设计 | 序列同源性方法在检测高度分化或新系统方面有限，结构引导方法计算成本高 | 系统探索微生物免疫系统，指导理性噬菌体疗法、微生物组工程和合成生物学应用 | 原核生物的多样化抗病毒防御系统 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | 人工智能方法 | 基因组数据 | NA | NA | 原核生物 | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 822 | 2025-12-07 |
Genome-based exploration of volatile flavor diversity from food yeast species
2025-Jan-30, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foaf067
PMID:41269214
|
综述 | 本文综述了基于基因组技术探索食品酵母物种中挥发性风味多样性的最新进展，重点关注酯类、苯类、硫化合物和酚类衍生物的形成途径，并展望了通过共发酵和合成生物学推动食品发酵创新的未来方向 | 利用基因组尺度技术重新定义风味多样性研究，结合共发酵策略和组学分析，为下一代食品发酵创新提供新视角 | 作为一篇小型综述，可能未全面覆盖所有相关研究或实验细节 | 探索食品酵母物种中挥发性风味化合物的遗传和进化驱动因素，以促进食品发酵创新 | 各种酵母物种，特别是酿酒酵母与非传统酵母物种 | 合成生物学 | NA | 基因组尺度技术、组学分析 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 酿酒酵母、非传统酵母物种 | 酯类、苯类、硫化合物和酚类衍生物的生物合成途径 | 食品、工业生物技术 |
| 823 | 2025-12-06 |
Microbial-mycotoxin interactions in food: A review of ecotoxicological implications and omics approaches for understanding detoxification mechanisms
2026-Apr, Food microbiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.fm.2025.104955
PMID:41344758
|
综述 | 本文综述了食品中微生物与霉菌毒素的相互作用，重点关注其生态毒理学影响以及利用组学方法阐明微生物解毒机制 | 系统整合了微生物解毒机制（吸附与酶促降解）与多组学技术（宏基因组学、基因组学、转录组学）的应用，并展望了合成生物学、CRISPR基因编辑和机器学习辅助生物信息学等未来方向 | 微生物解毒效率存在可变性、作用机制尚不明确、面临监管障碍，以及在复杂食品基质中检测掩蔽型霉菌毒素存在挑战 | 探讨食品系统中微生物与霉菌毒素的相互作用，以开发可持续的解毒策略，保障食品安全并降低生态毒理学影响 | 霉菌毒素（如黄曲霉毒素、赭曲霉毒素A、伏马菌素、单端孢霉烯族毒素、玉米赤霉烯酮）及其与微生物的相互作用 | NA | NA | 宏基因组学、基因组学、转录组学、多组学整合分析 | NA | NA | NA | CRISPR基因编辑 | NA | NA | 食品、农业、环境 |
| 824 | 2025-12-06 |
Fusarium-responsive materials: A next-generation strategy for sensing, actuation, and sustainable crop protection
2026-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2025.128967
PMID:41061457
|
综述 | 本文探讨了融合纳米技术、化学传感和智能驱动技术，构建能够实时识别病原体并自主干预的镰刀菌响应材料，以应对全球农业中镰刀菌属病原体带来的威胁 | 提出了“镰刀菌响应材料”这一新范式，将病原体特异性生物传感与刺激响应型纳米载体递送系统相结合，并展望了与机器学习、自供能传感器及合成生物学融合的智能、精准、可持续作物保护框架 | 本文是一篇展望性综述，主要提出概念框架和研究方向，未报告具体的实验数据或验证结果 | 旨在为应对镰刀菌属病原体对全球农业、粮食安全和可持续性的威胁，探索一种集实时传感与自主干预于一体的下一代作物保护策略 | 镰刀菌属病原体及其相关的生化特征，如挥发性有机化合物、霉菌毒素和酶标记物 | NA | NA | 电化学传感、光学传感、等离子体传感、机器学习算法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 825 | 2025-12-06 |
The evolving landscape of precise DNA insertion in plants
2025-Dec-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66715-7
PMID:41330932
|
综述 | 本文回顾了植物基因组中精确DNA插入技术的发展历程，从随机方法到基于CRISPR-Cas系统的工具，并分析了当前挑战与新兴解决方案 | 系统梳理了CRISPR-Cas系统在植物精确DNA插入中的应用演进，包括基因靶向、先导编辑及基于重组酶/转座酶的平台，并探讨了从理论到实践的转化路径 | 本文为综述性文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献分析，可能未覆盖最新技术突破 | 探讨植物基因组精确DNA插入技术的演变、当前局限性与未来发展方向，以推动作物改良和合成生物学应用 | 植物基因组编辑技术，特别是CRISPR-Cas系统及相关工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、基因靶向(GT)、先导编辑(PE)、重组酶/转座酶平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 826 | 2025-12-06 |
