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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2025-10-05 |
Engineering bi-directional chemically-modulated synthetic condensates for cellular control
2025-Jul-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61877-w
PMID:40675979
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研究论文 | 开发了一种名为ARDrop的化学遗传平台,通过工程化雄激素受体及其药物实现生物分子凝聚物的可逆调控 | 首次利用雄激素受体和临床药物构建了能够双向化学调控合成凝聚物的平台,实现了凝聚物的形成与溶解的可逆控制 | 未明确说明该平台在所有蛋白质类型中的普适性及长期稳定性的具体数据 | 开发精确操控相分离凝聚物的工具,为合成生物学应用设计工程化凝聚物 | 雄激素受体(AR)及其配体药物,多种蛋白质的相分离行为 | 合成生物学 | NA | 理性工程方法,化学遗传平台 | NA | NA | NA | ARDrop平台 | 哺乳动物细胞 | 双向化学调控合成凝聚物系统,具有稳定液体样性质的相分离模块 | 医学, 合成生物学 |
| 842 | 2025-10-05 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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研究论文 | 本研究应用迭代深度学习设计具有细胞类型特异性的人类合成增强子 | 采用迭代深度学习策略设计合成增强子,在两种人类细胞系中实现强差异活性,并通过单细胞水平验证增强子活性与转录因子表达的相关性 | NA | 解决合成生物学中如何实现细胞类型特异性基因表达靶向的重要问题 | 人类合成增强子序列 | 机器学习 | NA | 深度学习,染色质可及性分析,转录因子结合位点分析,扰动实验 | 深度学习模型 | 基因组序列数据,增强子活性测量数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 人类细胞系 | 合成增强子设计,具有细胞类型特异性调控功能 | 医学,合成生物学 |
| 843 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Jul, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
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综述 | 介绍合成生物学纳米医学的基本概念及其与传统和仿生纳米医学的区别,综述合成生物学在纳米医学中的应用进展 | 提出合成生物学纳米医学新概念,采用基因工程策略设计纳米药物,融合自上而下和自下而上两种策略 | NA | 探讨合成生物学与纳米医学的融合及其在疾病诊断和治疗中的应用潜力 | 合成生物学纳米药物 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 844 | 2025-10-05 |
Living Biotherapeutics Using Nanoparticles-Armed Cyanobacteria for Boosting Photodynamic-Immunotherapy of Cancer
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502746
PMID:40344505
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研究论文 | 开发了一种结合蓝细菌与纳米颗粒的活体生物治疗平台,用于增强癌症的光动力免疫治疗 | 首次将自供氧蓝细菌与多功能前药纳米颗粒结合,创建能够自供应纳米颗粒和氧气的活体纳米治疗剂 | NA | 开发新型癌症光动力免疫治疗平台 | 癌症治疗中的光动力免疫疗法 | 合成生物学与纳米医学 | 癌症 | 共价自组装策略、静电吸附、660nm激光照射 | NA | NA | NA | NA | 蓝细菌 | 自供氧系统与药物递送系统 | 医学 |
| 845 | 2025-10-05 |
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.03.003
PMID:40168989
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综述 | 介绍利用高通量突变筛选技术理解、抑制和工程化膜转运蛋白的方法与潜力 | 提出将高通量筛选方法系统应用于研究多特异性转运蛋白,并探讨其在抑制剂设计和合成生物学中的应用前景 | NA | 阐明多特异性膜转运蛋白的功能机制并开发其工程化应用 | 多特异性膜转运蛋白 | 合成生物学 | NA | 高通量突变筛选 | NA | 遗传筛选数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 生物技术 |
| 846 | 2025-10-05 |
Functional Modification of Cyanobacterial Phycobiliprotein and Phycobilisomes through Bilin Metabolism Control
2024-08-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00094
PMID:39038807
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研究论文 | 通过调控藻胆素代谢对蓝藻藻胆蛋白和藻胆体进行功能改造 | 构建了具有精细调控PEB生物合成能力的新型蓝藻菌株PEB1,首次实现可逆的PCB-to-PEB替换并形成稳定的嵌合藻胆体复合物 | 未详细评估工程菌株在自然环境中长期遗传稳定性 | 研究藻胆体在光适应中的结构功能关系及其在合成生物学中的应用 | 淡水蓝藻PCC 7942及其工程改造菌株PEB1 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白表达调控 | NA | 光谱数据、蛋白复合物分析 | 工程菌株PEB1及其对照 | 异源基因表达 | 蓝藻 | PEB生物合成通路(PebA和PebB酶的可控表达) | 可再生能源, 生物工程 |
| 847 | 2025-10-05 |
Leveraging yeast sequestration to study and engineer posttranslational modification enzymes
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28621
PMID:38079116
