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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-10-05 |
Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture
2025-Jun-03, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04279-x
PMID:40459729
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综述 | 探讨利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌中绿脓菌素产量的前景 | 首次系统探讨合成生物学工具在绿脓菌素生物合成中的应用潜力 | NA | 通过基因水平操作提高绿脓菌素产量以满足水产养殖需求 | 铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径 | 合成生物学 | 弧菌病 | 基因水平操作 | NA | NA | NA | NA | 铜绿假单胞菌 | 绿脓菌素生物合成途径 | 农业 |
| 822 | 2025-10-05 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
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研究论文 | 开发了一种名为Coli Bond的双功能加密系统,利用合成生物学技术在大肠杆菌中实现安全信息存储和传输 | 将DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态相结合,通过咖啡因浓度和温度调控信息传输,并具备温度敏感的自毁机制 | 多次传输后菌株存活率快速下降,可能影响长期传输稳定性 | 开发安全可控的微生物信息存储和传输系统 | 工程化大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、DNA存储技术 | NA | DNA编码信息 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 咖啡因降解通路、温度敏感自毁机制、条件生长控制系统 | 信息安全、数据存储 |
| 823 | 2025-10-05 |
Unlocking the potential of flavonoid biosynthesis through integrated metabolic engineering
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1597007
PMID:40510168
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综述 | 本文全面综述了黄酮类化合物的生物合成、调控机制及产量提升策略,并提出了整合合成生物学与人工智能的可持续生产新路径 | 首次将植物细胞工厂、基因组编辑、环境优化和人工智能驱动的代谢工程进行系统性整合,为黄酮类化合物生产提出创新路线图 | NA | 探索黄酮类化合物生物合成的潜力及产量提升策略 | 黄酮类化合物的生物合成途径、调控机制和运输过程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、空间代谢组学、人工智能 | NA | 代谢组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物细胞 | 黄酮类化合物生物合成途径 | 医药,营养,化妆品 |
| 824 | 2025-10-05 |
Open-endedness in synthetic biology: A route to continual innovation for biological design
2024-01-19, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi3621
PMID:38241375
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研究论文 | 提出合成生物学中的开放式设计方法,强调设计新颖性与功能目标同等重要 | 将开放式设计理念引入合成生物学,主张设计新颖性至少与功能实现同等重要,突破传统目标导向设计的局限 | NA | 探索合成生物学中开放式设计方法,推动生物设计的持续创新 | 合成生物学设计方法论 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 825 | 2025-10-05 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体中16种tRNA修饰酶并验证其中14种的定位,确定了6种对寄生虫存活至关重要的tRNA修饰酶 | 首次系统性地定义了恶性疟原虫顶质体这一简化细胞器的最小tRNA修饰酶集合,揭示了反密码子环修饰在细胞器维持中的核心作用 | 两个基因无法被成功敲除,其中一个具有双重定位可能在其他细胞区室发挥功能,另一个可能具有代谢旁路无法替代的关键功能 | 解析恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用机制 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶及其功能 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | 16种预测的tRNA修饰酶,其中14种验证定位,12种进行基因敲除研究 | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 826 | 2025-10-05 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
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综述 | 本文综述了糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出了临时糖基化支架策略,为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | NA | 探讨糖基化对蛋白质折叠的影响及其在合成生物学中的应用 | 糖基化修饰的蛋白质 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医药 |
| 827 | 2025-10-05 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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研究论文 | 本研究表征了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,用于微生物合成苯乙烯 | 通过真菌铁酸盐脱羧酶的多序列比对设计出首个共识蛋白PSC1,解决了苯乙烯生物合成中关键脱羧步骤的挑战 | NA | 开发高效的微生物合成苯乙烯的生物工艺 | 共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质晶体学、定点突变、共识设计 | NA | 蛋白质结构数据、酶活性数据 | NA | 遗传工程 | 恶臭假单胞菌DOT-T1E | 苯乙烯生物合成途径:L-苯丙氨酸→反式肉桂酸→苯乙烯的两步代谢途径 | 工业生物技术 |
