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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2026-01-01 |
Trends in Customizable Single-Cell Protein Production Enabled by Synthetic Biology: Carbon-Negative Biomanufacturing and Engineered Functionalities
2025-Dec-31, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08537
PMID:41330641
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综述 | 本文综述了合成生物学如何推动可定制单细胞蛋白生产的趋势,包括碳负生物制造和工程化功能的发展 | 探讨了从糖类到废物衍生流和C1化合物的底物演变,以及通过合成生物学实现营养定制和感官属性编程的新兴策略 | NA | 分析合成生物学在解决单细胞蛋白生产可持续性、效率和可扩展性挑战中的应用 | 单细胞蛋白生产价值链,包括底物、菌株开发、发酵过程和营养定制 | 合成生物学 | NA | 模型驱动代谢工程、数字精准控制发酵 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 优化蛋白质生物合成的代谢途径 | 农业, 食品 |
| 822 | 2026-01-01 |
Neutral theory of cooperative dynamics
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515423122
PMID:41417606
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研究论文 | 本文提出了一种基于随机中性理论的合作物种模型,探讨了合作互动在生态系统中的作用 | 模型在经典中性理论基础上引入物种间合作复制的假设,揭示了低迁移率下物种丰度分布的双峰模式及核心合作物种的作用 | NA | 研究合作物种的随机中性理论,以理解合作互动对生物多样性和生态系统稳定性的影响 | 合作物种的动力学行为,包括物种丰度分布、多样性和停留时间 | 生态学 | NA | 随机中性理论建模 | 中性理论模型 | 理论模型数据 | NA | NA | NA | NA | 微生物组研究、合成生物学、生命起源 |
| 823 | 2026-01-01 |
Deep learning-based investigation of chloroplast translation regulatory sequences
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1698951
PMID:41459449
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研究论文 | 本研究开发了一种结合CNN、LSTM、Attention和Residual架构的混合深度学习模型,用于分类和分析植物与藻类叶绿体翻译调控序列,特别是5'非翻译区序列及SD基序的存在与否 | 首次应用深度学习模型分析叶绿体翻译调控序列,并提出了在藻类质体工程中引入异源前导序列的两种潜在策略 | 模型性能虽强,但存在一小部分植物和藻类序列表现出跨组模式,可能影响分类准确性 | 研究叶绿体翻译调控序列的架构,以促进合成生物学和基因工程的发展 | 植物和藻类的叶绿体5'非翻译区序列,包括含与不含SD基序的序列 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN, LSTM, Attention, Residual | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 基因工程 |
| 824 | 2026-01-01 |
Macrophage polarization: molecular mechanisms, disease implications, and targeted therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1732718
PMID:41459510
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综述 | 本文综述了巨噬细胞极化的分子机制、在疾病中的作用以及靶向极化的治疗策略 | 超越了传统的M1/M2二分法,强调了极化状态的连续性和动态性,并系统阐述了信号通路、代谢重编程和表观遗传机制之间的互作网络 | 临床转化面临脱靶效应、递送效率低、微环境依赖性等挑战 | 阐明巨噬细胞极化的分子机制及其在疾病中的作用,并探讨靶向极化的治疗策略 | 巨噬细胞(包括组织驻留巨噬细胞和单核细胞来源的巨噬细胞)及其极化状态 | 免疫学 | NA | 单细胞组学、空间转录组学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | 基因编辑 | NA | NA | 医学 |
| 825 | 2025-12-31 |
Molecular engineering and in-silico biotechnological innovations for microbial degradation of persistent pesticides
2026-Feb, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2025.106833
PMID:41461407
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综述 | 本文综述了利用分子工程和生物技术创新促进微生物降解持久性农药的最新进展 | 整合了下一代测序、多组学平台、CRISPR-Cas编辑、合成生物学和AI驱动的代谢工程等多种前沿技术,并强调从实验室到田间应用的转化潜力 | NA | 推动微生物降解持久性农药,实现可持续的农药管理和环境修复 | 持久性农药、降解微生物、相关基因与酶途径 | 合成生物学 | NA | 下一代测序、多组学平台、CRISPR-Cas编辑、合成生物学、AI驱动的代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物 | NA | 环境、农业 |