Advances in trypsin research: sources, structural insights, applications and protein engineering for industrial use
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148996
PMID:41232883
|
综述 | 本文综述了胰蛋白酶的研究进展，包括其来源、结构、应用以及为工业用途进行的蛋白质工程改造 | 系统总结了通过定点突变等蛋白质工程方法增强胰蛋白酶抗自降解能力和热稳定性的最新进展，并提出了整合AI驱动蛋白质设计与合成生物学工具的未来研究方向 | 在阐明动态酶-底物相互作用、利用天然序列多样性以及在工业规模条件下实现最佳产量方面仍存在挑战 | 综述胰蛋白酶的研究进展，并探讨通过蛋白质工程改进其工业应用性能 | 胰蛋白酶（一种丝氨酸蛋白酶） | NA | NA | 定点突变，蛋白质工程，重组蛋白表达 | NA | NA | NA | NA | 微生物重组表达系统 | NA | 工业生物技术 |
| 827 | 2025-12-06 |
Targeting and tracking mRNA lipid nanoparticles at the particle, transcript and protein level
2025-Oct, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01511-8
PMID:41102346
|
综述 | 本文综述了用于监测RNA负载脂质纳米颗粒体内行为的现有及新兴技术，并讨论了改善组织与细胞靶向的策略，以扩展该技术的应用范围 | 系统整合了脂质纳米颗粒化学修饰、生物工程及合成生物学方法（如利用microRNA靶位点）来调控mRNA递送与表达，并探讨了通过修饰编码蛋白来控制有效载荷的稳定性与亚细胞定位 | NA | 扩展RNA负载脂质纳米颗粒在非肝脏疾病治疗中的应用，并加速其临床转化 | RNA负载脂质纳米颗粒 | NA | NA | 脂质纳米颗粒技术、合成生物学方法、microRNA靶向技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 828 | 2025-12-06 |
The AML immune paradox: decoding escape pathways and pioneering checkpoint, vaccine, and combination strategies
2025-Jul-09, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01795-9
PMID:40634759
|
综述 | 本文综述了急性髓系白血病（AML）免疫治疗的机制、挑战与未来方向，重点探讨了免疫检查点抑制剂和疫苗策略 | 系统解码AML的免疫逃逸途径，并整合检查点阻断、疫苗及联合策略等新兴免疫疗法，提出通过单细胞基因组学、人工智能和合成生物学识别新靶点及改善患者分层 | 面临肿瘤微环境异质性、耐药性白血病干细胞、治疗毒性（如贫血、细胞因子释放综合征）、克隆进化导致的复发以及缺乏预测性生物标志物等挑战 | 评估AML免疫治疗的机制、挑战与未来方向，旨在改善临床疗效 | 急性髓系白血病（AML）及其免疫抑制性肿瘤微环境 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞基因组学、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 829 | 2025-12-06 |
[Improvement of the Approval System for the Development and Experimentation of Living Modified Organisms in Synthetic Biology]
2023-Aug-17, Jugan geon-gang gwa jilbyeong
DOI:10.56786/PHWR.2023.16.32.3
PMID:41334470
|
研究论文 | 本文探讨了合成生物学中活体修饰生物体（LMOs）的开发和实验审批系统的现状，并提出改进方案以平衡安全与科研活力 | 提出一个旨在确保LMO研究安全同时促进相关研究活力的国家审批系统改进计划 | NA | 探索合成生物学相关LMOs的法律法规现状，识别LMO开发和实验趋势，并提出审批系统改进方案 | 活体修饰生物体（LMOs）的开发和实验审批系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 830 | 2025-12-06 |
Engineering longevity-design of a synthetic gene oscillator to slow cellular aging
2023-04-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.add7631
PMID:37104589
|