| 828 | 2025-10-05 |
Cell-free expression and SMA copolymer encapsulation of a functional receptor tyrosine kinase disease variant, FGFR3-TACC3
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86194-6
PMID:39848978
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研究论文 | 本研究通过无细胞蛋白表达系统成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并利用SMA共聚物进行封装 | 首次通过无细胞表达系统在48小时内成功表达功能性FGFR3-TACC3融合蛋白,并实现300 µg/mL的特定产量 | 尚未获得全长受体酪氨酸激酶的高分辨率结构,传统表达系统无法充分表达该蛋白 | 开发跨膜蛋白特别是受体酪氨酸激酶融合蛋白的表达方法 | FGFR3-TACC3融合蛋白(受体酪氨酸激酶疾病变异体) | 合成生物学 | 癌症 | 无细胞蛋白表达(CFPE),SMA共聚物封装 | NA | 蛋白功能数据 | NA | 无细胞表达系统 | 无细胞系统 | NA | 医学 |
| 829 | 2025-10-05 |
Optimal network sizes for most robust Turing patterns
2025-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86854-7
PMID:39849094
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研究论文 | 通过随机矩阵理论分析较大网络的雅可比矩阵,揭示图灵模式在生物系统中出现的概率及其最优网络规模 | 发现图灵模式的出现概率高于预期,且最稳健的图灵网络存在仅包含少量分子物种的最优规模 | NA | 分析复杂基因调控通路中图灵模式的形成机制 | 基因调控网络和图灵模式 | 系统生物学 | NA | 随机矩阵理论 | 图灵激活-抑制模型 | NA | NA | NA | NA | 图灵网络 | 合成生物学 |
| 830 | 2025-10-05 |
Optimizing phage therapy with artificial intelligence: a perspective
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1611857
PMID:40496019
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综述 | 探讨人工智能如何优化噬菌体疗法以应对抗菌素耐药性威胁 | 将人工智能与合成生物学相结合,推动下一代合成噬菌体的遗传优化设计 | NA | 通过人工智能方法改进噬菌体疗法的开发流程 | 噬菌体与宿主细菌的相互作用机制 | 机器学习 | 抗菌素耐药性感染 | 人工智能方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌 | NA | 医学 |
| 831 | 2025-10-05 |
Revolutionizing immunotherapy: The next frontier in CAR T-cell engineering
2025-Jul, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104751
PMID:40306469
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综述 | 本文系统回顾了CAR-T细胞疗法从第一代到第五代的发展历程及其在癌症治疗中的革命性应用 | 整合了合成生物学技术开发第五代CAR-T细胞,引入共刺激结构域、双信号通路和细胞因子释放机制等创新设计 | 在实体瘤治疗中仍面临肿瘤免疫抑制微环境和抗原异质性的挑战 | 探索CAR-T细胞疗法的发展历程和未来方向 | CAR-T细胞疗法的技术演进和临床应用 | 合成生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 细胞工程技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | T细胞 | 嵌合抗原受体设计,包括信号传导通路和细胞因子释放机制 | 医学 |
| 832 | 2025-10-05 |
Detection of TuMV by a toehold switch sensor coupled with NASBA amplification in Pseudostellaria heterophylla
2025-Jun-09, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01394-5
PMID:40490766
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研究论文 | 开发了一种基于核酸序列扩增和toehold开关传感器的无细胞表达系统,用于检测太子参中的芜菁花叶病毒 | 结合NASBA扩增和toehold开关传感器,实现了快速、高灵敏度的病毒检测,可直接用于田间样品 | 未明确说明检测系统的稳定性和长期保存性能 | 开发高效检测太子参中芜菁花叶病毒的诊断系统 | 太子参植物和芜菁花叶病毒 | 合成生物学 | 植物病毒感染 | 核酸序列扩增(NASBA), toehold开关传感器 | NA | RNA片段 | 田间样品(纯化和粗提RNA提取物) | toehold开关 | 无细胞表达系统 | toehold开关传感器结合视觉报告基因 | 农业,医学 |
| 833 | 2025-10-05 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-Jun-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和化学方法开发了具有抗菌活性的可降解生物源聚合物 | 结合真菌工程宿主异源生产单体前体与化学修饰,构建了新型羟基苯甲酸-丙交酯共聚物库 | 仅针对革兰氏阳性菌进行了测试,缺乏对其他病原体的广谱抗菌活性验证 | 开发具有抗菌活性的可降解生物源聚合物以应对抗生素耐药性问题 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧基-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-丙交酯基聚合物 | 合成生物学 | 细菌感染 | 异源生产、化学修饰、开环聚合 | NA | 实验数据 | 通过改变[单体]/[引发剂]比例(M/I = 5-30)制备不同聚合度的聚合物 | 合成生物学 | 工程真菌 | NA | 医药 |
| 834 | 2025-10-05 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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研究论文 | 开发了一种能够通过高阶组装靶向癌细胞的合成治疗性原细胞 | 利用主客体化学构建正交多糖基原细胞,整合靶向配体和催化纳米颗粒实现程序化空间耦合催化反应 | 目前仅进行体外实验验证 | 开发可编程的原细胞治疗系统用于癌症治疗 | 合成原细胞与癌细胞的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 主客体化学、静电驱动自组装 | NA | 实验数据 | NA | Gibson Assembly | NA | GOx/Pt-AuNP催化反应级联系统,用于生成一氧化氮 | 医学 |
| 835 | 2025-10-05 |
Transcription regulation by RNA-induced structural strain in duplex DNA
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf429
PMID:40401557
|
研究论文 | 本文描述了一种通过RNA-DNA三链体调控转录的机制,该机制通过诱导DNA双链结构应变来增强或抑制转录 | 首次揭示了RNA-DNA三链体通过引起DNA双链结构应变来调控转录的分子机制 | 研究主要基于大肠杆菌系统,在更复杂生物体中的适用性需要进一步验证 | 探索非编码RNA通过形成三链体结构调控基因表达的分子机制 | RNA-DNA三链体、大肠杆菌启动子架构 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、体外表征、启动子文库筛选 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 大肠杆菌 | 基于启动子的转录调控架构 | 基础研究 |
| 836 | 2025-10-05 |
Expanding the σ54-dependent transcription process with orthogonal designs
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf442
PMID:40401558
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研究论文 | 本研究通过改造σ54因子及其配对启动子,开发了三组正交表达系统 | 通过知识导向筛选和重新设计σ54的RpoN盒,创建了具有不同启动子偏好性和理想相互正交性的σ54突变体 | NA | 扩展合成生物学工具箱,实现可靠和多样化的基因表达 | σ54因子、细菌增强子结合蛋白(bEBPs)、启动子 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、蛋白质工程 | NA | NA | 在三种非模式细菌中验证 | CRISPR-Cas9 | 细菌, 非模式细菌 | 正交基因表达系统、遗传电路、生物传感器 | 工业生物技术, 环境 |
| 837 | 2025-10-05 |
Engineering plant photoreceptors towards enhancing plant productivity
2025-May-06, Plant molecular biology
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11103-025-01591-9
PMID:40327169
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综述 | 概述植物光感受器工程在提高植物生产力方面的应用潜力 | 整合光感受器工程与光遗传学技术用于作物育种创新 | 未提及具体实验验证数据 | 通过工程化改造植物光感受器提高作物生产力 | 植物光感受器蛋白及其调控通路 | 合成生物学 | NA | 基因工程、光遗传学 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | 作物植物 | 光感受器信号通路工程 | 农业 |
| 838 | 2025-10-05 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
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研究论文 | 本文提出了一种旨在促进微生物学领域包容性和持久性的途径项目 | 设计了整合噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等新兴领域的公平培训途径 | NA | 促进微生物学领域多元化人才培养和劳动力发展 | 微生物学领域的教育项目和人才培养途径 | 微生物学教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 839 | 2025-10-05 |
Lipase activated endocytosis-like behavior of oil-in-water emulsion
2024-10-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52802-8
PMID:39353937
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研究论文 | 本研究揭示了水包油乳液中脂滴在酶促反应触发下表现出的内吞样行为及其功能应用 | 首次发现脂肪酶触发的人工脂滴内吞样行为,并阐明其由界面张力降低和膜压缩力增加驱动的机制 | NA | 探索人工脂滴的生物物理动态行为及其在合成生物学中的应用 | 水包油乳液脂滴 | 合成生物学 | NA | 酶促反应分析 | NA | 生物物理数据 | NA | NA | NA | 人工脂滴系统 | 工业生物技术,材料 |
| 840 | 2025-10-05 |
Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013
PMID:40487243
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研究论文 | 通过补充产色氨酸细菌修复肠道屏障功能并缓解骨质疏松 | 首次揭示色氨酸缺失通过破坏肠道屏障引发骨质疏松的机制,并提出基于合成生物学的产色氨酸菌株干预策略 | 研究仅基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 探究肠道微生物代谢物色氨酸在骨质疏松发病中的作用及治疗潜力 | 骨质疏松模型小鼠和老年小鼠 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 微生物代谢组学分析 | NA | 代谢物检测数据 | 骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | 色氨酸生物合成途径 | 医学 |