合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
821	2024-11-29	Different transcriptomic and metabolomic analysis of Saccharomyces cerevisiae BY4742 and CEN.PK2-1C strains 2024-Nov-07, Archives of microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00203-024-04178-y PMID:39508902	研究论文	研究了两种酵母菌株Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C的转录组和代谢组差异	首次系统分析了这两种酵母菌株在代谢和转录水平上的差异	研究仅限于两种特定的酵母菌株，结果可能不适用于其他酵母菌株	探讨不同酵母菌株间的转录和代谢变化，为高效酵母细胞工厂的建立提供基础	Saccharomyces cerevisiae BY4742和CEN.PK2-1C菌株	NA	NA	转录组分析和代谢组分析	NA	转录组数据和代谢组数据	两种酵母菌株
822	2024-11-27	Optimisation of coumaric acid production from aromatic amino acids in Kluyveromyces marxianus 2024-Dec-10, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2024.11.002 PMID:39522732	研究论文	研究利用合成生物学工具优化Kluyveromyces marxianus生产香豆酸的过程	通过合成生物学方法，成功构建了能够高效生产香豆酸的Kluyveromyces marxianus菌株，并优化了其代谢途径	工程菌株在生物反应器中面临氧化还原平衡挑战，需要进一步优化以适应工业条件	开发可持续的生物工艺平台，优化酵母生产香豆酸的效率	Kluyveromyces marxianus菌株及其生产香豆酸的代谢途径	NA	NA	合成生物学	NA	NA	NA
823	2024-11-27	Cyanobacteriochromes: A Rainbow of Photoreceptors 2024-Nov, Annual review of microbiology IF:8.5Q1 DOI:10.1146/annurev-micro-041522-094613 PMID:38848579	综述	本文综述了蓝藻光敏色素（CBCR）的谱调谐、光转换和光生物学特性及其在合成生物学中的应用	本文介绍了CBCR在近紫外到近红外范围内的多样性光循环及其在蓝细菌光生物学中的多方面调控作用	NA	探讨蓝藻光敏色素的进化、光转换机制及其在合成生物学中的应用	蓝藻光敏色素（CBCR）及其在光生物学中的作用	生物学	NA	NA	NA	NA	NA
824	2024-11-27	The new biology: a bridge to clinical cardiology 2012-Apr, Hippokratia IF:0.3Q3 PMID:23935264	研究论文	本文探讨了生物学研究的新进展如何促进临床心脏病学的发展	本文介绍了系统生物学、合成生物学和转化医学等新兴学科在临床医学和心脏病学中的应用	NA	探讨生物学新进展在临床心脏病学中的应用	系统生物学、合成生物学和转化医学等新兴学科	生物医学	心血管疾病	NA	NA	NA	NA
825	2024-11-26	[Removal, detection, and limits of endotoxin in the industry of recombinant proteins] 2024-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology DOI:10.13345/j.cjb.240051 PMID:39584330	综述	本文综述了重组蛋白生产过程中内毒素的去除、检测及其限值设定	总结了不同行业中重组蛋白产品的内毒素限值，并强调了无论表达宿主是否为细菌，注射用重组蛋白的最终产品都需要进行内毒素检测	NA	为重组蛋白大规模生产过程中内毒素的研究提供参考	重组蛋白生产过程中的内毒素去除、检测及其限值设定	NA	NA	NA	NA	NA	NA
826	2024-11-26	The de novo design and synthesis of yeast chromosome XIII facilitates investigations on aging 2024-Nov-22, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54130-3 PMID:39578428	研究论文	本文通过设计和合成酵母染色体XIII，研究了其在复制衰老中的作用	成功构建了884 Kb的合成酵母染色体XIII，并利用SCRaMbLE系统获得了具有延长寿命的合成酵母菌株	NA	研究合成酵母染色体在复制衰老中的作用	酵母染色体XIII及其在复制衰老中的作用	合成生物学	NA	SCRaMbLE系统	NA	转录组数据	20株SCRaMbLEd synXIII菌株
827	2024-11-26	Synthetic cooperation in engineered yeast populations 2007-Feb-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.0610575104 PMID:17267602	研究论文	本文展示了通过引入少量遗传修饰，可以在先前无相互作用的细胞群体中实现持久合作	构建了一个名为CoSMO的合成强制合作系统，该系统由一对非交配酵母菌株组成，每株菌株为另一株提供必需代谢物	合作系统中存在未预料到的限制，如饥饿耐受性的不对称性和营养物质释放延迟	展示如何通过遗传工程实现持久合作，并探讨其在农业、污染物处理和医学等领域的潜在应用	非交配酵母菌株及其合作行为	合成生物学	NA	遗传修饰	NA	实验数据	一对非交配酵母菌株