研究论文 | 本文设计了一种合成基因振荡器，通过重编程酵母细胞的内源性切换开关，创建了自主遗传时钟，以减缓细胞衰老过程 | 首次将合成生物学方法应用于工程化长寿，通过构建基因振荡器来延迟细胞衰老的承诺，连接了基因网络架构与细胞寿命 | 研究基于酵母细胞模型，尚未在更复杂生物体中验证；可能未全面考虑所有衰老相关因素 | 工程化细胞长寿，通过合成基因网络设计来减缓衰老过程 | 酵母细胞 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 基因网络设计、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母细胞 | 合成基因振荡器，基于内源性切换开关重编程，产生核仁与线粒体衰老过程之间的持续振荡 | 医学 |
| 831 | 2025-12-05 |
Marine-derived natural products as anti-osteoporosis agents
2026-Jan-15, European journal of medicinal chemistry
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ejmech.2025.118284
PMID:41138334
|
综述 | 本文系统总结了152种具有抗骨质疏松活性的海洋天然产物，并探讨了其生物合成途径、全合成策略及临床转化挑战 | 首次系统梳理海洋来源（主要为海洋真菌）的抗骨质疏松天然产物，并整合基因组挖掘与合成生物学等新兴技术推动临床转化 | 未涉及具体临床实验数据，转化路径中的药效学与毒理学评估仍需深入 | 加速海洋天然产物在骨质疏松治疗领域的药物开发 | 海洋来源的天然产物（以聚酮类和萜类为主） | NA | 骨质疏松症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | 文献数据、化合物结构信息 | 152种海洋天然产物 | NA | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 832 | 2025-12-05 |
Integrative Multi-Omics and Artificial Intelligence: A New Paradigm for Systems Biology
2025-Dec, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251392371
PMID:41203247
|
综述 | 本文综述了整合多组学与人工智能在系统生物学中的应用，强调其在癌症生物学、微生物工程和合成生物学中的原理、方法及案例 | 提出整合多组学与人工智能作为系统生物学的新范式，克服高维度、异质性和上下文限制的挑战 | 存在数据异质性和可解释性等当前限制 | 评估多组学整合的原理、方法及应用，以推动生物系统预测模型和生物技术应用 | 基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多组学数据 | 系统生物学 | 癌症 | 高通量组学技术、单细胞组学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 833 | 2025-12-05 |
Plant-derived peptides: From identification to agronomic applications
2025-Dec-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.11.004
PMID:41243283
|
综述 | 本文综述了植物源肽作为生物农药和生物刺激剂的潜力，并提出了一个整合肽鉴定、分子设计、生物制造和生态评估的框架 | 提出结合人工智能、纳米技术和合成生物学等新兴技术，以克服植物源肽商业化中的瓶颈 | 商业化受限，包括多样性探索不足、生产成本高、生态风险评估不完整和应用场景未定义 | 探索植物源肽作为环保型生物农药和生物刺激剂在农业中的应用潜力 | 植物源肽及其在农业中的鉴定、设计和应用 | 农业生物技术 | NA | 人工智能、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 834 | 2025-12-05 |
PyFuRNAce: an integrated design engine for RNA origami
2025-Dec-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66290-x
PMID:41326357
|
研究论文 | 介绍了一个名为pyFuRNAce的开源、基于Python的RNA纳米结构设计软件包，专注于共转录RNA折纸设计 | 开发了首个将RNA折纸完整工作流程（从基序定义到序列生成）集成到单一用户友好平台的集成设计引擎 | NA | 开发用户友好的RNA纳米结构设计工具以推动RNA纳米技术发展 | RNA纳米结构，特别是共转录RNA折纸 | 合成生物学 | NA | 原子力显微镜，共聚焦荧光成像 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA折纸纳米结构（包括自组装RNA丝、RNA液滴和大型共转录RNA折纸） | 医学，生物技术，合成生物学 |
| 835 | 2025-12-05 |
Modeling of Phage-Mediated CRISPRi System to Inhibit Antibiotic Resistances in Bacteria
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
DOI:10.1109/EMBC58623.2025.11253443
PMID:41337296
|
