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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-04-06 |
Recent Progress in Sequence Optimization of mRNA Vaccine: Biological Mechanism, Quantitative Metrics, and Computational Model
2026, Bioinformatics and biology insights
IF:2.3Q3
DOI:10.1177/11779322261431255
PMID:41883679
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综述 | 本文深入分析了mRNA疫苗序列优化的最新进展,综述了该领域的最新计算和生物学方法,并提出了当前模型的局限性 | 综合探讨mRNA疫苗序列优化的生物机制、定量指标和计算模型,为有效mRNA疫苗设计提供新见解 | 当前模型难以应对生物系统的复杂性,需要进一步研究以优化不同生物背景和治疗应用中的mRNA序列 | 优化mRNA疫苗序列以提升其效力、稳定性和免疫原性 | mRNA疫苗序列 | 合成生物学与计算生物学 | 传染病 | 合成生物学方法和计算模型 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 842 | 2026-04-06 |
Immunometabolic Circuits in Infection for Advancing Host Directed Therapies
2024-09-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66980
PMID:39345111
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研究论文 | 本研究开发了一种基于四环素诱导(TetON)的合成生物学回路,用于递送琥珀酸脱氢酶以消除细胞内利什曼原虫 | 首次将合成生物学回路设计与聚复合物纳米颗粒递送系统结合,靶向宿主免疫代谢通路治疗利什曼病 | 研究仅在鼠巨噬细胞系中进行验证,尚未开展体内动物模型实验 | 开发靶向宿主免疫代谢通路的合成生物学疗法以消除细胞内利什曼原虫 | 利什曼原虫感染的鼠巨噬细胞系 | 合成生物学 | 利什曼病 | 合成生物学回路设计、聚复合物纳米颗粒递送、四环素诱导系统 | TetON诱导表达系统 | 细胞实验数据、细胞因子表达数据 | 鼠巨噬细胞系(具体数量未明确说明) | TetON系统、质粒载体构建 | 鼠巨噬细胞系 | 四环素诱导的合成生物学回路,用于表达琥珀酸脱氢酶作为治疗剂 | 医学 |
| 843 | 2026-04-05 |
Artificial intelligence revolutionizes cellular metabolic pathway reconstruction
2026-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2026.01.003
PMID:41850996
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综述 | 本文提出了一个整合逆合成规划与生物学约束的概念框架,以改进细胞代谢途径重建的生物可行性 | 将逆合成规划与生物学约束相结合,并利用大语言模型驱动代谢网络的理解、设计、评估与优化 | NA | 改进合成生物学中细胞代谢途径的重建方法 | 细胞代谢网络 | 合成生物学 | NA | 逆合成规划,大语言模型 | 大语言模型 | NA | NA | NA | NA | 代谢网络 | 工业生物技术 |
| 844 | 2026-04-05 |
Frontiers in polysaccharide biosynthesis: Decoding the catalytic logic of enzymes for future applications
2026-Mar-27, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2026.109907
PMID:41931921
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综述 | 本文系统分析了不同生物来源中天然多糖生物合成的分子机制,并综述了利用合成生物学策略重建和优化这些天然网络的最新进展 | 聚焦于从底物前体激活、糖链聚合到组装后修饰的完整过程,并探讨了人工智能和系统生物学等新兴技术在该领域的整合应用前景 | NA | 理解多糖的生物合成机制,并为未来在工程化系统中可控生产结构明确的多糖提供理论基础 | 动物、植物和微生物中的多糖生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 845 | 2026-04-05 |
In vivo self-assembled SOD1-siRNAs mitigate muscle atrophy and denervation in amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf291
PMID:40795306
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过重编程肝脏作为组织底盘,在体内自组装封装SOD1-siRNA的小细胞外囊泡,以靶向脊髓神经元并特异性沉默突变SOD1,从而缓解肌萎缩侧索硬化症小鼠模型的肌肉萎缩和去神经支配 | 提出了一种创新的合成生物学策略,利用肝脏作为组织底盘在体内自组装靶向性小细胞外囊泡,实现了突变SOD1基因的特异性沉默,并设计了基于AAV的长期自组装系统 | 研究仅在Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证;长期安全性和潜在免疫原性未充分评估 | 开发针对肌萎缩侧索硬化症(ALS)的新型基因沉默治疗策略 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠模型(模拟家族性ALS) | 合成生物学 | 肌萎缩侧索硬化症 | siRNA基因沉默技术、小细胞外囊泡递送系统、AAV载体技术 | NA | 动物实验数据、蛋白质水平检测、行为学评估 | Tg(SOD1G93A)转基因小鼠(具体数量未在摘要中说明) | AAV(腺相关病毒)载体 | 小鼠(肝脏细胞) | CMV启动子驱动的合成构建体,编码SOD1-siRNA及sEV表面RVG靶向标签,形成靶向性基因沉默递送系统 | 医学(神经退行性疾病治疗) |