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母细胞区室化技术研究和工程化翻译后修饰酶的方法 | 首次详细讨论了酵母内质网区室化技术,并系统比较了不同酵母区室化系统的特点 | 不同系统在测量和控制酶催化效率方面存在各自的局限性 | 开发高通量功能筛选方法以研究和改造翻译后修饰酶 | 翻译后修饰酶(蛋白酶、蛋白连接酶、氧化还原酶、激酶等转移酶) | 合成生物学 | NA | 酵母表面展示、酶介导的转录激活、细胞器区室化 | NA | NA | NA | 酵母表面展示 | 酿酒酵母 | 酶介导的转录激活系统 | 化学生物学, 合成生物学, 生物医学 |
| 848 | 2025-10-05 |
Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in Escherichia coli
2024-03, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28628
PMID:38116710
|
研究论文 | 利用蓝光响应EL222和绿/红光响应CcaSR在大肠杆菌中通过多色光调控三种糖酵解途径的代谢通量比例 | 首次实现通过多色光调控三种糖酵解途径(EMP、PP和ED)的代谢通量比例 | NA | 开发合成生物学工具以精确控制代谢通量分布 | 大肠杆菌中的糖酵解途径 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | 代谢通量数据 | NA | EL222, CcaSR | 大肠杆菌 | 光控基因表达系统,包括在启动子区域插入识别序列来调控gnd和edd基因表达 | 工业生物技术 |
| 849 | 2025-10-05 |
Synthetic Immunotherapy: Programming Immune Cells with Novel and Sophisticated Logic Capabilities
2022-09, Transplantation and cellular therapy
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.jtct.2022.06.001
PMID:35691572
|
综述 | 本文回顾了CAR-T细胞的现有逻辑功能及其局限性,并探讨了合成生物学工具如何推动合成免疫疗法这一新领域的发展 | 提出“合成免疫疗法”新概念,通过合成生物学技术为免疫细胞编程复杂逻辑功能 | 当前获批的CAR-T细胞仅具备简单逻辑功能,存在对正常组织的毒性和细胞因子毒性等问题 | 探讨如何通过合成生物学改进CAR-T细胞疗法,实现更精准的癌症免疫治疗 | 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)及其合成生物学改造 | 合成生物学 | 癌症 | 细胞免疫疗法、合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN | T细胞 | 模块化受体、可定制传感器、布尔逻辑门、多抗原识别系统 | 医学 |
| 850 | 2025-10-05 |
Codes across (life)sciences
2025-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
|
综述 | 本文探讨了“代码”概念在不同科学领域的含义、形式化及其在生命科学中的核心作用 | 跨学科视角整合数学、计算机科学到心理文化领域的代码研究,提出基于代码的统一生命理论框架 | 代码概念在不同学科中存在形式化程度差异,部分定义仍显模糊 | 构建跨学科代码研究的整体框架,探索生命系统中代码的通用理论 | 从细胞过程到文化实践的各类生物和社会系统中的代码现象 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 跨学科科学、合成生物学、人工智能 |
| 851 | 2025-10-05 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
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综述 | 本文系统评述了工程化蛋白质支架在癌症免疫治疗中的双重应用:治疗递送和肿瘤微环境分子成像 | 开发能够同时解决肿瘤穿透性不足和提供实时监测能力的多功能蛋白质支架平台 | 在将这些有前景的平台转化为临床应用方面仍面临持续挑战 | 开发用于癌症免疫治疗的多功能蛋白质支架平台 | 工程化蛋白质支架及其在肿瘤微环境中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | 生成模型、强化学习 | 结构生物学数据、计算模型数据 | NA | 理性工程设计 | 重组表达系统 | 多功能蛋白质支架设计 | 医学 |
| 852 | 2025-10-05 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
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综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶的分子工程和生物技术进展及其工业应用 | 系统总结了多种酶工程策略(包括异源表达、CRISPR-Cas9、组学方法和纳米固定化)在提升β-葡萄糖苷酶性能方面的创新应用 | 未明确说明现有策略在工业放大过程中的具体实施障碍和成本效益分析 | 改善β-葡萄糖苷酶的催化效率、热稳定性和葡萄糖耐受性以促进生物转化过程的工业应用 | β-葡萄糖苷酶及其工程化改造 | 工业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 黑曲霉 | 使用里氏木霉Pcdna1启动子进行异源表达 | 能源, 食品, 医药 |
| 853 | 2025-10-05 |
Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253
PMID:40517854
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研究论文 | 本研究在全基因组水平鉴定了蛇根草中与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶,并验证了三个Op10HGOs的酶活性 | 首次在蛇根草中全基因组鉴定15个10HGOs,并证实Op10HGO2和Op10HGO3在喜树碱生物合成中的关键作用 | 仅对三个Op10HGOs进行了酶活性验证,其他12个10HGOs的功能尚未明确 | 鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因,为异源重建生物合成途径提供基因元件 | 蛇根草(Ophiorrhiza pumila)中的10-羟基香叶醇氧化还原酶 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组学分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因组数据、酶学数据 | 15个10HGOs基因,其中3个进行详细功能验证 | 转基因技术 | 蛇根草 | 喜树碱生物合成途径 | 医药 |
| 854 | 2025-10-05 |
Ultra-high throughput mapping of genetic design space