研究论文 | 本文提出了一种基于工程化噬菌体递送CRISPR干扰系统以抑制细菌抗生素耐药性的创新策略，并开发了数学模型来模拟其动态过程 | 利用工程化噬菌体递送CRISPRi系统来精确沉默耐药基因，并结合数学模型评估系统性能及长期疗效潜力 | NA | 开发合成生物学方法以对抗抗菌素耐药性 | 抗生素耐药性病原体 | 合成生物学 | 细菌感染 | CRISPR干扰系统 | 数学模型 | 模拟数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | CRISPRi递送系统 | 医学 |
| 836 | 2025-12-05 |
Strength in diversity: unlocking the full potential of engineered living materials with multistrain collaboration
2025-Jan-14, FEMS microbiology reviews
IF:10.1Q1
DOI:10.1093/femsre/fuaf055
PMID:41206547
|
研究论文 | 本文探讨了工程活材料中多菌株协作的潜力，以提升其功能和适用性 | 提出利用多菌株协作来克服单菌株在代谢负担和工程化方面的限制，从而扩展ELMs的功能 | 多菌株ELMs技术尚处于早期阶段，具体应用和稳定性有待进一步研究 | 研究如何通过多菌株协作优化工程活材料的设计和性能 | 工程活材料，特别是包含细菌、真菌、植物或藻类等生物的材料 | 合成生物学与材料科学交叉领域 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌、植物、藻类 | 多菌株协作系统，旨在实现自组装、驱动和动态交互等功能 | 医疗保健、建筑、农业 |
| 837 | 2025-12-05 |
Dynamic processes of fate decision in inducible bistable systems
2024-12-03, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2024.10.015
PMID:39478343
|
研究论文 | 本文通过数学建模研究了诱导型双稳态系统中基因调控网络对细胞命运决定的动态过程的影响 | 揭示了基因调控步骤的延迟和外部诱导时间尺度对命运决定动态轨迹的偏差作用，并提出了稳态参数决定命运决定景观而动态过程形成新的瞬态分布的观点 | NA | 研究诱导型双稳态系统中细胞命运决定的动态过程 | 基因调控网络和细胞命运决定过程 | 系统生物学 | NA | 数学建模 | 常微分方程 | NA | NA | NA | NA | 诱导型双稳态系统 | 合成生物学 |
| 838 | 2025-12-04 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-Jan-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
|
研究论文 | 本研究提出了一种集成暗场照明的数字微流控平台，通过人工智能辅助增强液滴检测性能，用于现场病原体检测 | 开发了具有可切换双模式光学系统的ITO-DMF平台，利用暗场成像显著提升液滴对比度，优化AI驱动的液滴识别和特征提取 | NA | 提高数字微流控系统中基于人工智能的液滴识别精度，实现自动化病原体检测 | 数字微流控平台中的液滴，以及临床样本中的肺炎支原体 | 计算机视觉 | 肺炎 | 暗场成像，荧光成像，qPCR | 深度学习模型 | 图像 | 临床样本 | NA | NA | NA | 医学 |
| 839 | 2025-12-04 |
Engineered Commensals as Next-Generation Drug Delivery Agents for Nose-to-Brain Therapeutics in Neurological Disorders
2025-Dec-03, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.5c00874
PMID:41268975
|
综述 | 本文探讨了利用合成生物学和材料工程开发的工程化共生菌作为鼻-脑给药系统，用于治疗中枢神经系统疾病 | 提出将工程化共生菌与鼻内给药途径相结合，绕过血脑屏障，实现中枢神经系统药物的靶向递送 | NA | 开发一种基于工程化共生菌的鼻-脑给药系统，以改善中枢神经系统疾病的治疗 | 中枢神经系统疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病、中风、胶质瘤） | 合成生物学 | 神经系统疾病 | 合成生物学、材料工程 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞、细菌、病毒 | 疾病靶向迁移、局部治疗生产、适应性递送、免疫激活、代谢调节 | 医学 |
| 840 | 2025-12-04 |
Techno-economic assessment-guided biofoundry for microbial strain development
2025-Dec-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.002
PMID:41330850
|
研究论文 | 本文提出了一种结合机器人辅助模块和实验价格指数来优化合成生物学工作流程及生物铸造厂经济效益的方法 | 定义了机器人辅助模块作为即插即用单元，并引入实验价格指数这一结合时间和成本的标准化指标来评估和优化合成生物学工作流程 | 未提及具体实验验证的样本规模或实际应用案例的详细数据 | 开发一种用于评估和优化生物铸造厂自动化流程经济效益的方法 | 微生物菌株开发工作流程 | 合成生物学 | NA | 机器人自动化、DBTL工作流程 | NA | 实验流程数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 工业生物技术 |