| 826 | 2025-12-31 |
Protein-Based Nanostructures: Column-free Biosynthesis of Bundlemer Peptides with Programmable, Orthogonally Reactive Handles for Nanomaterial Construction
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17204
PMID:41369150
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研究论文 | 本研究开发了一种基于重组表达的、可编程的束状肽(bundlemer)作为模块化构建单元,用于构建复杂的蛋白质纳米结构 | 通过融合pH可切割的intein-inclusion body实现无痕纯化,并整合SpyTag和sortase识别基序,实现了正交反应性连接和精确组装 | NA | 开发模块化生物合成平台,用于构建具有精确结构和功能的蛋白质纳米材料 | 重组表达的束状肽及其融合构建体 | 合成生物学 | NA | 重组表达、TEM、SEC-MALS、SDS-PAGE、DLS | NA | 蛋白质序列、结构图像 | NA | SpyCatcher-SpyTag连接、sortase介导连接 | NA | 模块化束状肽作为构建单元,通过正交连接化学组装成纤维结构和多层纳米笼结构 | 生物材料工程、靶向药物递送、合成生物学 |
| 827 | 2025-12-31 |
Real-Time Monitoring of Microbial Metabolic Dynamics through a Carbon Dot-Functionalized Whole-Cell Electrochemical Biosensor
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18617
PMID:41395934
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研究论文 | 本研究开发了一种基于碳点功能化全细胞电化学生物传感器的平台,用于实时监测微生物代谢动态 | 通过将碳点工程化微生物与先进循环伏安法相结合,利用量子增强电荷传输机制实现电化学信号近20倍放大,并采用模块化生物架构设计,可跨多种微生物系统无缝适配 | NA | 开发实时监测微生物代谢动态的新型生物传感平台 | 微生物代谢网络及其动态变化 | NA | NA | 碳点工程化、循环伏安法、电化学生物传感 | NA | 电化学信号、代谢物数据 | NA | 碳点功能化、合成生物学 | 微生物(具体种类未指定) | 全细胞生物传感器、模块化生物架构 | 工业生物技术、临床诊断、生物过程优化 |
| 828 | 2025-12-31 |
Light-Controlled Synthetic Communication Networks via Paired Connexon Nanopores
2025-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.11.648033
PMID:40291719
|
研究论文 | 本文通过工程化连接蛋白通道,在基于脂质体的合成细胞间构建了光控正交通信网络 | 首次设计出紫外线与近红外光分别响应的连接蛋白43和32通道,实现了合成细胞间波长依赖的正交信号分子传输 | NA | 模拟生物细胞间通信网络,构建合成细胞间的可控通信系统 | 基于脂质体的合成细胞与工程化连接蛋白通道 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、脂质体组装 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | 光控正交通信网络,包含紫外线响应的连接蛋白43通道和近红外响应的连接蛋白32通道 | 合成生物学基础研究 |
| 829 | 2025-12-30 |
[Progress in engineering design and application of electrogenetic systems]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250322
PMID:41457542
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综述 | 本文综述了电遗传系统的组成、优势、发展历程、关键响应调控元件及其应用,并展望了该技术在合成生物学中的前景 | 整合电子设备与遗传方法控制基因表达,是合成生物学的新兴交叉领域,具有广泛的应用潜力 | 当前电遗传学存在不足,未来需进一步研究以推动进展 | 总结电遗传系统的发展与应用,为相关研究者提供参考,促进合成生物学中电遗传学研究的进步 | 电遗传系统及其关键响应调控元件(如代谢物转录因子、氧化应激转录因子、哺乳动物核因子) | 合成生物学 | NA | 电遗传技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于代谢物转录因子、氧化应激转录因子、哺乳动物核因子等的电遗传调控系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 830 | 2025-12-30 |
[Research progress in applications of iron-based materials in microbial energy conversion]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250524
PMID:41457541
|
综述 | 本文系统综述了铁基材料在微生物能源转换技术中的应用研究进展,并分析了其促进转换的关键机制 | 系统总结了铁基材料在多种微生物能源转换技术中的应用,并深入分析了其促进转换的机制,为高效耦合系统的构建提供理论支持 | NA | 为高效铁基材料-微生物耦合系统的构建、优化及实际应用提供理论支持和技术参考 | 铁基材料在微生物能源转换技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 酶工程 | 微生物 | NA | 能源 |