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532704
PMID:36993481
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研究论文 | 介绍了一种名为CLASSIC的基因筛选平台,能够高通量评估任意长度的基因构建体并揭示基因部件组合规则 | 结合长短读长NGS测序技术,首次实现了对多kb长度基因电路设计的高通量定量评估 | NA | 加速合成生物学发展,通过筛选多样化基因电路设计并学习'组成-功能'映射关系 | 基因电路设计和遗传部件组合 | 合成生物学 | NA | 下一代测序(NGS),长短读长测序技术 | 机器学习模型 | 基因序列数据,表达谱数据 | 单次实验可测量超过10^5个基因电路设计 | NA | 人类细胞 | 5-20 kb长度的多样化基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 855 | 2025-10-05 |
Xenotopic synthetic biology: Prospective tools for delaying aging and age-related diseases
2025-Mar-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu1710
PMID:40153513
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综述 | 本文探讨利用非哺乳动物酶类作为延缓衰老和年龄相关疾病的潜在工具 | 提出利用异源物种酶类逆转年龄相关代谢变化的新策略,而非直接靶向自身基因 | NA | 探索通过代谢调控延缓衰老和年龄相关疾病的替代策略 | 来自低等生物的影响年龄相关代谢过程的酶类 | 合成生物学 | 老年疾病 | 酶工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 856 | 2025-10-05 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文探讨调节性T细胞的生物学特性及其在疾病治疗中的应用前景 | 结合纳米医学和合成生物学技术开发新一代T细胞精准调控疗法 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解问题 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的临床应用策略 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 857 | 2025-10-05 |
Architectural engineering of Cyborg Bacteria with intracellular hydrogel
2024-Oct, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2024.101226
PMID:39328785
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研究论文 | 本研究通过调控不同结构的水凝胶实现半机械细菌的物理和生化特性控制 | 首次展示了通过调控细胞内水凝胶组分(不同光引发剂、分子量PEG-DA、4臂PEG-DA和dsDNA-PEG)来调控半机械细菌功能与结构的新策略 | NA | 探索通过细胞内材料工程控制半机械细菌功能的新方法 | 半机械细菌(Cyborg Bacteria) | 合成生物学 | NA | 细胞内水凝胶工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 细胞内PEG基水凝胶架构 | 工业生物技术 |
| 858 | 2025-10-05 |
Molecular Engineering of Functional SiRNA Agents
2024-06-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00181
PMID:38733599
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研究论文 | 开发了一种通过细菌发酵高产率大规模生产功能性siRNA药物的创新生物工程平台 | 采用新型tRNA融合pre-miRNA载体在活宿主细胞内生产多种形式的BioRNA/siRNA药物,实现100%成功率的九种目标分子高水平过表达 | NA | 推进合成生物学领域,为研究和药物开发提供新型功能性siRNA药物生物工程平台 | 小干扰RNA(siRNA)药物 | 合成生物学 | NA | 细菌发酵,分子工程 | NA | NA | 九种目标BioRNA/siRNA分子,每0.25升细菌培养物产量3-10毫克 | NA | 细菌 | tRNA融合pre-miRNA载体系统 | 医学,药物开发 |
| 859 | 2025-10-05 |
Emerging Coumestans in Cancer Therapy With Mechanistic Insights and Clinical Potential
2025-Jul, Archiv der Pharmazie
IF:4.3Q1
DOI:10.1002/ardp.70058
PMID:40685808
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综述 | 本文全面综述了香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的抗癌机制及临床潜力 | 系统阐述香豆雌酚衍生物通过调控多条信号通路抑制癌症的机制,并提出结合合成生物学、生物信息学和人工智能提升疗效的新方法 | 香豆雌酚类化合物存在生物利用度低、水溶性差、代谢快等临床应用挑战 | 探讨香豆雌酚类化合物在癌症治疗中的机制及临床转化潜力 | 香豆雌酚、蟛蜞菊内酯、异秦皮啶和补骨脂定等香豆雌酚衍生物 | NA | 乳腺癌,卵巢癌,前列腺癌 | 合成生物学,生物信息学,人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 860 | 2025-10-05 |
Quencher-Free Fluorescence Monitoring of G-Quadruplex Folding
2025-Jan-28, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10720
PMID:39895733
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研究论文 | 开发了一种无需淬灭剂的单染料标记方法用于监测G-四链体DNA的折叠与解折叠过程 | 首次实现了仅使用单染料标记(无需淬灭剂)的FRET类似格式来监测G-四链体结构转变 | NA | 开发低成本高通量监测G-四链体结构折叠转变的技术 | G-四链体形成DNA序列 | 合成生物学 | NA | 荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | NA | NA | G-四链体结构 | 合成生物学 |