| 846 | 2026-04-05 |
Engineering water exchange is a safe and effective method for magnetic resonance imaging in diverse cell types
2024-Apr-22, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-024-00424-5
PMID:38649904
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研究论文 | 本研究证明水通道蛋白Aqp1可作为安全的遗传报告基因,在不同细胞类型中产生强磁共振信号且不影响细胞生理功能 | 首次系统证明Aqp1过表达不会引起内质网应激,且不影响多种细胞固有生物学功能,解决了其作为深层组织报告基因的安全性质疑 | 研究主要基于体外细胞系实验,尚未在完整生物体内验证长期安全性 | 评估Aqp1作为遗传编码磁共振报告基因的安全性和有效性 | 小鼠和人类来源的多种细胞系 | 合成生物学 | NA | 磁共振成像 | NA | 影像数据 | 多种小鼠和人类细胞系 | 遗传编码 | 哺乳动物细胞 | 水通道蛋白生物传感器 | 医学 |
| 847 | 2026-04-04 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
|
研究论文 | 本文探讨了利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食物的技术路径 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂,用于精密发酵,超越单一细胞蛋白生产,并以重组乳蛋白分泌为案例研究 | NA | 开发可持续、独立于农业的食物生产方式,实现碳中和与碳捕获 | 氢氧化细菌(HOBs) | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢工程 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计,用于精密发酵与重组蛋白分泌 | 食品、工业生物技术 |
| 848 | 2026-04-04 |
Are amyloid-based materials conducive to tissue engineering?
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.009
PMID:40975651
|
综述 | 本文综述了基于淀粉样蛋白的生物材料在组织工程中的应用潜力,包括其作为细胞培养支架、伤口愈合和类器官开发的材料 | 强调了淀粉样蛋白的独特性质(如稳定性、机械强度和结构多样性)与结构及合成生物学进展的结合,使其成为创新生物材料的有前景候选者 | NA | 探讨淀粉样蛋白基材料在组织工程中的适用性和应用前景 | 淀粉样蛋白原纤维及其作为生物材料的特性 | NA | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 849 | 2026-04-04 |
Fighting citrus Huanglongbing with evolutionary principles
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.004
PMID:41330792
|
综述 | 本文综述了基于进化原理的害虫管理策略,并结合人工智能和合成生物学技术,以柑橘黄龙病为例,探讨了可持续农业解决方案 | 提出了进化信息害虫管理(EIPM)框架,将进化原理与人工智能、合成生物学相结合,用于设计持久的生物防治工具 | NA | 开发可持续的农业害虫管理策略,特别是针对柑橘黄龙病 | 柑橘黄龙病(HLB)及其防治 | 农业生物技术 | 柑橘黄龙病 | 人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 850 | 2026-04-04 |
Discovery, characterization, and application of chromosomal integration sites in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus islandicus
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.003
PMID:41330849
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研究论文 | 本研究系统性地鉴定并表征了嗜热古菌Sulfolobus islandicus中的染色体整合位点,并利用CRISPR-Cas系统实现了外源基因的整合与表达 | 首次系统性地鉴定并表征了S. islandicus中的8个染色体整合位点,利用CRISPR-COPIES流程和多组学计算工作流程开发了13个人工CRISPR RNAs,并利用内源性CRISPR-Cas系统实现了基因整合 | 研究中发现整合位点存在显著的位置效应,可能影响外源基因的表达效率 | 扩展S. islandicus的遗传工具,推动其作为古菌合成生物学和工业生物技术平台的潜力 | 嗜热古菌Sulfolobus islandicus | 合成生物学 | NA | CRISPR-COPIES流程、多组学计算工作流程、β-半乳糖苷酶测定 | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas | Sulfolobus islandicus | 基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 851 | 2026-04-04 |
Techno-economic assessment-guided biofoundry for microbial strain development