| 831 | 2025-12-30 |
[Recent advances in the application of synthetic biotechnology in production of 5-aminolevulinic acid]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250395
PMID:41457543
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综述 | 本文综述了利用合成生物技术高效生产5-氨基乙酰丙酸的最新进展,包括代谢途径优化、关键酶工程和发酵工艺优化等策略 | 通过重构天然C4和C5途径、开发非天然合成路线,实现了对5-ALA前体代谢通量的精确调控,并结合关键酶的定向进化与理性设计显著提高了催化效率 | 5-ALA的亲脂性弱、稳定性低和生物利用度差等问题降低了其应用效率,如何提高其稳定性和亲脂性是未来需要解决的关键问题 | 构建高效的微生物细胞工厂,实现5-氨基乙酰丙酸的绿色高效工业化生产 | 5-氨基乙酰丙酸 | NA | NA | 代谢途径优化、关键酶工程、发酵工艺优化、定向进化、理性设计 | NA | NA | NA | 合成生物技术 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒状杆菌 | 重构天然C4和C5代谢途径、开发非天然合成路线 | 生物医学, 农业, 食品工业 |
| 832 | 2025-12-30 |
[Engineering Rhodotorula toruloides based on exogenous targeting signal peptides]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250498
PMID:41457588
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研究论文 | 本研究通过外源靶向信号肽工程化改造红酵母Rhodotorula toruloides,验证了其细胞器靶向性能并应用于烷烃合成 | 首次在R. toruloides中系统验证了三种细胞器靶向信号肽的功能,并成功应用于脂肪酸光脱羧酶的区室化表达 | 仅测试了三种外源信号肽,对R. toruloides内源信号肽的研究仍有限 | 开发R. toruloides的合成生物学工具并拓展其细胞区室化工程应用 | 红酵母Rhodotorula toruloides及其细胞器靶向系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、荧光蛋白标记、发酵工程 | NA | 荧光成像数据、代谢产物检测数据 | NA | 信号肽融合技术 | Rhodotorula toruloides | 细胞器靶向表达系统(内质网、线粒体、过氧化物酶体) | 工业生物技术、能源 |
| 833 | 2025-12-30 |
[Plant synthetic biology technologies and natural product biosynthesis]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250445
PMID:41457591
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综述 | 本文综述了植物合成生物学的基础研究现状、主要应用方向,特别是在合成启动子、精准基因组编辑和可编程基因回路方面的进展,并探讨了其在天然产物生物合成中的潜力 | 重点介绍了植物合成生物学在合成启动子、精准基因组编辑技术和可编程基因回路设计方面的最新进展,以及其在天然产物生物合成中的变革潜力 | 文章批判性地审视了该领域当前面临的挑战,但未具体说明这些挑战的细节或解决方案 | 旨在概述植物合成生物学的基础研究现状、应用方向,并探讨其在天然产物生物合成中的潜力 | 植物合成生物学技术,包括遗传元件、调控组件和代谢途径的模块化组装 | 合成生物学 | NA | 精准基因组编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 高等植物 | 可编程基因回路,如逻辑门、生物传感器或代谢途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 834 | 2025-12-30 |
[Advances in metabolic engineering of common yeast species]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250522
PMID:41457589
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综述 | 本文综述了常见酵母物种的生理特性、作为生物合成底盘细胞的优缺点、当前应用,以及代谢工程策略的最新研究进展,并展望了未来研究方向 | 通过比较多种常见酵母物种,并总结最新的代谢工程策略,为下一代酵母底盘细胞的开发和工程应用提供指导 | NA | 探讨酵母代谢工程的最新进展和未来方向 | 常见酵母物种及其作为微生物底盘细胞的应用 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母, 毕赤酵母, 裂殖酵母 | 复杂代谢途径设计、全面代谢重布线 | 能源, 材料, 化学品, 工业生物技术 |
| 835 | 2025-12-30 |
[Microfluidics-driven synthetic biology and biomanufacturing: research progress in methods and applications and future perspectives]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250444
PMID:41457587
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综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学和生物制造中的应用,包括其在设计-构建-测试-学习循环中的作用以及在上游菌株培养改进和下游处理集成优化中的角色 | 探讨微流控技术如何通过单细胞精度、高通量筛选和快速迭代解决合成生物学和生物制造中的挑战,并分析其作为赋能技术、跨学科整合和AI驱动智能系统的未来方向 | 微流控技术在合成生物学和生物制造中面临微尺度放大和芯片材料等瓶颈 | 综述微流控技术在合成生物学和生物制造中的研究进展、应用案例及未来展望 | 微流控技术、合成生物学和生物制造 | NA | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 能源, 农业, 环境保护, 化学品与材料, 农业食品 |
| 836 | 2025-12-30 |
[DNA modification by sulfur: mechanistic insights drives synthetic biotechnologies forward]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250474
PMID:41457586
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综述 | 本文综述了DNA硫修饰的发现、机制及其在合成生物技术中的应用 | 首次聚焦于DNA硫修饰(磷硫酰化)作为天然修饰的突破性发现,并探讨其在基因编辑和工业菌株开发中的新兴应用 | NA | 阐明DNA硫修饰的分子机制及其在合成生物学中的技术应用 | DNA硫修饰(磷硫酰化)及其相关细菌防御系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 837 | 2025-12-30 |
[Application of synthetic biology in contamination remediation of the petrochemical industry]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250581
PMID:41457606
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综述 | 本文综述了合成生物学在石化工业污染修复中的应用,重点介绍了生物传感器、工程降解菌株和合成微生物群落的研究进展 | 系统总结了合成生物学在石化污染修复领域的最新进展,并针对工程微生物应用中的问题提出了可能的解决方案 | NA | 开发新的生物修复技术以提高石化污染物的降解效果 | 石化污染物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 生物传感器、降解途径、合成微生物群落 | 环境 |
| 838 | 2025-12-30 |
[Generation of antibody diversity in mammals: mechanisms and synthetic biology applications]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250475
PMID:41457603
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综述 | 本文综述了哺乳动物中抗体多样性的生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组,并探讨了相关酶在合成生物学中的应用进展 | 强调了TdT、胞苷脱氨酶和DNA糖基化酶等关键酶在合成生物学中的最新应用进展,为生物技术和医学研究提供了新方向 | NA | 总结哺乳动物抗原受体多样化的分子机制,并探讨抗体筛选、应用及相关酶在合成生物学中的进展 | 免疫球蛋白(抗体)及其多样性生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 重组激活基因蛋白、末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)、激活诱导胞苷脱氨酶、DNA糖基化酶 | 哺乳动物 | NA | 医学, 生物技术 |
| 839 | 2025-12-30 |
[Applications of protein structure determination in synthetic biology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250437
PMID:41457622
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综述 | 本文综述了蛋白质结构测定技术在合成生物学中的应用,包括蛋白质工程、代谢途径优化、生物传感器设计和人工生物系统构建 | 总结了冷冻电镜、X射线晶体学和基于人工智能的预测方法等最新技术突破在合成生物学中的应用进展 | NA | 为合成生物学相关研究领域提供理论参考和技术视角 | 蛋白质结构测定技术及其在合成生物学中的应用 | NA | NA | 冷冻电镜、X射线晶体学、人工智能预测方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 840 | 2025-12-29 |
Enzyme-driven triplex structure-based DNA logic circuits
2025-Dec-24, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03853-6
PMID:41444625
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研究论文 | 本研究提出了一种基于三链体结构的酶驱动DNA逻辑电路,通过简化链设计和减少信号泄漏,实现了高效、可扩展的生物计算 | 引入了输入-门级联形成三链体结构的设计,显著降低了链复杂度,并利用Bst 3.0聚合酶实现了低泄漏、高速率的运算 | 未明确讨论长期稳定性、体内应用可行性或与其他生物系统的兼容性 | 开发高性能、低泄漏的DNA逻辑电路以推动生物计算发展 | 基于三链体结构的酶驱动DNA逻辑电路 | 合成生物学 | NA | DNA逻辑电路设计、酶驱动反应 | NA | NA | NA | Bst 3.0聚合酶 | NA | 基于三链体结构的逻辑门、多级级联电路(二级/三级)、复杂逻辑电路、大规模平方根运算电路 | 生物传感、数据存储、合成生物学 |