828	2024-11-24	Biosensing strategies using recombinant luminescent proteins and their use for food and environmental analysis 2024-Dec, Analytical and bioanalytical chemistry IF:3.8Q1 DOI:10.1007/s00216-024-05552-x PMID:39325139	综述	本文综述了基于重组发光蛋白（RLPs）的生物传感策略及其在食品和环境分析中的应用	本文介绍了新型融合蛋白和优化表达系统，以提高发光生物传感器的稳定性、亮度和光谱特性	本文未提及具体的实验数据或技术细节	综述基于重组发光蛋白的生物传感技术在食品和环境监测中的最新进展	重组发光蛋白及其在生物传感器中的应用	生物技术	NA	重组发光蛋白	NA	NA	NA
829	2024-11-19	Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology 2024-Nov-16, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019 PMID:39551128	综述	本文综述了甘草属植物的分类、药理学、活性成分生物合成和合成生物学	整合了来自不同领域的知识，提供了一个全面理解甘草属植物的独特视角	NA	提供一个全面的视角，为未来的分子育种和合成生物学研究奠定基础	甘草属植物的分类、活性成分及其药理活性、甘草的组学、活性化合物的生物合成途径和代谢工程	NA	NA	代谢工程	NA	NA	NA
830	2024-11-24	Bottom-up synthetic immunology 2024-Nov, Nature nanotechnology IF:38.1Q1 DOI:10.1038/s41565-024-01744-9 PMID:39187581	研究论文	本文探讨了自下而上的合成免疫学作为治疗和预防传染病及癌症的新兴领域	提出了一种基于纳米技术的自下而上合成免疫学方法，以克服传统基因工程免疫细胞的局限性	目前主要限于体外应用，且受到免疫功能固有的复杂调控机制的限制	探索利用纳米技术进行免疫系统工程化的新方法，以改善预防和治疗策略	传染病和癌症的免疫机制	合成生物学	NA	纳米技术	NA	NA	NA
831	2024-11-24	Rewiring gene circuitry for plant improvement 2024-Aug, Nature genetics IF:31.7Q1 DOI:10.1038/s41588-024-01806-7 PMID:39075207	综述	本文综述了在特定细胞中，随着发育和响应时间的推移，基因调控活动的最新进展及其对植物表型变异的影响	介绍了新的合成生物学工具和基因编辑技术，这些技术允许对转基因进行可调节的时空调控，并能够操纵内源基因的调控	NA	探讨如何通过重新布线基因电路来解决农业、能源和环境中的最大挑战	植物基因调控活动及其对表型的影响	合成生物学	NA	基因编辑技术	NA	NA	NA
832	2024-11-23	Sticky enzymes: increased metabolic efficiency via substrate-dependent enzyme clustering 2024-Nov-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.11.05.622105 PMID:39574612	研究论文	本文探讨了通过底物依赖的酶聚集来提高代谢效率的机制	提出了酶通过相分离自组织成近似最优大小和间隔的集群，并通过数学模型验证了其对代谢通量和毒性代谢物的显著改善	主要基于数学模型研究，缺乏实验验证	研究酶集群在细胞内的最优组织方式及其对代谢效率的影响	酶集群的形成机制及其对代谢通量和毒性代谢物的影响	代谢工程	NA	数学建模	NA	NA	NA
833	2024-11-23	Enzyme cascades for in vitro and in vivo FMN prenylation and UbiD (de)carboxylase activation under aerobic conditions 2024, Methods in enzymology DOI:10.1016/bs.mie.2024.10.015 PMID:39572138	研究论文	本文介绍了在有氧条件下使用酶级联系统进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD（脱）羧酶激活的两种方法	开发了在有氧条件下进行FMN法尼基化和UbiD激活的稳健方法，以促进异源活性UbiD酶的生产	目前对FMN法尼基化和UbiD激活的实验复杂性了解有限，导致重组UbiD酶的活性不足	开发高效的方法进行体外和体内FMN法尼基化和UbiD激活，以促进活性UbiD酶的异源生产	UbiD（脱）羧酶及其辅因子FMN的法尼基化	生物催化	NA	酶级联系统	NA	NA	使用重组大肠杆菌细胞进行实验
834	2024-11-22	Superior Photostability of the Unnatural Base 6-Amino-5-nitropyridin-2-ol: A Case Study Using Ultrafast Broadband Fluorescence, Transient Absorption, and Theoretical Computation 2024-Nov-21, The journal of physical chemistry letters IF:4.8Q1 DOI:10.1021/acs.jpclett.4c02751 PMID:39526600	研究论文	研究了非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇（Z）在不同溶剂中的激发态动力学	首次全面研究了Z的激发态动力学，发现其具有优越的光稳定性	NA	探讨非天然碱基Z的光稳定性及其在生物和环境应用中的潜力	非天然碱基6-氨基-5-硝基吡啶-2-醇（Z）	NA	NA	超快宽带时间分辨荧光光谱和瞬态吸收光谱	NA	光谱数据	NA
835	2024-11-22	Balanced Training Sets Improve Deep Learning-Based Prediction of CRISPR sgRNA Activity 2024-Nov-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00542 PMID:39495623	研究论文	本文研究了使用平衡和不平衡数据集训练卷积神经网络（CNN）和大语言模型（LLM）对CRISPR sgRNA活性的预测效果	通过在训练集中添加合成sgRNA，提高了在不平衡数据集上预测sgRNA活性的准确性	未提及	探讨平衡训练集对深度学习模型预测CRISPR sgRNA活性的影响	CRISPR-Cas12a筛选数据生成的平衡和不平衡数据集	机器学习	NA	CRISPR-Cas12a筛选	卷积神经网络（CNN）和大语言模型（LLM）	文本	未提及具体数量
836	2024-11-22	Reconstructing Early Microbial Life 2024-Nov, Annual review of microbiology IF:8.5Q1 DOI:10.1146/annurev-micro-041522-103400 PMID:39163590	综述	本文综述了早期微生物生命的研究进展，重点介绍了古代代谢途径及其在生物创新重建中的应用	本文整合了微生物学、古生物学和进化合成生物学，形成了一个新兴的跨学科领域，用于重建古代生物创新	将分子遗传学、群体生物学和进化生物学方法应用于前寒武纪生物研究仍然是一个重大挑战	探讨早期微生物生命的进化及其对地球生态系统的影响	早期微生物生命及其代谢途径	NA	NA	NA	NA	NA	NA
837	2024-11-22	Standardization of Fluorescent Reporter Assays in Synthetic Biology across the Visible Light Spectrum 2023-12-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00386 PMID:37981737	研究论文	本文介绍了一种标准化荧光报告基因检测方法，用于合成生物学中可见光谱范围内的荧光报告基因	提出了一个简单且易于访问的校准方法，将设备特定的输出转换为标准化的输出，表达每孔的荧光量作为已知等效荧光染料浓度每细胞	仅限于可见光谱范围内的荧光报告基因	提高不同实验室间板读取器实验结果的可比性和可交换性	荧光报告基因的表达水平	合成生物学	NA	荧光报告基因检测	NA	荧光数据	NA
838	2024-11-22	At-Home, Cell-Free Synthetic Biology Education Modules for Transcriptional Regulation and Environmental Water Quality Monitoring 2023-10-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.3c00223 PMID:37699423	研究论文	开发了四个稳定的无细胞生物传感教育模块，用于转录调控和环境水质监测	开发了无需专业实验室设备的稳定无细胞生物传感教育模块，适用于家庭和课堂使用	仅在K-12教师和高中生中进行了试点测试，需要进一步验证其在大规模教育中的有效性	解决合成生物学领域教育资源不平等的问题，提供易于使用的教育模块	无细胞生物传感教育模块，用于转录调控和环境水质监测	合成生物学	NA	无细胞生物传感技术	NA	NA	130名高中生和K-12教师
839	2024-11-22	Systems Metabolic Engineering of Escherichia coli 2016-05, EcoSal Plus DOI:10.1128/ecosalplus.ESP-0010-2015 PMID:27223822	综述	本文综述了系统代谢工程及其在埃希氏大肠杆菌中的应用	系统代谢工程结合了系统生物学、合成生物学和进化工程，使微生物能够系统性地生产超出其天然能力的化学品	NA	探讨系统代谢工程在埃希氏大肠杆菌中的策略和应用	埃希氏大肠杆菌及其在化学品生产中的应用	合成生物学	NA	系统代谢工程	NA	NA	NA
840	2024-11-21	Effective removal of Pb from industrial wastewater: A new approach to remove Pb from wastewater based on engineered yeast 2024-Nov-14, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.136516 PMID:39561540	研究论文	本文介绍了一种基于工程酵母的新技术，用于从工业废水中去除铅	开发了一种新的操作技术，基于工程酵母的机制理解和响应面优化方法，解决了大规模处理污染物的高操作成本和技术限制问题	NA	解决铅污染问题，降低操作成本，实现工程酵母在工业应用中的规模化	工程酵母、铅污染的工业废水	生物工程	NA	基因敲除、响应面优化	NA	NA	NA