2026-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.002
PMID:41330850
|
研究论文 | 本文提出了一种基于实验价格指数(EPI)和机器人辅助模块(RAM)的标准化方法,用于评估和优化生物铸造厂中的自动化工作流程,以提高微生物菌株开发的经济效率 | 引入了实验价格指数(EPI)作为结合时间和成本的标准化指标来量化自动化工作流程效率,并提出了机器人辅助模块(RAM)作为即插即用单元来构建工作流程 | 未明确说明该方法在不同类型生物技术应用中的普适性验证程度,也未详细讨论实际部署中可能遇到的技术或操作挑战 | 开发一种标准化方法来评估和优化生物铸造厂中自动化工作流程的经济效率,以加速微生物菌株开发 | 生物铸造厂中的自动化工作流程,特别是用于微生物菌株开发的四个工作流程:gRNA克隆、基因组编辑、DNA组装和样品分析 | 合成生物学 | NA | 设计-构建-测试-学习(DBTL)工作流程、机器人辅助自动化 | NA | 实验时间和成本数据 | NA | CRISPR-Cas9(用于基因组编辑)、DNA组装技术 | 微生物(具体种类未指定) | NA | 工业生物技术 |
| 852 | 2026-04-04 |
Molecular approaches to increasing plant root carbon
2026-Apr, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.006
PMID:41353042
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综述 | 本文综述了通过分子途径和合成生物学方法增加植物根系碳储存以应对温室气体问题的策略 | 探讨利用合成生物学工程化作物根系以增强地下碳储存的创新分子途径 | 增加根系碳分配可能面临产量降低的挑战,且根系碳储存效果需进一步测试验证 | 研究如何通过分子和合成生物学方法提高植物根系碳含量,以促进碳封存 | 植物根系,特别是作物植物 | 合成生物学 | NA | 分子途径工程,合成生物学方法 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 作物植物 | NA | 环境,农业 |
| 853 | 2026-04-04 |
A reversible small-molecule-switchable self-amplifying RNA expression platform
2026-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.151436
PMID:41839281
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研究论文 | 本研究开发了一种可逆的小分子开关自扩增RNA表达平台,用于精确调控基因表达 | 首次将自扩增RNA设计为可编程基因电路,实现小分子控制的基因表达开关,并整合多重调控模块实现独立可逆调控 | NA | 开发可控的RNA治疗和合成生物学应用平台 | 自扩增RNA构建体及其在基因表达调控中的应用 | 合成生物学 | NA | RNA工程、脂质纳米颗粒封装 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 哺乳动物细胞 | 可编程RNA基因电路,包含多重调控模块如去稳定化结构域、RNA结合蛋白、四环素响应阻遏蛋白和k-turn RNA基序 | 医学 |
| 854 | 2026-04-04 |
Structures of pentatricopeptide repeat proteins
2026-Apr-01, Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications
DOI:10.1107/S2053230X26002311
PMID:41919993
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综述 | 本文系统综述了已解析的pentatricopeptide repeat (PPR)蛋白晶体结构,分析了其结晶学特性、结构特征及其对理解PPR功能的作用 | 首次对PPR蛋白的所有晶体结构进行全面编目和综合分析,揭示了PPR识别密码、RNA结合时的构象变化以及模块化结构基础 | NA | 系统整理和分析PPR蛋白的晶体结构数据,以促进对其结构和功能的理解 | PPR蛋白的晶体结构(包括天然和设计蛋白) | 结构生物学 | NA | 晶体学、冷冻电镜 | NA | 结构数据 | 113个PPR蛋白结构(30个PPR和83个核糖体PPR结构) | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 855 | 2026-04-04 |
Bioactive Peptides: Production Strategies, Biological Activities, and Emerging Therapeutic Applications
2026-Mar-26, Protein and peptide letters
IF:1.0Q4
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综述 | 本文综述了生物活性肽的生产策略、生物活性及其新兴治疗应用,并整合了分子、生物技术和信息学驱动的视角 | 独特整合了当前分子、生物技术和信息学驱动的视角,提供了2024-2025年在生产策略、生物测定优化和治疗转化方面的最新进展综述 | 存在纯化困难、稳定性问题和生物利用度限制等挑战,限制了其广泛应用 | 探讨生物活性肽的生产策略、生物活性及其在疾病预防和治疗中的应用潜力 | 源自动物、植物和海洋生物等天然来源的短链氨基酸(生物活性肽) | NA | NA | 酶水解、微生物发酵、化学合成、重组方法、超滤、色谱、质谱、电泳 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 食品, 农业 |
| 856 | 2026-04-04 |
Advancing Africa's bioeconomy and biosolutions through microbial natural product discovery: unlocking indigenous microbe potential for sustainability
2026-Mar-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00174-25
PMID:41384918
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综述 | 本文综述了如何通过微生物天然产物发现,利用非洲本土微生物资源推动其生物经济发展和可持续生物解决方案的开发 | 整合了BV-BRC数据库分析与文献证据,首次系统梳理了非洲本土传统模型及新兴非模型细菌底盘菌株的基因组分布,为基于组学的生物解决方案开发提供了资源图谱 | 调查仅基于BV-BRC数据库数据,未能涵盖所有非洲微生物资源,且受限于数据库的覆盖范围和更新程度 | 推动非洲生物经济发展,通过微生物生物技术解决医疗、农业和工业生物技术领域的可持续性问题 | 非洲本土微生物资源,特别是细菌和病毒资源 | 工业生物技术 | NA | 基因组测序、功能组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、文献数据 | 基于BV-BRC数据库的微生物基因组数据 | NA | 细菌(传统模型及新兴非模型底盘菌株) | NA | 医疗, 农业, 工业生物技术 |
| 857 | 2026-04-04 |
Quantification of cholesterol incorporation in giant unilamellar vesicles produced by a modified cDICE method
2026-Mar-25, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d5sm01124h
PMID:41801146
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研究论文 | 本文提出了一种改进的cDICE方法,用于在巨型单层囊泡中量化胆固醇的掺入,利用荧光膜生物传感器进行非破坏性评估 | 使用甲基-β-环糊精-胆固醇复合物在eDICE方法中高效掺入胆固醇,并开发了基于荧光膜生物传感器的定量分析技术 | NA | 改进模型膜中胆固醇的掺入方法,以更好地模拟真核细胞膜的性质 | 巨型单层囊泡(GUVs)及其胆固醇掺入效率 | 膜生物物理学 | NA | 甲基-β-环糊精-胆固醇复合物递送、荧光膜生物传感器(如NR12A和Flipper-TR)、光谱成像、荧光寿命成像 | NA | 荧光图像数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、生物物理学 |
| 858 | 2026-04-04 |
Engineering sensor-based antithetic integral controllers for enhanced dynamic performance and noise attenuation
2026-Mar-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101512
PMID:41763220
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研究论文 | 本文开发并分析了一种基于传感器的抗合成积分反馈控制器,通过将比例和积分作用嵌入最小遗传架构中,以增强动态性能和噪声衰减 | 在经典抗合成控制基序基础上进行单一修改,使sAIF架构固有地整合了比例反馈,无需额外电路,从而加快动态响应并抑制纯积分反馈典型的噪声放大 | NA | 设计高性能生物控制器,用于合成生物学、代谢工程和细胞疗法 | 传感器基抗合成积分反馈控制器 | 合成生物学 | NA | 内含肽介导的剪接 | NA | NA | NA | 内含肽介导的剪接 | 大肠杆菌 | 传感器基抗合成积分反馈控制器,整合比例和积分反馈 | 合成生物学, 代谢工程, 细胞疗法 |
| 859 | 2026-04-04 |
Pseudomonas putida JM37 as a novel bacterial chassis for ethylene glycol upcycling
2026-Mar, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133884
PMID:41453527
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研究论文 | 本文报道了恶臭假单胞菌JM37作为一种新型细菌底盘,用于乙二醇升级回收的代谢和生物技术潜力 | 首次将恶臭假单胞菌JM37鉴定为高效代谢乙二醇的细菌底盘,并揭示其乙醛酸同化途径的遗传冗余支持其稳健代谢 | NA | 探索乙二醇的微生物升级回收,以支持可持续生物生产和循环经济 | 恶臭假单胞菌JM37及其在乙二醇代谢和生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、定向诱变、异源生物合成途径表达 | NA | NA | NA | 合成生物学底盘 | 恶臭假单胞菌JM37 | 乙醛酸同化途径、中链聚羟基脂肪酸酯生物合成途径、紫罗兰素生物合成操纵子、PET水解酶分泌系统 | 环境、工业生物技术 |
| 860 | 2026-04-04 |
Solvent-Mediated Dewetting Principles for Cell-Sized Liposome Formation
2026-Mar, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202512610
PMID:41622818
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研究论文 | 本研究揭示了溶剂介导的去润湿原理,用于细胞尺寸脂质体的形成 | 首次阐明了溶剂介导的去润湿过程中溶剂去除与机械刺激的双重作用机制,并建立了可预测的高通量脂质体制备方法 | 未明确说明实验中所用脂质的具体类型和比例,且机械刺激的量化标准可能需要进一步优化 | 探究溶剂介导的去润湿原理,以实现细胞尺寸脂质体的可控形成 | 由己醇和石蜡油溶剂组合形成的双乳液模板及其向脂质体的转变过程 | 合成生物学 | NA | 微流控技术、光学镊子 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |